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      馬鈴薯軟腐病菌室內(nèi)藥劑及拮抗細(xì)菌篩選

      2019-01-23 07:13:48馮迪南王夢瑤余成鵬劉瓊光
      廣東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年12期
      關(guān)鍵詞:軟腐病平板馬鈴薯

      馮迪南,王夢瑤,余成鵬,劉瓊光,2

      (1. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,廣東 廣州 510642;2. 廣東省微生物信號與作物病害防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510642)

      馬鈴薯是我國第四大糧食作物,中國是世界上馬鈴薯第一生產(chǎn)大國。然而,馬鈴薯病害是影響馬鈴薯生產(chǎn)的一大障礙,其中馬鈴薯細(xì)菌性軟腐病是大田生產(chǎn)和貯藏期發(fā)生最普遍且嚴(yán)重的病害之一[1]。引起馬鈴薯腐爛癥狀的病原菌種類主要包括果膠桿菌屬(Pectobacterium)和迪克氏菌屬(Dickeya)中的一些種[2],其中Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense (簡稱Pcb)分布廣泛,危害嚴(yán)重[3]。馬鈴薯作為廣東省冬種作物,種植面積大。近年來,田間馬鈴薯細(xì)菌性軟腐病逐年加重,病原細(xì)菌可侵染馬鈴薯的塊莖、莖和葉,導(dǎo)致發(fā)病部位變黑、組織軟腐、散發(fā)惡臭味,嚴(yán)重影響馬鈴薯產(chǎn)量和品質(zhì)。目前,馬鈴薯軟腐病防治的主要措施是以加強(qiáng)栽培管理為主的農(nóng)業(yè)防治,且防治藥劑種類較少[4],生產(chǎn)上用于防治植物細(xì)菌病害的化學(xué)藥劑是否對病原細(xì)菌Pcb都有效果,尚不十分清楚,因此,有必要篩選對Pcb有明顯抑菌作用的理想藥劑。此外,生物防治因其對環(huán)境友好、對人畜安全等諸多優(yōu)點(diǎn)受到國際廣泛重視,其中的生防細(xì)菌是防治植物病害的環(huán)保新選擇,并且拮抗菌劑在生產(chǎn)實(shí)踐中也取得了令人矚目的成就,顯示出巨大經(jīng)濟(jì)效益和廣闊應(yīng)用前景[5],為此,分離篩選有效的拮抗細(xì)菌顯得尤為重要。但是,迄今有關(guān)馬鈴薯軟腐細(xì)菌的拮抗菌篩選以及軟腐病的生物防治研究較少。

      本研究以馬鈴薯軟腐病菌Pcb菌株P(guān)o-2為指示菌,通過室內(nèi)平板抑菌試驗(yàn),篩選對Pcb抑菌作用較好的化學(xué)藥劑,并探索不同藥劑混配的作用效果,進(jìn)一步篩選和鑒定對Pcb有較好抑菌效果的拮抗細(xì)菌,以期為馬鈴薯細(xì)菌性軟腐病的化學(xué)防治和生物防治奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      供試病原菌為馬鈴薯軟腐病菌Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis Po-2菌株,分離自廣東省惠東縣馬鈴薯產(chǎn)區(qū),由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)細(xì)菌研究室保存并提供。

      LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,氯化鈉10 g,瓊脂18 g,蒸餾水1 000 mL。以不加瓊脂作為液體培養(yǎng)基。普通細(xì)菌培養(yǎng)基:牛肉膏3 g,酵母膏3 g,蛋白胨3 g,硫酸鎂0.25 g,磷酸氫二鉀2 g,磷酸二氫鉀0.5 g,蔗糖15 g,瓊脂18 g,蒸餾水1 000 mL。供試藥劑選擇國內(nèi)馬鈴薯生產(chǎn)上防治植物細(xì)菌性病害的9種藥劑,見表1。

      表1 供試藥劑及其有效成分和廠家

      1.2 試驗(yàn)方法

      1.2.1 單一藥劑對馬鈴薯軟腐病菌的平板抑菌試驗(yàn) 各藥劑設(shè)置2個濃度,其中一個是藥劑說明書上的使用濃度,另一個是該濃度的3倍稀釋液,利用平板打孔方法,測定9種藥劑對Pcb的抑菌作用。方法如下:將Po-2單菌落接種于10 mL LB培養(yǎng)液中,30℃培養(yǎng)24 h,調(diào)整OD600約為0.5,并取1 mL菌液加入到100 mL融化的(約45℃)LB固體培養(yǎng)基中,充分混勻后,倒入滅菌培養(yǎng)皿中,制成含Pcb指示菌Po-2平板,凝固后用7 mm打孔器在平板上打孔,在孔內(nèi)加入50 μL藥劑,每個藥劑濃度3次重復(fù),以無菌水作對照。30℃培養(yǎng)24 h后,測量抑菌圈大小。

      1.2.2 混合藥劑對馬鈴薯軟腐病菌的平板抑菌試驗(yàn) 挑選單一藥劑抑菌作用效果較好的藥劑,以1∶1進(jìn)行兩兩混配,進(jìn)行平板抑菌試驗(yàn),方法同1.2.1。

      1.2.3 馬鈴薯軟腐病菌拮抗細(xì)菌分離和篩選土壤細(xì)菌分離 土壤樣本采集于華南農(nóng)業(yè)大學(xué)校園及周邊環(huán)境的植物根際,土壤細(xì)菌分離方法為:稱取10 g土壤于錐形瓶中,加入50 mL無菌水,充分?jǐn)嚢瑁o置15~20 min,取上清液進(jìn)行10倍梯度稀釋,而后取100 μL稀釋液均勻涂布在普通細(xì)菌培養(yǎng)基平板上,30℃培養(yǎng)24~48 h,挑取不同形態(tài)單菌落,多次純化,備用。

      拮抗細(xì)菌平板篩選:將上述已純化的細(xì)菌菌株接種于10 mL LB中,30℃培養(yǎng)24 h,調(diào)整OD600約為0.5,然后取3 μL點(diǎn)接在新制備的Po-2平板上,方法同1.2.1。30℃培養(yǎng)24~48 h,測定抑菌圈大小。

      1.2.4 拮抗細(xì)菌16S rDNA初步鑒定 對篩選出的拮抗細(xì)菌,采用細(xì)菌的通用引物E8F/ATCGTGCCCATCGATCACTG和1541R/CATGGATCGTCATAAAGCT,PCR擴(kuò) 增 16S rDNA片段,25 μL PCR反應(yīng)體系為:PCR緩沖 液 2.5 μL、dNTPs 2 μL、引物各1 μL、TaqDNA聚合酶0.4 μL、雙蒸水17.1 μL、模板1.0 μL。反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸 1.5 min,35個循環(huán);72℃延伸10 min,4℃保存。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測和純化后,送上海英濰捷基生物技術(shù)公司測序,并將序列在NCBI網(wǎng)站上進(jìn)行核酸序列Blast比對,選取同源性較高的序列用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 萬勝清、克菌康、辛菌胺醋酸鹽、金霉唑等藥劑對馬鈴薯軟腐病菌具有較好抑菌作用

      平板抑菌試驗(yàn)結(jié)果(圖1)表明,9種藥劑中對軟腐病菌Po-2的抑菌作用存在差異,其中萬勝清(20%溴菌腈·5%壬菌銅)800倍抑菌圈直徑最大、平均為24.50 mm,稀釋2 400倍后抑菌圈直徑仍有19.33 mm;克菌康(3%中生菌素)600倍的抑菌圈直徑5.92 mm,稀釋1 800倍后抑菌圈直徑為3.67 mm;1.2%辛菌胺醋酸鹽稀釋200倍和600倍,其抑菌圈直徑分別為7.58和3.58 mm;金霉唑(1.5%噻霉酮)稀釋600倍和1 800倍,其抑菌圈直徑分別為6.08和2.25 mm。然而,碧生(20%噻唑鋅)、龍克菌(20%噻菌銅)、興農(nóng)(33.5%喹啉銅)、可殺得叁仟(46%氫氧化銅)和銅高尚(27.12%堿式硫酸銅)等5種藥劑,在它們最小稀釋倍數(shù)范圍內(nèi)對Po-2均沒有抑菌作用,抑菌圈直徑均為0.00 mm(表2)。4種藥劑最大稀釋度的抑菌試驗(yàn)結(jié)果表明,對馬鈴薯軟腐病菌的抑菌效果表現(xiàn)為萬勝清>克菌康>辛菌胺醋酸鹽>金霉唑。

      圖1 藥劑萬勝清在Po-2平板上產(chǎn)生的抑菌圈

      表2 9種藥劑對馬鈴薯Pcb菌株P(guān)o-2的平板抑菌圈直徑

      2.2 辛菌胺醋酸鹽和萬勝清混配對馬鈴薯軟腐病菌的抑菌效果

      將抑菌效果較好的辛菌胺醋酸鹽和萬勝清兩種藥劑混配,平板上測定對馬鈴薯軟腐病菌Po-2的抑菌作用,結(jié)果發(fā)現(xiàn),辛菌胺醋酸鹽和萬勝清混配后抑菌圈直徑為25.67 mm,而單獨(dú)辛菌胺醋酸鹽抑菌圈直徑為9.17 mm,單獨(dú)萬勝清抑菌圈直徑為26.42 mm,表明這兩種藥劑混配后并不能提高抑菌效果。

      2.3 馬鈴薯軟腐細(xì)菌拮抗細(xì)菌的分離和拮抗效果測定

      從不同植物根際土壤中共分離出150個細(xì)菌菌株,通過平板抑菌試驗(yàn),得到5個細(xì)菌菌株對馬鈴薯軟腐細(xì)菌Po-2有抑菌作用,其抑菌圈直徑在2.75~3.83 mm之間(表3),其中拮抗菌RFjk2的抑菌作用最明顯(圖2)。

      表3 5個拮抗細(xì)菌對軟腐病菌Po-2的平板抑菌圈大小

      圖2 拮抗細(xì)菌RFjk2和RFjk3對馬鈴薯軟腐病菌Po-2的平板抑菌作用

      2.4 5個拮抗細(xì)菌16S rDNA序列分析和初步鑒定

      進(jìn)一步對這5個菌株進(jìn)行16S rDNA測序,采用細(xì)菌通用引物E8F/1541R PCR擴(kuò)增16S rDNA片段,其目的片段大小均為1.5 kp大小。擴(kuò)增產(chǎn)物測序后,將獲得的序列在NCBI網(wǎng) 站(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) 進(jìn)行BLAST同源性檢索,計(jì)算所測定的5個菌株的16S rDNA全序列遺傳距離,對5個菌株經(jīng)MEGA4軟件統(tǒng)計(jì),采用鄰接法(NJ法)分別構(gòu)建5個拮抗細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3~圖7)。

      表4 5個拮抗細(xì)菌16S rDNA序列BLAST和初步鑒定結(jié)果

      結(jié)果表明,拮抗菌RFjk1與菠蘿泛生菌Pantoea ananatis 菌株SGAir0210(基因編號:CP028033.1)的16S rDNA序列同源性為99%,初步鑒定為泛生菌屬(Pantoea)(圖3、表4);拮抗菌RFjk2與粘質(zhì)沙雷氏菌Serratia marcescens 菌株EG5(基因編號:KU321349.1)的16S rDNA序列同源性為100%,鑒定為粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)(圖4、表4);拮抗菌RFjk3與殺變形假單胞菌Pseudomonas plecoglossicida RD_MAAMIA_05(基因編號:KU597532.1)的16S rDNA序列同源性為99%,初步鑒定為假單胞菌屬(Pseudomonas)(圖5、表4);拮抗菌RFjk4和RFjk5與松鼠葡萄球菌Staphylococcus sciuri(基因編號:LS483305.1和JX134627.1)的16S rDNA序列同源性為99%,初步鑒定為葡萄球菌屬(Staphylococcus)(圖6~圖7、表4)。

      圖3 拮抗細(xì)菌RFjk1基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

      圖4 拮抗細(xì)菌RFjk2基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

      圖5 拮抗細(xì)菌RFjk3基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

      圖6 拮抗細(xì)菌RFjk4基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

      圖7 拮抗細(xì)菌RFjk5基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育樹

      3 結(jié)論與討論

      迄今,國內(nèi)外防治作物細(xì)菌性病害的新型化學(xué)藥劑種類較少,且大多數(shù)以銅制劑為主[6],然而,同一成分的殺細(xì)菌劑并非對所有植物病原細(xì)菌都有抑菌或殺菌作用。本研究通過室內(nèi)平板抑菌試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)國內(nèi)市場上使用的9種殺細(xì)菌藥劑對馬鈴薯軟腐病菌Pcb的抑菌效果差異較大,其中萬勝清(20%溴菌腈·5%壬菌銅)、克菌康(3%中生菌素)、辛菌胺醋酸鹽、金霉唑(1.5%噻霉酮)等4種藥劑對Pcb菌株P(guān)o-2抑菌效果較好,而碧生(20%噻唑鋅)、龍克菌(20%噻菌銅)、興農(nóng)(33.5%喹啉銅)、可殺得叁仟(46%氫氧化銅)、銅高尚(27.12%堿式硫酸銅)等5種藥劑在其使用濃度范圍內(nèi)對Po-2均沒有抑菌作用。

      噻霉酮主要用于防治真菌病害,未報(bào)道其對軟腐病細(xì)菌有作用,本研究發(fā)現(xiàn),1.5%噻霉酮對馬鈴薯軟腐菌Pcb具有抑菌效果。辛菌胺醋酸鹽是一種廣譜性殺菌劑,對一些真菌、細(xì)菌及病毒病害均有一定的防治效果[7-9],中生菌素和溴菌·壬菌銅較多地應(yīng)用于植物細(xì)菌病害防治[10-11]。由此,我們認(rèn)為,田間防治Pcb引起的作物細(xì)菌性軟腐病,可推薦使用萬勝清(20%溴菌腈·5%壬菌銅)、中生菌素、辛菌胺醋酸鹽和金霉唑(1.5%噻霉酮)等藥劑,萬勝清和辛菌胺醋酸鹽混配并不能提高抑菌效果,不建議在生產(chǎn)上混合使用,但可以輪換使用,還需要進(jìn)一步的田間試驗(yàn)。

      噻唑鋅是新一代高效、低毒、安全的有機(jī)鋅殺菌劑,20%噻唑鋅對水稻黃單胞桿菌(Xanthomonas oryzae)、大白菜軟腐病菌(Pectobacterium carotovorum subsp. carotovora)有較好的抑菌作用和病害防治效果[12-13];噻菌銅可用于煙草野火病、柑桔潰瘍病、姜瘟病等細(xì)菌病害的防治[14-15];喹啉銅則可用于防治黃瓜細(xì)菌性角斑病,且與烯酰嗎啉混和使用,效果更佳[16];其他幾種銅制劑,如可殺得三仟、銅高尚等有報(bào)道用來防治水稻白葉枯病、水稻細(xì)菌性條斑病和稻曲病等[17-19]。然而,本研究卻發(fā)現(xiàn),噻菌銅、喹啉銅、氫氧化銅和堿式硫酸銅等銅制劑,在它們的使用濃度范圍內(nèi),均不表現(xiàn)對馬鈴薯軟腐細(xì)菌Pcb的平板抑菌和殺菌作用,原因可能由于這些銅制劑本身對Pcb作用效果差,也可能生產(chǎn)上大量使用這些銅制劑,病菌已經(jīng)產(chǎn)生了抗藥性,需要進(jìn)一步研究。

      目前,針對由Pcb引起的細(xì)菌性軟腐病的生物防治研究極少,本研究從土壤中分離獲得5個對軟腐細(xì)菌Pcb具有抑菌效果的拮抗細(xì)菌,16S rDNA序列分析表明,它們分別與菠蘿泛生菌(Pantoea ananatis)、粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)、變形假單胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)及松鼠葡萄 球 菌(Staphylococcus-sciuri) 的 16SrDNA序列相似性在99%以上。有研究表明,泛生菌屬Pantoea細(xì)菌對茄鏈格孢(Alternaria solani)、辣椒枝孢(Cladosporium capsici)、稻梨孢菌(Pyricularia oryzae)、甘薯長喙殼菌(Ceratocystis fimbriata)、西瓜殼二孢(Ascochyta citrullina)等病原真菌有抑菌效果[20],成團(tuán)泛菌(Pantoea agglomerans)對志賀氏菌(Shigella castellani)、大腸桿菌(Escherichia coli)、沙門氏菌(salmonella enteritidis)等病原細(xì)菌有抑制作用[21]。本研究分離得到的拮抗菌RFjk1初步鑒定為菠蘿泛生菌(Pantoea ananatis),該細(xì)菌可引起多肉葉片細(xì)菌性褐腐?。?2],但鮮見有抑菌作用的報(bào)道;拮抗菌RFjk3、RFjk4和RFjk5初步鑒定為變形假單胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)和松鼠葡萄球菌(Staphylococcus sciuri),變形假單胞菌作為自然界的常見菌,對多種污染物有較強(qiáng)的分解能力,常被用于污水處理[23],同時也引起大黃魚疾?。?4];松鼠葡萄球菌廣泛分布于自然界,為條件性致病菌,可感染人及多種動物[25],較少報(bào)道對植物病原細(xì)菌具有抑菌作用,這3個拮抗菌能否有效用于馬鈴薯軟腐病的生物防治,以及它們對環(huán)境的潛在風(fēng)險(xiǎn)性,需要進(jìn)一步研究。

      有報(bào)道顯示,粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)對尖孢鐮刀菌引起的黃瓜枯萎病有防治效果[26],從魔芋中分離的粘質(zhì)沙雷氏菌對魔芋軟腐病菌(Pectobacterium carotovora subsp.carotovora和Pectobacterium chrysanthemi)有拮抗作用[27],因此,粘質(zhì)沙雷氏菌用于植物病害生物防治具有較大潛力。本研究分離獲得的具有最大抑菌圈的拮抗細(xì)菌RFjk2屬于粘質(zhì)沙雷氏菌,這將為馬鈴薯軟腐病的生物防治應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

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