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      甜瓜果實(shí)長度主基因+多基因遺傳分析

      2022-05-07 04:13:30李文龍梁曉雪胡建斌
      中國瓜菜 2022年4期
      關(guān)鍵詞:加性顯性甜瓜

      黃 松,李文龍,梁曉雪,李 瓊,胡建斌

      (1.信陽農(nóng)林學(xué)院 河南 信陽 464001; 2.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院 鄭州 450002)

      甜瓜(L.)為葫蘆科一年生蔓生植物,其多樣性僅次于同科植物南瓜。近期進(jìn)化研究表明,栽培甜瓜歷史上經(jīng)歷了三次獨(dú)立馴化,第一次發(fā)生在非洲,隨后的兩次發(fā)生在亞洲,整個(gè)亞洲及地中海沿岸的北非和南歐等廣大地區(qū)都有可能是栽培甜瓜的馴化地。甜瓜豐富的多樣性主要表現(xiàn)在果實(shí)性狀上,其變異類型眾多,包括果實(shí)形狀、果皮底色、果面覆蓋物(網(wǎng)紋、覆紋、果皮毛)、果面特征(溝、棱、皺紋)、果肉厚度、果肉顏色、果肉品質(zhì)(糖、酸、維生素C 含量及香氣和質(zhì)地等)等性狀的變異。據(jù)此,Pitrat建議將栽培甜瓜分為長毛亞種(ssp.)和短毛亞種(ssp.)及其下屬的16個(gè)變種。其中,長毛亞種和短毛亞種分別對(duì)應(yīng)生產(chǎn)上的厚皮甜瓜類型和薄皮甜瓜類型。果實(shí)形狀(或果形指數(shù))是甜瓜重要的外觀性狀,也是甜瓜變異最明顯的性狀之一,主要有圓形、蘋果形、卵形、橢圓形、圓柱形、棒形等6 種類型。生產(chǎn)上推廣應(yīng)用的厚皮甜瓜品種多以圓形和橢圓形為主,薄皮甜瓜品種以蘋果形和卵形為主。相關(guān)性研究表明,決定果實(shí)形狀的主要因素是細(xì)胞的縱向分裂速率,即果實(shí)長度。因此,探明甜瓜果實(shí)長度的遺傳基礎(chǔ),對(duì)果實(shí)外觀性狀的遺傳改良具有重要意義。

      早期Wall認(rèn)為,甜瓜長果形對(duì)圓果形是顯性遺傳。林碧英等對(duì)薄皮×厚皮甜瓜雜交后代進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),長果形或橢圓形對(duì)圓球形均為顯性遺傳。然而更多的研究表明,甜瓜果實(shí)長度是典型的數(shù)量性狀,無論是在自然群體還是在特定分離群體中,果實(shí)長度都會(huì)出現(xiàn)連續(xù)變異。目前,在甜瓜的12 條染色體上均發(fā)現(xiàn)有控制果實(shí)長度或果形指數(shù)的QTL,大約有130 個(gè),但在不同的遺傳背景下,其定位結(jié)果不盡相同。其中,報(bào)道的第8 染色體QTL最多,達(dá)26 個(gè),而第5 染色體僅有2 個(gè)QTL。這些研究結(jié)果表明,調(diào)控甜瓜果實(shí)長度的基因遍布整個(gè)基因組,且其效應(yīng)大小不一,遺傳基礎(chǔ)十分復(fù)雜。主基因+多基因混合遺傳模型是解析復(fù)雜數(shù)量性狀遺傳基礎(chǔ)的有效方法,該方法通過分析特定群體的性狀表型,以檢測影響目的性狀的主基因和多基因數(shù)目,并評(píng)估其遺傳效應(yīng),進(jìn)而揭示目的性狀的遺傳規(guī)律,已經(jīng)用于茄子、西葫蘆、黃瓜等果實(shí)形狀的遺傳分析。

      筆者以果實(shí)長度差異明顯的2 份甜瓜材料構(gòu)建6 個(gè)世代群體,采用主基因+多基因混合遺傳模型分析方法,對(duì)春秋兩季甜瓜果實(shí)長度進(jìn)行遺傳分析,以期明確果實(shí)長度所屬的遺傳模型及其基因效應(yīng),為甜瓜果實(shí)形狀遺傳改良提供理論依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      試驗(yàn)材料為圓果形自交系H581(P)和長果形H906(P),其果形指數(shù)分別為1.0 和12.0,花期子房長度差異也十分明顯(圖1),兩份材料均選自前期構(gòu)建的甜瓜核心種質(zhì)。2017 年秋季雜交配制F,2018 年春季自交獲得F,秋季回交獲得回交1 代B(F×P)和B(F×P)。為了準(zhǔn)確統(tǒng)計(jì)分離群體單株的果實(shí)表型,將B、B和F群體各單株分別自交構(gòu)建其家系(B、B和F)。

      圖1 親本材料H906 和H581 的果實(shí)和開花當(dāng)天的子房表型

      1.2 方法

      2019 年春季(3—7 月)和秋季(7—10 月)在河南農(nóng)業(yè)大學(xué)毛莊科教園區(qū)試驗(yàn)基地進(jìn)行甜瓜各世代群體的育苗和田間種植。春季于日光溫室中育苗,秋季于塑料大棚中遮陽育苗。幼苗長至2 葉1心時(shí)定植,非分離群體P、P和F分別種植30 株,分離群體B、B和F分別種植96 個(gè)、110 個(gè)和140 個(gè)家系,每個(gè)家系包括7~10 個(gè)單株。每株在11~15 節(jié)選留1 個(gè)瓜,除去其他雌花及側(cè)枝,其他田間管理同常規(guī)。待果實(shí)成熟時(shí)采用直尺(最小刻度1 mm)測量果實(shí)長度。

      1.3 數(shù)據(jù)分析

      非分離群體(P、P和F)各單株的果長實(shí)測值為其表型值,分離群體(B、B和F)各單株的果實(shí)表型值以其對(duì)應(yīng)的家系單株實(shí)測值的平均值代替。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 果實(shí)長度的變異分析

      春秋兩季對(duì)甜瓜6 個(gè)世代群體的果實(shí)長度進(jìn)行統(tǒng)計(jì),結(jié)果見表1。春季非分離群體P、P和F果實(shí)長度均值分別為10.2、110.9、43.4 cm,秋季果實(shí)長度均值分別為和9.7、98.8、39.4 cm,且群體內(nèi)變異較小(<17%)。春季果實(shí)長度平均值普遍高于秋季,可能是春季果實(shí)生長發(fā)育時(shí)期比秋季長的緣故。F均值處于P和P之間,但無論是在春季還是秋季,其均值明顯偏向圓果親本P。分離群體(B、B和F)的果實(shí)長度變異較大,春季>25%,秋季>40%,秋季果實(shí)長度變異更明顯。無論是春季還是秋季,B果實(shí)長度均值最小,B果實(shí)長度均值最大,F(xiàn)果實(shí)長度均值介于二者之間。各分離群體的峰度均為負(fù)值,說明存在主效基因的作用。果實(shí)長度在3 個(gè)分離群體中呈現(xiàn)連續(xù)分布,春秋兩季B和F果實(shí)長度偏向圓果親本P,B偏向長果親本P2,且均呈現(xiàn)單偏峰分布(B和F偏度均為正值,B偏度為負(fù)值)(圖2),符合主基因+多基因表型變異的基本特征。

      圖2 甜瓜果實(shí)長度在分離群體中的頻次分布

      表1 甜瓜果實(shí)長度表型統(tǒng)計(jì)

      2.2 遺傳模型的選擇和檢驗(yàn)

      采用主基因+多基因混合遺傳模型對(duì)6 個(gè)世代群體果實(shí)長度表型值進(jìn)行遺傳分析,分別計(jì)算24種模型MLV 值和AIC 值,結(jié)果見表2。根據(jù)AIC值最小原則,選取最小AIC 值及與之差異不大的遺傳模型作為備選模型。春季3 個(gè)最小AIC 值分別為2 188.243、2 192.339 和2 184.243,所對(duì)應(yīng)的模型分別為C-0、D-0 和E-1,秋季3 個(gè)最小AIC 值分別為867.288、859.539 和860.129,所對(duì)應(yīng)的模型也是C-0、D-0 和E-1,即這3 種模型為春秋兩季所共有,均可作為果實(shí)長度的備選模型。C-0 對(duì)應(yīng)PG-ADI,為加性-顯性-上位多基因模型,無主基因效應(yīng);D-0和E-1 分別對(duì)應(yīng)MX1-AD-ADI 和MX2-ADI-AD,受1 對(duì)或2 對(duì)主效基因控制,也受多種效應(yīng)的多基因影響。由此可見,備選的3 種遺傳模型存在一定的差異,特別是C-0 與D-0、E-1 的差異較大,需要進(jìn)一步檢驗(yàn),以確定最適遺傳模型。

      表2 各遺傳模型的MLV 及AIC 值

      對(duì)3 個(gè)備選模型進(jìn)行適合性檢驗(yàn),結(jié)果見表3。C-0 模型在春秋兩季共出現(xiàn)7 個(gè)顯著性統(tǒng)計(jì)量,D-0模型在兩季共有3 個(gè)顯著性統(tǒng)計(jì)量,而E-1 模型在兩季未出現(xiàn)顯著性統(tǒng)計(jì)量。根據(jù)顯著性統(tǒng)計(jì)量數(shù)最少原則,E-1 模型可認(rèn)為是最適遺傳模型,即2 對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因模型。因此,甜瓜果實(shí)長度由主基因和多基因聯(lián)合調(diào)控,主基因的遺傳效應(yīng)包括加性、顯性和上位性效應(yīng)。

      表3 備選模型C-0、D-0 和E-1 的適合性檢驗(yàn)

      2.3 E-1模型遺傳參數(shù)的估測

      基于最適遺傳模型E-1,各類參數(shù)估算結(jié)果見表4。一階參數(shù)估算表明,控制果實(shí)長度的主基因有2 對(duì)(、),其加性效應(yīng)()在春秋兩季均為正值,但效應(yīng)值的差異較大。第1 對(duì)主基因()的效應(yīng)值較大(春季12.22,秋季9.74),第2 對(duì)主基因()的效應(yīng)值相對(duì)較?。ù杭?.06,秋季1.69),均能增加果實(shí)的長度。兩對(duì)主基因的顯性作用()均為負(fù)向,能減少果實(shí)長度,但效應(yīng)值差異明顯?;虼杭撅@性效應(yīng)最強(qiáng)(-12.08),秋季則較弱(-3.67),基因在春秋兩季的顯性效應(yīng)不同,但效應(yīng)值均較低(||<2),說明顯性效應(yīng)受環(huán)境影響較大。由此可知,基因的加性和顯性效應(yīng)明顯強(qiáng)于基因,且在春季的作用更為明顯,說明基因在春季能更好地發(fā)揮其育種價(jià)值。

      表4 最適模型E-1 的一階和二階參數(shù)估算

      注::群體均方;、:第一、二主基因的加性效應(yīng);、:第一、二主基因的顯性效應(yīng);:兩主基因間的加性×加性互作效應(yīng);:兩主基因之間的加性×顯性互作效應(yīng);:兩主基因之間的顯性×加性互作效應(yīng);:兩主基因之間的顯性×顯性互作效應(yīng);:多基因方差;:主基因方差;:主基因遺傳率;:多基因遺傳率。

      2 對(duì)主基因存在多種互作效應(yīng),其中加性×加性互作效應(yīng)()較強(qiáng),秋季(14.11)高于春季(5.98),可用于增加果實(shí)長度。盡管2 對(duì)主基因的加性-顯性互作效應(yīng)(和)和顯性-顯性互作效應(yīng)()均能被檢測到,但其效應(yīng)值均很低(||、||和||均小于5),且不同季節(jié)的作用方向不同,說明互作效應(yīng)對(duì)表型的貢獻(xiàn)甚微,且易受環(huán)境影響,難以用于果實(shí)長度的遺傳改良。

      二階參數(shù)的估算結(jié)果表明,春季主基因在B、B和F群體中的遺傳率()分別為42.67%、69.59%和81.05%,秋季3 個(gè)群體的分別為61.03%、70.42%和83.33%,主基因在B和F中表現(xiàn)出高遺傳率,說明B和F世代有利于果實(shí)長度的選擇與改良。多基因遺傳率()相對(duì)較低,且僅在部分群體中被檢出。如春季B的最大,也僅為26.57%,其他群體很低(<14%),秋季B和春秋兩季F的h均為0。由此可見,甜瓜果實(shí)長度主要受主基因控制,主基因遺傳率在各世代的比重較高,早期選擇能取得較好的效果。

      3 討論與結(jié)論

      果實(shí)長度是決定果實(shí)形狀的重要因素,也是果實(shí)重要的外觀性狀。作為遺傳多樣性最豐富的葫蘆科植物之一,甜瓜果實(shí)形狀變化多樣,不同果形的商業(yè)品種也十分常見,如長果形的羊角蜜,橢圓形的西州密25,圓果形的玉菇。因此,果實(shí)長度也是甜瓜重要的商品性狀。甜瓜果實(shí)長度除了受遺傳因素調(diào)控外,還受光照強(qiáng)度、花期溫度、土壤營養(yǎng)狀況等環(huán)境因素影響。盡管前人已經(jīng)對(duì)甜瓜果實(shí)形狀(果實(shí)長度、果形指數(shù)等)進(jìn)行了大量遺傳研究,如通過配制各種作圖群體(BC、F、RIL 等),并在可控的條件(如溫室、大棚等)下觀測果實(shí)表型性狀以減少環(huán)境影響,但至今仍然未克隆到調(diào)控甜瓜果長的關(guān)鍵基因,這從側(cè)面反映了甜瓜果實(shí)長度遺傳基礎(chǔ)的復(fù)雜性。

      作為剖析復(fù)雜數(shù)量性狀遺傳結(jié)構(gòu)的一種有效方法,主基因+多基因混合遺傳模型已經(jīng)應(yīng)用于果實(shí)形狀的遺傳基礎(chǔ)分析。如甜瓜同屬植物黃瓜,其果實(shí)長度符合2 對(duì)加性-顯主基因模型(B-2),主基因遺傳率最高達(dá)88.09%。茄子和辣椒的果實(shí)長度均符合2 對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性上位性多基因模型(E-1),主基因遺傳率較高(>50%)。西葫蘆果實(shí)長度受1 對(duì)加性主基因+加性-顯性多基因(D-2),但主基因遺傳率較低(<30%)。不同種類植物的果實(shí)長度遺傳模型不盡一致,但大多受少數(shù)主基因和多基因聯(lián)合調(diào)控,為挖掘果實(shí)長度調(diào)控基因提供了理論依據(jù)。筆者從前期構(gòu)建的甜瓜核心種質(zhì)中鑒定了一份果實(shí)極長的種質(zhì)材料H906,該種質(zhì)為甜瓜長毛亞種(ssp.)下的蛇瓜變種(var.),是目前所知的甜瓜中果實(shí)最長的類型,可能包含了控制果長的關(guān)鍵基因。筆者通過主基因+多基因混合遺傳模型分析發(fā)現(xiàn),甜瓜果實(shí)長度符合2 對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性多基因模型(E-1),受主基因和多基因的聯(lián)合調(diào)控,且包含多種遺傳效應(yīng),與前人研究結(jié)果基本一致。

      在本試驗(yàn)中,E-1 模型中主基因的遺傳效應(yīng)顯得更為復(fù)雜。其中,加性和顯性效應(yīng)對(duì)果實(shí)長度起主要調(diào)控作用,尤其是春季的作用更明顯,且以第1對(duì)主基因()為主,互作效應(yīng)影響較小(除加性互作效應(yīng)外)。由于加性和顯性效應(yīng)在育種實(shí)踐中有較大的利用價(jià)值,因此甜瓜果實(shí)長度的遺傳改良可從關(guān)鍵的基因入手,在特定季節(jié)(如春季)加強(qiáng)對(duì)基因的選擇。由于主基因的遺傳率較高(除春季B外均高于60%),多基因遺傳率較低(除春季B外均低于14%),因此,甜瓜果實(shí)長度的遺傳改良可考慮在F、B及其自交后代中開展,在早期世代加強(qiáng)對(duì)主基因(特別是基因)的選擇,以便快速獲得所需的單株。同時(shí),考慮到主基因的加性和顯性效應(yīng)均發(fā)揮重要作用,而顯性效應(yīng)是不可固定的遺傳變量(隨世代推移可能會(huì)消失),遺傳操控難度較大,因而在實(shí)際選擇育種過程中,應(yīng)盡量擴(kuò)大群體規(guī)模,選擇同時(shí)具備加性和顯性效應(yīng)的基因型單株,從而獲得理想的育種材料。

      盡管本試驗(yàn)探明了甜瓜果實(shí)長度所屬的遺傳模型,證實(shí)了果實(shí)長度具備遺傳改良的潛力,但僅僅通過傳統(tǒng)的田間性狀重組來改良果實(shí)長度不可避免的存在盲目性。因此,在明確其遺傳方式的基礎(chǔ)上,借助現(xiàn)代高通量基因分型技術(shù),采用正向遺傳學(xué)方法鑒定控制果實(shí)長度的主效基因或QTL,通過分子標(biāo)記輔助選擇可實(shí)現(xiàn)果實(shí)長度的精準(zhǔn)改良。

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