C新突變細(xì)胞模型的建立及初步研究"/>
王建力,暢雪麗,張 煒,郭軍紅
線粒體神經(jīng)胃腸腦肌病(mitochondrial neurogastrointestinal encephalomyopathy,MNGIE)是一組常染色體隱性遺傳的罕見病,臨床表現(xiàn)包括眼瞼下垂和/或眼外肌麻痹、胃腸蠕動障礙、周圍神經(jīng)病變;肌肉病理檢查可發(fā)現(xiàn)破碎紅纖維(ragged-red fibers,RRFs)和破碎藍(lán)纖維(ragged-blue fibers,RBFs),頭顱磁共振成像(MRI)可見廣泛的腦白質(zhì)病變[1-3]。目前認(rèn)為其致病基因?yàn)槲挥诔H旧w22q13.32的TYMP基因,該基因編碼胸苷磷酸化酶(thymidine phosphorylase,TP)。TYMP基因突變致TP功能異常,使脫氧胸苷和脫氧尿苷大量蓄積于組織器官中,從而導(dǎo)致三磷酸脫氧核苷酸庫(dNTPs)的平衡被破壞,引起病人一系列臨床表現(xiàn)。
RRM2B基因位于常染色體8q22.3,編碼p53-誘導(dǎo)型核糖核苷酸還原酶(ribonucleotide reductase,RNR)的小亞基(p53inducible small subunit of the ribonucleotide reductase,p53R2)。RNR可以催化核糖核苷酸(nucleoside diphospate,NDP)還原生成相應(yīng)脫氧核糖核苷酸(deoxy-ribonucleotide diphosphate,dNDP),是體內(nèi)三磷酸脫氧核糖核苷酸(deoxy-nucleoside triphosphate,dNTP)從頭合成的限速酶和關(guān)鍵酶[4]。p53R2對于dNTPs的合成十分重要,對于需要不斷復(fù)制的線粒體脫氧核糖核酸(mitochondrial DNA,mtDNA)更是如此;RRM2B基因突變導(dǎo)致dNTP從頭合成途徑異常,從而導(dǎo)致mtDNA耗竭綜合征(mtDNA-depletion syndromes,MDS)[5]。MDS是一組mtDNA拷貝數(shù)嚴(yán)重減少導(dǎo)致受影響組織和器官的能量生產(chǎn)受損的常染色體隱性遺傳疾病[6]。RRM2B基因突變所致的MDS一般表現(xiàn)為癲癇、肌病、胃腸道功能紊亂、乳酸酸中毒、腎小管腎病,甚至幼年死亡[7]。然而MDS仍有較為輕微的臨床表型報道,病人甚至成年起病,臨床表現(xiàn)為MNGIE[8]。
本研究報道1例臨床主要表現(xiàn)為腦白質(zhì)病變、呼吸衰竭、聽力下降、眼外肌麻痹、腹瀉及惡液質(zhì)的中年女性病人,臨床擬診MNGIE,基因檢測結(jié)果提示RRM2B基因c.420G>C純合突變。
1.1 臨床數(shù)據(jù)收集 超過3位專業(yè)的神經(jīng)科醫(yī)生確定病人臨床表現(xiàn),收集病人生化指標(biāo)及影像學(xué)結(jié)果;股四頭肌處進(jìn)行肌肉活體組織檢查;留取病人靜脈血,康旭醫(yī)學(xué)檢測中心對37個線粒體基因和185個線粒體相關(guān)核基因進(jìn)行檢測及數(shù)據(jù)分析。
1.2 細(xì)胞模型
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng) 37 ℃,5% CO2,DMEM細(xì)胞培養(yǎng)基添加10%胎牛血清培養(yǎng)293T細(xì)胞。
1.2.2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 轉(zhuǎn)染前24 h,在不含抗生素的完全培養(yǎng)基中接種細(xì)胞,細(xì)胞密度80%~90%時轉(zhuǎn)染質(zhì)粒。48 h后收集細(xì)胞。
1.2.3 Western Blot試驗(yàn) 裂解液提取細(xì)胞蛋白,12 000 r/min離心10 min,97 ℃加熱10 min后進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。蛋白經(jīng)SDS-PAGE膠分離后轉(zhuǎn)移至NC膜;5%脫脂奶粉封閉1 h,在4 ℃下用p53R2/GAPDH抗體孵育過夜。洗膜后,二抗4 ℃孵育過夜。洗膜并檢測結(jié)合抗體。
1.2.4 mtDNA含量檢測 提取細(xì)胞(5×106)的線粒體DNA,利用分光光度計測定線粒體DNA濃度。
1.3 文獻(xiàn)檢索 根據(jù)關(guān)鍵詞RRM2B、線粒體在PubMed、萬方數(shù)據(jù)庫、中國知網(wǎng)進(jìn)行檢索。
1.3.1 納入標(biāo)準(zhǔn) ①公開發(fā)表的期刊論文、著作、會議論文及摘要、學(xué)位論文;②病人經(jīng)基因檢測發(fā)現(xiàn)明確的RRM2B基因變異;③文獻(xiàn)中給出詳細(xì)的臨床表現(xiàn),包括病人性別、年齡、臨床表現(xiàn)、各臨床表現(xiàn)出現(xiàn)的時間及生化指標(biāo)和輔助檢查。
1.3.2 排除標(biāo)準(zhǔn) ①未行基因檢測或經(jīng)基因檢測未能明確致病基因;②未對病人臨床表現(xiàn)進(jìn)行詳細(xì)描述或臨床表現(xiàn)以統(tǒng)計學(xué)形式給出;③重復(fù)發(fā)表的病例;④病人為雜合突變,臨床表現(xiàn)極為輕微或僅在特殊誘因下發(fā)病。
2.1 臨床資料
2.1.1 臨床表現(xiàn) 1例40歲女性病人,由于腹瀉及體重減輕入住我院。病人足月順產(chǎn),6歲使用慶大霉素后雙耳聽力受損,之后聽力逐漸下降,至37歲聽力完全喪失;7歲時曾診斷為過敏性紫癜(具體不詳);27歲因外傷行頭顱CT檢查,提示腦白質(zhì)病變;31歲時病人出現(xiàn)進(jìn)行性肢體無力,活動后加重;33歲時因發(fā)熱診斷為慢性腎炎(具體不詳);37歲開始無明顯誘因出現(xiàn)排便次數(shù)增多,每日4次或5次,成形;37~40歲逐漸出現(xiàn)吞咽困難、眼瞼下垂、視物成雙,體重減輕共25 kg。家族史:祖母與外祖母系同村同姓人家,具體親緣關(guān)系不詳;其父排便次數(shù)多,每日4次或5次,成形;32歲剖宮產(chǎn)一女,其女體健。病人身高158 cm,體重34 kg(體質(zhì)指數(shù)13.62 kg/m2)。神經(jīng)系統(tǒng)查體:高級智能活動正常;雙側(cè)瞳孔等大等圓,直徑約4.0 mm,對光反射存在;雙側(cè)眼瞼下垂,眼球活動差;雙耳聽力完全喪失;屈頸無力,吞咽困難,雙側(cè)軟腭上抬無力,四肢近端肌力差,四肢腱反射減弱;四肢末梢淺感覺減退,余神經(jīng)系統(tǒng)查體大致正常。
2.1.2 生化指標(biāo) 尿糖輕微增高;血常規(guī)、尿常規(guī)、凝血、肝腎功能、電解質(zhì)、血糖、肌酶、甲狀腺功能、風(fēng)濕系列、血漿乳酸水平大致正常。
2.1.3 影像學(xué)檢查 頭顱MRI提示彌漫腦白質(zhì)病變(見圖1),磁共振波譜分析(MRS)未見乳酸峰增高。肌電圖及神經(jīng)電圖提示輕度神經(jīng)源性損害。上消化道中消化道造影提示:慢性胃炎、胃下垂;腸功能紊亂(通過過快);橫結(jié)腸低位。
圖1 頭顱MRI提示腦白質(zhì)病變
2.1.4 肌肉病理檢查 征得病人家屬同意后,對病人進(jìn)行肌肉病理檢查。結(jié)果提示:肌纖維大小重度不等,小圓變肌纖維散在存在,蘇木精-伊紅(HE)及改良格莫瑞三色(MGT)染色可見RRFs;琥珀酸脫氫酶(SDH)染色可見大量RBFs,細(xì)胞色素氧化酶(COX)染色可見部分肌纖維COX酶活性缺失:ATPase染色提示Ⅱ型纖維萎縮;油紅 O 染色液(ORO)染色及過碘酸雪夫氏(PAS)染色未見異常。詳見圖2。
圖2 肌肉病理檢查可見RRFs(×100)
2.1.5 基因檢測 在征得病人家屬同意后對病人進(jìn)行基因檢測。檢測線粒體基因組上的37個基因,未發(fā)現(xiàn)與臨床表型相關(guān)的基因變異,進(jìn)一步檢測未發(fā)現(xiàn)病人線粒體基因大片段變異;檢測線粒體病相關(guān)185個核基因,在病人RRM2B基因發(fā)現(xiàn)c420.G>C(p.Leu140Phe)的純合核苷酸變異,對病人父母該位點(diǎn)進(jìn)行Sanger測序,證實(shí)其父母該位點(diǎn)均為雜合子(見圖3)。該突變在ExACA、ClinVar及OMIM數(shù)據(jù)庫均未見收錄。
圖3 基因檢測結(jié)果(箭頭指示突變位點(diǎn))
2.1.6 隨訪結(jié)果 2年后,病人因發(fā)熱導(dǎo)致呼吸衰竭再次入住我院。查體:體質(zhì)指數(shù)較前無明顯改變;右側(cè)瞳孔3.5 mm,左側(cè)瞳孔3.0 mm,對光反射消失;其他體征較前無明顯改變。血?dú)夥治?鼻導(dǎo)管吸氧狀態(tài)下):pH 7.09,動脈血氧分壓103 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),動脈血二氧化碳分壓108 mmHg。立即給予病人抗感染及呼吸支持治療;在院期間反復(fù)發(fā)生嚴(yán)重感染,6個月后病人家屬要求帶管離院(氣管切開狀態(tài)),院外繼續(xù)家用呼吸機(jī)輔助呼吸;規(guī)律隨訪1年后失訪。
2.2 細(xì)胞模型 干擾質(zhì)粒(pLVX-shRNA2-shR RM2B)轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞抑制293T細(xì)胞RRM2B基因轉(zhuǎn)錄,之后轉(zhuǎn)染含突變的過表達(dá)質(zhì)粒[Plvx-IRES-ZsGreen1-RRM2B(c.420G>C)]模擬RRM2B基因c.420G>C的突變細(xì)胞。
2.2.1 RRM2B基因c.420G>C突變降低293T細(xì)胞內(nèi)RRM2B基因蛋白表達(dá)水平 RRM2B基因是編碼p53R2蛋白的核基因。Western Blot法測定細(xì)胞內(nèi)p53R2蛋白的數(shù)量(見圖4),在含突變細(xì)胞內(nèi)p53R2蛋白含量顯著下降,即RRM2B基因蛋白表達(dá)量下降。同時,在轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒(pLVX-res-ZsGreen1-RRM2B)后可以逆轉(zhuǎn)這種下降趨勢。
2.2.2 RRM2B基因c.420G>C突變降低293T細(xì)胞內(nèi)mtDNA含量 p53R2蛋白對于mtDNA的生成十分重要,所以推測RRM2B基因c.420G>C突變同樣可以影響mtDNA數(shù)量并導(dǎo)致MDS。提取細(xì)胞內(nèi)mtDNA,利用分光光度計測定mtDNA含量(見圖5)。在突變細(xì)胞內(nèi)mtDNA數(shù)量顯著下降,同時,在轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒(pLVX-res-ZsGreen1-RRM2B)后mtDNA含量恢復(fù)。
A:空白組,無任何處理;B:干擾質(zhì)粒的空白對照;C:過表達(dá)質(zhì)粒的空白對照;D:實(shí)驗(yàn)組,轉(zhuǎn)染含點(diǎn)突變的過表達(dá)質(zhì)粒+干擾質(zhì)粒;E:對照組,轉(zhuǎn)染不含點(diǎn)突變的過表達(dá)質(zhì)粒+干擾質(zhì)粒。與實(shí)驗(yàn)組比較,*P<0.001。圖4 RRM2B基因c.420G>C下調(diào)基因表達(dá)量
A:空白組,無任何處理;B:干擾質(zhì)粒的空白對照;C:過表達(dá)質(zhì)粒的空白對照;D:實(shí)驗(yàn)組,轉(zhuǎn)染含點(diǎn)突變的過表達(dá)質(zhì)粒+干擾質(zhì)粒;E:對照組,轉(zhuǎn)染不含點(diǎn)突變的過表達(dá)質(zhì)粒+干擾質(zhì)粒。與實(shí)驗(yàn)組比較,*P<0.001。圖5 RRM2B基因c.420G>C降低細(xì)胞內(nèi)mtDNA含量
2.3 文獻(xiàn)回顧 根據(jù)納入標(biāo)準(zhǔn),初次檢索后得到76篇文獻(xiàn);根據(jù)排除標(biāo)準(zhǔn)最終得到9篇文獻(xiàn)[7-15]。根據(jù)9篇文獻(xiàn),統(tǒng)計來自12個家系的13例RRM2B基因變異病人(包含本研究納入的1例病人)的臨床數(shù)據(jù),總結(jié)RRM2B基因變異的臨床特點(diǎn)。詳見表1。
表1 13例RRM2B基因突變病人臨床表現(xiàn)及輔助化驗(yàn)檢查指標(biāo)
哺乳動物中,mtDNA共編碼13種線粒體蛋白質(zhì);但是mtDNA的數(shù)量及表達(dá)依賴于數(shù)百個核基因編碼的在細(xì)胞質(zhì)中合成后輸入線粒體的蛋白質(zhì),這些基因決定了mtDNA的數(shù)量、復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、RNA成熟和翻譯[16]。這一類核基因可以分為兩類:一類是編碼的蛋白可以直接作用于mtDNA復(fù)制叉的基因,例如POLG、POLG2和TWINKLE;一類是編碼的蛋白可以為mtDNA復(fù)制提供所需的dNTPs,例如TK2、DGUOK、TYMP、SUCLA2、ANT1[17]。也就是說,這些核基因的變異可以影響線粒體內(nèi)的核苷酸平衡或mtDNA復(fù)制進(jìn)而導(dǎo)致mtDNA異常。
RRM2B基因是編碼p53R2的核基因,位于8q22.3。兩個拷貝數(shù)的p53R2與兩個拷貝數(shù)的R1一起形成RNR;RNR可以催化NDP還原生成相應(yīng)dNDP,為DNA的合成和修復(fù)提供前體[18]。p53R2對于非增殖細(xì)胞中DNA修復(fù)和mtDNA合成所需的dNTPs合成至關(guān)重要[19]。
RRM2B基因變異主要影響的器官是骨骼肌、大腦及腎臟[20]。RRM2B基因變異導(dǎo)致MDS,表現(xiàn)為癲癇、肌張力降低、腹瀉、腎小管病變、乳酸酸中毒和嬰幼兒早期死亡[7]。
缺乏p53R2會阻礙氧化損傷后DNA的修復(fù)并激活p53依賴的細(xì)胞凋亡。由于腎臟對于清除體內(nèi)有毒代謝產(chǎn)物十分重要,意味著腎臟經(jīng)常暴露于各種氧化應(yīng)激環(huán)境下,因此RRM2B突變常導(dǎo)致嚴(yán)重的腎臟損害[21]。RRM2B基因突變所致疾病的臨床表現(xiàn)可能存在組織器官特異性,這可能與胚胎早期細(xì)胞核DNA突變致mtDNA復(fù)制異常,在不同干細(xì)胞之間mtDNA損傷或耗竭的程度不同[22];隨著干細(xì)胞的分裂分化產(chǎn)生了組織器官特異性,同樣可以解釋不同病人之間發(fā)病年齡、病情嚴(yán)重程度差異較大的原因。本研究所報道的1例病人臨床表現(xiàn)為胃腸道功能紊亂、周圍神經(jīng)損害、RRFs和腦白質(zhì)病變,完全符合MNGIE的臨床特征,基因檢測發(fā)現(xiàn)RRM2B基因c.420G>C純合核苷酸變異。目前已有文獻(xiàn)報道成年RRM2B基因突變病人臨床表現(xiàn)為MNGIE[8]。事實(shí)上,RRM2B基因突變病人臨床常伴隨有胃腸道功能障礙,出現(xiàn)類似MNGIE病人臨床表型,稱為MNGIE-like[23]。
通過對所統(tǒng)計的文獻(xiàn)中13例病人的臨床表現(xiàn)、生化指標(biāo)及輔助檢查結(jié)果總結(jié):①所有病人均出現(xiàn)不同程度的肌無力,且肌無力出現(xiàn)后常伴隨著病人病情的嚴(yán)重暴發(fā),提示肌無力出現(xiàn)的早晚可能與病人病程長短呈正相關(guān),同時提示臨床醫(yī)生在處理該類病人過程中,在出現(xiàn)肌無力的臨床表現(xiàn)后,應(yīng)積極進(jìn)行對癥處理,做好呼吸支持和營養(yǎng)支持,以降低或推遲致死性臨床癥狀的發(fā)生。②有4例(30.8%)病人表現(xiàn)出文獻(xiàn)中RRM2B基因突變所致的典型的腎小管疾病,但在晚發(fā)型病人未見到典型的腎小管病,該4例病人的腹部超聲均表現(xiàn)為腎椎體高回聲影,這可能與鈣沉積相關(guān)。因此臨床兒科醫(yī)生應(yīng)注意完善該類病人的腎臟超聲,一旦發(fā)現(xiàn)腎臟有類似影像學(xué)表現(xiàn),應(yīng)考慮到RRM2B基因突變的可能性。③有6例(46.2%)病人的頭顱影像學(xué)檢查發(fā)現(xiàn)脫髓鞘樣改變,除外7例未進(jìn)行腦脊液檢查的病人,6例行腦脊液檢查的病人中腦脊液蛋白水平均明顯升高,高度提示RRM2B基因突變可破壞血腦屏障;且編號為2、3的病人聽力障礙均為應(yīng)用抗生素藥物后出現(xiàn),猜測可能是因?yàn)檠X屏障受損導(dǎo)致藥物穿透血腦屏障后作用于中樞神經(jīng)系統(tǒng),導(dǎo)致藥物的中樞神經(jīng)系統(tǒng)副作用發(fā)生率增加。因此,對于此類病人應(yīng)謹(jǐn)慎使用中樞神經(jīng)系統(tǒng)毒性的藥物,以降低中樞神經(jīng)系統(tǒng)副作用的發(fā)生的概率。④有7例(53.8%)病人出現(xiàn)不同的胃腸道癥狀(包括食欲差、嘔吐、腹瀉),其中編號為1、2、3、11的病人同時具備胃腸道癥狀、聽力障礙、眼瞼下垂/眼外肌麻痹,輔助檢查頭顱影像學(xué)檢查異常、肌肉活檢可見RRF等特征,臨床上亦可診斷MNGIE,再次明確RRM2B基因突變可導(dǎo)致MNGIE的臨床表型,擴(kuò)充了MNGIE的基因譜。⑤在5例仍存活的病人中,包括2例臨床表現(xiàn)嚴(yán)重的早發(fā)型病人,此2例病人在病程前期即給予G-管進(jìn)行營養(yǎng)支持;2例呼吸肌輔助呼吸的病人在院外繼續(xù)呼吸機(jī)輔助呼吸后仍可較長時間存活,提示對于此類病人,較早的進(jìn)行營養(yǎng)學(xué)支持和必要的呼吸支持能顯著改善病人預(yù)后。
在體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,轉(zhuǎn)染pLVX-shRNA2-shRRM2B至293T細(xì)胞抑制細(xì)胞內(nèi)RRM2B基因轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)染Plvx-IRES-ZsGreen1-RRM2B(c.420G>C)模擬突變細(xì)胞,作為對照組轉(zhuǎn)染pLVX-res-ZsGreen1-RRM2B挽救實(shí)驗(yàn)組的改變。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí),與對照組相比,含RRM2B基因c.420G>C的細(xì)胞RRM2B基因蛋白表達(dá)量顯著下降,mtDNA含量下降,初步明確了該突變的致病性和致病機(jī)制。
在RRM2B基因變異的病人中:①肌無力的發(fā)生常意味著致死性臨床癥狀的發(fā)生;②MNGIE的臨床表型常見;③早期營養(yǎng)支持以及及時的呼吸支持可能會顯著改善病人預(yù)后。