林宇嵐,李正昀,吳 斐,裴 蘊(yùn),張 揚(yáng),張林平,楊 瀅,譚明曦
(江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 鄱陽湖流域森林生態(tài)系統(tǒng)保護(hù)與修復(fù)國家林業(yè)和草原局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江西 南昌 330045)
油茶(Camellia oleifera Abel.)又稱茶子樹,屬于山茶科、山茶屬植物,是我國南方丘陵地區(qū)重要的木本油料樹種[1]。油茶籽所榨茶油中含有大量不飽和脂肪酸,具有降低血脂、降低膽固醇、保護(hù)心血管系統(tǒng)等功效[2]。此外,油茶也是防風(fēng)固沙和保持水土的重要樹種[3]。截止2017 年底,我國油茶種植面積已擴(kuò)大到443 萬多hm2[4]。然而,在油茶林經(jīng)營過程中,大量不合理施肥已造成生態(tài)環(huán)境質(zhì)量下降,引起的土壤重金屬含量過高、土壤環(huán)境酸化板結(jié)等問題日益突出[5]。因此,提高化肥利用效率,降低施用量,恢復(fù)退化土壤已成為我國油茶產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展突出問題。
叢枝菌根(Arbuscular mycorrhizas,AM)真菌,作為一種廣泛存在于陸地生態(tài)系統(tǒng)的共生菌,能夠改善植物對(duì)磷、氮等養(yǎng)分的吸收,提高植物對(duì)生物和非生物逆境的抗性[6]。隨著人們對(duì)作物生產(chǎn)中高產(chǎn)、資源高效意識(shí)的不斷提高,AM 真菌在集約化作物生產(chǎn)體系中的作用日益受到關(guān)注[7]。AM 真菌的生理生態(tài)功能與其群落結(jié)構(gòu)密切相關(guān),不同的AM 真菌群落通常具有不同的功能[8-9]。植物種類是影響AM 真菌群落結(jié)構(gòu)特征的重要因素[10]。大量研究發(fā)現(xiàn),在物種水平上,同一生境下共存的不同植物,其共生的AM 真菌種類明顯不同[11]。少量有關(guān)同一植物不同品種AM 真菌群落組成的研究表明,AM 真菌的群落組成受到寄主植物基因型的影響[11]。郭邵霞和劉潤進(jìn)[8]研究發(fā)現(xiàn),牡丹基因型能改變AM 真菌的侵染率和種屬組成。Mao 等人[12]發(fā)現(xiàn),不同品種小麥AM 真菌侵染率相同但群落組成不同。近年來,人們不斷地篩選和培育出具有優(yōu)良性狀的作物新品種,并應(yīng)用于生產(chǎn),因此,開展同一植物不同栽培品種AM 真菌群落組成的研究具有一定的理論研究和實(shí)際應(yīng)用意義。
目前,關(guān)于油茶根際AM 真菌種類已有相關(guān)報(bào)道[5],然而,對(duì)不同品種油茶根際AM 真菌的多樣性是否存在差異未見報(bào)道。為此,本研究以不同品種油茶根際土壤為研究對(duì)象, 采用Illumina MiSeq 高通量測序技術(shù)研究油茶不同品種AM 真菌多樣性,并分析AM 真菌群落特征與土壤理化性質(zhì)間的關(guān)系,為油茶專用菌肥研發(fā)和集約化可持續(xù)經(jīng)營提供科學(xué)理論依據(jù)。
油茶根際土壤取自江西省宜春市袁州區(qū)江西星火農(nóng)林公司油茶種植基地(27°43′ N,114°11′E),該基地屬典型亞熱帶季風(fēng)氣候,年降水量1 595.8 mm,年平均氣溫16.4 ℃,土壤類型為紅壤。選取的長林3(CL3)、長林4(CL4)、長林53( CL53)、 贛無84-8( GW84-8)、 贛興48(GX48)5 個(gè)品種均為5 年生油茶,每個(gè)品種生態(tài)環(huán)境條件一致,且經(jīng)營管理措施相同,種植密度為2 m×3 m。每個(gè)品種油茶林中隨機(jī)劃定5 個(gè)樣地,每個(gè)樣地隨機(jī)選取長勢相似的油茶5 株。去除土壤表面枯落葉層,在距植物主干50 cm 的東南西北4 個(gè)方位,采集0~20 cm 的油茶根系,在無菌自封袋中輕輕抖動(dòng)根系,收集根系上的土壤,作為根際土,將同一樣地5 株植物根際土壤混合均勻,5 個(gè)樣地作為重復(fù),共計(jì)25 個(gè)土壤樣品,將土樣編號(hào)裝入自封袋運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室并分為兩份,1 份在-80 ℃條件下冷凍保存,用于DNA 提取及高通量測序;另一份土樣避光風(fēng)干保存,用于測定土壤理化性狀。
AM 真菌侵染率測定采用臺(tái)盼藍(lán)( Trypan blue)染色法[13]和顯微十字交叉法[14]進(jìn)行觀察統(tǒng)計(jì);土壤理化性質(zhì)測定方法具體參照魯如坤主編《土壤農(nóng)業(yè)化學(xué)分析方法》[15],土壤含水率測定采用烘干法;土壤pH 采用電位法;土壤全氮、全磷采用HClO4-H2SO4消化法;銨態(tài)氮采用靛酚藍(lán)比色法測定;硝態(tài)氮用鍍銅鎘還原-重氮化偶合比色法測定;有效磷測定采用氟化銨-鹽酸浸提法;有機(jī)質(zhì)采用重鉻酸鉀容量法(外加熱法)測定。
油茶根際土壤總DNA 的提取使用土壤基因組DNA 抽 提 專 用 試 劑 盒 ( 購 自MP biomedicals 公司),利用瓊脂糖電泳檢測DNA 的完整性。采用AMV4.5NF( 5 ′-AAGCTCGTAGTTGAATTTCG-3 ′)/ AMDGR( 5 ′-CCCAACTATCCCTATTAATC AT-3′)引物對(duì)AM 真菌rDNA 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,利用illumina 高通量測序儀(Illumina MiSeq)測序平臺(tái)進(jìn)行測序,下機(jī)數(shù)據(jù)通過QIIME(v1.8.0)剔除問題序列。
采用SPSS 20.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析[16],用鄧肯檢驗(yàn)(Duncan’s test)進(jìn)行分析和差異顯著性檢驗(yàn)。采用R 軟件,用非度量多維尺度分析(nonmetric multidimensional scaling, NMDS) 檢驗(yàn)AM真菌屬水平群落組成結(jié)構(gòu)[17];用Mothur[18]軟件對(duì)屬水平的各個(gè)分類單元在品種之間的序列量差異進(jìn)行兩兩比較檢驗(yàn)。使用QIIME[19]軟件計(jì)算Alpha多樣性指數(shù)[ 主要包括辛普森指數(shù)(simpson)、Chao 1指數(shù)、ACE 指數(shù)和香農(nóng)指數(shù)(shannon)],并進(jìn)行多元方差分析和置換檢驗(yàn)(Adonis/ Permutational multivariate analysis of variance, PERMANOVA)。利用R 軟件的冗余分析(Redundancy analysis, RDA)描述根際AM 真菌豐富度最高的5 個(gè)屬和土壤因子間的關(guān)系。采用Origin Pro 8.5 軟件進(jìn)行繪圖(http://www.originlab.com/)。
AM 真菌對(duì)5 個(gè)品種油茶的主要侵染類型均為菌絲侵染,不同品種油茶AM 真菌的侵染率存在差異(圖1)。GX48 的總侵染率最高,GW84-8的總侵染率最低。5 個(gè)品種的菌絲侵染率變化規(guī)律與總侵染率基本一致。CL4 和CL53 的泡囊侵染率高于其他品種。CL4 的叢枝侵染率高于其他品種。
對(duì)5 個(gè)不同品種油茶根際土壤進(jìn)行高通量測序,共獲得1 376 048 條高質(zhì)量序列,所有序列共歸為2 538 個(gè)OTUs,其中CL4、GW84-8、GW48、CL3、CL53 中包含的OTU 數(shù)目分別是830、931、1 163、1 103、1 012 個(gè)。5 個(gè)品種共有OTUs 為176 個(gè),其中不同品種特有OTU 數(shù)目分別是237、196、259、306、201 個(gè)??傮w來看,不同品種油茶根際土壤共有的微生物數(shù)量較少。
圖1 油茶不同品種根系A(chǔ)M 真菌侵染率Fig. 1 Infection rate of AM fungi in roots of different cultivars of Camellia oleifera
對(duì)OTUs 從門到屬依次進(jìn)行分類,總共獲得AM 真菌群落1 門、 1 綱、 4 目、 10 科、 12 屬(表1),即為球囊菌門Glomeromycota 和球囊菌綱Glomeromycetes, 4 個(gè)目分別為球囊霉目Glomerales( 占總數(shù)的62.40%)、 類球囊霉目Paraglomerales( 25.32%) 、 原 囊 霉 目Archaeosporales( 4.28%) 、 多 樣 孢 囊 霉 目Diversisporales(0.98%);在科水平,5 個(gè)油茶品種根際中共鑒定出10 個(gè)科, 其中球囊霉科Glomeraceae(占總數(shù)的41.12%)、類球囊霉科Paraglomeraceae( 25.32%) 、 近 明 球 囊 霉 科Claroideoglomeraceae(21.28%)等相對(duì)豐度較高,而原囊霉科Archaeosporaceae(2.22%)、雙型囊霉 科Ambisporaceae( 2.05%) 、 無 梗 囊 霉 科Acaulosporaceae( 0.57%) 、 巨 孢 囊 霉 科Gigasporaceae( 0.33%) 、 多 樣 孢 囊 霉 科Diversisporaceae( 0.07%) 、 和 平 囊 霉 科Pacisporaceae( 0.02%) 、 地 管 囊 霉 科Geosiphonaceae(0.01%)等相對(duì)豐度較低。
不同品種油茶根際AM 真菌群落組成不同,其中從CL4、CL53 根際土壤中均檢測到12 個(gè)屬,而GW84-8、CL3、GX48 中分別檢測到11、10、9 個(gè)屬(圖2)。球囊霉屬Glomus、類球囊霉屬Paraglomus、巨孢囊霉屬Gigaspora 和近明球囊霉屬Claroideoglomus 的相對(duì)豐度在5 個(gè)油茶品種間具有顯著差異(圖2)。與其他品種相比,GW84-8 中球囊霉屬Glomus 相對(duì)豐度(71.49%)最高,而類球囊霉屬Paraglomus(6.70%)和巨孢囊霉屬Gigaspora(0.02%)相對(duì)豐度最低;CL53 中近明球囊霉屬Claroideoglomus相對(duì)豐度(34.12%)最高,而巨孢囊霉屬Gigaspora相對(duì)豐度(0.18%)最低。
表1 油茶根際土壤AM 真菌群落系統(tǒng)分類 Table 1 Taxonomy of AM fungal communities in rhizosphere soil of Camellia oleifera
圖2 油茶不同品種根際土壤AM 真菌屬水平分類單位組成及豐度Fig. 2 Taxonomic composition and distribution abundance of the AM fungal genera in rhizosphere soil of different cultivars of Camellia oleifera
不同品種油茶AM 真菌α 多樣性分析結(jié)果如表2 所示,5 個(gè)品種油茶根際土壤AM 真菌的辛普森指數(shù)、Chao 1 指數(shù)、ACE 指數(shù)和香農(nóng)指數(shù)均無顯著差異,說明品種對(duì)油茶根際AM 真菌多樣性影響不大。
不同品種油茶根際土壤AM 真菌β 多樣性分析結(jié)果如圖3 所示,第一軸從左至右的梯度基本代表品種從CL53 到CL3 排列,代表梯度比較短,第二軸從上至下的梯度代表品種從CL53 到CL4 排列,代表梯度較短。從品種分布來看,GW84-8 和GX48 分布較集中,而CL3、CL4 和CL53 分布較發(fā)散,表明CL3、CL4 和CL53 群落結(jié)構(gòu)差異較大,而GW84-8 和GX48 差異較小。Adonis 分析結(jié)果表明,油茶5 個(gè)品種的AM 真菌屬水平上的群落結(jié)構(gòu)存在顯著差異(P<0.05)。
表2 油茶不同品種根際土壤AM 真菌α 多樣性指數(shù) Table 2 Alpha diversity index of AM fungi in the rhizosphere soil of different cultivars of Camellia oleifera
圖3 油茶不同品種根際土壤AM 真菌屬水平群落結(jié)構(gòu)NMDS 分析Fig. 3 NMDS analysis of community structure of AM fungi in rhizosphere soil of different cultivars of Camellia oleifera
RDA 分析表明,土壤因子對(duì)AM 真菌群落變異的解釋量超過30.13%,第一排序軸解釋群落變化的16.91%, 而第二排序軸解釋群落變化的13.22%(圖4)。硝態(tài)氮對(duì)AM 真菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響(P<0.05)。其中,類球囊霉屬Paraglomus、巨孢囊霉屬Gigaspora、原囊霉屬Archaeospora、多樣孢囊霉屬Diversispora、 無梗囊霉屬Acaulospora、隔球囊霉屬Septoglomus和地管囊霉屬Geosiphon豐度與硝態(tài)氮正相關(guān),而雙型囊霉屬Ambispora豐度與硝態(tài)氮負(fù)相關(guān)。
圖4 油茶不同品種根際土壤AM 真菌屬水平群落及土壤理化因子的RDA 分析Fig. 4 RDA analysis of genus-level communities and soil properties of AM fungi in rhizosphere soil of different cultivars of Camellia oleifera
地球陸地上絕大多數(shù)植物都能與AM 真菌形成菌根,AM 真菌的生長發(fā)育和完成生活史離不開寄主植物[20]。本研究結(jié)果表明5 個(gè)不同品種油茶均能與AM 真菌形成共生體,AM 真菌總侵染率介于20.61%~43.07% 之間,平均侵染率為34.10%,屬于中度侵染。各油茶品種間的AM 總侵染率、菌絲侵染率、泡囊侵染率及叢枝侵染率均有顯著差異, 表明在本試驗(yàn)系統(tǒng)中, 油茶品種是影響AM 真菌侵染率的重要因素,這與前人的一些研究結(jié)論一致,如Steinkellner 等人[21]對(duì)10 個(gè)品種番茄的AM 侵染率進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)番茄品種顯著影響AM 真菌的侵染率;郭紹霞等[8]研究表明牡丹品種會(huì)影響到AM 真菌侵染率和種屬構(gòu)成。同一植物不同品種的生理生化特性不同,根系生理代謝和分泌物組成含量的差異可能影響AM 真菌對(duì)植物根系的識(shí)別和侵染強(qiáng)度[12]。
運(yùn)用高通量測序技術(shù)對(duì)5 個(gè)不同品種油茶根際土壤AM 真菌進(jìn)行檢測,結(jié)果表明油茶根際土壤共有AM 真菌12 個(gè)屬,相對(duì)豐度前3 的屬分別為球囊霉屬Glomus( 41.053%)、 類球囊霉屬Paraglomus( 25.323%) 、 近 明 球 囊 霉 屬Claroideoglomus(21.276%),其中Glomus 屬是油茶林AM 真菌中分布范圍最廣的屬,這與鄧小軍等[5]、蘇琍英等[22]研究結(jié)論一致;而劉輝等[23]在茶樹中共分離鑒定出8 屬36 種AM 真菌,其中Acaulospora、Glomus、Funneliformis 為 豐 度 較 高的前三個(gè)屬,上述結(jié)果表明AM 真菌對(duì)寄主植物有一定的偏好性。本研究中,5 個(gè)品種油茶根際分別鑒定出9~12 個(gè)屬AM 真菌,且AM 真菌的辛普森指數(shù)、Chao 1 指數(shù)、ACE 指數(shù)和香農(nóng)指數(shù)均無顯著差異,表明品種對(duì)油茶根際土壤AM 真菌豐富度和多樣性的影響不明顯; 由于Glomus、Paraglomus、Gigaspora 和Claroideoglomus 等屬在不同品種中的相對(duì)豐度存在差異,因此造成了不同品種油茶的AM 真菌群落結(jié)構(gòu)的變化,與郭邵霞等[8]、Mao 等人[12]研究結(jié)果一致。植物種類是影響AM 真菌群落結(jié)構(gòu)的重要的因子[24],不同植物和同一植物不同品種遺傳物質(zhì)并不相同,可能由于根系形態(tài)結(jié)構(gòu)、分泌物等差異,能促進(jìn)或抑制某些AM 真菌的生長發(fā)育,進(jìn)而影響到植物AM 真菌群落結(jié)構(gòu)特征。
在陸地生態(tài)系統(tǒng)中,土壤類型、土壤肥力、土壤pH 值等土壤因子都會(huì)對(duì)AM 真菌群落組成和分布有重要影響[25-28]。Matev?等人[29]認(rèn)為有效磷是影響葡萄園AM 真菌群落變化的主要原因之一;Guo 等人[30]認(rèn)為土壤pH 是影響AM 真菌多樣性的最主要土壤因子,可能是由于其能夠直接影響AM真菌生理狀態(tài),改變其生態(tài)位,并通過調(diào)節(jié)土壤養(yǎng)分的生物有效性等間接影響AM 真菌群落;而鄧小軍等[5]在研究中發(fā)現(xiàn)油茶AM 真菌豐度與全氮、有機(jī)質(zhì)顯著正相關(guān)。在本研究中,我們發(fā)現(xiàn)硝態(tài)氮是影響油茶根際AM 真菌群落組成與分布的最主要因素,這可能是因?yàn)橄鯌B(tài)氮在土壤中移動(dòng)性較強(qiáng),能夠通過質(zhì)流被植物吸收,并改變土壤養(yǎng)分平衡和時(shí)空特性,從而間接地影響AM 真菌群落[31]。AM 真菌的群落組成是其生理生態(tài)功能的基礎(chǔ)[9],這些AM 真菌群落結(jié)構(gòu)的差異是否影響其功能還有待進(jìn)一步研究。
AM 真菌是陸地生態(tài)系統(tǒng)中重要的微生物之一,本研究研究了5 個(gè)不同品種油茶根際AM 真菌群落的多樣性及其群落結(jié)構(gòu)特征,結(jié)果表明,油茶根際土壤中AM 真菌資源較為豐富,5 個(gè)不同品種油茶根際土壤AM 真菌多樣性無顯著差異,而油茶品種對(duì)AM 真菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響,且硝態(tài)氮是影響油茶根際AM 真菌群落組成和分布的主要土壤因子。