劉錕
摘要:天然產(chǎn)物是藥物開(kāi)發(fā)的寶庫(kù),天然產(chǎn)物分子的分子結(jié)構(gòu)研究對(duì)藥物活性與結(jié)構(gòu)修飾有重要意義。本文綜述了含有橋頭雙鍵的核心骨架的天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)特征取得的一些進(jìn)展。
關(guān)鍵詞:Anti-Bredt 規(guī)則;橋頭雙鍵;天然產(chǎn)物;
近幾十年從植物中提取到化學(xué)結(jié)構(gòu)特殊的天然產(chǎn)物分子,有較好生理活性的天然分子Taxol(紫杉醇)[1,2]、phomactins[3]、抗生素abyssomicins B–D [4]等。其化學(xué)結(jié)構(gòu)如圖1所示,這些分子不僅化學(xué)結(jié)構(gòu)獨(dú)特,而且在化學(xué)全合成也極具有挑戰(zhàn)性,主要難點(diǎn)在于構(gòu)建分子中橋頭雙鍵(Bridgehead Double Bonds)。
根據(jù)Bredt 規(guī)則[5]橋頭雙鍵是不可能存在的,橋頭雙鍵存在會(huì)引起一定的烯烴張力(olefin strain)[6]。雙鍵碳原子軌道雜化為sp2雜化屬于平面型的軌道覆蓋會(huì)對(duì)橋環(huán)施加較大的形變張力。已有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)證實(shí)天然產(chǎn)物中是存在Anti-Bredt規(guī)則[7]的橋頭雙鍵的結(jié)構(gòu)的存在,雖然在雙環(huán)分子中橋頭雙鍵X-ray圖譜不能直接看出雙鍵軌道覆蓋扭曲夾角(τ),但可以直接得到扭曲角φ1WC1C2Y和φ2 XC1C2Z,因?yàn)樵陔p環(huán)體系中的扭曲所以φ1 ≠ φ2,則扭曲夾角τ = (φ1+φ2) / 2。其橋頭雙鍵通式和軌道模型如圖2所示,
含橋頭雙鍵的天然產(chǎn)物分子的化學(xué)穩(wěn)定性與張力大小密切相關(guān),上世紀(jì)80年代,Schleyer 提出基于分子力場(chǎng)理論方法計(jì)算含有橋頭雙鍵的雙環(huán)烯烴分子的張力從而判斷分子的穩(wěn)定性 [8]。通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬將分子中成鍵原子的相互作用(Bond Stretching)、鍵角(Angle Bending)、扭曲勢(shì)能(Torsion)和非鍵作用(No-bonded interactions)計(jì)算出分子張力。他們利用MM系列分子力場(chǎng)計(jì)算出54個(gè)含有橋頭烯烴的分子[9],其實(shí)驗(yàn)結(jié)果與Fawcett提出S經(jīng)驗(yàn)值判定化學(xué)橋頭雙鍵骨架穩(wěn)定性比較吻合[8][10]。
目前有該類天然產(chǎn)物通過(guò)單晶衍射圖譜完成了分子橋頭雙鍵鍵長(zhǎng)(?)和扭轉(zhuǎn)夾角(τ)研究工作對(duì)化合物穩(wěn)定性判定和結(jié)構(gòu)鑒定有重要意義[8]。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,隨著橋頭雙鍵環(huán)系的增加橋頭烯烴的扭轉(zhuǎn)夾角在減小,說(shuō)明橋頭雙鍵的P軌道可以更好地覆蓋,繼而增加分子的穩(wěn)定性。同時(shí)在對(duì)比Taxol和crispolide[11]在同樣具有雙環(huán)[5.3.1]橋頭雙鍵核心骨架,由于雙鍵的位置異構(gòu),通過(guò)分子力場(chǎng)模擬計(jì)算結(jié)果也是不同的,如表1所示。
總結(jié) 隨著新的天然產(chǎn)物不斷發(fā)現(xiàn)和新的分離方法的應(yīng)用,一些結(jié)構(gòu)新穎的分子也被相應(yīng)的發(fā)現(xiàn),雖然利用現(xiàn)有儀器高效的完成分離和鑒定工作,但是在含有橋頭雙鍵的天然產(chǎn)物的提取分離和結(jié)構(gòu)鑒定仍然存在一定的挑戰(zhàn),主要是因?yàn)樵擃惢衔锏幕瘜W(xué)性質(zhì)較活潑而結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,容易發(fā)生氧化或者重排反應(yīng),在化學(xué)合成上也存在一定的困難。同時(shí)也期待這類天然產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)同紫杉醇(Taxol)類似優(yōu)秀的天然藥物。
參考文獻(xiàn)
G. Appendino. Nat. Prod. Rep. 1995, 12, 349 – 360.
Y.-F. Wang, Q.-W. Shi, M. Dong, H. Kiyota, Y.-C. Gu, B. Cong, Chem. Rev. 2011, 111, 7652 – 7709.
[3] J. Ciesielski, A. Frontier, Org. Prep. Proced. Int. 2014, 46, 214 – 251.
[4] H. Zhner, H.-P. Fiedler, R. D. Sussmuth. Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 116, 2628 – 2630.
[5] J. Bredt, J. Houben, P. Levy, Chem. Ber. 1902, 35, 1286–1292.
[6] D. J. Martella, M. Jones, Jr., P. v. R. Schleyer, W. F. Maier, J.Am. Chem. Soc. 1979, 101, 7634–7637.
[7] J. Bredt, Ann. Acad. Sci. Fenn. Ser. A2 1927, 29A, 3 – 22.
[8] E.H. Krenske, C.M. Williams, Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 10608 –10612.
[9] W.F. Maier ,P Schleyer. J. Am. Chem.Soc. 1981, 103, 1891- 1900.
[10] R.H. Pouwer, C.M. Williams. Angew. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 13664 – 13688.
[11] C. Zdero, F. Bohlmann, M. Mller. Phytochemistry . 1987, 26,2763 – 2775.