朱麗平,許修宏,張文浩,成利軍,李洪濤,王紫琪,賀 寧
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,哈爾濱 150030)
牛糞堆肥中反硝化細(xì)菌與理化參數(shù)的關(guān)系
朱麗平,許修宏*,張文浩,成利軍,李洪濤,王紫琪,賀寧
(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院,哈爾濱 150030)
以nosZ基因?yàn)闃?biāo)記,應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳法(PCR-DGGE)對牛糞堆肥過程中反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,通過冗余分析(Redundancy analysis,RDA)法,分析反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化與堆肥過程中理化參數(shù)(堆體溫度、pH、含水率、氨態(tài)氮和硝態(tài)氮)之間的關(guān)系。結(jié)果表明,反硝化細(xì)菌群落的Shannon-Weaver指數(shù)在堆肥0~4 d升高,在7~29 d減小。對優(yōu)勢條帶進(jìn)行測序發(fā)現(xiàn)Alcaligenes存在于整個(gè)堆肥過程中,判定其為此過程中優(yōu)勢菌屬。反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在堆肥前期(0~4 d)變化較小,而在降溫腐熟期(23~29 d)變化劇烈。皮爾遜相關(guān)系數(shù)分析表明,反硝化細(xì)菌群落多樣性與含水率呈極顯著正相關(guān)關(guān)系(r= 0.960,P<0.01),與溫度呈顯著正相關(guān)關(guān)系(r=0.766,P<0.05)。
堆肥;反硝化細(xì)菌;理化參數(shù);群落結(jié)構(gòu);冗余分析
朱麗平,許修宏,張文浩,等.牛糞堆肥中反硝化細(xì)菌與理化參數(shù)的關(guān)系[J].農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào),2016,35(9):1781-1787.
ZHU Li-ping,XU Xiu-hong,ZHANG Wen-hao,et al.Correlationship between denitrifying bacteria and physicochemical factors in cow manure composting[J]. Journal of Agro-Environment Science,2016,35(9):1781-1787.
近年來,隨著我國農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè)的迅速發(fā)展,大量畜禽糞便和農(nóng)業(yè)秸稈露天放置,對環(huán)境造成了嚴(yán)重污染[1]。目前,采取了多種方式對禽畜糞便和農(nóng)作物秸稈進(jìn)行資源化處理,如將禽畜糞便加工成有機(jī)肥料、將秸稈進(jìn)行飼料化或材料化等[2],但好氧堆肥法仍然是處理有機(jī)固體廢棄物最有效的方式之一[3]。
在堆肥化過程中,反硝化細(xì)菌能夠?qū)⑾跛猁}轉(zhuǎn)化成氣態(tài)氮(NO、N2O、N2)[4],不僅會(huì)造成空氣污染,同時(shí)還降低了堆肥品質(zhì)。參與反硝化過程的還原酶主要有4種[5],其中的nosZ基因催化N2O還原成N2[6],能夠有效減少溫室氣體的排放,因此,在反硝化過程中,以nosZ基因?yàn)闃?biāo)記,分析反硝化細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)變化,對研究堆肥過程中氮素轉(zhuǎn)化過程及規(guī)律具有重要的意義。近些年來,雖然在研究堆肥化過程中的反硝化菌方面取得了很大的進(jìn)展[2,7],但對堆肥過程中理化參數(shù)與反硝化菌群之間關(guān)系的研究尚少。
本研究采用牛糞與稻草秸稈進(jìn)行好氧堆肥實(shí)驗(yàn),對堆肥過程中溫度(T)、pH、含水率、氨態(tài)氮(NH+4-N)、硝態(tài)氮(-N)等理化參數(shù)進(jìn)行參數(shù)測定。通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳技術(shù)(PCRDGGE)來研究以nosZ基因?yàn)闃?biāo)記的反硝化細(xì)菌的群落動(dòng)態(tài)變化,應(yīng)用冗余分析(Redundancyanalysis,RDA)方法研究堆肥過程中反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與理化參數(shù)之間的相關(guān)性,利用皮爾遜相關(guān)系數(shù)法分析反硝化細(xì)菌群落多樣性與理化參數(shù)的相關(guān)性,并分析影響菌群變化的驅(qū)動(dòng)因子。
1.1堆肥實(shí)驗(yàn)與樣品采集
堆肥實(shí)驗(yàn)中的牛糞與水稻秸稈均來自哈爾濱市農(nóng)場,堆肥材料主要成分見表1。將水稻秸稈剪成小段(3~5 cm),便于與牛糞的充分混勻,秸稈與牛糞按照干重比1∶3進(jìn)行充分混合,并且將混合物料的含水率調(diào)節(jié)為60%~65%,置于實(shí)驗(yàn)室自制的堆肥模擬容器中進(jìn)行發(fā)酵,堆肥過程中定期進(jìn)行翻堆,整個(gè)堆肥過程共持續(xù)30 d。
表1 堆肥材料的主要成分Table 1 Properties of raw materials for composting
在堆體的上中下三層的不同位置分別在第0、1、4、7、13、23、29 d取樣并混勻(7個(gè)樣品),以堆肥天數(shù)為樣品標(biāo)號。在堆肥第3、5、11、21 d進(jìn)行翻堆。7個(gè)樣品分為兩部分保存,一部分用于理化參數(shù)的測定,另一部分放于-80℃用于分子實(shí)驗(yàn)分析。
1.2堆肥理化參數(shù)的測定
在堆體上、中、下三層的不同位置,使用精密溫度計(jì)分別測其溫度并取平均值,同時(shí)記錄下室溫。堆體含水率的測定采用恒重法,將7個(gè)堆肥樣品在105℃下烘干24 h,然后進(jìn)行計(jì)算,得出含水率數(shù)值。pH的測定是將每個(gè)堆肥樣品稱取1 g,按1∶10(質(zhì)量濃度)加入去離子水,150 r·min-1下振蕩30 min后在10 000 r·min-1進(jìn)行離心,離心15 min后過濾,濾液用數(shù)字pH儀器測定。NH+4-N含量根據(jù)鮑士旦[8]的農(nóng)化分析方法進(jìn)行測定,-N含量采用酚二磺酸比色法進(jìn)行測定[9]。
1.3DNA提取、純化
用實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)的CTAB法對堆肥樣品總DNA進(jìn)行提?。?0],使用OMEGA純化試劑盒對粗提取的總DNA進(jìn)行回收、純化,檢測純化結(jié)果后于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4PCR擴(kuò)增
堆肥過程中反硝化細(xì)菌的檢測以nosZ基因?yàn)闃?biāo)記,選用引物對nosZ-F/nosZ-1622R進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并且在nosZ-1622R的5′端添加GC夾[11]。PCR擴(kuò)增,體系為50 μL,其中:10×PCR Buffer 5 μL,dNTP 5 μL,模板1 μL,Taq酶0.6 μL,上下游引物各 0.8 μL,ddH2O補(bǔ)足至50 μL。擴(kuò)增條件為:預(yù)變性5 min(95℃);35個(gè)循環(huán)中再次變性45 s(95℃),退火45 s(61℃),延伸1 min(72℃);最后再延伸10 min(72℃)[12],于4℃下保存并停止反應(yīng)。
1.5DGGE及條帶測序
應(yīng)用DcodeTM系統(tǒng)對PCR產(chǎn)物進(jìn)行DGGE實(shí)驗(yàn)。使用尿素濃度范圍為35%~70%的8%聚丙烯酰胺凝膠(丙烯酰胺∶雙丙烯酰胺=37.5∶1,m/V)。電泳條件:在60℃恒溫的1×TAE電泳緩沖液中,120 V恒定電壓下電泳12 h[11]。電泳結(jié)束后,將DGGE膠進(jìn)行染色并拍照。切下主要條帶溶于水后,用不帶GC夾子的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并測序。
測序結(jié)果提交至GenBank獲得基因登錄號,用BLAST比對出同源性最高的序列并下載,使用MEGA4.0程序的鄰接法(Neighbor-Joining)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
1.6數(shù)據(jù)處理
DGGE圖譜分析采用Quantity One 4.6.2軟件,根據(jù)公式H=-ΣPiln Pi計(jì)算出反硝化細(xì)菌的多樣性指數(shù)(H);反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化與理化參數(shù)的相關(guān)性分析采用Canoco 4.5軟件分析,首先對分析數(shù)據(jù)進(jìn)行除趨勢對應(yīng)分析(Detrended correspondence analysis,DCA),當(dāng)排序軸的梯度長度相對較短時(shí)(<2),選用冗余分析方法進(jìn)行分析[13],應(yīng)用Canodraw 4.5程序?qū)⑸傻臄?shù)據(jù)文件進(jìn)行作圖分析[14];利用SPSS17.0軟件中皮爾遜相關(guān)系數(shù)法分析反硝化細(xì)菌群落多樣性與理化參數(shù)之間的相關(guān)性。
2.1理化參數(shù)的變化
圖1為堆肥過程中溫度變化,根據(jù)堆肥過程中溫度的變化可以將堆肥過程分為三個(gè)階段:0~3 d為升溫期;4~12d為高溫期;13~29d為降溫腐熟期。堆肥開始后溫度逐漸升高,在第5 d時(shí)達(dá)到最高溫57.6℃,并且溫度超過55℃的堆肥時(shí)間持續(xù)了5 d,可在堆肥過程中殺死各種病原菌,滿足基本的堆肥衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)[15]。堆體溫度在堆肥第13 d開始迅速下降,且在堆肥后期(13~29 d)溫度變化趨于平穩(wěn),堆肥過程結(jié)束時(shí)溫度接近于室溫。堆肥過程中溫度的變化與堆體內(nèi)微生物活性息息相關(guān),二者相互影響,微生物的大量活動(dòng)導(dǎo)致堆體溫度升高,同時(shí)高溫也會(huì)影響微生物體內(nèi)的酶活。所以,溫度既是影響堆肥過程中微生物群落變化的重要因素,也是評價(jià)堆肥是否達(dá)到穩(wěn)定化的重要條件[16]。
圖1 堆肥過程中溫度變化Figure 1 Changes of temperature during composting process
圖2為堆肥過程中含水率與pH的變化。堆肥過程中含水率的變化始終保持在40%~70%的范圍內(nèi),整體呈現(xiàn)下降的趨勢,在堆肥初期(0 d)堆肥含水率最大,達(dá)到65.7%,隨著堆體溫度升高,含水率逐漸變小,在堆肥結(jié)束時(shí)達(dá)到最低值42.1%。水分不僅直接影響堆體內(nèi)微生物的代謝,而且會(huì)影響堆肥的腐熟速度[15]。堆肥過程中的pH變化在8.06~8.57之間,在堆肥第1 d降至最低值(8.06),第7 d時(shí)達(dá)到最大值(8.57),在堆肥后期(13~29 d)逐漸下降。因?yàn)樵诙逊食跗?,微生物分解大量有機(jī)物的過程中產(chǎn)生有機(jī)酸,使得堆體pH值降低;后期有機(jī)酸的降解及NH+4-N的大量積累使得堆體pH逐漸升高[8]。
圖3為NH+4-N和-N含量變化。NH+4-N含量在堆肥前期(0~4 d)升高而在堆肥后期(7~29 d)呈迅速降低的變化趨勢,其含量從堆肥起始階段(0 d)的767 mg·kg-1迅速增加到第4 d時(shí)的最大值1159 mg· kg-1;隨著堆肥的進(jìn)行,堆體溫度逐漸升高,大量NH3揮發(fā)[17],從而導(dǎo)致NH+4-N的含量迅速減少(4~29 d),堆肥結(jié)束時(shí)降至最小值453 mg·kg-1。而-N含量在整個(gè)堆肥過程中呈現(xiàn)上升趨勢,在堆肥初期-N含量僅為105 mg·kg-1,可能是由于在初期(0~3 d)某些具有硝化作用的微生物的活性受到了高溫以及NH+4-N大量積累的抑制,致使-N的生成速度減緩[18]。在堆肥4 d以后-N含量迅速增加,堆肥結(jié)束時(shí)達(dá)到425 mg·kg-1。
圖2 堆肥過程中pH和含水率變化Figure 2 Changes of pH and water content during composting process
圖3 堆肥過程中NH+-N和NO--N變化43Figure 3 Changes of NH+-N and NO--N during43composting process
2.2 DGGE圖譜分析
不同時(shí)期的堆肥樣品PCR產(chǎn)物經(jīng)DGGE分離,其結(jié)果如圖4所示。圖中字母代表?xiàng)l帶編號,在7個(gè)泳道上共識別出8條特異性的條帶。堆肥前期(0~7 d)樣品條帶的分布與后期(13~29 d)分布的差異性較大,說明隨著堆肥的進(jìn)行,反硝化細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)發(fā)生了明顯的變化。在堆肥過程中,每個(gè)時(shí)期均有條帶G出現(xiàn),說明其具有較強(qiáng)的耐受性,為堆肥過程中的優(yōu)勢種群;條帶B、C和F僅在堆肥高溫期出現(xiàn),是高溫期的特異性條帶,具有較強(qiáng)的耐高溫性。
2.3多樣性分析
不同時(shí)期反硝化細(xì)菌群落的多樣性指數(shù)應(yīng)用Shannon-Weaver公式進(jìn)行計(jì)算[19],其結(jié)果如表2所示。反硝化細(xì)菌的多樣性總體呈現(xiàn)先增加后降低的趨勢。在堆肥開始時(shí),反硝化細(xì)菌的多樣性指數(shù)呈整個(gè)堆肥過程中的最低值1.803,隨著堆肥的進(jìn)行,反硝化細(xì)菌的多樣性逐漸升高,在高溫期(第4 d)達(dá)到最大值2.536,在堆肥后期多樣性指數(shù)有所下降。這是由于堆肥前期堆體內(nèi)營養(yǎng)物質(zhì)含量相對較為豐富,對反硝化細(xì)菌的生長較為有利;然而,不同菌屬的反硝化細(xì)菌對溫度等理化參數(shù)的敏感程度不盡相同,某些菌屬因適應(yīng)不了高溫或因營養(yǎng)物質(zhì)的減少而被淘汰,使得反硝化細(xì)菌的多樣性呈現(xiàn)高低不同的趨勢[20]。
圖4 堆肥樣品的DGGE圖譜Figure 4 DGGE profile of compost samples
2.4系統(tǒng)發(fā)育分析
要想在實(shí)際工作中實(shí)現(xiàn)對生產(chǎn)規(guī)模的提升,就應(yīng)該進(jìn)行必要的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn),只有這樣才能在實(shí)際工作中實(shí)現(xiàn)對農(nóng)產(chǎn)品成本的顯著控制與降低。而要想達(dá)成當(dāng)前的工作目標(biāo),培育和發(fā)展新型經(jīng)營主體是一項(xiàng)十分重要的環(huán)節(jié)。當(dāng)前很多新型經(jīng)營主體對于這一工作還缺乏必要的認(rèn)識,導(dǎo)致出現(xiàn)了很多問題。
將8個(gè)成功測序的序列結(jié)果提交給Genbank并獲得登錄號:KU246118-KU246125。使用MEGA 4.0建立系統(tǒng)發(fā)育樹,其結(jié)果如圖5所示。所有的條帶測序結(jié)果與BLAST數(shù)據(jù)庫中比對的序列同源性菌高于55%。在堆肥過程中,條帶G測序結(jié)果與產(chǎn)堿菌屬(Alcaligenes)有較高的相似性,在堆肥各個(gè)時(shí)期始終出現(xiàn),是堆肥過程中的優(yōu)勢菌屬;條帶E和A分別在堆肥初期(1 d)和后期(13 d)被檢測到,經(jīng)測序與副球菌屬(Paracoccus)和固氮螺菌屬(Azospirillum)有較高的相似性;條帶B、C和F僅在高溫期出現(xiàn),其測序結(jié)果分別與無色桿菌屬(Achromobacter)、未培養(yǎng)細(xì)菌和假單胞菌屬(Pseudomonas)有較高的同源性。
2.5理化參數(shù)與反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的相關(guān)性分析
堆肥過程中反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與理化參數(shù)的冗余分析結(jié)果如圖6。前2個(gè)排序軸分別解釋了57.5%和21.1%的反硝化細(xì)菌種群變化,說明這些理化參數(shù)對堆肥過程中反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的變化有顯著的影響。在RDA二維排序結(jié)果中,帶箭頭的矢量線表示不同的理化參數(shù),圓圈代表在不同堆肥天數(shù)時(shí)取樣樣品。箭頭的矢量線長度可以表示不同理化參數(shù)與物種之間的相關(guān)性,其矢量線越長,相關(guān)性就越大,反之則越小[21]。從RDA排序圖中可以看出,含水率、硝態(tài)氮和氨態(tài)氮三個(gè)參數(shù)的連線相對較長,說明在堆肥過程中這些因素對反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化的影響較大。在RDA分析中,圓圈之間的距離表示菌落結(jié)構(gòu)的差異性,圓圈間連線越短,差異性越?。?3]。由此可知,反硝化細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)在堆肥前期(0~4 d)變化較小。在降溫腐熟期(23~29 d)變化則較為劇烈。
表2 反硝化細(xì)菌的多樣性指數(shù)Table 2 Diversity index of denitrifying bacteria
圖5 反硝化細(xì)菌的系統(tǒng)進(jìn)化樹Figure 5 Phylogenetic tree of denitrifying bacteria
圖6 反硝化細(xì)菌種群變化與理化參數(shù)的RDA圖Figure 6 RDA of denitrifying bacteria community and physic-chemical parameters
堆肥過程中理化參數(shù)(含水率、硝態(tài)氮和氨態(tài)氮)對反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化有不同程度的影響。含水率與堆肥中溶解氧的濃度密切相關(guān),當(dāng)含水率較大時(shí),堆體中溶解氧濃度較低[22],利于反硝化菌的生長,因?yàn)槎鄶?shù)反硝化菌屬厭氧微生物。在堆肥初始階段(0~3 d),堆體含水率較大,在一定程度上使得堆體內(nèi)成厭氧或缺氧的狀態(tài),因而反硝化菌的生長較為穩(wěn)定,其群落結(jié)構(gòu)變化較小;在堆肥后期(4~29 d),含水率降低使得溶氧量相對較高,使得堆體內(nèi)的反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生了較大的變化。
過去的研究中,有學(xué)者發(fā)現(xiàn),硝態(tài)氮含量可以影響反硝化速率與菌群的群落結(jié)構(gòu)變化[23]。在本文中,硝態(tài)氮與反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)有一定的相關(guān)性,也有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),反硝化細(xì)菌的變化與硝態(tài)氮濃度并無顯著的相關(guān)性[24]。這些結(jié)果表明,在不同的環(huán)境條件下,硝態(tài)氮濃度對反硝化細(xì)菌群落變化的影響存在顯著性的差異。堆肥的前期(0~4 d),堆肥中反硝化細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)變化較小,在此階段中,供反硝化細(xì)菌作用的營養(yǎng)物質(zhì)相對較多,反硝化細(xì)菌作用時(shí)相對穩(wěn)定,所以,群落結(jié)構(gòu)變化不大,其硝態(tài)氮含量逐漸積累增加;但在堆肥后期(23~29 d),反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化卻很大,其原因可能是因?yàn)槎逊屎笃跔I養(yǎng)物質(zhì)的減少以及大量硝態(tài)氮的積累,對反硝化細(xì)菌的作用產(chǎn)生了一定程度的影響。所以,反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化與理化因子之間的關(guān)系還需更多的研究。氨態(tài)氮表面上雖然與反硝化細(xì)菌的作用并無直接聯(lián)系,但在氨態(tài)氮氧化生成硝態(tài)氮的過程中,會(huì)產(chǎn)生大量N2O氣體,此氣體作為反硝化功能基因(nosZ)的底物,其含量多少會(huì)對反硝化細(xì)菌的作用產(chǎn)生影響。胡春曉等[25]也在對農(nóng)業(yè)廢棄物好氧堆肥過程的研究中發(fā)現(xiàn),氨態(tài)氮濃度與nosZ基因呈顯著正相關(guān)關(guān)系。
反硝化細(xì)菌的變化,不僅體現(xiàn)在其群落結(jié)構(gòu)與理化參數(shù)的相關(guān)性,還有反硝化細(xì)菌群落多樣性與理化參數(shù)之間的相關(guān)性。理化參數(shù)與反硝化細(xì)菌群落多樣性的皮爾遜相關(guān)性分析結(jié)果如表3所示。堆肥過程中反硝化細(xì)菌群落多樣性與含水率呈極顯著正相關(guān)關(guān)系(r=0.960,P<0.01),說明隨著含水率的變大,反硝化細(xì)菌的群落多樣性呈現(xiàn)顯著性的增加,反之則減少;溫度與反硝化細(xì)菌群落多樣性呈顯著正相關(guān)關(guān)系(r= 0.766,P<0.05),說明隨著溫度的增加,反硝化細(xì)菌多樣性也增加,反之則呈下降的趨勢。但溫度卻不是影響反硝化細(xì)菌多樣性的最主要因素,溫度的變化通過對溶氧量及含水率等因素的影響,從而對反硝化細(xì)菌的多樣性有一定程度的影響[26-28]。含水率對反硝化細(xì)菌群落多樣性的影響呈現(xiàn)了極顯著的相關(guān)性,說明反硝化細(xì)菌群落多樣性對堆體內(nèi)含水率的大小敏感程度很大,其細(xì)微的變化就能引起多樣性的改變。
表3 理化參數(shù)與反硝化細(xì)菌群落多樣性的皮爾遜相關(guān)分析Table 3 Pearson correlations between physic-chemical parameters and diversity index of denitrifying bacteria
溫度也可以對其他理化參數(shù)產(chǎn)生影響,從而間接地影響微生物的代謝活動(dòng)。在堆肥過程中,溫度的變化使得堆體內(nèi)含水率有所不同,其含水率的大小與溶氧濃度存在著一定的相關(guān)性。堆體內(nèi)含水率較大時(shí),溶氧濃度相對較低,反之溶氧量含量較高[29]。有大量的研究表明,當(dāng)溶解氧濃度在一定的范圍內(nèi)時(shí),反硝化細(xì)菌的活性不會(huì)受到溶解氧濃度的影響[30];當(dāng)溶解氧的濃度低于某個(gè)值的時(shí)候,反硝化細(xì)菌的活性隨著溶解氧濃度的降低而升高。這就說明影響反硝化細(xì)菌活性的溶解氧濃度存在著一個(gè)極限值,也稱為閾值[31]。堆肥過程溶氧的變化可能受堆肥水分的影響,因此堆肥過程中反硝化細(xì)菌群落多樣性隨含水率的變大而升高。
(1)在牛糞堆肥過程中,反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在堆肥前期(0~4 d)變化較小,在堆肥后期(23~29 d)變化較為劇烈;反硝化細(xì)菌群落多樣性總體呈現(xiàn)先升高(0~4 d)后降低的趨勢(23~29 d);
(2)Alcaligenes(條帶G)存在于整個(gè)堆肥過程中,有較強(qiáng)的耐受性,是堆肥過程中反硝化細(xì)菌的優(yōu)勢種屬;Achromobacter(條帶B)、未培養(yǎng)細(xì)菌(條帶C)和Pseudomonas(條帶F)僅出現(xiàn)在堆肥高溫期,具有較強(qiáng)的耐高溫性,是高溫階段的優(yōu)勢性菌屬。
(3)堆體含水率、硝態(tài)氮和氨態(tài)氮對群落結(jié)構(gòu)變化有著不同程度的影響。含水率與反硝化細(xì)菌群落多樣性呈極顯著正相關(guān)關(guān)系,溫度與反硝化細(xì)菌群落多樣性呈顯著正相關(guān)關(guān)系。
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Correlationship between denitrifying bacteria and physicochemical factors in cow manure composting
ZHU Li-ping,XU Xiu-hong*,ZHANG Wen-hao,CHENG Li-jun,LI Hong-tao,WANG Zi-qi,HE Ning
(School of Resources and Environmental Sciences,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China)
In the present paper,the community structure of denitrifying bacteria during cow manure composting process was analyzed by polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis(PCR-DGGE)based on the nosZ gene.The relationship between the changesofdenitrifyingbacteria community structure and the physic-chemical parameters(temperature,pH,water content was evaluated by redundancy analysis(RDA).Results showed that the Shannon-Weaver index of denitrifying bacteria increased during 0~4 d but decreased during 7~29 d of the composting.Based on the sequencing of dominant bands,Alcaligenes were the dominant species during composting.Redundancy analysis(RDA)showed that the community structure of dinitrifying bacteria changed little at the early stage of composting(0~4 d),while it changed dramatically in the maturity stage of composting(23~29 d).Pearson correlation analysis showed that denitrifying bacteria community diversity was extremely significantly positively correlated with water content(r=0.960,P≤0.01),and significantly positively correlated with temperature(r=0.766,P≤0.05).
compost;denitrifier;physico-chemical parameter;bacterial community structure;redundancy analysis
X713
A
1672-2043(2016)09-1781-07doi:10.11654/jaes.2016-0250
2016-03-01
國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31272484,31372351)
朱麗平(1990—),女,碩士,研究方向?yàn)槲⑸?。E-mail:502348499@qq.com
許修宏E-mail:xuxiuhong@neau.edu.cn