王蕾 李梓宇 鐘英英 安歡 葉云
摘? 要:為分析羅漢果治療肺癌的潛在作用機(jī)制,通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析得出羅漢果中有182個(gè)潛在有效成分,運(yùn)用化合物-靶點(diǎn)及蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)篩選出4個(gè)與抗肺癌相關(guān)的有效成分及5個(gè)抗肺癌關(guān)鍵靶點(diǎn)。這5個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)主要富集在cAMP、HIF-1和TNF等信號(hào)通路,且5個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)在肺癌組織中的轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平有差異表達(dá),與患者的預(yù)后相關(guān)。對(duì)上述有效成分及關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接,結(jié)果表明,關(guān)鍵靶點(diǎn)SRC基因與山柰酚對(duì)接效果最高,為-9.9 kJ/mol。本研究初步揭示了羅漢果中多成分、多靶點(diǎn)、多通路治療肺癌的作用機(jī)制,為進(jìn)一步探究肺癌的治療策略提供借鑒。
關(guān)鍵詞:羅漢果;肺癌;網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué);山柰酚;酒渣堿;信號(hào)通路
中圖分類號(hào):R285.5? ? ? ? DOI:10.16375/j.cnki.cn45-1395/t.2022.02.016
0? ? 引言
肺癌是全球最常見(jiàn)的惡性腫瘤,起源于支氣管黏膜或腺體,且具有惡性程度高、預(yù)后差等特點(diǎn)[1]。全球腫瘤統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,肺癌的發(fā)病率和死亡率均遠(yuǎn)高于其他惡性腫瘤,位居首位,在我國(guó)早已取代肝癌成為惡性腫瘤首位死因,其5年生存率僅為20%[2-3]。當(dāng)前肺癌主要采取以手術(shù)治療為主的綜合治療,由于肺癌早期無(wú)明顯癥狀,80%的患者確診時(shí)已是晚期[4],基本無(wú)法通過(guò)手術(shù)治愈。采用化療手段對(duì)患者進(jìn)行治療時(shí),因其對(duì)腫瘤細(xì)胞無(wú)選擇性,導(dǎo)致在殺滅腫瘤細(xì)胞時(shí),也殺傷了正常細(xì)胞,嚴(yán)重降低了患者的生活質(zhì)量。此外,腫瘤的耐藥性等原因也使得治療難度加大,因此,尋找一種能有效治療肺癌且副作用小的治療方式具有重要 意義[5]。
羅漢果是葫蘆科羅漢果屬植物的成熟果實(shí),是一類藥食同源、主產(chǎn)廣西的中藥,其味甘、性涼?,F(xiàn)代藥理研究顯示,羅漢果具有清熱潤(rùn)肺、利咽開(kāi)音、潤(rùn)腸通便等功效[6],且具有保護(hù)肝臟、降糖降血脂、抗氧化、抑菌消炎和抗癌等藥理作用[7-8]。目前絕大多數(shù)治療肺癌的藥物屬于毒副作用大的化學(xué)合成藥物,因此,低毒的天然化合物對(duì)研發(fā)抗癌新藥有著廣闊的應(yīng)用前景[9]。有實(shí)驗(yàn)表明羅漢果苷水溶液的各項(xiàng)毒理學(xué)觀察參數(shù)均未超過(guò)安全標(biāo)準(zhǔn),Ames致突變?cè)囼?yàn)結(jié)果顯示陰性,表明羅漢果提取物的低毒性適合用來(lái)研發(fā)新藥[10]。羅漢果醇對(duì)多種癌癥具有很好的防癌和抗癌作用,并且羅漢果醇的濃度越高,抑制癌細(xì)胞增殖的能力越強(qiáng)[11],這充分說(shuō)明了羅漢果具有治療肺癌的功效。由于中藥本身具有復(fù)雜性,現(xiàn)有研究對(duì)羅漢果如何抗肺癌的作用機(jī)制仍不明確,無(wú)法系統(tǒng)、科學(xué)地闡述其作用機(jī)制,使得羅漢果在臨床應(yīng)用上受到制約,因此,探討羅漢果對(duì)肺癌的作用機(jī)制極有意義。
基于網(wǎng)絡(luò)大數(shù)據(jù)的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法適合用來(lái)研究具有多成分、多靶點(diǎn)、多通路的中藥作用機(jī)理。本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,挖掘羅漢果治療肺癌的有效成分、篩選肺癌相關(guān)作用靶點(diǎn),分析這些有效成分和靶點(diǎn)蛋白的作用,并構(gòu)建相應(yīng)的網(wǎng)絡(luò)藥理圖,篩選得到關(guān)鍵靶點(diǎn)。最后在數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證,為在臨床上應(yīng)用羅漢果治療或輔助治療肺癌提供理論支撐。
1? ? 材料與方法
1.1? ?材料
TCMSP(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform)數(shù)據(jù)庫(kù)(http://tcmspw.com/tcmsp.php)、SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.swisstargetprediction.ch/)、GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)(https.//www.genecards.org/)、STRING數(shù)據(jù)庫(kù)(https://string-db.org/)、Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)(metascape.org/)、Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)(https://kmplot.com/analysis/)、GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)(http://gepia.cancer-pku.cn/)、HPA數(shù)據(jù)庫(kù)(the human protein atlas,https://www.proteinatlas.org/)、PDB數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.rcsb.org/)、Venny 2.1在線作圖網(wǎng)站、 Cytoscape 3.6.1軟件、PyMOL軟件、Auto Dock軟件等。
1.2? ?方法
1.2.1? ? 羅漢果有效成分和成分靶點(diǎn)的搜集
通過(guò)TCMSP平臺(tái)檢索羅漢果的全部有效成分,通過(guò)成分藥物動(dòng)力學(xué)參數(shù)進(jìn)行篩選。相關(guān)篩選條件為:口服利用度(oral bioavailability, OB)≥30%,藥物相似性(drug-likeness,DL)≥ 0.18。將羅漢果中的目標(biāo)化合物結(jié)構(gòu)導(dǎo)入SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù)中,對(duì)羅漢果的有效成分進(jìn)行作用靶點(diǎn)預(yù)測(cè),得到羅漢果有效成分的作用靶點(diǎn)集合。
1.2.2? ?羅漢果有效成分靶點(diǎn)與肺癌靶點(diǎn)的搜集
通過(guò)GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù),以“Lung Cancer”作為關(guān)鍵詞檢索肺癌相關(guān)靶點(diǎn)。將搜集到的肺癌靶點(diǎn)與羅漢果有效成分靶點(diǎn)導(dǎo)入Venny 2.1在線作圖網(wǎng)站,得到羅漢果有效成分抗肺癌的交集靶點(diǎn)。
1.2.3? ?構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”及關(guān)鍵靶點(diǎn)的蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)
將羅漢果有效成分與其抗肺癌交集靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape 3.6.1軟件中,構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò),通過(guò)STRING數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)羅漢果抗肺癌的交集靶點(diǎn)進(jìn)行分析,蛋白種類為“Homo- sapiens”,構(gòu)建羅漢果治療肺癌的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),使用Cytoscape 3.6.1 軟件對(duì)蛋白相互作用圖進(jìn)行可視化。
1.2.4? ?關(guān)鍵基因靶點(diǎn)的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析
利用Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行GO(gene ontology)功能富集分析和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)生物學(xué)通路富集分析,P < 0.05作為顯著差異篩選條件,將分析得到的結(jié)果利用微生信(http://www.bioinformatics.com.cn/)在線繪圖。
1.2.5? ? 構(gòu)建關(guān)鍵基因靶點(diǎn)在肺組織中的蛋白表達(dá)圖
使用HPA數(shù)據(jù)庫(kù)獲得關(guān)鍵靶點(diǎn)基因在正常組織與肺癌組織中的蛋白表達(dá)圖。
1.2.6? ? 構(gòu)建生存曲線
通過(guò)Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行生存分析,得到關(guān)鍵靶點(diǎn)基因在肺癌中的生存曲線圖,獲得基因表達(dá)與疾病預(yù)后的信息。P < 0.05代表有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
1.2.7? ? 分子對(duì)接驗(yàn)證
在TCSMP數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得羅漢果有效成分的結(jié)構(gòu);在PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取關(guān)鍵靶點(diǎn)基因的3D結(jié)構(gòu);然后通過(guò)PyMOL軟件脫水去除活性中心的配體,使用Auto Dock軟件進(jìn)行分子對(duì)接,以結(jié)合能作為評(píng)價(jià)對(duì)接結(jié)果的標(biāo)準(zhǔn)。
2? ? 結(jié)果
2.1? ?羅漢果有效成分及其靶點(diǎn)的收集
檢索TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù),其中收錄了羅漢果182個(gè)有效成分。進(jìn)一步以O(shè)B≥30%和DL≥0.18作為篩選條件,獲得有效成分11個(gè),如表1所示。根據(jù)是否與肺癌相關(guān),篩選得到9個(gè)有效成分(MOL-010105、MOL010131、MOL001494、MOL001-506、MOL001749、MOL002140、MOL000358、MOL000422、MOL009295),再通過(guò)SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)9個(gè)有效成分進(jìn)行靶點(diǎn)垂釣,檢索到羅漢果有效成分的作用靶點(diǎn)428個(gè),刪除無(wú)效和重復(fù)的靶點(diǎn)后,獲得羅漢果有效成分靶點(diǎn)312個(gè)。
2.2? ?獲取有效成分靶點(diǎn)與疾病靶點(diǎn)的共同靶點(diǎn)
檢索GeneCards人類基因數(shù)據(jù)庫(kù),收集到肺癌疾病靶點(diǎn)22 399個(gè)。通過(guò)在線Venny 2.1,將312個(gè)有效成分潛在靶點(diǎn)與22 399個(gè)肺癌靶點(diǎn)取交集,得到295個(gè)共同靶點(diǎn),如圖1所示。將這295個(gè)共同靶點(diǎn)作為羅漢果有效成分抗肺癌的預(yù)測(cè)靶點(diǎn)來(lái)進(jìn)行下一步的分析。
2.3? ?“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)和PPI網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析
將羅漢果中的9個(gè)有效成分與295個(gè)共同靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape軟件,構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析,如圖2(a)所示。橙色圓形代表靶點(diǎn);紫色菱形代表化合物。該“化合物-靶點(diǎn)”互作網(wǎng)絡(luò)中明顯度值較大的依次排列為:kaempferol(山柰酚)、flazin(酒渣堿)、beta-sitosterol(β-谷甾醇)和mandenol(甘露醇),說(shuō)明這4種化合物極有可能是羅漢果治療肺癌的關(guān)鍵化合物。
將得到的295個(gè)共同靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建各靶點(diǎn)之間的PPI網(wǎng)絡(luò)圖,如圖2(b)所示。在PPI網(wǎng)絡(luò)中,共有295個(gè)節(jié)點(diǎn)和1 002條邊,連線緊密表明靶點(diǎn)之間聯(lián)系較為密切。在PPI網(wǎng)絡(luò)中度值(Degree值)較高,處于核心位置的靶點(diǎn)有AKT1、SRC、EGFR、ESR1、MMP9。
2.4? ?GO功能富集分析和KEGG通路富集分析
為了進(jìn)一步研究羅漢果抗肺癌的生物學(xué)功能,通過(guò)Metascape數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)上述295個(gè)共同靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。以? ? P < 0.05作為篩選條件,共得到201個(gè)生物過(guò)程(biological process,BP),52個(gè)分子功能(molecular function,MF),47個(gè)細(xì)胞組分(cellular component,CC)和87條KEGG通路。富集程度排名前20位的分析結(jié)果如圖3(a)—圖3(c)所示。主要富集的生物過(guò)程包括:細(xì)胞對(duì)有機(jī)環(huán)狀化合物、氮化合物的反應(yīng),對(duì)脂質(zhì)代謝過(guò)程、系統(tǒng)過(guò)程、類固醇代謝過(guò)程的調(diào)節(jié),以及調(diào)控激素水平和MAPK級(jí)聯(lián)反應(yīng)等。分子功能則主要富集在分子功能的激素結(jié)合與一元羧酸結(jié)合、蛋白激酶活性、核受體活性、碳酸鹽脫水酶活性、氧化還原酶活性等。另外,靶點(diǎn)主要與膜筏、神經(jīng)元細(xì)胞體、囊泡腔、突觸后膜、內(nèi)溶酶體腔等細(xì)胞組分有密切關(guān)系。
關(guān)鍵靶點(diǎn)的KEGG通路富集分析排名前20位的分析結(jié)果如圖3(d)所示,靶點(diǎn)主要參與氮代謝、細(xì)胞凋亡、cAMP通路、缺氧誘導(dǎo)因子(HIF-1)信號(hào)通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號(hào)通路、PPAR信號(hào)通路以及AMPK信號(hào)通路等。
2.5? ?關(guān)鍵靶點(diǎn)的基因表達(dá)差異分析
在轉(zhuǎn)錄水平上,通過(guò)檢索GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn),與正常肺組織相比,MMP9在肺腺癌組織中的表達(dá)存在顯著差異,如圖4所示。說(shuō)明其可能在肺癌的發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮比較重要的作用。
圖4? ?(網(wǎng)絡(luò)版彩圖)肺腺癌和正常肺組織中AKT1、 EGFR、ESR1、MMP9和SRC的表達(dá)差異圖
2.6? ?關(guān)鍵靶點(diǎn)在肺組織中的蛋白表達(dá)
為進(jìn)一步了解關(guān)鍵靶點(diǎn)SRC、AKT1、ESR1、MMP9和EGFR在肺癌中的差異表達(dá),在蛋白表達(dá)水平對(duì)其進(jìn)行驗(yàn)證。通過(guò)檢索HPA數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn),這些關(guān)鍵靶點(diǎn)基因編碼的蛋白在正常肺組織與肺癌患者肺組織中的表達(dá)量均存在顯著性差異,如圖5所示。其中,在肺癌腫瘤組織中,SRC低表達(dá),AKT1、ESR1、MMP9和EGFR則高表達(dá)。這些結(jié)果進(jìn)一步提示這些靶點(diǎn)在蛋白水平上的表達(dá)異??赡芘c肺癌的發(fā)生發(fā)展有一定的關(guān)系。
2.7? ?生存曲線圖
由圖6可以看出,除AKT1外(P=0.071),其他4個(gè)基因的表達(dá)與總體生存率均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P [<] 0.05)。其中SRC、MMP9低表達(dá)的患者總體生存率優(yōu)于高表達(dá)組,而ESR1和EGFR高表達(dá)的患者總體生存率則優(yōu)于低表達(dá)組。另外,SRC、MMP9的風(fēng)險(xiǎn)比HR > 2,表明這2個(gè)基因?yàn)榉蜗侔┑奈kU(xiǎn)因素。
2.8? ?分子對(duì)接
將關(guān)鍵核心靶點(diǎn)與有效成分進(jìn)行分子對(duì)接,得到的結(jié)果如表2所示。若結(jié)合能小于-20.93 kJ/mol,則表明其有較穩(wěn)定的結(jié)合活性。山柰酚、酒渣堿、β-谷甾醇與關(guān)鍵靶點(diǎn)SRC、AKT1、ESR1、EGFR分子對(duì)接結(jié)果都低于-20.93 kJ/mol,其中SRC與山柰酚、酒渣堿及β-谷甾醇結(jié)合最穩(wěn)定,分別為? ? ? ?-9.60 kJ/mol、-8.17 kJ/mol和-9.00 kJ/mol,表明羅漢果中核心活性成分與抗肺癌核心靶點(diǎn)的分子對(duì)接效果良好。
3? ? 討論
3.1? ?羅漢果有效成分分析
根據(jù)“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)得到羅漢果4個(gè)有效成分,分別為酒渣堿、山柰酚、β-谷甾醇和甘露醇。酒渣堿屬于β-咔啉類化合物,可以促進(jìn)抑癌基因PTEN表達(dá),抑制ERK基因表達(dá),抑制ERK信號(hào)通路的激活,從而促進(jìn)癌細(xì)胞凋亡。β-咔啉類生物堿可以特異性抑制細(xì)胞分裂周期CDK基因,從而抑制癌細(xì)胞增殖[12-13]。近年來(lái)相關(guān)研究表明,山柰酚具有多種抗癌活性[14-15],通過(guò)上調(diào)p53和bax的表達(dá)、下調(diào)bcl-2的表達(dá)水平使細(xì)胞發(fā)生凋亡[16]。此外,山柰酚能從mRNA和蛋白水平抑制ER-Ra的表達(dá),使非小細(xì)胞肺癌A549細(xì)胞的侵襲和遷移能力降低[17-18]。β-谷甾醇具有抗炎作用,通過(guò)阻止炎癥因子TNF-α和IL-6的釋放以及下調(diào)NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,有效減輕由LPS所致的肺水腫和炎癥反應(yīng)[19-20]。甘露醇多作為一種輔助藥物治療腫瘤,作脫水劑使癌細(xì)胞脫水,減緩癌細(xì)胞代謝及生長(zhǎng)??赏ㄟ^(guò)暫時(shí)性開(kāi)放血腦屏障,提高顱內(nèi)藥物濃度,預(yù)防非小細(xì)胞癌腦轉(zhuǎn)移[21]。
3.2? ?羅漢果核心基因分析
蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選出的SRC、EGFR、ESR1、MMP9、AKT1可能是羅漢果治療肺癌的關(guān)鍵靶點(diǎn)。SRC在NSCLC細(xì)胞中過(guò)表達(dá)后,通過(guò)誘導(dǎo)NSCLC增殖和轉(zhuǎn)移以及激活Fn14/NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),可阻斷槲皮素的抗NSCLC作用[22]。EGFR可以過(guò)表達(dá),激活下游重要的信號(hào)通路,加速細(xì)胞增殖和抑制細(xì)胞凋亡。EGFR-TKIs(EGFR酪氨酸激酶抑制劑)可顯著改善具有EGFR激活突變的NSCLC患者的總體生存期和無(wú)進(jìn)展生存期,且EGFR-TKIs可阻斷EGFR分子活化,抑制EGFR同源或與ERBB3異源二聚體的形成,從而抑制EGFR,阻止下游的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),起到抑制細(xì)胞增殖、加速細(xì)胞程序性死亡的作用[23]。ESR1(雌激素受體1)和I期非小細(xì)胞肺癌患者肺組織中HOXC9基因甲基化的頻率高于非癌性病變患者,說(shuō)明ESR1和NSCLC有密切聯(lián)系,而SNAI2/SLUG與ESR1 mRNA表達(dá)呈顯著負(fù)相關(guān)(P < 0.000 1),說(shuō)明雌激素受體途徑對(duì)這些惡性特征有重大影響[24]。MMP9屬于基質(zhì)金屬蛋白酶家族,研究表明,MMP9在人非小細(xì)胞肺癌組織中的表達(dá)顯著高于病灶旁邊的正常肺組織和良性病變肺組織。并且據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,MMP9的蛋白陽(yáng)性率及mRNA表達(dá)水平與非小細(xì)胞肺癌的臨床分期、分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移密切相關(guān),由此可以說(shuō)明MMP9在非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生和發(fā)展進(jìn)程中起著較為重要的作用[25]。AKT1異?;罨瘯?huì)促進(jìn)癌細(xì)胞生長(zhǎng),抑制細(xì)胞凋亡,通過(guò)抑制或阻斷AKT通路,可以起到抑制肺癌的作用[26]。
3.3? ?羅漢果富集結(jié)果分析
GO功能富集分析顯示類固醇代謝、激素水平調(diào)節(jié)、激素結(jié)合、蛋白激酶活性這些生物學(xué)過(guò)程與癌癥的代謝與發(fā)展有著密切的聯(lián)系。KEGG通路分析發(fā)現(xiàn)羅漢果主要通過(guò)癌癥通路、神經(jīng)活性配體受體相互作用信號(hào)通路、cAMP信號(hào)通路和HIF-1信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路等通路參與調(diào)控,cAMP信號(hào)通路在細(xì)胞中對(duì)許多胞外刺激(如激素、生長(zhǎng)因子等)所引起的反應(yīng)起著重要作用,參與調(diào)控細(xì)胞增殖、凋亡等生理活動(dòng)[27]。研究表明,HIF-1信號(hào)通路調(diào)控并參與細(xì)胞葡萄糖代謝、細(xì)胞增殖及血管形成的蛋白質(zhì)表達(dá),在缺氧的環(huán)境下誘導(dǎo)產(chǎn)生HIF-1α,激活下游靶基因VEGF,從而誘發(fā)腫瘤細(xì)胞生成血管[28]。以上結(jié)果表明羅漢果的有效成分通過(guò)這些生物學(xué)過(guò)程及通路參與肺癌的 治療。
由GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)的基因差異表達(dá)結(jié)果可知,SRC、AKT1、ESR1、MMP9和EGFR這5個(gè)靶點(diǎn)基因在正常肺組織和肺癌患者肺組織中有極顯著的表達(dá)差異。SRC、AKT1和MMP9低表達(dá)組的患者總體生存率大于高表達(dá)組,而ESR1和EGFR高表達(dá)組的患者總體生存率大于低表達(dá)組。以上結(jié)果說(shuō)明,SRC、AKT1、ESR1、MMP9和EGFR在正常組織和肺癌組織中的蛋白水平存在差異,且與肺癌的預(yù)后密切相關(guān),從而更有力地說(shuō)明這些關(guān)鍵靶點(diǎn)與肺癌緊密相關(guān),影響著肺癌的發(fā)生與發(fā)展過(guò)程。
4? ? 結(jié)論
本研究發(fā)現(xiàn)羅漢果中9個(gè)與肺癌相關(guān)的有效成分,檢索這9個(gè)有效成分的靶點(diǎn)與肺癌相關(guān)靶點(diǎn),取交集得到295個(gè)作用靶點(diǎn),分析295個(gè)作用靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)氮代謝信號(hào)通路、cAMP信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路等多條信號(hào)通路為主要作用通路。通過(guò)“化合物-靶點(diǎn)”與PPI網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建,篩選出與抗肺癌高度相關(guān)的4個(gè)有效成分和5個(gè)關(guān)鍵作用靶點(diǎn)。在蛋白水平上驗(yàn)證了5個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)的表達(dá)與肺癌發(fā)生發(fā)展有一定關(guān)系,生存分析結(jié)果進(jìn)一步說(shuō)明5個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)與肺癌患者的預(yù)后密切相關(guān)。本研究分析了羅漢果通過(guò)多成分、多靶點(diǎn)、多通路治療肺癌的作用機(jī)制,為深入研究羅漢果治療肺癌的作用機(jī)制提供了一定的參考,為臨床上應(yīng)用中藥治療肺癌和中藥現(xiàn)代化提供了新思路。
參考文獻(xiàn)
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The mechanism of the effective ingredients of Siraitia
grosvenorii in the treatment of lung cancer based on
network pharmacology
WANG Lei, LI Ziyu, ZHONG Yingying, AN Huan, YE Yun*
(School of Biological and Chemical Engineering, Guangxi University of Science and Technology,
Liuzhou 545006, China)
Abstract: The mechanism of the potential effects of Siraitia grosvenorii in the treatment of lung cancer was analyzed. 182 potential active ingredients were found in Siraitia grosvenorii through TCMSP? ? ? database and network pharmacological analysis. Four active ingredients and five key anti-lung cancer targets were screened by component-target and protein-protein interaction network. These 5 key targets were mainly enriched in cAMP, HIF-1 and TNF signaling pathways, and the transcription level and? protein level of them were differentially expressed in lung cancer tissues, which was related to the? prognosis of patients. The results of molecular docking with the above active ingredients and key? ? ? ?targets show that the docking effect of key target SRC gene with kaempferol was -9.9 kJ/mol, the? ?highest. This study reveals the mechanism of multi-ingredient, multi-target and multi-pathway of? ? ? ?Siraitia grosvenorii in the treatment of lung cancer, providing reference for further exploration of the strategies of lung cancer treatment.
Key words: Siraitia grosvenorii; lung cancer; network pharmacology; kaempferol; flazin; signaling? ? ?pathway
(責(zé)任編輯:于艷霞)