鄧 云
(福建省南平市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,福建 南平 354200)
【研究意義】由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae,無(wú)性世代為Pyricularia oryzae)引起的稻瘟病是水稻上最具毀滅性的真菌病害,也是福建省水稻生產(chǎn)中最嚴(yán)重的真菌性病害之一[1?6]。目前,全國(guó)因稻瘟病引起的水稻產(chǎn)量損失已經(jīng)達(dá)到每年10億kg,給我國(guó)糧食安全帶來(lái)了嚴(yán)重隱患[7?8]。培育和種植抗病品種不僅能有效解決因農(nóng)藥造成的殘毒和環(huán)境污染問(wèn)題,同時(shí)能夠遏制稻瘟病流行,是防治稻瘟病最安全、經(jīng)濟(jì)和有效的途徑。然而,稻瘟病菌生理小種的專化性、遺傳復(fù)雜性和頻繁變異,導(dǎo)致抗病水稻品種在連續(xù)推廣3~5年后抗性降低甚至喪失?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】?jī)?yōu)質(zhì)抗原主要來(lái)源于稻瘟病多發(fā)區(qū)域內(nèi)經(jīng)長(zhǎng)時(shí)間自然選擇留下的品種及野生稻和栽培稻等稻種資源中表現(xiàn)出抗稻瘟病的品種[6]。根據(jù)Flor[9]的基因?qū)驅(qū)W說(shuō),水稻在抵抗稻瘟病菌侵染過(guò)程中,寄主的抗病基因與稻瘟病菌的無(wú)毒基因間編碼產(chǎn)物可互作識(shí)別,引發(fā)過(guò)敏性壞死反應(yīng)(HR),抑制稻瘟病菌在植株中的擴(kuò)展,從而產(chǎn)生抗病效應(yīng)[10],李宏宇等[11]認(rèn)為水稻與稻瘟病菌之間的特異互作符合“基因?qū)颉奔僬f(shuō),即水稻品種有一種抗病基因R,稻瘟菌中就會(huì)有一個(gè)與之對(duì)應(yīng)的無(wú)毒基因。福建省是稻瘟病多發(fā)地區(qū),國(guó)內(nèi)已有不少學(xué)者對(duì)福建省的稻瘟病菌小種組成、分布和消長(zhǎng)動(dòng)態(tài)、稻瘟病菌無(wú)毒基因在地區(qū)和年份間差異情況進(jìn)報(bào)道[12?21]。【本研究切入點(diǎn)】隨著福建省主栽品種的變化,稻瘟病菌的無(wú)毒基因出現(xiàn)頻率也隨之改變,因此有必要分析稻瘟病菌近年來(lái)無(wú)毒基因年份間的動(dòng)態(tài)變化情況。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】本研究通過(guò)采集、分離2018—2020年福建省各主要稻區(qū)的稻瘟病生理小種,篩選出具有抗性頻率高、廣譜抗性的抗瘟基因,為今后根據(jù)不同地區(qū)流行菌株的無(wú)毒基因型和變化趨勢(shì)選擇培育具有相應(yīng)廣譜抗病基因的水稻品種并進(jìn)行合理布局,為提高水稻品種的抗性水平、延長(zhǎng)抗性周期、防治稻瘟病奠定基礎(chǔ)[22?27]。
24個(gè)近等基因水稻(NILs)和對(duì)照高感品種麗江新團(tuán)黑谷(LTH)由福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所田大剛轉(zhuǎn)贈(zèng)。供試的稻瘟病菌單孢分別于2018—2020年采集自福建省南平、三明、龍巖等26個(gè)水稻種植地,每年9月中下旬(中稻黃熟期)隨機(jī)采集稻瘟病發(fā)生區(qū)域的穗頸部樣本,標(biāo)明采集日期和地點(diǎn),共計(jì)樣本179份(表1)。每年分離的稻瘟病菌單孢培養(yǎng)于濾紙片上并放?20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
表1 2018—2020年福建省稻瘟病菌供試菌株Table 1 M. oryzae sample collection, 2018-2020
致病性測(cè)定方法參照陳福如等[20]的方法以及稻瘟病苗期鑒定標(biāo)準(zhǔn),病情調(diào)查方法參照辛威等[5]的方法。單個(gè)稻瘟病菌株的致病力(Pathogenic frequency,PF)、致病力類型劃分等參考楊秀娟等[21]的方法。致病力PF(%)=(感病水稻資源材料數(shù)量/所有供試水稻資源材料總數(shù))×100。當(dāng)PF≥ 70.0%時(shí)為強(qiáng)致病力,70.0%>PF≥50.0%時(shí)為較強(qiáng)致病力,50.0%>PF≥20.0%時(shí)為中等致病力,PF<20.0%時(shí)為弱致病力。
單個(gè)抗病基因的抗性頻率(Resistance frequency,RF)RF(%)=(對(duì)測(cè)試抗病基因無(wú)致病力的菌株數(shù)/所有菌株數(shù))×100。
稻瘟病菌培養(yǎng)基為淀粉培養(yǎng)基,配方:可溶性淀粉10 g,酵母膏2 g,CaCo33 g,瓊脂粉16 g,蒸餾水1 000 mL,pH6.5。
根據(jù)供試菌株對(duì)NILs的致病情況建立0-1數(shù)據(jù)庫(kù),抗病記為1,感病記為0。用IBM SPSS Statistics19數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)進(jìn)行系統(tǒng)聚類分析,對(duì)供試菌株進(jìn)行分類劃分并綜合衡量其遺傳差異大小,構(gòu)建其遺傳關(guān)系樹狀,參考劉翔[1]的方法。
供試的179個(gè)稻瘟病菌株對(duì)24個(gè)含單個(gè)抗病基因水稻品種的致病性顯示,強(qiáng)致病力菌株占比26.81%,較強(qiáng)致病力菌株占比36.31%,中等致病力菌株占比27.37%,弱致病力菌株占比9.51%,較強(qiáng)致病力菌株占優(yōu)勢(shì),說(shuō)明福建省的大多數(shù)稻瘟病菌株對(duì)供試24個(gè)抗病基因表現(xiàn)較強(qiáng)的致病力。
表2顯示,24個(gè)含單個(gè)抗病基因的近等基因系對(duì)福建省的稻瘟病菌群體的抗性頻率為19.32%~91.49%,其中Pi-z5和Pi-9(t)兩個(gè)抗病基因的抗性頻率最高,分別為91.49%和91.25%,Pi-kh和Pi-1兩個(gè)抗病基因的抗性頻率也較高,在80%~90%,Pi-7(t)、Pi-5(t)、Pi-k、Pi-12(t)等4個(gè)抗病基因的抗性頻率在70%~80%,Pi-ta和Pi-b的抗性頻率較低,低于20%。
表2 抗稻瘟病基因?qū)Ω=ㄊ〉疚敛【目剐灶l率Table 2 Effect of blast resistant genes on frequency of resistance to M. oryzae isolated in Fujain
表3中24個(gè)福建稻瘟病菌的無(wú)毒基因在2018—2020年的分布變化情況可以看出,2018—2020年24個(gè)無(wú)毒基因出現(xiàn)的總的平均頻率逐年下降,由2018年的49.57%下降至2020年的38.01%,Avr-Z5,Avr-9(t)這2個(gè)無(wú)毒基因在3個(gè)年度中出現(xiàn)的頻率都在80%以上,平均出現(xiàn)頻率分別為88.95%和87.37%,年度間變化不大且穩(wěn)定;Avr-1、Avr-kh、Avr-k、Avr-12(t)、Avr-7(t)、Avr-5(t)、Avr-3等7個(gè)無(wú)毒基因出現(xiàn)的平均頻率在50%~80%;無(wú)毒基因在2018—2020年出現(xiàn)頻率下降20%的有9個(gè),分別為Avr-kh、Avr-7(t)、Avr-5(t)、Avr-3、Avr-kp、Avr-19(t)、Avr-km、Avr-z和Avr-ks,無(wú)毒基因在2018—2020年出現(xiàn)頻率上升20%有1個(gè),Avr-20的頻率由16.67%上升至50.00%。平均出現(xiàn)頻率低于20%的3個(gè)無(wú)毒基 因?yàn)锳vr-ks、Avr-b、Avr-ta,應(yīng)用中應(yīng)謹(jǐn)慎使用。
表3 福建省稻瘟病菌無(wú)毒基因在2018-2020年間的分布Table 3 Distribution of avirulent genes of M. oryzae in Fujian, 2018-2020
表4的結(jié)果顯示,檢測(cè)的179個(gè)稻瘟病菌株分別含有0~22個(gè)數(shù)目不等的無(wú)毒基因,在數(shù)目上共出現(xiàn)了23種類型,含有6、7、8、9、11個(gè)無(wú)毒基因的病菌最多,在群體中的頻率分別為10.06%、8.94%、8.94%、7.82%和8.38%,其中含有6個(gè)無(wú)毒基因的頻率 最高。
表4 2018—2020年福建省稻瘟病菌的不同數(shù)量無(wú)毒基因出現(xiàn)頻率Table 4 Occurrence frequency of avirulent gene combinations of M. oryzae in Fujian, 2018-2020
表5的結(jié)果顯示,武夷山、松溪、邵武、浦城、光澤、建陽(yáng)、寧化、將樂(lè)和上杭等9個(gè)地區(qū)都分布有24個(gè)無(wú)毒基因,無(wú)毒基因分布數(shù)量和出現(xiàn)頻率較高為上杭(49.19%),光澤次之(48.18 %),武夷山最低(41.23%)。在各地區(qū)中出現(xiàn)頻率達(dá)到90%以上的無(wú)毒基因有6個(gè),分別為Avr-1、Avr-5、Avr-7、Avr-Z5和Avr-9、Avr-kh,其中Avr-1出現(xiàn)頻率最高的地區(qū)為寧化(94.74%),Avr-5出現(xiàn)頻率最高的地區(qū)為浦城(95.66%),Avr-Z5在武夷山、松溪、邵武、光澤、建陽(yáng)和寧化等出現(xiàn)頻率都達(dá)到了90%以上,Avr-7出現(xiàn)頻率最高的地區(qū)為邵武(98.50%),Avr-9在武夷山、邵武和上杭的出現(xiàn)頻率都達(dá)到了90%以 上,Avr-kh出現(xiàn)頻率最高的地區(qū)為將樂(lè)(90.91%)。
表5 稻瘟病菌無(wú)毒基因在福建省9個(gè)地區(qū)的分布Table 5 Distribution of M. oryzae avirulent genes in 9 regions in Fujian
利用IBM SPSS Statistics19軟件聚類分析179個(gè)菌株對(duì)24個(gè)含單個(gè)抗病基因近等基因系的鑒定結(jié)果(圖1)表明,歐式距離(Euclidean distance)越小,菌株的遺傳距離越近,在歐式距離20遺傳相似水平處,不同抗病基因?qū)Σ煌甑目垢胁町惪梢园?79個(gè)菌株劃分為7個(gè)遺傳譜系(遺傳相似組)。在7個(gè)遺傳譜系中,第Ⅰ譜系為優(yōu)勢(shì)譜系,含有124個(gè)菌株,占總數(shù)的69.27%;第Ⅱ譜系含有3個(gè)菌株;第Ⅲ譜系含有2個(gè)菌株,第Ⅳ譜系含有5個(gè)菌株,第Ⅴ譜系含有2個(gè)菌株,第Ⅵ譜系含有20個(gè)菌株,第Ⅶ譜系含有23個(gè)菌株。不同地區(qū)不同年份的菌株存在一定的遺傳相似性,但是大多數(shù)的遺傳相似程度并不與地區(qū)和年份的變化而呈現(xiàn)出很大的關(guān)聯(lián)性,例如歐式距離為1的相似菌株為4組,圖中由上至下依次為:第一組25號(hào)和75號(hào)菌株分別為2018年和2019年采集的光澤地區(qū)的稻瘟病菌單孢,第二組的57號(hào)和69號(hào)菌株分別為2018年采集的上杭地區(qū)的稻瘟病菌單孢和2018年松溪地區(qū)采集的稻瘟病菌單孢,第三組的2號(hào)和112號(hào)菌株分別為2018年采集的光澤地區(qū)的稻瘟病菌單孢和2019年建陽(yáng)地區(qū)采集的稻瘟病菌單孢,第四組的84號(hào)和99號(hào)菌株都為2019年采集的將樂(lè)地區(qū)的稻瘟病菌單孢。從譜系的結(jié)果看稻瘟病菌的無(wú)毒基因在同一地區(qū)的種群豐富,在演變上隨機(jī)性較強(qiáng)且演變速度較快。
圖1 179個(gè)稻瘟病菌菌株對(duì)24個(gè)NILs親和反應(yīng)型的聚類分析結(jié)果Fig. 1 Dendrogram on compatible response of 179 M. oryzae isolates to 24 NILs
目前國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)于無(wú)毒基因與寄主之間的作用原理提出了以下幾點(diǎn)假說(shuō):Hammone-kosack K E等認(rèn)為病原物侵染寄主時(shí),無(wú)毒基因(Avr)編碼蛋白會(huì)被寄主細(xì)胞內(nèi)對(duì)應(yīng)的抗病基因產(chǎn)物識(shí)別,信號(hào)分子將局部性侵染反應(yīng)迅速傳遞到整個(gè)植株,從而激活被侵入點(diǎn)細(xì)胞發(fā)生過(guò)敏性反應(yīng)(hypersensitive response,HR)即防衛(wèi)抗性機(jī)制,最終導(dǎo)致寄主細(xì)胞程序性死亡(PCD),病原物也因失去寄生繁殖生長(zhǎng)受到抑制[27]從而獲得系統(tǒng)性抗性(systemic acquired resistance,SAR)。Mayank等[28]提 出 保 衛(wèi) 假 說(shuō)(guard hypothesis),該假說(shuō)認(rèn)為病原物的無(wú)毒基因的毒性因子Avr蛋白先與寄主體內(nèi)相應(yīng)的毒性靶向物接觸,并結(jié)合一起形成感受信號(hào)復(fù)合體,從而啟動(dòng)防衛(wèi)基因的表達(dá)激發(fā)植株產(chǎn)生抗性。Flor[9]提出“基因?qū)颉奔僬f(shuō)(gene-for-gene hypothesis),該假說(shuō)認(rèn)為病原的無(wú)毒基因編碼特異的激發(fā)子,引起細(xì)胞程序性死亡即過(guò)敏性反應(yīng);本試驗(yàn)開展的理論基礎(chǔ)就是基于基因?qū)蚣僬f(shuō)以及稻瘟病菌與寄主水稻之間的互作效應(yīng)。
本試驗(yàn)于2018—2020年收集并分離福建省9個(gè)水稻主產(chǎn)區(qū)的中稻穗頸瘟單孢菌株179份,分別接菌鑒定24份含單個(gè)抗病基因的近等基因系。結(jié)果表明福建省較強(qiáng)致病力菌株占優(yōu)勢(shì)??共』虻目剐灶l率較高的有4個(gè),其中Pi-z5和Pi-9(t)兩個(gè)抗病基因的抗性頻率最高,分別為91.49%和91.25%,Pi-kh和Pi-1兩個(gè)抗病基因的抗性頻率在80%-90%,Pi-7(t)、Pi-5(t)、Pi-k、Pi-12(t)等4個(gè)抗病基因的抗性頻率在70%-80%,這些抗病基因在育種中可以重點(diǎn)采用。出現(xiàn)頻率低于20%的3個(gè)無(wú)毒基因Avr-ks、Avr-b、Avr-ta應(yīng)用中需注意觀察,謹(jǐn)慎使用。楊秀娟等[21]利用41個(gè)已知抗病基因水稻品種測(cè)定2003-2006年從福建省主要稻區(qū)采集分離的87個(gè)稻瘟病單胞菌株的致病性,結(jié)果表明:病菌群體對(duì)水稻抗病基因Pi-d2、Pi-k(1)、Pi-km、Pi-kh、Pi-1(1)、Pi-z5(1)、Pi-z5(2)、Pi-1(2)的毒力頻率均低于10%,提示這些抗病基因在福建省可作抗原使用;阮宏椿等[3]利用CO39近等基因系來(lái)鑒定2012-2015年間從福建省各稻區(qū)種植的普感品種麗江新團(tuán)黑谷上采集的347株稻瘟病菌單孢菌株,結(jié)果表明:Pi-km、Pi-7(t)、Pi-9(t)、Pi-kp、Pi-k、Pi-kh、Pi-z5、Pi-ta等8個(gè)抗病基因的抗病性較強(qiáng),抗譜均高于70%;本試驗(yàn)的鑒定結(jié)果與前人成果大致相同,主要區(qū)別為本研究結(jié)果中的抗病基因Pi-ta和Pi-km的抗性頻率較前人研究結(jié)果下降幅度較大,應(yīng)用時(shí)需謹(jǐn)慎,Pi-12(t)的抗性頻率有所上升,可以考慮采用,這也同時(shí)說(shuō)明隨著福建省水稻主栽品種的布局變化,稻瘟病菌的無(wú)毒基因優(yōu)勢(shì)基因型也隨之改變。因此,持續(xù)監(jiān)測(cè)近年來(lái)的稻瘟病菌無(wú)毒基因型的組成和變化是抗病育種和抗病品種布局的關(guān)鍵依據(jù)。
Pi-z5和Pi-9(t)這兩個(gè)抗病基因是本研究結(jié)果中對(duì)福建省的稻瘟病菌抗性頻率最高的。Pi9基因定位于第6號(hào)染色體上,是一個(gè)廣譜的稻瘟病抗病基因。Qu等[29]研究發(fā)現(xiàn)Pi9的cDNA全長(zhǎng)為4 009 bp,包括一段3 099 bp的編碼區(qū)和910 bp非編碼區(qū),Pi9編碼一個(gè)羧基端含有富亮氨酸重復(fù)域(LRRs)的1 032個(gè)氨基酸組成的蛋白產(chǎn)物。在水稻中,Pi9基因是組成型表達(dá),不受病原菌的誘導(dǎo)。Piz5基因也是定位在水稻第6號(hào)染色體上(又名Pi2),與Pi9基因復(fù)等位,也是一個(gè)廣譜的稻瘟病抗病基因。其最先被定位在標(biāo)記RG64和RZ612之間[30?31]。而后被精細(xì)定位在分子標(biāo)記RG64和AP22之間[32],Zhou等采用與克隆Pi9基因相同的方法克隆了Piz5基因,證明Piz5基因也屬于NBS-LRR類基因,與Pi9相同也含有2個(gè)內(nèi)含子,其cDNA全長(zhǎng)3332 bp,Piz5編碼由1個(gè)核苷酸結(jié)合位點(diǎn)(NBS)和3個(gè)富亮氨酸重復(fù)區(qū)(LRR)組成的包含1032個(gè)氨基酸的蛋白產(chǎn)物[33?37]。
本研究菌株的采樣方式為每年福建省中稻生產(chǎn)中稻瘟病發(fā)生地隨機(jī)采樣,不同于前人研究中的從單一的感病品種上采樣,隨機(jī)采樣存在如遇某地某年稻瘟病不發(fā)生則缺少樣本的情況,存在連續(xù)性不強(qiáng)的缺點(diǎn),但是隨機(jī)采樣的樣本更能反映生產(chǎn)中主栽品種上正在流行的菌株,筆者認(rèn)為隨機(jī)采樣更具有代表性。另外,稻瘟病菌群體的聚類分析結(jié)果顯示,同一地區(qū)的稻瘟病菌的菌群豐富且具有多樣性,今后應(yīng)擴(kuò)大采樣群體,加大分離稻瘟病菌單孢的數(shù)量,擴(kuò)大群體進(jìn)行研究以便得到更加完善的結(jié)論。