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      1327例親子鑒定STR基因座突變的分析

      2020-08-16 15:37:31盧雅文
      中國典型病例大全 2020年5期
      關(guān)鍵詞:突變親子鑒定遺傳學(xué)

      【摘要】目的 以湖北地區(qū)為例,選擇1327例親子鑒定結(jié)果為肯定對(duì)其STR基因座突變情況予以分析;方法 選擇1327例親自鑒定結(jié)果為肯定的人群作為研究對(duì)象,先采用Chelex-100法對(duì)其DNA進(jìn)行提取,然后再應(yīng)用Microreader 21 Direct ID System STR熒光檢測(cè)試劑盒對(duì)基因分型進(jìn)行檢測(cè);結(jié)果? 經(jīng)統(tǒng)計(jì),有315例為雙親三聯(lián)體、單親二聯(lián)體分別為315例、1012例,總共觀察到1642次減數(shù)分裂。其中存在1個(gè)STR 基因座突變的為40例,20個(gè)STR 基因座中發(fā)現(xiàn)基因座突變共17例,包含一步突變39例,二步突變1例。發(fā)現(xiàn)的突變37例來自父親,3例來自母親。結(jié)論 在親子鑒定中, STR基因座突變發(fā)生率較高,針對(duì)這一情況需要逐漸積累STR基因座突變數(shù)據(jù),應(yīng)用低突變率與其他擁有良好多態(tài)性的遺傳標(biāo)記,提升鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性。

      【關(guān)鍵詞】遺傳學(xué);突變;親子鑒定;湖北

      作為在人類基因組織中廣泛的存在的短串聯(lián)重復(fù)序列(STR),該序列屬于一種具有一定長度的多態(tài)性DNA序列,該序列是將2~7bp作為核心重復(fù)的單位。當(dāng)前,STR基因座已經(jīng)成為人類遺傳學(xué)中至關(guān)重要的一種遺傳標(biāo)記,當(dāng)前被廣泛應(yīng)用在法醫(yī)檢驗(yàn)中。STR其核心序列較短,以至于射線、環(huán)境等均可能致使STR發(fā)生突變,該序列在發(fā)生遺傳時(shí)容易出現(xiàn)變異的情況,因此受到了社會(huì)各界的高度重視,2008年美國血庫學(xué)會(huì)提出父源突變率達(dá)到了0.007%~0.371%,而我國相關(guān)數(shù)據(jù)顯示其突變率達(dá)到了0.008%-0.44%[1] 。接下來分析了1327例親子鑒定STR基因座突變,具體見下文:

      1 材料與方法

      1.1 樣本

      1327例親子鑒定均來源于湖北明鑒法醫(yī)司法鑒定所2015-2016年6月所承辦的案件,且為日常檢案、全部鑒定結(jié)果為肯定,且全部屬于健康無關(guān)個(gè)體。

      1.2 DNA提取方法

      采用Chelex-100法對(duì)血液樣本中的DNA進(jìn)行提取[4]。

      1.3 STR檢測(cè)

      采用Microreader 21 Direct ID System STR熒光檢測(cè)試劑盒(閱微基因技術(shù)有限公司),并對(duì)D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、等共二十個(gè)STR基因座和1個(gè)性別基因座Amelogenin實(shí)施復(fù)合擴(kuò)增。將擴(kuò)增產(chǎn)物置于ABI 3100遺傳分析儀上對(duì)毛細(xì)管電泳實(shí)施分型,通過GeneMapper ID v3.2軟件進(jìn)行結(jié)果分析。

      1.4 STR基因座突變分析

      按照文獻(xiàn)[2]的相關(guān)闡述內(nèi)容對(duì)突變的來源進(jìn)行判斷。例如:雙親等位基因,突變的等位基因?yàn)榕c突變成的新等位基因距離步數(shù)相差最小的等位基因,假如相差的步數(shù)一樣時(shí),突變基因則是結(jié)構(gòu)相似的等位基因;如果步數(shù)一樣時(shí),且結(jié)構(gòu)相似,那么將其判定為來源不明。假如在突變的STR基因座內(nèi)存在某1個(gè)基因座違反遺傳規(guī)律的情況時(shí),并且全部屬于一步突變,則親代的等位基因型和子代的等位基因型主要表現(xiàn)出核心重復(fù)序列增多或者減少,本文增多用+1表示,減少用-1表示。

      2 結(jié)果

      2.1 STR基因座突變率及特征

      根據(jù)檢測(cè),結(jié)果顯示315例為雙親三聯(lián)體親子鑒定,1012例為單親二聯(lián)體親子鑒定,在這些病例中,STR基因座突變的基因共1個(gè),16例為三聯(lián)體,24例為二聯(lián)體,在20個(gè)STR基因座中觀察到17個(gè)基因座存在突變現(xiàn)象(表1),F(xiàn)GA基因座的突變率最高,為0.305%,而D16S539、D2S441、TPOX基因座未觀察到突變事件。

      2.2? STR基因座突變步數(shù)

      通過對(duì)同一家系突變基因座上的等位基因型開展分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中一步突變共39例,兩步突變僅1例,通過分析基因座突變情況,發(fā)現(xiàn)有17例對(duì)象的核心重復(fù)序列增加了1個(gè),1例基因座(子代)突變?yōu)樵黾佣€(gè)核心重復(fù)序列,基因組突變?yōu)闇p少了一個(gè)核心重復(fù)序列的共22例。

      2.3 STR基因座突變來源統(tǒng)計(jì)

      在觀察到的40例突變中.37例來源于父系.占92.5% ;3例來源于母系,占7.5%,父系來源突變與母系來源突變的比例為12:1,差異顯著(經(jīng)卡法檢驗(yàn),P<0.001)。

      3 討論

      3.1 STR基因座突變率

      有文獻(xiàn)指出:STR基因座突變率與多態(tài)性程度二者是正相關(guān),一般情況下,親權(quán)鑒定遺傳標(biāo)記的突變率應(yīng)<0.2%[3]”,由此可見,在親權(quán)鑒定時(shí),不適宜選擇突變率高的基因座。在本文中,通過檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)突變率最高的為FGA基因座,高達(dá)0.305%,其中未發(fā)現(xiàn)D16S539、D2S441、TPOX基因座發(fā)生突變。

      3.2 STR基因座突變模式分析

      當(dāng)前,很多學(xué)者都指出STR發(fā)生突變的模式為逐步突變[4],換而言之即絕大部分的STR基因座的突變方式為完整重復(fù)單位的增加或者減少,其中以單個(gè)重復(fù)單位增減最為常見,而兩個(gè)及以上重復(fù)單位的改變非常罕見。步數(shù)越少,發(fā)生突變的概率就越低,多步突變依然是一步步突變而來的。在上文中發(fā)現(xiàn)一步突變?cè)谕蛔兛偫龜?shù)中所占比例為97.5%,提示其發(fā)生率最高,這與其他學(xué)者的研究結(jié)果一致[5]。

      3.3 STR基因座突變的性別差異

      通過本研究發(fā)現(xiàn):父系來源突變是母系來源突變的12倍,且P<0.05,其原因可能為男性精母細(xì)胞在分裂成精子過程中,細(xì)胞分裂的次數(shù)高于女性配子細(xì)胞成熟時(shí)所需的次數(shù)。

      3.4 STR基因座突變機(jī)制

      當(dāng)前,大部分學(xué)者認(rèn)同接受STR基因座突變的機(jī)制為復(fù)制滑動(dòng)或者復(fù)制滑鏈錯(cuò)配。詳細(xì)而言,在DNA復(fù)制過程中,當(dāng)新生鏈與模板鏈分離時(shí),在STR基因座的重復(fù)區(qū)域出現(xiàn)堿基錯(cuò)配從而形成一個(gè)乃至數(shù)個(gè)重復(fù)區(qū)域的環(huán)狀結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致新生鏈縮短或者延長的情況,呈現(xiàn)出1個(gè)重復(fù)單位增加或者減少[6]。

      綜上所述,伴隨著進(jìn)行親自鑒定數(shù)量的不斷上漲,相關(guān)領(lǐng)域越來越注重STR基因組突變對(duì)鑒定結(jié)果影響的研究,針對(duì)這一情況,需要加強(qiáng)數(shù)據(jù)的積累,以提升鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性。

      參考文獻(xiàn)

      [1]鄧志輝,吳國光,程良紅,等. 13個(gè)STR 基因座在親子鑒定案例中的基因突變觀察[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2003,18(3):150-153.

      [2]張玉靜.分子遺傳學(xué)[M].北京:科學(xué)出版社,2000.

      [3]李海霞,馬曉燕,張晉湘,等.24個(gè)常用STR基因座的突變觀察與分析[J].中山大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版),2010,31(1):13-16.

      [4]李秋陽,豐偉軍,楊慶恩,等.常用STR基因座突變的觀察與分析[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2005,21(2):86-89.

      [5]賴力,薛士杰,金靜君,等.福建地區(qū)親子鑒定2363例STR基因座突變研究[J].中外健康文摘,2011,8(33):24-26.

      [6]李茜,程良紅,魏天莉,等.親子鑒定中STR基因座的基因突變分析[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2008,23(6):394-396.

      作者簡(jiǎn)介: 盧雅文 (1986.09)女 ,湖北省武漢市,漢族,本科, 研究方向:法醫(yī)物證、親子鑒定

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