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      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的研究進(jìn)展

      2020-05-08 12:02:10董志珅倪孟祥
      化學(xué)與生物工程 2020年4期
      關(guān)鍵詞:諾卡核糖體噻唑

      董志珅,倪孟祥

      (中國(guó)藥科大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,江蘇 南京 210000)

      近幾十年來(lái),由于抗生素的大量使用,導(dǎo)致細(xì)菌變異出大量耐藥菌,嚴(yán)重威脅人類健康。在美國(guó),每年有至少200萬(wàn)人感染耐藥菌,2.3萬(wàn)人死于耐藥菌感染[1]。我國(guó)是一個(gè)人口大國(guó),耐藥菌對(duì)我國(guó)人民生命健康的威脅絲毫不亞于癌癥,解決好耐藥菌的問(wèn)題刻不容緩。因此,研究抗菌新機(jī)制、開(kāi)發(fā)新的臨床藥物尤為重要。

      諾卡沙星是由百時(shí)美施貴寶公司的Leet等[2]于20世紀(jì)末發(fā)現(xiàn)的,其從一發(fā)現(xiàn)便引起全球的廣泛關(guān)注,其中不乏制藥巨頭,不過(guò)大部分的研究集中在21世紀(jì)的前10年,而最近10年對(duì)其關(guān)注熱點(diǎn)急劇下降。制藥巨頭放棄諾卡沙星的主要原因可能是因?yàn)橹Z卡沙星的成藥性差,投入與回報(bào)不成比例。圖1是以“Nocathiacin”為詞條在百鏈數(shù)據(jù)庫(kù)檢索到的期刊文獻(xiàn)及專利數(shù)量。

      圖1 以“Nocathiacin”為詞條在百鏈數(shù)據(jù)庫(kù)檢索到的期刊文獻(xiàn)及專利數(shù)量Fig.1 Number of journal documents and patents retrieved by "Nocathiacin" in Bailian Database

      與常規(guī)抗生素相比,諾卡沙星是一類比較少見(jiàn)的硫肽類抗生素家族,雖然該家族中已經(jīng)有100多種分子為我們所知[3],但是真正研究透徹、實(shí)現(xiàn)商品上市的并不多,現(xiàn)在市場(chǎng)上常用產(chǎn)品有硫鏈絲菌素、那西肽等。

      作者在此從時(shí)間維度上綜述諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的生物合成機(jī)制、生產(chǎn)策略、抗菌機(jī)制,指出諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物在應(yīng)用方面存在的問(wèn)題,為其在醫(yī)藥及養(yǎng)殖行業(yè)的廣泛應(yīng)用提供有效策略。

      1 諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物

      諾卡沙星是由三噻唑取代吡啶為核心的環(huán)肽類抗生素,其結(jié)構(gòu)類似物是具有相同核心、對(duì)氨基酸肽鏈進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造以及對(duì)側(cè)鏈進(jìn)行修飾得到的。諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物大多是由苛求擬無(wú)枝酸菌(Amycolotopsisifastidiosa)以及假諾卡氏菌(Nocardiapseudobrasiliensisi)發(fā)酵產(chǎn)生的天然次級(jí)代謝產(chǎn)物。目前,諾卡沙星有NocathiacinⅠ、Nocathiacin Ⅱ、Nocathiacin Ⅲ、Nocathiacin Ⅳ等4種,NocathiacinⅠ的結(jié)構(gòu)式[4]如圖2所示。

      噻唑霉素的結(jié)構(gòu)特征和諾卡沙星極其相似,只是側(cè)鏈的相關(guān)官能團(tuán)發(fā)生了改變[5],如圖3所示。目前,約有10種天然的噻唑霉素分子,其中有幾個(gè)分子是缺少吲哚環(huán)的,它們?cè)谏锎x上被證明是諾卡沙星和噻唑霉素的前體。

      2 諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的生物合成機(jī)制

      2.1 核糖體蛋白的基因表達(dá)

      起初學(xué)者們并不能確定諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的先導(dǎo)肽是核糖體蛋白還是非核糖體蛋白,甚至對(duì)整個(gè)硫肽類抗生素家族的來(lái)源都模棱兩可。直到2009年,結(jié)合各項(xiàng)研究成果最終得到結(jié)論,諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物是一種核糖體蛋白。2011年,劉文團(tuán)隊(duì)成功克隆了硫鏈絲菌素生物合成基因簇,闡明了碳端合成機(jī)制[6]。Luo等[7]通過(guò)位點(diǎn)突變和探針的插入證明了硫肽生物合成基因簇的正確性。TclE-h基因是編碼先導(dǎo)肽鏈骨架的基因,在該基因的上游編碼了雙加氧酶基因TclD,下游則編碼了多個(gè)功能酶以及外排泵的基因。此外,在該基因鏈中還含有編碼了核糖體L11蛋白的基因以及菌體本身的抗性基因。陳依軍團(tuán)隊(duì)[8]深入研究了那西肽生物合成基因簇,確定了那西肽生物合成過(guò)程中的轉(zhuǎn)錄因子,同樣證明了那西肽也是由核糖體蛋白表達(dá)產(chǎn)生的。

      圖2 NocathiacinⅠ的化學(xué)結(jié)構(gòu)式Fig.2 Chemical structural formula of Nocathiacin Ⅰ

      圖3 噻唑霉素的化學(xué)結(jié)構(gòu)式Fig.3 Chemical structural formula of Thiazomycin

      2.2 先導(dǎo)肽鏈的切除

      骨架基因TclE-h表達(dá)的先導(dǎo)肽鏈氨基酸殘基一般有50~60個(gè),隨后會(huì)在水解酶的作用下切除N末端的30多個(gè)殘基,剩下的十幾個(gè)殘基的N端第一個(gè)氨基酸是絲氨酸,第二個(gè)是半胱氨酸。在肽鏈的結(jié)構(gòu)中也存在“半胱氨酸-絲氨酸-半胱氨酸”的三連結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)序列是形成噻唑環(huán)、吡啶環(huán)的核心殘基序列。

      2.3 噻唑環(huán)、吡啶環(huán)的形成

      噻唑環(huán)是由絲氨酸和蘇氨酸殘基脫水形成的(圖4a),而吡啶環(huán)則是在肽鏈充分彎曲的情況下,兩個(gè)半胱氨酸在酶的作用下縮合氧化形成的(圖4b)。這種結(jié)構(gòu)在諾卡沙星和噻唑霉素中都是一樣的。

      a.噻唑環(huán)形成的化學(xué)過(guò)程 b.吡啶環(huán)形成的化學(xué)過(guò)程

      2.4 基團(tuán)的修飾

      在經(jīng)過(guò)噻唑環(huán)、吡啶環(huán)及骨架形成過(guò)程后,便得到噻唑霉素的前體物噻唑霉素E,對(duì)其基團(tuán)進(jìn)行不同修飾即可得到噻唑霉素E1、噻唑霉素E2、噻唑霉素E3[5]。通過(guò)控制培養(yǎng)條件對(duì)側(cè)位基團(tuán)進(jìn)行修飾,不同的培養(yǎng)條件會(huì)形成不同的基團(tuán)修飾,所以才會(huì)形成諸多的諾卡沙星類似物。為得到高純度藥品,往往需要經(jīng)過(guò)多次條件優(yōu)化。除此以外,在環(huán)肽形成以后,鏈中蘇氨酸的一個(gè)側(cè)鏈羥基會(huì)和吲哚反應(yīng),給分子結(jié)合上一個(gè)吲哚,這便形成了諾卡沙星和噻唑霉素的本體。

      3 諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的生產(chǎn)策略

      諾卡沙星是由放線菌分泌的一種體外天然抗生素。由于其結(jié)構(gòu)復(fù)雜,化學(xué)全合成策略到目前為止還沒(méi)有實(shí)現(xiàn)。但是隨著化學(xué)合成技術(shù)的進(jìn)步,發(fā)展了一些半合成化學(xué)工藝。雖然不能完全合成出諾卡沙星,但是半合成的思路為諾卡沙星的結(jié)構(gòu)改造提供了相應(yīng)的策略。

      3.1 生物發(fā)酵

      在自然條件下,諾卡沙星產(chǎn)生菌的野生菌株分泌量很低,遠(yuǎn)達(dá)不到需求量。經(jīng)過(guò)定向誘變菌株和優(yōu)化培養(yǎng)條件后,諾卡沙星產(chǎn)生菌的發(fā)酵水平可以達(dá)到300 μg·mL-1[4]。作者所在課題組通過(guò)物理誘變,獲得一株可以穩(wěn)定產(chǎn)諾卡沙星的苛求擬無(wú)枝酸菌,同時(shí)優(yōu)化了發(fā)酵培養(yǎng)基及發(fā)酵條件。發(fā)酵培養(yǎng)基組成為:葡萄糖30 g·L-1、酵母提取物15 g·L-1、硫酸銨2 g·L-1、磷酸氫二鉀3 g·L-1、豆粉20 g·L-1。在32 ℃、200 r·min-1的搖床中培養(yǎng)72 h,諾卡沙星產(chǎn)量可達(dá)230 mg·L-1、純度可達(dá)80%以上。在相同條件下,噻唑霉素的產(chǎn)量始終很低,可以忽略不計(jì)。

      那西肽目前已經(jīng)上市,它的主要生產(chǎn)手段就是通過(guò)活躍鏈霉菌進(jìn)行發(fā)酵,其產(chǎn)量已經(jīng)達(dá)到克級(jí),通過(guò)不斷的育種篩選可以得到優(yōu)良菌株。李依韋等[9]通過(guò)育種篩選得到了一株產(chǎn)量高達(dá)1 582.73 μg·mL-1的高產(chǎn)菌株。

      3.2 化學(xué)半合成

      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物是由核糖體前體蛋白修飾而成的,而核糖體蛋白都服從中心法則,所以在諾卡沙星的改造中可以通過(guò)突變的方式改變骨架基因的編碼,形成新的骨架。通過(guò)大量的非定點(diǎn)突變可以形成諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的分子庫(kù)。該策略已經(jīng)大量應(yīng)用于其它的硫肽類抗生素上[10-12]。

      利用化學(xué)半合成方法改造諾卡沙星的策略主要有兩個(gè):第一,不改變主體骨架,只對(duì)末端結(jié)構(gòu)進(jìn)行改造,在諾卡沙星的末端有脫水丙氨酸(dehydroalanine),由于其空間位阻小,提供了改造的可能性,不僅可以引入親水基團(tuán)增加水溶性,為成藥做鋪墊,還可以降解掉末端官能團(tuán),形成新的化合物[13]。第二,對(duì)骨架進(jìn)行相應(yīng)的改造,有報(bào)道對(duì)大環(huán)骨架上的2-羥基吡啶[14]以及N-羥基吲哚[15]進(jìn)行相應(yīng)的定向衍生,優(yōu)化了諾卡沙星分子,在保留其抗菌活性的同時(shí),增加溶解度。

      4 諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的抗菌機(jī)制

      諾卡沙星的抗菌機(jī)制從時(shí)間上來(lái)看并不是非常新穎。早在1979年,Wienen等[16]在研究硫鏈絲菌素對(duì)細(xì)菌作用后蛋白質(zhì)的變化時(shí)發(fā)現(xiàn),硫鏈絲菌素是通過(guò)結(jié)合核糖體L11蛋白、阻斷蛋白質(zhì)合成途徑來(lái)起到抑制細(xì)菌生長(zhǎng)的作用。目前,臨床上還沒(méi)有明確發(fā)現(xiàn)該途徑的高致病性耐藥菌。

      5 諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物在應(yīng)用方面存在的問(wèn)題

      (1)溶解性差

      97%純度的諾卡沙星是淡黃色偏綠的干燥粉末,有強(qiáng)烈的揮發(fā)性香氣,分子極性低,溶解性差。在水中的溶解度低于1 mg·mL-1,在純甲醇和乙酸乙酯中的溶解度低于10 mg·mL-1;易溶于氯仿、二甲亞砜等低極性試劑。溶解性差是諾卡沙星的主要問(wèn)題,在幾乎所有的相關(guān)文獻(xiàn)中,都有相同的表述。

      (2)見(jiàn)光易分解

      諾卡沙星分子物理穩(wěn)定性很差,在紫外光照射下極易降解,半衰期約為3 h。所以其儲(chǔ)存條件比較苛刻,生產(chǎn)工藝要求也很高。

      (3)對(duì)細(xì)胞有毒殺作用

      諾卡沙星的作用途徑是蛋白質(zhì)合成途徑,那么勢(shì)必在一定劑量下會(huì)對(duì)人體細(xì)胞產(chǎn)生毒殺作用。作者所在課題組通過(guò)體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn),驗(yàn)證了低劑量條件下諾卡沙星對(duì)HepG2細(xì)胞株的毒殺作用,結(jié)果顯示,在劑量低于1 μg·mL-1時(shí),諾卡沙星對(duì)HepG2細(xì)胞株沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)上的細(xì)胞毒殺作用;在劑量高于10 μg·mL-1時(shí),存在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的細(xì)胞毒殺作用。

      (4)成本高

      目前,諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物大多還是由發(fā)酵產(chǎn)生的,也正是因?yàn)槿芙庑缘膯?wèn)題,導(dǎo)致發(fā)酵產(chǎn)量一直不高,達(dá)不到工業(yè)大生產(chǎn)的水平,即使實(shí)驗(yàn)室小試的生產(chǎn)成本也高達(dá)數(shù)百元。這么高的生產(chǎn)成本,是否能被市場(chǎng)接受,也是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。

      (5)純化步驟復(fù)雜

      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物目前的生產(chǎn)方法決定了后續(xù)的純化工藝的復(fù)雜性。雖然實(shí)驗(yàn)室階段已經(jīng)可以生產(chǎn)出60%~70%純度的產(chǎn)品,但在制藥行業(yè),這種純度遠(yuǎn)沒(méi)有達(dá)到要求。目前的純化策略主要是溶媒萃取法獲得粗品,然后根據(jù)分子性質(zhì)差異設(shè)計(jì)后續(xù)的分離工藝,主要有凝膠柱分離法、ODS柱分離法、薄層制備板分離法以及大孔樹(shù)脂分離法。實(shí)驗(yàn)室通過(guò)凝膠柱分離以及薄層板分離粗品,得到97%純度的諾卡沙星,但回收率太低,也不適合大批量生產(chǎn)。徐天華等[17]對(duì)那西肽的純化工藝進(jìn)行了研究,比較了8種大孔吸附樹(shù)脂對(duì)那西肽粗品所含雜質(zhì)的吸附能力,發(fā)現(xiàn)混合樹(shù)脂純化那西肽比較理想,可以得到99%純度的那西肽。該工藝可以純化克級(jí)甚至十克級(jí)樣品,如果對(duì)其進(jìn)行改進(jìn),也可能實(shí)現(xiàn)大量純化的設(shè)想。

      6 諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物的應(yīng)用

      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物即便有一些缺點(diǎn),但并不妨礙它的廣泛應(yīng)用。1998年,農(nóng)業(yè)部批準(zhǔn)了那西肽作為新獸藥;硫鏈絲菌素也被廣泛應(yīng)用于獸用飼料添加劑。雖然目前還沒(méi)有供人直接使用的產(chǎn)品上市,但是從目前的研究來(lái)看,應(yīng)用是可期的。

      6.1 醫(yī)藥行業(yè)的應(yīng)用

      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物在臨床上可以制備成注射粉針制劑[18],與其它藥物聯(lián)合使用,治療感染高危病患。根據(jù)體外數(shù)據(jù)顯示,諾卡沙星和噻唑霉素的最低抑菌濃度(MIC)為3 ng·mL-1[6]。這表明諾卡沙星的抑菌效果非常好。

      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物還有潛在的抗癌作用,由于其作用途徑為蛋白質(zhì)合成途徑,理論上對(duì)癌細(xì)胞是具有毒殺作用的,并且已經(jīng)有報(bào)道稱,硫鏈絲菌素可以誘導(dǎo)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞自噬,可以作為臨床上針對(duì)非小細(xì)胞肺癌的自噬誘導(dǎo)劑[19]。

      6.2 養(yǎng)殖行業(yè)的應(yīng)用

      諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物可以用于食品工業(yè)。近年來(lái),我國(guó)政府發(fā)布大量政策及意見(jiàn)指導(dǎo):在肉類及禽類養(yǎng)殖加工中,慎重使用抗生素。在這種情況下,為了保證生產(chǎn),類似于那西肽等新型的抗菌藥物被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè),幫助從業(yè)者用藥作業(yè)的同時(shí),也保護(hù)了消費(fèi)者的食品安全權(quán)益。那西肽和硫鏈絲菌素已經(jīng)在這方面完成了實(shí)踐,有相應(yīng)的獸用產(chǎn)品上市,諾卡沙星也可以往這方面拓展。

      7 展望

      臨床耐藥菌對(duì)人類健康的威脅日趨嚴(yán)峻,新抗生素的研發(fā)難度越來(lái)越大,近年新獲批的抗生素種類越來(lái)越少。這種現(xiàn)狀的存在具有兩面性:一方面,減少抗生素的使用,有利于耐藥菌的野生化;另一方面,一旦爆發(fā)大規(guī)模疫情,可能會(huì)無(wú)藥可用,這種風(fēng)險(xiǎn)是存在的。諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物有極佳的抑菌活性,雖然成藥性差,目前無(wú)法直接應(yīng)用于臨床。但是隨著化學(xué)合成技術(shù)的更新、制藥技術(shù)的進(jìn)步,這些問(wèn)題必會(huì)解決。相信,不久的將來(lái),諾卡沙星及其結(jié)構(gòu)類似物可以成為臨床藥物,為人們的健康服務(wù)。

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