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      柚皮苷和胃蛋白酶相互作用的光譜研究

      2021-07-12 02:38:30楊鑫徐晶馬坤王娜楊廣德南冠軍
      中醫(yī)藥信息 2021年5期
      關(guān)鍵詞:能量轉(zhuǎn)移柚皮苷作用力

      楊鑫,徐晶,馬坤,王娜,楊廣德,南冠軍

      (1.西安交通大學(xué)第二附屬醫(yī)院,陜西 西安 710004;2.陜西省人民醫(yī)院,陜西 西安 710068;3.西安交通大學(xué)藥學(xué)院,陜西 西安 710061)

      柚皮苷(Naringin,NRG)是一種雙氫黃酮類化合物,主要存在于蕓香科柚、葡萄柚和酸橙等植物中。柚皮苷具有多種生物學(xué)活性,如抗病毒、抗炎、抗過敏、鎮(zhèn)痛等,還能通過調(diào)節(jié)血液中膽固醇水平,減少血栓從而改善局部微循環(huán),達到防治血管性疾病的目的[1-2]。

      胃蛋白酶(Pepsin,Pep),又稱胃液素,是人類及多數(shù)哺乳動物胃腸道內(nèi)的一種重要消化酶,對人類而言,Pep分子量約為35 kDa, 在37~42 ℃的酸性環(huán)境中具有最強活性[3],主要是通過水解聚氨基酸間的肽鍵鏈接使食物中的蛋白類物質(zhì)被消化[4]。胃液中的前體物質(zhì)——胃蛋白酶原,在酸性條件下被激活后形成胃蛋白酶從而發(fā)揮作用[5]。胃蛋白酶目前被廣泛應(yīng)用于各類工業(yè)和食品生產(chǎn)中,包括方便食品、奶制品、消化藥及口香糖加工制造,以及啤酒、果酒的澄清應(yīng)用方面[6]。

      天然活性化合物和蛋白質(zhì)或酶等生物大分子的相互作用研究越來受到關(guān)注。小分子化合物與酶等生物大分子相互作用,一方面可能會引起酶的構(gòu)象改變,影響其活性;另一方面會影響小分子化合物的吸收、轉(zhuǎn)運等[7]。鑒于NRG廣泛存在于一些水果中,Pep又是重要消化酶;因此有必要研究NRG和Pep的相互作用,從分子水平方面闡明NRG與Pep的作用特點[8-11]。因此本研究將通過研究NRG與Pep的熒光猝滅類型、結(jié)合常數(shù)K、結(jié)合位點數(shù)n、作用力類型、Pep構(gòu)象的變化,結(jié)合NRG與Pep的氨基酸殘基的距離r等關(guān)鍵參數(shù)的研究,并通過測定結(jié)合常數(shù)隨溫度的變化情況,進一步確定NRG與Pep的作用機制及可能性,為分子水平上研究NRG與Pep的作用特點提供信息[12-15]。

      1 儀器與試劑

      熒光分光光度計(RF-5310pc,日本島津公司);紫外分光光度計(UV-2450,日本島津公司);分析天平(AY120,日本島津公司);循環(huán)恒溫水浴鍋(HWY-501, 上海昌吉地質(zhì)儀器有限公司);數(shù)顯pH計(PHS-29A,上海儀電科學(xué)儀器股份有限公司);超純水機(1810B,上海摩勒生物科技有限公司)。

      Pep(北京索萊寶科技有限公司,分析純);NRG(西安冠宇生物技術(shù)公司,分析純);檸檬酸、磷酸氫二鈉、乙醇和氯化鈉(西安化學(xué)試劑廠,分析純)。

      2 方法與結(jié)果

      2.1 儲備液的配制

      2.1.1 檸檬酸-磷酸鹽緩沖液

      先準確稱取檸檬酸21.01 g,然后用蒸餾水溶解并定容至1 000 mL;準確稱取十二水合磷酸氫二鈉(Na2HPO4·12H2O)3.58 g,用蒸餾水溶解定容至50 mL。準確稱取5.85 g NaCl置1 000 mL容量瓶中,加入上述檸檬酸溶液530 mL和十二水合磷酸氫二鈉溶液20 mL,溶解完全后蒸餾水定容。

      2.1.2 Pep標準儲備液的配制

      準確稱取87.5 mg的Pep置100 mL容量瓶中,使用上述檸檬酸-磷酸鹽緩沖液溶解并定容,得到2.5×10-5mol/L的Pep標準儲備液,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      2.1.3 NRG儲備液的配制

      精確稱取10 mg NRG置10 mL容量瓶中,加入乙醇溶解定容,得到1.72×10-3mol/L 的NRG儲備液,4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

      2.2 試驗方法

      2.2.1 NRG與Pep相互作用的紫外吸收光譜

      精密量取5 mL Pep標準儲備液,用上述檸檬酸-磷酸鹽緩沖溶液稀釋至濃度為1.25×10-5mol/L,取與Pep相同摩爾濃度的NRG溶液,另取與相同濃度的Pep-NRG混合溶液于37 ℃反應(yīng)5min后,分別在200~400 nm范圍內(nèi)掃描紫外光譜。

      2.2.2 NRG與Pep相互作用的熒光猝滅光譜

      精密量取10 mL 1.25×10-5mol/L Pep稀釋液于比色管中,加入25 μL乙醇,恒溫水浴5 min,取2 mL于比色皿中,將激發(fā)波長設(shè)為280 nm,并將激發(fā)光譜和發(fā)射光譜的狹縫寬度設(shè)為5 nm,獲得溶液在290 ~ 440 nm范圍內(nèi)的熒光發(fā)射光譜。逐次加入NRG儲備液置比色管中,每次2 μL,掃描后再將比色皿中的溶液倒回,搖勻,置于25 ℃恒溫水浴鍋中,恒溫5 min,重新取該溶液2 mL在原圖上掃描猝滅光譜,并記錄每次掃描的峰值的熒光強度。

      將恒溫水浴溫度分別改為30 ℃和37 ℃,重復(fù)以上操作。

      2.2.3 同步熒光光譜

      室溫下,操作方法同“熒光猝滅光譜”。精密量取一定量濃度和體積的Pep稀釋液于比色管中,取2 mL于比色皿中,以Δλ = 15 nm和Δλ = 60 nm測定其同步熒光光譜(Δλ為發(fā)射波長與激發(fā)波長的差,即Δλ=λem- λex;激發(fā)光柵與發(fā)射光柵狹縫寬均為5 nm),逐次加入NRG儲備液于比色管中,每次2 μL,掃描后再將比色皿中的溶液倒回,搖勻,靜置5 min,重復(fù)以上操作測定其同步熒光光譜。

      2.2.4 三維熒光

      室溫下,精密量取一定量濃度和體積的Pep稀釋液于比色管中,取2 mL于比色皿中,將激發(fā)波長設(shè)置為從220 nm開始,間隔為5 nm,直到400 nm為止,在220 ~ 500 nm范圍內(nèi)掃描熒光光譜,得出NRG-Pep的三維熒光光譜。

      2.3 結(jié)果

      2.3.1 NRG對Pep的猝滅作用

      見圖1,圖1中a、b、c分別為在25、30、37 ℃下NRG對Pep的熒光猝滅光譜。NRG與Pep的相互作用機制可由熒光光譜的變化推斷得出。從圖中可以看出,隨著NRG濃度的增加,峰位和峰形基本不變,而Pep的熒光強度隨NRG濃度的增加而降低,由此可以推測NRG與Pep產(chǎn)生了相互作用。

      注:圖中C (Pep) = 1.25×10-5 mol/L,圖中1~11熒光猝滅光譜對應(yīng)的的C (NRG) = 0、0.34、0.69、1.03、1.38、1.72、2.06、2.41、2.75、3.10、3.44×10-6 mol/L。圖1 在25 ℃ (a),30 ℃ (b),37 ℃ (c)不同溫度下NRG對Pep的熒光猝滅光譜

      2.3.2 柚皮苷與胃蛋白相互作用的猝滅機理

      根據(jù)Stern-Volmer方程[16],即公式(1),以F0/F為縱坐標,Pep溶液中加入的NRG濃度[Q](×10-6mol/L)為橫坐標作圖,可得到不同溫度情況下NRG對Pep的熒光猝滅曲線,并對曲線做線性回歸,見圖2。

      (1)

      其中,F(xiàn)0:熒光強度(不加猝滅劑);F:熒光強度(加入猝滅劑);Kq:雙分子表觀猝滅常數(shù);τ0:無猝滅劑條件下,熒光分子的平均壽命(約為10~8 s);[Q]:猝滅劑濃度;Ksv:猝滅速率常數(shù)。

      以F0/F為縱坐標,猝滅劑濃度[Q]為橫坐標,繪制Stern-Volmer曲線,回歸方程的斜率即為Ksv,同時求得Kq。

      Ksv隨測試溫度升高而升高,見表1,初步推斷NRG對Pep的猝滅機制為動態(tài)猝滅。此外,由于雙分子表觀猝滅常數(shù)Kq值均遠大于最大擴散碰撞猝滅常數(shù)2.0×1010L/(mol·s),說明引起熒光體熒光猝滅的主要原因可能是形成了新的配合物,猝滅機理為靜態(tài)猝滅,所以可以推出Pep的熒光猝滅可能不是分子擴散和碰撞引起的動態(tài)猝滅,而是形成新的復(fù)合物引起的復(fù)合式靜態(tài)猝滅。

      注:●表示25 ℃;█表示30 ℃;▲表示37 ℃。圖2 在不同溫度下NRG對Pep的熒光猝滅曲線

      表1 NRG對Pep的Stern-Volmer回歸方程及猝滅常數(shù)

      2.3.3 柚皮苷與胃蛋白酶的結(jié)合常數(shù)和結(jié)合位點數(shù)

      根據(jù)公式(2)計算NRG與Pep的結(jié)合位點數(shù)。用lg[(F0-F)/F] 對lg[Q] 作雙對數(shù)圖,對數(shù)據(jù)作線性擬合,直線斜率即為不同溫度下NRG與Pep的結(jié)合位點數(shù)。結(jié)果如圖3所示,并將其相關(guān)系數(shù)列于表2中。

      (2)

      注:●表示25 ℃;█表示30 ℃;▲表示37 ℃。圖3 不同溫度下NRG對Pep熒光猝滅的雙對數(shù)曲線

      表2 NRG與Pep的結(jié)合常數(shù)和結(jié)合位點數(shù)

      由斜率知,NRG與Pep的結(jié)合位點數(shù)n≈1下,二者結(jié)合時,存在約1個單獨的結(jié)合位點,即大約1個NRG分子與1個Pep分子結(jié)合形成配合物。

      2.3.4 柚皮苷與胃蛋白酶相互作用的作用力類型

      用對應(yīng)溫度下的結(jié)合常數(shù)的自然對數(shù)lnK對1/T作圖,線性擬合得到圖4,再根據(jù)公式(3)和(4),可計算得到結(jié)合反應(yīng)的ΔG,ΔH,ΔS等熱力學(xué)函數(shù)的變化值,所得結(jié)果見表3。

      (3)

      ΔG=ΔH-TΔS=-RTlnK

      (4)

      式中K表示溫度為T時的結(jié)合常數(shù);T表示絕對溫度;R表示普適氣體常量;ΔG表示反應(yīng)的標準摩爾吉布斯自由能變;ΔH表示反應(yīng)焓變;ΔS表示反應(yīng)熵變。

      藥物分子與蛋白質(zhì)作用力類型可以根據(jù)ΔH和ΔS的值來判斷:若ΔH>0,ΔS>0,則是典型的疏水作用力;若ΔH<0,ΔS>0,則是靜電作用力;若ΔH<0,ΔS<0,則表明是氫鍵和范德華力;若ΔG<0,則表明反應(yīng)過程是自發(fā)進行的。

      圖4 NRG對1/T的線性關(guān)系

      由表3可知,NRG-Pep結(jié)合體系的ΔH>0,ΔS>0,NRG與Pep分子間存在的相互作用力為疏水作用力。ΔG<0表明NRG與Pep的結(jié)合是自由能降低的分子作用過程,說明NRG可以自發(fā)地與Pep相結(jié)合。

      表3 NRG與Pep結(jié)合的熱力學(xué)常數(shù)

      2.3.5 NRG對Pep構(gòu)象的影響

      NRG對Pep構(gòu)象見圖5。

      注:圖中Δλ=15 nm (a),Δλ= 60 nm (b),C (Pep) = 1.25×10-5 mol/L;圖中1~11對應(yīng)的的C (NRG) = 0、0.34、0.69、1.03、1.38、1.72、2.06、2.41、2.75、3.10、3.44×10-6 mol/L。圖5 室溫下NRG對Pep的同步熒光光譜

      圖5中的a和b分別為在室溫條件下,Pep在Δλ=15 nm (酪氨酸殘基)和Δλ=60 nm (色氨酸殘基)的同步熒光光譜。隨著NRG濃度增大,Pep同步熒光強度逐漸降低。其中,色氨酸殘基的熒光強度降低的幅度較大,表明Pep的熒光強度可能主要來自色氨酸殘基,其最大發(fā)射波長發(fā)生了藍移,表明色胺酸殘基環(huán)境的疏水性增大,Pep趨向折疊態(tài),因此Pep的構(gòu)型發(fā)生了變化。

      2.3.6 柚皮苷對胃蛋白酶紫外吸收光譜的影響

      NRG與Pep反應(yīng)后在波長280 nm處有最大吸收峰,加入NRG后,Pep紫外吸收光譜發(fā)生了明顯紅移,表明NRG與Pep形成了新的復(fù)合物。見圖6。

      注:圖中C (Pep) = 1.25×10-5 mol/L,C (Pep) =C (NRG) = 1.25×10-5 mol/L; a. NRG; b. NRG-Try; c. Try; d. b-a。圖6 NRG與Pep相互作用的紫外吸收光譜

      2.3.7 柚皮苷與胃蛋白酶之間的能量轉(zhuǎn)移

      小分子物質(zhì)與熒光發(fā)射基團間的能量轉(zhuǎn)移效率E和結(jié)合距離r可由公式(5)計算得出:

      (5)

      其中E為能量轉(zhuǎn)移效率,F(xiàn)0和F分別表示不加猝滅劑和加入猝滅劑后蛋白的熒光強度,R0表示轉(zhuǎn)移效率為50%時的臨界距離,r為小分子藥物與蛋白的熒光發(fā)射基團的距離。R0可由公式(6)計算得出:

      (6)

      式中K2表示偶極空間取向因子,N表示介質(zhì)的折射指數(shù),Φ表示供能體的熒光量子產(chǎn)率,J表示供能體的熒光發(fā)射光譜和受能體的紫外吸收光譜的重疊積分,可由公式(7)計算得出:

      (7)

      F(λ)表示供能體在波長λ處的熒光強度,ε(λ)表示受能體在波長λ處的摩爾吸光系數(shù),K2=2/3,N=1.336,Φ=0.15;可由公式5~7式計算得出J,R0,和r值。當供能體與受能體間的距離小于7 nm時,表明蛋白與小分子藥物之間發(fā)生了能量轉(zhuǎn)移。

      供能體Pep的熒光光譜圖與受能體NRG的紫外吸收光譜圖有重疊,根據(jù)F?rster非輻射能量轉(zhuǎn)移原理,可計算出NRG在Pep上的結(jié)合位置距色氨酸殘基的距離r=2.44 nm (<7 nm),表明Pep與NRG之間可能存在能量轉(zhuǎn)移。見圖7,表4。

      表4 NRG與Pep間的能量轉(zhuǎn)移參數(shù)

      2.3.8 柚皮苷與胃蛋白酶之間的三維熒光

      三維圖a為Pep三維熒光,三維圖b為NRG-Pep三維熒光,可以看出NRG-Pep峰強度降低,表示了NRG和Pep之間有相互作用。見圖8。

      圖8 胃蛋白酶和柚皮苷的三維熒光圖

      3 討論

      NRG能顯著猝滅Pep的熒光,熒光猝滅實驗結(jié)果表明,NRG與Pep的作用機制為(復(fù)合式)靜態(tài)猝滅[17]。NRG與Pep結(jié)合時約存在1個單獨的結(jié)合位點,即大約1個NRG分子與1個Pep分子結(jié)合形成配合物,隨著溫度的升高,結(jié)合常數(shù)也增大,37 ℃時,NRG與Pep的結(jié)合常數(shù)最大為3.40×105。通過Vant Hoff方程計算得出,NRG與Pep間的作用力類型為疏水作用力,NRG與Pep的結(jié)合是自由能降低的分子作用過程,NRG可以自發(fā)地與Pep相結(jié)合。

      根據(jù)同步熒光光譜表明,NRG在與Pep作用時,Pep構(gòu)象發(fā)生了一定程度的變化[13]。紫外吸收光譜的變化表明NRG與Pep之形成了不發(fā)光的復(fù)合物,進而導(dǎo)致熒光吸收光譜變化,同時,F(xiàn)?rster非輻射能量轉(zhuǎn)移原理表明,NRG與Pep之間存在著能量轉(zhuǎn)移現(xiàn)象,進一步證實了NRG和Pep之間存在以靜態(tài)猝滅發(fā)生相互作用的可能[18]。

      通過建立植物活性成分與酶結(jié)合的體外模型,得到了兩者結(jié)合的緊密程度、結(jié)合部位、結(jié)合作用力、結(jié)合位點數(shù)等信息,不僅有助于在分子水平上認識蛋白質(zhì)和藥物的相互作用,獲得藥物結(jié)合生物大分子的基本信息,還可以提供藥物藥效學(xué)和藥動學(xué)的相關(guān)信息。

      NRG與Pep的相互作用機制可由熒光光譜的變化推斷得出,NRG與Pep產(chǎn)生了相互作用或自發(fā)結(jié)合,Pep的熒光猝滅可能是形成新的復(fù)合物引起的復(fù)合式靜態(tài)猝滅,大約1個NRG分子與1個Pep分子結(jié)合形成配合物并伴隨能量轉(zhuǎn)移。

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