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      基于EST-SSR熒光標(biāo)記和毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)分析邵武碎銅茶群體遺傳多樣性與親緣關(guān)系研究

      2019-04-26 12:08:52孔祥瑞王讓劍邱麗玲鄭國(guó)華邱陳華
      茶葉學(xué)報(bào) 2019年4期
      關(guān)鍵詞:邵武親緣類(lèi)群

      楊 軍,孔祥瑞,王讓劍,邱麗玲,鄭國(guó)華,邱陳華

      (1.福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所/國(guó)家茶樹(shù)改良中心福建分中心/農(nóng)業(yè)部福建茶樹(shù)及烏龍茶加工科學(xué)觀測(cè)實(shí)驗(yàn)站,福建 福州 350012;2.邵武農(nóng)業(yè)農(nóng)村局,福建 邵武 354000)

      邵武碎銅茶又名“觀星茶”也叫“神仙茶”,為有性茶樹(shù)群體種,2009年入選為福建省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳認(rèn)定的福建省茶樹(shù)優(yōu)異種質(zhì)資源保護(hù)區(qū)。其生長(zhǎng)于福建省邵武市和平鎮(zhèn)海拔1000多米的留仙峰山上,生長(zhǎng)環(huán)境多為亂石巖縫,制作成綠茶與紅茶品質(zhì)風(fēng)味獨(dú)特,取少量茶與古銅錢(qián)一起咀嚼2~3 min,能使銅錢(qián)軟化而破碎得名,被稱(chēng)為世界兩大“奇茶”之一[1]。

      近些年,EST-SSR分子標(biāo)記因來(lái)自于功能基因,具有多態(tài)性高、共顯性、重復(fù)性好等特點(diǎn),在資源鑒定與輔助育種中廣泛應(yīng)用[2-5]。茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性與親緣關(guān)系分析是野生茶樹(shù)種質(zhì)初步鑒定的重要手段。近些年,利用分子標(biāo)記技術(shù)分別對(duì)云南白鶯山茶樹(shù)種質(zhì)資源[6]、貴陽(yáng)花溪古茶樹(shù)資源[7]、黔南野生茶樹(shù)種質(zhì)資源[8]、香竹簧茶樹(shù)王與野生茶樹(shù)種質(zhì)資源[9]、貴州古茶樹(shù)種質(zhì)資源[10]進(jìn)行研究,結(jié)果表明云南白鶯山茶樹(shù)種質(zhì)資源亞群間存在著基因交流;貴陽(yáng)花溪古茶樹(shù)資源由喬木型向灌木型進(jìn)化;黔南野生茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳差異較大,遺傳基礎(chǔ)較寬;香竹簧茶樹(shù)王與野生茶樹(shù)、栽培型茶樹(shù)品種之問(wèn)的遺傳關(guān)系較遠(yuǎn);由于遺傳因素和地理位置不同引起貴州古茶樹(shù)資源的遺傳多樣性高。本試驗(yàn)對(duì)邵武碎銅茶群體進(jìn)行個(gè)體材料的親緣關(guān)系與遺傳多樣性研究,旨在對(duì)邵武茶樹(shù)種質(zhì)進(jìn)行初步鑒定,為茶樹(shù)育種、雜交親本選配提供初步依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      參試的29份邵武碎銅茶來(lái)自于福建省邵武市和平鎮(zhèn)留仙峰。以40個(gè)福建省茶樹(shù)良種作為對(duì)照(表1),對(duì)照樣品采自于福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所。采集各個(gè)材料一芽二葉鮮葉后用液氮迅速冷凍處理,保存在-70℃冰箱中備用。

      1.2 試驗(yàn)方法

      1.2.1 農(nóng)藝性狀調(diào)查 農(nóng)藝性狀調(diào)查參考陳亮等[11]撰寫(xiě)的《茶樹(shù)種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》。

      表1 69份供試材料的名稱(chēng)與來(lái)源

      1.2.2 基因組DNA的提取 采用改進(jìn)的CTAB法[12]提取茶樹(shù)基因組DNA。用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行茶樹(shù)基因組分子量大小檢測(cè),用756-MC型紫外分光光度計(jì)測(cè)定茶樹(shù)基因組DNA的純度(OD260/280比值)。

      1.2.3 引物合成 參照文獻(xiàn)[13]引物序列,序列由上海Sangon公司合成,引物信息見(jiàn)表2。

      1.2.4 PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物鑒定 PCR 反應(yīng)體系為:ddH2O18.8 μL,10×Buffer2.5 μL(Mg2+),dNTP(10 mmol·L-1)0.5 μL,上、下游primer(10 μmol·L-1)各0.5 μL,Taq polymerase 0.2 μL(0.5 U),模板DNA 1 μL。PCR反應(yīng)于美國(guó)ABI-9600型擴(kuò)增儀上進(jìn)行,熱循環(huán)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性4 min,然后進(jìn)入下列溫度循環(huán):94℃變性45 s,不同溫度條件退火60 s,72℃延伸75 s,重復(fù)35個(gè)熱循環(huán);72℃延伸10 min,最后4℃保存。

      引物統(tǒng)一在反向引物(R)的5′段標(biāo)記熒光(FAM/TAMRA),由上海百力格生物科技有限公司合成。擴(kuò)增產(chǎn)物0.5 μL,GeneScanTM500 ROXTM0.5 μL,HiDi 9 μL,混勻后使用ABI公司3730XL進(jìn)行毛細(xì)管電泳。

      1.2.5 數(shù)據(jù)處理 采用ABI公司的GeneMapper 4.0軟件,選擇GeneScanTM500 ROXTM作為分子量標(biāo)準(zhǔn),對(duì)每一個(gè)擴(kuò)增出的條帶記錄大小。運(yùn)用PopGen 3.2軟件計(jì)算Shannon信息指數(shù)(I)和Nei’s基因多樣性指數(shù)(H)。運(yùn)用NTSYSpc2.1中的Tree plot程序進(jìn)行聚類(lèi)分析。

      表2 20對(duì) SSR 引物及其序列

      2 結(jié)果與分析

      2.1 邵武碎銅茶葉片性狀初步調(diào)查

      從表3中看出邵武碎銅茶種質(zhì)資源,葉身多為平,葉片著生狀態(tài)為稍上斜與水平,葉面以微隆起為主,葉尖以漸尖為主;調(diào)查葉片長(zhǎng)寬比值范圍在1.92~3.06,平均值為2.40,推測(cè)葉片以橢圓形為主,少量為長(zhǎng)橢圓形;葉面積平均值為17.87 cm2,為小葉種,與當(dāng)?shù)胤N質(zhì)資源描述為中葉種有所差異,葉面積大小受葉片調(diào)查代表性、調(diào)查時(shí)間與生長(zhǎng)環(huán)境氣候變化相關(guān),推測(cè)有性邵武碎銅茶種質(zhì)資源群體為小葉種與中葉種并存。

      2.2 親緣關(guān)系分析

      從相似系數(shù)聚類(lèi)圖1上看出,69個(gè)參試材料分為8個(gè)類(lèi)群,除TY286、TY299、TY264外,其它邵武碎銅茶種質(zhì)資源分布于類(lèi)群A、B、C;D類(lèi)群主要為閩東地區(qū)綠茶品種資源;E類(lèi)群主要為黃棪、金牡丹等高香烏龍茶品種資源;F類(lèi)群主要為閩北烏龍茶品種資源;G類(lèi)群主要為閩南烏龍茶品種資源;H類(lèi)群主要為福云系列綠茶品種資源。從整體上看,邵武碎銅茶種質(zhì)資源與福建主要茶樹(shù)品種未聚類(lèi)在一起,分為3個(gè)相對(duì)獨(dú)立的類(lèi)群。與具有云南遺傳基礎(chǔ)的福云系列品種資源相比,邵武碎銅茶跟福建省品種資源親緣關(guān)系相對(duì)較近,說(shuō)明本研究的親緣關(guān)系在一定程度上反映了不同群體資源間遺傳距離的遠(yuǎn)近。同時(shí),邵武碎銅茶種質(zhì)資源具有獨(dú)特的遺傳背景。

      表3 葉片性狀調(diào)查結(jié)果

      注:農(nóng)藝性狀調(diào)查時(shí)間為8月。

      2.3 群體間遺傳多樣性比較分析

      從表4中看出,A-H群體中Shannon遺傳多樣性指數(shù)最高的為B、C群體,推測(cè)在群體數(shù)量差不多情況下,邵武碎銅茶種質(zhì)資源遺傳多樣性豐富;Shannon遺傳多樣性指數(shù)最低的為E、F群體。Hardy-Weinberg遺傳偏離指數(shù)D主要反映Ho(觀測(cè)雜合度)和He(期望雜合度)之間的平衡關(guān)系,D值越接近0,基因型的分布就越接近于平衡狀態(tài),D值大于0說(shuō)明存在雜合子過(guò)剩,D值小于0,說(shuō)明存在雜合子缺失現(xiàn)象[14]。類(lèi)群A、F、G的Ho與對(duì)應(yīng)的He相當(dāng),說(shuō)明這3個(gè)類(lèi)群基因型的分布就越接近于平衡狀態(tài);類(lèi)群B、C、D、E、H 的Ho高于對(duì)應(yīng)的He,D值大于0,雜合子過(guò)?,F(xiàn)象,尤其是類(lèi)群H的D值最大,屬于親本單一,基本遺傳背景來(lái)自與福云系列;整體邵武碎銅茶種質(zhì)資源的D值趨向0,說(shuō)明邵武資源整體基因型的分布趨向平衡,群體相對(duì)穩(wěn)定。

      從群體聚類(lèi)圖2看出,同屬邵武碎銅茶種質(zhì)資源的類(lèi)群A、B、C聚類(lèi)在一起,群體遺傳背景相對(duì)一致;類(lèi)群D、E、F、G聚類(lèi)在一起,主要為福建審(鑒)定品種;H類(lèi)群主要為福云系列綠茶品種資源,與其它福建茶樹(shù)種質(zhì)資源親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),說(shuō)明其云南種質(zhì)資源遺傳基礎(chǔ)起到一定的作用。

      圖1 遺傳相似系數(shù)聚類(lèi)圖Fig.1 Dendrogram on genetic similarity

      表4 對(duì)比11個(gè)群體遺傳多樣性

      圖 2 群體遺傳相似系數(shù)聚類(lèi)圖Fig. 2 Dendrogram on genetic similarity of various groups

      3 討論

      3.1 遺傳多樣性分析

      茶樹(shù)種質(zhì)資源Shannon多樣性指數(shù)是衡量茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性的重要指標(biāo)。91個(gè)云南千家寨不同海拔野生茶樹(shù)Shannon多樣性指數(shù)為1.33[15];廣東歷史名茶群體種曲江羅坑茶與豐順馬圖茶Shannon多樣性指數(shù)分別為1.217與1.228[16];38個(gè)湖南黃金茶Shannon多樣性指數(shù)為0.55[17];福建地區(qū)茶樹(shù)資源Shannon多樣性指數(shù)為1.16[18];122個(gè)云南野生茶樹(shù)Shannon多樣性指數(shù)為0.88[19]。本試驗(yàn)計(jì)算29個(gè)邵武碎銅茶種質(zhì)資源Shannon多樣性指數(shù)為1.1298,與前人研究相比,Shannon多樣性指數(shù)高于湖南黃金茶與122個(gè)云南野生茶樹(shù),低于廣東歷史名茶與91個(gè)云南千家寨不同海拔野生茶樹(shù),初步鑒定說(shuō)明邵武碎銅茶種質(zhì)資源的群體遺傳多態(tài)性高,多樣性豐富。

      3.2 邵武碎銅茶親緣關(guān)系分析

      29個(gè)邵武碎銅茶種質(zhì)資源與參試對(duì)照福建審(鑒)定品種與地方品種均未聚類(lèi)在一起,說(shuō)明邵武碎銅茶與福建現(xiàn)有育成品種的遺傳背景差異較大,擁有相對(duì)獨(dú)立的遺傳背景,具有較強(qiáng)的育種潛力。除參試材料TY286、TY299、TY264外,邵武碎銅茶種質(zhì)資源主要分為3個(gè)群體,每個(gè)群體的農(nóng)藝性狀、生化成分、適制性茶類(lèi)等需要進(jìn)一步鑒定與觀察;參試材料整體聚類(lèi)分析初步看出,人工選育品種多聚類(lèi)在一起,比如類(lèi)群E、H,地方品種多聚類(lèi)在一起,比如類(lèi)群D、G,同時(shí),綠茶類(lèi)型多聚類(lèi)在一起,烏龍茶類(lèi)型聚類(lèi)在一起。

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