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      一株低致病力H5N3 亞型禽流感病毒的全基因組序列分析及其對(duì)小鼠的感染性研究

      2020-08-06 08:39:46崔鵬飛崔嘉琦谷文麗張?jiān)?/span>范威峰仲啟鑫鄧國(guó)華陳化蘭
      關(guān)鍵詞:抗原性致病性亞型

      邢 鑫,崔鵬飛,崔嘉琦,谷文麗,張?jiān)?,范威峰,仲啟鑫,鄧?guó)華,陳化蘭

      (中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/農(nóng)業(yè)部動(dòng)物流感重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室,黑龍江 哈爾濱 150069)

      禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)屬于正粘病毒科流感病毒屬,其基因組為8 個(gè)節(jié)段的單股負(fù)鏈RNA。AIV 包含16 種HA 亞型和9 種NA 亞型,且其HA 與NA 亞型組合多樣[1]。按照病毒對(duì)家禽的致病性可以將AIV 分為高致病性禽流感病毒(HPAIV)和低致病性禽流感病毒(LPAIV)[2]。其中,HPAIV 包含部分H5 和H7 亞型AIV,高致病性H5 亞型AIV 通常引起家禽的大規(guī)模死亡,從而造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失[3]。常見(jiàn)的高致病性H5 亞型有H5N1、H5N6、H5N8 等組合,而H5N3 HPAIV 引起流感疫情的報(bào)道較少,僅在1961 年南非發(fā)生數(shù)千只燕鷗因感染H5N3 死亡[4]和中國(guó)臺(tái)灣地區(qū)家禽感染高致病性H5N3 死 亡 的 報(bào) 道[5]。H5N3 亞 型AIV 在 家 禽 中 屬 于 比較罕見(jiàn)的H5 亞型病毒組合之一,加上低致病力H5N3 亞型AIV 感染宿主后臨床癥狀不明顯,以至于人們對(duì)該類型病毒關(guān)注度較低。為了解我國(guó)H5N3亞型AIV 的部分生物學(xué)特性,本研究對(duì)2019 年我國(guó)廣西省分離到的一株H5N3 亞型LPAIV 進(jìn)行了全基因組序列分析、抗原性分析,及其對(duì)小鼠的感染性分析和受體結(jié)合特性分析。通過(guò)對(duì)該病毒株的生物學(xué)特性進(jìn)行探究,有利于獲得我國(guó)H5N3 亞型AIV的遺傳演化、抗原性與致病性的變化規(guī)律,能夠?yàn)橐咔榈念A(yù)警預(yù)報(bào)、防控措施的調(diào)整提供數(shù)據(jù)支持。

      1 材料與方法

      1.1 病毒株及實(shí)驗(yàn)動(dòng)物低致病力H5N3 亞型AIV由國(guó)家禽流感參考實(shí)驗(yàn)室分離并保存,其分離自2019 年春季廣西省禽流感監(jiān)測(cè)樣品,病毒命名為DK/GX/S11453/2019(H5N3)(簡(jiǎn)稱為DK/GX/S1453/19);10 日齡SPF 雞胚購(gòu)自中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心;6 周齡雌性BALB/c 小鼠購(gòu)自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司。

      1.2 主要試劑病毒RNA 提取試劑盒購(gòu)自北京天根生化科技有限公司;M-MLV 反轉(zhuǎn)錄酶及RNA 酶抑制劑購(gòu)自美國(guó)Promega 公司;EasyTaqDNA 聚合酶購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;膠回收試劑盒購(gòu)自美國(guó)OMEGA 公司;Big Dye Terminator 測(cè)序試劑盒3.1version 購(gòu)自美國(guó)ABI 公司;受體試驗(yàn)所用α-2,3 和α-2,6 糖鏈由日本東京大學(xué)的Yasou Suzuki 博士惠贈(zèng);雞H5 抗血清由國(guó)家禽流感參考實(shí)驗(yàn)室制備;山羊抗雞IgG-HRP 購(gòu)自Southernbiotech 公司。

      1.3 病毒的全基因組序列測(cè)定及遺傳演化分析

      1.3.1 核酸的提取及RT-PCR 擴(kuò)增利用病毒RNA提取試劑盒提取病毒RNA 后反轉(zhuǎn)錄為cDNA。根據(jù)GenBank 中H5 亞型AIV 同源性最高的序列區(qū)域設(shè)計(jì)所需擴(kuò)增片段的引物,并進(jìn)行PCR 擴(kuò)增[6],擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)大小無(wú)誤后,利用膠回收試劑盒進(jìn)行純化。

      1.3.2 序列測(cè)定及遺傳演化分析以純化后的PCR產(chǎn)物為模板,使用測(cè)序反應(yīng)試劑盒BigDye Terminator處理后于ABI 測(cè)序儀中進(jìn)行基因序列測(cè)定。測(cè)序結(jié)果使用DNAStar 軟件中的Seqman 程序拼接全基因組序列,利用NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST 比對(duì),選擇與所測(cè)定基因序列核苷酸同源性相近的病毒株作為參考株基因序列。使用Megalign 同源性比對(duì)后應(yīng)用MEGA7.0 軟件繪制該病毒株表面基因的進(jìn)化樹(shù),并分析其進(jìn)化關(guān)系。

      1.4 抗原性差異分析將該H5N3 亞型AIV 測(cè)定血凝價(jià)后配制成標(biāo)準(zhǔn)的四單位抗原,四單位抗原驗(yàn)證準(zhǔn)確后按照標(biāo)準(zhǔn)的OIE HA-HI 方法進(jìn)行交叉HA-HI試驗(yàn)[7],測(cè)定該病毒對(duì)不同分支H5 亞型AIV 血清的交叉血凝抑制效價(jià)。

      1.5 小鼠感染性試驗(yàn)參照文獻(xiàn)[8]測(cè)定該分離株雞胚半數(shù)感染量(EID50)。利用干冰輕微麻醉小鼠后,使用106EID50/50 μL 的該病毒鼻腔感染8 只6 周齡的雌性BALB/c 小鼠,50 μL/只。另設(shè)5 只小鼠鼻腔接種50 μL PBS 作為空白對(duì)照。感染后第3 d 隨機(jī)安樂(lè)死3 只感染組小鼠,分別無(wú)菌采集每只小鼠的腦、鼻甲、脾臟、腎臟和肺臟,置于1 mL 含有雙抗的PBS離心管中,組織勻漿并離心后取上清液,接種10 日齡雞胚進(jìn)行組織病毒含量的滴定。剩余的小鼠連續(xù)觀察14 d 并記錄小鼠的體質(zhì)量變化及死亡情況。

      1.6 病毒的受體結(jié)合特性分析采用糖鏈固相結(jié)合ELISA 的方法分析DK/GX/S1453/19 病毒株的受體結(jié)合特性:將α-2, 3 和α-2, 6 糖鏈分別以初始濃度為100 ng/μL 二倍倍比稀釋后以100 μL/孔的劑量包被ELISA 板,放入交聯(lián)儀中使用紫外照射10 min,使用預(yù)冷的PBS 洗滌4 遍。將病毒配制為64 單位抗原,以100 μL/孔包被ELISA 板。4 ℃孵育過(guò)夜后使用 預(yù) 冷 的0.1%PBST 洗 滌4 遍,預(yù) 冷 的PBS 洗 滌 一遍。加入100 μL 10%的福爾馬林室溫作用30 min,以去除NA 的活性。使用相同的方法洗滌后加入100 μL 1∶400 稀釋的雞H5 抗血清,37 ℃作用1 h。洗滌后加入100 μL 1∶1 500 稀釋的山羊抗雞IgG-HRP,37 ℃作用1 h。洗滌后在避光條件下加入100 μL OPD顯色液,顯色5 min~10 min,根據(jù)其顏色變化及時(shí)加入50 μL 0.5 mol/L H2SO4。在 酶 標(biāo) 儀 上 讀 取OD490nm值。使用GraphPad Prism 5 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析并制圖。

      2 結(jié) 果

      2.1 病毒的遺傳演化分析結(jié)果將DK/GX/S1453/19病毒株各基因片段進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證目的片段,膠回收后進(jìn)行基因序列的測(cè)定,測(cè)定的基因序列使用Seqman 程序拼接全基因組序列。將病毒株的全基因組序列分別經(jīng)NCBI BLAST 比對(duì),繪制表面基因進(jìn)化樹(shù)并進(jìn)行遺傳演化分析。全基因組序列比對(duì)結(jié)果顯示,DK/GX/S1453/19 病毒株HA、NA 兩個(gè)表面基因片段均與我國(guó)2017 年于重慶分離到的一株鴨源A/duck/Chongqing/S4362/2017(H5N3)(登錄號(hào)為MN171428.1)親緣關(guān)系最近(圖1、圖2)。兩株病毒的HA 與NA 基因的核苷酸序列同源性分別為98.41%和99.50%,表明兩株病毒的表面基因可能來(lái)源相同。DK/GX/S1453/19 各基因節(jié)段與核苷酸同源性最高病毒株的同源性如表1 所示,除了與HA 與NA 基因的同源性最高病毒為同一病毒株,與其余基因片段PB2、PB1、PA、NP、M 與NS基因的核苷酸同源性最高病毒株均不相同,內(nèi)部基因表現(xiàn)出明顯的遺傳多樣性。該病毒株和當(dāng)前優(yōu)勢(shì)流行株的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),其基因來(lái)源具有野鳥(niǎo)源性,且進(jìn)化來(lái)源較為原始。

      表1 與各基因節(jié)段核苷酸同源性最高的病毒株Table 1 The virus strains with the highest homology with each segment nucleotide

      特殊位點(diǎn)的氨基酸序列分析顯示,DK/GX/S1453/19 病毒株的HA 蛋白裂解位點(diǎn)處的序列為PQRETR/GLF,僅含有一個(gè)堿性氨基酸,符合LPAIV 的分子特征。HA 蛋白糖基化位點(diǎn)的變化與病毒的抗原性與致病性密切相關(guān),本研究中的病毒株含有7 個(gè)潛在糖基化位點(diǎn)(以H3 亞型為標(biāo)準(zhǔn)),分別為20NNS22、21NST23、33NNT35、169NNT171、289NSS291、483NGT485、541NGS543。HA 蛋白的受體結(jié)合特性決定了流感病毒的宿主特異性,以H3 亞型HA 為模板分析影響HA受體結(jié)合位點(diǎn)氨基酸序列,結(jié)果顯示該病毒株的aa138、aa226 和aa228 位為典型的禽型受體氨基酸特征,即為138A、226Q、228G。此外還存在160A 的人型受體氨基酸特征,至于133S 位點(diǎn)能否影響病毒的受體結(jié)合特性,還有待進(jìn)一步研究。M1 蛋白存在N30D 和T215A可以增強(qiáng)H5N1 AIV對(duì)小鼠的致病力[9],該病毒的M1蛋白具有30D 和215A 的分子特征。同時(shí)NS1 蛋白未見(jiàn)80~84 位的頸部缺失現(xiàn)象,其aa42 位為S,已有文獻(xiàn)報(bào)道NS1 蛋白P42S 可以增強(qiáng)H5 亞型AIV 對(duì)小鼠的致病力[10]。上述結(jié)果表明,DK/GX/S1453/19 病毒株為一株低致病力AIV,但其存在可能感染哺乳動(dòng)物的風(fēng)險(xiǎn)。

      2.2 抗原性差異分析結(jié)果將DK/GX/S1453/19 病毒株與實(shí)驗(yàn)室保存的H5 亞型的各分支參考病毒株的標(biāo)準(zhǔn)血清進(jìn)行HA-HI 試驗(yàn)??乖苑治鼋Y(jié)果具體見(jiàn)表2,表明該病毒株與近幾年使用的各個(gè)H5 疫苗株的抗原差異性較大。

      2.3 小鼠的感染性試驗(yàn)結(jié)果經(jīng)Reed-Muench[6]法計(jì) 算,DK/GX/S1453/19 病 毒 株 為106.68EID50/100 μL。將該病毒株以106EID50/50 μL 的劑量鼻腔感染小鼠,3 d 后取樣進(jìn)行臟器滴定,結(jié)果顯示,DK/GX/S1453/19 病毒株可在小鼠肺臟和鼻甲內(nèi)有效復(fù)制,病毒滴度 分 別 為3.12 log10EID50/mL 和1.33 log10EID50/mL,但病毒不能在小鼠的腦、脾臟和腎臟內(nèi)復(fù)制(圖3)。其余小鼠連續(xù)觀察14 d,結(jié)果顯示,小鼠無(wú)明顯的臨床癥狀和體質(zhì)量下降情況(圖4)。以上結(jié)果表明DK/GX/S1453/19 病毒株對(duì)小鼠呈現(xiàn)低致病力。

      圖1 DK/GX/S11453/2019(H5N3)病毒株的HA 基因進(jìn)化樹(shù)Fig.1 The phylogenetic tree of the HA gene of DK/GX/S11453/2019(H5N3)

      圖2 DK/GX/S11453/2019(H5N3)病毒株的NA 基因進(jìn)化樹(shù)Fig.2 The phylogenetic tree of the NA gene of DK/GX/S11453/2019(H5N3)

      2.4 H5N3 亞型AIV 的受體結(jié)合特性分析結(jié)果采用糖鏈固相結(jié)合ELISA 的方法分析DK/GX/S1453/19病毒株的受體結(jié)合特性,分析結(jié)果顯示,該病毒株對(duì)α-2, 3 和α-2, 6 受體的結(jié)合能力均較弱,其中結(jié)合α-2,3 受體的能力要略強(qiáng)于α-2,6 受體(圖5)。表明,DK/GX/S1453/19 病毒株同時(shí)具有結(jié)合人源受體和禽源受體的能力。

      表2 DK/GX/S11453/2019(H5N3)病毒株的抗原差異分析結(jié)果Table 2 The results of antigenicity analysis of DK/GX/S11453/2019(H5N3)

      圖3 感染3 d 后小鼠臟器滴定結(jié)果Fig.3 Viral titers in the organs of mice at 3 d post-inoculation

      圖4 小鼠感染后體質(zhì)量變化Fig.4 Weight change of mice post-inoculation

      圖5 DK/GX/S11453/2019(H5N3)病毒株的受體結(jié)合特異性分析Fig.5 Characterization of the receptor binding properties of DK/GX/S11453/2019(H5N3)

      3 討 論

      本研究中DK/GX/S1453/19 病毒株是從我國(guó)廣西壯族自治區(qū)分離得到,遺傳演化分析表明HA 與NA片段均與2017 年來(lái)源于重慶的一株鴨源H5N3 核苷酸同源性最高,兩株病毒的表面基因可能來(lái)源于同一祖先。分析與該病毒株表面基因同源性相近的幾株國(guó)內(nèi)H5N3 發(fā)現(xiàn),這些H5N3 的HA 片段和蒙古國(guó)分離的一株H5N7 病毒株相近,而NA 片段也與蒙古國(guó)的一株H10N3 親緣關(guān)系較近,說(shuō)明國(guó)內(nèi)近幾年的H5N3 亞型AIV 有可能由野鳥(niǎo)傳入。并且,這些病毒株內(nèi)部基因均具有明顯的遺傳多樣性,分別與不同來(lái)源的H5N3、H6N2、H4N6 等病毒親緣關(guān)系密切。早期國(guó)外有學(xué)者在野鳥(niǎo)體內(nèi)分離到H5N3 病毒株,其基因來(lái)源也呈現(xiàn)明顯的遺傳多樣性[11-12]。另外有研究報(bào)道,2002 年以來(lái),我國(guó)華南地區(qū)分離的H5N3 病毒株是由不同AIV 形成的重配病毒株[13]。以上研究均說(shuō)明H5N3 病毒株的產(chǎn)生可能是由于不同病毒株在野鳥(niǎo)體內(nèi)攜帶和傳播過(guò)程中發(fā)生了基因重排現(xiàn)象。抗原性分析結(jié)果表明,該病毒株和各疫苗株之間的抗原差異性較大,與最早使用的Re-5 疫苗株抗原性類似,這樣從病毒抗原性上來(lái)分析,新分離的H5N3 亞型病毒與我國(guó)早期出現(xiàn)的病毒抗原性相似,而與近幾年家禽體內(nèi)的優(yōu)勢(shì)病毒株差異明顯。

      HA 蛋白糖基化位點(diǎn)的數(shù)量和分布與其功能密切相關(guān)[14],已有研究報(bào)道,當(dāng)在2009 年甲型H1N1流感病毒HA 蛋白上添加額外的糖基化位點(diǎn)后,突變病毒對(duì)小鼠和雪貂的致病性降低[15]。此外,H5N1亞型AIV 的HA 蛋白在158 位氨基酸殘基發(fā)生糖基化修飾可以降低病毒對(duì)小鼠和雪貂的致病性[16-17]。本研究使用的病毒株HA 蛋白含有7 個(gè)潛在糖基化位點(diǎn),并不包含已報(bào)道的158 位氨基酸殘基糖基化位點(diǎn),關(guān)于這些糖基化位點(diǎn)是否會(huì)影響病毒的抗原性與致病性還有待深入研究。受體結(jié)合位點(diǎn)分析表明本病毒株HA 蛋白在138A、226Q、228G 位點(diǎn)表現(xiàn)為典型禽型受體類型的特征,但160A 表現(xiàn)為人型受體分子特征,這一分子特征與受體結(jié)合試驗(yàn)結(jié)果一致,即為DK/GX/S1453/19 病毒株具有同時(shí)結(jié)合α-2, 3 和α-2,6 受體的能力。有研究報(bào)道H5 病毒株受體結(jié)合位點(diǎn)S133A 可增強(qiáng)病毒與α-2, 6 受體結(jié)合的能力[18],至于本研究中發(fā)現(xiàn)的133S 是否會(huì)影響受體結(jié)合能力,還有待于進(jìn)一步探究。已有研究表明,M1 蛋白的N30D 和T215A 突變,以及NS1 蛋白的P42S 突變均會(huì)增強(qiáng)H5 亞型AIV 對(duì)小鼠致病力[9-10],本研究中的病毒株存在M1 蛋白的30D 和215A,NS1 蛋白的42S 這些分子特征,但該病毒株對(duì)小鼠并未表現(xiàn)出高致病力,說(shuō)明該病毒株可能還存在其他會(huì)影響致病力的因素。雖然該病毒株對(duì)小鼠低致病力,但病毒可以在小鼠肺臟和鼻甲內(nèi)有效復(fù)制,存在一定的感染哺乳動(dòng)物及人類的風(fēng)險(xiǎn)。該H5N3 病毒株的出現(xiàn)也充分表明當(dāng)前我國(guó)家禽面臨的AIV 感染風(fēng)險(xiǎn)較高,應(yīng)加大監(jiān)測(cè)力度,密切關(guān)注這些新亞型病毒株在家禽中出現(xiàn)的頻率和波及面,以及病毒抗原性差異,為我國(guó)禽流感的綜合防控提供數(shù)據(jù)支持。

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