具核梭桿菌通過調控miR-181b在結腸癌細胞中形成炎性微環(huán)境的機制

林 欣 何 杰 魏 芳 趙 沖 曾利紅 吳 瓊 黃惠康 杜艷蕾 王 紅

廣州醫(yī)科大學附屬廣州市第一人民醫(yī)院消化內科 廣州消化疾病中心(510180)

具核梭桿菌通過調控miR-181b在結腸癌細胞中形成炎性微環(huán)境的機制

林 欣 何 杰 魏 芳 趙 沖 曾利紅 吳 瓊 黃惠康 杜艷蕾 王 紅*

廣州醫(yī)科大學附屬廣州市第一人民醫(yī)院消化內科廣州消化疾病中心(510180)

具核梭桿菌； miR-181b； 腫瘤壞死因子α； 結直腸腫瘤

腸道菌群在結直腸癌發(fā)病中的作用日益受到關注。Mira-Pascual等[1]發(fā)現(xiàn)腺瘤和結直腸癌黏膜的菌群結構與正常對照明顯不同，其中結直腸癌組具核梭桿菌(Fusobacteriumnucleatum，F(xiàn)n)和腸桿菌數量顯著增多。目前發(fā)現(xiàn)與結直腸癌發(fā)生相關的病原菌可能包括Fn、致病性大腸桿菌、產毒性脆弱擬桿菌等[2]。Strauss等[3]發(fā)現(xiàn)IBD患者腸黏膜中Fn呈高豐度，提示Fn可能在炎癥相關的結腸癌發(fā)病機制中起重要作用。在移植瘤ApcMin/+小鼠模型中發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)n具有募集髓樣腫瘤免疫細胞的能力，能形成炎性微環(huán)境[4]。炎性微環(huán)境在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要的促進作用，炎性因子介導的信號通路或許參與腫瘤細胞的惡性演進，認識并深入了解炎性微環(huán)境的調控機制尤為重要。

最近一項研究[5]表明，在Fn刺激巨噬細胞的炎癥反應過程中，可誘導產生某些miRNA，通過增加炎性因子水平來實現(xiàn)調節(jié)宿主細胞對病原體反應的能力。然而在腸道炎癥反應過程中起重要作用的miRNA尚不清楚。人miRNA-181基因由miR-181a-1、miR-181a-2、miR-181b-2、miR-181b-2、miR-181c和miR-181d組成[6]，是一個重要的基因表達調控因子[7]，近期研究發(fā)現(xiàn)，miR-181a在單核巨噬細胞中能調節(jié)炎癥反應，與炎癥因子呈負相關[8]。然而，F(xiàn)n是否通過miR-181發(fā)揮作用，以及結腸癌細胞形成炎性微環(huán)境的機制尚不明確。miR-181與其靶基因在結直腸癌中可能參與的信號通路尚待研究。本研究通過構建Fn感染結腸癌Caco-2細胞炎癥模型，并運用miRNA測序技術找出差異表達的miRNA，旨在探討結腸癌細胞形成炎性微環(huán)境的可能機制，為研究結腸癌發(fā)生機制提供一定的理論基礎。

材料與方法

一、菌株、細胞株和主要試劑

1.菌株：Fn標準菌株ATCC 10953購自廣東省微生物研究所微生物菌種保藏中心。

2.細胞株：人結直腸腺癌細胞株Caco-2購自美國ATCC細胞庫。人淋巴細胞由廣州市第一人民醫(yī)院消化內科健康志愿者全血樣本中獲取并簽署知情同意書，研究方案通過醫(yī)院倫理委員會審查。

3.主要試劑：psiCHECKTM-2載體(Promega公司)。染料法Hairpin-it hsa-miR-181b-5p定量和U6校準qRT-PCR試劑盒(上海吉瑪制藥技術有限公司)，miR-181b mimics、inhibitor模擬物以及對應的陰性對照RNA(蘇州吉瑪基因股份有限公司)。RNA提取試劑、逆轉錄試劑、qPCR試劑(日本TAKARA公司)，LipofectamineTM2000(Invitrogen公司)，腫瘤壞死因子α(TNF-α)檢測試劑盒(武漢優(yōu)爾生商貿有限公司)，TNF-α抗體、β-actin抗體、羊抗兔二抗、羊抗鼠二抗(Abcam公司)，BCA蛋白定量試劑盒(Thermo Science有限公司)，人淋巴細胞分離液Histopaque?-1077(Sigma公司)，ECL試劑盒(Millipore公司)。

二、研究方法

1.細菌培養(yǎng)：取Fn菌株在哥倫比亞血平板上劃線，37 ℃孵箱厭氧培養(yǎng)48 h至單個菌落明顯可見。鑒定、傳代，挑取單個菌落接種至含BHI培養(yǎng)基的無菌離心管中，37 ℃孵箱厭氧培養(yǎng) 24 h，使細菌處于生長對數期，制備細菌懸液。

2.細胞培養(yǎng)和分組：Caco-2細胞以含20% FBS的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng)，調整細胞密度為1×106～2×106/個，接種于6孔板，培養(yǎng)在37 ℃、5% CO2環(huán)境中。待細胞貼壁融合度達80%時，棄培養(yǎng)基，按照MOI=200∶1(細菌∶細胞)，處理組細胞中加入Fn菌體懸液(2×108～4×108CFU)，對照組以相應體積培養(yǎng)基替代，培養(yǎng)6 h后收集樣本。

3.miRNA測序：收集細胞裂解樣本，送廣州市銳博生物科技有限公司行miRNA測序。

4.細胞轉染：Fn感染Caco-2細胞接種于6孔板，將轉染試劑分別與200 pmol/孔miR-181b mimics和inhibitor混合后轉染細胞，6 h后細胞換液，48 h后收集上清，收集細胞提取總RNA或總蛋白。

5.qRT-PCR法：取各組細胞，提取總RNA，逆轉錄成cDNA，行實時熒光定量PCR。TNF-α引物上游：5’-CCT CCT CTC TGC CAT CAA GA-3’，下游：5’-CTG AGT CGG TCA CCC TTC TC-3’。以β-actin作為內參，引物上游：5’-TGA CGT GGA CAT CCG CAA AG-3’，下游：5’-CTG GAA GGT GGA CAG CGA GG-3’。每個樣本設置2個復孔，采用2-ΔΔCt法計算目的基因的表達。

6.ELISA法：取各組細胞培養(yǎng)液上清，1 000×g室溫離心20 min，按ELISA試劑盒說明書檢測上清液中TNF-α含量。每組實驗重復3次。

7.蛋白質印跡法：取各組細胞，以蛋白裂解液裂解細胞，提取總蛋白，BCA法定量蛋白。取20 μg蛋白樣品行SDS-PAGE凝膠電泳，5%脫脂奶粉室溫封閉1 h。加入TNF-α一抗(工作濃度1∶2 500)、β-actin一抗(工作濃度1∶10 000)4 ℃孵育過夜。加入二抗室溫孵育1 h，ECL法顯影。凝膠圖像處理系統(tǒng)行灰度掃描，分析目的蛋白相對表達量。

8.淋巴細胞提?。撼槿〗】抵驹刚呖鼓?，以RPMI-1640培養(yǎng)基按1∶1稀釋。加入淋巴細胞分離液，400×g室溫離心30 min。吸取上、中層界面處一白色云霧層狹窄帶，加入RPMI-1640培養(yǎng)基，離心。末次離心后，棄上清，加入RPMI-1640培養(yǎng)基重懸細胞。適當稀釋后，計數細胞。

9.Transwell小室法：水化小室，37 ℃孵箱培養(yǎng)1 h。分別設置細菌細胞共培養(yǎng)組、陰性對照組、陽性對照組，將對應培養(yǎng)基加入至下室，小室加入1.5×105個/孔人淋巴細胞，37 ℃、5% CO2培養(yǎng) 4 h。取出小室，洗滌，固定，染色，透明，封片。光學顯微鏡下閱片，每個小室膜隨機選取5個高倍鏡視野(×400)，計數所有穿膜淋巴細胞數，取均值。

三、統(tǒng)計學分析

結 果

一、Fn感染Caco-2細胞可釋放炎性因子、招募淋巴細胞

與共培養(yǎng)前細胞相比，與Fn共培養(yǎng)6 h后細胞形態(tài)變得不規(guī)則，細胞膜受到破壞，細胞間聯(lián)系疏松不緊密(圖1A)。

與對照組相比，F(xiàn)n組炎性因子TNF-α、IL-1β、RELM-β mRNA表達顯著升高(P<0.05)(圖1B)。Fn組TNF-α mRNA和蛋白表達均顯著高于對照組(P<0.05)(圖1B、1C)，培養(yǎng)上清液中TNF-α含量亦顯著高于對照組(P<0.01)(圖1D)。

Transwell小室結果顯示，與陰性對照組相比，陽性對照組和Fn組穿膜淋巴細胞數均顯著增高(P<0.05)(圖1E)。提示含有TNF-α的Fn與細胞共培養(yǎng)上清可募集淋巴細胞。另一方面，該現(xiàn)象進一步驗證了Fn感染Caco-2細胞炎癥模型的可靠性。

與對照組比較，*P<0.05，**P<0.01

A：Fn感染Caco-2細胞誘導的細胞形態(tài)改變；B：Fn感染Caco-2細胞中炎性因子mRNA表達(qRT-PCR法)；C：TNF-α蛋白表達(蛋白質印跡法)；D：上清液中TNF-α含量(ELISA法)；E：穿膜淋巴細胞數量(Transwell小室法，×400)

圖1 Fn感染Caco-2細胞可釋放炎性因子、招募淋巴細胞

二、Fn感染Caco-2細胞抑制miR-181b表達

miRNA測序結果顯示Fn組miR-181b表達顯著低于對照組(表1)。qRT-PCR法對測序結果進行驗證發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)n組miR-181b表達顯著低于對照組(t=5.390，P=0.001 0)(圖2)。

表1 兩組間miR-181b表達的miRNA測序結果

圖2 Fn感染Caco-2細胞可抑制miR-181b表達(qRT-PCR法)

三、Fn通過抑制miR-181b表達上調TNF-α

與對照組相比，miR-181b mimics+Fn組TNF-α mRNA和蛋白表達顯著降低(P<0.05)，上清液中TNF-α含量亦顯著降低(P<0.05)，說明miR-181b表達與TNF-α表達呈負相關(圖3)。

四、TNF-α為miR-181b的靶基因

miR-181b inhibitor組TNF-α mRNA和蛋白表達均顯著高于對照組(P<0.05)，上清液中TNF-α含量亦顯著升高(P<0.05)(圖4A～4C)。進一步說明miR-181b與TNF-α呈負調控關系。

使用三種生物信息學工具預測發(fā)現(xiàn)miR-181b-5p種子區(qū)與TNF-α 3’UTR有結合位點，且位點一致(圖4D)，雙熒光素酶活性檢測亦證實兩者的靶標關系(圖4E)。在轉染克隆有TNF-α基因3’UTR質粒的實驗中miR-181b-5p組與空白對照組、陰性對照組相比差異均有統(tǒng)計學意義(P=0.028，P=0.016)，說明miR-181b-5p能通過結合TNF-α基因3’UTR影響其熒光活性改變。在轉染克隆有突變型TNF-α基因3’UTR質粒的實驗中，miR-181b-5p mimics組與空白對照組和陰性對照組相比無明顯差異(P>0.05)，說明miR-181b-5p不能通過結合突變型TNF-α基因3’UTR影響其熒光活性改變，結合位點突變完全。而miR-181b受到抑制后，在轉染克隆有TNF-α基因3’UTR質粒的實驗中，miR-181b-5p inhibitor組與空白對照組、陰性對照組相比差異均有統(tǒng)計學意義(P=0.011，P=0.007)，說明miR-181b-5p inhibitor能封閉miR-181b-5p，通過抑制結合TNF-α基因3’UTR影響其熒光活性改變。而在轉染克隆有突變型TNF-α基因3’UTR質粒的實驗中，miR-181b-5p inhibitor組與空白對照組和陰性對照組相比無明顯差異(P>0.05)。

五、Fn通過調控miR-181b在結腸癌細胞中形成炎性微環(huán)境

Fn與過表達miR-181b的Caco-2細胞共培養(yǎng)上清液中，穿膜淋巴細胞數較陰性對照組顯著降低(P<0.05)，而陰性對照組與空白對照組相比無明顯差異(圖5)。說明在Fn感染的情況下，上調miR-181b表達能使結腸癌細胞中TNF-α表達降低，降低招募的淋巴細胞數。

討 論

Fn是一種具有侵襲性[9]、黏附性[10]的厭氧菌，可釋放促炎因子。Fn相關結直腸癌的研究[11-12]發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)n能通過自身結構及其代謝產物等組分，刺激宿主細胞產生一系列炎性因子，如TNF-α、IL-6、IL-8、PGE2等，從而參與結直腸癌的發(fā)生、發(fā)展。

A：TNF-α mRNA表達(qRT-PCR法)；B：上清液中TNF-α含量(ELISA法)；C：TNF-α蛋白表達(蛋白質印跡法)

A：TNF-α mRNA表達(qRT-PCR法)；B：上清液中TNF-α含量(ELISA法)；C：TNF-α蛋白表達(蛋白質印跡法)；D：三種生物信息學工具發(fā)現(xiàn)miR-181b與TNF-α結合位點一致；E：293T細胞轉染重組載體和突變體質粒后活性比較

圖4 TNF-α為miR-181b的靶基因

圖5 Fn通過上調miR-181b表達降低招募的淋巴細胞數(Transwell小室法，×400)

Caco-2細胞是一種培養(yǎng)達到融合時表達正常腸上皮細胞分化特征的結腸癌細胞，且為合適的轉染宿主。Trainer等[13]對19種結腸癌細胞株的致瘤性進行分級，發(fā)現(xiàn)Caco-2細胞屬于Ⅱ級結腸原發(fā)性腺癌細胞，可形成腺狀和管狀組織結構，并具有分泌黏蛋白以及形成成纖維細胞的能力，長期培養(yǎng)后可致腫瘤形成。Caco-2細胞常用于腸道癌前病變細胞模型，多項研究[14-17]通過構建Caco-2細胞模型研究IBD、腺瘤型息肉等疾病，因此本研究選用Caco-2作為細胞模型。本研究發(fā)現(xiàn)Fn組TNF-α mRNA和蛋白表達均顯著增高，提示Fn能促進Caco-2細胞中TNF-α的表達。最近一項研究[18]證實了ETBF與IL-17結合能誘導MO-MDSC分化，促進結直腸癌的發(fā)生。Fn亦具有募集MDSC的能力，可形成腫瘤炎性微環(huán)境而起促癌的作用。

miRNA對結腸癌細胞周期和增殖的調控具有重要意義。Yang等[19]發(fā)現(xiàn)Fn感染小鼠中miR-21表達顯著增加。應用miR-21抑制劑能抑制與Fn共培養(yǎng)結腸癌細胞的增殖和侵襲。早期研究顯示某些miRNA由巨噬細胞炎癥反應過程中誘導產生，具有調節(jié)宿主細胞對病原體反應的能力，而病原體本身又能反過來調節(jié)miRNA表達[20-21]。Ito等[22]通過比較腺瘤組織等癌前病變和結直腸癌組織發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)n表達與miR-31表達可能存在一定的關系，但仍需進一步明確其關系。Nosho等[5]認為Fn或許能通過miR-21增加IL-10和PGE2水平，抑制腫瘤微環(huán)境中的抗腫瘤T細胞介導的特異性免疫應答。有研究[23]發(fā)現(xiàn)miR-155能通過擴大炎癥效應促進腫瘤發(fā)生，在炎癥與癌癥之間起橋梁的關系。本研究通過對細胞模型行miRNA測序發(fā)現(xiàn)，F(xiàn)n組中miR-181b表達顯著降低。有研究[24]發(fā)現(xiàn)miR-181b-1受到激活后，能通過CYLD途徑實現(xiàn)炎癥-癌變的過程。提示miR-181b可能在Fn感染Caco-2細胞導致的炎癥過程中扮演重要角色，可能是“炎癥-腫瘤”轉化過程中新的節(jié)點miRNA分子。

本研究使用生物信息學工具檢測miR-181b與TNF-α的結合位點，并采用雙熒光素酶實驗對兩者的靶標關系進行檢測。結果發(fā)現(xiàn)TNF-α為miR-181b的靶基因，兩者呈負調控關系。Fn感染能促進結腸癌細胞中TNF-α表達，并具有募集淋巴細胞的能力。抑制細胞中miR-181b表達，可誘導TNF-α釋放增多。當Fn感染存在的情況下，恢復細胞中miR-181b水平，TNF-α表達依然下調，miR-181b對細胞的內在調控作用起主要的影響。因此，推測Fn可能通過抑制miR-181b上調TNF-α的表達，從而形成炎性微環(huán)境，最終在Fn感染所致的反復局部炎癥反應過程中誘導結直腸癌的發(fā)生。

綜上所述，本研究結果表明Fn感染的結腸癌細胞中miR-181b表達下降，并通過靶向調節(jié)其下游基因TNF-α，招募淋巴細胞向炎癥部位聚集，形成炎性微環(huán)境，由于反復炎癥感染的存在，為結直腸癌的發(fā)生提供了病理生理基礎，提示miR-181b在Fn參與的炎癥相關性結直腸癌的發(fā)生和發(fā)展過程中可能發(fā)揮重要作用。然而，目前對Fn誘導miR-181b表達的機制尚不明確，且“Fn感染-炎癥-腫瘤”整個過程中涉及的關鍵基因的動態(tài)變化仍未完全清楚，有待后續(xù)進一步深入研究。

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(2017-04-13收稿；2017-05-11修回)

MechanismofFusobacteriumnucleatumviaRegulatingmiR-181bforFormingAnInflammatoryMicroenvironmentinColonCancerCells

LINXin,HEJie,WEIFang,ZHAOChong,ZENGLihong,WUQiong,HUANGHuikang,DUYanlei,WANGHong.

DepartmentofGastroenterology,GuangzhouFirstPeople’sHospital,GuangzhouMedicalUniversity;GuangzhouDigestiveDiseaseCenter,Guangzhou(510180)

WANG Hong,Email:wong.hong@163.com

Fusobacteriumnucleatum; miR-181b; Tumor Necrosis Factor-alpha; Colorectal Neoplasms

10.3969/j.issn.1008-7125.2017.10.004

*本文通信作者，Email:wong.hong@163.com

背景：具核梭桿菌(Fn)是口腔常見的致病菌，研究發(fā)現(xiàn)Fn與結直腸癌的發(fā)生、發(fā)展密切相關，尤其是炎癥相關性結直腸癌。目的探討Fn感染在結腸癌細胞中形成炎性微環(huán)境的機制。方法構建Fn感染Caco-2細胞的炎癥模型，行miRNA測序。將miR-181b mimics或inhibitor轉染Fn感染的Caco-2細胞。以qRT-PCR和蛋白質印跡法分別檢測TNF-α mRNA和蛋白表達，ELISA法檢測上清液中TNF-α含量，Transwell小室法檢測穿膜淋巴細胞數。結果Fn組TNF-α mRNA和蛋白表達均顯著高于對照組(P<0.05)，上清液中TNF-α含量顯著升高(P<0.05)，穿膜淋巴細胞數量明顯增多(P<0.05)。miRNA測序和qRT-PCR結果均顯示，F(xiàn)n組miR-181b表達較對照組顯著降低(P<0.05)。與對照組相比，miR-181b mimics+Fn組TNF-α mRNA和蛋白表達顯著降低(P<0.05)；而miR-181b inhibitor組TNF-α mRNA和蛋白表達均顯著升高(P<0.05)。生物信息學工具和雙熒光素酶檢測證實TNF-α可能為Caco-2細胞中miR-181b的靶基因。結論Fn通過抑制Caco-2細胞中miR-181b表達而上調TNF-α表達，募集淋巴細胞形成炎性微環(huán)境。

Background:Fusobacteriumnucleatum(Fn) is a common oral pathogen.Studies have shown that Fn is closely related to the occurrence and development of colorectal cancer,especially the inflammation-related colorectal cancer.AimsTo investigate the mechanism of Fn in forming an inflammatory microenvironment in colon cancer cells.MethodsAn inflammation model of Caco-2 cells infected by Fn was constructed,and miRNA sequencing was performed.miR-181b mimics or inhibitor was transfected into Fn infected Caco-2 cells.mRNA and protein expressions of TNF-α were determined by qRT-PCR and Western blotting,respectively,and concentration of TNF-α in supernatant was measured by ELISA,number of lymphocyte penetrating the membrane was measured by Transwell chamber.ResultsCompared with control group,mRNA and protein expressions of TNF-α were significantly increased (P<0.05),concentration of TNF-α in supernatant was significantly increased (P<0.05),and number of lymphocyte penetrating the membrane was significantly increased in Fn group (P<0.05).miRNA sequencing and qRT-PCR results showed that expression of miR-181b was significantly decreased in Fn group than in control group (P<0.05).Compared with control group,mRNA and protein expressions of TNF-α were significantly decreased in miR-181b mimics+Fn group (P<0.05),however,mRNA and protein expressions of TNF-α were significantly increased in miR-181b inhibitor group (P<0.05).Bioinformatics tools and Luciferase assay confirmed that TNF-α might be the target gene of miR-181b in Caco-2 cells.ConclusionsFn can up-regulate the expression of TNF-α by inhibiting miR-181b in Caco-2 cells and recruiting lymphocytes to form an inflammatory microenvironment.