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      我國部分地區(qū)羊駝十二指腸賈第蟲的PCR 檢測和鑒定

      2021-04-03 01:02:16黃玫瑰張齊元徐春艷侯旻昱
      現(xiàn)代畜牧獸醫(yī) 2021年3期
      關(guān)鍵詞:賈第人獸羊駝

      黃玫瑰,張齊元,汪 文,2,徐春艷,侯旻昱,王 甜,井 波*

      (1.塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木動(dòng)物疫病診斷與防控工程實(shí)驗(yàn)室新疆阿拉爾 843300;2.阿克蘇職業(yè)技術(shù)學(xué)院,新疆阿克蘇 843000)

      十二指腸賈第蟲(Giardia duodenalis)是人和動(dòng)物常見的人獸共患腸道寄生原蟲,宿主范圍廣泛[1]。家畜、寵物和野生動(dòng)物等動(dòng)物糞便中的十二指腸賈第蟲包囊常污染水源和食物,導(dǎo)致人畜賈第蟲病的暴發(fā)和流行[2]?;谶z傳進(jìn)化研究,十二指腸賈第蟲至少分化為8個(gè)(A-H)集聚體,集聚體A 和B 是人獸共患集聚體,主要感染人和多種動(dòng)物,而其他集聚體則多存在宿主特異性[1,3]。我國自2002 年首次從澳大利亞引種羊駝,隨后建立多個(gè)基地進(jìn)行繁育和推廣,用于毛紡業(yè)、觀光業(yè)和旅游業(yè)的發(fā)展,甚至部分作為寵物,與人接觸密切[4]。1987 年,在美國威斯康星州首次報(bào)道大羊駝感染十二指腸賈第蟲,隨后陸續(xù)在美國、秘魯和澳大利亞等國家均有美洲駝感染十二指腸賈第蟲的報(bào)道[5-8],而我國有關(guān)羊駝感染十二指腸賈第蟲的研究資料較少。本試驗(yàn)采用PCR 法檢測我國不同地區(qū)羊駝的感染情況和鑒定基因型,以期為羊駝賈第蟲病防控提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 樣品來源

      分別于2016 年8 月至2017 年7 月和2019 年7 至8 月收集塔城市、溫宿縣、和靜縣、青河縣、尼勒克縣、青島市、繁峙縣、代縣和陽曲縣養(yǎng)殖基地的羊駝糞便(20~30 g)樣本484份,帶回實(shí)驗(yàn)室置于4 ℃冷藏箱保存。羊駝多數(shù)為成年母駝,采集樣本時(shí)均未見腹瀉。

      1.2 DNA提取

      每份糞便樣本在自封袋內(nèi)充分揉勻后,分別用一次性筷子挑取約300 mg,置于潔凈的2 mL 離心管內(nèi),使用糞便全基因組DNA 提取試劑盒(E.Z.N.A.?D4015-02,美國OMEGA Bio-Tek 公司生產(chǎn)),按照說明書步驟操作提取200 μL DNA,置-20 ℃保存。

      1.3 PCR擴(kuò)增

      參考Appelbee 等[9]的十二指腸賈第蟲小亞基核糖體RNA(SSU rRNA)基因引物序列。引物由蘇州金維智生物科技有限公司合成。其中,第一輪上游序列為5'-AAGTGTGGTGCAGACGGACTC-3',下游序列為5'-CTGCTGCCGTCCTTGGATGT-3',目的片段為497 bp;第二輪上游序列為5'-CATCCGGTCGATCCTGCC-3',下游序列為5'-AGTCGAACCCTGATTCTCCGCCAGG-3',目的片段為299 bp。PCR反應(yīng)體系25 μL:模板DNA 1 μL、10×Buffer 2.5 μL、dNTPs 2 μL、rTaq酶0.15 μL、上下游引物(20 μmol/L)各0.3 μL、二甲基亞砜(DMSO)1.25 μL、雙蒸水17.5 μL。第一輪和第二輪的退火溫度分別為55 ℃和59 ℃。PCR反應(yīng)結(jié)束后,取5 μLPCR產(chǎn)物于1.5%的瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,凝膠成像系統(tǒng)中檢查結(jié)果。

      1.4 測序與序列分析

      PCR 擴(kuò)增出目的片段的產(chǎn)物,委托蘇州金維智生物科技有限公司進(jìn)行雙向測序。將測定序列進(jìn)行拼接,在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLAST 搜索,應(yīng)用Clustal X 2.11軟件對(duì)所獲序列進(jìn)行比對(duì)分析,鑒定十二指腸賈第蟲集聚體。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 羊駝十二指腸賈第蟲感染情況(見圖1、表1)

      圖1 十二指腸賈第蟲SSU rRNA基因的PCR擴(kuò)增Fig.1 PCR amplication based on SSU rRNA gene of G.duodenalis

      由圖1、表1 可知,對(duì)484 份羊駝糞便樣本DNA 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,有8 份擴(kuò)增出目的片段條帶,十二指腸賈第蟲總感染率為1.7%。9個(gè)養(yǎng)殖基地中,溫宿縣、和靜縣、青河縣、尼勒克縣、代縣和陽曲縣羊駝十二指腸賈第蟲感染率分別為3.0%、5.0%、2.9%、8.3%、2.6%和0.5%;而塔城市、青島市和繁峙縣的羊駝均未發(fā)現(xiàn)十二指腸賈第蟲感染。

      表1 我國不同地區(qū)羊駝十二指腸賈第蟲感染情況Tab.1 Infection of G.duodenalis in alpaca in different collection sites in China

      2.2 十二指腸賈第蟲集聚體鑒定

      擴(kuò)增出的8 個(gè)十二指腸賈第蟲陽性樣本均成功雙向測序,序列比對(duì)分析結(jié)果表明,5 條序列與我國馬源十二指腸賈第蟲集聚體A(序列登錄號(hào):MN174121)同源性為100%,鑒定為集聚體A;3 條序列與我國猴源十二指腸賈第蟲集聚體B(KJ888984)同源性為100%,鑒定為集聚體B;8 個(gè)樣本均為人獸共患集聚體。

      3 討論

      2008 年,Trout 等[6]對(duì)美國馬里蘭州的羊駝十二指腸賈第蟲感染情況進(jìn)行調(diào)查,發(fā)現(xiàn)感染率為4.9%。Gomez-Puerta等[5]和Gómez-Couso等[7]分別于2012年和2014年對(duì)秘魯羊駝的十二指腸賈第蟲感染情況進(jìn)行調(diào)查,發(fā)現(xiàn)感染率較高,分別為13.0%和50.0%。2018 年,Koehler 等[8]報(bào)道澳大利亞不同羊駝群的十二指腸賈第蟲的感染率為7.4%。本次調(diào)查發(fā)現(xiàn),我國羊駝十二指腸賈第蟲感染率為1.7%,低于秘魯、美國馬里蘭州和澳大利亞等地羊駝十二指腸賈第蟲的感染率,可能與調(diào)查中的樣本多來自成年羊駝?dòng)嘘P(guān)。在秘魯?shù)囊豁?xiàng)調(diào)查顯示,小于1月齡羊駝和成年羊駝的感染率分別為33.3%和1.8%,存在顯著的年齡差異[5]。目前,我國多數(shù)羊駝養(yǎng)殖基地多是引種、擴(kuò)繁和銷售模式,幼齡羊駝在基地中相對(duì)較少。在今后的調(diào)查中,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)幼齡羊駝的調(diào)查。

      十二指腸賈第蟲的8種集聚體(A-H)中,集聚體A和集聚體B為人獸共患集聚體,具有廣泛的宿主,可通過污染水源感染人和動(dòng)物[1-2]。在馬里蘭州的調(diào)查顯示,3份羊駝陽性十二指腸賈第蟲樣本均為集聚體A[5];在秘魯?shù)恼{(diào)查顯示,46 份羊駝羊駝陽性十二指腸賈第蟲樣本37 份為集聚體A,9份為集聚體E[6]。在秘魯?shù)牧硪豁?xiàng)調(diào)查顯示,基于2個(gè)基因位點(diǎn),對(duì)137個(gè)羊駝十二指腸賈第蟲顯微鏡鏡檢陽性樣本進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,成功獲得92 條序列,其中,67 條為集聚體A,24 條為集聚體E,1 條為集聚體A 和E 混合感染[7]。在澳大利亞的調(diào)查顯示,6 份羊駝羊駝陽性十二指腸賈第蟲樣本5份為集聚體A,1份為集聚體E。本次調(diào)查發(fā)現(xiàn),我國不同地區(qū)羊駝感染的十二指腸賈第蟲以集聚體A 為優(yōu)勢集聚體,與上述報(bào)道的調(diào)查結(jié)果相一致;同時(shí)發(fā)現(xiàn)羊駝可感染集聚體B,是否還感染其他集聚體有待于進(jìn)一步調(diào)查研究。

      4 結(jié)論

      調(diào)查結(jié)果顯示,我國部分地區(qū)羊駝十二指腸賈第蟲感染率較低,存在人獸共患集聚體A 和集聚體B,提示具有潛在的人獸共患風(fēng)險(xiǎn)。

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