王玉霞,羅祿軍,張 賽,黃曉斐,賈廣韜,孫同毅,高媛媛
(濰坊醫(yī)學(xué)院1.藥學(xué)院,2.生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,山東省蛋白質(zhì)與多肽藥物工程實(shí)驗(yàn)室,山東省高校生物藥物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 濰坊 261053)
抗生素的廣泛使用甚至濫用導(dǎo)致耐藥性菌株種類和數(shù)量驚人地增長(zhǎng),已成為全球性公共衛(wèi)生安全問(wèn)題[1]。抗菌肽是具有抗菌活性的多肽分子[2],相比于傳統(tǒng)抗生素,不易產(chǎn)生耐藥性,作為對(duì)抗抗生素耐藥細(xì)菌的潛在候選藥物備受關(guān)注。抗菌肽存在于絕大多數(shù)生命體中(包括病毒、原核微生物、真核微生物、原生生物、植物、魚(yú)類、昆蟲(chóng)、兩棲類、爬行類和哺乳動(dòng)物等),是生物經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期進(jìn)化適應(yīng)外在生存環(huán)境的產(chǎn)物。組蛋白來(lái)源的抗菌肽多存在于魚(yú)類等水生生物體內(nèi),與組蛋白氨基酸序列高度相似,在不同生命體中擁有較高的保守性[3],因其優(yōu)良的抗菌特性成為近幾年的研究熱點(diǎn)[4]。
抗菌肽buforin是其中一類組蛋白來(lái)源的抗菌肽,主要包括buforin Ⅰ,buforin Ⅱ和buforin Ⅱ衍生肽。buforin Ⅰ最早由Park等[5]從亞洲蟾蜍的胃組織中分離得到,是首個(gè)被挖掘的buforin家族抗菌肽。組蛋白H2A通過(guò)在蛙胃部冗余表達(dá)并分泌到胃內(nèi)腔,經(jīng)過(guò)胃蛋白酶C的切割,形成含有39個(gè)氨基酸殘基的多肽,即buforin Ⅰ,其具有較強(qiáng)抗菌活性(表1),形成的抗菌層可以防止外來(lái)細(xì)菌侵襲蛙胃[6]。buforin Ⅱ是buforin Ⅰ在胞內(nèi)經(jīng)蛋白酶進(jìn)一步切割后得到的含21個(gè)氨基酸殘基的多肽[7],其抗菌活性較buforin Ⅰ有較大提高,且具有良好的抗癌活性。本文對(duì)buforin Ⅱ及其重要衍生肽的結(jié)構(gòu)及其抗菌和抗癌活性的最新研究進(jìn)展進(jìn)行綜述,為改造現(xiàn)有抗菌肽,開(kāi)發(fā)生物活性、安全性和穩(wěn)定性更好的潛力分子及其臨床應(yīng)用提供思路。
表1 buforin及其衍生肽的抑菌活性[5,7,9]
buforin Ⅱ的氨基酸序列為T(mén)RSSRAGLQFPVGRVHRLLRK,含有5個(gè)精氨酸(arginine,Arg)和1個(gè)賴氨酸,帶6個(gè)正電荷。buforin Ⅱ二級(jí)結(jié)構(gòu)的分子動(dòng)力學(xué)(molecular dynamics,MD)模擬結(jié)果表明,C端由兩親性α螺旋構(gòu)成,正電荷側(cè)鏈和疏水側(cè)鏈分布在螺旋的兩面。多肽主鏈上第11位氨基酸——脯氨酸處的剛性吡咯環(huán)打斷了α螺旋,形成了一個(gè)脯氨酸鉸鏈,在鉸鏈的N端形成了一個(gè)額外螺旋區(qū)[7]。buforin Ⅱ具有獨(dú)特的分子結(jié)構(gòu),從N端到C端依次為“螺旋-脯氨酸鉸鏈-兩親性螺旋”(圖1A),此特殊結(jié)構(gòu)使其具有獨(dú)特的抗菌機(jī)制。隨著對(duì)其結(jié)構(gòu)與功能探索的深入,研究者以buforin Ⅱ?yàn)樗{(lán)本設(shè)計(jì)了大量buforin Ⅱ衍生肽,對(duì)抗菌肽結(jié)構(gòu)與功能的研究起到了促進(jìn)作用。
圖1 Buforin Ⅱ結(jié)構(gòu)(A)及其選擇性穿膜(B)、抗菌(C)、抗癌(D)機(jī)制.Arg:精氨酸;Pro:脯氨酸;Lys:賴氨酸.
buforin Ⅱ的二級(jí)結(jié)構(gòu)與陽(yáng)離子螺旋抗菌肽,特別是等陽(yáng)離子螺旋抗菌肽(cathelicidin)家族的LL-37[8]極其相似。LL-37通過(guò)利用正電荷的氨基酸殘基(Arg/賴氨酸)靶向細(xì)菌帶負(fù)電荷的磷脂和脂多糖,通過(guò)擾動(dòng)細(xì)胞膜發(fā)揮抗菌作用。但大量研究結(jié)果表明,有別于LL-37等陽(yáng)離子螺旋抗菌肽家族抗菌肽,buforin Ⅱ是穿透細(xì)胞膜而非破壞細(xì)胞膜發(fā)揮作用。因此,研究buforin Ⅱ的穿膜機(jī)制有重要意義。
脯氨酸鉸鏈和“Arg面”賦予buforin Ⅱ穿透細(xì)胞膜而不破壞細(xì)胞膜的特殊生物活性。Uyterhoeven等[9]研究表明,buforin Ⅱ一級(jí)氨基酸序列可在水溶液中形成“螺旋-脯氨酸鉸鏈-兩親性螺旋”的二級(jí)結(jié)構(gòu),而其最重要特點(diǎn)是5個(gè)Arg處于一個(gè)平面,形成一個(gè)“Arg面”。這個(gè)“Arg面”帶有5個(gè)正電荷,在遇到負(fù)電荷磷脂分子時(shí),通過(guò)電荷吸引,分子迅速反轉(zhuǎn)使“Arg面”朝向膜[10]。肽的N端和C端以脯氨酸鉸鏈為核心發(fā)生構(gòu)象轉(zhuǎn)變,與Arg接觸的磷脂分子迅速向內(nèi)部塌陷,形成瞬時(shí)孔道進(jìn)入胞內(nèi)[11](圖1B)。當(dāng)11位脯氨酸被置換為其他氨基酸時(shí)破壞細(xì)胞膜,而非穿透細(xì)胞膜,驗(yàn)證了脯氨酸鉸鏈?zhǔn)莃uforin Ⅱ穿膜而非破膜的關(guān)鍵[7,12]。
與此同時(shí)更多的數(shù)據(jù)表明,富集的Arg是穿膜肽的一個(gè)重要特征,許多穿膜肽如Tat,tachyplesin Ⅰ和bactenecin-7等均可通過(guò)在序列中富集的Arg發(fā)揮穿膜功能[13]。而buforin Ⅱ形成的“Arg面”驗(yàn)證了這一觀點(diǎn),為之后改造多肽和預(yù)測(cè)多肽結(jié)構(gòu)提供了理論基礎(chǔ)。此外,由于buforin Ⅱ可通過(guò)獨(dú)特的穿膜機(jī)制將藥物遞送至胞內(nèi)而未破壞細(xì)胞,在藥物遞送方面也具有潛在的應(yīng)用價(jià)值[14-16]。
buforin Ⅱ?qū)?xì)菌(G+/G-)和真菌均有廣譜高效的抗菌能力(表1)。buforin Ⅱ?qū)追N典型的G+/G-菌均有較強(qiáng)的抑菌活性(最低抑菌濃度≤4 mg·L-1),且對(duì)真菌的抑菌活性(最低抑菌濃度為1 mg·L-1)強(qiáng)于細(xì)菌。根據(jù)buforin Ⅱ穿膜而不破膜的特殊機(jī)制,推測(cè)其抗菌靶點(diǎn)在胞內(nèi)。Uyterhoeven等[9]推測(cè)其胞內(nèi)靶點(diǎn)為帶負(fù)電的DNA,并進(jìn)行了buforin Ⅱ與DNA體外MD模擬。結(jié)果表明,buforin Ⅱ與DNA的雙螺旋大溝緊密結(jié)合,且結(jié)合前后多肽構(gòu)象并未發(fā)生顯著改變(圖1C)。buforin Ⅱ各氨基酸側(cè)鏈與DNA結(jié)合時(shí)的相互作用研究結(jié)果表明,Arg2,Arg14和Arg20與DNA的相互作用能較高。借此驗(yàn)證了細(xì)菌DNA可能是buforin Ⅱ的抗菌靶點(diǎn)之一。
郝剛課題組[17-18]對(duì)buforin Ⅱ及其衍生肽的抗菌機(jī)制做了較多研究,主要有以下結(jié)果:①buforin Ⅱ可與DNA靜電吸附結(jié)合,通過(guò)消除堿基堆砌力使雙螺旋構(gòu)型解旋達(dá)到抗菌效果;②buforin Ⅱ與DNA結(jié)合部分較為保守,AT堿基對(duì)的濃度越高,結(jié)合能力越強(qiáng);③buforin Ⅱ也可與RNA結(jié)合,從而抑制轉(zhuǎn)錄和翻譯,影響大分子物質(zhì)合成;④buforin Ⅱ可攻擊呼吸鏈,抑制呼吸作用和ATP合成。
目前,有關(guān)buforin Ⅱ抗菌機(jī)制方面的研究還停留在體外實(shí)驗(yàn)和分子模擬的水平,雖然已經(jīng)證明buforin Ⅱ可抑制DNA的部分功能,但仍然不排除其他靶點(diǎn),因此需進(jìn)一步驗(yàn)證。
為提高 buforin Ⅱ的抗菌能力,Park等[7]用3種策略對(duì)buforin Ⅱ進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造。第1種是截?cái)嗖呗?,通過(guò)逐一將氨基酸從N端或C端切下,驗(yàn)證截短多肽的抗菌功能。buforin ⅡN端的4個(gè)氨基酸殘基(TRSS)被切除后,得到衍生肽buforin ⅡA,其序列為RAGLQFPVGRVHRLLRK,抗菌活性得以提升。與之相反,C端氨基酸殘基的切除會(huì)導(dǎo)致抗菌活性降低(最小抑菌濃度>256 mg·L-1),且圓二色光譜圖顯示多肽呈無(wú)規(guī)卷曲。第2種改造策略是替換策略,在buforin ⅡA的基礎(chǔ)上替換個(gè)別氨基酸,這一策略同樣會(huì)導(dǎo)致抗菌活性的喪失。第3種是拼接策略,即用不同多肽片段與buforin核心序列進(jìn)行拼接。buforin ⅡB是對(duì)α螺旋部件(RLLR)進(jìn)行3次重復(fù)得到的buforin Ⅱ衍生物,其序列為RAGLQFPLGRLLRRLLRRLLR。此拼接改造增強(qiáng)了C端兩親螺旋的正電荷密度和疏水強(qiáng)度,其抗菌活性與buforin ⅡA相似甚至更高(表1)。Kim等[19]做了相似的拼接改造,并將之命名為histonin,序列為RAGLQFPVGKLLKKLLKRLKR,與 Bufouin Ⅱ相比其抗菌效果較差(表1),但增強(qiáng)了其在原核表達(dá)系統(tǒng)中的表達(dá)量。Beyth等[20]在buforin ⅡB的基礎(chǔ)上做了進(jìn)一步改造:一方面通過(guò)增強(qiáng)脯氨酸附近氨基酸側(cè)鏈空間位阻來(lái)增強(qiáng)脯氨酸鉸鏈;另一方面將亮氨酸全部替換為疏水性更強(qiáng)的纈氨酸,增強(qiáng)脯氨酸鉸鏈兩端兩親性螺旋的疏水強(qiáng)度。改造得到的肽序列為RVVRQWPIGRVVRRVVRRVVR,將其命名為buforin ⅢB。buforin Ⅲ B較buforin ⅡB對(duì)大腸桿菌和糞腸球菌有更強(qiáng)的抑制作用。另外,肽環(huán)化也可在固定多肽構(gòu)象的基礎(chǔ)上,使抗菌活性得到提升[21]。
此外,增強(qiáng)抗菌肽對(duì)蛋白酶的耐受性也是重要的改造方向。Meng等[22]對(duì)buforin家族多個(gè)抗菌肽進(jìn)行了氟化改造,通過(guò)將亮氨酸側(cè)鏈甲基的6個(gè)氫替換為氟,得到了多個(gè)buforin家族抗菌肽的氟化物。這些多肽對(duì)胃蛋白酶的耐受顯著增強(qiáng),抗菌能力也得到了保留或加強(qiáng),但溶血活性卻無(wú)改變。
buforin Ⅱ抗癌作用的研究起步較晚,由于此時(shí)已發(fā)現(xiàn)作用機(jī)制相同但生物活性更強(qiáng)的buforin ⅡB,為此抗癌作用研究主要集中于buforin ⅡB。
Lee等[23]對(duì)buforin ⅡB的廣譜抗癌效果進(jìn)行了驗(yàn)證,對(duì)其對(duì)人成纖維細(xì)胞、小鼠胚胎成纖維細(xì)胞、Jurkat和HeLa細(xì)胞的細(xì)胞毒性進(jìn)行了檢測(cè)。結(jié)果表明,buforin ⅡB對(duì)2種成纖維細(xì)胞株(人和小鼠的正常組織細(xì)胞)無(wú)殺傷作用,但在極低濃度對(duì)2種癌細(xì)胞的殺傷率即可>85%。這種對(duì)癌細(xì)胞的選擇性殺傷可能是由于癌細(xì)胞膜上有大量帶負(fù)電荷的神經(jīng)節(jié)苷脂。隨后,他們測(cè)定了buforin ⅡB對(duì)包括非小細(xì)胞肺癌、白血病、乳腺癌、中樞神經(jīng)瘤、黑色素瘤、腎癌、卵巢癌、結(jié)腸癌和前列腺癌在內(nèi)的62種癌細(xì)胞株的半數(shù)抑制濃度。結(jié)果顯示,半數(shù)抑制濃度均<25 mg·L-1,表明buforin ⅡB體外有廣譜抗癌作用,同時(shí)也闡明了buforin ⅡB對(duì)癌細(xì)胞和正常細(xì)胞毒性有差異的原因。癌細(xì)胞表面有很多帶負(fù)電的神經(jīng)節(jié)苷脂,buforin ⅡB帶正電荷的“Arg面”可以神經(jīng)節(jié)苷脂為靶點(diǎn)富集到癌細(xì)胞表面,從而選擇性攻擊癌細(xì)胞。在選擇性進(jìn)入癌細(xì)胞后,內(nèi)膜系統(tǒng)中只有線粒體表面帶有較高密度的負(fù)電磷脂,之后則通過(guò)線粒體依賴途徑來(lái)誘導(dǎo)癌細(xì)胞凋亡(圖1D)。
buforin ⅡB對(duì)不同癌細(xì)胞的抗癌機(jī)制或有不同。Li等[24]報(bào)道,buforin ⅡB通過(guò)調(diào)控周期蛋白依賴性激酶2和周期蛋白A的表達(dá),阻斷肺癌細(xì)胞HepG 2的細(xì)胞周期,從而抑制癌細(xì)胞的活性。Han等[25]報(bào)道,buforin ⅡB通過(guò)P53途徑誘導(dǎo)前列腺癌細(xì)胞Pc-3和Du-145凋亡。buforin ⅡB在體外的廣譜抗癌能力使其成為一種新型的抗癌分子,但由于其對(duì)不同癌細(xì)胞的抗癌機(jī)制不同,因此仍有待深入研究。
表2 組蛋白H2A源抗菌肽buforin Ⅱ的同源肽
buforin Ⅱ?yàn)閬喼摅蛤蹾2A源抗菌肽,在許多水生生物及兩棲動(dòng)物中均發(fā)現(xiàn)了buforin Ⅱ的同源肽(表 2)。其中abhisin[26]來(lái)自于盤(pán)鮑,當(dāng)abhisin濃度為250 mg·L-1時(shí),不能抑制其他幾種G+/G-致病菌(如溶藻弧菌和副溶血性弧菌)的生長(zhǎng),但對(duì)卵形假單胞菌的生長(zhǎng)抑制作用強(qiáng)于對(duì)其他幾種細(xì)菌。hipposin[27-28]來(lái)自于大西洋比目魚(yú)的皮膚黏液,對(duì)多種致病菌均具有良好的抗菌能力。與之類似的還有himantura,litopenaeu和scallop A等。這些抗菌肽均為組蛋白H2A源抗菌肽,序列上保留了脯氨酸鉸鏈,并含有大量帶正電荷氨基酸殘基。有一個(gè)例外是parasin[29],來(lái)自于鯰魚(yú)的皮膚黏液,序列并未保留重要的脯氨酸鉸鏈,且二級(jí)結(jié)構(gòu)也與其他組蛋白H2A N端抗菌肽的α螺旋不同,而是以兩親性β折疊為特征。根據(jù)序列的保守性,Kong等[4]利用齊河鯽魚(yú)cDNA文庫(kù)和PCR技術(shù),得到了齊河鯽魚(yú)的組蛋白H2A源抗菌肽Ca-L-hippo,其抑菌效果與hipposin相近。
這些抗菌肽是長(zhǎng)期自然選擇保留下來(lái)的天然肽序列,對(duì)其進(jìn)行活性探究對(duì)發(fā)現(xiàn)新抗菌肽和改造抗菌肽結(jié)構(gòu)方面意義重大。對(duì)不同物種同源片段的整理和分析,既可拓寬研發(fā)潛在活性多肽分子的思路,也可加深人們對(duì)多肽結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系的理解,在抗生素濫用導(dǎo)致耐藥性嚴(yán)重的今天尤為重要。
目前對(duì)buforin Ⅱ的研究仍集中于分子改造與作用機(jī)制方面,雖可通過(guò)各種改造得到抗菌效果良好的衍生肽,但其抗菌作用靶點(diǎn)尚未確定,仍需要繼續(xù)探索。buforin Ⅱ獨(dú)特的穿膜機(jī)制在納米藥物研究上有獨(dú)特優(yōu)勢(shì),目前已有研究通過(guò)將buforin Ⅱ修飾在磁性納米粒上,利用其穿膜特性將納米制劑遞送至胞內(nèi)靶點(diǎn),但這樣的修飾手段抑制了buforin Ⅱ原本的抗菌效力[16,30]。因此,在利用穿膜特性的同時(shí)如何保留其原本的抗菌活性也需繼續(xù)探索。