溫室白粉虱染色體水平基因組圖譜組裝成功（2020.4.13 科學網(wǎng)）

近日，《分子生態(tài)資源》在線發(fā)表了農(nóng)業(yè)害蟲溫室白粉虱的染色體級別基因組圖譜。

該項工作由中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所（以下簡稱蔬菜所）蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊和美國康奈爾大學BTI合作完成。他們揭示了溫室白粉虱發(fā)育特異性表達和抗藥性分子機制。該項研究對深入開展白粉虱功能基因組學研究、植物—昆蟲—微生物及病毒互作、粉虱類害蟲抗性治理應用均具有重要意義。

論文第一作者、蔬菜所副研究員謝文介紹，溫室白粉虱和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴重的兩種粉虱類害蟲。煙粉虱基因組在2016年和2017年由合作雙方共同解析完成，但溫室白粉虱基因組一直懸而未決。

在最新研究中，他們利用三代測序平臺Pacbio長reads和Hi-C技術(shù)，實現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級別的組裝，其組裝大小為787Mb，含11條染色體;注釋到18275個蛋白編碼基因，重復序列占基因組的56.6%。

通過白粉虱發(fā)育階段特異性表達分析，他們找到一些和白粉虱蛹化和羽化有關聯(lián)的基因，例如卵黃蛋白基因和cuticle基因。

此外，白粉虱和煙粉虱進化上的分化程度遠遠大于煙粉虱不同生物型之間。白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn)，天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴張，這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關。通過細胞色素P450家族的比較分析，研究人員在白粉虱中找到了與煙粉虱CYPCM1同源的4個P450基因，這4個基因?qū)⒂兄诤Y選白粉虱代謝新煙堿類藥劑。