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      eDNA,搜索瀕危動物的大偵探

      2018-05-23 07:13:34陸新
      環(huán)球人物 2018年10期
      關(guān)鍵詞:龜鱉復(fù)性單鏈

      陸新

      前不久,生物學(xué)家的朋友圈被一只龜刷屏了,確切來說,是一只鱉。4月,國際龜鱉生存聯(lián)盟在官網(wǎng)宣布:美國華盛頓州立大學(xué)的科學(xué)家通過檢測eDNA,在越南春慶湖發(fā)現(xiàn)極瀕危的斑鱉。

      這條新聞有兩個關(guān)鍵詞:斑鱉和eDNA。讓我們一一來做名詞解釋,先從斑鱉開始。斑鱉是渾身布滿黃斑的橢圓形大鱉,背盤長度能超過1米。體重超過100公斤,是全世界300多種龜鱉里數(shù)量最少、最瀕危的,沒有之一。目前全世界發(fā)現(xiàn)了4只活著的斑鱉:中國兩只,都在蘇州動物園;越南兩只,分別在同莫湖和春慶湖。

      中國人很早就認識了斑鱉。最著名的就是“黿鼉?yōu)榱弧钡牡涔?。傳說周穆王出師東征,到了九江,下令大肆捕殺黿、鼉,用以填河架橋,渡江伐越。這里的黿,就是斑鱉。半個世紀前,人們還能在江蘇、云南等地捕到不少斑鱉。但隨著過度捕捉和環(huán)境惡化,進入新世紀后,國內(nèi)再也沒有野生斑鱉的消息,最終只剩下蘇州動物園的兩只。

      然而,科學(xué)家并沒有停下尋找斑鱉的腳步。所以這次,他們運用了動物保育領(lǐng)域如今最熱門的技術(shù)——eDNA。eDNA,全名environmental DNA,翻譯過來叫作環(huán)境DNA,是指在環(huán)境樣品中所有被發(fā)現(xiàn)的不同生物的基因組DNA的混合。講通俗點。就是科學(xué)家通過對土壤、沉積物、排泄物、空氣、水體等樣品進行研究。提取樣品中的各種DNA,分析這些DNA分別屬于哪些物種……也就是說,只要一壞土。我們就能知道哪些動物曾走過。這項技術(shù)提出于1987年。1990年第一次使用于微生物調(diào)查,2008年第一次用于檢測淡水中的物種。

      eDNA并不是什么高深的學(xué)問,它的主要基礎(chǔ)技術(shù)就是我們高中學(xué)過的聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)。實驗證明,DNA在高溫時可以發(fā)生變性解鏈,雙鏈變成單鏈;溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈??茖W(xué)家就通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計引物(即引子,是一小段單鏈DNA或核糖核酸,為DNA復(fù)制的起始點)和特定的酶,讓微量DNA在生物體外大幅復(fù)制、增加。所以。無論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點的DNA,就能用PCR加以放大,進行比對??梢哉f,現(xiàn)代生物研究、刑偵調(diào)查中,PCR功不可沒。1993年,其發(fā)明者穆利斯因此獲得諾貝爾化學(xué)獎。

      不過。生物殘骸上的DNA信息畢竟比較集中,若是一杯水,里面的DNA信息就變得復(fù)雜、分散,光靠PCR技術(shù)誤差很大。所以,在eDNA研究中,科學(xué)家通過熒光標記的方式定量觀察需要的DNA。比如,我們在樣本中摻入會與斑鱉DNA反應(yīng)發(fā)光的物質(zhì)。若在PCR過程中發(fā)現(xiàn)熒光。就可以確認物種存在了。這種方式叫作實時熒光定量PCR,簡稱qPCR。

      事實上。這些技術(shù)的操作遠比我們說得復(fù)雜??茖W(xué)家們對eDNA的探索就像草原上找米粒一樣,工作量和難度都難以想象。但無論如何,eDNA依然是搜索稀有物種最有效的方法之一。中國科學(xué)家正準備利用這個技術(shù)在云南紅河調(diào)查,希望能找到第五只珍貴的斑鱉。

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