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      以小見(jiàn)大,大數(shù)據(jù)多組學(xué)揭開(kāi)玉帶鳳蝶演化秘密

      2019-06-19 05:42:14張蔚
      時(shí)代人物 2019年33期
      關(guān)鍵詞:玉帶鳳蝶擬態(tài)

      □文|張蔚

      演化生物學(xué)關(guān)注生命過(guò)程的基本問(wèn)題,自達(dá)爾文劃時(shí)代的演化理論提出之后,在思辨推理中不斷的延續(xù)拓展。它探究的問(wèn)題自生命誕生而始,貫穿至今,直至未來(lái)。

      如何解釋生物多樣性?生命如何繁衍、變異、適應(yīng)?物種是如何界定和形成?種種疑問(wèn)隨著科學(xué)積累愈加明晰,又在曲折中盤(pán)旋上升。

      2007年《科學(xué)》雜志建刊125周年時(shí)提出了125個(gè)最具挑戰(zhàn)性的科學(xué)問(wèn)題,其中最重要的前25個(gè)問(wèn)題即包括了:地球生命何時(shí)和如何產(chǎn)生?什么決定了物種多樣性?

      問(wèn)題提出至今十余年間,科學(xué)發(fā)展已經(jīng)日新月異。

      此外,基礎(chǔ)演化理論研究與人類(lèi)生活的關(guān)系日益密切,生態(tài)文明作為一個(gè)人類(lèi)文明發(fā)展的新階段,更加重視保護(hù)和建設(shè)生物多樣性,物種多樣性則是生物多樣性的核心。

      作為一名演化生物學(xué)工作者,我在研究經(jīng)歷中親身體會(huì)到了時(shí)代浪潮推動(dòng)這一經(jīng)典學(xué)科蓬勃發(fā)展,期望以小見(jiàn)大,以蝴蝶擬態(tài)為例,闡述生物演化研究的精彩魅力。

      蝴蝶是一類(lèi)鱗翅目昆蟲(chóng),物種多樣性非常豐富。演化研究關(guān)注蝴蝶翅膀的花紋,這是因?yàn)楹岚蚪Y(jié)構(gòu)相當(dāng)簡(jiǎn)單,但承載著復(fù)雜的功能,例如運(yùn)動(dòng)和求偶等,并且?guī)椭玫牡钟鞌场?/p>

      例如一類(lèi)我國(guó)南方常見(jiàn)的無(wú)毒的玉帶鳳蝶,其部分雌蝶展現(xiàn)出模仿有毒的紅珠鳳蝶的鮮艷花紋,由于這一類(lèi)假警戒的模仿形式首先由英國(guó)博物學(xué)家貝茨在1862年研究巴西蝶類(lèi)時(shí)提出,因此稱(chēng)為“貝氏擬態(tài)”。

      自達(dá)爾文和華萊士時(shí)期起,玉帶鳳蝶擬態(tài)便為人所知,并作為教科書(shū)中列舉的經(jīng)典實(shí)例,一百多年來(lái),科學(xué)家一直致力于在形態(tài)和理論范疇研究這一類(lèi)復(fù)雜擬態(tài)性狀,并通過(guò)飼養(yǎng)觀察其后代表型,認(rèn)為它可能是被一個(gè)單一孟德?tīng)栁稽c(diǎn)控制,提出了擬態(tài)超級(jí)基因假說(shuō),即多個(gè)連鎖的基因共同控制這一復(fù)雜性狀。

      我在芝加哥大學(xué)Kronforst教授的指導(dǎo)下進(jìn)行博士后研究,參與到了研究玉帶鳳蝶擬態(tài)遺傳機(jī)制的工作。合作者Kunte博士首先飼養(yǎng)了幾百只蝴蝶建立家系,對(duì)這個(gè)控制擬態(tài)的遺傳位點(diǎn)進(jìn)行粗定位,由于采用方法的分辨率的局限,獲得的位點(diǎn)包含五個(gè)基因。

      得益于迅速發(fā)展的高通量核酸測(cè)序技術(shù),我對(duì)玉帶鳳蝶進(jìn)行了局部基因組組裝和全基因組關(guān)聯(lián)分析,將該位點(diǎn)定位到了單基因-雙性基因,這一基因在模式生物果蠅中被證明是一個(gè)控制性別決定的關(guān)鍵基因。

      我進(jìn)一步在蝴蝶中鑒定了雙性基因的不同剪切形式,找到了控制這一擬態(tài)特征的雌性轉(zhuǎn)錄本,以及發(fā)現(xiàn)了該擬態(tài)基因是被保留在一段倒位的染色體結(jié)構(gòu)變異中,至此解開(kāi)了玉帶鳳蝶擬態(tài)的機(jī)制。

      此后的研究中,日本科學(xué)家Fujiwara課題組對(duì)該蝴蝶的基因組進(jìn)行組裝,再次確定這一段擬態(tài)基因的染色體倒位區(qū)域,并采用RNA干擾實(shí)驗(yàn)對(duì)該基因進(jìn)行了功能驗(yàn)證。

      后來(lái),我對(duì)該擬態(tài)基因的起源的演化進(jìn)行研究,將研究范圍拓展至更多的近緣種鳳蝶,應(yīng)用了全基因組的群體遺傳學(xué)分析,揭示了這一擬態(tài)和染色體變異的單起源事件,并在理論上提出了擬態(tài)可能伴有負(fù)面效應(yīng)的遺傳負(fù)荷,使得雌性擬態(tài)—非擬態(tài)的多態(tài)性得以共存。

      在多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)的共同努力下,玉帶鳳蝶擬態(tài)這一經(jīng)典科學(xué)問(wèn)題得以解答,新的研究成果被收錄進(jìn)多本教科書(shū)。從一個(gè)世紀(jì)前的博物觀察直至百年后經(jīng)典問(wèn)題的最終揭秘,離不開(kāi)演化研究者對(duì)科學(xué)問(wèn)題的執(zhí)著求索以及大數(shù)據(jù)時(shí)代多組學(xué)技術(shù)的有力支撐。在這樣一個(gè)快速發(fā)展整合創(chuàng)新的時(shí)代,繼續(xù)這樣的演化研究和傳播理性思維,我們面對(duì)著復(fù)雜的問(wèn)題和空前的機(jī)遇,也肩負(fù)著嶄新的使命。

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