鄭寶強,喬紅娟,李柏君,KAOTachung,張 燕,王 雁*
(1. 國家林業(yè)局林木培育重點實驗室,中國林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所,北京 100091;2. Gao's Orchid Garden,AV Geroldo Azzoni 905 Rio Acima Jundiai SP,Brasil 13215-840;3. 北京市電氣工程學(xué)校,北京 100025)
許多植物中都存在綠色葉片出現(xiàn)黃色或白色斑塊的突變體[1-7],這些突變植株是研究光合作用、葉綠素合成代謝和葉綠體發(fā)育等過程的極佳材料[8]。此外,這類表型也是許多觀賞花卉的主要觀賞性狀,是園藝工作者對花卉品種的主要改良和育種目標(biāo)之一[9-11]。因此,探究葉片黃色或白色的斑化形成機制具有重要的生物學(xué)意義和應(yīng)用價值。
葉綠素是使植物葉片顯綠色的主要色素,其在植物體內(nèi)的生物合成通路已經(jīng)得到了詳細描述和報道[12-15]。許多研究表明,葉綠素生物合成途徑中結(jié)構(gòu)基因的表達量變化會直接決定葉綠素在組織中的積累量,從而影響葉片顏色的表型[16-17]。當(dāng)這些結(jié)構(gòu)基因表達量下降時,會導(dǎo)致中間產(chǎn)物無法被催化成葉綠素,最終使葉片失綠從而產(chǎn)生白色或黃色的斑塊或條紋[15,18-20];同時,造成組織失綠的具體機制在不同植物之間存在差異。因此,探索不同植物突變體葉片失綠的具體分子機制具有重要的意義,是對相關(guān)植物進行葉色園藝性狀改良的理論基礎(chǔ)和依據(jù)。
蘭科(Orchidaceae)植物因其獨特的花形、豐富的花色和迷人的花香而世界聞名,其許多種和栽培品種已成為廣受大眾歡迎的觀賞花卉。葉片失綠的突變現(xiàn)象在蘭花中被稱為“葉藝”,其能夠提高蘭花的觀賞價值,是蘭花園藝工作者主要的選育目標(biāo)之一[21]。但是,目前葉藝在蘭科中的分子機制研究較少,僅在蘭屬(Cymbidium)[20,22-23]和卡特蘭屬(Cattleya)[24]有過相關(guān)報道,大多研究主要在生理水平上對葉藝機制進行探索[10,25-29]。近年來,許多石斛屬(Dendrobium)的葉藝突變體在市場上越來越受歡迎。鐵皮石斛(Dendrobium catenatum)在自然環(huán)境和人工栽培條件下常出現(xiàn)葉藝現(xiàn)象[30],這些葉藝鐵皮石斛是石斛品種改良與培育的優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資源。此外,鐵皮石斛的高質(zhì)量基因組已經(jīng)公布[31],這為研究鐵皮石斛葉藝現(xiàn)象的分子機制提供了便利與基礎(chǔ)。
供試材料為鐵皮石斛葉藝突變體的無性系,其葉片上有大面積白色斑塊或條紋。本研究所用材料都培養(yǎng)在中國林業(yè)科學(xué)研究院溫室中,采光為自然光照,正常栽培管理。
1.2.1 葉片顯微結(jié)構(gòu)觀察 分別取正常鐵皮石斛(WT)、葉藝鐵皮石斛葉子綠色組織(YYG)、葉藝鐵皮石斛葉藝白色組織(YYW),用雙面刀片快速切成薄片,放入有蒸餾水的玻璃皿中。選擇其中最薄的透明度最大的薄片做成臨時切片,在光學(xué)顯微鏡(Olympus,日本)下觀察和拍照。
1.2.2 葉綠體超顯微結(jié)構(gòu)觀察 根據(jù)Li等[15]的方法,將實驗材料制備成切片;利用透射電鏡(JEOL,日本)對切片中的葉綠體顯微結(jié)構(gòu)進行觀察和拍照。
本研究采用邵勤等[32]的葉綠素提取和含量計算方法,對不同處理稱取等量實驗材料并研磨至粉末,然后利用80%丙酮進行葉綠素萃取。通過UV2310Ⅱ分光光度計分別測定提取液波長在663、646、470 nm下的OD值。最后,根據(jù)相關(guān)計算公式得到不同實驗處理的葉綠素含量。根據(jù)Bogorad[33]的方法對實驗樣品中膽色素原(Porphobilinogen,PBG)、尿 卟 啉 原 III (Uroporphyrinogen Ⅲ,UrogenIII)和糞卟啉 III(Coproporphyrinogen Ⅲ,CoprogenⅢ)進行提取和含量測定。根據(jù)Lee等[34]的方法對實驗樣品的原卟啉IX (Protoporphyrin IX,Proto IX)、鎂原卟啉IX(Mg-Protoporphyrin IX, Mg-Proto IX)和原葉綠素酸酯(Protochlorophyllide,Pchlide)進行提取和含量測定。每處理進行3個生物學(xué)重復(fù)測定,并利用Omiscshare tools (http://omicshare.com/tools/)對數(shù)據(jù)進行Student's pairedt-test。
1.4.1 總RNA提取和質(zhì)量檢測 利用改良的SDS法[35]提取實驗樣品中的總RNA。利用NanoDrop 2000微量分光光度計(Thermo Scientific Inc., USA)對RNA的質(zhì)量進行檢測,OD260/280≥1.8、OD260/230≥1.8和濃度大于100 ng·μL-1的RNA被用于下一步的反轉(zhuǎn)錄。
1.4.2 相關(guān)基因的qRT-PCR定量 利用EasyScript One Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix qPCR(全式金,中國)反轉(zhuǎn)錄試劑合成RNA的cDNA第一鏈。從已發(fā)表的鐵皮石斛基因組[31]中找與葉綠素合成相關(guān)的基因,利用NCBI的Primer-BLAST進行引物設(shè)計(表1)。以Dc18S作為內(nèi)參基因?qū)?shù)據(jù)進行標(biāo)準(zhǔn)化。根據(jù)TaKaRa TB GreenTMPremixEx TaqTM試劑盒(TaKaRa, Japan)使用說明書設(shè)置LightCycler480 System(Roche,USA)的qRT-PCR運行程序進行基因的qRT-PCR定量。每個基因在每個處理中進行3個生物學(xué)重復(fù)測定,并利用Omiscshare tools (http://omicshare.com/tools/)對數(shù)據(jù)進行Student's pairedt-test。
表1 葉綠素合成相關(guān)基因的qRT-PCR引物序列Table 1 The primer sequences of chlorophyll biosynthesis related genes for qRT-PCR
利用SPSS 13.0與Excel 2010對生理指標(biāo)進行統(tǒng)計和方差分析,基因定量采用Comparative CT(-ΔΔCt)法進行計算[36]。
正常的鐵皮石斛葉片為全綠色(圖1a),而葉藝鐵皮石斛的葉片上則出現(xiàn)了大面積的白色條紋或斑塊(圖1b、c)。對葉片橫切面的顯微觀察結(jié)果顯示:正常鐵皮石斛(WT)和葉藝鐵皮石斛葉片綠色組織(YYG)的部位中充滿了綠色細胞(圖1d、e),而葉藝鐵皮石斛葉藝白色組織(YYW)的部位中則基本上看不到綠色細胞(圖1f)。對這些組織細胞的超顯微結(jié)構(gòu)觀察顯示:WT和YYG的葉綠體呈飽滿的半球形,其體內(nèi)富含排列整齊的基粒片層和類囊體基粒,淀粉顆粒少(圖2);而YYW的葉綠體則呈干癟的三角形,體內(nèi)基粒片層和類囊體基粒數(shù)量稀疏且排列無規(guī)則,淀粉顆粒多(圖2)。這些結(jié)果顯示葉子呈綠色的WT和YYG富含大量的綠色葉綠體且具有相似的葉綠體細胞結(jié)構(gòu),而YYW則與前兩者相反。
圖1 葉藝和正常鐵皮石斛的形態(tài)特征和葉片顯微觀察Fig. 1 The morphological characteristics and microscopic structure of normal and mutant D. catenatum leaves
圖2 石斛葉片葉綠體的超顯微結(jié)構(gòu)觀察Fig. 2 The ultrastructure of chloroplast in D. catenatum leaves
葉綠素和類胡蘿卜素含量測定顯示:WT和YYG之間的葉綠素a、葉綠素b、總?cè)~綠素和類胡蘿卜素含量無明顯差異,但它們都顯著高于YYW(圖3)。這一結(jié)果顯示YYW的葉綠素合成受到了阻礙,并支持了其白化表型特征和顯微觀察YYW中幾乎沒有綠色細胞的結(jié)果。
圖3 野生型和突變型鐵皮石斛葉片中光合色素的含量Fig. 3 Photosynthetic pigments content of WT and mutant leaves
葉綠素合成的上游中間代謝物中,YYW的膽色素原含量是WT的84%,而尿卟啉原Ⅲ和糞卟啉原Ⅲ含量則分別是WT的109%和137%(圖4)。在葉綠素合成下游中間前體物質(zhì)中,WT和YYG的原卟啉IX、鎂原卟啉IX和原葉綠素酸酯含量是YYW的4.9~17.1倍,而它們二者之間的差距相較于YYW則較?。▓D4)。糞卟啉原Ⅲ是原卟啉IX和鎂原卟啉IX重要合成前體[15]。因此,這些結(jié)果顯示:YYW在合成葉綠素的過程中,原卟啉IX的合成受到了阻礙,中間產(chǎn)物無法正常流向葉綠素合成。
WT、YYG和YYW中葉綠素生物合成途徑中8個結(jié)構(gòu)基因的qRT-PCR結(jié)果(圖5)顯示:YYW中的尿卟啉原脫羧酶(Uroporphyrinogen decarboxylase, DcHEME)、糞卟啉原氧化脫羧酶(Coproporphyrinogen III oxidase, DcHEMF)、原卟啉原氧化酶(Protoporphyrinogen oxidase, DcHEMG)和鎂螯合酶H和鎂螯合酶H亞基(Mg chelatase H subunit, DcCHLH)的表達量都顯著低于WT和YYG。羥甲基后膽色素原合酶(Porphobilinogen deaminase, DcHEMC)的表達量在三者之間并無明顯差異,而YYG和YYW中的膽色素原合酶(Porphobilinogen Synthase, DcHEMB)、鎂螯合酶D亞基(Mg chelatase D subunit, DcCHLD)和鎂原卟啉IX甲基轉(zhuǎn)移酶(Mg protoporphyrin IX methyltransferase, DcCHLM)的表達量則都顯著低于WT。值得注意的是,HEMF和HEMG是合成原卟啉IX的關(guān)鍵酶,而CHLH和CHLD則是合成鎂原卟啉IX的關(guān)鍵酶[15]。
大多數(shù)植物的葉片為綠色,但許多植物都有葉片白化的突變體,而這種葉片出現(xiàn)白化的突變現(xiàn)象是許多觀賞植物的重要觀賞性狀,具有很高的觀賞價值[15]。葉綠素是植物進行光合作用的主要物質(zhì),同時它也是使植物組織呈現(xiàn)綠色的重要色素[37]。在許多植物的白化突變體中,其葉子的白化區(qū)域都出現(xiàn)了葉綠素積累量顯著下降[13,38-40]。本研究通過顯微觀察發(fā)現(xiàn),YYW基本沒有綠色細胞,同時其葉綠體細胞結(jié)構(gòu)畸形且體內(nèi)基粒片層和類囊體基粒數(shù)量稀疏且排列無規(guī)則。許多研究表明,植物葉色的突變都伴隨著葉綠體細胞結(jié)構(gòu)的改變和體內(nèi)類囊體基粒的無序排列[11,41-42]。因此,葉綠素含量的下降是導(dǎo)致葉藝鐵皮石斛葉片出現(xiàn)白色條紋或斑塊的主要原因。此外,糞卟啉原Ⅲ在YYW中的含量顯著高于WT和YYG,而糞卟啉原Ⅲ的下游產(chǎn)物原卟啉IX、鎂原卟啉IX和原葉綠素酸酯在WT和YYG中的含量是YYW的4.7~17.1倍。這進一步表明,YYW的葉綠素合成從糞卟啉原Ⅲ下游產(chǎn)物合成開始就受到了阻礙,而這可能是導(dǎo)致YYW中葉綠素?zé)o法正常合成的主要原因。
葉綠素生物合成途徑中關(guān)鍵酶編碼基因表達量的變化會直接影響葉綠素在植物組織的積累量,從而改變植物組織的顏色表型[15-17,43]。本研究中,葉綠素合成途徑中的DcHEMF、DcHEMG、DcCHLH和DcCHLM在YYW中的表達量顯著低于正常葉片。在葉綠素合成途徑中,糞卟啉原Ⅲ經(jīng)過HEMF和HEMG的催化后會生成原卟啉,然后分別通過CHLD、CHLH和CHLI進一步形成鎂原卟啉IX[17]。值得注意的是,葉藝鐵皮石斛中糞卟啉原Ⅲ含量顯著高于正常葉片,而原卟啉和鎂原卟啉IX含量則顯著低于正常葉片。前人研究表明,金魚草(Antirrhinum majus)葉片的黃綠表型是由Tam3插入使ChlH基因失去活性所導(dǎo)致[44]。水稻(Oryza sativa)葉片的突變體中,由于T-DNA插入到line 9-07117的鎂螯合酶大亞基ChlH中,使其無法正常轉(zhuǎn)錄翻譯,導(dǎo)致水稻葉片失綠[18]。銀杏(Ginkgo biloba)葉片的黃化突變體中,GbPPO、GbCHLD、GbCHLH和GbCHLI在黃化葉片中的表達量下調(diào),同時其糞卟啉原Ⅲ含量顯著高于正常葉片,而原卟啉IX和鎂原卟啉IX的含量則相反[15]。本研究中,DcHEMF、DcHEMG和DcCHLH在YYW中的低表達使糞卟啉原Ⅲ無法正常流向葉綠素合成,造成葉綠素的積累量減少,最終導(dǎo)致葉片失綠。這些研究結(jié)果為今后石斛屬的葉藝性狀改良提供了理論依據(jù)和分子基礎(chǔ)。
圖4 野生型和突變型鐵皮石斛葉片中葉綠素合成的中間產(chǎn)物含量Fig. 4 The content of chlorophyll intermediates in WT and mutant leaves
圖5 野生型和突變體石斛葉片中葉綠素合成相關(guān)基因的表達量變化Fig. 5 The relative expression of some chlorophyll biosynthesis relative genes in WT and mutant leaves
DcHEMF、DcHEMG和DcCHLH在葉藝鐵皮石斛葉片白色區(qū)域中的低表達使糞卟啉原Ⅲ無法正常流向葉綠素合成,這導(dǎo)致了葉綠素含量的下降,是使鐵皮石斛出現(xiàn)葉藝表型的主要原因。