田小鵬 ,鄧 甜 ,董冬雪 ,祖航天 ,呂明生 *,3,王淑軍 ,3
(1.江蘇海洋大學(xué) 江蘇省海洋生物資源與環(huán)境重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 連云港222005;2.江蘇海洋大學(xué) 江蘇省海洋生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 連云港222005;3.江蘇海洋大學(xué) 江蘇省海洋生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心,江蘇 連云港 222005)
右旋糖酐是一種以α-D-吡喃葡萄糖為單體,通過葡糖苷鍵鏈接而形成的多聚糖[1]。它是由某些細(xì)菌如腸膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)、莢膜醋酸菌(Acetobacter capsulatum)等發(fā)酵將蔗糖轉(zhuǎn)化合成而得到的,主要以α-1,6-糖苷鍵鏈接,除此之外,一些支鏈還包含了α-1,3-糖苷鍵與α-1,4-糖苷鍵[2-3]。
右旋糖酐酶(EC3.2.1.11)是一類能夠?qū)R恍越到庥倚囚笑?1,6-糖苷鍵的糖苷水解酶,存在于糖苷水解酶(GH)家族49家族和66家族中,并且這兩個家族序列間沒有同源性[4-5]。一般根據(jù)催化位點(diǎn)不同將右旋糖酐酶分為內(nèi)切型右旋糖酐酶(Endodextranase)以及外切型右旋糖酐酶(Exodextranase)[1]。外切型右旋糖酐酶主要切割右旋糖酐鏈的非還原端的α-1,6-糖苷鍵,產(chǎn)生葡萄糖。內(nèi)切型右旋糖酐酶主要從右旋糖酐的內(nèi)部切割α-1,6-糖苷鍵,產(chǎn)生葡萄糖、異麥芽糖以及一系列低聚異麥芽糖[1,6]。目前所報(bào)道的右旋糖酐酶主要為內(nèi)切型右旋糖酐酶。絕大多數(shù)內(nèi)切型右旋糖酐酶只有在具有多個連貫的α-1,6-糖苷鍵存在時才能發(fā)揮水解作用[7]。
右旋糖酐酶在食品、化工以及醫(yī)藥等領(lǐng)域都有著非常廣泛的應(yīng)用[8],且主要來源于微生物,其產(chǎn)生菌種類繁多,主要分為真菌類與細(xì)菌類[6]。真菌所產(chǎn)生的右旋糖酐酶活性較高,穩(wěn)定性較好,被廣泛應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)中[9]。但是,許多真菌如霉菌,除了少數(shù)已經(jīng)通過食藥安全認(rèn)證外,絕大多數(shù)的霉菌在發(fā)酵過程中還會伴隨著復(fù)雜的次級代謝產(chǎn)物的產(chǎn)生,因而存在安全隱患,從而限制了它們的應(yīng)用,尤其是在醫(yī)藥、食品等領(lǐng)域[6,10]。相較于真菌,細(xì)菌的生長繁殖速度快,發(fā)酵時間短,產(chǎn)酶效率高。但是,來源于細(xì)菌的右旋糖酐酶普遍酶活較低,穩(wěn)定性較差[6]。已有一些研究者將目光轉(zhuǎn)向了海洋細(xì)菌,海洋環(huán)境孕育著豐富的微生物資源,由于海洋環(huán)境的特殊性,來源于海洋微生物的右旋糖酐酶通常具有耐鹽、耐堿、耐低溫等特性,在工業(yè)生產(chǎn)中有很大的應(yīng)用前景[11-12]。
為了擴(kuò)大海洋微生物右旋糖酐酶的應(yīng)用價值,提高其利用率,作者以產(chǎn)右旋糖酐酶的海洋細(xì)菌Catenovulum sp.DP03為材料,完成了其全基因組測序,比較分析了來源于該菌株的兩種右旋糖酐酶的性質(zhì)及其水解右旋糖酐的產(chǎn)物,為海洋微生物的右旋糖酐酶的克隆表達(dá)與應(yīng)用提供一定理論依據(jù)。
1.1.1 培養(yǎng)基
1)2216 E培養(yǎng)基 酵母粉1 g/L,魚粉蛋白胨5 g/L,陳海水配制;pH 7.8;
2)LB培養(yǎng)基 酵母粉5 g/L,胰蛋白胨10 g/L,NaCl 5 g/L,蒸餾水配制;pH 7.4。
1.1.2 菌株與試劑
1)菌株 Catenovulum sp.DP03菌株:作者所在實(shí)驗(yàn)室從海洋環(huán)境中篩選得到并保存[13];大腸桿菌DH5α與大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞:購買自全式金生物科技有限公司;大腸桿菌pET29a:作者所在實(shí)驗(yàn)室保存。
2)試劑 DNA marker10000:購自 Takara-寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司;BCA蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度測定試劑盒、細(xì)菌基因組提取試劑盒、高純度質(zhì)粒小提試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒:購自生工生物工程(上海)有限公司;Taq Plus DNA polymerase、限制性核酸內(nèi)切酶Not I與Bgl II:購自NEB(北京)有限公司;其他試劑:分析純,購自國藥化學(xué)試劑有限公司。
1.2.1 Catenovulum sp.DP03基因組提取與全基因組測序 將保存于甘油管中的菌Catenovulum sp.DP03在2216E培養(yǎng)基中活化后,使用細(xì)菌基因組提取試劑盒提取菌株的基因組,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測后送至生工生物工程(上海)有限公司進(jìn)行全基因組測序,分析測序結(jié)果,根據(jù)基因注釋結(jié)果挖掘出其右旋糖酐酶基因序列及蛋白質(zhì)序列,并對該右旋糖酐酶的蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。
1.2.2 右旋糖酐酶基因克隆 根據(jù)右旋糖酐酶基因序列設(shè)計(jì)如下引物(表1),并使用Taq Plus DNA polymerase聚合酶連鎖式反應(yīng) (PCR)擴(kuò)增目的基因;使用瓊脂糖凝膠檢測并回收目的基因;使用限制性核酸內(nèi)切酶Not I與Bgl II同時酶切目的基因與pET29a質(zhì)粒,瓊脂糖凝膠回收目的基因與pET29a;使用Solution I將目的基因與載體pET29a連接后轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,37℃過夜培養(yǎng)后挑選出陽性克隆,送生工生物工程(上海)有限公司測序以驗(yàn)證克隆子的正確性。
表1 引物Table 1 Primers
1.2.3 重組右旋糖酐酶的表達(dá) 使用高純度質(zhì)粒提取試劑盒提取重組質(zhì)粒,取1 μL重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌 BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,37℃過夜培養(yǎng)后挑單菌落于含50 μg/mL卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min培養(yǎng)6~8 h,使菌體OD600=0.6~0.8,然后按2%接種體積分?jǐn)?shù)接種于100 mL含50 μg/mL卡那霉素的新 LB液體培養(yǎng)基中,在37 ℃、180 r/min 培養(yǎng) 4~6 h,使菌體 OD600=0.6~0.8,然后加入終濃度為0.5 mmol/L異丙基-β-D-硫代半乳 糖 苷 (Isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside,IPTG),置于18℃、180 r/min誘導(dǎo)表達(dá)24 h后,離心收集細(xì)胞,使用磷酸緩沖鹽溶液(phosphate buffer saline,PBS)清洗細(xì)胞3次后加入10 mL PBS緩沖液懸浮細(xì)胞,使用超聲波細(xì)胞破碎儀破碎細(xì)胞壁,得到重組右旋糖酐酶粗酶液。
1.2.4 重組右旋糖酐酶的純化 根據(jù)重組右旋糖酐酶所帶的His標(biāo)簽,使用鎳柱親和層析的方法對粗酶液進(jìn)行純化,分別使用含 20、50、70、100、150、200、250 mmol/L咪唑的磷酸鹽緩沖液 (50 mmol/L NaH2PO4,300 mmol/L NaCl,咪唑,使用 NaOH 溶液調(diào)節(jié)pH至8,并使用0.22 μm濾膜過濾除菌)梯度洗脫,并收集洗脫液,然后使用8 g/dL SDS-PAGE電泳檢測純化效果,并使用BCA蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度測定試劑盒測定粗酶液及各洗脫液的蛋白質(zhì)質(zhì)量濃度,同時使用DNS法測定其右旋糖酐酶活力。
1.2.5 右旋糖酐酶活力測定 使用DNS法測定右旋糖酐酶酶活力,方法如下:在一定的溫度與pH條件下,將20 μL酶液與180 μL質(zhì)量分?jǐn)?shù)3%右旋糖酐T70反應(yīng)一定時間后,在反應(yīng)體系中加入200 μL DNS終止反應(yīng),沸水浴5 min,加入3 mL蒸餾水進(jìn)行稀釋,取200 μL于96孔板中,使用酶標(biāo)儀讀取540 nm處的吸光值,測定其還原糖生成量(以不同質(zhì)量濃度葡萄糖做標(biāo)準(zhǔn)曲線)。以先加入DNS終止反應(yīng)后再加入酶液作為對照組,其他與實(shí)驗(yàn)組相同。酶活力單位定義(U)為上述反應(yīng)條件下,每分鐘釋放 1 μmoL葡萄糖所需的酶量[14]。
1.2.6 重組右旋糖酐酶最適催化溫度及pH 以3%右旋糖酐 T70(pH 7)為底物,分別在 20、25、30、35、40、45、50℃下測定重組右旋糖酐酶活力,并計(jì)算其酶活力。然后分別配制50 mmol/L不同pH(乙酸-乙酸鈉,pH 4.0~5.0; 磷酸鹽,pH 6.0~7.5;Tris-HCl,pH 8.0~9.0; 碳酸鈉-碳酸氫鈉緩沖液:pH 10)的緩沖液,然后用不同緩沖液配制3%右旋糖酐T70為底物,分別在最適溫度下測定右旋糖酐酶活力,并計(jì)算其酶活力。所有試驗(yàn)均設(shè)3個平行。
1.2.7 重組右旋糖酐酶水解右旋糖酐產(chǎn)物分析將重組右旋糖酐酶Cadex2870和Cadex2872與3%右旋糖酐T70(pH 7)分別在45℃和30℃下反應(yīng)0.5、2、6、24 h,沸水浴 1 min 滅活,然后 1 000 r/min離心1 min,取上清液用0.22 μm濾膜過濾。首先,各取0.5 μL反應(yīng)液進(jìn)行薄層層析(TLC)分析該右旋糖酐酶水解右旋糖酐T70產(chǎn)物,展開劑為:5 mL正丙醇、2 mL乙酸乙酯、8 mL乙腈、1 mL乙酸、4.5 mL去離子水;顯色劑為:0.2 g地衣酚、10 mL濃硫酸、80 mL無水乙醇、10 mL去離子水;85℃下顯色5 min。其次,使用高效液相色譜(HPLC)分析2 h與6 h的產(chǎn)物,以葡萄糖、麥芽糖、麥芽三糖、麥芽四糖、麥芽五糖、麥芽六糖以及麥芽七糖標(biāo)準(zhǔn)品為對照。色譜條件:色譜柱為Waters sugar-Pak1(300 mm×6.5 mm),流動相為去離子水,流速為0.4 mL/min,柱溫為75℃,進(jìn)樣量為20 μL。使用Empower GPC軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)采集和處理,計(jì)算各產(chǎn)物的峰面積。
通過Illumina Hiseq4000平臺測序,Catenovulum sp.DP03基因組基本信息見表2?;跍y序數(shù)據(jù)組裝得到樣品DP03基因組大小為4 417 646 bp,GC含量40.95%,共231個拼接,451個重疊群?;蚪M組分分析后發(fā)現(xiàn),樣品DP03的基因組含有3 801個基因,總長度為3 881 685 bp,平均長度1 021 bp,占基因組全長的88.50%?;蚪M串聯(lián)重復(fù)序列共144個,總長度為16 943 bp,占基因組全長的0.3863%。小衛(wèi)星序列76個,微衛(wèi)星序列27個,tRNA 60個,rRNA 2個。
表2 Catenovulum sp.DP03基因組信息統(tǒng)計(jì)Table 2 Information of Catenovulum sp.DP03 DNA
經(jīng)碳水化合物酶專門數(shù)據(jù)庫 (Carbohydrate-Active enZYmes Database,CAZy) 數(shù)據(jù)庫分析,Catenovulum sp.DP03基因組中含有糖苷水解酶131個,占比42.1%,包括α-木聚糖酶、α-葡糖苷酶、阿拉伯糖苷酶、聚半乳糖醛酸酶、β-半乳糖苷酶、蔗糖磷酸化酶、1,4-α-葡聚糖分支酶 GlgB、淀粉蔗糖酶、α-淀粉酶、果聚糖酶以及右旋糖酐酶等。糖苷轉(zhuǎn)移酶57個,糖水化合物脂酶51個,碳水化合物結(jié)合模塊45個,多糖裂解酶14個,以及輔助模塊的酶13個,見圖1。
圖1 Catenovulum sp.DP03基因功能注釋CAZy圖Fig.1 Gene function annotation by CAZy of Catenovulum sp.DP03
根據(jù)基因組注釋結(jié)果,Catenovulum sp.DP03中含有兩個右旋糖酐酶基因,基因編號分別為GL002870與GL002872(對應(yīng)編碼的蛋白質(zhì)分別稱為 Cadex2870與 Cadex2872)。如表3所示,GL002870基因大小為2 511 bp,GL002872基因大小為2 805 bp,分別編碼836個氨基酸與935個氨基酸,蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量大小分別為92 100與103 200,等電點(diǎn)分別為pI 4.43與pI 4.33,酸性氨基酸殘基總數(shù)分別為104與106,堿性氨基酸殘基總數(shù)分別為52與46,疏水性總平均值(GRAVYA)分別為-0.416與-0.377,所以這兩種蛋白質(zhì)均為酸性、親水性蛋白質(zhì)。根據(jù)SOPMA對其二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測,在Cadex2870的二級結(jié)構(gòu)中,9.45%為α螺旋結(jié)構(gòu) (Alpha helix,h),32.30%為擴(kuò)展長鏈(Extended strand,e),6.82% 為β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)(Beta turn,t),51.44%為無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu);在Cadex2872的二級結(jié)構(gòu)中,8.02%為α螺旋結(jié)構(gòu),32.73%為擴(kuò)展長鏈,6.20%為β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),53.05%為無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)。Cadex2870與Cadex2872都屬于糖苷水解酶GH49家族。Cadex2870與Cadex2872的蛋白質(zhì)序列與已報(bào)道的右旋糖酐酶蛋白質(zhì)序列相似度比較低。在構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,Cadex2870與Cadex2872聚為一支,然后與Cellvibrio sp.KY-YJ-3(WP 151055493.1)聚為一支,Cadex2870和Cadex2872序列與其序列相似性分別為49.6%和47.9%,見圖2。
表3 Cadex2870與Cadex2872生物信息學(xué)分析Table 3 BioinformaticsanalysisofCadex2870 and Cadex2872
圖2 Cadex2870與Cadex2872系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of Cadex2870 and Cadex2872
使用 SWISS-MODLE以 AoDex(Arthrobacter oxidans KQ11)為模板進(jìn)行三維同源建模,Cadex2870與Cadex2872的整體結(jié)構(gòu)與AoDex的結(jié)構(gòu)整體相似,其相似性分別為54.53%與53.66%,但是在一些片層與環(huán)區(qū)中仍存在一些差異,見圖3,其氨基酸序列比對結(jié)果見圖4。
圖3 右旋糖苷酶Cadex2870和Cadex2872同源建模與Aodex的結(jié)構(gòu)比較Fig.3 Comparison between Aodex and Cadex2870/Cadex2872
圖4 Cadex2870、Cadex2872與Aodex氨基酸序列比對Fig.4 Sequences blast of Cadex2870,Cadex2872 and Aodex amino
根據(jù)重組右旋糖酐酶所帶的His標(biāo)簽,經(jīng)鎳柱親和層析純化后,測其不同梯度洗脫液中的蛋白質(zhì)濃度與右旋糖酐酶活力,并進(jìn)行8 g/dL的SDSPAGE電泳檢測,結(jié)果見圖5。其相對分子質(zhì)量大小與經(jīng)氨基酸序列推測出的相對分子質(zhì)量大小一致。在鎳柱純化過程中,低濃度咪唑(20~70 mmol/L)能洗脫出非特異性結(jié)合蛋白質(zhì);而目的蛋白質(zhì)需要高濃度的咪唑(150~250 mmol/L)才能被洗脫下來。重組右旋糖酐酶Cadex2870與Cadex2872經(jīng)鎳柱純化之后分別被純化了20.5倍與9.7倍,得率分別為76.7%與62.8%,純化之后右旋糖酐酶活力分別為16.2 U/mg 與 4.0 U/mg,見表4。
圖5 重組右旋糖酐酶Cadex2870(a)和Cadex2872(c)經(jīng)鎳柱純化的電泳圖以及不同濃度咪唑洗脫與蛋白質(zhì)濃度和酶活力Cadex2870(b)和 Cadex2872(d)的關(guān)系Fig.5 Purification of the recombinant dextranase Cadex2870 (a)and Cadex2872 (c)by Ni-column and the relationship between concentration of imidazole with protein and activity of dextranase Cadex2870(b)and Cadex2872(d)
表4 重組右旋糖酐酶的純化Table 4 Purification of recombinant dextranase
如圖6(a)所示,Cadex2870的最適催化溫度為45℃,Cadex2872的最適催化溫度為30℃,在35~50℃范圍內(nèi),Cadex2870的活性要高于Cadex2872的活性;在20~30℃范圍內(nèi),Cadex2872的活性高于Cadex2870 的活性。 如圖 6(b)所示,Cadex2870 與Cadex2872的最適催化pH分別為8和7,并且在pH 6~9范圍內(nèi)都具有良好的催化效率,而Cadex2872催化范圍相比于Cadex2870的催化范圍較廣,并且在較酸/堿性條件下催化效率要高于Cadex2870。
圖6 溫度(a)以及pH(b)對酶活性的影響Fig.6 Effect of temperature(a) and pH(b) on dextranase
如圖7和表5所示,重組右旋糖酐酶Cadex2870與Cadex2872水解右旋糖酐T70的產(chǎn)物主要為異麥芽七糖、異麥芽五糖以及異麥芽四糖,其中,當(dāng)水解時間延長時,Cadex2870水解右旋糖酐的產(chǎn)物還伴隨有少量的異麥芽糖產(chǎn)生,并且異麥芽四糖的量要高于其他寡糖的量。
圖7 重組右旋糖酐酶水解右旋糖酐T70產(chǎn)物分析Fig.7 Products analysis of recombinant dextranases hydrolyzed dextran T70
表5 重組右旋糖酐酶水解右旋糖酐T70產(chǎn)物質(zhì)量分?jǐn)?shù)Table 5 Content of sugar in hydrolysates after enzymatic hydrolysis of dextran by recombinant dextranase
對海洋細(xì)菌Catenovulum sp.DP03的全基因組進(jìn)行了測序,從其基因組中挖掘到兩個右旋糖酐酶基因。目前,已有少數(shù)的右旋糖酐酶的蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)已被成功解析,并上傳至Protein Date Bank(PDB)數(shù)據(jù)庫中,包括來源于Streptococcus mutans的右旋糖酐酶SmDex[15]、Thermoanaerobacter pseudethanolicus的右旋糖酐酶 TpDex[16]、Penicillium minioluteum的右旋糖酐酶Dex49A[4]以及海洋細(xì)菌Arthrobacter oxydans KQ11的右旋糖酐酶AoDex[17]。以海洋細(xì)菌A.oxydans KQ11的右旋糖酐酶AoDex為模板進(jìn)行三維同源建模,Cadex2870與Cadex2872的整體結(jié)構(gòu)與AoDex的結(jié)構(gòu)整體相似,在其N端與C端各有一個結(jié)構(gòu)域,AoDex的催化區(qū)域?yàn)镼418-D440,分別對應(yīng) Cadex2870的 Q431-D453以及Cadex2872的Q425-D447,且在催化位點(diǎn)處具有高度保守性;AoDex中的Asp439與Asp420分別為催化酸和堿,分別對應(yīng)Cadex2870的Asp433和Asp452,以及Cadex2872的Asp427和Asp446(圖4,紅色虛線方框內(nèi))。
Cadex2870的最適催化溫度為45℃,Cadex2872的最適催化溫度為30℃,在低溫下,Cadex2872催化效率更高,這與一些冷適應(yīng)性酶性質(zhì)相似,例如冷適應(yīng)的β-卡拉膠酶、冷適應(yīng)的β-葡萄糖苷酶以及冷適應(yīng)的β-淀粉酶等等,他們在低溫下具有更高的活性[18-20]。Cadex2870與Cadex2872的最適催化pH分別為8和7,并且在pH 6~9范圍內(nèi)都具有良好的催化效率,而Cadex2872催化范圍相比于Cadex2870的催化范圍較廣,并且在較酸/堿性條件下催化效率要高于Cadex2870。陸源微生物所產(chǎn)的右旋糖酐酶絕大多數(shù)最適催化溫度都在45~65℃,最適催化pH在5.0~6.5,并且在低溫條件下催化效率較低[21-24]。該兩種重組右旋糖酐酶在較低溫度下有更高的活性,并且pH作用范圍廣,因此,該酶在工業(yè)應(yīng)用中具有更高的價值。例如,在低溫或者室溫條件下的生產(chǎn)過程中,無須加熱或者冷卻,從而降低生產(chǎn)的成本;還可通過溫和的熱處理使酶失活,從而快速終止反應(yīng)[25]。另外,該酶的最適作用溫度與pH條件接近人的口腔環(huán)境,將該酶作為口腔牙菌斑的防治藥物具有潛在價值。并且越來越多的證據(jù)表明,堿的產(chǎn)生在pH穩(wěn)態(tài)中起著重要作用,pH穩(wěn)態(tài)可能調(diào)節(jié)齲病的發(fā)生和發(fā)展[26-27]。因此,該右旋糖酐酶在用于開發(fā)新的海洋藥物來治療這種情況具有重要意義。
Cadex2870與Cadex2872水解右旋糖酐T70的產(chǎn)物主要為異麥芽七糖、異麥芽五糖以及異麥芽四糖,當(dāng)水解時間延長時,Cadex2870水解右旋糖酐的產(chǎn)物還伴隨有少量的異麥芽糖產(chǎn)生,該兩種重組右旋糖酐酶與目前所報(bào)道的絕大多數(shù)右旋糖酐酶的性質(zhì)相似,他們催化水解右旋糖酐主要產(chǎn)生異麥芽寡糖,而葡萄糖的含量很低或者沒有,這類右旋糖酐酶被鑒定為內(nèi)切型右旋糖酐酶,他們從右旋糖酐的內(nèi)部水解α-1,6-糖苷鍵[28-32]。目前所報(bào)道的右旋糖酐酶絕大多數(shù)都屬于內(nèi)切型右旋糖酐酶,其能夠水解右旋糖酐產(chǎn)生異麥芽寡糖,具有很好的應(yīng)用價值。異麥芽寡糖不會被人體和動物消化吸收,但是能夠被腸道的有益微生物雙歧桿菌所利用,促使雙歧桿菌增殖,但腸道內(nèi)其他有害微生物如大腸桿菌、金色葡萄球菌則不能利用此糖,從而抑制了腸道有害微生物的生長,使腸道內(nèi)微生態(tài)向良性循環(huán)調(diào)整。如維持腸道正常細(xì)菌群平衡,抑制病原菌與腐敗菌生長,維持腸道正常功能;降低膽固醇水平,防治高血壓;增強(qiáng)人體免疫功能;雙歧桿菌還具有抗腫瘤活性[33-35]。異麥芽寡糖還具有甜度低、難以被胃酶消化,不會改變血液中胰島素水平,也不會增加血糖等特點(diǎn),所以糖尿病患者可放心食用[33,36]。除此之外,異麥芽寡糖不會被口腔鏈球菌利用,因而能夠防止齲齒[32-33]。因此,利用該兩種重組右旋糖酐酶水解右旋糖酐產(chǎn)生一系列異麥芽寡糖,在生產(chǎn)益生元等功能性食品方面具有很好的前景。
從海洋細(xì)菌Catenovulum sp.DP03的全基因組中挖掘出兩個右旋糖酐酶基因,其中GL002870基因大小為2 511 bp,編碼836個氨基酸,蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量大小為 92 100,等電點(diǎn)為 pI 4.43;GL002872基因大小為2 805 bp,編碼935個氨基酸,蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量大小為103 200,等電點(diǎn)為pI 4.33,都屬于酸性、親水性蛋白質(zhì)。在Cadex2870的二級結(jié)構(gòu)中,9.45%為α螺旋結(jié)構(gòu),32.30%為擴(kuò)展長鏈,6.82%為β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),51.44%為無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu);在Cadex2872的二級結(jié)構(gòu)中,8.02%為α螺旋結(jié)構(gòu),32.73%為擴(kuò)展長鏈,6.20%為 β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),53.05%為無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)。Cadex2870與Cadex2872都屬于糖苷水解酶GH49家族,在系統(tǒng)發(fā)育樹中,Cadex2870與Cadex2872聚為一支,然后與Cellvibrio sp.KY-YJ-3聚為一支。Cadex2870與Cadex2872的3D結(jié)構(gòu)與AoDex的結(jié)構(gòu)整體相似,其相似性分別為54.53%與53.66%,AoDex的催化區(qū)域?yàn)镼418-D440,分別對應(yīng)Cadex2870的Q431-D453以及Cadex2870的Q425-D447,且在催化位點(diǎn)處具有高度保守性。將Cadex2870與Cadex2872基因克隆表達(dá)后,得到純化的Cadex2870的酶活力為16.2 U/mg,Cadex2872的酶活力為4 U/mg,分別被純化了20.5與9.7倍,得率分別為76.7%與62.8%。Cadex2870與Cadex2872的最適催化溫度分別為45℃與30℃,最適催化pH分別為7和8;Cadex2870水解右旋糖酐的產(chǎn)物為異麥芽七糖、異麥芽五糖、異麥芽四糖以及少量異麥芽糖;Cadex2872水解右旋糖酐的產(chǎn)物為異麥芽七糖、異麥芽五糖以及異麥芽四糖,所以,這兩種右旋糖酐酶均屬于內(nèi)切型右旋糖酐酶。