任平平 馬安峰 程斐 孫朝輝 高建偉
摘要:大白菜根腫病是一種嚴重影響大白菜生長的土傳病害,已成為大白菜的重要病害之一。CRb基因是抗大白菜根腫病的重要基因。本研究對已發(fā)表的6個CRb分子標記進行篩選,獲得1個與CRb緊密連鎖的共顯性標記TCR05。該標記在抗病純和材料中產(chǎn)生279 bp的PCR擴增片段,在感病材料中產(chǎn)生250 bp的PCR片段,在抗病雜合材料中同時產(chǎn)生279 bp和250 bp的PCR片段。利用TCR05對24份育種材料進行篩選,均含CRb基因,其中8份為純合體,16份為雜合體,篩選結(jié)果與田間鑒定結(jié)果基本一致。
關(guān)鍵詞:大白菜;根腫??;CRb;分子標記;種質(zhì)資源
中圖分類號:S634.102.4文獻標識號:A文章編號:1001-4942(2016)06-0007-04
大白菜是原產(chǎn)于中國的重要蔬菜作物。大白菜根腫病是由蕓薹根腫菌侵染所致的一種土傳性病害[1]。根腫菌自大白菜根毛侵入細胞內(nèi),從根部皮層進入形成層,根部薄壁細胞受刺激而加速分裂,導(dǎo)致根部長出腫瘤,植株萎蔫死亡[2]。迄今,至少有8個大白菜抗根腫病基因得到定位,分別是Crr1、Crr2、Crr3、Crr4、CRa、CRb、CRc和 CRk[3~7]。其中,CRb對根腫菌生理小種2、4和8均具有良好抗性,并表現(xiàn)為單基因顯性遺傳特性[6]。本研究對已發(fā)表的6個CRb標記進行驗證,并對24份抗性種質(zhì)資源進行分析,以期在大白菜抗根腫病育種中對CRb基因的跟蹤和提供抗性種質(zhì)資源提供支持。
1材料與方法
1.1試驗材料
供篩選與基因CRb緊密連鎖標記的試材為抗根腫病大白菜自交系YH-036、感根腫病自交系冠291以及兩者的雜交組合。
供篩選種質(zhì)資源共24個(表1),其中BCYM-1~BCYM-4和ZY-1~ZY-4為8個抗根腫病大白菜自交系,其他16個為日本和韓國種子公司正在測試尚未推廣的新品種。每個自交系和品種選取最優(yōu)良的單株進行測試。
1.2試驗方法
1.2.1抗根腫病基因CRb分子標記供試引物及其序列供篩選的與基因CRb緊密連鎖的6對引物及其序列見表2。
1.2.2DNA提取及PCR擴增利用改良CTAB法提取大白菜基因組DNA[8]。用于PCR反應(yīng)的試劑均購自生工生物工程(上海)股份有限公司。
PCR反應(yīng)總體積為20 μL:在96孔的PCR板中分別加入PCR Master Mix(2×) 10 μL,上游引物和下游引物(10 U)各1 μL,50 ng/μL的模板DNA 2 μL,ddH2O補齊至20 μL。
PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性0.5 min,62℃退火1 min,72℃延伸1 min,35個循環(huán);72℃重延伸10 min,4℃保存。
PCR產(chǎn)物于1.5%瓊脂糖凝膠電壓5 V/cm條件下電泳1 h,用Goodview染色,Bio-RAD凝膠成像系統(tǒng)成像,觀察并保留結(jié)果。
1.2.3分子標記篩選分別取YH-036、冠291和其雜交組合各16株用6對候選引物進行PCR擴增和分析,篩選出最佳的分子標記。
1.2.4大白菜種質(zhì)資源PCR鑒定利用篩選的分子標記對24份大白菜種質(zhì)資源進行鑒定分析。
1.2.5大白菜種質(zhì)資源抗病性調(diào)查大白菜種子催芽后播種于50孔穴盤,穴盤中所用基質(zhì)均經(jīng)過高溫滅菌,放置在光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每份大白菜種質(zhì)資源設(shè)4個重復(fù),每個重復(fù)6株,隨機排列。
將高感根腫病病株的病根清洗干凈后稱重,加入適量的水,用粉碎機磨碎至勻漿與滅菌基質(zhì)混合,用血球計數(shù)板計數(shù)使?jié)舛冗_到2×108個孢子/g基質(zhì),并將土壤pH值調(diào)整至5.5左右,為病菌發(fā)病營造良好條件。
待大白菜苗長至3~4片真葉時移栽至加入菌土的營養(yǎng)缽中,保持基質(zhì)濕度60%左右,置于25℃光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng)40天后,對植株進行抗病性調(diào)查。將植株取出后,洗凈根部泥土,調(diào)查記錄抗病性。主根和側(cè)根或須根都無腫瘤記為抗病,只要在主根、側(cè)根或須根出現(xiàn)腫瘤,不分大小均記為感病。
2結(jié)果與分析
2.1分子標記篩選
6對候選引物對大白菜抗、感病自交系及其雜交組合的PCR擴增結(jié)果表明,只有TCR01和TCR05能擴增出鑒定大白菜抗根腫病基因CRb呈陽性或隱性的共顯性特異性條帶。其中TCR05在抗病自交系YH-036中擴增出一條279 bp的PCR片段,在感病自交系冠291中擴增出一條250 bp的PCR片段,在其雜交組合中擴增出與其親本對應(yīng)的兩條條帶(圖1),與文獻[6]報道一致,且在多次重復(fù)試驗中表現(xiàn)穩(wěn)定。因此,TCR05可以作為鑒定大白菜抗根腫病基因CRb呈陽性或隱性的理想分子標記。
2.2大白菜種質(zhì)資源PCR鑒定
利用分子標記TCR05對24份大白菜種質(zhì)資源CRb基因進行鑒定分析(表3)。如圖2所示,TCR05在24份大白菜資源中均能擴增出PCR片段,其中1~8號種質(zhì)資源均只擴增出一條279 bp的抗病片段,鑒定為CRb/CRb純合的種質(zhì)資源;其他16份材料中均分別擴增出279 bp的抗病片段和250 bp的感病片段,鑒定為CRb/crb雜合的種質(zhì)資源。
2.3大白菜種質(zhì)資源抗病性鑒定結(jié)果
供試的24份大白菜種質(zhì)資源總體表現(xiàn)為抗根腫病,但11、18、24號種質(zhì)資源中個別單株出現(xiàn)了腫瘤。其中,11號供試材料的側(cè)根共出現(xiàn)3個直徑5 mm左右的腫瘤,地上部病癥表現(xiàn)不明顯;18號供試大白菜資源的主根共出現(xiàn)5個3 mm左右的腫瘤,地上部表現(xiàn)出失水萎蔫現(xiàn)象;24號僅在須根部位出現(xiàn)細微突起,地上部植株生長無明顯影響(表4)。
3討論與結(jié)論
根腫病最早于1737年在英國地中海西岸和歐洲南部發(fā)現(xiàn),現(xiàn)已成為一種世界性病害[9]。近年來,我國大白菜根腫病發(fā)病范圍迅猛擴大,面積急劇增加,造成大白菜產(chǎn)量和品質(zhì)大幅度降低,已成為大白菜主要病害之一。生產(chǎn)實踐證明,栽培措施和化學(xué)、生物等防治方法不僅效果甚微而且化學(xué)防治污染環(huán)境[10],選育抗根腫病大白菜新品種是一條有效、經(jīng)濟和環(huán)保的途徑[11]。源于歐洲蕪菁的多個抗病基因已成功導(dǎo)入到大白菜種質(zhì)中,但目前大白菜根腫病的抗性檢測主要采用人工接種鑒定方法,接種效果受外界環(huán)境的影響大、效率低,不能鑒定抗性基因的類型[12]。因此,育種中急需運用分子標記輔助育種方法彌補人工接種的缺陷。本研究篩選出一個與抗病基因CRb緊密連鎖的SCAR標記TCR05,具有結(jié)果穩(wěn)定可靠、操作簡便、效率高、可鑒別雜合子和純合子等優(yōu)點,可有效用于今后抗根腫病大白菜育種工作中。
Piao等(2004)[6]利用韓國和日本的10個感病品種和37個抗病品種對CRb位點開發(fā)分子標記,在抗病品種中有18個品種含有TCR01和TCR05標記,在感病品種中均未擴增到這2個標記。本研究利用TCR05對源于日本和韓國的24份較新抗根腫病種質(zhì)資源進行鑒定,均鑒定出抗病基因CRb的存在,說明抗病基因CRb在國外抗根腫病大白菜品種中已得到廣泛采用,應(yīng)引起我國育種工作者的重視。
本研究人工接種試驗證明,含有雜合基因CRb的大白菜種質(zhì)資源11、18、24號表現(xiàn)出不同程度的感病性,而其他21份種質(zhì)資源均表現(xiàn)為抗根腫病,與分子標記的結(jié)果不完全一致。迄今為止,對于大白菜抗根腫病基因的類別、效應(yīng)方式、基因間相互作用等研究不夠深入,目前已發(fā)現(xiàn)的8個與根腫病抗性有關(guān)的基因位點分別是Crr1、Crr2、Crr3、Crr4、CRa、CRb、CRc和 CRk,其中,Crr3、CRa、CRb、CRk均位于染色體A03上,Crr1、Crr2和Crr4分別位于染色體A08、A01和A06上,CRc位于染色體A02上。從大白菜種質(zhì)資源11、18、24號表現(xiàn)出不同程度的感病性來分析,基因CRb對根腫病的抗性可能與其它抗病性基因有關(guān)聯(lián),存在加性效應(yīng)等基因互作效應(yīng),這一假設(shè)值得進一步驗證,以期為今后抗病育種提供理論依據(jù)。
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