陳少波 位佳琳 何蕊邢春來 初洪波 位鴻
(長春中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,長春130117)
類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)是一種全身性疾病,主要表現(xiàn)為慢性對稱性關(guān)節(jié)炎[1-2]。一般認(rèn)為RA是感染引發(fā)的自身免疫反應(yīng),臨床研究表明RA發(fā)生與環(huán)境、家族遺傳、感染以及性激素失調(diào)有關(guān),特征為關(guān)節(jié)滑膜組織、軟骨和骨骼炎癥變化,導(dǎo)致以滑膜炎為基礎(chǔ)的關(guān)節(jié)病變,晚期可引起關(guān)節(jié)強(qiáng)直、畸形和功能嚴(yán)重受損,最終導(dǎo)致殘疾和死亡[3-5]。RA可發(fā)生于任何年齡,60歲以上患者明顯多于30歲以下者,女性發(fā)病率普遍高于男性,嚴(yán)重影響患者健康和生活質(zhì)量[6]。臨床上RA治療方式主要為糖皮質(zhì)激素、非甾體類抗炎藥等,雖緩解疼痛效果明顯,但副作用較大,故采用傳統(tǒng)中藥進(jìn)行多靶點治療是更好的選擇[7-9]。
甘姜苓術(shù)湯(Ganjianglingzhu Decoction,GJLZ)即腎著湯,出自漢代張仲景所著《金匱要略》,由甘草、白術(shù)、干姜、茯苓四味藥材組成[10]。近年研究表明,GJLZ應(yīng)用廣泛,除可治療腎著?。ê疂窀街I經(jīng)而見腰部寒冷沉重的病證),在RA、寒濕腰痛、膝骨關(guān)節(jié)痛等臨床治療方面也有較好療效[11]。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)基于系統(tǒng)生物學(xué)對疾病發(fā)展過程進(jìn)行闡釋,再采用一系列網(wǎng)絡(luò)觀念認(rèn)識藥物與機(jī)體的相互作用,可通過尋找藥物和疾病間有意義的共同靶點系統(tǒng)揭示中藥產(chǎn)品在分子水平上的治療機(jī)制,對RA防治具有現(xiàn)實指導(dǎo)意義,為臨床應(yīng)用提供實驗基礎(chǔ)[12]。
本研究采用液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析及體外實驗結(jié)合的模式,更全面地研究藥物作用機(jī)制[13]。應(yīng)用超高液相色譜-串聯(lián)四級桿飛行時間質(zhì)譜儀聯(lián)用技術(shù)(UPLC-Q-TOF/MS)指認(rèn)出復(fù)方中關(guān)鍵成分,再采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對GJLZ的成分靶點和疾病靶點、生物學(xué)過程及途徑進(jìn)行預(yù)測,采用CCK-8和ELISA實驗驗證小鼠單核巨噬細(xì)胞白血病細(xì)胞(RAW264.7)的炎癥反應(yīng),初步闡明GJLZ作用于RA的機(jī)制,為RA治療提出新的見解,為臨床深入研究RA提供新思路[14]。
1.1 材料干姜、茯苓、白術(shù)、甘草經(jīng)長春中醫(yī)藥大學(xué)肖井雷教授鑒定均符合規(guī)定;對照品甘草苷(批號:111610-201607)、甘草酸(批號:111847-201505)、β-谷甾醇(批號:110851-201608)、常春藤皂苷元(批號:111733-201205)、麥角甾醇(批號:111845-201604)、月桂酸(批號:111774-201602)、白術(shù)內(nèi)酯Ⅱ(批號:111976-201501)、棕櫚酸(批號:111733-201607)均購于中國食品藥品檢定研究院,質(zhì)量分?jǐn)?shù)均>95%;乙腈(色譜純,4 L,美國Thermo Fisher Scientific公司);小鼠單核巨噬細(xì)胞白血病細(xì)胞(RAW264.7)來源于中國科學(xué)院上海細(xì)胞生物研究所細(xì)胞庫;胎牛血清(美國Clark);青霉素-鏈霉素雙抗(100 ml,定州百克賽斯生物科技有限公司);DMEM培養(yǎng)基(500 ml,美國Gibco);CCK-8溶液(500 T,大連美侖生物技術(shù)有限公司);脂多糖(LPS,上海懋康生物科技有限公司);VEGF、IL-17 ELISA檢測試劑盒(鼠源,48 T,中國黃石科研)。
1.2 方法
1.2.1 藥材提取和溶液制備按處方量取甘草28.0 g、干姜56.0 g、茯苓56.0 g、白術(shù)28.0 g(共168.0 g),加1 000 ml水浸泡30 min,武火煎煮至沸騰,轉(zhuǎn)文火煎煮至600 ml,冷凍干燥,粉碎,得到提取物粉末。對照品溶液制備:分別稱取各對照品約2.0 mg置于10 ml量瓶,加甲醇定容至刻度,搖勻,得到單一對照品溶液(0.2 mg/ml)。分別精密吸取各對照品溶液適量,混合,得到混合對照品溶液(2 μg/ml)。供試品溶液制備:稱取粉末約0.1 g,精密稱定,置于10 ml量瓶,加70%乙醇8 ml,超聲處理40 min(250 W,40 kHz),放冷,70%乙醇水溶液稀釋至刻度定容,搖勻,離心,0.45 μm濾膜過濾[15]。
1.2.2 UPLC-Q-TOF/MS篩選有效成分采用UPLC-Q-TOF/MS進(jìn)行有效成分篩選,色譜柱:OOD-4475-AN C18(2.1 mm×100 mm,1.7 μm);波長:237 nm;流速:0.3 ml/min;柱溫:30℃;進(jìn)樣量:8 μl;流動相:0.1%甲酸水(A)-乙腈(B);梯度洗脫見表1。采用電噴霧離子源(ESI),負(fù)離子檢測模式,噴霧電壓3.8 kV,氣體溫度350℃,霧化器40psig,干燥氣體(氮氣)流速為10.0 L/min,碎片器175 V,撇油器電壓65 V,全掃描范圍m/z50~1 000。根據(jù)對照品鑒定精確相對分子量及保留時間確定化學(xué)成分。
表1 梯度洗脫Tab.1 Gradient elution
1.2.3 藥物靶點和疾病靶點收集取1.2.2中獲取的成分輸入中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫分析平臺(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)、中醫(yī)藥整合藥理學(xué)研究平臺(http://www.tcmip.cn/TCMIP/index.php/Home/Login/login.html)和SwissTargetPrediction平臺(http://swisstargetprediction.ch/)中,以口服生物利用度(OB)≥30%、藥物相似度(DL)≥0.18為條件,物種設(shè)置為“Homo sapiens”,收集成分靶點,篩重,獲得藥物靶點。以“Rheumatoid arthritis”為關(guān)鍵詞,在Drugbank數(shù)據(jù)庫(https://www.drugbank.ca/)中進(jìn)行檢索,獲得靶點,篩重,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫將靶點蛋白名稱轉(zhuǎn)化成基因名稱,獲得疾病靶點。
1.2.4 疾病-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將疾病、藥物成分、靶點導(dǎo)入Cytoscape3.8.0軟件,以三者為節(jié)點,選用Merge功能,相互關(guān)系分別用邊相連,構(gòu)建“疾病-藥物成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)。為進(jìn)一步研究GJLZ治療RA的靶點,將RA和GJLZ蛋白靶點上傳至venny(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html)軟件,繪制藥物靶點和疾病靶點韋恩圖(veen),得到成分和疾病的交集靶點,采用Cytoscape3.8.0軟件構(gòu)建“疾病-藥物成分-交集靶點”網(wǎng)絡(luò)圖。
1.2.5 交集靶點的GO生物功能分析和KEGG通路富集分析將1.2.3獲得的交集靶點輸入至String Versio軟件繪制PPI網(wǎng)絡(luò)圖,采用Cytoscape3.8.0軟件對其進(jìn)行可視化分析。將得到的共同靶標(biāo)導(dǎo)入R語言軟件,基于GO和KEGG分析,結(jié)合富集計算(GO:Count≥2,P≤0.05;KEGG:P≤0.01)確定交集靶點參與的生物學(xué)過程和通路,根據(jù)P值進(jìn)行降序排列,選擇前20位生物學(xué)功能和通路,采用Cyto?scape3.8.0軟件繪制“疾病-藥物成分-靶點-信號通路”網(wǎng)絡(luò)圖,闡明核心靶點在信號通路中的作用,得到GJLZ抗RA的主要作用通路及初步機(jī)制。
1.2.6 分子對接驗證選取生物利用度較高的3個成分與3個核心靶點進(jìn)行對接,將Gingerenone-A、Glycyrol、Gingerenone-B輸 入PubChem[PubChem(nih.gov)]平臺,下載化合物2D結(jié)構(gòu),通過Autodock vina 1.1.2軟件將其轉(zhuǎn)化為PDBQT格式配體。從Protein DataBank(RCSB PDB:Homepage)網(wǎng)站獲取小分子受體,采用Pymol軟件去除水和有機(jī)配體,采用Autodock vina 1.1.2軟件對受體蛋白和小分子進(jìn)行對接。結(jié)合能<0時表明配體和受體親和力較強(qiáng),選擇親和力最好的作為對接構(gòu)象,Pymol分析作圖。
1.2.7 細(xì)胞培養(yǎng)及藥物毒性檢測RAW264.7細(xì)胞采用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基培養(yǎng),37℃、5%CO2。將對數(shù)生長期的RAW264.7細(xì)胞懸液接種于96孔板(8×104個/ml),100 μl/孔,設(shè)置對照組(細(xì)胞+培養(yǎng)基)、GJLZ組(100、50、25、12.5、6.25、3.125 μg/ml),各組設(shè)6個復(fù)孔,加藥培養(yǎng)24 h,加入10 μl CCK-8溶液,在CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2h,酶標(biāo)儀檢測450 nm處各孔吸光度(A)值。
1.2.8 ELISA檢測細(xì)胞因子IL-17、VEGF含量將RAW264.7細(xì)胞懸液接種于6孔板(1×105個/ml),2 ml/孔,貼壁后設(shè)置對照組(NOR)、LPS模型組(MOL)、LPS+GJLZ低、中、高劑量組,培養(yǎng)24 h后取培養(yǎng)基,離心(2 500 r/min),取上清,采用ELISA試劑盒檢測IL-17、VEGF含量。
2.1 GJLZ化學(xué)成分鑒定與確認(rèn)將液質(zhì)聯(lián)用分析結(jié)果與化學(xué)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對[16],共得到15種化學(xué)成分(東莨菪醇、月桂酸、甘草苷、白術(shù)內(nèi)酯Ⅱ、棕櫚酸、姜烯酮-C、甘草酸、常春藤皂苷元、β-谷甾醇、甘草素B、麥角甾醇、姜烯酮-A、甘草酚、姜烯酮-B、12-姜辣素),將15種成分的出峰時間、化學(xué)名稱、分子式、分子量及加合物進(jìn)行匯總,結(jié)果見附圖1、附表1(www.immune99.com)。
2.2 藥物靶點和疾病靶點收集通過Swiss Target Prediction和TCMSP數(shù)據(jù)庫得到15種化學(xué)成分靶點,篩選后(OB>30,DL>0.18)得到177個成分靶點。從GeneCards數(shù)據(jù)庫獲取RA疾病靶點,篩選后(置信度得分>5.0分)得到2 048個疾病靶點,置信度得分>5.0分表明該靶點與RA密切相關(guān)(圖1A)。
2.3 疾病-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)及PPI構(gòu)建將篩選出的15種成分、疾病、相關(guān)靶點構(gòu)建“成分-疾病-靶點”網(wǎng)絡(luò)圖(圖1C)。為進(jìn)一步研究RA,采用R軟件制作成分靶點和疾病靶點veen圖,得到GJLZ和RA交集靶點19個(圖1A)。采用Cytoscape3.8.0軟件繪制“疾病-成分-交集靶點”網(wǎng)絡(luò)圖并進(jìn)行可視化分析(圖1C)。通過網(wǎng)絡(luò)圖可觀察到15個成分中甘草素B連接12個交集靶點,甘草酚連接8個交集靶點,姜烯酮-A、姜烯酮-B、姜烯酮-C分別連接5個交集靶點,12-姜辣素連接2個交集靶點,其余成分連接1個或1個以上靶點。PPI顯示34個節(jié)點,144條邊,置信度得分最高的(置信度得分>0.9分)節(jié)點包括AKT1、HSP90AA1、NOS3、KDR、MAPK14,均高度參與細(xì)胞炎癥、細(xì)胞周期及增殖過程(圖1B)。
圖1 GJLZ調(diào)控RA的靶基因分析Fig.1 Analysis of GJLZ target genes regulating RA
2.4 GO分析和KEGG分析GO功能分析根據(jù)P<0.05篩選出前20條結(jié)果,繪制條形圖進(jìn)行對比(圖2A),交集靶標(biāo)主要與炎癥、增殖、腫瘤及生長周期相關(guān),交集靶點主要參與核受體活性、配體激活的轉(zhuǎn)錄因子活性、類固醇激素受體活性、RNA聚合酶Ⅱ一般轉(zhuǎn)錄起始因子結(jié)合、一般轉(zhuǎn)錄起始因子結(jié)合等生物學(xué)功能。與交集靶基因連接密切的有核受體活性及配體激活的轉(zhuǎn)錄因子活性,分別連接5個靶點,類固醇激素受體活性與4個靶點相連,其余生物功能分別與3個或3個以上靶點基因相連,同一個靶點蛋白也同時參與多個生物學(xué)功能。
KEGG通路分析根據(jù)P<0.05篩選出前20條有顯著意義的通路,繪制KEGG條形圖(圖2B),主要包括化學(xué)致癌作用-受體激活、血管內(nèi)皮生長因子信號通路、催乳素信號通路、IL-17信號通路、輔助性T細(xì)胞17細(xì)胞分化、cGMP-PKG信號通路、PI3K-Akt信號通路等,以上通路主要與細(xì)胞炎癥、增殖、生長周期有關(guān)。NOS3參與5條通路,HSP90AA1參與4條通路,KDR和MAPK14分別參與3條通路,其余靶點參與1條或1條以上通路(圖2B)。
2.5 分子對接網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析GJLZ治療RA的相關(guān)基因,NOS3、HSP90AA1和KDR連接通路最多,是最重要的蛋白靶點,對“藥物成分、疾病、交集靶點”繪制的網(wǎng)絡(luò)圖進(jìn)行拓?fù)浞治?,姜烯酮A、姜烯酮B、甘草酚排名較高,且姜烯酮A與HSP90AA1、姜烯酮B與NOS3、甘草酚與KDR相關(guān),故分別以這3種成分為配體,蛋白靶點為受體進(jìn)行剛性對接,姜烯酮B和NOS3的對接能量為-7.8 kJ/mol,甘草酚和KDR的對接能量為-7.5 kJ/mol,姜烯酮A和HSP90AA1的對接能量為-3.6 kJ/mol,結(jié)合能均為負(fù)值,表明結(jié)合活性好(附表2、附圖2,www.immune99.com)。
圖2 核心靶點的GO分析和KEGG分析圖Fig.2 GO analysis and KEGG analysis diagram of core target
2.6 體外細(xì)胞實驗結(jié)果與正常組相比,GJLZ(12.5、25、50、100 μg/ml)組細(xì)胞活力增強(qiáng),且隨藥物濃度增加對細(xì)胞無毒害作用。故選擇GJLZ(25、50、100 μg/ml)低、中、高3個劑量組進(jìn)行實驗(圖3)。ELISA測定細(xì)胞炎癥因子證實網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測,即GJLZ通過抑制炎癥因子釋放治療RA。與空白組相比,LPS刺激下,模型組細(xì)胞中IL-17、VEGF表達(dá)水平明顯升高;與模型組相比,藥物組以濃度依賴的方式抑制IL-17、VEGF產(chǎn)生,表明藥物治療后,促炎因子水平下調(diào),阻止RA進(jìn)展(圖4)。
圖3 不同濃度GJLZ對細(xì)胞活力的影響Fig.3 Effects of different concentrations of GJLZ on cell viability
圖4 GJLZ對VEGF、IL-17表達(dá)的影響Fig.4 Effect of GJLZ on expressions of VEGF and IL-17
RA發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,主要與炎癥、非炎癥性免疫細(xì)胞、細(xì)胞炎癥因子及受體信號通路有關(guān)[17-18]。文獻(xiàn)報道,GJLZ可用于RA治療,但機(jī)制尚不清楚,故本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測并初步探討GJLZ治療RA的機(jī)制。
本研究質(zhì)譜分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),GJLZ含有15種化學(xué)成分,包含甘草酚、姜烯酮-A、姜烯酮-B等。甘草酚是一種新型免疫抑制劑,CIA模型研究顯示,甘草酚通過調(diào)節(jié)固有免疫和降低IL-17表達(dá)抑制RA發(fā)展[19]。SUK等[20]用肥胖小鼠進(jìn)行體內(nèi)體外實驗,結(jié)果表明姜烯酮-A可預(yù)防肥胖,還可通過降低促炎因子活性抑制巨噬細(xì)胞炎癥。綜上,復(fù)方中的關(guān)鍵成分可通過作用于不同炎癥因子和信號通路抑制炎癥發(fā)生,故預(yù)測GJLZ在RA治療方面療效顯著。
通過venny軟件獲得韋恩圖,顯示藥物和疾病交集靶點為19個,將藥物成分、疾病和交集靶點繪制網(wǎng)絡(luò)圖后得到GJLZ治療RA的關(guān)鍵成分。根據(jù)質(zhì)譜分析得到的15個化學(xué)成分,最終確認(rèn)GJLZ和RA共有蛋白靶點34個,通過String軟件構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖,分析高度連接節(jié)點,其中AKT1、HSP90AA1、NOS3、KDR、MAPK14的置信度得分>0.9分,與其他靶點蛋白相互作用顯著,表明這些靶點在RA生物學(xué)過程中非常重要。GO和KEGG通路分析顯示,GJLZ治療RA的靶點主要涉及VEGF、IL-17、Th17細(xì)胞分化、cGMP-PKG、PI3K-Akt等信號通路。VEGF、IL-17是重要的炎癥因子,可通過體內(nèi)誘導(dǎo)血管增生和增加內(nèi)皮促炎因子產(chǎn)生導(dǎo)致炎癥反應(yīng)。PI3K-Akt是經(jīng)典的信號通路,IL-17通過PI3K-Akt途徑并以此作為媒介引發(fā)RA[21-22]。CIA大鼠研究發(fā)現(xiàn),VEGF表達(dá)隨關(guān)節(jié)炎指數(shù)升高而增加[23]。
分子對接結(jié)果表明,細(xì)胞炎癥相關(guān)核心基因分子結(jié)合能均小于-3 kJ/mol,表明成分和蛋白靶點對接構(gòu)象較好,結(jié)合活性較好,核心成分可直接與AKT1、HSP90AA1、KDR、NOS3相互作用,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞炎癥和增殖,以進(jìn)一步篩選GJLZ治療RA的相關(guān)機(jī)制[24]。研究表明,AKT1在CIA小鼠體內(nèi)外實驗中均為抑制炎癥的直接靶標(biāo),可通過促進(jìn)AKT1表達(dá) 減 輕CIA小 鼠 關(guān)節(jié) 炎癥 和 損 傷[25]。ZAICHKO等[26]采用ELISA檢測36例女性RA患者血清NOS3濃度,結(jié)果顯示患者血清中NOS3含量顯著降低,NOS3與炎癥因子分泌呈負(fù)相關(guān)。KDR在血管生成和炎癥中起重要作用,PCR和ELISA結(jié)果顯示RA患者KDR水平顯著高于健康志愿者[27-28]。HSP90AA1核心蛋白與NOS3相關(guān),均參與破骨細(xì)胞分化、細(xì)胞代謝過程,與RA病理生理過程密切相關(guān)[29-30]。WANG等[31]發(fā)現(xiàn),HSP90AA1是參與炎癥的核心基因,可通過IL-17和TNF通路治療疾病,且是通過VEGF通路抑制相關(guān)疾病的重要蛋白[32]。ZHU等[33]通過大鼠實驗結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)證明,NOS3、TNF等治療靶點通過IL-17、RA相關(guān)通路治療疾病。核心蛋白間相互作用表現(xiàn)出高度連通性,直接或間接改變基因表達(dá),最終抑制炎癥發(fā)生。
經(jīng)過質(zhì)譜鑒定、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測及分子模擬對接初步驗證后,通過CCK-8和ELISA進(jìn)一步證明GJLZ可顯著下調(diào)LPS模型細(xì)胞IL-17及VEGF表達(dá),抑制炎癥反應(yīng)發(fā)生,阻止RA發(fā)展。SUN等[34]通過ELISA檢測IL-17含量,結(jié)果表明與對照組相比,RA高活動組和低活動組IL-17等炎癥因子表達(dá)顯著上調(diào)[35-36]。臨床Meta分析發(fā)現(xiàn),VEGF是血管生成和炎癥的有效介質(zhì),與RA發(fā)病機(jī)制密切相關(guān)[37]。
綜上,本研究通過UPLC-Q-TOF/MS和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對GJLZ治療RA的機(jī)制進(jìn)行預(yù)測,通過分子對接進(jìn)行初步驗證,再用細(xì)胞實驗進(jìn)一步驗證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)GJLZ治療RA的機(jī)制與抑制IL-17和VEGF表達(dá)有關(guān),為臨床治療RA提供了理論依據(jù),為更好地研究GJLZ治療RA提供了科學(xué)基礎(chǔ),具有重要研究價值。