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      中國漢族人群前交叉韌帶損傷與β-fib基因多態(tài)性的相關(guān)性

      2016-06-24 12:20:06陳鴻史荔張俊趙道洪史磊陸秦楠張啟段祺輝舒嵩華
      中國運動醫(yī)學雜志 2016年9期
      關(guān)鍵詞:多態(tài)性韌帶測序

      陳鴻 史荔 張俊 趙道洪 史磊陸秦楠 張啟 段祺輝 舒嵩華

      1昆明市第一人民醫(yī)院運動醫(yī)學關(guān)節(jié)外科(昆明650000)

      2中國醫(yī)學科學院醫(yī)學生物學研究所

      3昆明醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院骨科

      中國漢族人群前交叉韌帶損傷與β-fib基因多態(tài)性的相關(guān)性

      陳鴻1史荔2張俊3趙道洪3史磊2陸秦楠1張啟1段祺輝1舒嵩華1

      1昆明市第一人民醫(yī)院運動醫(yī)學關(guān)節(jié)外科(昆明650000)

      2中國醫(yī)學科學院醫(yī)學生物學研究所

      3昆明醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院骨科

      目的:探索β-fib基因多態(tài)性與中國漢族人群前交叉韌帶(anterior cruciate ligament,ACL)損傷發(fā)生的關(guān)系。方法:收集105名ACL損傷的漢族患者,以110名無ACL損傷史的漢族個體作為對照,通過限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析、測序技術(shù)對β-fib基因啟動子區(qū)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)進行檢測并分型,開展病例對照關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果:β-fib基因啟動子區(qū)共檢出6個SNPs,包括;β-148C/T(rs1800787)、β-249C/T(rs1800788)、β-455G/ A(rs1800790)、β-854G/A(rs1800791)、β-933G/A(rs2227389)、β-1420G/A(rs1800789),其中rs1800790、rs1800788和rs1800787的AG、CT和CT基因表型頻率在病例組中高于對照組 (P<0.05)。rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型C G A*、T G A*、T G G*在病例組和對照組中也顯示統(tǒng)計學差異。結(jié)論:在中國漢族人群,β-fib基因啟動子區(qū)rs1800790、rs1800788和rs1800787及其單倍型可能與ACL損傷的發(fā)生相關(guān)。

      前交叉韌帶損傷;β-fib基因多態(tài)性;病例對照研究

      前交叉韌帶(anterior cruciate ligament,ACL)是人體膝關(guān)節(jié)中重要的靜力性穩(wěn)定結(jié)構(gòu),ACL損傷在膝關(guān)節(jié)的損傷中較為常見,是引起膝關(guān)節(jié)功能障礙的常見因素之一[1]。 ACL損傷常使患者健康水平下降,將出現(xiàn)脛骨前移并導致膝關(guān)節(jié)不穩(wěn),繼而出現(xiàn)半月板損傷,尤其內(nèi)側(cè)半月板損傷多見[2],且ACL損傷時間越久,關(guān)節(jié)軟骨退變的范圍和程度越大[3],結(jié)果會進一步加速膝關(guān)節(jié)的退行性改變和骨關(guān)節(jié)炎的發(fā)生[4]。大量研究表明ACL損傷的患者關(guān)節(jié)炎發(fā)生的概率遠高于無損傷的患者[5,6]。明確ACL損傷的原因?qū)⒂兄陬A(yù)防膝關(guān)節(jié)損傷,但目前ACL損傷發(fā)生的病因尚不清楚,Bahr等[7]認為內(nèi)部因素和外部因素共同作用導致ACL損傷,而作為內(nèi)部危險因素之一的遺傳因素逐漸受到人們的重視[8]。研究表明,在ACL損傷的發(fā)生過程中以及手術(shù)后,常常伴隨著纖維蛋白原(fibrinogen,F(xiàn)g)水平的顯著升高[9-11]。而β-fib基因決定纖維蛋白β多肽鏈的合成進而影響血漿纖維蛋白原水平的大部分變化。由于不同人種或不同地區(qū)的人群存在基因異質(zhì)性,在中國人群中β-fib基因多態(tài)性是否與ACL損傷相關(guān)呢?本研究探討β-fib基因啟動子區(qū)的基因多態(tài)性與中國漢族人群ACL損傷發(fā)生的相關(guān)性。

      1 對象與方法

      1.1研究對象

      納入標準:(1)體格檢查膝關(guān)節(jié)不穩(wěn)、磁共振(MRI)與關(guān)節(jié)鏡檢查明確ACL損傷;(2)除ACL損傷,不合并有膝關(guān)節(jié)其他部位的韌帶損傷。

      排除標準:(1)除ACL損傷,合并有膝關(guān)節(jié)其他部位的韌帶損傷;(2)既往風濕或類風濕性關(guān)節(jié)炎、化膿性關(guān)節(jié)炎、膝關(guān)節(jié)結(jié)核等膝關(guān)節(jié)疾病患者;(3)既往膝關(guān)節(jié)手術(shù)或外傷患者。

      2011年10 月至2015年10月,研究包括105名ACL損傷患者和110名正常對照者:ACL損傷患者男73例、女32例,平均年齡33.62±11.18歲,左ACL損傷41例,右ACL損傷64例;正常對照者男69例、女41例,平均年齡35.57±12.78歲。均為漢族。臨床診斷前交叉韌帶損傷的方法主要包括:臨床膝關(guān)節(jié)穩(wěn)定性體格檢查提示膝關(guān)節(jié)不穩(wěn),膝關(guān)節(jié)MRI檢查提示ACL異常信號,關(guān)節(jié)鏡檢查明確ACL損傷。本次試驗的ACL損傷病例同時滿足以上三方面的檢查標準,上述三個標準均不滿足者進入對照組。本研究獲得昆明醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院及昆明醫(yī)科大學臨床研究倫理委員會批準通過,經(jīng)患者和正常對照本人及其家屬同意并簽署同意書。

      1.2DNA提取、定量

      采集ACL損傷病例及對照組外周靜脈血5 ml, EDTA抗凝。使用AxyPrep血基因組DNA小量試劑盒提取樣本的基因組DNA,采用瓊脂糖凝膠電泳對樣品DNA進行測定。電泳條件:4V/cm,2%瓊脂糖電泳45分鐘,凝膠成像。使用分光光度計ND-1000測定DNA濃度,調(diào)節(jié)DNA濃度至15 ng/μL~20 ng/μL。

      1.3fib啟動子SNP檢測

      1.3.1PCR引物設(shè)計

      用DNASTAR primerselect設(shè)計引物序列。引物設(shè)計完成后在UCSC上進行PCR確認擴增序列準確性和長度。再將序列輸入NCBI進行BLAST序列比對,再次確認序列準確性和長度;同時確認擴增序列中的限制性核酸內(nèi)切酶酶切位點是否是待檢測的SNP位點和酶切片段的長度。最后抽取一些樣本進行測序確認。引物序列 (擴增片段 1560bp)為:上游引物 (F):5’-ACGTCACTAAAATAAAATCCTGTCTA-3’;下游引物(R):5’-GAAGCTCCAAGAAACCATCC-3’

      1.3.2PCR擴增:PCR反應(yīng)體系

      10×PCR擴增緩沖液2.0 μL、dNTP1.6 μL、正向引物0.2 μL、反向引物0.2 μL HostStart rTaq聚合酶0.1 μL、模板DNA 1.3 μL,再加入雙蒸水至20 μL。PCR反應(yīng)程序 94℃,3 min(94℃,30 s;58.9℃,30 s;72℃,2 min)×30;72℃,10 min,4℃保存。

      1.3.3雙向測序

      擴增PCR產(chǎn)物經(jīng)生工生物工程(上海)有限公司測序,檢測β-fib基因啟動子區(qū)多態(tài)位點。

      1.4統(tǒng)計學分析

      所有數(shù)據(jù)采用 SPSS17.0進行統(tǒng)計分析。采用Hardy-weinberg遺傳平衡定律檢驗病例組和對照組的基因頻率以及等位基因頻率。運用SHEsis程序[12](http://analysis2.bio-x.cn/myAnalysis.php)分析統(tǒng)計β-fib基因啟動子區(qū)的基因型、等位基因及其單倍型頻率。位點的多態(tài)性與ACL損傷風險之間的相關(guān)性用比值比(oddsratio,OR 值 ) 及 其 95% 可 信 區(qū) 間(confidenceintervals,CI)表示。P<0.05表示差異具有統(tǒng)計學意義。

      2 結(jié)果

      2.1β-fib基因啟動子區(qū)SNP檢測

      β-fib基因啟動子區(qū)共檢出6個SNPs,包括;β-148C/T(rs1800787),β-249C/T(rs1800788),β-455G/A (rs1800790),β-854G/A(rs1800791),β-933G/A(rs222-7389),β-1420G/A(rs1800789)。測序結(jié)果如圖1。

      2.2β-fib基因病例對照分析

      2.2.1Hardy-Weinberg平衡檢驗

      對照組與感染組等位基因的頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P值均>0.05),說明人群具有代表性。

      圖1 β-fib基因啟動子區(qū)6個SNPs測序結(jié)果

      2.2.26個SNPs在病例組與對照組中等位基因頻率與基因型頻率比較

      研究比較了6個SNPs在病例組和對照組中等位基因頻率,以及基因型頻率分布。結(jié)果6個SNPs等位基因頻率在病例組和對照組中未顯示差異 (P值均>0.05),但 rs1800790、rs1800788和 rs1800787的AG、CT和CT基因表型頻率在病例組中高于對照組,其差異具有顯著性意義,P值分別為0.0045、0.0022和0.010。這提示rs1800790、rs1800788和rs1800787可能與ACL的發(fā)生相關(guān)。結(jié)果見圖2和3。

      圖2 β-fib基因6個SNPs等位基因頻率比較

      圖3 β-fib基因6個SNPs基因型頻率比較

      圖4 β-fib基因6個SNPs連鎖不平衡圖

      2.2.36個SNPs連鎖不平衡分析

      將β-fib基因6個SNPs進行連鎖不平衡分析,結(jié)果如圖4顯示 :rs2227389、rs1800791和rs1800790連鎖不平衡較高。其余位點之間連鎖程度較低。

      2.2.4單倍型構(gòu)建及病例對照分析

      根據(jù)連鎖不平衡分析結(jié)果,構(gòu)建了rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型,并進行對照病例分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)C G A*,T G A*,T G G*單倍型顯示差異有統(tǒng)計學意義。見表1。

      表1 rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型ACL病例—對照分析結(jié)果

      3 討論

      目前,ACL損傷的發(fā)病機制并不十分清楚,內(nèi)外多種因素都可能與ACL損傷的發(fā)生相關(guān)。長期以來,學者們關(guān)注于ACL的三維空間結(jié)構(gòu)、三維力學機制的分析研究。但近年來,多種高風險因子的發(fā)現(xiàn)表明基因與基因、基因與環(huán)境的相互作用在ACL損傷發(fā)生中也起到非常重要的作用。研究表明:性別、家族因素、特殊的遺傳序列變異等也是ACL損傷發(fā)生的高風險因素。ACL損傷在女性的發(fā)生率高于男性,Posthumus對Ⅴ型膠原基因COL5A1基因多態(tài)性進行了分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):女性ACL損傷患者COL5A1 BstUI RFLP CC基因型的頻率顯著高于對照[13]。另外,女性XII型膠原基因COL12A1 AluI RFLP AA型ACL損傷的風險也增高[14]。Khoschnau等觀察到Ⅰ型膠原基因COL1A1 Sp1結(jié)合位點的多態(tài)性與ACL損傷減低相關(guān)[15]。而且ACL損傷患者親屬中ACL損傷的發(fā)生率高于正常,是正常的2倍,患者一級親屬的ACL損傷的發(fā)生率則達到2倍以上[16]。這些數(shù)據(jù)都提示遺傳因素在ACL損傷的發(fā)生中起到一定作用。對遺傳高風險因子的鑒別有利于確定在職業(yè)或非職業(yè)體育活動中,重復(fù)性的機械負荷是否是導致個體損傷增加的因素,而且有助于在未來的治療中,針對不同個體采用最有效的治療方法。同時,遺傳風險因素也是決定損傷預(yù)后的重要因素。因此,ACL損傷的遺傳機制分析越來越受到重視,研究表明除了膠原蛋白(COL1A1,COL5A1,COL12A1)基因,還有基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)、血管內(nèi)皮生長因子 (vascular endothelial growth factor,VEGF)及其受體-2(KDR)、肌原纖蛋白2(FBN2)等基因編碼或表達ACL的結(jié)構(gòu),并與ACL損傷有關(guān)[17-19]。

      纖維蛋白原(fibrinogen,F(xiàn)g)是肝臟合成的一種血漿球蛋白,由完全相同的兩個亞基組成,每個亞基含有α、β、γ三條肽鏈,主要作為凝血因子Ⅰ 參與凝血,是凝血系統(tǒng)的核心蛋白質(zhì),它在凝血過程的最后階段被凝血酶切斷纖維蛋白原α鏈N-末端區(qū)域的纖維蛋白肽A和β鏈N-末端區(qū)域的纖維蛋白肽B而生成纖維蛋白單體,最終形成不溶性纖維蛋白凝塊而發(fā)揮血液凝固作用。纖維蛋白原3對多肽鏈分別由3條獨立的基因(α、β、γ)編碼,其中纖維蛋白原Bβ鏈的mRNA合成被認為是控制整個分子合成的限速步驟,所以β-fib基因決定了纖維蛋白β多肽鏈的合成進而影響血漿纖維蛋白原水平的大部分變化。本實驗對β-fib基因啟動子區(qū)的基因多態(tài)性進行初步研究,共檢出6個SNPs:β-148C/T(rs1800787),β-249C/T(rs1800788),β-455G/ A (rs1800790),β-854G/A (rs1800791),β-933G/A (rs2227389),β-1420G/A(rs1800789)。病例對照分析結(jié)果表明:rs1800790,rs1800788和rs1800787的AG、CT 和CT基因表型頻率在病例組中高于對照組,其差異具有顯著性意義,P值分別為0.0045、0.0022和0.010。進一步構(gòu)建的rs2227389-rs1800791-rs1800790單倍型C G A*、T G A*、T G G*在病例組和對照組中也顯示統(tǒng)計學差異。近年來的研究也表明,在ACL損傷的發(fā)生過程中以及手術(shù)后,常常伴隨著纖維蛋白原水平的顯著升高[9-11]。

      4 結(jié)論

      綜上所述,在中國漢族人群,β-fib基因啟動子區(qū)rs1800790、rs1800788和rs1800787及其單倍型可能與ACL損傷的發(fā)生相關(guān)。

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      Association of β-fib gene polymorphisms with ACL injury in Chinese Han Population

      Chen Hong1,Shi Li2,Zhang Jun3,Zhao Daohong3,Shi Lei2,Lu Qinnan1,Zhang Qi1,Shu Songhua1
      1 Sports Medicine and Joint Surgery,The First People’s Hospital of Kunming,Yunnan 650000,China
      2 Institute of Medical Biology,Chinese Medical Sciences Academy,Yunnan 650000,China
      3 Department of Orthopedics,The Second Affiliated Hospital of Kunming Medical University,Yunnan 650000,China

      Lu Qinnan,Email:luqinnanyn@163.com

      ObjectiveTo investigate the association of polymorphisms of β-fib gene with anterior cruciate ligament(ACL)injury in Chinese Han population.MethodOne hundred and five ACL injury patients were recruited in an experimental group,while 110 healthy counterparts were selected into a controll group.RFLP analysis and genetic sequencing technology were applied to detect and classify the single nucleotide polymorphisms(SNPs)in the β-fib gene promoter region.Then association analysis was conducted.Result In the β-fib gene promoter region,6 SNPs were detected as follow:β-148C/T (rs1800787),β-249C/T (rs1800788),β-455G/A (rs1800790),β-854G/A (rs1800791),β-933G/A (rs2227389),,β-1420G/A (rs1800789)).Moreover,the AG,CT and CT phenotypes of β-fib rs1800790,rs1800788 and rs1800787 gene were found significantly more in the experimental group than the control group (P<0.05).Significant differences were also found in the appearance of rs2227389-rs1800791-rs1800790 haplotype CGA*,TGA*,TGG* between the 2 groups.Conclusionβ-fib rs1800790,rs1800788 and rs1800787 genes and their haplotypes were related to ACL injury in Chinese Han population.

      ACL injury,β-fib gene polymorphism,association analysis

      2016.01.19

      云南省科技計劃項目(昆醫(yī)聯(lián)合專項)(40210029)

      陸秦楠,Email:luqinnanyn@163.com

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