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      羊口瘡病毒B2L基因密碼子優(yōu)化及截短表達

      2018-10-16 07:42:02范峻豪劉春羽溫永俊張七斤
      中國動物檢疫 2018年10期
      關(guān)鍵詞:密碼子親水性菌液

      張 靜,范峻豪,劉春羽,趙 一,溫永俊,張七斤

      (內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018)

      羊口瘡(ORF)是由羊口瘡病毒(ORFV)感染山羊和綿羊引起的一種急性、接觸性傳染病,人偶有感染。本病以羊口唇、乳房等處的皮膚和粘膜形成紅斑、丘疹、膿瘡、潰瘍和結(jié)痂等為主要特征[1-2]。ORFV全基因組大小為135~139 kb,為雙鏈線性DNA病毒,基因組包含131個基因,其中B2L基因位于基因組的左末端。病毒在宿主細胞內(nèi)增值時,B2L基因在病毒DNA尚未開始復(fù)制時便大量轉(zhuǎn)錄翻譯42 ku大小的蛋白。該蛋白是ORFV外囊膜的主要成分,可強烈刺激宿主免疫系統(tǒng)產(chǎn)生免疫應(yīng)答[3-4]。

      本研究截短表達了ORFV B2L基因,并依照大腸桿菌密碼子偏好進行密碼子優(yōu)化,使其在原核表達系統(tǒng)中進行融合表達,純化出高濃度重組蛋白,為后續(xù)建立ORFV血清學(xué)檢測方法提供了重要的抗原物質(zhì),尤其是為建立ORFV間接ELISA方法奠定了物質(zhì)基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 主要試劑

      Ni-NTA Agarose親和純化柱、Binding Buffer和Elution Buffer:購自生工生物工程(上海)有限公司;180 ku蛋白預(yù)染 Marker:購自Thermo公 司;Anti-His Mouse mAb、100 ku蛋 白 預(yù) 染Marker:購自全式金生物技術(shù)有限公司;Anti-Mouse IgG:購自SIGMA;PVDF膜:購自Bio-Rad;蛋白上樣緩沖液、SDS-PAGE凝膠配制試劑盒、BeyoECL Plus:購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;BL21(DE3)感受態(tài)細胞:購自天根生化科技(北京)有限公司。其他試劑均為標準化學(xué)分析純試劑。

      1.2 主要儀器

      Trans-Blot SD半干轉(zhuǎn)印槽:美國Bio-Rad公司;Alph Imager HPr凝膠成像系統(tǒng):美國Protein Simple公司;雙垂直蛋白電泳儀:中國百晶生物公司;脫色搖床:中國五相儀器儀表公司。

      1.3 B2L蛋白截短及密碼子優(yōu)化

      運用DNA Star中的Protean軟件,分析B2L蛋白的親水性、可塑性、蛋白表面可及性、抗原指數(shù);根據(jù)分析結(jié)果截取抗原指數(shù)高、親水性好、可塑性好的片段進行截短表達和密碼子優(yōu)化;將優(yōu)化好的片段送吉林庫美生物有限公司進行合成,然后連接到pET32a(+)表達載體上,再轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細胞中。

      1.4 重組蛋白表達

      將重組菌劃線接種于含Amp+的LB固體培養(yǎng)基37 ℃過夜培養(yǎng),將過夜菌挑單菌落接種于3 mL含氨芐抗性的新鮮 LB液體培養(yǎng)基,搖菌培養(yǎng)12 h;按1%的比例將純化培養(yǎng)的菌液接種于200 mL含Amp+的新鮮LB液體培養(yǎng)基,37 ℃ 200 r/min震蕩培養(yǎng);用分光光度計測A到0.6時,加入IPTG誘導(dǎo);將菌液12 000 r/min離心10 min,棄上清,用Binding buffer洗滌2次,然后重懸,于冰浴中進行超聲破碎(具體以超聲菌液清亮為止);將超聲裂解菌液4 ℃ 12 000 r/min離心10 min,分離上清和沉淀;將沉淀用尿素溶解,經(jīng)過SDS-PAGE電泳測定,并且以未誘導(dǎo)菌為陰性對照。

      1.5 重組蛋白純化

      將Ni-NTA Agarose親和純化柱加入5 mL Binding Buffer平衡10次,將蛋白加入平衡好的Ni-NTA鎳柱填料中,在冰上結(jié)合30 min;收集流穿液,加5 mL Binding Buffer洗滌1次,收集洗滌液,加Elution Buffer 5 mL洗1次,收集洗脫液。

      1.6 重組蛋白Western-blot鑒定

      將經(jīng)SDS-PAGE電泳的蛋白條帶轉(zhuǎn)印到PVDF膜上,電壓14 V 1 h;用5%脫脂乳室溫封閉2 h,然后用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;在膜上加入Anti-His Mouse mAb為一抗(1∶4 000稀釋),4 ℃過夜孵育,第2天用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;再將膜放入1∶5 000稀釋的Anti-Mouse IgG中孵育1 h,取出膜后用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;在PVDF膜上加ECL顯影液,放于熒光顯色儀中顯色。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 B2L蛋白截短及密碼子優(yōu)化

      2.1.1 B2L蛋白截短 利用DNA Star中的Protean軟件,分析B2L蛋白的親水性、可塑性、蛋白表面可及性、抗原指數(shù)等,選取抗原指數(shù)高、親水性好、可塑性好的片段進行截短表達。分析結(jié)果見圖1-A,截取的目的蛋白氨基酸序列見圖1-B。

      圖1 B2L蛋白的生物信息學(xué)分析

      2.1.2 B2L蛋白截短基因的密碼子優(yōu)化 根據(jù)大腸桿菌的密碼子偏好進行密碼子優(yōu)化,用E.coli Codon Usage Analyzer 2.1在線軟件分析優(yōu)化結(jié)果。結(jié)果顯示(圖2),優(yōu)化后的密碼子適應(yīng)指數(shù)(CAI)為1,且無稀有密碼子。CAI是反映編碼區(qū)同義密碼子與密碼子最佳使用相符合的程度,取值范圍在0~1之間,越高表明該基因的密碼子使用偏好性越強[7-8]。

      圖2 密碼子優(yōu)化分析結(jié)果(CAI為1)

      2.3 重組蛋白SDS-PAGE分析

      將重組表達載體轉(zhuǎn)入大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)中,經(jīng)條件優(yōu)化,最終確定37 ℃ IPTG終濃度為1 mmol/L誘導(dǎo)培養(yǎng)3 h后表達的效果最佳。SDS-PAGE檢測結(jié)果見圖3。從結(jié)果中可以看出,誘導(dǎo)的pET32a(+)-B2L重組菌超聲后上清及沉淀中的30 ku附近出現(xiàn)清晰條帶,而未誘導(dǎo)的PET-32a-B2L重組菌在這一位置沒有這一條帶,因此認為B2L重組蛋白得到了成功表達。

      圖3 SDS-PAGE檢測結(jié)果

      2.4 重組蛋白純化

      將誘導(dǎo)表達得到的B2L蛋白經(jīng)鎳柱親和層析后收集到的流穿液、洗滌液和洗脫液,分別取20 μL進行SDS-PAGE電泳,可以看出流穿液和洗滌液中也有 重組蛋白存在,但洗脫液中的重組蛋白單一,因而認為重組蛋白得到較好的純化(圖4)。

      圖4 SDS-PAGE電泳結(jié)果

      2.5 重組蛋白Western-blot檢測

      Western blot結(jié)果見圖5。純化的蛋白在30 ku附近出現(xiàn)1條清晰條帶,而未誘導(dǎo)的重組菌和誘導(dǎo)的空表達載體菌沒有出現(xiàn)目的條帶,表明重組蛋白在大腸桿菌中成功表達。

      圖5 Western-blot結(jié)果

      3 討論

      目前,羊口疫廣泛流行于全球各羊養(yǎng)殖國家或地區(qū),且發(fā)生頻率逐年上升,流行范圍逐漸擴大,特別是我國黑龍江、新疆、內(nèi)蒙古、西藏、青海、吉林等養(yǎng)殖地區(qū),近年頻頻暴發(fā)羊口疫疫情[5],給養(yǎng)羊業(yè)造成了一定的經(jīng)濟損失,同時鑒于國內(nèi)缺乏相關(guān)檢測試劑盒,故應(yīng)給予羊口疫更高的關(guān)注。本試驗通過PET-32a(+)表達載體構(gòu)建截短B2L重組表達質(zhì)粒,獲得了可溶性O(shè)RFV B2L蛋白,為將來建立間接ELISA檢測ORFV抗體提供了物質(zhì)基礎(chǔ),更為準確診斷ORF和流行病學(xué)調(diào)查提供了簡便快捷的方法[6-7]。

      為了提高B2L重組蛋白的產(chǎn)量,在試驗中通過對B2L基因優(yōu)化及截短,可以使蛋白得到更好的表達,且不失B2L蛋白的免疫原性。又通過表達條件的摸索和優(yōu)化,使用最佳條件,37 ℃ IPTG終濃度1 mmol/L,誘導(dǎo)表達3 h,最終蛋白得到了大量表達。

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