李亞嬌,孫國(guó)琴**,于傳宗,王海燕,龐 杰,郭九峰
(1.內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010031;2.內(nèi)蒙古大學(xué)物理科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010021)
隨著人們生活水平不斷提高,各年齡段人們追求的生活品質(zhì)不斷提升。由于食用菌味道鮮美、風(fēng)味獨(dú)特,且具有很高的營(yíng)養(yǎng)保健及藥用價(jià)值,成為現(xiàn)代人們青睞的餐桌食品,野生食用菌更是倍受學(xué)者及消費(fèi)者關(guān)注,具有良好的開(kāi)發(fā)應(yīng)用前景[1-3]。我國(guó)是野生食用菌資源最豐富的國(guó)家之一,據(jù)統(tǒng)計(jì),全世界已知的食用菌有2 000多種,我國(guó)已被鑒定的約有近1 000種,其中有100多種被馴化,用于商業(yè)栽培的有60多種[4-5]。然而,還有很多具有極高食(藥)用價(jià)值的食用菌資源仍未被挖掘。近年來(lái),由于野生菌市場(chǎng)火熱,利益驅(qū)使人們亂采亂挖、過(guò)度采集;加之生態(tài)環(huán)境退化,致使野生食用菌資源量逐年遞減,許多品種瀕臨滅絕,因此,急需對(duì)野生菌資源進(jìn)行馴化保育工作。
將形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)(如DNA分子標(biāo)記技術(shù))相結(jié)合,由表及里的對(duì)野生菌進(jìn)行深層次的基因挖掘,從本質(zhì)上進(jìn)行鑒定。DNA分子標(biāo)記技術(shù)具有快速、準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn)[6-7],能夠?qū)π螒B(tài)差異較小的種間及種內(nèi)菌株進(jìn)行鑒別[8]。常用的食用菌DNA分子標(biāo)記方法主要有隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性(RAPD)[9]、簡(jiǎn)單序列重復(fù)區(qū)間擴(kuò)增多態(tài)性(ISSR)[10]、擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性 (AFLP)[11-12]、特征片段擴(kuò)增區(qū)域 (SCAR)[13]、核糖體DNA(rDNA-ITS)[14-15],其中核糖體 DNA(rDNA-ITS)是最常用的方法。核糖體 DNA(rDNA)中既包含保守的編碼區(qū)18S、5.8S和28S,適合種以下水平的研究[16];同時(shí)又包含進(jìn)化速率較快的非編碼區(qū),內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)1和2(ITS1和ITS2)以及非轉(zhuǎn)錄區(qū),承受的進(jìn)化選擇壓力較小,進(jìn)化速度較快,適合屬以下水平的研究[17]。
內(nèi)蒙古自治區(qū)東西地域跨度較大,地勢(shì)復(fù)雜、氣候多樣,因此野生食用菌資源較豐富、差異性大、特異性強(qiáng)。這就需要食用菌科研工作者加大力度進(jìn)行考察、收集、保育,充分挖掘內(nèi)蒙古大草原上的珍稀野生食用菌資源。鄂爾多斯位于內(nèi)蒙古自治區(qū)阿拉善-鄂爾多斯生物多樣性中心的核心區(qū)域,是生物多樣性研究的關(guān)鍵地帶[18]。筆者團(tuán)隊(duì)于2017年8月在對(duì)鄂爾多斯市野生食用菌資源考察時(shí)采集到一株野生食用菌樣品,當(dāng)?shù)匕傩辗Q(chēng)之為“紫蘑菇”,且已有很長(zhǎng)的食用歷史。通過(guò)組織分離及收集孢子的方式獲得純菌絲體,進(jìn)行馴化保育,并采用傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類(lèi)及分子生物學(xué)方法對(duì)樣品進(jìn)行系統(tǒng)的分析鑒定。
樣品編號(hào) gf7821,于2017年8月采自?xún)?nèi)蒙自治區(qū)西部鄂爾多斯市。樣品被帶回內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院進(jìn)行孢子收集,并通過(guò)組織分離方式獲得純菌絲體,后進(jìn)行了保藏、馴化。
主要試劑:植物基因DNA提取試劑盒(離心柱型),天根生化科技 (北京)有限公司;PCR引物ITS1/4,上海生工生物工程有限公司。
主要儀器:QS510C高壓滅菌鍋,重慶雅馬拓科技有限公司;SW-CJ-1F超凈工作臺(tái),蘇州安泰空氣科技有限公司;5430R高速離心機(jī),德國(guó)艾本德公司(eppendorf);TC-EA48DAPCR儀,杭州博日科技有限公司;DYY-6C電泳儀,北京市六一生物科技有限公司。
1.2.1 樣品采集
采集樣品后對(duì)其生態(tài)環(huán)境及外部形態(tài)進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)觀(guān)察,并詳細(xì)記錄,同時(shí)拍照。將樣品清理干凈,編號(hào)后帶回內(nèi)蒙古農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院。
1.2.2 孢子收集
將樣品菌柄用小刀削去泥土,放入超凈工作臺(tái),用75%的酒精擦拭菇體表面進(jìn)行消毒;再將菇體表面用無(wú)菌水快速?zèng)_洗3次,用滅過(guò)菌的吸水紙盡量吸干菇體表面水分;然后用灼燒過(guò)的鐵絲穿過(guò)菇體,菌褶向下懸掛于滅過(guò)菌的廣口瓶?jī)?nèi)收集擔(dān)孢子,于-70℃冰箱保存[19]。
1.2.3 母種及原種培養(yǎng)基
母種改良PDA培養(yǎng)基制作方法:馬鈴薯200 g·L-1、蔗糖 10 g·L-1、葡萄糖 10 g·L-1、酵母粉 1.5 g·L-1、蛋白胨 1.5 g·L-1、硫酸鎂 0.5 g·L-1、磷酸氫二鉀1 g·L-1、瓊脂10 g·L-1加蒸餾水定容至1 L。于高壓滅菌鍋121℃滅菌25 min后備用。
原種燕麥培養(yǎng)基制作方法:新鮮無(wú)霉變的燕麥粒用自來(lái)水清洗干凈,以料液比1.0∶1.6比例浸泡12 h,于高壓滅菌鍋121℃滅菌60 min后備用。
1.2.4 rDNA-ITS方法分子鑒定
1)DNA提取
子實(shí)體提?。簩⒐┰囎訉?shí)體置于65℃烘干箱內(nèi)8 h烘干,然后置于微量植物樣品粉碎機(jī)內(nèi)粉碎,分裝于離心管內(nèi),低溫處保藏以備DNA提取。稱(chēng)取適量子實(shí)體粉末,用天根試劑盒提取DNA。
菌絲體DNA提取:刮取適量母種改良PDA培養(yǎng)基上的菌絲,置于液氮中研磨后用試劑盒提取DNA。
2)PCR擴(kuò)增
ITS序列通用引物ITS1/ITS4,堿基序列如下。
ITS1:TCCGTAGGTGAACCTGCGG;ITS4:TCCTCCGCTTATTGATATGC。
PCR擴(kuò)增采用20 μL反應(yīng)體系:Mix 10 μL、引物各 1 μL、DNA 模板 2 μL、dd H2O 6 μL。
PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性40 s,50℃退火1 min,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);72℃繼續(xù)延伸10 min;4℃保存。
電泳條件為:1.2%瓊脂糖凝膠,電壓100 V。
經(jīng)過(guò)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,檢測(cè)合格送往英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司測(cè)序。
3)序列比對(duì)、序列的數(shù)據(jù)分析及系統(tǒng)進(jìn)化分析
將測(cè)序結(jié)果在NCBI中進(jìn)行BLAST比對(duì),根據(jù)比對(duì)序列結(jié)果及形態(tài)特征,進(jìn)行同源性分析,并用DNAman 8驗(yàn)證,確定相關(guān)信息。從GenBank隨機(jī)下載蘑菇科 (Agaricaceae)傘菌屬 (Agaricus)的種序列用于系統(tǒng)發(fā)育分析,利用MEGA 6.0軟件鄰接法 NJ(Neighbor-joining method,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),以自展法(Bootstrap 1 000次重復(fù))檢驗(yàn)各分支的置信度。
樣品采集地位于鄂爾多斯市烏審旗(108°17′36″E~109°40′22″E,37°38′54″N~39°23′50″N)。該地地處毛烏素沙漠腹部,海拔為1 300 m~1 400 m,年平均氣溫6.8℃,全年日照2 800 h~3 000 h,有效積溫2 800℃~3 000℃,年降水量350 mm~400 mm,年蒸發(fā)量2 200 mm~2 800 mm。
樣品子實(shí)體形態(tài)見(jiàn)圖1。
圖1 子實(shí)體外觀(guān)形態(tài)Fig.1 Appearance of the fruit body
如圖1所示,樣品子實(shí)體小型,為淺褐色,遇傷后變紅逐漸變紫,肉厚,有特殊的蘑菇香味;菌蓋呈不規(guī)則形狀、有少量淺褐色鱗片,菌蓋直徑3 cm ~7 cm,菌柄 (3~8)cm×(3~4)cm,圓柱或圓錐形;菌褶初期淺褐色,后漸變深褐色至黑色;菌柄上無(wú)菌環(huán)。子實(shí)體幼時(shí)主要生長(zhǎng)在土壤里,成熟時(shí)依舊半生或全部在土壤里。
通過(guò)組織分離方法,將菌種塊移至改良的PDA平板培養(yǎng)基上,25℃下避光培養(yǎng)。試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)圖2、圖3。
圖2 菌絲體發(fā)育成“小蘑菇”Fig.2 Mycelium develops into‘small fruit body’
圖3 菌絲體發(fā)育成“蘑菇圈”Fig.3 The mycelium develops into a‘mushroom circle’
如圖2、圖3所示,一段時(shí)間后發(fā)現(xiàn)菌絲體長(zhǎng)成多個(gè)塊狀的凸起,并不斷長(zhǎng)大,從外觀(guān)上看類(lèi)似于原基,直至長(zhǎng)成一個(gè)“小蘑菇”,有的甚至形成類(lèi)似于“蘑菇圈”的形態(tài)。將“小蘑菇”用解剖刀切開(kāi),見(jiàn)圖4。
圖4 “小蘑菇”解剖橫面圖Fig.4 Anatomical cross section of‘little mushroom’
如圖4所示,為蘑菇形狀的解剖橫面圖。再將母種轉(zhuǎn)接至燕麥粒原種培養(yǎng)基中,在25℃下避光培養(yǎng),見(jiàn)圖5。
圖5 燕麥二級(jí)培養(yǎng)基菌種Fig.5 Secondary strain in oat medium
如圖5所示,可得到菌絲潔白、濃密、粗壯的二級(jí)原種。
經(jīng)測(cè)定,樣品子實(shí)體的rDNA ITS序列長(zhǎng)度為950 bp。于2020年6月11日將測(cè)序結(jié)果通過(guò)NCBI進(jìn)行BLAST比對(duì),取其中最大評(píng)分和同源性較高的8個(gè)序列比對(duì)結(jié)果見(jiàn)表1。
如表1所示,樣品gf7821與Agaricus padanus同源性最高,為98.33%~98.20%。將二者再次進(jìn)行比對(duì)驗(yàn)證,在GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中下載A.padanus的ITS序列,用DNAman 8軟件進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果見(jiàn)圖6。
圖6 序列比對(duì)部分圖Fig.6 Diagramof sequence alignment
由圖6可知,序列一致度(identity)為68.18%,進(jìn)一步說(shuō)明分子水平上可確定gf7821為蘑菇科一個(gè)新的種。
從GenBank中隨機(jī)下載蘑菇科傘菌屬的種的序列,軟件生成的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),見(jiàn)圖7。
從圖7中可以看出,樣品gf7821與A.padanus聚為一類(lèi),且在外圍,自展支持率為100%;而樣品gf7821與Agaricus amicosus自展支持率為42%,與其他的序列則均不在同一類(lèi)群上,遺傳距離更遠(yuǎn)。由此分析可能樣品gf7821與A.padanus可能在進(jìn)化史、生活史上存在一定的關(guān)聯(lián),而與A.padanus及其他種可能有區(qū)域性差異或是生理生化特點(diǎn)上本質(zhì)差異。
圖7 基于ITS序列的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)Fig.7 Bootstrap tree based on ITS sequences
樣品gf7821采集于氣候干燥、毛烏素沙漠腹部的內(nèi)蒙古西部鄂爾多斯市,獨(dú)特的氣候環(huán)境下生長(zhǎng)的樣品gf7821有其獨(dú)一無(wú)二的特點(diǎn)。樣品gf7821因其獨(dú)特的味道深受當(dāng)?shù)厝讼矏?ài),但也因此遭到當(dāng)?shù)厝诉^(guò)度采食而瀕臨滅絕,因此,應(yīng)該受到重視,以保護(hù)這一珍貴的資源。
gf7821在母種階段形成獨(dú)特的原基結(jié)構(gòu)“小蘑菇”,由于其獨(dú)特的生長(zhǎng)方式,可以考慮其出菇方式及形式是否也存在特異性,這是接下來(lái)工作需要突破的方向;形成類(lèi)似的“蘑菇圈”是否與草原蘑菇也有相似的生活史及相同的生理生化特點(diǎn)也是值得深思的。通過(guò)形態(tài)學(xué)描述及分子標(biāo)記法最終確定gf7821為蘑菇科的一個(gè)新種,結(jié)論具有可靠性。通過(guò)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),gf7821與A.padanus為同一類(lèi)群可能在進(jìn)化史、生活史上存在一定的關(guān)聯(lián)。A.padanus首次記錄于意大利,在中國(guó)境內(nèi)首次記錄于2012年新疆的艾比湖附近[20],可參考A.padanus一些相關(guān)報(bào)道對(duì)gf7821進(jìn)行人工馴化及生理生化特點(diǎn)分析,但必須考慮自身特點(diǎn)。
由于蘑菇科傘菌屬真菌不僅味道鮮美,且在食(藥)用方面占有重要地位,因此推斷該種gd7821具有一定的開(kāi)發(fā)價(jià)值,需進(jìn)一步研究和探討,為人工馴化提供可靠依據(jù)。