張 慧,朱紅勝,劉文亞
(南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院 蘇州市立醫(yī)院 檢驗(yàn)科,江蘇 蘇州 215002)
急性T淋巴細(xì)胞白血病(T-cell acute lymphoblastic leukemia, T-ALL)是胸腺細(xì)胞多個(gè)基因異常的惡性侵襲性腫瘤, 兒童和成人新診斷為T-ALL病例分別占15%和25%。在T-ALL中目前比較明確的突變基因主要是IL-7R、WT1、FBXW7、NOTCH11和PHF6[1-5]。IL-7在T淋巴細(xì)胞的正常發(fā)育和功能維持中有著非常重要的作用,主要通過(guò)與IL-7R結(jié)合發(fā)揮其生物學(xué)功能[6]。除了IL-7,其他的細(xì)胞因子胸腺基質(zhì)淋巴細(xì)胞生成素(thymic stromal lymphopoietin,TSLP)也可結(jié)合IL-7R而組成TSLP受體的另一條鏈TSLPR。IL-7R和CRLF2信號(hào)在早期T淋巴細(xì)胞發(fā)育成熟過(guò)程中有著非常重要的作用[7];IL-7通過(guò)啟動(dòng)JAK/STAT5和PI3K/AKT/mTOR信號(hào)途徑活化促進(jìn)T細(xì)胞的生存和細(xì)胞周期進(jìn)展[8]。有研究發(fā)現(xiàn)在T-ALL患者中可以檢測(cè)到IL-7R的突變[6],為進(jìn)一步研究T-ALL患者中IL-7R的突變情況,本研究對(duì)125例ALL患者進(jìn)行第二代測(cè)序,探討ALL中IL-7R 突變特征。
1.1病例選擇 收集2008年6月至2018年10月蘇大附一院和蘇州市立醫(yī)院共125例T-ALL骨髓標(biāo)本庫(kù)患者,提取其基因組DNA,研究對(duì)象均經(jīng)遺傳學(xué)、細(xì)胞形態(tài)學(xué)、免疫表型、和分子生物學(xué)確診,其中男102例,女23例;男:女比4.43:1,年齡范圍7~32歲,中位年齡23歲。125例患者中,49例患者未在我院行誘導(dǎo)化療,治療情況不詳。其余分別給予VDCP(長(zhǎng)春新堿類+蒽環(huán)類+環(huán)磷酰胺+糖皮質(zhì)激素+酪氨酸激酶抑制劑)和VDCLP方案(長(zhǎng)春新堿類+蒽環(huán)類+環(huán)磷酰胺+門冬酰胺酶+糖皮質(zhì)激素)。
1.2儀器與試劑 DNA提取試劑盒、測(cè)序反應(yīng)通用試劑盒、水平離心機(jī)(LDZ-5)、光學(xué)顯微鏡(日本Olympus公司)、PCR儀(ABI2720)(美國(guó)ABI公司)、PCR擴(kuò)增引物。
1.3方法 按照DNA提取試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行。按照儀器和試劑盒說(shuō)明書對(duì)IL-7R基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增;擴(kuò)增產(chǎn)物送公司測(cè)序,基因突變陽(yáng)性樣本進(jìn)一步進(jìn)行TA克隆。
1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 20.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。計(jì)數(shù)資料以百分比或率表示,采用χ2檢驗(yàn)(或Fisher精確概率檢驗(yàn));非正態(tài)分布計(jì)量資料以中位數(shù)(四份位數(shù))表示,采用非參數(shù)Mann-Whitney檢驗(yàn);以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)和預(yù)后 兩組WBC、Hb、Plt、LDH 、原始細(xì)胞、復(fù)發(fā)率及病死率等指標(biāo)在兩組之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均>0.05)。見表1。
表1 兩組實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)和預(yù)后比較
2.2125例T-ALL脾臟、肝臟和淋巴結(jié)浸潤(rùn)的比例 在125例T-ALL患者中有脾臟浸潤(rùn)者57.6%(72/125),有肝臟浸潤(rùn)者29.6%(37/125),有淋巴結(jié)浸潤(rùn)者56.0%(7/125)。
2.3IL-7R突變信息 IL-7R突變位于IL-7R跨膜區(qū)的P240-S246序列;突變的類型為開放閱讀框的插入和缺失,7例突變類型分別為:c.727-730 InsAGCCACTGCCAGG DelCTAA, c.724-736 InsCCTACGGGAT DelTTACTAACCATCA, c.732 InsGGGCCCAATATTGTGACGT DelC, c.724-736InsCCTACGGGAT DelTTACTAACCATCA,c.732 InsCTAAGGTGC,c.731-732 InsGGTTGTCAGAG DelAC, c.720-736 InsAAAACGGT DelTATCTTACTAACCATCA。見表2和圖1。
表2 T-ALL中IL-7R突變插入缺失的具體堿基序列及其他基因突變情況
IL-7R在T淋巴細(xì)胞的發(fā)育、成熟、細(xì)胞內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定的維持等方面有著重要的作用[9]。本研究125例T-ALL患者中IL-7R基因突變率為5.6%(7/125),Shochat等[7]研究中IL-7R在ALL中的突變率為10.5%,Zenatti等[10]報(bào)道IL-7R基因突變率為9%,本研究IL-7R基因突變率稍低于后兩者的報(bào)道。本研究中7例IL-7R基因突變者同時(shí)伴有Notch1基因突變的有2例,伴有PFH6突變的有1例,伴有WT1突變的有1例。7例IL-7R基因突變的類型是開放閱讀框的插入和缺失,突變的位置位于IL-7R跨膜區(qū)的P240-S246序列,與文獻(xiàn)報(bào)道基本一致[10]。
圖1 IL-7R突變插入缺失的具體堿基序列圖 方框內(nèi)為插入的序列(所有插入-缺失突變均為雜合,只有等位基因分離后才顯示突變的等位基因)。WT:野生型;Ins:插入;Del:刪除
本組IL-7R突變分別是c.727-730 InsAGCCACTGCCAGG DelCTAA, c.724-736 InsCCTACGGGAT DelTTACTAACCATCA, c.732 InsGGGCCCAATATTGTGACGT DelC, c.724-736InsCCTACGGGAT DelTTACTAACCATCA,c.732 InsCTAAGGTGC,c.731-732 InsGGTTGTCAGAG DelAC, c.720-736 InsAAAACGGT DelTATCTTACTAACCATCA。本研究顯示,兩組病死率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。由于突變患者比較少,需擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步研究該基因突變對(duì)預(yù)后的影響。研究顯示,IL-7R突變產(chǎn)生一個(gè)半胱氨酸,使相鄰的鏈產(chǎn)生同源二聚化,導(dǎo)致二硫鍵的形成,使受體發(fā)生構(gòu)像改變,導(dǎo)致信號(hào)通路持續(xù)活化而參與腫瘤形成機(jī)制[11]。另外,有研究報(bào)道IL-7R的5號(hào)外顯子也可以發(fā)生基因突變[12]。這就要求我們擴(kuò)大T-ALL患者的樣本量、增加T-ALL病人的信息作進(jìn)一步的研究。
生物學(xué)和功能分析表明這些突變的IL-7R基因可激活造血祖淋巴細(xì)胞獨(dú)立生長(zhǎng)的細(xì)胞因子[7]。有研究指出IL-7R和CRLF2的突變表明額外增加在近膜處的半胱氨酸是白血病Ⅰ型細(xì)胞因子受體基因突變激活的機(jī)制[7]。針對(duì)T-ALL的靶向治療方案仍缺乏特異性以及不良反應(yīng)大等問(wèn)題,這些問(wèn)題有待于進(jìn)行更深入性的探究和解決。強(qiáng)化化療方案的應(yīng)用使兒童T-ALL患者預(yù)后顯著提高,但成人及復(fù)發(fā)耐藥T-ALL患者的預(yù)后仍較差。研制新型靶向藥物特異性阻斷T-ALL細(xì)胞內(nèi)生存及耐藥相關(guān)的異常激活信號(hào)通路近年來(lái)被認(rèn)為是治療成人及復(fù)發(fā)難治T-ALL患者的新策略[13-16]。近年來(lái),雖然對(duì)IL-7R突變?cè)赥-ALL中具體機(jī)制仍不清楚,但對(duì)IL-7R基因在T-ALL中的認(rèn)識(shí)不斷增加。綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)的若干突變位點(diǎn)和類型值得進(jìn)行深入的功能和機(jī)制研究,需進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步研究該基因突變?cè)赥-ALL患者中的影響。