朱會芹 王瑞飛
摘 要 piRNA(PIWI-interacting RNA)是近年來發(fā)現(xiàn)的一種非編碼小RNA(non-coding RNA ncRNA)。它主要在生殖細胞中表達,與生殖系統(tǒng)DNA完整性、翻譯過程、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄和動物生育能力的調(diào)節(jié)等有關(guān)。該文對piRNA沉默轉(zhuǎn)錄過程、piRNA芯片技術(shù)、生殖系和干細胞維護及piRNA在癌癥治療等方面的最新進展進行總結(jié),并對這些方面進行了簡單評述。
關(guān)鍵詞 piRNA;轉(zhuǎn)座子沉默;piRNA芯片;生殖系干細胞;癌癥
中圖分類號 Q81 文獻標識碼 A 文章編號 1674-6708(2016)162-0195-02
piRNA是近年來發(fā)現(xiàn)的一類新的非編碼小RNA,2006年,piRNA首次被科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)并于小鼠睪丸內(nèi)分離出來。piRNA由24-32個核苷酸組成,因其能與Piwi蛋白家族成員結(jié)合發(fā)生相互作用,故稱為Piwiinteracting RNAs,即piRNAs。piRNA有如下特點:來源于單鏈RNA前體、普遍分布在整個基因組上但具有高度的不連續(xù)性、5′端多具有尿嘧啶偏向性、多分布于動物生殖細胞和胚胎干細胞內(nèi)、多數(shù)位于基因間隔區(qū)、少數(shù)分布在基因內(nèi)含子和外顯子中。piRNA的生物功能多種多樣,主要有沉默轉(zhuǎn)座子、阻礙轉(zhuǎn)錄翻譯、調(diào)節(jié)生育能力和影響遺傳信息傳遞等。據(jù)專家統(tǒng)計,在當今社會,每小時就會有3個物種滅絕,這在很大程度上是因為遺傳信息傳遞失敗所致,研究piRNA的生物學(xué)特性有利于挽救瀕危物種。目前,癌癥是影響我國公共健康的主要問題,與piRNA相結(jié)合的piwi家族在有機體干細胞自我更新、配子發(fā)生和RNA干擾等生物過程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,piwi家族過表達很可能會引起生殖腫瘤形成,因此,通過調(diào)節(jié)piRNA的生物學(xué)活性可以相應(yīng)的減少癌癥的發(fā)生。本文對piRNA在沉默轉(zhuǎn)錄基因、調(diào)節(jié)翻譯、維持生殖系和干細胞及治療癌癥方面發(fā)揮的作用和piRNA芯片技術(shù)的進展進行綜述,以期對相關(guān)領(lǐng)域的研究人員有所幫助。
1 沉默轉(zhuǎn)錄基因和調(diào)節(jié)翻譯過程
piRNA是一種特異表達的內(nèi)源性小分子RNA,存在于果蠅、斑馬魚、哺乳動物的生殖細胞和早期胚胎中,在機體內(nèi)主要位于基因間隔區(qū)。piRNA能夠和Piwi蛋白結(jié)合發(fā)揮作用,它是由呈束狀排列的DNA序列(piRNA簇)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的。piRNA簇中有相應(yīng)的轉(zhuǎn)座子片段,可以促使piRNA攻擊相關(guān)轉(zhuǎn)座子,進而沉默該轉(zhuǎn)座子的基因轉(zhuǎn)錄過程。另外,在精子形成過程中,Miwi和piRNA與帽結(jié)合復(fù)合體聯(lián)結(jié),調(diào)節(jié)mRNA的穩(wěn)定性,影響翻譯。piRNA能夠沉默基因轉(zhuǎn)錄過程,例如,Erwin等[ 1 ]以發(fā)育不全患有D.virilis綜合癥的果蠅為研究對象,觀察到以下現(xiàn)象:轉(zhuǎn)座因子的效應(yīng)會隨著piRNA的增多而減小,不同親代在轉(zhuǎn)座因子的影響下其后代發(fā)育的情況也有很大差異,證實piRNA能夠使轉(zhuǎn)座子沉默,導(dǎo)致果蠅發(fā)育過程中部分基因的轉(zhuǎn)錄過程發(fā)生改變。Senti等[2]對果蠅卵巢中piRNA生物轉(zhuǎn)化途徑之間的相互關(guān)系進行分析,發(fā)現(xiàn)piRNA能使生殖細胞中的與卵子發(fā)生有關(guān)的轉(zhuǎn)座子沉默,影響原有基因的轉(zhuǎn)錄,從而影響卵子的產(chǎn)生。除此之外,piRNA能對翻譯過程進行調(diào)節(jié),Gou等[ 3 ]發(fā)現(xiàn)小鼠Miwi和piRNA與帽結(jié)合復(fù)合體聯(lián)結(jié)后,精子細胞中的mRNA被大規(guī)模清除,影響生殖細胞中部分mRNA的翻譯。
2 維持生殖系和干細胞功能
piRNA存在的主要場所是生殖細胞和干細胞,與Piwi亞家族蛋白結(jié)合形成piRNA復(fù)合物(piRC),目前,piRNA的功能主要是根據(jù)Piwi蛋白來推測的。Piwi有維持生殖系和干細胞的功能,Piwi亞家族主要由MIWI,MILI和MIWI2等特異蛋白組成,在精子的發(fā)育形成中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。三個特異性蛋白都出現(xiàn)在減數(shù)分裂時期,其中一個缺失,精子形成就會出現(xiàn)缺陷。小鼠MIWI2突變體和果蠅Piwi突變體的生殖細胞表型相同,證明了小鼠的MIWI2和果蠅的Piwi在維持生殖系和干細胞功能方面起著類似的作用。此外,piRNA在生殖細胞中的富集現(xiàn)象和Miwi突變種的雄性不育都體現(xiàn)出了piRNA與配子形成有關(guān)。例如,Gonzalez等[ 4 ]以果蠅為實驗對象,發(fā)現(xiàn)果蠅睪丸中的Piwi蛋白不僅能夠維持生殖系干細胞(GSC)也能維持體細胞囊腫干細胞(CySC)的發(fā)育,另外,Piwi蛋白對生殖系干細胞有一定的調(diào)節(jié)作用。如果降低果蠅睪丸中Piwi蛋白的活性,干細胞的分化就會受阻,干細胞功能也就不能實現(xiàn),影響睪丸中精子的形成。Pek等[5]發(fā)現(xiàn)在缺乏與piRNA沉默轉(zhuǎn)座子相關(guān)的蛋白時生殖系干細胞分裂將會被阻塞,不能順利完成分化過程。Zhao等[6]報道,piRNA與MIWI結(jié)合可以導(dǎo)致精子細胞中的泛素蛋白酶體降解。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),精細胞發(fā)育為成熟精子必須經(jīng)歷此過程,在MIWI缺失的情況下,精子將不會發(fā)育完全,因此,Miwi一旦發(fā)生突變,很可能會導(dǎo)致雄性不育現(xiàn)象的發(fā)生。
3 piRNA芯片技術(shù)
與其他非編碼小RNA相比,piRNA發(fā)現(xiàn)較晚,而且種類數(shù)目要遠多于其它小分子RNA,目前,我們對piRNA的了解尚淺。由于存在的許多問題沒有解決,piRNA的分析鑒定要比siRNA和miRNA都具有挑戰(zhàn)性。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷完善,芯片測序技術(shù)越發(fā)具有實用性,因此,研究人員可以通過應(yīng)用芯片技術(shù)對piRNA的生物學(xué)功能進行全面深入的研究。當前科學(xué)家們已經(jīng)成功的研究出針對各種哺乳動物的piRNA芯片,可以對piRNA的表達情況進行鑒定。例如,Busch等[7]利用微陣列芯片技術(shù)進行測序,檢測3個piRNAs(pir-30924,pi-57125,pir–38756)在腫瘤中的表達情況,發(fā)現(xiàn)非轉(zhuǎn)移性腫瘤中pir-57125較高,而轉(zhuǎn)移性腫瘤中pir-30924和pir–38756較多,此發(fā)現(xiàn)對患者的腫瘤性質(zhì)判斷以及治療方面有很大幫助。Chu等[8]以鄰近正常組織為對照通過基因芯片技術(shù)分析piRNA在膀胱癌組織中的表達情況,發(fā)現(xiàn)106 piRNAs的表達水平上調(diào),91piRNAs在膀胱癌組織中被抑制,其中piRNA DQ594040的顯著減少是引起膀胱癌的主要原因。Dharap等[9]應(yīng)用微陣列芯片技術(shù)分析成年老鼠大腦皮層在瞬態(tài)局部缺血狀態(tài)下的piRNAs,發(fā)現(xiàn)老鼠的105piRNAs表達方式發(fā)生改變,但部分piRNA在此狀態(tài)下是冗余的。piRNA芯片技術(shù)的應(yīng)用對piRNA自身生物功能的研究和人類疾病治療有不可替代的作用,隨著芯片技術(shù)的不斷發(fā)展,piRNA的生物起源和功能終將會被闡明。
4 展望
目前,人們對piRNA的研究已經(jīng)取得顯著進展,了解piRNA能在多水平(維持生殖系DNA 完整、沉默轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄過程、抑制翻譯、參與異染色質(zhì)的形成、執(zhí)行表觀遺傳調(diào)控和生殖細胞發(fā)生)對機體遺傳物質(zhì)的表達進行調(diào)控。但由于piRNA是目前已知的種類最為繁多的非編碼小RNA,這增加了piRNA研究的難度,當前人們對piRNAPiwi蛋白和piRNA的諸多結(jié)構(gòu)和功能信息尚不清楚,還需要更為深入全面的進行探究。piRNA與生物遺傳和生殖發(fā)育密切相關(guān),通過調(diào)節(jié)piRNA途徑可以影響相關(guān)動物的繁殖情況,拯救瀕危物種,進而更好的維持物種數(shù)目。piRNA對人類的疾病防治有至關(guān)重要的作用,癌癥患者體內(nèi)的特異piRNA較正常人有明顯不同,研究患者的特異piRNA特性,有助于為癌癥治療提供某些方法手段。隨著芯片技術(shù)或高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展,我們必將會對piRNA所具有的強大功能有一個更加深入和確切的認識,進而推動科技進步,造福全人類。
參考文獻
[1]Erwin AA, Galdos MA, Wickersheim ML,et al. piRNAs Are Associated with Diverse Transgenerational Effects on Gene and Transposon Expression in a Hybrid Dysgenic Syndrome of D. virilis[J]. PLOS Genetics,2015,11(8): e1005332.
[2] Senti KA,Jurczak D,Sachidanandam R, et al. piRNA-guided slicing of transposon transcripts enforces their transcriptional silencing via specifying the nuclear piRNA repertoire[J]. Genes& Development,2015,29(16): 1747-1762.
[3] Gou LT, Dai P, Yang JH, et al. Pachytene piRNAs instruct massive mRNA elimination during late spermiogenesis.Cell Res,2014,24(6): 680-700.
[4]Gonzalez J, Qi HY, Liu N, et al.Piwi Is a Key Regulator of Both Somatic and Germline Stem Cells in the Drosophila Testis[J]. Cell Rep,2015,12(1): 150-161.
[5]Pek JW, Kai T. Non-coding RNAs enter mitosis: functions, conservation and implications[J]. Cell Division,2011,6:6.
[6]Zhao S,Gou LT,Zhang M, et al. piRNA-Triggered MIWI Ubiquitination and Removal by APC/C in Late Spermatogenesis[J].Developmental Cell,2013,24(1):13-25.