何微 岳苑 賈冰凝
摘 要:隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,分子生物學(xué)檢測技術(shù)已成為現(xiàn)代食品檢測行業(yè)中的重要分支。近些年我國對食品的質(zhì)量愈發(fā)重視,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)憑借著其高效、迅速、精準(zhǔn)的優(yōu)勢已成為食品安全檢測技術(shù)中的中流砥柱,進(jìn)入了新階段。本文對食品檢測中實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的應(yīng)用以及分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的安全隱患進(jìn)行了分析與總結(jié),提出了有效的管理對策,確保了檢測環(huán)境與數(shù)據(jù)的安全。
關(guān)鍵詞:分子生物學(xué)檢測技術(shù) 實(shí)時(shí)熒光定量PCR 實(shí)驗(yàn)室安全
中圖分類號:TS20 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1672-3791(2018)04(b)-0133-03
眾多數(shù)據(jù)顯示,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)由于其不可替代的優(yōu)點(diǎn),加之近年來各地科技攻關(guān)均把醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域中的食品安全作為重要的優(yōu)先研究領(lǐng)域,因此該技術(shù)被廣泛應(yīng)用于各類食品的微生物檢測、動物源性食品摻假技術(shù)的檢測以及食品的轉(zhuǎn)基因狀況檢測等等。大量研究表明微生物與分子生物學(xué)檢測技術(shù)是食品中致病菌以及摻假情況檢測的基礎(chǔ)和支撐。黨的十八大之后,國家食品藥品監(jiān)督管理總局對食品檢測領(lǐng)域不斷進(jìn)行擴(kuò)項(xiàng),使得各檢測機(jī)構(gòu)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室在改進(jìn)檢測技術(shù),優(yōu)化檢測方法的同時(shí)也不斷擴(kuò)大實(shí)驗(yàn)室規(guī)模,完善檢測的硬件設(shè)施,但也因此加大了分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室管理難度。分子實(shí)驗(yàn)室在給我們檢測提供便捷的同時(shí),其中所包含的高毒、易燃、易爆、強(qiáng)氧化物質(zhì)[1]也給我的檢測工作帶來了困擾,近期不斷報(bào)道的各類生物安全事故[2],更警示著我們實(shí)驗(yàn)室安全不可松懈。
本文通過介紹近年來實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在食品檢測領(lǐng)域的應(yīng)用,并總結(jié)近年來國內(nèi)外生物實(shí)驗(yàn)室發(fā)生的安全事故,針對具體檢測情況,探究子分生物實(shí)驗(yàn)室所應(yīng)具備的安全管理準(zhǔn)則。
1 實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)概括
1.1 實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的原理
PCR反應(yīng)技術(shù)是模擬體內(nèi)DNA復(fù)制的原理在體外促和成特異DNA片段的一種方法[1],實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)則是根據(jù)所添加的熒光基團(tuán)所產(chǎn)生的熒光信號的變化實(shí)監(jiān)測每一個(gè)循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物量的變化,具體檢測過程中的定量分析是根據(jù)循環(huán)閾值(Ct)和標(biāo)準(zhǔn)曲線的分析進(jìn)行的。根據(jù)不同的熒光標(biāo)記類型可以將RT-PCR技術(shù)分為探針類和非探針類,研究表明,探針類標(biāo)記的特異性更高,應(yīng)用更廣。
1.2 非探針類法(熒光染色法)
眾多的熒光染料中SYBR Green1由于其操作簡單(無須脫色或沖洗),染色的凝膠樣品熒光信號強(qiáng),背景信號低,因此是應(yīng)用最為廣泛的。有數(shù)據(jù)表明熒光染色法至少可檢出20pg DNA,這高于EB染色法的25~100倍。此外還有LC Green TM1和Pico Green等新型熒光染料,當(dāng)PCR擴(kuò)增的時(shí)候,所添加的染料結(jié)合到DNA上[3],則會產(chǎn)生熒光信號,便于研究者的有效收集。但實(shí)踐證明,染料法雖然成本低,可其特異性不強(qiáng),他會與所有的雙鏈的DNA相結(jié)合,從而產(chǎn)生熒光,這大大降低了熒光染色法的檢測精度[4]。
1.3 熒光探針法
探針法則避開了熒光染色法的不足,在對模板進(jìn)行擴(kuò)增時(shí),除引物外再添加一個(gè)特異性的探針,此探針的兩端具有發(fā)光和淬滅兩個(gè)基團(tuán),當(dāng)DNA通過引物進(jìn)行合成的時(shí),探針折斷,其兩端的基團(tuán)均被釋放,此時(shí)實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀通過收集發(fā)光基團(tuán)產(chǎn)生熒光,從而對檢測基因進(jìn)行定量[5]。目前食品檢測過程中應(yīng)用最多的為TaqMan探針技術(shù)[6],在擴(kuò)增過程中,每一次模板的復(fù)制就伴隨著一個(gè)探針的斷裂,并同時(shí)釋放一個(gè)熒光信號,隨著產(chǎn)物的增加,熒光信號也跟著不斷加強(qiáng),將不同的模板擴(kuò)增的Ct值和標(biāo)準(zhǔn)模板數(shù)的對數(shù)值擬合成標(biāo)準(zhǔn)曲線,從而準(zhǔn)確推斷出起始模板的數(shù)量。
除此之外,我們還有ScorpionsTM/AmplifluorTM (雜交探針)、LUX(雜交探針)、Universal probe library-LNA ( locked nucleic acids水解探針)、Simple probe探針、Dual-oligo FRET pairs(雙雜交探針)等探針技術(shù)[7]。
1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR法在食品檢測方面的應(yīng)用
實(shí)時(shí)熒光PCR 技術(shù)有效減少擴(kuò)增產(chǎn)物的交叉污染[8],加之其可以直接定量,查看濃度,這就避免了傳統(tǒng)PCR檢測時(shí)所需的電泳及相關(guān)色劑對檢測人員造成傷害。因此該檢測方法被廣泛應(yīng)用在對食品中的致病菌進(jìn)行檢測的環(huán)節(jié)中[9],相比較傳統(tǒng)的按部就班的微生物檢測辦法,實(shí)時(shí)熒光定量PCR法更為快速、敏感[10]。
轉(zhuǎn)基因食品近年發(fā)展十分迅速,但其所產(chǎn)生的食品安全性問題也成為公眾關(guān)注的焦點(diǎn),隨著人們食品安全需求的日益增加,目前對食品轉(zhuǎn)基因檢測已從定性提高到定量水平。當(dāng)前對轉(zhuǎn)基因食品檢測技術(shù)路線主要有兩條:一是對外源基因表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測;二是直接檢測外源基因DNA。與此同時(shí),熒光定量PCR技術(shù)還可應(yīng)用于食品中摻假問題的檢查。
以上種種表明,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在檢驗(yàn)過程中必不可少,因此為了保障工作的順利開展,我們不僅要熟練掌握分子檢測技術(shù),更應(yīng)保障分子實(shí)驗(yàn)室的安全。
2 分子實(shí)驗(yàn)室的安全
2.1 分子實(shí)驗(yàn)室安全隱患分析
根據(jù)國內(nèi)外分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室安全事故的報(bào)道[11],本文將分子安全隱患主要?dú)w結(jié)為以下幾個(gè)方面。
2.1.1 實(shí)驗(yàn)危險(xiǎn)試劑及檢驗(yàn)廢棄物
日常食品的微生物和分子生物學(xué)檢驗(yàn)過程中因?yàn)樯婕暗骄|(zhì)、稀釋、培養(yǎng)、擴(kuò)增等步驟,因此常常會產(chǎn)生一些廢液、培養(yǎng)物及固體廢棄物等,其中很多廢棄物具有生物安全隱患[12];其尤其是利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對食品中的微生物進(jìn)行快速檢測時(shí),很容易造成各類致病菌及組織樣品的污染,這類污染物具有一定的傳染性,倘若處理不當(dāng)會不僅會造成檢驗(yàn)室的污染,影響今后的檢測結(jié)果;更會對實(shí)驗(yàn)人員的身體健康造成傷害。另外檢測中所用部分生物試劑也會對檢驗(yàn)員造成潛在的危害,如若細(xì)胞裂解液、各類酶、溴化乙錠染色液以及各類模板及其所對應(yīng)的引物和探針等具有一定的致癌性和毒性[13]。
2.1.2 易造成事故的儀器設(shè)備
食品檢測分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中有很多專用檢驗(yàn)設(shè)備,較為常見的有高壓滅菌鍋、干熱加熱器、均質(zhì)器、液氮鋼瓶、高速冷凍離心機(jī)、PCR儀等設(shè)備[14],具體操作時(shí)必須嚴(yán)格按照規(guī)定要求進(jìn)行使用,否則會造成嚴(yán)重的后果。此外,某些大功率儀器設(shè)備使用時(shí)發(fā)生故障,有可能會引起電力故障甚至火災(zāi),尤其是高壓滅菌鍋,使用時(shí)輕則燙傷,重則爆炸;因此一定要注意防護(hù)。
為了確保日常檢測工作的順利開展我們一定要做到防患于未然,不僅需要注意熒光定量PCR等大型儀器的期間核查和校準(zhǔn),還需要注意實(shí)驗(yàn)室安全維護(hù)。
3 食品檢測分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的管理
3.1 分子實(shí)驗(yàn)室的功能區(qū)域的設(shè)立及相應(yīng)的衛(wèi)生管理措施
根據(jù)各單位具體的檢測需要,食品檢測分子生物學(xué)科研實(shí)驗(yàn)室可以劃分為RNA(DNA)提取專區(qū)、體系配置及核酸濃度檢查區(qū)、PCR擴(kuò)增區(qū)、電泳區(qū)、滅菌區(qū)等區(qū)域。各區(qū)域之間通過傳遞窗傳遞物品,傳遞窗中安裝紫外燈,做好了隔離措施,從以確保降低實(shí)驗(yàn)室污染、減少安全事故的發(fā)生。
此外在實(shí)驗(yàn)室日常管理中,嚴(yán)格實(shí)行專人專責(zé),注意日常檢測工作中儀器的期間核查、維護(hù)保養(yǎng)、水電安全、衛(wèi)生消毒效果等的監(jiān)測,對于大型儀器及危險(xiǎn)系數(shù)較高的儀器,如高壓滅菌鍋,實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀等使用前必須安排人員進(jìn)行學(xué)習(xí),考核合格后方可上崗,并定期做好檢驗(yàn)人員的持續(xù)能力評價(jià)工作。
3.2 嚴(yán)格加強(qiáng)生物試劑的管理
食品檢測過程中所需使用的生物試劑的管理是每個(gè)檢測機(jī)構(gòu)中分子生物實(shí)驗(yàn)室管理的重要部分,特別是危險(xiǎn)試劑的管理。因此必須從試劑的購買申請、采購、驗(yàn)收、儲存、管理、使用、無害化處理等全過程加強(qiáng)規(guī)范管理[15]。對于劇毒試劑(如EB染料)、易燃(如酒精)、易爆品(如液氮等)以及試驗(yàn)所需標(biāo)準(zhǔn)菌株的購買均得交單位審批后方可購買。在實(shí)驗(yàn)室中,各類試劑及培養(yǎng)基均需做好嚴(yán)格的分類擺放,對于標(biāo)準(zhǔn)菌株的管理需嚴(yán)格實(shí)行雙人雙鎖管理制度,并要求填寫領(lǐng)用登記單,以及相關(guān)入庫表。
3.3 生物廢棄物管理
對于分子實(shí)驗(yàn)過程中所產(chǎn)生廢棄物(如帽子、口罩、手套、槍頭、DNA提取物、擴(kuò)增產(chǎn)物等),嚴(yán)格按照操作流程實(shí)行,絕不隨意放置,分子檢測實(shí)驗(yàn)室應(yīng)規(guī)定明顯的實(shí)驗(yàn)廢棄物回收點(diǎn),嚴(yán)禁把實(shí)驗(yàn)廢棄物和普通生活垃圾混放,對于產(chǎn)生的廢棄物必須進(jìn)行無害化處理后才能傾倒或填埋,及時(shí)做好污染物處理記錄,并且定期采用生物(化學(xué))監(jiān)測檢測滅菌及無害化處理效果。
4 未來展望
近幾年來,各地的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室數(shù)量呈逐年增加的趨勢,而有關(guān)采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對食品進(jìn)行快速檢測的地方標(biāo)準(zhǔn)也層不不窮,與此同時(shí),隨著分子生物學(xué)技術(shù)更為廣泛的被應(yīng)用,檢驗(yàn)過程中的易制毒化學(xué)品的使用數(shù)量亦在不斷增加,因此迫切需要各單位對易制毒化學(xué)品進(jìn)行規(guī)范管理,并在管理方式上進(jìn)行創(chuàng)新;在提升檢測技術(shù),優(yōu)化檢測方法的同時(shí),也要多借鑒他人的成功之處,在此基礎(chǔ)上,形成本單位更為有效的分子實(shí)驗(yàn)室安全規(guī)范管理體系,使得檢測和管理每一個(gè)環(huán)節(jié)無懈可擊。通過單位各部門的充分合作,確保檢測工作更順利的開展 。
參考文獻(xiàn)
[1] MORRICA P,BARBATO F,IACOVO R D,et al.Kinetics and mechanism of imazosulfuron hydrolysis[J].Journal of Agriculture and Food Chemistry,2001(49):3816-3820.
[2] 彭穎慧.分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室安全管理實(shí)踐與思考[J].廣東化工,2017,12(44):276-277.
[3] 應(yīng)安明,王桂玲.實(shí)驗(yàn)室建設(shè)規(guī)劃是新形勢下高校實(shí)驗(yàn)室發(fā)展的關(guān)鍵[J].實(shí)驗(yàn)技術(shù)與管理,2007,24(1)134-137.
[4] LIN C N,CHIEN C H,CHIOU M T,et al.Development of SYBR green-based real-time PCR for the detection of canine,feline and porcine parvoviruses[J].Taiwan Veterinary Journal.2014,40(1):1-9.
[5] Pilla R,Snel G G M,Malvisi M,et al.Duplex real time PCR assay for rapid identification of Staphylococcus aureus isolates from dairy cow milk[J].Journal of Dairy Research,2013,80(2):223-226.
[6] Hein I,Lehner A,Rieck P,et al.Detection and genotyping by real-time PCR of the staphylococcal enterot oxin genes sea to sej[J].Mol Cell Probes.2003(17):139-147.
[7] Haupt K,Mosbach K.,Molecularly imprinted polymers and their use in biomimetic sensors,Chem.Rev.2000(100):2495-2504.
[8] CALCIUM M,DEPLANE M,VILAREM G,et al,2017(91):606-615.
[9] Andersen C L,Jeusen J L,Orntoft T F.Normalisation of real-time quantitative reverse transcription-PCR data:a model-based variance estimation approach to identify genes suited for normalization applied to bladder and colon cancer data sets[J].Cancer Res.,2004,64:5245-5250.
[10]李光偉,邱楊,肖性龍,等.沙門菌熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測試劑的研制及應(yīng)用[J].微生物學(xué)通報(bào),2007,34(3):496-499.
[10]鄧文星,張映.實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)綜述[J].生物技術(shù)通報(bào),2007,27(5):93-96.
[11]張黎,劉嵩巖.論我國易制毒化學(xué)品防控體系構(gòu)建[J].江西警察學(xué)院學(xué)報(bào),2014(1):48-53.
[12]LEEJ S,YANG W K,HAN E Y,et al.Monitoring precursor chemicals of methamphetamine through enantiomer profiling[J].Forensic Science International,2007,173(1):68-72.
[13]鄭巧敏.生化與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)和管理的體會[J].檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)教育,2005(4):13-14.
[14]沈繼朵,蘇成福,張艷麗,等.中醫(yī)藥院校生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的安全管理[J].中國中醫(yī)藥現(xiàn)代遠(yuǎn)程教育,2018(3).
[15]楊德平.淺談上海市臨床PCR實(shí)驗(yàn)室的建立和管理[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2016,37(5):714-716.