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      線粒體DNA D-loop基因多態(tài)性與腎透明 細(xì)胞癌發(fā)病的相關(guān)性分析*

      2018-07-06 06:30:56王天浩閆飛袁建林魏迪朱政來(lái)東李西安
      西部醫(yī)學(xué) 2018年6期
      關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

      王天浩 閆飛 袁建林 魏迪 朱政 來(lái)東 李西安

      (空軍軍醫(yī)大學(xué)西京醫(yī)院泌尿外科, 陜西 西安 710000)

      腎透明細(xì)胞癌是臨床常見的泌尿系惡性腫瘤之一,是腎臟惡性腫瘤最為常見的類型,惡性程度較高,且癌細(xì)胞容易脫落而轉(zhuǎn)移,嚴(yán)重影響患者預(yù)后。近年其發(fā)病率呈逐年升高的趨勢(shì),因此,對(duì)其發(fā)病機(jī)制的研究成為學(xué)界和臨床的焦點(diǎn)問(wèn)題[1-4]。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,多種腎透明細(xì)胞癌的相關(guān)腫瘤分子標(biāo)志物被逐步確立,而作為細(xì)胞核外唯一的遺傳物質(zhì)線粒體DNA(mtDNA),由于容易發(fā)生突變,其與癌癥發(fā)病的聯(lián)系受到重視[5-8]。D-loop在內(nèi)的非編碼區(qū)域是mtDNA多態(tài)性熱點(diǎn)區(qū)域,據(jù)相關(guān)研究表明該區(qū)域與多種腫瘤的發(fā)病和預(yù)后有關(guān)[9-12], 故本文探討了線粒體DNA(mtDNA)D-loop基因多態(tài)性與腎透明細(xì)胞癌的關(guān)系,為臨床研究提供依據(jù)。

      1 資料與方法

      1.1 一般資料 選取2014年3月~2017年2月在我院治療的腎透明細(xì)胞癌患者63例為觀察組,其中男性39例,女性24例;年齡34~68歲,平均年齡(50.17±9.22)歲;納入標(biāo)準(zhǔn):①均經(jīng)病理學(xué)診斷。②術(shù)前未接受化療、放療等治療。③臨床隨訪資料保存完整。排除標(biāo)準(zhǔn):①不能隨訪者。②合并其他原發(fā)性腫瘤者。同時(shí)選取健康志愿者70例作為對(duì)照,其中男性40例,女性30例;年齡32~70歲,平均年齡(49.83±8.17)歲;觀察組和對(duì)照組受試者性別、年齡比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

      1.2 實(shí)驗(yàn)方法

      1.2.1 所有患者術(shù)前均空腹抽取外周靜脈血,外周血標(biāo)本當(dāng)天提取DNA后置于-80℃恒溫冰箱保存。

      1.2.2 引物合成及PCR擴(kuò)增 設(shè)計(jì)擴(kuò)增 mtDNAD-loop區(qū)的引物沒(méi),上游引物:5'-CCCCATGCTTACAAGCAAGT-3';下游引物:5'-GCTTTGAGGAGGTAAGCTAC-3'。引物合成和純化均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司完成。PCR 反應(yīng)采用25μL 反應(yīng)體積。反應(yīng)程序:95℃預(yù)變性2min,95℃變形30s,55℃退火30 s,72℃延伸1min,38個(gè)循環(huán),最后于72℃延伸 5 min。

      1.2.3 DNA測(cè)序及結(jié)果分析 將 PCR 反應(yīng)產(chǎn)物送至上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司,用 ABIPRISM 3100 DNA 序列分析儀對(duì) PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,利用 DNAman 軟件分析腎透明細(xì)胞癌患者的mtDNAD-loop區(qū)序列,并與人mtDNA文庫(kù)記錄的劍橋序列(rCRS)進(jìn)行比對(duì),篩選出 mtDNAD-loop區(qū)的多態(tài)性位點(diǎn)。

      1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 統(tǒng)計(jì)分析采用SPSS19.0軟件,樣本代表性采用Hardy-Wenberg遺傳平衡檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料比較使用t檢驗(yàn),生存曲線采用Kaplan-Meier描繪法,比較采用Log-rank檢驗(yàn)。以P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 mtDNAD-loop基因多態(tài)性位點(diǎn)分布 觀察組和對(duì)照組mtDNAD-loop區(qū)共發(fā)現(xiàn)135個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),其中9個(gè)位點(diǎn)分布頻率>5%,包括262、488、523、525、16293、16298、16304、16362和16519。根據(jù)Hardy-Wenberg遺傳平衡檢驗(yàn),最后發(fā)現(xiàn)觀察組和對(duì)照組262位點(diǎn)基因型頻率分布符合Hardy-Wenberg定律,其樣本代表性好,其余位點(diǎn)基因型頻率分布不符合Hardy-Wenberg定律。

      2.2 兩組mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)基因型及等位基因頻率比較 觀察組和對(duì)照組mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)基因型及等位基因頻率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),其中觀察組TT基因型及等位基因T頻率分布為19.05%和38.89%,明顯高于對(duì)照組(P<0.05),見表1。

      2.3 mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與臨床病理特征的關(guān)系 不同性別、年齡、病理分級(jí)和臨床分期腎透明細(xì)胞癌患者mtDNAD-lOOP區(qū)262位點(diǎn)基因多態(tài)性分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表2。

      2.4 mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與預(yù)后關(guān)系 截止2017年9月,CC基因型和CT基因型患者中位生存時(shí)間分別為40.40個(gè)月和40.20個(gè)月,明顯高于TT基因型患者的34.81個(gè)月,比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(2=25.585,P<0.05),見圖1。

      表2 mtDNA D-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與臨床病理特征的關(guān)系[n(×10-2)] Table 2 The relationship between polymorphism of 262 locus in mtDNA D-loop region and clinicopathological features

      圖1 生存曲線圖 Figure 1 Survival graph

      3 討論

      線粒體是真核細(xì)胞的重要細(xì)胞器之一,是呼吸和氧化的中心,并且其攜帶了部分DNA,即線粒體DNA(mtDNA),是細(xì)胞核外唯一的遺傳物質(zhì), 由16568個(gè)堿基對(duì)組成,含有3個(gè)基因,其中13個(gè)為蛋白質(zhì)基因,2個(gè)為 rRNA基因, 22個(gè)為tRNA基因[13-15]。mtDNA處于活性氧及其他自由基包圍之中,且缺乏相應(yīng)組蛋白的保護(hù)以及完整的內(nèi)修復(fù)系統(tǒng),與核內(nèi)基因組相比,mtDNA較易發(fā)生突變[16-17]。mtDNA的多態(tài)性熱點(diǎn)區(qū)域主要集中在包括D-loop在內(nèi)的非編碼區(qū)域,D-loop區(qū)是mtDNA復(fù)制的調(diào)控區(qū)域,所以該區(qū)域DNA的復(fù)制和表達(dá)異常,往往與多種腫瘤的病發(fā)和預(yù)后具有相關(guān)性[18-20]?;蚨鄳B(tài)性是指由于單個(gè)核苷酸變異,引起染色體基因組水平上的DNA序列呈多態(tài)性,成為限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)標(biāo)志和微衛(wèi)星標(biāo)志發(fā)現(xiàn)后的第三代標(biāo)志物,可能與多種腫瘤的病發(fā)和預(yù)后有關(guān)[21-22]。

      3.1 mtDNAD-loop基因多態(tài)性位點(diǎn)分布分析 本文采用Hardy-Wenberg遺傳平衡檢驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,現(xiàn)結(jié)果如下:觀察組和對(duì)照組mtDNAD-loop區(qū)共發(fā)現(xiàn)135個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),根據(jù)Hardy-Wenberg遺傳平衡檢驗(yàn),最后發(fā)現(xiàn)觀察組和對(duì)照組262位點(diǎn)基因型頻率分布符合Hardy-Wenberg定律,其樣本代表性好,因此本文選用mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)基因型頻率為研究對(duì)象。

      3.2 兩組mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)基因型及等位基因頻率比較分析 mtDNAD-loop區(qū)的基因呈多態(tài)性,可能與腎透明細(xì)胞癌的發(fā)病有相關(guān)性,因此本文以262位點(diǎn)基因型及等位基因頻率為指標(biāo),發(fā)現(xiàn)觀察組和對(duì)照組mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)基因型及等位基因頻率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,其中觀察組TT基因型及等位基因T頻率分布明顯高于對(duì)照組,結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,這表明mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)TT基因及等位基因T與腎透明細(xì)胞癌的發(fā)病具有相關(guān)性,在一定程度上解釋了腎透明細(xì)胞癌的在基因水平的部分發(fā)病機(jī)制。

      3.3 mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與臨床病理特征的關(guān)系分析 為了排除其他因素對(duì)mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與腎透明細(xì)胞癌相關(guān)性的干擾,本文研究了不同性別、年齡、病理分級(jí)和臨床分期腎透明細(xì)胞癌患者mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)基因多態(tài)性分布,發(fā)現(xiàn)結(jié)果差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,表明了性別、年齡、病理分級(jí)和臨床分期等因素與mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性不具相關(guān)性,進(jìn)一步確定了其與腎透明細(xì)胞癌發(fā)病密切相關(guān)。

      3.4 mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與預(yù)后關(guān)系分析 據(jù)相關(guān)研究表明,mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與腎透明細(xì)胞癌的預(yù)后具有相關(guān)性,因此本文研究了二者的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)CC基因型和CT基因型患者中位生存時(shí)間明顯高于TT基因型患者,差異比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,這表明mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)TT基因型不利患者預(yù)后的改善,從而縮短患者的生存周期。

      4 結(jié)論

      本文探討了mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)的多態(tài)性與腎透明細(xì)胞癌的關(guān)系,從基因水平對(duì)腎透明細(xì)胞癌的發(fā)病機(jī)制進(jìn)行考察,顯示腎透明細(xì)胞癌患者mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)攜帶等位基因T的頻率明顯升高,明確了mtDNAD-loop區(qū)262位點(diǎn)多態(tài)性與腎透明細(xì)胞癌發(fā)病的相關(guān)性。但其與臨床病理特征無(wú)明顯關(guān)系,有先進(jìn)進(jìn)一步研究。

      【參考文獻(xiàn)】

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