李帥+劉榮梅+李海濤+高繼國
摘要:營養(yǎng)期殺蟲蛋白(vegetative insecticidal protein,簡稱VIP)是蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis,Bt)在營養(yǎng)期表達(dá)的一類新型殺蟲毒蛋白,該蛋白的發(fā)現(xiàn)使得Bt殺蟲劑在殺蟲活性、殺蟲范圍方面得到很大突破。首次比較我國不同氣候類型(熱帶:海南省,亞熱帶:廣西壯族自治區(qū),溫帶:黑龍江?。┑腂t菌株和vip基因的分布情況。結(jié)果表明,從海南省841份土樣中分離出156株Bt菌(18.55%),從廣西地區(qū)1 420份土樣中分離出356株Bt菌(25.07%),從黑龍江省1 010份土樣中分離出167株Bt菌(16.53%);從海南省的156株Bt菌中鑒定出22個vip基因(占14.1%),從廣西地區(qū)的356株Bt菌中鑒定出2個vip基因(占5.62%),然而,從黑龍江省的156株Bt菌中沒有鑒定出vip基因(0%)。利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,簡稱PCR)方法成功克隆出1個[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]的全長基因并獲得登錄號KT792883,將該基因插入到表達(dá)載體pET-21b中,轉(zhuǎn)化菌株Rosetta(DE3),在低溫條件下表達(dá)88 ku的蛋白,將該蛋白進(jìn)行生物活性測定,結(jié)果顯示,該蛋白對甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)具有較好的殺蟲活性,LC50為5.124 ng/mg,對棉鈴蟲(Heliothis armigera)活性較低,LC50為870.1 ng/mg。研究結(jié)果顯示,Bt菌株和vip基因的分布有地域性差異,在溫度較高的熱帶、亞熱帶地區(qū)有比較豐富的Bt菌株和vip基因資源。研究將有利于充分利用土壤中的Bt菌株,分離具有自主知識產(chǎn)權(quán)和重要應(yīng)用價值的新型vip抗蟲基因,這將會為研究新型殺蟲蛋白、延緩害蟲抗性問題提供有益幫助。
關(guān)鍵詞:蘇云金芽孢桿菌;vip基因;鑒定;氣候類型;生物活性測定
中圖分類號: Q938.1+1文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A[HK]
文章編號:1002-1302(2017)04-0018-04
蟲害是影響糧食產(chǎn)量的一個重要因素,目前廣泛應(yīng)用的化學(xué)殺蟲劑對非靶目標(biāo)有很大的毒性且不易降解。生物殺蟲劑可作為化學(xué)殺蟲劑的替代品,蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis)便是目前廣泛應(yīng)用的環(huán)境友好型生物殺蟲劑[1]。蘇云金芽孢桿菌在生長代謝過程中可以產(chǎn)生多種對昆蟲有致病性的殺蟲毒素,其中δ-內(nèi)毒素(deltaendotoxin)以蛋白質(zhì)結(jié)晶的結(jié)構(gòu)形式存在于細(xì)胞內(nèi),并隨芽孢的釋放而釋放到胞外(如Cry、Cyt)。晶體蛋白對多種昆蟲具有特異的殺蟲活性,如對鱗翅目、鞘翅目、膜翅目有很高毒力,此外對線蟲也有毒性作用[2]。由于Bt蛋白對靶生物有很高的活性且對非靶生物無害[3-5],已經(jīng)有實驗室發(fā)掘Bt菌株和新型殺蟲蛋白來擴(kuò)大轉(zhuǎn)基因植物殺蟲譜和延緩害蟲抗性[6-9]。
VIP蛋白最早由Estruch等于1996年從蘇云金桿菌菌株AB88上清液中發(fā)現(xiàn)的[10]。營養(yǎng)期殺蟲蛋白主要被分為四大家族:Vip1、Vip2、Vip3、Vip4(http://www.lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/vip.html)。VIP蛋白與δ-內(nèi)毒素家族沒有同源性,且對鱗翅目[10]、鞘翅目[11]、同翅類[12]有活性;Vip3Aa蛋白氨基酸的同源性大于95%,且對鱗翅目昆蟲有很好的活性。個別氨基酸的差異可能會導(dǎo)致殺蟲活性、殺蟲范圍的改變[5]。Vip蛋白代表殺蟲轉(zhuǎn)基因的第2代,在蘇云金芽孢桿菌抗性方面,Vip3蛋白是最適合的替代者,在一定程度上克服了許多害蟲對Bt內(nèi)毒素低敏感或不敏感的弊端,它會提供一個范圍更大的殺蟲譜來緩解Cry蛋白產(chǎn)生的抗性問題[1,10,13-15]。
海南省位于中國南端,地處熱帶北緣,屬熱帶季風(fēng)氣候,素來有“天然大溫室”的美稱,這里長夏無冬,年平均氣溫 22~27 ℃;廣西壯族自治區(qū)位于中國華南地區(qū)西部,屬亞熱帶季風(fēng)氣候區(qū),年平均氣溫在16.5~23.1 ℃之間;黑龍江省位于歐亞大陸東部、太平洋西岸、中國最東北部,氣候為溫帶大陸性季風(fēng)氣候,全省年平均氣溫多在-5~5 ℃之間。在本研究中,筆者比較了屬于不同氣候類型的海南、廣西、黑龍江的Bt菌株和vip基因的分布情況,以期為Bt菌株和vip基因的發(fā)掘提供一定的理論依據(jù),這將有助于人們充分利用土壤中極其豐富的微生物資源,發(fā)掘具有較好殺蟲特異性、較高殺蟲活性的新型殺蟲蛋白,為害蟲抗性治理提供優(yōu)質(zhì)基因資源。
1材料與方法
1.1材料
菌株與載體:Bt菌株,由筆者所在實驗室分離并保存;pET-21b質(zhì)粒和大腸桿菌JM109、Rosetta菌株,由筆者所在實驗室保存。
主要試劑:Taq DNA聚合酶、KOD酶、氨芐青霉素(Amp)、5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-Gal)、異丙基硫代半乳糖苷(isopropyl β-D-1-thiogalactopyrano-side,IPTG)、蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn),均購自TaKaRa公司。PCR產(chǎn)物回收DNA試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒,購自美國Axygen公司。供試?yán)ハx,購自科云生物公司。
1.2方法
1.2.1Bt菌株的分離及鑒定分別從海南、廣西、黑龍江采集土樣,將采集的土樣通過高溫篩選的方法進(jìn)行Bt菌株分離。在50 mL離心管內(nèi)加入1 g土樣、20 mL滅菌水,80 ℃ 恒溫水浴30 min,靜置30 min后將上清液稀釋100倍,取 200 μL 涂到1/2LB培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)48 h,通過顯微鏡鏡檢。
1.2.2引物設(shè)計與合成根據(jù)[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]保守區(qū)的堿基序列,利用Primer 5軟件設(shè)計出用于vip基因鑒定的引物對 vip3a/vip3s。根據(jù)已知的[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]基因的序列設(shè)計全長引物vip3F/vip3R,并在上游引物中引入SalⅠ酶切位點,下游引物中引入Xho
1.2.4[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]類全長基因的克隆及表達(dá)用[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]基因的全長引物vip3F/vip3R進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系:25 μL KOD,各1 μL上、下游引物,1 μL模板,22 μL ddH2O。擴(kuò)增循環(huán):94 ℃ 5 min;94 ℃ 1 min,56 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30個循環(huán);72 ℃ 10 min。用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。用限制性內(nèi)切酶SalⅠ、XhoⅠ雙酶切PCR全長產(chǎn)物、載體pEB21b,連接、轉(zhuǎn)化大腸桿菌JM109感受態(tài)細(xì)胞,挑選單克隆進(jìn)行驗證,委托哈爾濱博仕生物技術(shù)有限公司測序。測序結(jié)果在美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)網(wǎng)站上進(jìn)行在線Blast比對,測序結(jié)果確定正確后提取重組子的質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌Rosetta,在含有氨芐抗生素(50 mg/mL)的LB固體培養(yǎng)基上進(jìn)行培養(yǎng)。挑取單克隆進(jìn)行驗證,將驗證正確的單克隆在LB液體培養(yǎng)基中于37 ℃搖床培養(yǎng),待D600 nm為0.6左右時,加入IPTG至終濃度為0.2 mmol/L,置于16 ℃搖床中過夜培養(yǎng)。離心收集菌體,將菌體懸浮于20 mmol/L Tris-HCl(pH值8.0)緩沖液中,超聲波破碎細(xì)胞5 min,10 000 r/min 離心10 min,將沉淀重新懸浮于20 mmol/L Tris-HCl(pH值8.0)緩沖液中,用十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)檢測蛋白的表達(dá)情況。
1.2.5生物活性測定用National Institutes of Health開發(fā)的Image J軟件分析SDS-PAGE圖譜來對蛋白進(jìn)行定量。將粗蛋白進(jìn)行濃度梯度稀釋,以pET-21b空質(zhì)粒的Rosetta為陰性對照,測定粗蛋白對甜菜夜蛾的毒力。稱取 10 g 人工飼料置于滅菌培養(yǎng)皿中,加入1 mL待測樣品稀釋液,充分混勻,分裝于24孔細(xì)胞培養(yǎng)板中。用毛筆接入甜菜夜蛾初孵幼蟲,每孔1頭,每個處理重復(fù)3次,置于27 ℃光照培養(yǎng)箱中,培養(yǎng) 7 d 后調(diào)查死、活蟲數(shù)[16-17]。
2結(jié)果與分析
2.1Bt菌株的分離及vip基因的鑒定
通過高溫篩選法從海南省的841份土樣中分離出156份Bt菌株,廣西地區(qū)的1 420份土樣中分離出356份Bt菌株,黑龍江省的1 010份土樣中分離出167份
的重組子轉(zhuǎn)化到Rosetta進(jìn)行培養(yǎng),誘導(dǎo)蛋白表達(dá)。SDS-PAGE檢測結(jié)果表明,在約88 ku處有1條電泳帶,與預(yù)期的目的蛋白相符,說明Vip3Aa蛋白成功表達(dá)(圖4)。
2.3生物活性測定的結(jié)果
將粗蛋白(Bt總蛋白)進(jìn)行濃度梯度稀釋,以pET-21b空質(zhì)粒的Rosetta為陰性對照,測定粗蛋白對甜菜夜蛾、棉鈴蟲的毒力,培養(yǎng)7 d后調(diào)查死、活蟲數(shù)。初篩結(jié)果顯示,粗蛋白對甜菜夜蛾有一定毒力。進(jìn)一步對該蛋白進(jìn)行復(fù)篩,表明 pET-[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]對甜菜夜蛾生測的LC50為3討論
目前Bt已成為世界上應(yīng)用最廣泛的微生物殺蟲劑,VIP是在Bt菌株營養(yǎng)期生長的一類殺蟲蛋白家族。已報道的VIP蛋白具有殺蟲作用,它可提供范圍更大的殺蟲譜。目前Bt菌株主要是從土壤中分離,因此筆者從具有不同代表性氣候條件的地區(qū),如海南省、廣西地區(qū)、黑龍江省采集了土壤樣品,利用高溫篩選法進(jìn)行Bt菌株的分離,利用PCR對vip基因進(jìn)行鑒定。已有報道對同一地區(qū)vip基因分布進(jìn)行調(diào)查,但到目前為止,尚無報道熱帶、亞熱帶、溫帶地區(qū)的Bt菌株、vip基因的分布情況。本研究首次對上述3個地區(qū)的Bt菌株和vip基因的分布情況進(jìn)行統(tǒng)計比較,結(jié)果表明,與溫帶地區(qū)相比較,熱帶、亞熱帶地區(qū)有更豐富的Bt菌株和vip基因資源。
蘇云金芽孢桿菌廣泛存在于土壤、水、污物等環(huán)境中,土壤中含有豐富的微生物,給Bt的生存提供良好的環(huán)境[18]。有報道指出,溫度較高的地方蘇云金芽孢桿菌的含量也較高。巴郎山、峨眉山的自然環(huán)境與其他地方不同,溫度、含氧量都很低,常年被積雪覆蓋,Bt的出菌率明顯低于四川省的其他地方[19]。還有一些研究表明,俄羅斯Caspianic地區(qū)的出菌率是7%,比寒冷地區(qū)(5.7%)、干燥地區(qū)(5%)的出菌率高[15]。本研究選擇了3個具(熱帶、亞熱帶和溫帶),對Bt菌株和vip基因資源進(jìn)行分析比較。海南省位于中國南端,海南島地處熱帶北緣,屬熱帶季風(fēng)氣候,土壤類型屬于磚紅壤、赤紅壤;廣西地區(qū)位于中國華南地區(qū)西部,屬亞熱帶季風(fēng)氣候區(qū);黑龍江省位于歐亞大陸東部、太平洋西岸,地處中國最東北部,氣候為溫帶大陸性季風(fēng)氣候,土壤有機(jī)質(zhì)含量高于其他地方,是世界三大黑土地之一。這3個地區(qū)具有明顯的氣候差異,而土壤屬于半開放的生態(tài)系統(tǒng),易受環(huán)境影響。南方高溫多雨,土壤微生物種類豐富,為細(xì)菌的生長、繁殖提供了有利條件;而北方寒冷干旱,芽孢存活力差,這可能是導(dǎo)致Bt菌株分布情況不同的原因。
而對于vip基因分布情況的不同,筆者認(rèn)為這與基因進(jìn)化有關(guān)?;蛟谶z傳過程中具有保守性,在某些條件下,例如溫度的變化、地理位置變遷等,一些基因的位置將會發(fā)生變化。開始這種變化是微小的,不同的環(huán)境和不同的積累,會導(dǎo)致基因向不同方向進(jìn)化,這可能是在不同氣候條件下vip基因分布情況不同的原因;另外,筆者所在實驗室一直在進(jìn)行cry基因的挖掘工作,發(fā)現(xiàn)cry基因數(shù)量并沒有像vip基因那樣存在較大地域性差異。因此,筆者也推測vip基因在進(jìn)化過程中更易受到各種自然環(huán)境因素的影響,如溫度、植被類型、昆蟲種類等;vip基因與cry基因的殺蟲譜及殺蟲作用機(jī)制的不同可能也與這種進(jìn)化差異有關(guān),具體原因還有待進(jìn)一步研究。由于VIP蛋白與CRY蛋白作用于昆蟲的受體不同[10],因此VIP蛋白可為CRY蛋白抗性提供管理策略,然而,土壤中含有的豐富vip基因資源還沒有被發(fā)掘,那么尋找新的vip基因就尤為重要。目前,PCR技術(shù)被廣泛應(yīng)用到vip基因的鑒定[20-21]。本研究用鑒定引物vip3a/3s和PCR的方法,鑒定出1個新型[WTBX][STBX]vip3Aa[WTBZ][STBZ]基因。結(jié)果表明,此方法可以用于vip基因的鑒定和新基因的發(fā)掘。
本研究的生物活性測定結(jié)果顯示,表達(dá)產(chǎn)物對甜菜夜蛾有明顯殺蟲作用。本研究首次對熱帶、亞熱帶和溫帶地區(qū)的Bt菌株和vip基因的不同分布進(jìn)行比較,結(jié)果顯示,熱帶、亞熱帶具有豐富的Bt菌株和vip基因資源,隨著溫度的降低,Bt菌株、vip基因的數(shù)量也隨之減少,因此筆者建議在熱帶、亞熱帶及溫度較高的地區(qū)進(jìn)行Bt菌株、vip基因的發(fā)掘,這將會為探索和發(fā)掘新型vip基因提供幫助。
參考文獻(xiàn):
[1]Bravo A,Soberón M. How to cope with insect resistance to Bt toxins?[J]. Trends in Biotechnology,2008,26(10):573-579.
[2]Bravo A,Gill S S,Soberón M. Mode of action of Bacillus thuringiensis Cry and Cyt toxins and their potential for insect control[J]. Toxicon,2007,49(4):423-435.
[3]Cerón J,Ortíz A,Quintero R,et al. Specific PCR primers directed to identify cry[QX(Y15]Ⅰ[QX)] and cry[QX(Y15]Ⅲ[QX)] genes within a Bacillus thuringiensis strain collection[J]. Applied and Environmental Microbiology,1995,61(11):3826-3831.
[4]Schnepf E,Crickmore N,van Rie J,et al. Bacillus thuringiensis and its pesticidal crystal proteins[J]. Microbiology and Molecular Biology Reviews,1998,62(3):775-806.
[5]Selvapandiyan A,Arora N,Rajagopal R,et al. Toxicity analysis of N-and C-terminus-deleted vegetative insecticidal protein from Bacillus thuringiensis[J]. Applied and Environmental Microbiology,2001,67(12):5855-5858.
[6]Ben-Dov E,Zaritsky A,Dahan E,et al. Extended screening by PCR for seven cry-group genes from field-collected strains of Bacillus thuringiensis[J]. Applied and Environmental Microbiology,1997,63(12):4883-4890.
[7]Guo S,Liu M,Peng D,et al. New strategy for isolating novel nematicidal crystal protein genes from Bacillus thuringiensis strain YBT-1518[J]. Applied and Environmental Microbiology,2008,74(22):6997-7001.
[8]Li H,Shu C,He X,et al:Detection and identification of vegetative insecticidal proteins [WTBX][STBX]vip3[WTBZ][STBZ] genes of Bacillius thuringiensis strains using polymerase chain reaction-high resolution melt analysis[J]. Curr Microbio,2012,64(5):463-468.
[9]Bates S,Zhao J,Roush R,et al. Insect resistance management in GM crops:past,present and future[J]. Nature Biotechnology,2005,23(1):57-62.
[10]Estruch J J,Warren G W,Mullins M A,et al. Vip3A,a novel Bacillius thuringiensis vegetative insecticidal protein with a wide spectrum of activities against lepidopeteran insects[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences,1996,93(11):5389-5394.
[11]Warren G W. Vegetative insecticidal proteins:novel proteins for control of corn pests[C]//Carozzi N,Koziel M. Advances in insect control:role of transgenic plants. London:Taylor and Francis,1997:109-121.
[12]Sattar S,Maiti M K. Molecular characterization of a novel vegetative insecticidal protein from Bacillius thuringiensis effective against sap-sucking insect pest[J]. Journal of Microbiology and Biotechnology,2011,21(9):937-946.
[13]Arrieta,G,Hernández A,Espinoza A M. et al. Diversity of Bacillus thuringiensis strains isolated from coffee plantations infested with the coffee berry borer Hypothenemus hampei[J]. Revista de Biologia Tropical,2004,52(3):757-764.[14]Franco-Rivera A,Benintende G.,Cozzi J,et al. Molecular characterization of Bacillus thuringiensis strains from Argentina[J]. Antonie vanleeu,2004,86(1):87-92.
[15]Seifinejad A,Salehijouzani G R,Hosseinzadeh A,et al. Characteriztion of Lepidoptera-active cry and vip genes in Iranian Bacillus thuringiensis strains collection[J]. Biological Control,2008,44(2):216-226.
[16]伍贈玲,黃天培,邱君志,等. 一種改良的蘇云金芽孢桿菌質(zhì)粒DNA提取方法[J]. 福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2004,33(2):200-201.
[17]Ibarra J E,del Rincón M C,Ordúz S,et al. Diversity of Bacillus thuringiensis strains from Latin America with insecticidal activity against different mosquito species[J]. Applied and Environmental Microbiology,2003,69(9):5269-5274.
[18]Wu Y,Gao M,Dai S,et al. Investigation of the cyt gene in Bacillus thuringiensis and the biological activities of Bt isolates from the soil of China[J]. Biological Control,2009,47(3):335-339.
[19]Patel K,Bhanshali F,Chaudhary A,et al. A new enrichment method for isolation of Bacillus thuringiensis from diverse sample types[J]. Applied Biochemistry and Biotechnology,2013,170(1):58-66.
[20]Yu X,Zheng A,Zhu J,et al. Characterization of vegetative insecticidal protein vip genes of Bacillus thuringiensis from Sichuan Basin in China[J]. Current Microbiology,2011,62(3):752-757.
[21]Liu J,Song F,Zhang J,et al. Identification of [WTBX][STBX]vip3A[WTBZ][STBZ]-type genes from Bacillus thuringiensis strains and characterization of a novel [WTBX][STBX]vip3A[WTBZ][STBZ]-type gene[J]. Letters in Applied Microbiology,2007,45