毛旭明,孫英杰,武 瑋,謝 軍,丁 鏟,吳艷濤
(1.揚州大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,揚州 225009;2.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海 200241;3. 西北民族大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院,蘭州 730030)
線粒體是真核細胞中一種重要的具有雙層膜結(jié)構(gòu)的細胞器,除了成熟的哺乳動物紅細胞和某些單細胞生物之外,線粒體幾乎存在于所有真核生物細胞中。線粒體最先被發(fā)現(xiàn)也是最重要的功能是通過呼吸鏈產(chǎn)生能量,即三磷酸腺苷(ATP)。ATP產(chǎn)生最重要的通路是三羧酸循環(huán),線粒體內(nèi)膜上的大量蛋白質(zhì)參與了這一過程,因此線粒體被認為是細胞的動力工廠。線粒體另一個重要的功能是儲存細胞中的鈣離子,線粒體能夠迅速攝取鈣,并稍后釋放,線粒體的這種瞬時儲存鈣的功能有利于維持細胞內(nèi)的鈣穩(wěn)態(tài)[1]。細胞中游離鈣的濃度可調(diào)節(jié)一系列反應(yīng),對細胞中的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)至關(guān)重要,由線粒體膜電位驅(qū)動的鈣釋放可以激活一系列第二信使,協(xié)調(diào)神經(jīng)細胞中的神經(jīng)遞質(zhì)釋放和內(nèi)分泌細胞中激素釋放的過程[2]。除此之外,線粒體還在其他一些細胞代謝中發(fā)揮重要作用,例如:線粒體活性氧介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞凋亡、激素信號傳導(dǎo)等。近年來,隨著線粒體抗病毒蛋白(mitochondrial antiviral-signaling protein, MAVS,又稱IPS-1, VISA,CARDIF)的發(fā)現(xiàn)[3-6],越來越多的證據(jù)顯示線粒體在先天性免疫中發(fā)揮重要的作用,本文就線粒體如何參與抗病毒先天性免疫進行了綜述。
病毒感染細胞時,先天免疫系統(tǒng)通過幾種類型的模式識別受體(pattern recognition receptor,PRR)快速識別病毒,這些識別病毒的PRR主要包括Toll樣受體(Toll-like receptors,TLR)和RIG-I(retinoic acid-inducible gene I)樣受體(RIG-I like receptors,RLR)。TLRs(例如TLR7和TLR3)位于細胞膜或細胞內(nèi)體的膜上,識別病毒的病原相關(guān)分子模式(pathogen-associated molecular patterns,PAMP)后招募接頭蛋白(例如MyD88和TRIF),導(dǎo)致下游信號通路的激活,產(chǎn)生I型干擾素(IFNs)和趨化因子[7]。RLR(例如RIG-I和MDA5)是細胞質(zhì)中識別病毒的模式識別受體[8-9]。這些胞質(zhì)解旋酶含有兩個N端串聯(lián)的半胱天冬酶招募結(jié)構(gòu)域(caspase recruitment domain,CARD)[8,10],RLR識別病毒后會發(fā)生構(gòu)象變化導(dǎo)致CARD域的暴露,與下游線粒體接頭蛋白MAVS的CARD結(jié)構(gòu)域產(chǎn)生互作,隨后激活下游的兩種細胞質(zhì)蛋白激酶復(fù)合物,一種包括“非經(jīng)典”IKK-相關(guān)激酶TBK1或IKK-i/ε和一系列接頭蛋白例如TANK、NAP1和NEMO。這種TBK1復(fù)合物負責(zé)激活轉(zhuǎn)錄因子IRF3的磷酸化和二聚化,IRF3轉(zhuǎn)位至細胞核中,誘導(dǎo)I型IFN基因的表達。另一種激酶復(fù)合物包括IKKα、IKKβ和NEMO,這種IKK復(fù)合物激活NF-κB,促進下游促炎性細胞因子的表達,參與先天性抗病毒反應(yīng)[5,8]。
用Poly(I: C)刺激MAVS缺陷小鼠無法引起IFN產(chǎn)量上升,RNA病毒感染MAVS缺陷小鼠后導(dǎo)致免疫反應(yīng)嚴重受損[11-12],這些結(jié)果說明MAVS在抗病毒先天免疫中發(fā)揮關(guān)鍵作用。MAVS如何參與介導(dǎo)抗病毒先天免疫信號傳導(dǎo)的具體機制尚不清楚,但重要的是,MAVS必須定位于線粒體才能發(fā)揮其功能[5],說明MAVS的信號傳導(dǎo)依賴于線粒體的狀態(tài)。與之相對應(yīng)的是,MFN1作為一種線粒體融合蛋白,能夠正調(diào)控MAVS介導(dǎo)的天然抗病毒反應(yīng)[13-15]。進一步研究結(jié)果顯示,MAVS能與MFN1發(fā)生相互作用,RLR激活后,MFN1-MAVS復(fù)合物調(diào)控線粒體上MAVS的重新分配以及線粒體的管網(wǎng)狀延伸[14-15]。盡管MAVS再分配的功能尚不明確,但線粒體的管網(wǎng)狀延伸能夠增強MAVS與STING的互作,促進細胞抗病毒反應(yīng)[14]。STING是位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的抗病毒信號接頭蛋白,在DNA病毒誘導(dǎo)的先天性免疫中發(fā)揮重要作用[16]。與MFN1相反,其同源蛋白MFN2卻能夠抑制MAVS功能,這可能與線粒體動力學(xué)無關(guān)[17]??梢姡M管MFN1和MFN2在線粒體融合方面具有相似的功能,但它們在抗病毒先天免疫方面似乎起著相反的作用[13]。MFN1和MFN2除了對線粒體融合的調(diào)控外,還能夠與各自的伴侶分子在線粒體外膜上進行同型和異型互作,以確保對MAVS介導(dǎo)信號傳導(dǎo)的精細調(diào)控。
MAVS介導(dǎo)的抗病毒信號傳導(dǎo)不僅受線粒體動力學(xué)的調(diào)控,同時,NLRX1[18]和gC1qR[19]兩種線粒體蛋白被證實通過抑制MAVS阻斷RIG-I和MDA5介導(dǎo)的抗病毒反應(yīng)。有趣的是,最近一項研究報道顯示線粒體膜電位(ΔΨm)也能調(diào)控RLR介導(dǎo)的先天性免疫通路[20]。用質(zhì)子載體CCCP處理或在MFN1和MFN2缺失的細胞中ΔΨm喪失,明顯阻斷了RLR介導(dǎo)的抗病毒先天免疫應(yīng)答,但對TLR3的激活沒有影響。ΔΨm在MAVS介導(dǎo)的信號傳遞中的具體作用還不明確,有報道認為ΔΨm的喪失可能會阻止MAVS復(fù)合體的重組,而MAVS復(fù)合體的重組能為病毒感染提供更迅速的反應(yīng)[20]。此外,ΔΨm的喪失還有可能阻止MAVS與STING的互作[14,16]。這些證據(jù)證明線粒體動力學(xué)和ΔΨm似乎都參與了MAVS介導(dǎo)的先天性免疫,但是將線粒體最重要的功能ATG合成抑制卻并不阻斷MAVS介導(dǎo)的信號傳導(dǎo),說明MAVS的功能不依賴于線粒體的能量供應(yīng)。
除了直接調(diào)控之外,線粒體還能夠通過活性氧(reactive oxygen species,ROS)間接調(diào)控先天免疫信號通路,例如NF-κB和JNK途徑,以及caspase 1炎性小體[21]。細胞內(nèi)活性氧的兩個主要來源是線粒體和膜相關(guān)的NADPH氧化酶(NOX)與雙重氧化酶(DUOX)復(fù)合物。NOX2和ROS對MAVS介導(dǎo)的抗病毒信號傳導(dǎo)至關(guān)重要。研究結(jié)果證實NOX2下調(diào)能降低MAVS的mRNA表達水平,而不影響其線粒體定位[22]。
MAVS作為RLR通路的樞紐接頭蛋白定位于線粒體外膜,且MAVS發(fā)揮功能依賴其線粒體定位,首次證實了線粒體在先天免疫信號通路中發(fā)揮重要作用。越來越多的證據(jù)證明許多宿主抗病毒免疫反應(yīng)都依賴于線粒體,許多參與細胞免疫反應(yīng)的分子均與線粒體關(guān)系密切,例如NLRP3、TLR等。
2.1 NLRP3 NLRP3是一種重要的NLR(NOD樣受體),在病原相關(guān)分子模式(PAMP)和損傷相關(guān)分子模式(damage associated molecular patterns,DAMP)誘導(dǎo)caspase 1炎性小體過程中發(fā)揮重要作用
[23]。NLRP3上游激活物的多樣性導(dǎo)致了NLRP3能識別由PAMP和DAMP觸發(fā)的信號,而不是直接識別單獨的分子(蛋白質(zhì)或核酸等)。這一點依然存在爭論,因為證據(jù)表明溶酶體損傷或者ROS可以直接作為NLRP3的激動劑。最初發(fā)現(xiàn)由NADPH復(fù)合體產(chǎn)生吞噬體相關(guān)ROS能激活NLRP3[24]。另有報道顯示,細胞中NADPH氧化酶依賴的ROS產(chǎn)生通路受阻能夠?qū)е翹LRP3通路激活[25]。有研究認為線粒體可能是激活NLRP3的ROS的主要來源,為這些相互矛盾的結(jié)果提供了可能的解釋[26]。他們發(fā)現(xiàn)魚藤酮和抗霉素這兩種藥物能夠阻斷線粒體呼吸鏈,導(dǎo)致線粒體ROS的生成,從而有效激活NLRP3。類似地,抑制自噬能導(dǎo)致產(chǎn)生ROS的缺陷線粒體積累,而該線粒體又能增強NLRP3依賴炎癥小體的激活。線粒體作為一種分子平臺,在NLRP3激動劑處理后能招募NLRP3中的幾個炎性小體成員,包括NLRP3本身和接頭蛋白ASC[26]。但是產(chǎn)生ROS的線粒體如何招募NLRP3炎性小體的機制目前仍然未知,對線粒體錨定相關(guān)復(fù)合物如何參與NLRP3炎癥小體形成還有待進一步研究。
2.2 TLRs 吞噬細胞吞噬細菌后導(dǎo)致多種先天免疫信號通路的激活并殺死微生物。ROS的產(chǎn)生是消滅微生物的一種最古老而有效的手段,它通過上調(diào)位于吞噬體表面的NADPH氧化酶復(fù)合物,從而實現(xiàn)與吞噬作用的功能互聯(lián)。TLR信號能增強NADPH氧化酶活性,而由該復(fù)合物產(chǎn)生的ROS能增強TLR介導(dǎo)的炎癥途徑[27]。最近一項研究表明線粒體也可能在吞噬相關(guān)的ROS生成和TLR信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方面起著關(guān)鍵作用。細胞表面TLRs包括TLR1、TLR2和TLR4的配體,能激活鼠巨噬細胞產(chǎn)生線粒體衍生的ROS,而內(nèi)體上的TLRs包括TLR3、TLR7、TLR8和TLR9的配體則不能激活鼠巨噬細胞產(chǎn)生ROS[28]。有趣的是,當(dāng)細胞吞噬了包被Pam3CSK4(TLR2配體)或LPS(TLR4配體)的乳膠微球后,細胞中線粒體聚集在含有乳膠微球的吞噬體附近,而當(dāng)乳膠微球包被CpG DNA(TLR9配體)時,則沒有觀察到類似的現(xiàn)象。由此可以推斷微生物的吞噬和TLR識別導(dǎo)致吞噬體周圍線粒體的聚集和局部ROS產(chǎn)生,這有助于消除被吞噬的微生物。進一步研究結(jié)果表明,TRAF6是TLR信號通路中至關(guān)重要的E3連接酶,在TLR1/2/4配體(而非TLR3/9配體)處理細胞后轉(zhuǎn)運至線粒體,而線粒體ECSIT蛋白被鑒定為TRAF6的泛素化靶標(biāo)蛋白,而該泛素化由TLR1/2/4配體特異性激活。線粒體中TRAF6-ECSIT通路的激活對線粒體在吞噬體附近的特異性定位以及線粒體ROS的誘導(dǎo)至關(guān)重要。這些研究顯示了線粒體ROS在吞噬微生物方面的重要性,TRAF6-ECSIT通路的例子說明線粒體在先天性免疫中發(fā)揮著樞紐作用[28]。
2.3 NLRX1 NLRX1是NLR家族成員中唯一一個具有N末端線粒體定位序列的蛋白,該區(qū)域被命名為字母“X”[18,29]。生化分析結(jié)果顯示NLRX1定位于線粒體基質(zhì)[30]。值得注意的是,NLRX1是目前已知的唯一的靶向線粒體的PRR家族成員,暗示了NLRX1可能是連接線粒體和先天免疫之間的重要“橋梁”。然而NLRX1的線粒體定位特征表明其似乎并不能直接識別微生物來源的分子標(biāo)記。因此,NLRX1的確切功能尚不明確。NLRX1的過表達能誘導(dǎo)ROS的產(chǎn)生[29],可能原因是NLRX1與UQCRC2發(fā)生互作,而UQCRC2是線粒體呼吸鏈復(fù)合體Ⅲ的重要組分,在ROS生成中具有關(guān)鍵作用[30]。有趣的是,NLRX1被證明也能與MAVS互作,抑制MAVS依賴性的抗病毒反應(yīng)[18]。但是,NLRX1具體如何與MAVS互作仍不清楚,因為這兩種蛋白質(zhì)定位于不同的由雙層膜隔離開的線粒體亞結(jié)構(gòu)域。有研究認為NLRX1進入線粒體依賴一定程度的內(nèi)膜ΔΨm[30],ΔΨm的損耗將導(dǎo)致NLRX1在細胞質(zhì)中滯留,滯留在細胞質(zhì)中的NLRX1與MAVS互作并抑制其介導(dǎo)的信號通路,這一假設(shè)還有待進一步證實。首先需要確定病毒感染能否誘導(dǎo)NLRX1在胞質(zhì)中的滯留。另一種可能性是NLRX1通過產(chǎn)生ROS影響RLR信號傳導(dǎo),而ROS已經(jīng)被證明能調(diào)控MAVS依賴的信號通路[22]。
2.4 IRGM IRGM是一種細胞中廣泛存在的人類鳥苷三磷酸酶,在先天免疫抵抗細胞內(nèi)病原方面發(fā)揮作用[31]。許多鼠源IRG基因由干擾素調(diào)節(jié),而人源只存在兩種直系同源基因IRGM和IRGC。IRGM最初被認為是一個假基因,后來被發(fā)現(xiàn)在人類巨噬細胞清除結(jié)核分枝桿菌過程中發(fā)揮作用[32]。已經(jīng)證明IRGM在雷帕霉素、饑餓和IFNγ誘導(dǎo)的細胞自噬限制結(jié)核分枝桿菌方面至關(guān)重要[32]。IRGM介導(dǎo)自噬的機制尚不清楚,但最近來自Deretic團隊的一項研究顯示線粒體在這個過程中發(fā)揮重要作用。IRGM聚集于線粒體并調(diào)節(jié)線粒體分裂,這一機制在自噬泡調(diào)控細胞內(nèi)病原過程中發(fā)揮作用[33]。 IRGM對線粒體的定位取決于IRGM與心磷脂的相互作用,心磷脂是主要在線粒體內(nèi)膜中被發(fā)現(xiàn)的一種線粒體脂質(zhì)。另外,對IRGM mRNA剪接突變體的研究結(jié)果表明,IRGM異構(gòu)體的過表達能誘導(dǎo)線粒體分裂,線粒體去極化和自噬依賴細胞死亡,導(dǎo)致主要的促炎激動劑HMGB1的釋放[33]??傊€粒體的動態(tài)調(diào)節(jié)似乎是決定IRGM在先天免疫中介導(dǎo)自噬(細胞存活)和凋亡或壞死(細胞死亡)這種雙重功能的重要因素。
有觀點認為,線粒體可能是從一種能與宿主細胞共生的古細菌進化而來,因此,線粒體DAMP(mDAMP)可以被認為是介于DAMP和PAMP之間的分子模式。線粒體作為細胞中特殊的細胞器,有自身的組成元件,如細胞色素c、甲酰肽和線粒體DNA(mtDNA)。在長期的進化過程中,細胞利用這些元件作為mDAMP來防止線粒體損傷。其中細胞色素c從線粒體內(nèi)膜釋放到細胞質(zhì)中后,能夠與APAF1相互作用,誘導(dǎo)caspase-9依賴的細胞凋亡[34]。
mtDNA是另一種重要的mDAMP,在細胞經(jīng)歷非正常死亡(例如病理學(xué)損傷)后釋放并激活一系列先天性免疫通路,最近有報道顯示線粒體中釋放的mtDNA能夠激活TLR9、NLRP3和STING等一系列先天性免疫信號通路[35-37](圖1)。
在細胞損傷和應(yīng)激(例如陽離子載體)后,線粒體釋放的mtDNA能夠激活內(nèi)含體中的TLR9,導(dǎo)致促炎性細胞因子基因的轉(zhuǎn)錄和促炎細胞因子的釋放,包括MMP-8、TNF-α、IL-6和IL-1β[35,38]。此外,mtDNA在皰疹病毒感染后釋放至細胞質(zhì)中,隨后被cGAS-cGAMP-STING通路識別,導(dǎo)致TBK1-IRF3依賴的I型IFN通路激活并抑制病毒復(fù)制[37,39]。有趣的是,登革熱病毒作為一種RNA病毒,同樣能夠誘導(dǎo)mtDNA的釋放和cGAS-cGAMPSTING通路的激活,說明RNA病毒似乎也能間接激活DNA受體cGAS介導(dǎo)的信號通路[40]。但也有研究顯示,登革熱病毒的NS2B蛋白能夠靶向降解cGAS,抑制mtDNA介導(dǎo)的cGAS通路的激活[41]。因此,RNA病毒通過誘導(dǎo)mtDNA釋放激活cGAS通路還有待進一步研究證實。此外,ATP的刺激能夠誘導(dǎo)線粒體功能障礙,mtDNA釋放到細胞質(zhì)中結(jié)合并激活NLRP3炎癥小體,而NLRP3炎癥小體募集和激活caspase-1,可將IL-1β和IL-18前體切割成生物活性形式。另一方面,微管相關(guān)蛋白1輕鏈3B(LC3B)/ Beclin 1介導(dǎo)的細胞自噬參與了mtDNA的清除,從而負調(diào)控NLRP3炎性小體的活化[36,42]。
越來越多的證據(jù)表明,線粒體除了在細胞代謝過程和細胞死亡中發(fā)揮重要作用,還是先天免疫信號激活的關(guān)鍵平臺。目前仍有很多問題尚待解決:為什么細胞中有眾多細胞器,唯獨線粒體與先天性免疫關(guān)系如此密切?其中一種解釋是線粒體上存在多種先天免疫途徑分子;另一個可能的原因為線粒體是細胞內(nèi)ROS的主要來源,在許多方面有助于宿主防御病原體。另外,為何是mtDNA,而不是基因組DNA能夠被宿主cGAS通路識別?cGAS通路如何分辨mtDNA和基因組DNA?目前針對病毒的防控主要停留在分子水平,通過對線粒體與抗病毒先天性免疫的研究,能夠為我們從細胞器水平進行病毒防控提供新策略。