劉思遠(yuǎn),王巧貞,吳鴻仙,黃庶識(shí),馮 潔**
(1.廣西醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院,廣西南寧 530021;2.廣西科學(xué)院,廣西生物物理與環(huán)境科學(xué)研究中心,廣西南寧 530007)
海洋真菌是海洋微生物的一個(gè)重要分支[1],它們常以寄生或腐生的方式,在海洋或港灣生態(tài)環(huán)境中生長(zhǎng)[2,3],并且參與有機(jī)物的分解和無機(jī)營(yíng)養(yǎng)物的再生過程,是維持海洋生態(tài)系統(tǒng)二氧化碳產(chǎn)生與固定之間動(dòng)態(tài)平衡的關(guān)鍵[4]。同時(shí),由海浪與河流黏土沉積形成的港灣泥灘,是一種與沙灘不同的獨(dú)特環(huán)境[5],海洋微生物為了適應(yīng)其特殊環(huán)境,往往發(fā)展出獨(dú)特的生命代謝途徑,由此能夠產(chǎn)生結(jié)構(gòu)特異、生物活性特殊的次生代謝產(chǎn)物[6,7]。因此,分離、純化和鑒定海洋微生物,對(duì)于揭示當(dāng)?shù)睾S蛭⑸锓N類,保存菌種,建立樣品庫(kù),提供研究海洋微生物藥物和農(nóng)藥的有效菌種[8],以及進(jìn)一步研究其次生代謝產(chǎn)物及其生理活性等均有重要意義。目前,已有文獻(xiàn)報(bào)道常見真菌培養(yǎng)基的配方[9],北部灣海域也發(fā)現(xiàn)多種具有生物活性的海洋真菌[10-12],然而針對(duì)不同分離培養(yǎng)基及加入不同抑制劑的優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)海洋真菌分離效果及分離多樣性的系統(tǒng)研究報(bào)道較為少見。本文采用不同培養(yǎng)基對(duì)采自廣西防城港的海泥樣品進(jìn)行研究,運(yùn)用相對(duì)多度(Relative Abundance)、Simpson指數(shù)、Jaccard系數(shù)考察不同培養(yǎng)基在提取、分離、純化菌種時(shí)的效果,在達(dá)到高效分離純化菌種目標(biāo)的同時(shí),又可以自主選擇分離樣品的多樣性與特異性,供同仁們參考;此外,分離得到的菌種還可以為后續(xù)海洋微生物的應(yīng)用研究及次生代謝產(chǎn)物研究提供物質(zhì)基礎(chǔ)。
2017年12月23日,于防城港市(21°36′57″N,108°13′47″E)采集海泥樣品,采樣深度為海灘地面下15 cm處,將海泥樣品置于采樣袋中,用冰盒轉(zhuǎn)運(yùn)至廣西科學(xué)院生物物理與環(huán)境科學(xué)研究中心,于4℃冰箱中暫存?zhèn)溆谩?/p>
6種普通培養(yǎng)基(定容1 L)分別是MD普通培養(yǎng)基(葡萄糖10 g,蛋白胨5 g,磷酸二氫鉀1 g,七水合硫酸鎂0.5 g,瓊脂20 g,無菌海水50%)、PDA普通培養(yǎng)基(煮沸去除濾液的馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂14 g,無菌海水50%)、YPDA普通培養(yǎng)基(蛋白胨20 g,酵母提取物10 g,葡萄糖2 g,0.2%腺嘌呤溶液15 mL,瓊脂20 g,無菌海水50%)、CA普通培養(yǎng)基(硝酸鈉3 g,磷酸二氫鉀1 g,七水合硫酸鎂0.5 g,氯化鉀0.5 g,硫酸鐵0.01 g,蔗糖30 g,瓊脂20 g,無菌海水50%)、SA普通培養(yǎng)基(麥芽糖40 g,蛋白胨10 g,瓊脂20 g,無菌海水50%)及PA普通培養(yǎng)基(蛋白胨2 g,七水合硫酸鎂0.5 g,瓊脂20 g,無菌海水50%)。各培養(yǎng)基使用去離子水配制,封口后在120℃下高溫滅菌30 min,冷卻至50℃時(shí)加入慶大霉素,使之濃度為50 μg/mL,以抑制細(xì)菌生長(zhǎng)。
優(yōu)化培養(yǎng)基以MD和PDA作為基礎(chǔ)培養(yǎng)基。8種抑制劑如下:青霉素20 μg/mL、鏈霉素50 μg/mL、氯霉素0.1 mg/mL、孟加拉紅1 mg/3 mL、青霉素20 μg/mL+慶大霉素50 μg/mL、鏈霉素50 μg/mL+慶大霉素50 μg/mL、青霉素20 μg/mL+氯霉素0.1 mg/mL、鏈霉素50 μg/mL+氯霉素0.1 mg/mL;后4種復(fù)合抑制劑以下簡(jiǎn)稱為青+慶、鏈+慶、青+氯、鏈+氯。
滅菌的離心管及移液器槍頭,各量程的移液器。
SW-CJ-1F潔凈工作臺(tái)(蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司)、LHS-250SC恒溫恒濕箱(上海天呈實(shí)驗(yàn)儀器制造有限公司)、1-1SP小型臺(tái)式離心機(jī)(德國(guó)SIGMA公司)、070-851型熱循環(huán)儀(德國(guó)Biometra公司)、美國(guó)伯樂電泳儀系統(tǒng)、Omega Fluor凝膠成像儀(美國(guó)Aplegen公司)。
10%的chelex-100樹脂(購(gòu)自上海伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品有限公司);膠紅(購(gòu)自BIOTIUM公司);引物ITS1、引物ITS4、5×loading buffer(購(gòu)自上海捷瑞生物工程有限公司);Taq PCR Master Mix酶、ddH2O(購(gòu)自生工生物工程上海股份有限公司);Trans 15K DNA Marker(購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司)。
稱取2 g海泥置于裝有8 mL無菌水溶液的滅菌離心管中,震蕩后取上層懸濁液,用無菌水將其梯度稀釋1 000倍,分別取100 μL涂布于各培養(yǎng)基上,每種培養(yǎng)基重復(fù)3次,每天觀察并記錄真菌生長(zhǎng)情況,通過菌落形態(tài)、顏色、大小來確定真菌種類,并編號(hào)留樣。
將所得各菌種接種于相同的培養(yǎng)基上反復(fù)純化,直至得到外觀、形態(tài)、顏色上一致的無雜菌污染的純種菌種。采用50%甘油水溶液置于-80℃冰箱中長(zhǎng)期保存,采用內(nèi)裝有斜面固體培養(yǎng)基的試管置于4℃冰箱短期保存。
在超凈工作臺(tái)上,挑取純化得到的真菌菌落,按試劑盒操作指南或按傳統(tǒng)提取DNA的方法進(jìn)行操作。試劑盒為Ezup 柱式真菌基因組 DNA 抽提試劑盒,購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司。傳統(tǒng)方法即將菌落挑取至1.5 mL離心管中,倒入液氮研磨成粉末狀;再加入10%的chelex-100樹脂50 μL,水浴100℃加熱10 min,冷卻至室溫(25℃以下)后,12 000 r/min離心10 min,保留上清液,即含真菌DNA。
取1 μL 1.6節(jié)的上清液與12 μL Taq酶、0.5 μL ITS4引物、0.5 μL ITS1引物、11 μL ddH2O混合進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)程序:94℃ 5 min;94℃ 1 min,53℃ 1 min,72℃ 1.5 min,34個(gè)循環(huán)后72℃充分延伸10 min。正向ITS1引物序列為5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′,反向ITS4引物序列為5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′。
取1 μL擴(kuò)增產(chǎn)物與DNA Marker進(jìn)行凝膠電泳,條件為電壓110 V,電流400 mA,電泳時(shí)間30 min。隨后在Omega Fluor 凝膠成像儀下觀察熒光條帶以辨別DNA是否提取成功,后將提取成功的DNA樣品送至生工生物工程上海股份有限公司進(jìn)行DNA測(cè)序。
將測(cè)得的DNA序列用Contig Express軟件拼接并在NCBI網(wǎng)站(www.ncbi.nlm.nih.gov)進(jìn)行BLAST比對(duì),以序列相似度大于或等于97%確定其屬(Genus)的分類學(xué)依據(jù)。
本研究采用SPSS 17.0軟件(Chicago,IL,USA)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)為卡方檢驗(yàn)(X2),以α=0.05作為檢驗(yàn)水準(zhǔn)。
本研究采用Simpson 指數(shù)和Jaccard系數(shù)分析菌種多樣性。Simpson指數(shù)是描述生境內(nèi)物種多樣性的指標(biāo)之一,數(shù)值越大說明生境內(nèi)真菌的均衡性和豐富程度越高;Jaccard系數(shù)是比較兩個(gè)集合間相似性與差異性的指標(biāo),數(shù)值越小說明兩集合的差異越大[13]。
選取序列相似度≥97%的菌株,并將其中相似度等于100%的菌株去除,最終共得111株不同的菌株。其中有1株葫蘆霉科Cucurbitariaceae真菌、3株子囊菌門Ascomycota真菌因未確定種屬均不納入本次分析比較。以屬作為分析的基本單位共分析107株真菌,不同屬的真菌在防城港海域海泥中的構(gòu)成差異明顯,其中優(yōu)勢(shì)菌種依次為青霉屬Penicillium39株,相對(duì)豐度36.45%;其次為枝孢屬Cladosporium21株,相對(duì)豐度19.63%;然后是曲霉屬Aspergillus11株,相對(duì)豐度10.28%。擲孢酵母屬Sporobolomyces、籃狀菌屬Talaromyces、Papiliotrema屬各4株,相對(duì)豐度均為3.74%;棒孢酵母屬Clavispora和囊擔(dān)菌屬Cystobasidium各3株,相對(duì)豐度均為2.80%;柄銹菌屬Puccinia、紅酵母屬Rhodotorula和Krasilnikovozyma屬各2株,相對(duì)豐度均為1.87%;附球菌屬Epicoccum、擬盤多毛孢屬Pestalotiopsis、假絲酵母屬Candida、莖點(diǎn)霉屬Phoma、擬青霉屬Purpureocillium、球腔菌屬M(fèi)ycosphaerella、鐮刀菌屬Fusarium、孔韌菌屬Porostereum、Acrodontium屬、Geosmithia屬、Pezizomycotina屬和Roussoella屬各1株,相對(duì)豐度均為0.93%。
6種普通培養(yǎng)基的分離結(jié)果如表1所示,PA普通培養(yǎng)基分離種類最少,為4屬;SA普通培養(yǎng)基中分離出的真菌種類最多,為10屬;其余4種普通培養(yǎng)基分離效果之間沒有顯著差異(P>0.05)。對(duì)比酵母菌和霉菌的分離效果,6種普通培養(yǎng)基分離得到的酵母菌最少為3屬,最多為4屬,分離效果相近;而在霉菌的分離效果上,SA普通培養(yǎng)基分離出霉菌最多為7屬,PA、CA普通培養(yǎng)基只分離出1屬,其余3種普通培養(yǎng)基分離的霉菌屬數(shù)相近,無顯著差異(P>0.05)。
表1 從6種普通培養(yǎng)基中分離得到的真菌屬數(shù)Table 1 Number of fungal genera isolated from six common media
6種普通培養(yǎng)基所分離出的真菌種數(shù)如表2所示。雖然PA普通培養(yǎng)基分離出的真菌屬數(shù)較少,但是從中分離得到的囊擔(dān)菌屬Cystobasidium真菌為41株,相比于其他的普通培養(yǎng)基具有顯著優(yōu)勢(shì)(P<0.05)。YPDA普通培養(yǎng)基對(duì)枝孢屬Cladosporium真菌的分離效果較其他普通培養(yǎng)基具有顯著優(yōu)勢(shì)(P<0.05)。此外,柄銹菌屬Puccinia真菌只在PA、CA普通培養(yǎng)基分離得到,擬盤多毛孢屬Pestalotiopsis真菌也只在SA、PDA普通培養(yǎng)基中分離得到?;@狀菌屬Talaromyces、球腔菌屬M(fèi)ycosphaerella及Geosmithia屬真菌只在SA培養(yǎng)基中分離得到,Porostereum屬真菌只在YPDA普通培養(yǎng)基分離得到,莖點(diǎn)霉屬Phoma、Papiliotrema屬真菌只在PDA普通培養(yǎng)基中分離得到,假絲酵母屬Candida、Acrodontium屬及Roussoella屬真菌只在MD普通培養(yǎng)基中分離得到。說明普通培養(yǎng)基對(duì)這些屬真菌分離的選擇性較高。綜上,PDA、MD和YPDA得到的酵母數(shù)和霉菌數(shù)比較均衡,結(jié)合實(shí)際應(yīng)用考慮,采用PDA、MD培養(yǎng)基進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
表2 從6種普通培養(yǎng)基分離得到的真菌種數(shù)Table 2 Number of fungi species isolated from the six common media
為了進(jìn)一步探討不同抑制劑對(duì)海洋真菌生長(zhǎng)的影響,本研究利用含有不同抑制劑的PDA、MD優(yōu)化培養(yǎng)基進(jìn)行分離實(shí)驗(yàn)。從分離結(jié)果可以看出(表3),PDA優(yōu)化培養(yǎng)基共分離得到244株霉菌,MD優(yōu)化培養(yǎng)基共分離得到141株,株數(shù)上PDA優(yōu)化培養(yǎng)基的分離效果明顯優(yōu)于MD優(yōu)化培養(yǎng)基(P<0.05);從屬數(shù)來看,PDA優(yōu)化培養(yǎng)基共分離得到4屬霉菌,而MD優(yōu)化培養(yǎng)基共分離得到8屬霉菌。在PDA優(yōu)化培養(yǎng)基中,分離霉菌株數(shù)最多的前4位依次為含鏈霉素的優(yōu)化培養(yǎng)基(63株)>含鏈+慶的優(yōu)化培養(yǎng)基(57株)>含鏈+氯的優(yōu)化培養(yǎng)基(46株)>含氯霉素的優(yōu)化培養(yǎng)基(41株)。在MD優(yōu)化培養(yǎng)基中,分離菌株數(shù)量最多的前3位依次為含鏈+慶的優(yōu)化培養(yǎng)基(44株)>含鏈+氯的優(yōu)化培養(yǎng)基(38株)>含氯霉素的優(yōu)化培養(yǎng)基(21株)。含鏈霉素、氯霉素的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基分離效果顯著優(yōu)于分別含這兩種抑制劑的MD優(yōu)化培養(yǎng)基(P<0.05)。PDA、MD優(yōu)化培養(yǎng)基均分離得到3屬酵母菌,與2.2節(jié)的結(jié)果基本一致。
表3 優(yōu)化培養(yǎng)基的分離結(jié)果Table 3 Separation results of optimized medium
含不同抑制劑的優(yōu)化培養(yǎng)基分離得到的真菌種類如表4所示。其中分別含鏈霉素、氯霉素、鏈+慶、鏈+氯的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基及分別含鏈+慶、鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基分離得到的真菌株數(shù)較多,這6種優(yōu)化培養(yǎng)基的分離效果明顯優(yōu)于其他10種優(yōu)化培養(yǎng)基(P<0.05)。青霉屬Penicillium因?yàn)檫m應(yīng)力較強(qiáng),所有優(yōu)化培養(yǎng)基均可分離得到;其次為枝孢菌屬Cladosporium及曲霉屬Aspergillus,含孟加拉紅的MD優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)分離枝孢菌屬稍有優(yōu)勢(shì),含孟加拉紅的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)分離曲霉屬稍有優(yōu)勢(shì)。另外,含青+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)分離籃狀菌屬Talaromyces具有顯著優(yōu)勢(shì)(P<0.05);囊擔(dān)菌屬Cystobasidium、擬青霉屬Purpureocillium、柄銹菌屬Puccinia以及Krasilnikovozyma屬只在含青霉素的MD優(yōu)化培養(yǎng)基中分離得到;鐮刀菌屬Fusarium真菌只在含青+慶的MD優(yōu)化培養(yǎng)基中分離得到;棒孢酵母屬Clavispora僅在含鏈+慶的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基中分離得到;擲孢酵母屬Sporobolomyces僅在含青+氯的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基中分離得到。
表4 優(yōu)化培養(yǎng)基所分離得到的真菌屬及種數(shù)Table 4 The genera and species number of fungi isolated from optimized medium
從表5中可以看出,SA、MD普通培養(yǎng)基具有良好的均衡性與多樣性(Simpson指數(shù)>0.8),PA普通培養(yǎng)基的Simpson指數(shù)明顯低于其他5種普通培養(yǎng)基,原因是PA普通培養(yǎng)基對(duì)真菌的選擇性較高。在含不同抑制劑的優(yōu)化培養(yǎng)基中,含青霉素、孟加拉紅的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基以及含青霉素、青+慶、青+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基均衡性較好(Simpson指數(shù)70.6),多樣性與豐富性也較高;含氯霉素、鏈霉素、鏈+慶、鏈+氯的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基與含鏈霉素、鏈+慶、鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基Simpson 指數(shù)偏低(<0.2),說明這些優(yōu)化培養(yǎng)基具有明顯的選擇性,適用于培養(yǎng)與分離特定種屬的真菌。
表5 普通培養(yǎng)基及優(yōu)化培養(yǎng)基的Simpson指數(shù)Table 5 Simpson index of common medium and optimized medium
另外,雖然MD、PDA普通培養(yǎng)基具有良好的均衡性和多樣性,但是在加入抑制劑后,其Simpson指數(shù)均有不同程度的降低。其中,分別含青霉素、孟加拉紅的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基及分別含青霉素、青+慶、青+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基,Simpson指數(shù)與其普通培養(yǎng)基相近,但分別含鏈霉素、氯霉素、鏈+慶、鏈+氯的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基,及分別含鏈霉素、鏈+慶、鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基Simpson指數(shù)降幅較大,顯示出與普通培養(yǎng)基截然不同的選擇性。
從表6-表8可以看出,普通培養(yǎng)基的Jaccard系數(shù)為0.222-0.600,說明它們的分離效果相似度較低,集合內(nèi)異質(zhì)性較高。而優(yōu)化培養(yǎng)基的Jaccard系數(shù)為0.111-1.000,范圍跨度較大。其中,含孟加拉紅的MD優(yōu)化培養(yǎng)基與含鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基之間Jaccard系數(shù)為1.000,說明這兩種培養(yǎng)基的分離差異性極小。但對(duì)比表5可知,二者Simpson指數(shù)差異較大,含鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)青霉屬真菌的選擇性遠(yuǎn)高于含孟加拉的MD優(yōu)化培養(yǎng)基。
表6 普通培養(yǎng)基的JaccardTable 6 Jaccard index of common medium
表7 PDA優(yōu)化培養(yǎng)基的Jaccard系數(shù)Table 7 Jaccard index of optimized PDA medium
表8 MD優(yōu)化培養(yǎng)基的Jaccard系數(shù)Table 8 Jaccard index of optimized MD medium
目前國(guó)內(nèi)關(guān)于不同培養(yǎng)基和不同抑制劑對(duì)海洋微生物分離效果的研究報(bào)道尚少,不同培養(yǎng)基由于成分不同,對(duì)真菌分離效果的均衡性與選擇性具有一定差異。目前學(xué)界普遍認(rèn)為,抗生素作為抑制劑可抑制細(xì)菌生長(zhǎng),對(duì)真菌生長(zhǎng)及分離一般沒有顯著影響。但是本研究發(fā)現(xiàn),加入不同抑制劑的培養(yǎng)基之間及其與原培養(yǎng)基之間,對(duì)同一份樣品的真菌分離效果相差甚遠(yuǎn),說明選擇合理的抑制劑有助于快速分離目標(biāo)海洋真菌。
本研究所得優(yōu)勢(shì)菌屬與多地已有報(bào)道的海洋真菌構(gòu)成相似[14]。6種普通培養(yǎng)基中,SA培養(yǎng)基分離得到的菌株種數(shù)最多,PA普通培養(yǎng)基所得菌株最少,Simpson指數(shù)分析結(jié)果與這一情況相符。PA普通培養(yǎng)基和YPDA普通培養(yǎng)基對(duì)菌株的分離效果表現(xiàn)出明顯的選擇性,其余4種普通培養(yǎng)基的Simpson指數(shù)較為接近;其中,MD普通培養(yǎng)基多樣性與均衡性較高,與文獻(xiàn)[12]結(jié)果相似。但在優(yōu)化培養(yǎng)基的實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),含抑制劑的MD優(yōu)化培養(yǎng)基Simpson指數(shù)均有所下降且程度不一,說明抑制劑在抑制細(xì)菌生長(zhǎng)的同時(shí)可能也會(huì)對(duì)真菌的生長(zhǎng)產(chǎn)生一定的抑制作用,但目前并沒有明確研究表明其影響機(jī)制、程度及范圍。其中,分別含青霉素、青+慶的MD優(yōu)化培養(yǎng)基的均衡性相對(duì)較高,與MD普通培養(yǎng)基的Simpson指數(shù)較為接近。其余優(yōu)化培養(yǎng)基的Simpson指數(shù)均小于0.7,而且分別含鏈霉素、氯霉素、鏈+氯的PDA優(yōu)化培養(yǎng)基與分別含鏈霉素、鏈+慶、鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基的Simpson指數(shù)小于0.1,結(jié)合表4可知這5種優(yōu)化培養(yǎng)基在分離海洋真菌時(shí)對(duì)青霉屬Penicillium具有較高的選擇性。
6種普通培養(yǎng)基之間的Jaccard系數(shù)均不超過0.6,說明任意兩種普通培養(yǎng)基分離所得的菌種組成相似度都較低。在優(yōu)化培養(yǎng)基中,MD優(yōu)化培養(yǎng)基分離的菌屬數(shù)稍多于PDA優(yōu)化培養(yǎng)基,但從PDA優(yōu)化培養(yǎng)基中分離得到的菌株數(shù)量明顯多于MD優(yōu)化培養(yǎng)基,產(chǎn)生該數(shù)量差異的主要原因是PDA培養(yǎng)基對(duì)青霉屬真菌具有較高的選擇性,這與文獻(xiàn)[9]的報(bào)道一致。但是PDA培養(yǎng)基的這種選擇性在6種普通培養(yǎng)基的實(shí)驗(yàn)中并沒有充分表現(xiàn),而是表現(xiàn)出對(duì)囊擔(dān)菌屬Cystobasidium的高選擇性,故推測(cè)優(yōu)化培養(yǎng)基中的8種抑制劑均可能對(duì)青霉屬真菌有抑制作用。優(yōu)化培養(yǎng)基之間的Jaccard系數(shù)數(shù)值跨度均較大。其中值得注意的是,含孟加拉紅的MD優(yōu)化培養(yǎng)基與鏈+氯的優(yōu)化MD培養(yǎng)基之間的Jaccard系數(shù)為1.000,是由于這兩種培養(yǎng)基所得真菌都為青霉屬Penicillium和枝孢菌屬Cladosporium真菌。結(jié)合Simpson指數(shù)可以看出,含孟加拉紅的MD優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)這兩種真菌的分離具有較好的均衡性,而含鏈+氯的MD優(yōu)化培養(yǎng)基對(duì)青霉屬Penicillium真菌具有較高的選擇性。
本研究中除分離得到111株基因序列相似度≥97%的真菌外,還發(fā)現(xiàn)了9個(gè)基因序列相似度小于97%的真菌菌株,其中5個(gè)菌株相似度小于94%。通常相似度94%被認(rèn)為是區(qū)分一個(gè)新種的最低界限,而相似度96.4%被認(rèn)為是值得區(qū)分一個(gè)新屬的界限[15],因此小于97%則無法確定這些真菌的種屬,未被列入本文研究對(duì)象。這9個(gè)相似度小于97%的菌株將會(huì)在后續(xù)研究中根據(jù)形態(tài)特征和系統(tǒng)發(fā)育樹確定其歸類。
本研究分離得到青霉屬真菌7種,包括托姆青霉Penicilliumthomii、橘青霉P.citrinum、草酸青霉P.oxalicum、爪哇青霉P.javanicum、產(chǎn)紫青霉P.purpurogenum、簡(jiǎn)青霉P.simplicissimum、菌核青霉P.sclerotiorum;枝孢菌屬真菌7種,包括黃色枝孢菌Cladosporiumxanthochromaticum、狹枝孢菌C.tenuissimum、芽枝狀枝孢菌C.cladosporioides、澳洲枝孢菌C.australiense、尖孢枝孢菌C.oxysporum、C.Perangustum、C.anthropophilum等,這兩屬真菌具有廣泛的藥用前景,包括抗癌[16,17]、抗菌[18]、抗氧化[19]以及合成藥用活性化合物的關(guān)鍵前體[20,21]。本研究結(jié)果有助于建立北部灣海域真菌樣品庫(kù),為后續(xù)海洋真菌代謝產(chǎn)物分離、結(jié)構(gòu)鑒定及生物活性提供基礎(chǔ)資料,同時(shí)也為高效地提取分離海洋真菌提供有價(jià)值的參考。