• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看

      ?

      植物比葉面積量化:ImageJ軟件法與打孔稱重法的比較*

      2022-01-23 12:20:04林權(quán)虹鄭禹軒馬素輝
      關(guān)鍵詞:葉形測(cè)量方法葉面積

      林權(quán)虹,陳 朧,鄭禹軒,馬素輝,田 地

      (1.首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,北京 100048;2.北京大學(xué)城市與環(huán)境學(xué)院,北京大學(xué)生態(tài)研究中心,北京 100871;3.北京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院,北京 100083)

      0 引 言

      葉片是植物進(jìn)行光合作用、呼吸作用和蒸騰作用的重要器官,也是與環(huán)境接觸面積最大的器官之一[1].葉片功能性狀可以反映植物的生理生態(tài)過程以及植物對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)[2].作為重要的葉片功能性狀之一,比葉面積(specific leaf area,SLA)是指葉片面積和葉片干質(zhì)量的比值.在個(gè)體水平上,SLA與葉片氮含量、葉片壽命、凈光合速率和植株相對(duì)生長(zhǎng)速率等密切相關(guān)[3-5],通常SLA較高的植物,其單位質(zhì)量葉片氮含量高、葉片壽命短、凈光合速率較高和植株生長(zhǎng)速率較快[6-9].在群落水平上,SLA是群落演替的重要特征之一,如Lu等[10]和胡耀升等[11]的研究表明SLA隨森林演替的進(jìn)程而發(fā)生不同變化.在生態(tài)系統(tǒng)水平上,通過SLA、葉片干物質(zhì)含量和根莖性狀等的變化可以預(yù)測(cè)草地生態(tài)系統(tǒng)對(duì)環(huán)境變化的響應(yīng)[12].此外,SLA還可以通過影響冠層密度來間接調(diào)節(jié)生態(tài)系統(tǒng)的溫度[13].因此,在不同的研究尺度上,精確測(cè)定SLA是非常必要的.

      不同方法測(cè)量SLA的差異主要源于葉面積測(cè)定數(shù)據(jù)的差異性.傳統(tǒng)的葉面積測(cè)量方法主要有方格計(jì)數(shù)法、長(zhǎng)寬校正法和打孔稱重法等,其中,方格計(jì)數(shù)法費(fèi)時(shí)且復(fù)雜,不適宜在野外進(jìn)行測(cè)定[14-15];長(zhǎng)寬校正法需根據(jù)植物類型、品種、葉形和生育期等調(diào)整校正系數(shù),不具有通用性[16-17];打孔稱重法基于相近葉位葉片的SLA相對(duì)恒定的原理,通過測(cè)量選定區(qū)域葉片的面積與干質(zhì)量,從而計(jì)算得到SLA,能人為避開部分植物葉脈對(duì)SLA客觀準(zhǔn)確性的影響[18-19],在傳統(tǒng)測(cè)量葉面積中的應(yīng)用較為廣泛.隨著技術(shù)的發(fā)展,電子測(cè)定技術(shù)和圖像處理法成為目前常用的SLA測(cè)量法.電子測(cè)定技術(shù)包括葉面積儀法和求積儀法等,前者操作簡(jiǎn)單、精確度高,但對(duì)葉片的形狀有一定的限制,如卷曲葉片難以測(cè)定[20],而且儀器價(jià)格昂貴、維修困難,葉片掃描速度對(duì)測(cè)定結(jié)果的影響也較大[21],導(dǎo)致該方法難以推廣;后者易受儀器自身狀況、測(cè)算方法、葉形等因素的影響[22].圖像處理法是建立在計(jì)算機(jī)圖像處理基礎(chǔ)上的新方法,可以快速測(cè)量大量葉片的葉面積[23].目前最常用的圖像處理軟件有Photoshop、Matlab和ImageJ等.Photoshop軟件可以任意選擇區(qū)域,為病蟲害葉片或形狀不規(guī)則葉片葉面積的分析提供了可能[24],但是在測(cè)量如胡麻(Linum usitatissimumL.)等小葉、多葉片植物時(shí),其工作量大、人為誤差較大[25];Matlab軟件具有完善的圖像處理技術(shù)和高效的數(shù)據(jù)計(jì)算能力,可以批量處理圖片,但是需要一定的編程水平[26];ImageJ軟件通過簡(jiǎn)單的人為設(shè)置,能大批量處理樣品,還可儲(chǔ)存輸出結(jié)果便于進(jìn)一步分析[27],在應(yīng)用上更為快捷.

      不同葉面積測(cè)量方法在實(shí)驗(yàn)成本和操作便捷度上存在較大差異.那么,其測(cè)得的SLA數(shù)值是否存在顯著差異?野外植物的物種多樣性極高,哪一種方法能更加精確地測(cè)量不同植物的SLA?或者對(duì)于特定的植物而言,不同方法是否各自具有測(cè)量?jī)?yōu)勢(shì)?這些問題關(guān)系到植物SLA測(cè)定的精確性,目前尚待解決.基于此,本文以ImageJ軟件法和打孔稱重法為例,分別測(cè)定不同物種不同葉形的SLA,比較2種方法測(cè)定結(jié)果的差異性和精確性,闡明其對(duì)不同物種和不同葉形植物SLA測(cè)定結(jié)果的影響,并分析引起SLA差異的潛在原因,以期為野外快速精確測(cè)定SLA提供方法選擇上的建議,同時(shí)為其他相關(guān)研究數(shù)據(jù)分析以及模型模擬提供參考.

      1 材料與方法

      1.1 研究區(qū)概況

      研究區(qū)位于浙江省舟山市(121°30′~123°25′E,29°32′~31°04′N)與北京市海淀區(qū)(116°03′~116°23′E,39°53′~40°09′N).浙江省舟山市屬北亞熱帶季風(fēng)氣候,該地區(qū)植物物種豐富度高,植被受人類活動(dòng)干擾少.北京市海淀區(qū)地處華北平原的北部邊緣地帶,屬暖溫帶半濕潤(rùn)半干旱大陸性季風(fēng)氣候,四季分明.

      1.2 葉片采集

      于2019年7—8月前往浙江省舟山市的東海大峽谷(最高海拔478 m)和舟山長(zhǎng)崗森林公園(最高海拔303 m)采集亞熱帶地區(qū)植物葉片;于2019年9月在北京市海淀區(qū)采集溫帶地區(qū)植物葉片.具體采樣時(shí),選取枝葉繁茂并能接受到全光照的植株為目標(biāo),在每棵植株向陽(yáng)面的上、中、下位置分別采集若干片完整成熟的葉片[28],2個(gè)地區(qū)各物種的葉片均采集12片以上.葉片去除葉柄后,放于-4℃冰箱中低溫保存.

      1.3 種屬鑒別與葉片信息收集

      首先,根據(jù)葉形、雌雄蕊類型和果實(shí)類型等形態(tài)特征,對(duì)植物進(jìn)行初步辨認(rèn);其次,針對(duì)較難確認(rèn)的植物,提取植物葉片DNA,將其與美國(guó)國(guó)家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)數(shù) 據(jù) 庫(kù)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)已有序列信息比對(duì)實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確鑒定.將鑒定植物物種名錄在中國(guó)植物志數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.iplant.cn/frps)中進(jìn)行檢索,獲取葉片形狀信息.經(jīng)鑒定,共獲取39個(gè)物種的分類信息以及1 468片葉片的葉形概況(表1).各物種的葉片形狀包括:三角卵形、寬卵形、卵狀披針形、倒披針形和長(zhǎng)圓形等,大致可歸類為卵形、披針形和橢圓形這3種基本形狀,各形狀葉片的物種數(shù)分別為18、12和9種.

      表1 39個(gè)物種的物種分類信息及葉形概況

      1.4 Image軟件法測(cè)定葉面積

      以8片葉片為1組進(jìn)行編號(hào)(若葉片過大或過小,則視情況改變分組的葉片數(shù)量),展平后鋪于掃描板上(佳能(中國(guó))有限公司,型號(hào)為Canon Scan LIDE400),以300 DPI的分辨率依次對(duì)葉片進(jìn)行灰度掃描,圖片保存為jpeg格式.使用ImageJ軟件分別計(jì)算掃描圖片中的葉片總面積(S1),單位為cm2.

      1.5 打孔稱重法測(cè)定葉面積

      使用打孔器(直徑6 mm)對(duì)掃描后的葉片均勻打孔(避開主脈),統(tǒng)計(jì)打孔數(shù)量(n).常規(guī)情況下,每片葉片打孔10個(gè),因三峽槭(Acer wilsonii)和臭椿(Ailanthus altissima)的葉面積較小,分別打孔5和6個(gè),記錄打孔所得的圓形葉片總面積(S2),單位為cm2.

      1.6 葉片質(zhì)量

      將葉片按物種歸類,分別封裝于信封中,在65℃烘箱中烘干48 h至恒質(zhì)量后,使用分析天平(精度1 mg)分別稱量打孔后葉片和打孔所得圓形葉片的質(zhì)量,記為m1和m2,單位為g.

      1.7 數(shù)據(jù)處理

      式中:ASL1為ImageJ軟件法測(cè)得的SLA,ASL2為打孔稱重法測(cè)得的SLA,單位均為cm2/g.

      所有統(tǒng)計(jì)分析均采用R(R Core Team,2020)完成.首先,對(duì)2種方法獲得的SLA數(shù)據(jù)進(jìn)行正態(tài)分布和方差齊性檢驗(yàn);其次,分別進(jìn)行四分位統(tǒng)計(jì)與配對(duì)樣本t檢驗(yàn)(對(duì)不滿足正態(tài)分布或方差齊性的數(shù)據(jù)進(jìn)行開方轉(zhuǎn)換);再次,采用多元線性回歸,分析葉形、物種和測(cè)量方法及其交互作用對(duì)SLA的影響;最后,為了剔除物種信息對(duì)SLA測(cè)定值的影響,對(duì)每個(gè)物種的所有SLA樣本數(shù)據(jù)取平均值,再用每個(gè)樣本的SLA值減去該平均值,由此得到該樣本校正后的SLA,即去除物種信息影響后的殘差,然后對(duì)該殘差與測(cè)量方法進(jìn)行一元線性回歸分析[29].當(dāng)P<0.05時(shí),認(rèn)為采用不同測(cè)量方法計(jì)算得到的SLA差異顯著.

      使用變異系數(shù)(coefficient of variance,CV)分析數(shù)據(jù)的離散程度,基于此評(píng)估SLA測(cè)定方法的精確度,其計(jì)算公式為:

      式中:為平均值,SD為標(biāo)準(zhǔn)偏差,CV1為 ImageJ軟件法的變異系數(shù),CV2為打孔稱重法的變異系數(shù),ΔCV為2種變異系數(shù)的差值.當(dāng)ΔCV>0時(shí),認(rèn)為采用打孔稱重法測(cè)定SLA更適合;當(dāng)ΔCV<0時(shí),認(rèn)為采用ImageJ軟件法測(cè)定SLA更適合;當(dāng)ΔCV=0時(shí),在對(duì)精確度要求不高的情況下,2種方法均可采用[30].

      2 結(jié) 果

      2.1 測(cè)量差異性

      多元線性回歸結(jié)果表明,物種和測(cè)量方法存在顯著的交互作用(F=201.890,P<0.05),在個(gè)體水平上,物種解釋了72.6%的SLA變化.不同方法計(jì)算39個(gè)物種SLA的差異性與精確性的結(jié)果如表2所示,采用ImageJ軟件法和打孔稱重法測(cè)得的所有物種的SLA變化范圍分別為(63.925±0.925)~(392.489±29.296)和(73.779±1.153)~(387.060±12.386)cm2/g.配對(duì)樣本t檢驗(yàn)的結(jié)果表明,與打孔稱重法相比,有30個(gè)物種采用ImageJ軟件法測(cè)量得出的SLA顯著偏低(t=-26.242~4.314,P<0.05).

      表2 不同方法計(jì)算39個(gè)物種比葉面積(SLA)的差異性與精確性

      繪制不同葉形SLA的四分位數(shù)對(duì)比圖(圖1),可知,除7號(hào)伏牛山箭竹(Fargesia funiushanensis)和32號(hào)桑(Morus alba)以外,采用ImageJ軟件法計(jì)算得出的SLA普遍要比打孔稱重法低.此外,采用這2種方法測(cè)得的SLA的上下限差值、25%和75%中位數(shù)的分布范圍也呈現(xiàn)出類似特點(diǎn).

      圖1 不同方法計(jì)算SLA的四分位數(shù)對(duì)比

      2.2 測(cè)量精確性

      進(jìn)一步對(duì)比SLA差異顯著的30個(gè)物種的ΔCV,其中有22個(gè)物種的ΔCV<0,說明這22個(gè)物種采用ImageJ軟件法測(cè)得的SLA的離散程度更小,測(cè)得的SLA精確度更高;其余8個(gè)物種計(jì)算得到的ΔCV>0,即這8個(gè)物種采用打孔稱重法得到的SLA更精確.

      2.3 不同葉形與物種的影響

      對(duì)39個(gè)物種分葉形進(jìn)行比較,經(jīng)配對(duì)樣本t檢驗(yàn)得到的SLA差異不顯著的9個(gè)物種中,有6種具卵形葉片,3種具披針形葉片;在SLA差異顯著的30個(gè)物種中,其葉形為卵形、披針形和橢圓形的物種數(shù)分別為12、9和9種.22個(gè)物種采用ImageJ軟件法測(cè)量更精確,其葉形包括披針形(8種)、卵形(8種)和橢圓形(6種);8個(gè)物種采用打孔稱重法測(cè)量更精確,其葉形包括披針形(1種)、卵形(4種)和橢圓形(3種).對(duì)不同葉形和物種的SLA進(jìn)行多元線性回歸分析,結(jié)果表明2種方法對(duì)不同物種SLA的測(cè)定結(jié)果有顯著差異(F=2.276,P<0.05),但對(duì)不同葉形植物的SLA測(cè)定無(wú)顯著影響(P=0.54).剔除物種的影響后,僅考慮測(cè)量方法對(duì)SLA影響的分析表明,大多數(shù)物種采用ImageJ軟件法測(cè)得的SLA仍然比打孔稱重法低(F=36.895,P<0.05).

      3 討 論

      3.1 測(cè)量方法引起差異的潛在原因

      前人針對(duì)采用不同方法測(cè)定葉面積展開了大量研究.如:柯嫻氡等[31]利用方格紙法、紙樣稱重法、葉面積儀法和掃描法測(cè)定木荷(Schima superba)和白蘭(Michelia alba)的葉面積,結(jié)果表明采用不同方法測(cè)得的葉面積均無(wú)顯著差異;高建昌等[27]采用ImageJ軟件法與傳統(tǒng)剪紙法在測(cè)定番茄(Lycopersicon esculentum)葉面積時(shí),測(cè)量結(jié)果差異不顯著,且采用ImageJ軟件法測(cè)定葉面積數(shù)值的穩(wěn)定性更高;李治中等[32]和劉小銳等[33]也得出上述類似結(jié)論.這些研究表明采用多種方法測(cè)定單一物種或較少物種的葉面積無(wú)顯著差異,但與此不同的是,本研究證實(shí)39個(gè)物種采用ImageJ軟件法計(jì)算得出的SLA較打孔稱重法普遍偏低,這與王家保等[34]采用不同方法測(cè)得小葉型果樹的葉面積存在顯著差異的結(jié)論具有一致性.

      2種常用的SLA測(cè)定方法對(duì)不同物種測(cè)量結(jié)果存在顯著差異,而葉形則無(wú)顯著影響.剔除物種信息對(duì)SLA的影響后,即僅考慮測(cè)量方法的SLA的一元線性回歸分析,表明不同測(cè)量方法對(duì)校正后的SLA仍有顯著影響,這說明ImageJ軟件法測(cè)得的SLA確實(shí)要低于打孔稱重法.分析此結(jié)果產(chǎn)生的原因,可能包括:(1)打孔誤差.打孔稱重法易受葉片含水量、葉齡、葉形、葉脈、葉片質(zhì)地、葉片厚度以及葉片大小等因素的影響[20,35].如以葉片質(zhì)地為例,杜仲(Eucommia ulmoides)的杜仲膠容易造成打孔邊緣不齊,導(dǎo)致打孔稱重法獲得的葉片實(shí)際面積與理論面積存在偏差.從葉形和葉脈的影響來看,植物葉形一般分為卵形、倒卵形、橢圓形和披針形等[36],葉脈分為叉狀脈、網(wǎng)狀脈和平行脈等[37],而葉形和葉脈往往會(huì)影響打孔的位置[38],導(dǎo)致SLA測(cè)量不精確.如部分植物的葉脈密度大于葉肉密度,且越靠近葉脈的位置葉片越厚,密度也越大,導(dǎo)致打孔所得的小圓片密度小于平均葉密度[14].(2)質(zhì)量誤差.打孔的葉片烘干后,存在葉屑掉落的現(xiàn)象,導(dǎo)致打孔稱重法出現(xiàn)更大的測(cè)量誤差.(3)方法局限性.以葉片局部的數(shù)據(jù)來反映整體的性質(zhì),這導(dǎo)致打孔稱重法具有一定局限性.

      3.2 測(cè)量方法的選擇

      基于植物功能性狀預(yù)測(cè)未來氣候變化,對(duì)生態(tài)系統(tǒng)的影響是動(dòng)態(tài)全球植被模型中的重要內(nèi)容[39],但是利用傳統(tǒng)方法測(cè)量SLA費(fèi)時(shí)費(fèi)力.隨著掃描儀的廣泛使用,基于圖像處理的葉面積測(cè)量越來越受到關(guān)注[40-42].圖像處理法中的ImageJ軟件功能豐富,可廣泛應(yīng)用于農(nóng)林業(yè)的研究中[43-45].本研究表明,對(duì)特定的植物而言,ImageJ軟件法和打孔稱重法具有各自的測(cè)量?jī)?yōu)勢(shì),有22個(gè)物種采用ImageJ軟件法計(jì)算的精確度更高,有8個(gè)物種采用打孔稱重法計(jì)算的精確度更高.ImageJ軟件法不但可以避免破壞植物組織,而且也可以用于計(jì)算有缺損葉片或形狀不規(guī)則葉片的葉面積[46],消除了打孔誤差和質(zhì)量誤差.在傳統(tǒng)測(cè)量法的基礎(chǔ)上,ImageJ軟件法極大地?cái)U(kuò)大了應(yīng)用范圍、縮短了測(cè)量時(shí)間和提高了測(cè)量精度.因此,在樣本量大或重復(fù)數(shù)多的情況下,可優(yōu)先選用ImageJ軟件法計(jì)算SLA.

      SLA主要由物種信息控制,并排除葉形對(duì)測(cè)量方法選擇的影響.本研究采用卵形、披針形和橢圓形這3種形狀劃分葉形,但由于同一物種的葉形存在表型可塑性,如甘肅桃(Amygdalus kansuensis)的葉片不僅存在披針形,也存在卵狀披針形這類過渡形態(tài)[47],在野外采樣中,較難準(zhǔn)確判斷葉形歸屬以選擇合適的SLA測(cè)量方法.因此,在實(shí)際應(yīng)用中,僅靠葉形來選擇葉面積測(cè)量方法過于粗放,應(yīng)綜合考慮物種信息及其相應(yīng)的葉形.

      4 結(jié)束語(yǔ)

      本研究采用ImageJ軟件法和打孔稱重法測(cè)量了39個(gè)植物物種的SLA,從測(cè)量結(jié)果的差異性來看,有30個(gè)物種采用ImageJ軟件法測(cè)量得出的SLA顯著低于打孔稱重法.從測(cè)量結(jié)果的精確性來看,在SLA差異顯著的30個(gè)物種中,有22個(gè)物種采用ImageJ軟件法計(jì)算的精確度更高,其余8個(gè)物種采用打孔稱重法得到的更精確.綜合葉形與物種來看,2種測(cè)量方法對(duì)不同物種SLA的測(cè)量結(jié)果產(chǎn)生顯著影響,但對(duì)不同葉形SLA測(cè)定結(jié)果的影響不顯著,可見主要由物種信息控制并排除以葉形作為SLA測(cè)定方法的判斷依據(jù).因此,在樣本量大或重復(fù)數(shù)多的情況下,可優(yōu)先選用ImageJ軟件法計(jì)算SLA,對(duì)未來野外采樣具有一定的指導(dǎo)意義.本研究著重探討葉形對(duì)SLA測(cè)量的影響,尚未針對(duì)葉脈、葉片質(zhì)地等性狀展開分析不同測(cè)量方法的差異性和精確性;同時(shí)實(shí)驗(yàn)物種的數(shù)量仍較少,以葉形為指標(biāo)進(jìn)行劃分得到的部分葉形的物種數(shù)量<10個(gè),重復(fù)度較低.因此,在下一步的研究中可加大物種的數(shù)量,并在植物其他葉片性狀與不同測(cè)量方法的適用性上進(jìn)行探究.

      致謝:感謝首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院張愛兵教授課題組、本科生趙佳月、溫婕、程可欣和王天漢等在實(shí)驗(yàn)開展過程中提供的幫助.

      猜你喜歡
      葉形測(cè)量方法葉面積
      作物葉面積測(cè)量的研究進(jìn)展
      馬奶子葡萄葉面積評(píng)估模型的建立
      “光合作用與細(xì)胞呼吸”重點(diǎn)分析和突破
      基于迭代稀疏分解的介損角測(cè)量方法
      基于應(yīng)變?cè)黼S鉆鉆壓測(cè)量方法研究
      一種高效的PCB翹曲度測(cè)量方法
      苧麻葉面積測(cè)定方法比較研究
      楓葉
      基于壓電激振的彈性模量測(cè)量方法
      水稻葉形遺傳調(diào)控機(jī)理的研究進(jìn)展
      贵港市| 抚宁县| 彝良县| 兴仁县| 特克斯县| 岐山县| 会东县| 泉州市| 赣榆县| 定兴县| 中宁县| 南阳市| 淄博市| 福海县| 秀山| 永善县| 石棉县| 正阳县| 江山市| 邵武市| 尚义县| 威信县| 陈巴尔虎旗| 武汉市| 故城县| 南川市| 兰溪市| 宿州市| 道真| 梓潼县| 阳谷县| 当雄县| 乡宁县| 墨玉县| 东乡县| 桂阳县| 会理县| 亳州市| 宁德市| 宜章县| 界首市|