李保娣 李紅育 張慧 于德山 何健
730000 蘭州,甘肅省疾病預(yù)防控制中心
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·論著·
2013-2015年度甘肅省流感病毒病原學(xué)特征分析
李保娣 李紅育 張慧 于德山 何健
730000 蘭州,甘肅省疾病預(yù)防控制中心
目的 分析甘肅省2013-2015年流行性感冒(流感)的流行特征,為今后的流感防控工作提供科學(xué)依據(jù)。方法 采集全省19家國家級流感監(jiān)測哨點醫(yī)院門診流感樣病例(influenza-like illness,ILI)的咽拭子,以熒光定量PCR方法檢測病毒核酸,核酸檢測陽性標(biāo)本用犬腎細(xì)胞(MDCK)進(jìn)行病毒分離培養(yǎng)鑒定。結(jié)果 對37 332份ILI咽拭子進(jìn)行流感病毒核酸檢測,陽性5 928份,陽性率為15.88%;2013年第14周-2016年第13周三個監(jiān)測年度流感病毒核酸陽性率依次為14.52%、12.36%和20.15%。按年齡組分析,<5歲嬰幼兒陽性率最低為12.78%,顯著低于其他年齡組;15-24歲陽性率最高為24.75%。對6 285份標(biāo)本進(jìn)行了流感病毒分離,分離到流感病毒1 630株,檢出率為25.93%,其中395株甲型H1N1、524株季節(jié)性H3N2、342株乙型Victorian系、367株乙型Yamagata系。結(jié)論 甘肅省流感病毒型別表現(xiàn)為交替流行規(guī)律,應(yīng)積極采取綜合性防控措施。
Fundprogram:NationalScienceandTechnologyMajorProjectforInfectiousDiseaseResearchofChina(2012ZX10004-208)
流行性感冒(流感)是由流感病毒引起的急性呼吸道傳染病,其傳播速度快,易在人群中引起大范圍流行、季節(jié)性流行及反復(fù)流行。2009年9月以來,甘肅省國家級流感監(jiān)測哨點醫(yī)院及網(wǎng)絡(luò)實驗室構(gòu)成了覆蓋全省所有市州的監(jiān)測體系。本研究旨在分析2013-2015年甘肅省流感病毒病原學(xué)特征,探討其流行規(guī)律,為全省流感預(yù)防控制提供參考。
1.1 病例定義 流感樣病例(influenza-likeillness,ILI):發(fā)熱(體溫≥38 ℃),伴咳嗽或咽喉疼痛等癥狀之一,缺乏其他實驗室診斷依據(jù)者。
1.2 流感病例哨點監(jiān)測 全省19家國家級流感監(jiān)測哨點醫(yī)院報告ILI病例,采集ILI標(biāo)本,甘肅省疾病預(yù)防控制中心及各市州疾病預(yù)防控制中心進(jìn)行病原學(xué)檢測并錄入系統(tǒng),暴發(fā)疫情監(jiān)測數(shù)據(jù)由疫情發(fā)生地疾病預(yù)防控制中心報告。
按照《全國流感監(jiān)測方案》(2010版)要求,采集發(fā)病3d之內(nèi)未使用抗病毒類藥物的ILI咽拭子,每年10月1日-次年3月31日每家哨點醫(yī)院每周采集10-15份,4-9月每月采集5-15份標(biāo)本。采集的咽拭子24h內(nèi)送至網(wǎng)絡(luò)實驗室,于4 ℃或-70 ℃以下保存,全過程避免標(biāo)本反復(fù)凍融。
1.3 病原學(xué)檢測
1.3.1 病毒RNA提取:用RneasyMiniKit(德國Qiagen公司)提取核酸,操作按試劑盒說明書進(jìn)行。
1.3.2 流感病毒核酸檢測:均使用Real-timePCR方法檢測,首先檢測甲型流感、乙型流感;甲型流感陽性再進(jìn)一步檢測甲型H1N1流感、季節(jié)性H1和H3流感;乙型流感陽性再進(jìn)一步進(jìn)行Victorian和Yamagata分型檢測。使用的引物和探針為中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所提供,擴(kuò)增試劑盒為德國Qiagen公司生產(chǎn),所有操作均按照試劑盒說明書進(jìn)行。
1.3.3 流感病毒分離鑒定:核酸檢測陽性標(biāo)本經(jīng)無菌處理后接種于狀態(tài)良好的MDCK細(xì)胞和(或)雞胚進(jìn)行流感病毒分離培養(yǎng),然后用血凝(HA)和血凝抑制法(HI)鑒定流感病毒的型別及亞型。
1.4 主要儀器設(shè)備 實時熒光PCR儀(ABI7500/7300儀)、SIGMA3-18K離心機(jī)、倒置顯微鏡(奧林巴斯)等。
1.5 統(tǒng)計學(xué)方法 數(shù)據(jù)采用Excel2010 和SAS9.1軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。不同樣本類型的陽性率比較用χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 流感病毒核酸檢測結(jié)果 2013-2015年度共檢測ILI咽拭子標(biāo)本37 332份,流感病毒核酸檢測陽性5 929份,陽性率為15.88%;其中:乙型流感2 588份,占總陽性數(shù)的43.66%;季節(jié)性H3N2陽性1 724份,占29.08%;甲型H1N1為1 600份,占26.99%。按年統(tǒng)計,2015年陽性率最高(20.15%),2013年次之(14.53%),2014年陽性率最低(12.36%),詳見表1、圖1。按標(biāo)本來源分,哨點醫(yī)院送檢的ILI標(biāo)本36 193份,陽性率15.41%;非哨點醫(yī)院送檢的ILI標(biāo)本856份,陽性率22.43%;暴發(fā)疫情報告病例送檢的ILI標(biāo)本283份,陽性率56.89%;詳見表2。
2013-2015年,甘肅省共報告流感/ILI暴發(fā)疫情23起,其中20起發(fā)生在中小學(xué)校及托幼機(jī)構(gòu),占總疫情數(shù)的86.96%。所有疫情共檢測標(biāo)本283份,流感病毒核酸檢測陽性161份,陽性率為56.89%,其中96份乙型、42份季節(jié)性H3N2、22份甲型H1N1、1份混合型(季節(jié)性H3N2和乙型流感混合)。所有疫情共報告發(fā)病數(shù)718例,死亡2例,其中甲型H1N1流感暴發(fā)疫情6起、死亡2例,其他型流感暴發(fā)疫情17例。
表1 2013-2015年度甘肅省流感病毒核酸檢測結(jié)果
注:N:數(shù)量;L:占總陽性數(shù)的百分比
Note: N: number; L: percentage of total positive number
圖1 2013年4月-2016年3月甘肅省流感流行特征Fig.1 Influenza epidemic characteristics of Gansu province from April 2013 to March 2016
標(biāo)本來源Specimensource檢測數(shù)Testnumber陽性數(shù)Positivenumber陽性率Positiverate(%)甲型N1N1A(H1N1)季節(jié)性H3N2SeasonalH3N2乙型InfluenzaB混合型Mixedtype哨點醫(yī)院Sentinelhospital36193557615.4114851652242711ILI暴發(fā)疫情ILIoutbreak28316156.892242961非哨點醫(yī)院Nonsentinelhospital85619222.439330654合計total37332592915.8816001724258816
注:哨點醫(yī)院采集標(biāo)本陽性率顯著低于ILI暴發(fā)疫情的陽性率(χ2=364.593,P<0.01)
Note: Positive rate of sentinel hospitals was significantly lower than that of the outbreak of ILI (χ2=364.593,P<0.01)
表3 2013-2015年度甘肅省不同年齡人群ILI標(biāo)本核酸檢測
2.2 分年齡ILI的檢測結(jié)果 將ILI標(biāo)本按年齡分為5組(0-、5-、15-、25-和60-歲組)統(tǒng)計,0-4歲組流感病毒陽性率最低(12.78%);5-14歲組流感病毒陽性率最高(24.75%);60歲以上組陽性數(shù)最少,占總陽性數(shù)的3.85%。經(jīng)統(tǒng)計學(xué)檢驗,各年齡組ILI病例中病毒核酸陽性率與總體陽性率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=663.013,P<0.01);5-14歲組病例流感病毒核酸陽性率與其他年齡組陽性率差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=96.972-622.864,P<0.01);其余各年齡組流感病毒核酸陽性率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.042-5.436,P>0.05)詳見表3。
2.3 流感病毒分離結(jié)果 2013-2015年甘肅省對6285份標(biāo)本進(jìn)行了流感病毒分離培養(yǎng),分離到流感病毒1 630株,檢出率為25.93%;其中395株甲型H1N1、524株季節(jié)性H3N2、342株乙型Victorian系、367株乙型Yamagata系;有兩株待定型,其中1株為甲型H1N1和乙型Victorian系混合株。全甘肅省除敦煌市外其余15家網(wǎng)絡(luò)實驗室均具備病毒分離能力,2015年全省分離病毒數(shù)最多(765株),檢出率為43.61%,三個監(jiān)測年度流感病毒檢出率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=468.055,P<0.01),詳見表4。
表4 2013-2015年度甘肅省流感病原學(xué)監(jiān)測陽性率及病毒型別分布
2.4 病原學(xué)分布特征 2013-2015年分離到的流感陽性毒株數(shù)分別為356株、509株和765株。2013年4-10月僅檢出2例甲型H1N1,11-12月以乙型Yamagata系為主;隨后2014年1-5月甲型H1N1毒株增多,與乙型Yamagata系共同成為優(yōu)勢株,6-11月甘肅省未有陽性毒株檢出,12月份開始季節(jié)性H3N2突然增多直至2015年2月底一直為優(yōu)勢毒株;2015年3-5月乙型Yamagata系又重新取代季節(jié)性H3N2而成為優(yōu)勢株,6-11月全省亦未有陽性毒株檢出,至此,甲型H1N1在甘肅省內(nèi)連續(xù)19個月未檢出陽性,12月份檢出2例乙型Yamagata系;2016年1-3月,甲型H1N1、乙型流感同時作為優(yōu)勢株而持續(xù)增加,且乙型Victorian系比例均大于乙型Yamagata系,同時,季節(jié)性H3N2也經(jīng)常檢出,且在2月份檢出達(dá)到20株。
2009年甲型H1N1流感流行之后,甘肅省流感流行季節(jié)流感流行毒株主要以乙型和季節(jié)性H3N2型交替形式出現(xiàn),其中乙型Victorian系和乙型Yamagata系也呈交替流行,直至2015監(jiān)測年度后期,甲型H1N1型流感毒株又重新出現(xiàn)并與其他型系毒株共同流行。
2009年以來,甘肅省為應(yīng)對流感防控新形勢,形成了覆蓋全省所有地州市的高效、敏感的流感監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)。從2013-2015年ILI年齡分布來看,甘肅省流感發(fā)病例數(shù)最高的人群是0-4歲的嬰幼兒,其次為5-14歲的青少年兒童,這與我省前幾年監(jiān)測結(jié)果[1]相同,也與我國其他地區(qū)及歐美北方地區(qū)流感流行特征研究結(jié)果[2-4]相一致。高度重視醫(yī)療機(jī)構(gòu)ILI標(biāo)本的采樣質(zhì)量,可以一定程度提高ILI陽性率。
甘肅省為典型北方省份,夏秋季(5-9月份)流感樣病例數(shù)少,流感毒株檢出率低;每年11月份開始ILI呈上升趨勢,12月份和次年2月份流行達(dá)到高峰,呈明顯的季節(jié)性、單峰性流行,流行強(qiáng)度受當(dāng)年流感病毒活動優(yōu)勢型別、人群免疫狀況等因素的影響;提示甘肅省冬春季12-2月份流感高峰前需加強(qiáng)流感監(jiān)測,特別加強(qiáng)學(xué)校等學(xué)齡兒童聚集場所的監(jiān)測工作,防止暴發(fā)疫情的發(fā)生。
2014年5月份之后甘肅省流感流行主要以B型和A(H3N2)型為主,到2016年1月份以后甲型H1N1再次流行,在2009年之前人群中流行的季節(jié)性H1N1流感從2010年之后再未檢測到,可能已經(jīng)被甲型H1N1流感毒株所替代。今后甘肅省流感監(jiān)測需嚴(yán)防甲型H1N1和其他流感舊毒株的再流行及新型毒株的出現(xiàn)。毒株的雞胚分離培養(yǎng)及暴發(fā)疫情處置需要完善。
傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)收集和分析方法結(jié)合大數(shù)據(jù)在公共衛(wèi)生領(lǐng)域的應(yīng)用必然會改變現(xiàn)在疫病防控被動的局面[5]。加強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)實驗室質(zhì)量控制,切實做好流感監(jiān)測工作,及時掌握流感的活動情況,明確流行株并及早發(fā)現(xiàn)變異株,為季節(jié)性流感的流行、流感大流行的預(yù)警預(yù)測提供依據(jù)[6,7]。
[1] 李紅育,張慧,姜中毅,等.2009-2012年甘肅省流感監(jiān)測病原學(xué)結(jié)果分析[J].中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志,2014,28(2):120-122. doi:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2014.02.015.
[2] 高燕,方立群,張勇,等.中國大陸季節(jié)性流感活動的時空分布特征[J].中華流行病學(xué)雜志,2009,30(11):1097-1101. doi:10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2009.11.001.
[3] Viboud C,Wladimir JA.Simonsen L.Influenza in tropical regions[J].PloS Med,2006,3 (4):1097-1101468-471e89 0468-0471. doi:10.1371/journal.pmed.0030089.
[4] Arkema JM, Meijer A, Meerhoff TJ,et al.Epidemiological and virological assessment of influenza activity in Europe,during the 2006-2007 winter[J].Euro Surveill, 2008,13(34):pii=18958. Available online: http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=18958.
[4] 鄒曉輝,朱聞斐,楊磊,等.谷歌流感預(yù)測—大數(shù)據(jù)在公共衛(wèi)生領(lǐng)域的嘗試[J].中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志, 2015,49(6):581-584.doi:10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2015.06.026.
[6] Centers for Disease Control and Prevention.[EB/OL].[2007-02-21].http://www.cdc.gov/flu/weekly/pdf/flu surveillance overview.pdf.
[7] Monto AS,Comanor L,Shay DK, et al. Epidemiology of pandemic influenza: use of suiveillance and modeling for pandemic preparedness[J].J Infect Dis,2006,194(Suppl2):S92-S97. doi: 10.1086/507559.
Analysis on the pathogenic characteristics of influenza viruses in Gansu Province,2013-2015
LiBaodi,LiHongyu,ZhangHui,YuDeshan,HeJian
GansuProvincialCenterforDiseaseControlandPrevention,Lanzhou730000,China
HeJian,Email: 1014770674@qq.com;LiHongyu,Email:hongyuligs@163.com
ObjectiveToofferascientificbasisfortheinfluenzapreventionandcontrol,weanalysedtheinfluenza(flu)characteristicsofGansuprovinceduringtheyearof2013to2015.MethodsWedetectedthesamplesoffluvirus,whichcollectedfromthethroatswabsofoutpatientswithinfluenza-likeillness(ILI)inthe19nationalinfluenzasurveillancesentinelhospitalsoftheGansuprovince,byfluorescencequantitativePCRtechnique,thepositivespecimenswereusedtoisolateandidentifytheviruswiththecaninekidneycells(MDCK).ResultsAftertheinfluenzavirusnucleicaciddetectionsof37 332ILIthroatswabs,wegot5 928positivesamples,andthepositiveratewas15.88%.Fromthe14thweekof2013tothe13thweekof2016,thepositiveratesoftheinfluenzavirusnucleicacidwereinturnasfollowing:14.52%, 12.36%and20.15%respectively.Accordingtoagegroups,theresultsshowedthatthelowestpositiverateof12.78%wasfromthebabiesbelow5yearsold,whichwassignificantlylowerthanthatoftheotheragegroups.Thehighestpositiverateof24.75%wascamefromthegroupof15-24yearsold. 1 630influenzaviruswasisolatedfrom6 285specimens,thepositiveratewas25.93%,whichincluding395A(H1N1), 524seasonalH3N2, 342BVictorianvirusand367BYamagatavirus.ConclusionsTheepidemictypesofinfluenzavirusinGansuprovinceperformintheruleofalternativespreading.Soitisnecessarytotakeactivemeasurestopreventandcontrolhumaninfectionwiththeinfluenzavirus.
Influenzavirus;Crowdmonitoring;Virusculture;Polymerasechainreaction
何健,Email:1014770674@qq.com;李紅育,Email:hongyuligs@163.com
10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2016.05.008
流感病毒;人群監(jiān)測;病毒培養(yǎng);聚合酶鏈反應(yīng)
國家“十二五”艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治科技重大專項(2012ZX10004-208)
2016-05-20)