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      白骨化骨骼的DNA 檢驗1 例

      2022-04-28 02:00:38江煜靈
      廣東公安科技 2022年1期
      關鍵詞:白骨骨粉檢材

      周 安 江煜靈

      (1.東莞市公安局厚街分局,廣東 東莞523960;2.東莞市公安局,廣東 東莞 523000)

      近年來,隨著DNA 提取技術的不斷進步,骨骼DNA 檢驗方法也得到迅速的發(fā)展,檢驗效率以及檢出成功率不斷提高。對于高度腐敗尸體、白骨化尸體能夠成功檢出骨骼STR分型是尋找尸源的可靠手段之一,但是一些陳舊白骨化的骨骼類案件中,由于骨骼經過風吹雨打、長期暴曬或者濕潤等惡劣環(huán)境,污染極其嚴重,DNA 高度降解,增加了種屬鑒定和DNA 檢驗的難度,成為法醫(yī)物證檢驗鑒定領域中的一大難題。本文通過對1例白骨化無名尸體中骨骼的成功檢驗,探討了脫鈣結合磁珠法提取陳舊骨骼DNA的檢驗方法。

      1 材料與方法

      1.1 檢材來源

      2019年3月某日,報警人報警稱,其在廣東省東莞市某鎮(zhèn)路邊發(fā)現(xiàn)一個白色化肥編織袋,袋內裝有一副殘缺的疑似人體的骸骨,后于2019年3月某日送檢2根疑似人體股骨和2020 年4 月某日送檢2 根疑似人體肱骨,要求做DNA檢驗。

      1.2 檢材的預處理

      仔細觀察送檢的股骨和肱骨,發(fā)現(xiàn)均已白骨化,沒有軟組織附著,外表有少量污垢。遂取股骨和肱骨各2 根,股骨編為A、B 號,肱骨編為C、D 號。使用手術刀片刮清洗骨骼表面污物和骨腔表面層,放置在84 消毒液浸泡10min 后,純水多次沖洗干凈,切取寬約6mm骨密質薄片2片,薄片放置于無水乙醇浸泡10min,將骨薄片剪成塊狀,濾紙擦干晾干備用。

      1.3 DNA提取

      采用螯合劑0.5mol/L EDTA(PH=8.0)溶液浸泡骨塊4h脫鈣,取各骨塊分別置于Freez?erMill 冷凍研磨儀,在液氮低溫環(huán)境下研磨至粉末狀,每份3g 骨粉放入10mL 的離心管內,按骨骼專用磁珠法DNA 提取試劑盒(長春博坤公司)添加對應比例的蛋白酶K 和骨粉孵育液?;靹蚝笾糜?6℃水浴恒溫12h,骨粉期間搖勻,補加一次蛋白酶K 225μL,繼續(xù)56℃水浴恒溫12h。離心取上清溶液,加入吸附液和超順磁性磁珠,充分搖勻后,吸取底部沉淀磁珠到提取試劑條,使用FL 案件專用型DNA 提取試劑盒(長春博坤公司,Kingfisher提取儀專用)提取骨粉模板DNA,洗脫體積30μL并收集。

      1.4 PCR擴增及電泳

      使用Verifiler Plus 復合擴增試劑盒(ABI公司,美國)進行擴增,反應體系10μL,其中 DNA 模板溶液 2μL,PCR 反應混合液 8μL(含有 Master mix additive 的 Master Mix 2μL,Primer Mix 1μL,純水5μL),擴增在ABI Veriti 96 well thermal cycler 上進行,擴增產物經ABI-3500XL 遺傳分析儀電泳后,使用Gen?eMarker V1.90軟件進行分型。

      2 實驗結果

      股骨所得STR 分型結果(見圖1、圖2),肱骨所得STR 分型結果(見圖3、圖4),均能成功檢測有效分型。

      圖1 白骨化股骨A檢出的STR分型圖譜

      圖2 白骨化股骨B檢出的STR分型圖譜

      圖3 白骨化肱骨C檢出的STR分型圖譜

      圖4 白骨化肱骨D檢出的STR分型圖譜

      由上述圖譜可見,所送檢材骨骼獲得的STR 電泳圖譜清晰,24 個基因座(圖為女性,缺少Yindel)均能顯示出峰,各基因座等位基因的峰高和分布均衡性較好,符合GA/T 1163—2014 的標準要求,但由于檢材降解因素,大片段基因座的峰值較低。

      3 討論

      3.1 檢材選取

      本案送檢的骨骼已經成白骨化,時間經歷較久,但整副骨骼較為完整,沒有遭受嚴重破壞。選取股骨和肱骨進行DNA 檢驗,因為這兩個部位骨骼DNA 含量相對較多,DNA檢出率較高[1]。

      3.2 污染控制

      本案骨骼在白色化肥編織袋里發(fā)現(xiàn),初步判斷是人為放置骨骼入編織袋內,骨骼表面相對干凈,但無法排除是否有外源性DNA附著在內,同時白骨化骨骼為疑難檢材,DNA 含量較低,因此檢驗過程的污染控制十分重要,需做好以下幾點:首先,需做好檢驗鑒定人員的保護以及檢驗工具的清潔與消毒,保證檢材在檢驗過程中不受污染;其次,在骨骼檢驗前,必須對其進行充分的去污處理,排除外源性DNA 的污染干擾;再次,由于該案無比對樣品,同一骨塊檢材要分開檢驗,至少要獨立檢驗二次,若是男性個體,至少應做常STR 和Y-STR 多態(tài)性檢驗,若是女性個體應做常STR 和mtDNA(條件允許下)多態(tài)性檢驗,確保能夠發(fā)現(xiàn)污染,及時排除干擾峰,從而提高結果的準確性和可溯源。

      3.3 檢驗方法

      在骨骼處理過程中應注意以下幾點:(1)脫鈣環(huán)節(jié),人體骨組織的細胞間質主要由膠原質和羥基磷灰石構成,加入EDTA 使羥基磷灰石的鈣離子斷裂,有利于骨骼結構疏松,易于裂解。由于預處理刮除骨骼表層組織,采用先脫鈣后研磨的思路,本案脫鈣時間嘗試在較短的時間中完成,避免了骨骼長時間脫鈣后DNA 含量嚴重損失的問題[2],保留脫鈣液待復檢核對,骨骼的分型圖譜結果顯示均獲得較完整的STR 分型。(2)研磨環(huán)節(jié),本案的骨骼使用液氮低溫研磨機進行研磨處理,使檢材一直處于低溫保護中,保證研磨過程中檢材DNA 不會發(fā)生降解或變性,同時樣品一直處于在液氮研磨槽中,避免在外界交叉污染的風險[3]。(3)磁珠轉移,在磁珠與骨粉裂解溶液下,吸取磁珠轉移到試劑條[4]進行DNA 提取,磁珠能充分吸附骨粉的DNA,有效提高DNA 的產量,達到檢驗高成功率。磁珠轉移法可以避免DNA 的污染和損失,該法操作相比其他提取方法[5-6]簡單方便,不易污染。

      綜上所述,本文采用骨骼專用磁珠法DNA 提取試劑盒法結合Verifiler Plus 復合擴增試劑盒檢驗骨骼DNA,收集磁珠后一步轉移即可,檢驗時間得到縮短,效率得到進一步提高,具有操作簡單便利,試劑經濟安全,DNA 產量高,能夠快速獲得完整的DNA 分型等特點,能滿足實際常規(guī)檢驗的要求,此方法適合于基層法醫(yī)對陳舊骨骼的DNA 進行檢驗。

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