趙 姝,李 健,2,馬立才,劉 旭,2,王 元,房文紅
(1.中國水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所,農(nóng)業(yè)部東海漁業(yè)資源開發(fā)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200090;2.上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院,上海 201306)
弧菌是海水養(yǎng)殖環(huán)境中最常見的一類致病菌,廣泛分布于海洋環(huán)境以及海洋生物體表和腸道中[1]。隨著海水養(yǎng)殖規(guī)?;图s化發(fā)展,病害頻繁發(fā)生導(dǎo)致藥物使用增多。喹諾酮類(quinolones)藥物是一類廣譜抗菌藥物,能抑制細(xì)菌的DNA促旋酶和拓?fù)洚悩?gòu)酶IV,導(dǎo)致細(xì)菌DNA的合成受到抑制。喹諾酮類藥物曾是水產(chǎn)養(yǎng)殖主要抗菌藥,目前恩諾沙星仍廣泛用于水產(chǎn)動(dòng)物細(xì)菌性疾病的防治,214株弧菌對其耐藥率為52.3%[2],抗菌藥的使用導(dǎo)致了細(xì)菌耐藥現(xiàn)象越來越普遍[3]。細(xì)菌對喹諾酮類藥物的耐藥機(jī)制主要為靶酶喹諾酮耐藥決定區(qū)(QRDRs)的突變和主動(dòng)外排系統(tǒng)介導(dǎo)的耐藥,前者目前以質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮耐藥基因(PMQR)為研究熱點(diǎn),其雖然介導(dǎo)低水平耐藥,但是常與整合子或插入序列相連,并協(xié)同其他耐藥基因[如超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)]一起水平傳播,進(jìn)而對臨床細(xì)菌性疾病的治療帶來了嚴(yán)重的威脅[4];后者通常引起細(xì)菌的多重耐藥性[5]。主動(dòng)外排系統(tǒng)是細(xì)菌普遍存在的一種耐藥機(jī)制,多見于腸桿菌科的研究報(bào)道[6]。多重耐藥外排泵的底物廣泛,可以外排結(jié)構(gòu)不同的抗菌藥物,目前已報(bào)道的藥物外排泵基因包括 oqxA、oqxB、acrR、marR和 soxR等。外排泵抑制劑可以使細(xì)菌對抗菌藥物的耐藥性降低,洪捷等[7]研究發(fā)現(xiàn),添加外排泵抑制劑羰基氰氯苯腙后,43株人源肺炎克雷伯菌對環(huán)丙沙星和左氧氟沙星的MIC值明顯降低。周維[8]對魚源哈維氏弧菌的研究發(fā)現(xiàn),加入5μg·mL-1的羰基氰氯苯腙后,10株弧菌的MIC值均下降了2~8倍。本研究擬對在前期開展海水養(yǎng)殖源弧菌耐藥性監(jiān)測過程中獲得的菌株進(jìn)行喹諾酮類藥物耐藥表型和基因型分析,通過比較不同外排泵抑制劑逆轉(zhuǎn)弧菌喹諾酮類藥物耐藥的效果,以期為弧菌耐藥機(jī)制研究提供思路,為海水養(yǎng)殖中弧菌病的防治和喹諾酮藥物耐藥的防控提供一定的理論依據(jù)。
121株弧菌為本實(shí)驗(yàn)室于2014—2015年從上海、山東、海南和江蘇等地患病水產(chǎn)動(dòng)物中分離所得,分別為溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)45株,大菱鲆弧菌(V.scophthalmi)42株,哈維氏弧菌(V.harveyi)16株,副 溶 血 弧 菌 (V.parahaemolyticus)14株,鰻弧菌(V.anguillarum)和創(chuàng)傷弧菌(V.vulnificus)各2株。藥敏實(shí)驗(yàn)質(zhì)控菌株大腸埃希菌(Escherichia coli)ATCC25922購自美國典型培養(yǎng)物保藏中心。
硫代硫酸鹽檸檬酸鹽膽鹽蔗糖瓊脂培養(yǎng)基(TCBS)、胰蛋白胨大豆肉湯(TSB)和2216E固體培養(yǎng)基購自青島海博生物技術(shù)有限公司。PremixEx TaqTM(Version 2.0 plus dye)、DNA Maker DL2000和瓊脂糖購自上海生工生物科技有限公司;Wizard?基因組DNA純化試劑盒購自普洛麥格(北京)生化科技有限公司。藥敏實(shí)驗(yàn)所用抗菌藥物標(biāo)準(zhǔn)品環(huán)丙沙星、諾氟沙星和恩諾沙星購自中國藥品生物制品檢驗(yàn)所。外排泵抑制劑甲基吡咯烷酮(N-methyl-2-pyrrolidone,NMP)、利血平(Reserpine,RSP)、羰基氰氯苯腙(Carbonyl cyanide m-chlorophenyl hydrazone,CCCP)和苯丙氨酸-精氨酸-β萘酰胺(Phe-Arg-βnaphthylamide,PAβN)購自 Sigma公司。
恒溫培養(yǎng)箱,MIR-254,日本 Sanyo;恒溫?fù)u床,SHKE5000-8CE,美 國 Thermo;PCR 儀,Mastercycler pro,德國 Eppendorf;電泳儀,DYY-7C,北京六一儀器廠;凝膠成像儀,G05-7500,美國BIO-RAD;超微量分光光度計(jì),ND5000,北京百泰克生物技術(shù)有限公司;微量移液器,德國Eppendorf。
在無菌環(huán)境下,將保存于-80℃的弧菌分區(qū)劃線于TCBS瓊脂平板,28℃培養(yǎng)16—24 h,然后挑取弧菌單菌落接種于2 mL的TSB肉湯(鹽度25)中,28℃搖床中200 r·min-1振蕩培養(yǎng)16—18 h,取1 mL菌液置于離心管中12 000 r·min-1離心2 min收集菌體,參照Wizard?基因組DNA純化試劑盒的操作說明提取PCR模板DNA。利用超微量分光光度計(jì)測定基因組DNA濃度,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
本研究采用美國臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)協(xié)會(huì)(CLSI)描述的瓊脂稀釋法[9]測定試驗(yàn)菌株對喹諾酮類抗菌藥物(恩諾沙星、諾氟沙星和環(huán)丙沙星)的敏感性,同時(shí)以大腸桿菌ATCC25922作為質(zhì)控菌株。藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn)參考CLSI,每個(gè)菌株做3個(gè)平行。恩諾沙星與諾氟沙星敏感、中介和耐藥判定折點(diǎn)分別為≤4μg·mL-1、8μg·mL-1和≥16μg·mL-1,環(huán)丙沙星敏感、中介和耐藥判定折點(diǎn)分別為≤1μg·mL-1、2μg·mL-1和≥4μg·mL-1。
實(shí)驗(yàn)前用MH培養(yǎng)基稀釋外排泵抑制劑儲(chǔ)存液,使甲基吡咯烷酮、利血平、羰基氰氯苯腙和苯丙氨酸-精氨酸-β萘酰胺終濃度分別為100μg·mL-1、40μg·mL-1、5μg·mL-1和 100μg·mL-1。4種外排泵抑制劑濃度為本實(shí)驗(yàn)室經(jīng)過預(yù)實(shí)驗(yàn)后確定,其他步驟參考1.5藥物敏感性實(shí)驗(yàn)。
利用PCR擴(kuò)增的方法檢測試驗(yàn)菌株的外排泵 基 因 (oqxA[5]、oqxB[10]、acrR[11]、marR[11]、soxR[12])、質(zhì) 粒 介 導(dǎo) 的 喹 諾 酮 耐 藥 基 因(qnrVC[13]、qnrS[14]、qnrA[15]、qnrB[16])以及 1類整合子 Int1[17]、4類超級(jí)整合子 SXT[18]和 I型插入序列共同區(qū)ISCR1[19]。PCR引物和擴(kuò)增時(shí)退火溫度參考上述文獻(xiàn);擴(kuò)增產(chǎn)物送往上海生工生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果在GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Blast比對分析。
121株弧菌對恩諾沙星、諾氟沙星和環(huán)丙沙星敏感性測定結(jié)果見表1。121株弧菌中,對恩諾沙星敏感菌株90株,耐藥菌株有31株;對諾氟沙星敏感菌株90株,中介菌株10株,耐藥菌株21株;對環(huán)丙沙星敏感菌株82株,中介菌株17株,耐藥菌株22株。對恩諾沙星和諾氟沙星雙重耐藥的菌株有10株,諾氟沙星和環(huán)丙沙星雙重耐藥菌株14株,環(huán)丙沙星和恩諾沙星雙重耐藥菌株11株,3種藥物同時(shí)耐藥的菌株10株。
對121株弧菌質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮耐藥基因qnrVC、qnrS、qnrA、qnrB和外排泵基因 oqxA、oqxB、acrR、marR、soxR進(jìn)行檢測,喹諾酮耐藥基因僅檢測到qnrA和qnrVC基因,外排泵耐藥基因僅檢測到oqxB(表 2)。其中,qnrA檢出 2株,檢出率1.65%;qnrVC檢出30株,檢出率24.8%;oqxB僅在1株溶藻弧菌(352菌株)中檢出,檢出率0.83%。對30株qnrVC基因陽性的弧菌菌株進(jìn)行深一步分析發(fā)現(xiàn),其分為6個(gè)亞型,分別為qnrVC1(6株)、qnrVC3(14株)、qnrVC4(2株)、qnrVC5(4株)、qnrVC6(3株)和 qnrVC7(1株)。
121株弧菌中,檢測到含1類整合子Int1菌株39株,含4類超級(jí)整合子SXT菌株42株,含I型插入序列共同區(qū)ISCR1菌株44株。其中,同時(shí)含有3種整合子相關(guān)的弧菌17株,Int1和SXT陽性的弧菌23株,Int1和ISCR1陽性的弧菌30株,SXT和ISCR1陽性的弧菌20株。
表1 121株弧菌對3種喹諾酮類藥物的M IC值分布Tab.1 M IC distribution of 121 Vibrio isolates to Enrofloxacin,Norfloxacin and Ciprofloxacin
表2 121株弧菌耐藥基因檢測結(jié)果Tab.2 Results of resistant genes of 121 Vibrio isolates
表3 121株弧菌整合子檢測結(jié)果Tab.3 Integrons detected in 121 Vibrio isolates
2.4.1 弧菌恩諾沙星MIC的變化
在 NMP、RSP、CCCP和 PAβN作用下,121株弧菌中分別有72株、64株、114株和39株弧菌對恩諾沙星的MIC降低了2倍及2倍以上(表4)。4種抑制劑多以降低2倍MIC為主,CCCP抑制劑的作用最為顯著。PAβN對弧菌恩諾沙星的作用最小,只有32.2%菌株MIC降低了,且最大降低倍數(shù)為4倍。
2.4.2 弧菌諾氟沙星MIC的變化
在 NMP、RSP、CCCP和 PAβN作用下,121株弧菌中分別有52株、43株、106株和33株弧菌對諾氟沙星的MIC降低了2倍及2倍以上(表5)。4種抑制劑多以降低2倍MIC為主,CCCP抑制劑的作用最為顯著。PAβN使27.3%的菌株MIC值有所下降,且大多數(shù)菌株降低倍數(shù)為4倍。NMP使1株弧菌的MIC值降低了32倍。
2.4.3 弧菌環(huán)丙沙星MIC的變化
在 NMP、RSP、CCCP和 PAβN作用下,121株弧菌中分別有60株、40株、80株和47株弧菌對環(huán)丙沙星的MIC降低了2倍及2倍以上(表6)。NMP分別使14株、3株弧菌的MIC值降低了4倍和8倍。PAβN分別使10株和1株弧菌的MIC值降低了4倍和8倍。RSP使14株和4株菌的MIC值降低了4倍和8倍。CCCP是4種藥物中使MIC值降低最多的抑制劑,分別使18株、15株、5株、2株弧菌的MIC值下降了4倍、8倍、16倍和32倍。
表4 外排泵抑制劑對121株弧菌的恩諾沙星M IC的影響Tab.4 Effects of four efflus pump inhibitors on Enrofloxacin's M IC s for 121 Vibrio isolates
表5 外排泵抑制劑對121株弧菌的諾氟沙星M IC的影響Tab.5 Effects of four efflus pump inhibitors on Norfloxacin's M IC s for 121 Vibrio isolates
2.4.4 外排泵抑制劑對弧菌的恩諾沙星、諾氟沙星和環(huán)丙沙星耐藥性的影響
4種外排泵抑制劑的效果都很顯著,降低了弧菌對恩諾沙星、諾氟沙星、環(huán)丙沙星的耐藥性(表7)。CCCP分別使14株的恩諾沙星耐藥菌株、4株諾氟沙星耐藥菌株、7株環(huán)丙沙星耐藥菌株變成敏感菌株;使17株恩諾沙星耐藥菌株、2株諾氟沙星耐藥菌株、6株環(huán)丙沙星耐藥菌株變成中介菌株。RSP使4株恩諾沙星耐藥菌株、1株諾氟沙星耐藥菌株變成敏感菌株。NMP使15株恩諾沙星耐藥菌株、1株諾氟沙星耐藥菌株、2株環(huán)丙沙星耐藥菌株變成敏感菌株。PAβN使3株恩諾沙星耐藥菌株、1株環(huán)丙沙星耐藥菌株變成敏感菌株。
對121株弧菌的喹諾酮類藥物耐藥表型和基因型進(jìn)行比較分析(表8),qnrA僅在2株弧菌中檢出,其中1株對環(huán)丙沙星表現(xiàn)為耐藥,對恩諾沙星和諾氟沙星均表現(xiàn)為敏感或中介;在3種喹諾酮類藥物中,qnrVC在耐藥菌株中的檢出率明顯高于敏感或中介菌株,尤其在諾氟沙星和環(huán)丙沙星的耐藥菌株中檢出率明顯高于敏感和中介菌種的檢出率。其中,1類整合子 Int1(51.6%)和I型插入序列共同區(qū)ISCR1(41.9%)在恩諾沙星耐藥菌株中的檢出率均高于敏感和中介菌株的檢出率。外排泵耐藥基因oqxB僅檢出1株,該菌對3種藥物均表現(xiàn)為高耐藥,且不與qnrVC和qnrA共存。
介導(dǎo)喹諾酮類藥物耐藥的機(jī)制可分為垂直傳播的染色體突變耐藥及水平傳播的質(zhì)粒介導(dǎo)耐藥兩種[20]。qnr基因是已知的一類重要的質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮耐藥基因,qnrA是在1998年第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的此類基因,而后,qnrS和qnrB基因陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)。qnrA、qnrB基因通常與一類整合子相連。在霍亂弧菌中發(fā)現(xiàn)的qnrVC基因位于可移動(dòng)原件上[21],且在弧菌中分布較多,部分變體以基因盒形式存在于染色體上,另一部分變體則通過轉(zhuǎn)座子或接合性元件等與其他類耐藥基因共同傳播[22]。本實(shí)驗(yàn)中,共檢測到2株弧菌攜帶qnrA基因,且與一類整合子Int1共存,提示qnrA可能與整合子協(xié)同作用介導(dǎo)弧菌的耐藥性。本實(shí)驗(yàn)共檢測到30株弧菌攜帶qnrVC基因,其中,對恩諾沙星耐藥菌株10株,對諾氟沙星耐藥菌株14株,對環(huán)丙沙星耐藥菌株16株,可見,qnrVC陽性菌株并不都表現(xiàn)高水平的喹諾酮類藥物耐藥性。劉旭[3]發(fā)現(xiàn),雖然qnrVC基因不能介導(dǎo)高水平的耐藥,但其轉(zhuǎn)移性強(qiáng),并可在不同種細(xì)菌間傳播。KIM等[23]發(fā)現(xiàn),霍亂弧菌中分離的由SXT攜帶的qnrVC3基因可與多種耐藥基因結(jié)合,導(dǎo)致弧菌的多重耐藥性,并驗(yàn)證了qnrVC基因可相對提高菌株對喹諾酮類藥物的耐藥水平,同時(shí)具有可傳播性。qnrVC已報(bào)道有 7個(gè)亞型[13,24-26],本研究中檢出的30株qnrVC陽性菌株存在6個(gè)亞型。qnr基因在弧菌中的廣泛分布和較大的基因間變異,以及弧菌對喹諾酮類藥物耐藥表型與基因型存在較大的不一致性,因此推測有更多的qnr基因尚未發(fā)現(xiàn)。
表6 4種外排泵抑制劑對121株弧菌的環(huán)丙沙星M IC的影響Tab.6 Effects of four efflus pump inhibitors on Ciprofloxacin's M IC s for 121 Vibrio isolates
表7 外排泵抑制劑對3種藥物耐藥菌株和中介菌株數(shù)量的改變Tab.7 Susceptibility results and changes in resistance and intermediate isolates
表8 弧菌對喹諾酮藥物耐藥表型和基因型比較分析Tab.8 Comparative analysis of Vibrio quinolone resistance phenotypes and genotypes
整合子是一類能夠捕獲、吸收和表達(dá)外源基因的遺傳元件,在細(xì)菌的耐藥性轉(zhuǎn)移擴(kuò)散中起到重要的作用,尤其會(huì)加重革蘭氏陰性菌的耐藥現(xiàn)象[27]。其中,SXT元件宿主范圍廣泛,結(jié)合轉(zhuǎn)移頻率高,并且以弧菌中發(fā)現(xiàn)最多;SXT元件可長達(dá)100 kb以上,常攜帶耐藥基因簇floR、strB、sul、dfrA、blaCMY-2等[28]。SXT元件介導(dǎo)的霍亂弧菌或燦爛弧菌基因向大腸桿菌的轉(zhuǎn)移頻率均可高達(dá)10-5~10-6/受體菌[29]。JIANG等[30]從我國養(yǎng)殖源海參中分離得到的87株副溶血弧菌,其中Int1的檢出率達(dá)到了100%。本研究通過對121株弧菌中整合子相關(guān)元件的研究發(fā)現(xiàn),Int1、SXT和ISCR1的檢出率分別達(dá)到了32.23%(39/121)、34.71%(42/121)和 36.36%(44/121),提示整合子相關(guān)元件的存在可能是弧菌耐藥性傳播的重要分子機(jī)制之一。
細(xì)菌抗菌藥物耐藥相關(guān)外排系統(tǒng)的作用機(jī)制主要包括:阻斷外排泵的能量來源、阻礙底物通過外排泵通道、干擾外排泵組裝等。CCCP是抑制質(zhì)子轉(zhuǎn)運(yùn)的強(qiáng)解偶聯(lián)劑,可自由擴(kuò)散于磷脂膜兩側(cè),破壞質(zhì)子跨膜梯度,阻斷外排轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)的能量供應(yīng)[31]。利血平是ATP水解能驅(qū)動(dòng)型的外排泵抑制劑,其本身就可作為某些外排泵的底物,可與抗菌藥物競爭結(jié)合外排泵蛋白,進(jìn)而對外排抗菌藥物產(chǎn)生抑制作用[32]。PAβN和NMP均屬于RND特異性外排泵抑制劑,是一類阻礙藥物通過外排泵通道的外排泵抑制劑,其作用機(jī)制為結(jié)合外排泵相應(yīng)位點(diǎn)以阻止其他物質(zhì)與之結(jié)合[33],從而抑制外排泵底物發(fā)生外排。4種外排泵抑制劑均能有效逆轉(zhuǎn)部分弧菌喹諾酮類藥物的耐藥表型,其中CCCP、RSP和NMP能顯著地降低弧菌對恩諾沙星的耐藥性。
外排泵的外排作用同樣是細(xì)菌喹諾酮類藥物耐藥性的重要形成機(jī)制,oqxB是第一個(gè)質(zhì)粒介導(dǎo)的RND家族多重耐藥外排泵,可水平傳播。本研究對121株弧菌的喹諾酮相關(guān)外排泵基因攜帶情況檢測發(fā)現(xiàn),這些弧菌中只有一株菌攜帶外排泵基因oqxB,攜帶該基因的菌株具有很高的耐藥表型,對恩諾沙星、諾氟沙星和環(huán)丙沙星的MIC值分別為 16μg·mL-1、32μg·mL-1和 64 μg·mL-1,加入4種外排泵抑制劑以后,3種抗菌藥的MIC值均顯著降低,且以降低4倍及以上為主。陳孝杰[5]實(shí)驗(yàn)研究顯示,食品動(dòng)物源和食品源大腸桿菌中oqxAB基因的檢出率均達(dá)到22.9%,醫(yī)院臨床分離株和寵物源大腸桿菌的檢出率也達(dá)12.3%和12.0%;且oqxAB基因在水產(chǎn)養(yǎng)殖源弧菌中未曾報(bào)道,推測此外排泵抑制劑對弧菌的作用原理與大腸桿菌有所不同,水產(chǎn)上弧菌耐藥的機(jī)制可能由于其攜帶的可移動(dòng)耐藥元件對其他種類細(xì)菌(如大腸桿菌)上攜帶的耐藥基因的傳播而導(dǎo)致的高水平耐藥。在本研究中,外排泵基因oqxB不與qnrVC和qnrA共存,提示外排泵基因可能是單獨(dú)介導(dǎo)弧菌高耐藥現(xiàn)象的重要機(jī)制。此外,本實(shí)驗(yàn)中的外排泵陽性菌株中并未檢出其他種類的外排泵基因,外排泵基因并不能完全解釋弧菌喹諾酮類藥物的耐藥表型,是否還存在其他相關(guān)的喹諾酮類耐藥基因及外排泵基因,還需要進(jìn)一步的研究和探索。
綜上所述,分離自我國海水動(dòng)物的弧菌部分?jǐn)y帶oqxB、qnrVC基因和qnrA基因,多數(shù)弧菌同時(shí)攜帶整合子相關(guān)元件,如Int1、SXT和ISCR1。外排泵抑制劑實(shí)驗(yàn)的結(jié)果表明,外排泵抑制劑能夠有效地抑制弧菌對喹諾酮類藥物的外排作用,從而提高弧菌對喹諾酮類藥物的敏感性。本研究結(jié)果為海水養(yǎng)殖源弧菌喹諾酮類耐藥性研究提供了一種新的思路方向。