李文仿 龍彬彬 姚方輝 趙宗彬 張華
近年來,乳腺癌的發(fā)病率呈上升趨勢,已位居女性惡性腫瘤的首位[1]。闡明乳腺癌發(fā)生發(fā)展的分子生物學(xué)機制對提高其診治水平具有一定意義[2]。N6—甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修飾RNA是近期腫瘤進展研究的熱點。m6A修飾是真核生物mRNA常見的甲基化修飾,參與真核生物mRNA的運輸、剪切、翻譯等過程[3-4]。m6A修飾通過甲基化酶、去甲基化酶及甲基化識別酶等調(diào)控mRNA甲基化,參與膀胱癌、胃癌等惡性腫瘤進展[5-6]。去甲基化酶AlkB同源蛋白5(AlkB homologue 5,ALKBH5)與甲基化轉(zhuǎn)移酶14(METTL14)、Wilms瘤相關(guān)蛋白(Wilms tumor 1 associated protein,WTAP)形成mRNA甲基化修飾復(fù)合體,是mRNA的m6A甲基化修飾主要調(diào)控單位,通過調(diào)控腫瘤基因表達,在惡性腫瘤進展中發(fā)揮作用[7]。本研究主要探討乳腺癌組織中ALKBH5的表達及臨床意義。
1.1 臨床資料 收集2017年5月至2018年9月在本院進行乳腺癌手術(shù)切除石蠟標(biāo)本90例,乳腺增生組織石蠟標(biāo)本20例,以及相應(yīng)乳腺癌患者的臨床資料、免疫組化指標(biāo)、病理檢查結(jié)果等。
1.2 siRNA轉(zhuǎn)染 轉(zhuǎn)染試劑Lipofection2000,購自Invitrogen。ALKBH5 siRNA序列由上海生工合成,序列為siRNA1:5′-GCAGC AAGGCAGTCT TTA AGT-3′,無 效 干擾RNA沒有相應(yīng)的mRNA作用靶點(siRNA NC),序列為5′-UUCUCCGAACGUG UCACGU-3′。ALKBH5的siRNA按照轉(zhuǎn)染Lipofection2000說明,轉(zhuǎn)染乳腺癌細(xì)胞MDA-MB231。
1.3 RNA提取 收集細(xì)胞并裂解,每6 cm培養(yǎng)板的細(xì)胞中加入1 mL Trizol溶液,將細(xì)胞轉(zhuǎn)移到無RNA酶離心管中。抽提:加入1/5體積的三氯甲烷,劇烈震蕩1 min,充分混合后,室溫靜置 3 min;37 ℃,12 000 r/min離心10 min;將上層RNA層轉(zhuǎn)移至新的無RNA 酶離心管。沉淀:加入等體積異丙醇,混勻,室溫靜置10 min;4 ℃,12 000 r/min離心10 min,可在底部觀察到沉淀的RNA,棄上清保留沉淀。洗滌:輕輕加入1 mL現(xiàn)用現(xiàn)配的75%乙醇,上下顛倒洗滌沉淀及管壁;4 ℃,12 000 r/min離心5 min,棄上清保留沉淀,室溫干燥。溶解:加入適量的DEPC處理水,溶解RNA;測量RNA濃度,用瓊脂糖凝膠電泳檢驗所提RNA。
1.4 RT-PCR Prime 5.0軟件設(shè)計并經(jīng)過Blast檢測,引物序列如下:GAPDH:5′-ACCCAGAAGACTGTGGGGATGG-3′,5′-TCTAGAC GGCAGGTCAGGTC-3′;ALKBH5的 引物 序 列 為:5′-CGGCGAAGG CTACACACT TACG-3′,5′-CCACCAGCTTTTGGATCACCA - 3′。qRT-PCR:取1μg的RNA模板,設(shè)置RT反應(yīng)程序為42 ℃、60 min,70 ℃、10 min。Q-PCR反應(yīng)以Bio-Rad CFX96儀進行擴增,條件如下:預(yù)變性采用95 ℃條件下作用30 s,循環(huán)1次;循環(huán)擴增次數(shù)為38次,95 ℃下作用10 s,60 ℃作用20 s,最后70 ℃延伸10 s。
1.5 MTT實驗 10%血清培養(yǎng)細(xì)胞,以每孔1000個細(xì)胞接種96孔板,每孔體積200 μL,培養(yǎng)3天,每孔加入MTT溶液(5 mg/mL,用PBS配置,PH值為7.4)20 μL,繼續(xù)孵育4 h,小心吸棄培養(yǎng)液上清。每孔加入150 μL DMSO,震蕩10 min,使結(jié)晶物充分溶解。選擇490 nm波長,在酶聯(lián)免疫監(jiān)測儀上測定各孔吸光值,以時間為橫坐標(biāo),吸光值為縱坐標(biāo),繪制細(xì)胞生長曲線圖。
1.6 免疫組化法 取4μL厚石蠟切片二甲苯脫蠟,加熱枸櫞酸鈉溶液抗原修復(fù)液至98 ℃,持續(xù)15 min修復(fù)抗原,內(nèi)源性抗原封閉采用山羊血清工作液15 min。兔抗人ALKBH5單克隆抗體(1:100)4 ℃過夜,生物素化二抗37 ℃孵育20 min,加入顯色溶液顯色[8]。蘇木素復(fù)染1 min,60 ℃烤片3 h,脫水,透明,中性樹膠封片。染色結(jié)果采用半定量方法評估染色結(jié)果,“-”代表無染色,“+”代表<25%染色,“++”代表25%~50%細(xì)胞染色,“+++”代表>50%細(xì)胞染色?!?、+”代表陰性,“++、+++”代表陽性。
1.7 Western Blot法 采用RIPA裂解緩沖液(50 mM Tris-HCl,pH 7.4,150 mM NaCl,1%脫氧膽酸鈉,1%Triton X-100,0.1%SDS;上海碧云天生物技術(shù)有限公司)裂解細(xì)胞。全蛋白以每孔50μg上樣進行SDS-PAGE電泳。采用PBS稀釋相應(yīng)一抗至1:1000濃度,于37 ℃搖床上孵育過夜,HRP標(biāo)記的二抗繼續(xù)孵育300 min。通過ECL試劑在用化學(xué)圖像發(fā)光系統(tǒng)檢測蛋白表達。
1.8 細(xì)胞克隆實驗 MDA-MB231細(xì)胞常規(guī)消化并計數(shù),將細(xì)胞以500個/孔接種于6孔板中,輕輕晃動培養(yǎng)板使細(xì)胞分散均勻,37 ℃細(xì)胞孵箱培養(yǎng)。每4~5天換液1次,培養(yǎng)10天。吸凈培養(yǎng)板中的培養(yǎng)基,用PBS溶液清洗2次,4%多聚甲醛固定30 min,然后用0.1%結(jié)晶紫溶液2 mL染色20 min。PBS清洗3次以上,自然風(fēng)干。以>50個細(xì)胞計為1個克隆,克隆形成率=(陽性克隆數(shù)/接種細(xì)胞數(shù))×100%,計算每組細(xì)胞的克隆形成率。
1.9 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件。計量資料以(±s)表示,采用獨立樣本t檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 ALKBH5在乳腺癌組織中表達 采用SP免疫組化法檢測ALKBH5在乳腺癌及乳腺增生組織中表達,ALKBH5主要定位于細(xì)胞核,胞漿及細(xì)胞膜均無ALKBH5表達,見圖1。乳腺癌組織中ALKBH5表達的陽性率為57.8%(52/90),乳腺增生組織中ALKBH5表達的陽性率為25.0%(5/20),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=7.042,P=0.008)。
圖1 ALKBH5在乳腺癌/增生組織中的表達(免疫組化×400)
2.2 乳腺癌中ALKBH5表達與臨床病理特征分析 ALKBH5表達與乳腺癌患者的年齡、性別、組織學(xué)分級、激素受體及腫瘤分期情況均無關(guān)(P>0.05)。ALKBH5高表達與乳腺癌患者的腫瘤大小(P=0.024)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(P=0.028)密切相關(guān)。見表1。
表1 乳腺癌組織中的ALKBH5表達與臨床病理特征分析[n(%)]
2.3 基因敲除ALKBH5抑制乳腺癌MDA-MB231細(xì)胞增殖 將 si-ALKBH5分別轉(zhuǎn)染至MDA-MB231細(xì)胞后,Q-PCR及Western Blot提示siRNA-ALKBH5明顯抑制乳腺癌中ALKBH5的mRNA及蛋白表達(P<0.05)。應(yīng)用MTT觀察細(xì)胞增殖情況,顯示ALKBH5-siRNA轉(zhuǎn)染組MDA-MB231細(xì)胞增殖在24 h、48 h及72 h明顯受到抑制而克隆形成實驗提示,ALKBH5-siRNA轉(zhuǎn)染組MDA-MB231細(xì)胞克隆明顯受到抑制。見圖2。
圖2 敲除ALKBH5抑制乳腺癌MDA-MB231細(xì)胞增殖
m6A是一種信使RNA的甲基化修飾,是一個動態(tài)可逆的修飾過程,由特異性的甲基化酶和去甲基化酶共同協(xié)調(diào)[9]。m6A修飾的核心甲基化轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體包括METTL3、METTL14和WTAP,另外一類酶是去甲基化轉(zhuǎn)移酶,主要功能是清除mRNA上的甲基化修飾,包括FTO、ALKBH5等[6,10]。m6A在惡性腫瘤的生長、侵襲和轉(zhuǎn)移中所起的調(diào)控作用已引起重視。研究發(fā)現(xiàn),m6A修飾參與胃癌、淋巴瘤等多種腫瘤進展[11-12],ALKBH5參與骨肉瘤等多種惡性腫瘤進展[4,13],但ALKBH5在胰腺癌中卻發(fā)揮抑癌作用,說明ALKBH5在不同癌組織中作用機制不同[14-15]。本研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌中ALKBH5表達增高,與患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及腫瘤的大小有關(guān),提示乳腺癌中ALKBH5有重要的生物學(xué)意義。
ALKBH5調(diào)控腫瘤進展的機制與促進靶基因mRNA去甲基化修飾有關(guān),在胰腺癌中高表達與預(yù)后較差有關(guān)[15]。ALKBH5通過去甲基化修飾FOXM1的mRNA,可明顯促進FOXM1表達,促進膠質(zhì)瘤細(xì)胞干性[16]。缺氧乳腺癌細(xì)胞干性HIF-1表達,可促進ALKBH5表達,進而影響通過mRNA去甲基化,促進多能性基因NANOG的表達,參與乳腺癌干性進展[17]。ALKBH5在卵巢癌中發(fā)揮抑制自噬作用,敲除ALKBH5抑制卵巢癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,其機制與ALKBH5激活EGFR-PIK3CA-AKT -mTOR信號通路,并可穩(wěn)定BCL2的mRNA及促進BCL2與Beclin1結(jié)合[18]。ALKBH家族也通過調(diào)控tRNA的去甲基化修飾,ALKBH3也可促進惡性腫瘤進展[19]。本研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌中ALKBH5表達增高,表明ALKBH5也可能通過調(diào)控相關(guān)靶基因表達,影響乳腺癌惡性進展。通過進一步敲低乳腺癌細(xì)胞MDA-MB231中ALKBH5,發(fā)現(xiàn)能抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖,提示ALKBH5可能是乳腺癌中發(fā)揮增殖促進作用,但具體機制需要進一步闡明。
綜上所述,ALKBH5在乳腺癌組織中異常高表達,與患者的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、腫瘤直徑較大有關(guān)。乳腺癌中ALKBH5可能是一個新的重要的治療靶點。