鄭甌翔,夏雷
溫州市公安局刑事科學技術研究所,浙江 溫州 325000
本實驗室在人員建庫工作中,通過對32 000余份無關個體樣本進行常染色體檢驗,發(fā)現(xiàn)2 例D12S391基因座具有四等位基因現(xiàn)象,發(fā)生率約為0.006 25%。為驗證該樣本檢驗的準確性及探究四等位基因形成的原因,本實驗室對其進行了復核檢驗。
采用直接擴增法進行DNA擴增。
分別采用華夏TM白金PCR 擴增試劑盒(美國Applied Biosystems 公司),人類STRtyper-21G 擴增熒光檢測試劑盒、SureID? PanGlobal 人類DNA 身份鑒定試劑盒(寧波海爾施公司),在9700型PCR 儀(美國Applied Biosystems 公司)上按各試劑盒說明書進行STR復合擴增,擴增體系為10μL,擴增產(chǎn)物應用3500xL基因分析儀(美國Applied Biosystems 公司)進行檢測,并使用GeneMapperTMID-X軟件(美國Applied Bio?systems公司)進行分型。
首次采用華夏TM白金PCR 擴增試劑盒進行擴增,結(jié)果顯示,除D12S391基因座表現(xiàn)為四等位基因外,其余基因座均表現(xiàn)為正常分型。1號樣本D12S391基因座基因型依次為19,21,22,23,峰高比約為1∶1∶1∶1(圖1);2 號樣本D12S391基因座基因型依次為16,21,22,23,峰高比約為1∶1∶1∶1(圖2)。
圖1 1號樣本采用華夏TM白金PCR擴增試劑盒的擴增結(jié)果Fig.1 The amplification results of sample 1 with HuaxiaTM Platinum PCR Amplification Kit
圖2 2號樣本采用華夏TM白金PCR擴增試劑盒的擴增結(jié)果Fig.2 The amplification results of sample 2 with HuaxiaTM Platinum PCR Amplification Kit
隨后分別采用人類STRtyper-21G 擴增熒光檢測試劑盒、SureID? PanGlobal 人類DNA 身份鑒定試劑盒進行復核,結(jié)果一致。
目前,國內(nèi)外法庭科學中個體識別、親子鑒定主要采用STR 分型方法。正常人常染色體單個STR 基因座只有2 個等位基因,純合子個體圖譜表現(xiàn)為只有1 個峰或1 條帶,而雜合子個體圖譜表現(xiàn)為2 個峰或2 條帶,也有報道[1-3]稱個別基因座檢出3 個峰或3 條帶。四等位基因是指個體圖譜單個STR 基因座表現(xiàn)為4個峰或4條帶,并且通過不同試劑盒驗證,可以得到確認,情況極為罕見。本文涉及的2 個樣本在分別采用華夏TM白金PCR擴增試劑盒、人類STRtyper-21G擴增熒光檢測試劑盒、SureID? PanGlobal 人類DNA身份鑒定試劑盒復合擴增后,在D12S391基因座檢出相同的基因型,且除D12S391基因座表現(xiàn)為四等位基因外,其余基因座均表現(xiàn)為正常分型,可以排除樣本污染、實驗室污染、PCR 擴增異常、熒光燃料污染、Pull-up 峰、某基因座過大或過小的off-ladder(OL)等位基因落在了相鄰基因座范圍內(nèi)[4-5]以及試劑盒引物設計等因素。在確定樣本為單一來源的情況下,某個STR 基因座檢出多等位基因,這種拷貝數(shù)變異(copy number variation,CNV)現(xiàn)象產(chǎn)生的原因是由于樣本中存在多余的染色體片段,采用PCR 引物擴增時產(chǎn)生了額外的PCR 擴增片段[6]。多等位基因的形成機制尚不明確,可能是由于遺傳因素,如染色體在減數(shù)分裂時出現(xiàn)不等價交換,或有絲分裂時異常分離導致三體綜合征、體細胞突變,或受精卵發(fā)育階段,染色體不分離產(chǎn)生嵌合體等,也可能是骨髓移植后形成了嵌合體。而根據(jù)遺傳學發(fā)育特征及D12S391基因座所在的染色體的特點,推測本文2 例樣本出現(xiàn)四等位基因的原因可能是局部基因重復,具體需要進一步開展基因座測序才可明確。關于峰高,本文2例在D12S391基因座中形成的4 個峰的峰高比均為1∶1∶1∶1,推測應該是該基因座的引物區(qū)存在相鄰的結(jié)合位點,且實現(xiàn)了均衡擴增。
在個體識別或親子鑒定中,四等位基因可能導致錯誤判斷,因此,出現(xiàn)基因座分型異常時應引起重視,使用多種試劑盒、多個基因座分型進行復核確認,排除各種因素的干擾和影響,降低錯誤分析的風險,確保鑒定意見的準確性,同時,可以考慮將四等位基因座作為特征基因座在個體識別中加以應用。