• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      遼寧省老鸛草屬植物種質(zhì)資源遺傳多樣性的ISSR分析

      2016-07-11 06:41:08孫鵬谷靜逸尹海波張建逵賈曉晴邵飛
      實用手外科雜志 2016年2期
      關(guān)鍵詞:親緣塊根遼寧

      孫鵬,谷靜逸,尹海波,張建逵,賈曉晴,邵飛

      (1.沈陽市第七人民醫(yī)院,遼寧 沈陽 110003;2.遼寧中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,遼寧 大連 116600)

      老鸛草,始見于明代蘭茂的《滇南本草》[1],是我國傳統(tǒng)中藥,來源于牻牛兒苗科植物牻牛兒苗(Erodiumstephanianum Willd)、老鸛草(Geranium wilfordii Maxim)或野老鸛草(G carolinianumL)的干燥地上部分,收載于我國2015年版《藥典》[2]。我國有牻牛兒苗科植物4屬,約67種,其中老鸛草屬植物55種[3],其中分布于遼寧省的有7種,分別為老鸛草(Geranium wilfordii Maxim)、鼠掌老鸛草(Geranium sibiricum L)、塊根老鸛草(Geranium dahuricum DC)、突節(jié)老鸛草 (Geranium Krameri Franch.et Sav Enum)、朝鮮老鸛草(Geranium franchetii R.Kunth)、長白老鸛草(Geranium baishanense Y.L.Chang)和毛蕊老鸛草(Geranium eriostemon Fish.ex DC)[3-5]。本研究利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù),揭示了遼寧省老鸛草屬植物資源的親緣關(guān)系及群體間的遺傳多樣性。

      1 材料

      供試材料均于2014和2015年7-9月采自遼寧省東部山區(qū)的21個居群,均經(jīng)大連自然博物館張淑梅教授和遼寧中醫(yī)藥大學(xué)藥用植物教研室尹海波教授鑒定,具體信息見表1。

      表1 樣品基本信息

      2 方法

      2.1 DNA提取

      將存儲在-80℃冰箱內(nèi)的實驗材料取出,迅速置于研缽中充分研磨。按照TIANGEN植物基因組DNA提取試劑盒的說明進行DNA的提取,用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,各個電泳道均出現(xiàn)一條清晰的DNA條帶,即所提取的DNA均完整。

      2.2 ISSR引物的選擇

      本實驗所用ISSR引物由上海生工生物工程股份有限公司合成,源自University of British Columbia(UBC大學(xué))公布的100條ISSR引物。根據(jù)相關(guān)論文[6],結(jié)合本實驗材料,從中篩選出擴增產(chǎn)物條帶清晰、多態(tài)性較好的引物用于不同種老鸛草親緣關(guān)系的分析。

      2.3 老鸛草屬植物ISSR-PCR最佳反應(yīng)體系的建立

      PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化是ISSR技術(shù)獲得較好研究結(jié)果的先決條件[7],本實驗通過對退火溫度、引物濃度和DNA模板量進行優(yōu)化,建立了PCR的最佳反應(yīng)體系。擴增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠(上海Sangon)染色,于Syngene凝膠成像儀觀察并拍照。

      2.4 數(shù)據(jù)處理

      ISSR-PCR擴增產(chǎn)物中,將電泳圖譜中較清晰的條帶(包括弱帶)計為“1”,無帶計為“0”,利用POPGENE軟件計算等位基因數(shù)、Nei′s遺傳多樣性指數(shù)、Shannona信息多樣性指數(shù)等參數(shù);利用軟件NTsys 2.10e分析遺傳相似性系數(shù),按UPGMA法構(gòu)建聚類圖[8,9]。

      3 結(jié)果與分析

      3.1 老鸛草屬植物的遺傳多樣性

      3.1.1 擴增產(chǎn)物的多態(tài)性分析

      采用24條隨機引物對樣品進行擴增篩選,其中8條引物能擴增出帶形清晰、多態(tài)性較好、清晰度高的擴增產(chǎn)物(表2),擴增條帶分布在300~3 000 bp之間(圖1)。8條引物共擴增出149條條帶,其中多態(tài)性條帶146條,多態(tài)性比率為97.99%,揭示老鸛草屬植物在物種水平上保持相當(dāng)高的遺傳多樣性。

      表2 ISSR-PCR的擴增結(jié)果

      3.1.2 Shannon信息指數(shù)分析和Nei遺傳多樣性指數(shù)分析

      利用Popgene 32軟件對7種老鸛草居群進行遺傳多樣性分析。由表3可以看出,老鸛草各個種群的平均Shannon指數(shù)和Nei′s基因多樣性指數(shù)分別在 0.236 4~0.402 9(平均 0.311 1)和 0.140 2~0.267 5(平均0.206 6)范圍內(nèi),表明老鸛草屬植物種群間具有較高的多態(tài)性、遺傳變異和進化水平。7個種群中,遺傳變異水平大小為PopK>PopB>PopM>PopT>PopS>PopL>PopC[10-12]。

      3.1.3 老鸛草的遺傳結(jié)構(gòu)

      圖1 部分UBC引物對7種老鸛草樣品的ISSR擴增結(jié)果 (M為標(biāo)準(zhǔn)分子量DL 5 000)

      遺傳結(jié)構(gòu)是通過物種居群內(nèi)和居群間的遺傳分化來體現(xiàn)的,根據(jù)總的遺傳多樣性(Ht)和群體內(nèi)遺傳多樣性(Hs)計算不同種群間的遺傳多樣性(Dst,Dst=Ht-Hs)和遺傳分化水平(Gst,Gst=Dst/Ht)。7個老鸛草種群間的遺傳多樣性Dst=0.250 5,分化指數(shù)Gst=0.604 2,說明種群間的遺傳變異占60.42%,而種群內(nèi)的遺傳變異為39.58%,雖然種群間變異占主要比重,但種群內(nèi)的變異程度亦相當(dāng)大;基因流系數(shù)Nm為0.327 7,遠小于1,說明種群間存在明顯的分化[13、14]。

      3.2 老鸛草屬植物種間親緣關(guān)系分析

      利用Ntsys 2.10 e軟件計算7個種間的遺傳相似系數(shù);采用UPGMA聚類分析方法構(gòu)建親緣關(guān)系樹狀聚類圖(圖2)。結(jié)果顯示,7種老鸛草在相似系數(shù)為0.52處被聚為兩類,老鸛草和鼠掌老鸛草被聚為Ⅰ類,其他5種聚為Ⅱ類;在相似系數(shù)為0.55處,Ⅱ類又分為3個亞類,即塊根老鸛草、突節(jié)老鸛草和長白老鸛草為一類,朝鮮老鸛草和毛蕊老鸛草各為一類,其中,塊根老鸛草和突節(jié)老鸛草的親緣關(guān)系最為接近,相似系數(shù)高達0.77。該分類結(jié)果與《中國植物志》中對組劃分及對原植物形態(tài)的分類結(jié)果相一致。

      4 討論

      4.1 對遼寧省老鸛草屬植物的考證

      據(jù)《中國植物志》記載,北方老鸛草(Geranium erianthum DC.)產(chǎn)于吉林省東部;《東北草本植物志》收錄老鸛草屬植物共9種,其中分布于遼寧的有6種,另記載北方老鸛草在吉林省多個縣均有分布;《遼寧植物志》共收載老鸛草屬植物7種,亦未將毛蕊老鸛草(Geranium eriostemon Fish.ex DC.)列入其中,而將Geranium erianthum DC.收錄。本實驗取材主要基于以下兩點考證:一是就現(xiàn)有資料來看,《中國植物志》第43卷成書于1997年,《東北草本植物志》第6卷成書于1977年,《遼寧植物志》成書于1988年。因此筆者推測,《東北草本植物志》對遼寧省僅有6種的記載實為紕漏,成書最晚的《中國植物志》明確收載于《遼寧植物志》的Geranium erianthum DC.一種產(chǎn)于吉林省,該說法與《東北草本植物志》的信息一致,而Geranium erianthum DC.和Geranium eriostemon Fish.ex DC.在親緣關(guān)系上極為相近[10],因此,初步判斷《遼寧植物志》對Geranium erianthum DC.很可能為誤定。二是在實地考察中,2014,2015年6-9月間我們在遼寧省調(diào)查了近200個天然山區(qū),其中包括《遼寧植物志》中對Geranium erianthum DC.有收錄的桓仁、寬甸等山區(qū),并未發(fā)現(xiàn)Geranium erianthum DC.,而Geranium eriostemon Fish.ex DC.在遼寧山區(qū)尤其本溪縣內(nèi)普遍分布較多;后又考察了中國科學(xué)院沈陽生態(tài)所(中國科學(xué)院林業(yè)土壤研究所前身)的憑證標(biāo)本,該標(biāo)本現(xiàn)無根部、無花果部位,唯有3大3小葉片存留,雖葉裂均至3/4處,但就目前不完整的信息并不能排除是Geranium eriostemon Fish.ex DC.的可能性。此外,我們曾在該所Geranium erianthum DC.標(biāo)本的標(biāo)注地區(qū)桓仁老禿頂多次進行較大規(guī)模的考察,依然未能發(fā)現(xiàn)該種,其中同行的有大連自然博物館張淑梅教授。綜合以上兩點的考證,筆者可初步斷定遼寧省的老鸛草屬植物共7種,分 別 為 GeraniumwilfordiiMaxim.、Geranium sibiricum L.、Geranium eranim dahuricum DC.、Geranium krameri Franch.et Sav.Enum.、Geranium koreanum Kom.in Act.、Geranium paishanense Y.L.Chang.和Geranium eriostemon Fish.ex DC.,而更正了《遼寧植物志》中的Geranium erianthum DC.。

      表3 195份老鸛草樣品遺傳多樣性的ISSR分析

      表4 7個種間的Nei遺傳距離(斜對線上方)和相似系數(shù)(斜對線下方)

      圖2 7種老鸛草基于ISSR的遺傳相似性UPGMA聚類圖

      4.2 ISSR在老鸛草屬植物種間親緣關(guān)系分析的適用性

      ISSR分子標(biāo)記技術(shù)能在不同的物種間通用,具有操作簡單、成本較低、穩(wěn)定性高、模板DNA用量少、多態(tài)性豐富等優(yōu)點。采用該法對同屬不同種間親緣關(guān)系的分析屢見不鮮,而目前在老鸛草屬植物中利用ISSR分子標(biāo)記進行種間親緣關(guān)系的分析尚未見報道。本實驗利用ISSR引物的通用性特點,將該分子標(biāo)記技術(shù)應(yīng)用于遼寧省老鸛草屬植物親緣關(guān)系的考察。結(jié)果表明,該標(biāo)記技術(shù)在反映老鸛草屬植物資源間的親緣關(guān)系和群體間遺傳多樣性中可行。由聚類結(jié)果可知,Ⅰ類均為直根系,Ⅱ類均為塊根,在Ⅱ類下依次分出處于高寒地區(qū)的毛蕊老鸛草、朝鮮老鸛草和長白老鸛草,生長于草甸的塊根老鸛草和突節(jié)老鸛草的親緣關(guān)系最為接近,該結(jié)果與原植物形態(tài)、分布地區(qū)的記載完全吻合,也表明老鸛草屬植物資源的遺傳分化與其來源的生態(tài)環(huán)境相關(guān)聯(lián)。

      4.3 老鸛草屬植物的遺傳多樣性

      本研究中,8條ISSR引物的多態(tài)性為97.99%,表明該7個種群間具有相當(dāng)豐富的遺傳多樣性。遺傳變異水平大小順序為塊根老鸛草>長白老鸛草>毛蕊老鸛草>突節(jié)老鸛草>鼠掌老鸛草>老鸛草>朝鮮老鸛草,且塊根老鸛草種群的Nei's基因多樣性(0.290 7)遠高于其他6個種群的平均水平(0.143 0)。照原植物形態(tài)來講,塊根老鸛草和大花組(直徑D>2.0 cm)中的突節(jié)老鸛草極為相似,本研究亦證實二者的親緣關(guān)系最為接近,但塊根老鸛草卻與Ⅰ類中的老鸛草和鼠掌老鸛草同歸為小花組(直徑D<2.0 cm),筆者猜測形態(tài)上的交叉可能是源于塊根老鸛草豐富的遺傳多樣性;長白老鸛草雖多處環(huán)境較單一的高寒地區(qū),其遺傳變異水平卻僅次于塊根老鸛草,該結(jié)果恰恰證實了《中國植物志》中長白老鸛草是塊根老鸛草原變種高寒類型的觀點。

      [1]劉娟,王良信.老鸛草的本草考證[J].中草藥,1992,23(5):276.

      [2]國家藥典委員會.中華人民共和國藥典·一部[S],北京:中國醫(yī)藥科技出版社,2015.122.

      [3]中國植物志編委會.中國植物志(43卷第1冊)[M].北京:科學(xué)出版社,2004.23-26.

      [4]李書心.遼寧植物志(上冊)[M].遼寧科學(xué)技術(shù)出版社,1988.1000-1003.

      [5]遼寧省林業(yè)土壤研究所.東北草本植物志(第6卷)[M].北京:科學(xué)技術(shù)出版社,1977.11.

      [6]王吉華.老鸛草品質(zhì)評價及遺傳多樣性研究[D].遼寧中醫(yī)藥大學(xué),2013.75.

      [7]陳美霞,朱文寧,孫煥,等.石斛屬植物ISSR擴增體系的建立與優(yōu)化[J].中國農(nóng)學(xué)通報,2014,30(10):177-181.

      [8]李先寬,王冰,鄭艷超,等.五味子特殊類型白果五味子的分子標(biāo)記研究[J].中藥材,2014,37(4):568-572.

      [9]李猛,王平,孫吉康,等.天然蜆殼花椒種群遺傳多樣性的ISSR標(biāo)記分析[J].中藥材,2014,37(12):2159-2163.

      [10]梁呈元,劉艷,李維林,等.薄荷屬植物遺傳多樣性的ISSR分析[J].中藥材,2011,34(8):1190-1193.

      [11]李紹臣,李鳳明,張立民,等.吉林省天然黃檗種群遺傳多樣性ISSR 分析[J].生態(tài)學(xué)報,2016,36(1):1-7.

      [12]朱田田,晉玲,杜弢,等.甘肅不同產(chǎn)地中麻黃遺傳關(guān)系的ISSR分析[J].中藥材,2013,36(9):1397-1401.

      [13] Kunar A,Rogstad SH.A hierarchical analysis of microsatelliteDNAdiversityinGambeloak(Qre ganlbelii Nutt.Fagaceae[J].Mol Ecol,1998,7:859.

      [14]Slatkin M.Gene flow in natural populations[J].Ann Rev Ecol Syst,1985,16:393-430.

      猜你喜歡
      親緣塊根遼寧
      谷子近緣野生種的親緣關(guān)系及其利用研究
      遼寧之光
      新少年(2022年3期)2022-03-17 07:06:38
      中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所藥用植物親緣學(xué)研究中心
      讀遼寧 愛遼寧
      遼寧艦
      學(xué)與玩(2018年5期)2019-01-21 02:13:08
      菊科藥用植物遺傳多樣性及親緣關(guān)系的ISSR分析
      德欽烏頭塊根化學(xué)成分的研究
      中成藥(2018年2期)2018-05-09 07:19:50
      塊根塊莖類植物細胞懸浮培養(yǎng)技術(shù)與應(yīng)用
      小白菜種質(zhì)遺傳多樣性與親緣關(guān)系的SRAP 和SSR分析
      木薯塊根拔起的最大應(yīng)力數(shù)值模擬及試驗
      临武县| 彭州市| 丰台区| 塔河县| 林州市| 本溪市| 林芝县| 梅河口市| 盈江县| 保定市| 湖口县| 红原县| 宁河县| 于都县| 阳城县| 吴江市| 偃师市| 华池县| 楚雄市| 鞍山市| 武邑县| 方正县| 嘉定区| 东阿县| 沁源县| 科技| 建昌县| 洞头县| 关岭| 屏东市| 海城市| 瑞丽市| 泰来县| 藁城市| 遂川县| 大足县| 威海市| 福州市| 开鲁县| 蓬莱市| 海兴县|