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      運用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)算法分析新型冠狀病毒肺炎中藥預(yù)防方的組方規(guī)律

      2022-01-20 05:30:06錢永昌何建華李月琴
      江蘇中醫(yī)藥 2021年12期
      關(guān)鍵詞:金銀花黃芪通路

      錢永昌 俞 芹 何建華 李月琴 王 蔚

      (泰州市姜堰中醫(yī)院,江蘇泰州225500)

      新型冠狀病毒肺炎(以下簡稱新冠肺炎)可歸屬于中醫(yī)學(xué)“疫病”范疇,中醫(yī)藥在防疫抗疫中發(fā)揮了重要作用。治未病是中醫(yī)特色,針對新冠肺炎的預(yù)防,部分地區(qū)的疫情防控指南及方案中推出了中藥預(yù)防方,中醫(yī)專家也擬定了相關(guān)處方?;趶?fù)雜網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)的挖掘,是以復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)體系為社團(tuán)結(jié)構(gòu),研究網(wǎng)絡(luò)中某一節(jié)點潛在的和整個網(wǎng)絡(luò)其他節(jié)點的聯(lián)系和對整個網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)影響[1]。近年來,有人嘗試用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論解決中藥方劑配伍等復(fù)雜問題,為中藥方劑研究開辟了新方法[2]。復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)能夠有效地挖掘方劑數(shù)據(jù)庫的中藥配伍規(guī)律,為方劑與中藥、方劑與病證、方劑與療法之間交錯關(guān)聯(lián)的復(fù)雜關(guān)系輔以科學(xué)解釋,給中醫(yī)藥理論提供科學(xué)實證。

      本研究我們收集新冠肺炎預(yù)防方,構(gòu)建若干相互作用的中藥節(jié)點及其關(guān)系的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),運用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的聚類解析算法,計算各味中藥在該網(wǎng)絡(luò)中的權(quán)重參數(shù),體現(xiàn)新冠肺炎預(yù)防處方中藥物之間的相互聯(lián)系及其規(guī)律,為進(jìn)一步提煉和優(yōu)化預(yù)防新冠肺炎等疫病的中藥方劑提供支持。

      1 研究資料

      收集2020年1月至2020年6月全國各地預(yù)防新冠肺炎的中藥處方,包括國家及地方政府、衛(wèi)生行政部門發(fā)布的疫情防控指南及方案中所列預(yù)防方劑以及高等中醫(yī)藥院校、院士、國醫(yī)大師、三級中醫(yī)醫(yī)院發(fā)布的預(yù)防方共88首(見表1,按處方來源以收集時間先后為序),方劑組方思路各異,藥物組成不同,每方2~14味,共涉及109種中藥。

      表1 88首新冠肺炎預(yù)防方藥物組成

      2 研究方法

      2.1 統(tǒng)計中藥出現(xiàn)次數(shù)及配伍次數(shù) 對109種藥物在不同預(yù)防方中出現(xiàn)的次數(shù),以條形圖形式在坐標(biāo)系上進(jìn)行展示,橫坐標(biāo)是藥材名稱,縱坐標(biāo)是藥材在所有藥方中的出現(xiàn)次數(shù),從左到右按降序排序。統(tǒng)計出現(xiàn)頻次較高的藥物與其他藥物的配伍數(shù)據(jù),以條形圖形式在坐標(biāo)系上展示,橫坐標(biāo)是藥物名稱,縱坐標(biāo)是對應(yīng)藥材在所有藥方中與其他藥材搭配使用過的次數(shù)之和。

      2.2 構(gòu)建預(yù)防方中藥網(wǎng)絡(luò) 將藥方中不同藥物之間的配伍繪圖表示,構(gòu)建新冠肺炎預(yù)防方中藥知識圖譜,通過網(wǎng)頁端圖譜界面展示,根據(jù)不同藥物之間聯(lián)系的強弱,對藥物進(jìn)行分類。每一個節(jié)點代表一味中藥,每一條邊代表兩味中藥在同一藥方中出現(xiàn),出現(xiàn)頻率不同的藥物對應(yīng)的節(jié)點大小不同。對應(yīng)節(jié)點越大表示該藥物出現(xiàn)頻率越高,與其他藥物的聯(lián)系性越強;節(jié)點越小表示該藥物與其他藥物的聯(lián)系性越弱。

      2.3 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)定量參數(shù)分析 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的中心性數(shù)值包括度、度中心性、介質(zhì)中心性、接近中心性、特征向量中心性,均為衡量和評價網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)的定量參數(shù)。復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)節(jié)點重要性綜合評價方法是將度中心性、接近中心性、介質(zhì)中心性綜合考慮[3]。度中心性是衡量節(jié)點中心性最直接的度量指標(biāo),即一個節(jié)點的度中心性越大,節(jié)點在網(wǎng)絡(luò)中的重要性越大。介質(zhì)中心性描述假設(shè)信息僅僅沿著最短路徑來傳播,越重要的節(jié)點與最短路徑聯(lián)系越緊密,經(jīng)過節(jié)點的最短路徑越多。接近中心性描述的是每個節(jié)點到其他節(jié)點的最短路的平均長度,也就是說對于某個節(jié)點而言,距離其他節(jié)點越近,那么它的中心度越高。特征向量中心性即在考慮自身位置的同時加入鄰居節(jié)點對網(wǎng)絡(luò)貢獻(xiàn)程度的考量。

      3 研究結(jié)果

      3.1 新冠肺炎預(yù)防方中各藥物出現(xiàn)頻次 對109種藥物在新冠肺炎預(yù)防方中出現(xiàn)的頻次進(jìn)行統(tǒng)計,其中出現(xiàn)頻次超過或等于4次的藥物見圖1。黃芪出現(xiàn)次數(shù)最多,為45次。

      圖1 88首新冠肺炎預(yù)防方藥物出現(xiàn)頻次(出現(xiàn)頻次≥4次的藥物)

      3.2 新冠肺炎預(yù)防方中藥物配伍頻次 見圖2。黃芪、金銀花、防風(fēng)與其他藥物配伍頻次最高,均超過200次。

      圖2 88首新冠肺炎預(yù)防方藥物配伍頻次

      3.3 新冠肺炎預(yù)防方藥物配伍關(guān)聯(lián) 新冠肺炎預(yù)防方藥物連接關(guān)系示意圖見圖3。黃芪、金銀花、防風(fēng)、甘草、貫眾等藥物出現(xiàn)頻率最高。根據(jù)圖譜可以清晰地觀察到藥物之間的聯(lián)系,可以迅速地找到所有與某味藥物有配伍關(guān)系的藥物。我們重點研究了與出現(xiàn)頻次最高的藥物黃芪相配伍的所有藥物,見圖4。與黃芪配伍頻次最多的藥物為金銀花、防風(fēng)、甘草、貫眾,這組藥物是預(yù)防新冠肺炎中藥復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的社團(tuán)焦點,是預(yù)防方的核心藥物。

      圖3 88首新冠肺炎預(yù)防方藥物連接關(guān)系示意圖

      圖4 88首新冠肺炎預(yù)防方中與黃芪配伍的藥物連接關(guān)系示意圖

      3.4 新冠肺炎預(yù)防方中主要藥物網(wǎng)絡(luò)中心性數(shù)值 系統(tǒng)對新冠肺炎預(yù)防方和其中的藥物進(jìn)行管理,完成對預(yù)防方的數(shù)據(jù)抽取,通過讀取EXCEL表格中新冠肺炎中藥配方的數(shù)據(jù),對藥物的使用次數(shù)做出統(tǒng)計,并且計算出不同藥物的度、度中心性、中介中心性、接近中心性、特征向量中心性等,將藥物按中心性數(shù)值由高到低排序(主要按“度”排序,“度”相同時按權(quán)重較大的“介質(zhì)中心性”排序),前10位的中藥見表2。

      表2 88首新冠肺炎預(yù)防方按中心性數(shù)值從高到低排序前10位藥物中心性數(shù)值

      4 討論

      新冠肺炎病位主要在肺,涉及脾胃,基本病因為感受濕毒,病機以濕、熱、毒、虛為主[4]。新型冠狀病毒首先利用自身的Spike蛋白與ACE2蛋白發(fā)生相互作用,從而侵入人體[5]。本病主要臨床表現(xiàn)為發(fā)熱、咳嗽和乏力,少數(shù)患者有惡心、嘔吐、腹瀉癥狀,逐漸出現(xiàn)呼吸困難。目前,對于新冠肺炎的治療仍沒有特效藥,而早預(yù)防、早治療能提高治愈率,降低病死率。

      本研究結(jié)果表明,收集的88首新冠肺炎預(yù)防方藥物的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中節(jié)點中心性前5位的中藥分別為黃芪、金銀花、防風(fēng)、甘草、貫眾。其中黃芪是最重要的藥物,其他四味藥物是與黃芪配伍頻次最高的藥物。以黃芪為主藥的扶正固本之方劑立意體現(xiàn)了“正氣存內(nèi),邪不可干”的中醫(yī)防疫理念,其作用也得到了相關(guān)實驗證明。

      黃芪中的多種化學(xué)成分能夠增強患者的免疫功能。黃芪的多種活性單體均能夠通過作用于免疫功能相關(guān)通路(鈣離子信號通路、腫瘤因子相關(guān)作用通路、PI3K-Akt信號相關(guān)通路等)提高免疫細(xì)胞的吞噬能力和殺傷作用,增強機體對病毒的抵抗能力。研究表明,黃芪多糖能夠促進(jìn)紅細(xì)胞生成,升高紅細(xì)胞比容及血紅蛋白數(shù)量,從而促進(jìn)造血干細(xì)胞的分化與增殖[6],推測其可改善新冠肺炎患者的凝血功能異常。黃芪總黃酮能夠通過增強超氧化物歧化酶(SOD)的活性,減少過氧化物對細(xì)胞膜的破壞,從而保護(hù)患者的肺組織[7]。采用GO富集分析發(fā)現(xiàn),黃芪-白術(shù)的有效活性成分參與細(xì)胞因子受體結(jié)合、細(xì)胞因子活性、受體配體活性、磷酸酶結(jié)合等生物學(xué)過程,可能通過此發(fā)揮防治新冠肺炎的作用[8]。

      金銀花清熱解毒,其不同部位的化學(xué)成分能夠顯著逆轉(zhuǎn)脂多糖誘導(dǎo)的炎癥因子釋放,產(chǎn)生抗炎作用,以防治新冠肺炎,且其能夠直接作用于病毒的復(fù)制過程。金銀花的主要成分綠原酸通過抑制白細(xì)胞介素(IL)-31、IL-33,減少炎癥趨化因子CCL7、CXCL8的釋放[9]。同時,綠原酸能夠直接作用于病毒RNA轉(zhuǎn)錄與翻譯等多個環(huán)節(jié),抑制病毒復(fù)制,發(fā)揮抗病毒作用[10]。金銀花的有效成分木犀草素能夠顯著降低促炎因子IL-1、1L-6、腫瘤壞死因子-α(TNF-α)水平,其對JNK、ERK、NF-κB等炎癥相關(guān)通路均有抑制作用[11]。此外,金銀花對免疫功能具有調(diào)節(jié)作用。金銀花多糖能夠增強NK細(xì)胞及巨噬細(xì)胞的殺傷作用和吞噬能力,促進(jìn)淋巴細(xì)胞增殖,從而顯著減緩環(huán)磷酰胺導(dǎo)致的免疫抑制反應(yīng)[12]。有研究者將金銀花有效活性成分作用靶點與新冠肺炎進(jìn)行分子對接后發(fā)現(xiàn),木犀草素通過作用于炎癥相關(guān)通路、絲裂原活化蛋白激酶等靶點,參與廣譜抗毒、抑菌與免疫調(diào)節(jié)作用[13]。

      甘草在臨床上常作為配伍藥物,發(fā)揮調(diào)和諸藥的作用。甘草具有抗腫瘤、抗炎、抗菌、抗病毒及調(diào)節(jié)免疫的藥理作用。研究者基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與分子對接分析,發(fā)現(xiàn)甘草作為新冠肺炎預(yù)防方中的關(guān)鍵藥物,主要發(fā)揮著調(diào)節(jié)炎癥和免疫應(yīng)答的作用[14]。甘草發(fā)揮抗炎作用的途徑廣泛,其有效活性成分亞油酸、色胺、白三烯、鞘氨醇等能夠作用于花生四烯酸、脂肪酸的代謝及磷脂的合成,抑制炎癥生成的多種途徑,產(chǎn)生強大的抗炎作用[15-16]。研究表明甘草水提物通過作用于Toll樣受體4信號通路,顯著抑制下游NF-κB、MAPK途徑所介導(dǎo)的IL-12炎癥因子釋放[17]。甘草及其有效成分能夠促進(jìn)巨噬細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞增殖與成熟,提高CD4+和CD8+水平,從而發(fā)揮調(diào)節(jié)細(xì)胞免疫應(yīng)答的作用[18]。

      新冠肺炎患者多具有發(fā)熱癥狀,防風(fēng)為傳統(tǒng)的辛溫解表藥。多項發(fā)熱動物模型研究均表明,防風(fēng)的活性成分升麻素、升麻苷、5-O-甲基維斯阿米純苷等具有顯著的解熱作用。同時,防風(fēng)還具有抗炎、調(diào)節(jié)免疫的作用,可增強患者免疫能力,抵抗病毒入侵[19]。防風(fēng)的有效成分升麻苷及二氫吡喃色酮是發(fā)揮抗炎作用的主要成分,分別能夠降低環(huán)氧化酶-2(COX-2)和一氧化氮(NO)的表達(dá)[20]。研究發(fā)現(xiàn)防風(fēng)多糖具有促進(jìn)Th1/Th2淋巴細(xì)胞亞群平衡的作用,可降低IL-4、IL-5炎癥因子,調(diào)控免疫應(yīng)答[21]。

      貫眾為新冠肺炎預(yù)防方中的常見組成藥物,其乙醇提取物能夠通過阻斷ERK/AP-1、TBKA1/IRF3等通路發(fā)揮抗炎作用[22]。多項研究證實其對H1N1甲型流感病毒、H5N1流感病毒、AD3腺病毒、FM1流感病毒等多種病毒具有顯著的抑制作用[23]。GO和KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn)貫眾的活性單體槲皮素能夠顯著抑制新冠肺炎相關(guān)通路SAPK/JNK、p38、p44/p42,阻斷MAPK信號通路,從而降低體內(nèi)炎癥因子浸潤,有效減輕炎癥程度,保護(hù)肺組織[13]。

      由于中藥復(fù)方防治新冠肺炎的相關(guān)研究涉及學(xué)科多,仍需進(jìn)行廣泛而深入的實驗研究和臨床試驗,進(jìn)一步優(yōu)化處方,明確中藥預(yù)防及治療新冠肺炎的安全性和有效性。

      (志謝:感謝解放軍理工大學(xué)張宏軍教授為本文的數(shù)據(jù)挖掘提供的大力支持)

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