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      大黃魚來源波羅的海希瓦氏菌SB-19的hfq基因功能分析

      2022-05-09 09:39:52江京洋韋旭航朱軍莉馮立芳
      食品科學(xué) 2022年8期
      關(guān)鍵詞:希瓦波羅的海氏菌

      江京洋,韋旭航,朱軍莉,吳 敏,馮立芳*

      (浙江工商大學(xué)食品與生物工程學(xué)院,浙江 杭州 310018)

      大黃魚(Larimichthys crocea)又稱黃魚、黃花魚、黃瓜魚,是我國四大傳統(tǒng)海產(chǎn)品(大黃魚、小黃魚、帶魚、烏賊)之一,其2019年的全國養(yǎng)殖量22.6萬 t,居海水養(yǎng)殖魚類之首,為我國東南沿海的重要經(jīng)濟(jì)魚類[1]。大黃魚體色金黃,含有豐富的微量元素、維生素、蛋白質(zhì)、不飽和脂肪酸,肉質(zhì)細(xì)致滑嫩,深受消費(fèi)者喜愛,因此大黃魚的市場需求極大。大黃魚常因運(yùn)輸工具的顛簸導(dǎo)致死亡,故其常以冷藏方式進(jìn)行運(yùn)輸和銷售。隨著冷藏時間的延長,大黃魚在內(nèi)源酶作用下發(fā)生自溶、脂肪氧化、以及耐冷細(xì)菌的繁殖并代謝,導(dǎo)致魚體腐敗和產(chǎn)生臭味變質(zhì),這部分適合生存和繁殖的細(xì)菌就是水產(chǎn)品貯藏過程中的特定腐敗菌[2]。

      波羅的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)為革蘭氏陰性桿菌,隸屬交替單胞菌目(Alteromonadales)希瓦氏菌科(Shewanellaceae)希瓦氏菌屬[3],能還原氧化三甲胺(trimethylamineN-oxide,TMAO)為三甲胺(trimethylamine,TMA),產(chǎn)生胺類化合物、硫化氫,具有較強(qiáng)的致腐能力,是大黃魚、南美白對蝦等海產(chǎn)品在冷藏過程中常見的特定腐敗菌[4-5]。在海產(chǎn)品腐敗過程中,特定腐敗菌會合成并釋放群體感應(yīng)信號分子——自誘導(dǎo)物(autoinducer,AI),以調(diào)控菌體密度和生理行為,并加速海產(chǎn)品腐敗變質(zhì)[6]。在波羅的海希瓦氏菌中已鑒定到兩種信號分子——二酮哌嗪類化合物(diketopiperazines,DKPs)和AI-2,二者均參與細(xì)菌的群體感應(yīng)事件[7-8]。

      RNA噬菌體Qβ復(fù)制酶的宿主因子Hfq是一種RNA分子伴侶蛋白,亦是一個結(jié)構(gòu)保守的六聚體蛋白,存在于革蘭氏陽性和陰性菌[9]。Hfq通過正向和負(fù)向兩種調(diào)控方式,調(diào)節(jié)細(xì)菌的小RNA(sRNA)和信使RNA(mRNA)的堿基配對,從而影響翻譯的進(jìn)程和RNA的穩(wěn)定性[10]。Hfq調(diào)控細(xì)菌多種代謝通路,影響的生理生化表型包括:生長速率、泳動能力、趨化能力、毒力、抗逆境能力以及群體感應(yīng)現(xiàn)象等[11]。例如,在哈維氏弧菌(Vibrio harveyi)的群體感應(yīng)調(diào)控系統(tǒng)中,Hfq在細(xì)胞密度較低的情況下與群體調(diào)控RNA(quorum regulatory RNAs,Qrr RNA)結(jié)合,抑制LuxR的轉(zhuǎn)錄和降低群體感應(yīng)現(xiàn)象[12]。在單核細(xì)胞性李斯特菌(Listeria monocytogenes)中,hfq基因缺失株的毒力和生物被膜形成能力顯著降低[13]。在奧奈達(dá)希瓦氏菌(S.oneidensis)中,hfq基因缺失株的指數(shù)期生長速率變慢、穩(wěn)定期細(xì)胞密度降低[14]。在大腸桿菌(Escherichia coliK-12)中,hfq基因突變株不僅表現(xiàn)為生長速率變慢和穩(wěn)定期細(xì)胞密度降低,還表現(xiàn)為細(xì)胞體積增大、滲透敏感性增強(qiáng)、抗紫外線能力減弱等[15]。但在金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)中,hfq基因表達(dá)水平較低,且hfq基因缺失株的生長速率和抗逆境能力與對照組無差異[16]。這說明Hfq在不同物種中存在功能趨異現(xiàn)象。

      目前有關(guān)波羅的海希瓦氏菌中Hfq功能的研究還鮮見報(bào)道,亦未知Hfq與水產(chǎn)品腐敗的相關(guān)性。鑒于此,本實(shí)驗(yàn)從波羅的海希瓦氏菌SB-19株中鑒定到1個hfq基因,并構(gòu)建hfq基因敲除株,通過分析細(xì)菌的生長速率、群體感應(yīng)現(xiàn)象、抗逆境能力、致腐能力,旨在為海產(chǎn)品腐敗菌的Hfq功能研究和明晰其致腐機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料與試劑

      波羅的海希瓦氏菌SB-19株為本課題組前期分離自冷藏大黃魚,經(jīng)生化鑒定和全基因組測序[17],菌株保存于-80 ℃冰箱[17]。

      所有培養(yǎng)基 青島海博生物技術(shù)有限公司;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增、RNA抽提、cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒、實(shí)時熒光定量PCR(realtime PCR)檢測試劑盒 寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司;其余生化試劑 國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。

      1.2 儀器與設(shè)備

      QuantStudio 6 Flex熒光定量PCR儀 美國Applied Biosystems公司;7890/5975氣相色譜-質(zhì)譜(gas chromatography-mass spectrometer,GC-MS)儀 美國安捷倫科技有限公司;970CTR熒光分光光度計(jì) 上海精科實(shí)業(yè)有限公司;Victor X酶標(biāo)儀 美國PerkinElmer公司;UV2550紫外分光光度計(jì) 日本島津公司。

      1.3 方法

      1.3.1 Hfq序列分析

      以本課題組前期測序、組裝、預(yù)測后的波羅的海希瓦氏菌SB-19株基因組為對象,構(gòu)建本地BLAST數(shù)據(jù)庫,將從NCBI網(wǎng)站查找并下載的波羅的海希瓦氏菌、奧奈達(dá)希瓦氏菌、腐敗希瓦氏菌(S.putrefaciens)以及大腸桿菌Hfq的氨基酸序列進(jìn)行比對,篩選條件為E-value>103。使用Clustalx軟件對篩選所得波羅的海希瓦氏菌SB-19株、希瓦氏菌屬和大腸桿菌的Hfq序列進(jìn)行同源序列比對。

      1.3.2 real-time PCR的檢測

      將活化菌株按照體積分?jǐn)?shù)1‰的接種量接入LB肉湯中,并在30 ℃搖床160 r/min進(jìn)行培養(yǎng),每隔4 h取樣一次,提取細(xì)菌總RNA,樣品中DNA殘留消化后即反轉(zhuǎn)錄為cDNA。以16S rRNA為內(nèi)參基因,進(jìn)行real-time PCR擴(kuò)增,采用2-ΔΔCt法計(jì)算hfq基因的相對表達(dá)水平[18]。

      1.3.3 波羅的海希瓦氏菌hfq基因敲除株的構(gòu)建

      根據(jù)波羅的海希瓦氏菌SB-19株的hfq基因及其兩側(cè)序列,設(shè)計(jì)PCR擴(kuò)增hfq基因上游和下游的同源臂片段引物(表1),然后用PCR擴(kuò)增和回收純化。巢式PCR將hfq基因上、下游片段與Cm基因表達(dá)框進(jìn)行連接,按照本課題組前期操作過程[17]進(jìn)行PCR片段的轉(zhuǎn)染和敲除株的篩選。

      表1 實(shí)驗(yàn)所用PCR引物Table 1 Primers used for PCR in this study

      1.3.4 細(xì)菌生長曲線的測定

      將活化的波羅的海希瓦氏菌SB-19株野生型(wide type,WT)與hfq基因敲除株(knock out,KO)分別接種到去離子水中,調(diào)整菌體濃度107CFU/mL,10 倍梯度稀釋至菌體濃度為106CFU/mL后轉(zhuǎn)接至裝LB肉湯的試管中,使起始菌體密度約為105CFU/mL,在30 ℃或4 ℃搖床160 r/min進(jìn)行培養(yǎng)。每隔4 h取100 μL進(jìn)行平板涂布,在30 ℃培養(yǎng)24 h、4 ℃培養(yǎng)144 h計(jì)數(shù),繪制細(xì)菌的生長曲線。細(xì)菌的生長動力學(xué)模型參考李學(xué)英等[19]提出的修正后Gompertz方程:

      1.3.5 DKPs和AI-2的檢測

      將活化的WT和KO菌株按照1‰接種于LB肉湯中,并在30 ℃搖床160 r/min進(jìn)行培養(yǎng),每隔6 h取樣一次。

      DKPs的檢測:10 000 r/min離心10 min后取上清液,用等體積氯仿萃取并收集有機(jī)相,經(jīng)旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)后再次用氯仿溶解提取物,定容至1 mL后用GC-MS檢測,色譜和質(zhì)譜條件同本課題組前期操作[20]。DKPs生成量以μg/mL表示。

      AI-2的檢測:10 000 r/min離心3 min,上清液用0.22 μm濾紙過濾,另將活化后培養(yǎng)至穩(wěn)定期的哈維氏弧菌BB170用AB培養(yǎng)基作1∶5 000稀釋,分別將10 μL待測上清液和90 μL稀釋的BB170菌液添加至96 孔酶標(biāo)板。在30 ℃孵育0.5 h,用熒光分光光度計(jì)在490 nm波長處檢測熒光強(qiáng)度[8]。AI-2水平以哈維氏弧菌BB170誘導(dǎo)熒光強(qiáng)度表示。

      1.3.6 生物被膜的檢測

      將活化后培養(yǎng)至穩(wěn)定期的WT和KO菌株按照體積比1∶100分別接種至含LB培養(yǎng)基的96 孔板中,在30 ℃生化培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h。將96 孔板中菌液傾倒干凈,隨后用無菌水清洗3次,置于超凈臺風(fēng)干。每孔加入0.2%結(jié)晶紫溶液200 μL,靜置染色15 min。棄去結(jié)晶紫溶液,用無菌水清洗干凈,再用33%冰醋酸溶液溶解,最后用酶標(biāo)儀測量595 nm處吸光度。

      1.3.7 胞外蛋白酶活性的檢測

      將1.5%瓊脂與10%脫脂牛奶混勻后滅菌制備脫脂牛奶瓊脂平板,取活化后培養(yǎng)至穩(wěn)定期的WT和KO菌液5 μL點(diǎn)樣,隨后置于30 ℃生化培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h,測量蛋白水解圈直徑。

      1.3.8 細(xì)菌抗逆能力的檢測

      將活化后培養(yǎng)至穩(wěn)定期的WT和KO菌株按照體積分?jǐn)?shù)1‰接種于不同脅迫條件中,以檢測細(xì)菌的抗逆境能力。NaCl脅迫:活化菌株接種至含不同質(zhì)量濃度NaCl(2、3、4 g/100 mL)的LB肉湯中;營養(yǎng)脅迫:活化菌株接種至用滅菌超純水稀釋(1∶2、1∶4、1∶8,V/V)的LB肉湯中;重金屬脅迫:活化菌株接種至含不同濃度Cu2+(0.05、0.15、0.3 mmol/L)的LB肉湯中;消毒劑脅迫:活化菌株接種至含不同質(zhì)量濃度NaClO(0.1、0.15、0.2 g/100 mL)的LB肉湯中。經(jīng)30 ℃搖床160 r/min培養(yǎng)24 h,然后用紫外分光光度計(jì)檢測菌液OD600nm。

      1.3.9 滅菌魚汁中揮發(fā)性鹽基氮(total volatile basic nitrogen,TVB-N)和TMA的測定

      滅菌魚汁的制作過程參照前期實(shí)驗(yàn)[17],取新鮮大黃魚背部肌肉與純凈水按照1∶2(g/mL)混合,均質(zhì)機(jī)拍打成勻漿后煮至70 ℃以沉淀蛋白質(zhì),上清液用定性濾紙過濾后煮沸15 min,然后在室溫下5 000 r/min離心30 min,再次過濾取上清液,每升上清液中添加終濃度0.1 mol/L磷酸鹽緩沖液(0.056 mol/L KH2PO4、0.044 mol/L K2HPO4,pH 6.6)、0.02 mol/L氧化三甲胺、0.4 mmol/LL-半胱氨酸、0.3 mmol/LL-甲硫氨酸,最后經(jīng)121 ℃高壓滅菌制備成滅菌魚汁。將活化后培養(yǎng)至穩(wěn)定期的WT和KO菌株按照體積分?jǐn)?shù)1‰接種于滅菌魚汁中,置于4 ℃生化培養(yǎng)箱。采用半微量定氮法測定魚汁中的TVB-N生成量,采用苦味酸法測定魚汁中的TMA生成量[21]。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 波羅的海希瓦氏菌SB-19株hfq基因的鑒定與表達(dá)規(guī)律

      Hfq在革蘭氏陰性和陽性菌中均有分布,是一個結(jié)構(gòu)保守的蛋白質(zhì)[9]。在本實(shí)驗(yàn)中,經(jīng)本地BLAST比對后從波羅的海希瓦氏菌SB-19株中篩選到1個Hfq,且其與目前已報(bào)道的波羅的海希瓦氏菌完全一致(圖1A),與奧奈達(dá)希瓦氏菌、腐敗希瓦氏菌以及大腸桿菌的Identity值分別為97.8%、98.9%和75.6%,這說明波羅的海希瓦氏菌hfq基因是一個結(jié)構(gòu)保守的基因。Hfq最早發(fā)現(xiàn)為大腸桿菌Qβ噬菌體在RNA復(fù)制過程中所必需的一種宿主因子,隨后又證實(shí)Hfq對細(xì)菌的生理活動大有裨益,如提高細(xì)菌的耐熱能力,hfq基因缺失株則表現(xiàn)出較低的環(huán)境適應(yīng)能力和抗逆能力等[22]。由此推測波羅的海希瓦氏菌SB-19株的hfq基因可能具有類似的生物學(xué)功能。

      圖1 Hfq氨基酸序列比對(A)和hfq基 因表達(dá)水平在波羅的海希瓦氏菌生長期間的變化規(guī)律(B)Fig.1 Amino acid sequence alignment of Hfq (A) and relative expression level of hfq gene determined by qPCR in S.baltica during a 24 h culture period (B)

      為分析波羅的海希瓦氏菌SB-19株hfq基因的功能,檢測其在遲緩期、對數(shù)期、穩(wěn)定期這3個重要的細(xì)菌生長階段的表達(dá)水平。由圖1B可知,在細(xì)菌培養(yǎng)至4 h的延緩期,hfq基因表達(dá)水平尚未發(fā)生顯著變化;在細(xì)菌進(jìn)入對數(shù)生長時期第8小時,hfq基因表達(dá)水平較起始提高了1 倍;此后hfq基因的表達(dá)水平持續(xù)升高,直至穩(wěn)定期第24小時,hfq基因表達(dá)水平較起始提高了3.7 倍。該現(xiàn)象與銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)和嗜肺軍團(tuán)菌(Legionella pneumophila)類似,hfq基因表達(dá)水平會隨著這兩種細(xì)菌生長時期的推進(jìn)而提高[23-24]。這說明hfq基因在波羅的海希瓦氏菌SB-19株生長的對數(shù)期和穩(wěn)定期發(fā)揮重要作用。

      2.2 hfq基因缺失對波羅的海希瓦氏菌SB-19株生長速率的影響

      WT株在30 ℃培養(yǎng)條件下生長迅速,一般在20 h左右即可進(jìn)入穩(wěn)定期,其最大比生長速率(μmax)為0.203 7,穩(wěn)定期的最大細(xì)菌數(shù)為8.31f0.11(lg(CFU/mL))。hfq基因KO株在30 ℃培養(yǎng)條件下,其生長曲線與WT株接近,只是在對數(shù)期的生長速率相對略低,其μmax為0.170 5,穩(wěn)定期的最大細(xì)菌數(shù)為8.25f0.12(lg(CFU/mL)),與WT株的細(xì)菌密度無顯著性差異(圖2A)。Brennan等[14]發(fā)現(xiàn)奧奈達(dá)希瓦氏菌中,hfq基因的缺失會導(dǎo)致突變株的生長速率變慢,穩(wěn)定期的細(xì)菌密度降低;但Bohn等[16]觀察到金黃色葡萄球菌的hfq基因突變株生長速率與對照組接近。表明hfq基因在不同菌株內(nèi)發(fā)揮不同程度的生物學(xué)效應(yīng),而當(dāng)波羅的海希瓦氏菌SB-19株處于最佳生長條件下,hfq基因?yàn)榉潜匾蜃印?/p>

      在4 ℃低溫培養(yǎng)條件下,WT株生長速率顯著降低,μmax為0.030 1,但其穩(wěn)定期的最大細(xì)菌數(shù)(8.16f 0.13(lg(CFU/mL)))接近于30 ℃培養(yǎng)條件。然而KO株在4 ℃低溫培養(yǎng)條件下生長速率更低,其μmax僅為0.010 2,且穩(wěn)定期的最大細(xì)菌數(shù)較相同條件下WT株降低了約2個數(shù)量級(圖2B)。此結(jié)果提示hfq基因有助于波羅的海希瓦氏菌SB-19株抵御低溫脅迫,即該基因可能參與細(xì)菌的抗環(huán)境脅迫過程。

      圖2 WT株和KO株在30 ℃(A)和4 ℃(B)的生長曲線Fig.2 Growth curves of WT and KO strains at 30 (A) and 4 ℃ (B)

      2.3 hfq基因?qū)Σ_的海希瓦氏菌SB-19株信號分子分泌和群體感應(yīng)的影響

      波羅的海希瓦氏菌在生長過程中會產(chǎn)生群體感應(yīng)現(xiàn)象,其分泌的信號分子DKPs和AI-2均調(diào)控細(xì)菌的群體感應(yīng)過程[8,17]。DKPs是由兩個氨基酸經(jīng)肽鍵連接而成的環(huán)二肽,存在于細(xì)菌、放線菌、真菌等,具有抗菌、神經(jīng)保護(hù)、免疫抑制等多種生物學(xué)活性和藥理學(xué)活性[25]。在細(xì)菌30 ℃培養(yǎng)的最初6 h,WT株和KO株的DKPs生成量非常接近,培養(yǎng)12 h,WT株的DKPs生成量達(dá)到(10.46f 0.34)μg/mL,顯著高于KO株的(9.21f0.32)μg/mL(圖3A);而此時WT株的細(xì)菌數(shù)(6.65f0.20(lg(CFU/mL)))也高于KO株(6.41f0.21(lg(CFU/mL)))(圖2A),所以WT株與KO株之間DKPs的差異可能是由細(xì)菌數(shù)量的不同所造成。隨著培養(yǎng)時間的延長(18 h和24 h),細(xì)菌進(jìn)入穩(wěn)定期,此時細(xì)菌對DKPs的消耗量大于生成量,培養(yǎng)液中DKPs含量逐漸降低,KO株的DKPs生成量略高于WT株,無顯著差異,這說明hfq基因不參與信號分子DKPs的分泌過程。AI-2在革蘭氏陽性和陰性細(xì)菌中均有發(fā)現(xiàn),是細(xì)菌種間交流的信號分子,參與生物被膜形成等群體感應(yīng)現(xiàn)象[26]。WT株和KO株在24 h內(nèi)均以接近水平生成AI-2,且KO株AI-2水平在12~24 h期間略高于WT株(圖3B),這表明hfq基因同樣不參與信號分子AI-2的分泌過程。

      圖3 WT株和KO株分泌信號分子DKPs(A)和AI-2(B)的水平Fig.3 Levels of DKPs (A) and AI-2 (B) secreted by WT and KO strains

      生物被膜是微生物在附著表面分泌的帶有黏性基質(zhì)的胞外聚合物,有助于增強(qiáng)微生物抵御環(huán)境脅迫的能力[27]。經(jīng)培養(yǎng)24 h后,WT株的生物被膜形成量高于KO株,且二者存在顯著差異(P<0.05)(表2),說明hfq基因參與波羅的海希瓦氏菌SB-19株的生物被膜形成過程。在單核細(xì)胞性李斯特菌中也有類似現(xiàn)象,其hfq基因缺失株不僅表現(xiàn)為生物被膜形成能力降低,而且對小鼠的致毒能力也明顯下降[13];嗜水氣單胞菌有2個hfq基因拷貝,hfq2基因缺失株會表現(xiàn)出生物被膜形成能力的降低[28],推測hfq基因參與細(xì)菌的群體感應(yīng)調(diào)控通路,與其生物被膜的形成密切相關(guān)。

      腐敗菌通過分泌胞外蛋白酶水解水產(chǎn)品中的蛋白質(zhì)和氨基酸,以獲取自身繁殖所需的營養(yǎng)物質(zhì),這進(jìn)而加劇水產(chǎn)品的腐敗變質(zhì)。在波羅的海希瓦氏菌中添加信號分子DKPs會促進(jìn)細(xì)菌胞外蛋白酶的活性和增強(qiáng)致腐能力[17]。在本實(shí)驗(yàn)中,WT株和KO株經(jīng)培養(yǎng)24 h后,WT株的胞外蛋白酶水解圈直徑顯著大于KO株(P<0.05)(表2),說明hfq基因也參與了波羅的海希瓦氏菌SB-19株的胞外蛋白酶分泌過程,即Hfq調(diào)控該菌的群體感應(yīng)事件,但不參與信號分子的分泌過程。

      表2 培養(yǎng)24 h WT株和KO株的生物被膜和胞外蛋白酶水解活力Table 2 Biofilm formation ability and extracellular protease activity of WT and KO strains

      2.4 hfq基因?qū)Σ_的海希瓦氏菌SB-19株抗逆境能力的影響

      在單核細(xì)胞性李斯特菌中,hfq基因的缺失會導(dǎo)致突變株對高鹽、乙醇、H2O2的適應(yīng)能力顯著降低[29],大腸桿菌中hfq基因的缺失也會降低其抗紫外線能力[15]。與對照組相比,在NaCl暴露條件下,2 g/100 mL NaCl略微促進(jìn)了WT株和KO株的生長,而隨著NaCl質(zhì)量濃度的提高,WT株和KO株菌株密度均降低,且KO株始終低于WT株(圖4A)。在營養(yǎng)脅迫條件下,當(dāng)LB營養(yǎng)肉湯添加量為1/2時,WT株與KO株的OD600nm分別較對照組減少了19.07%與62.87%;隨著LB營養(yǎng)肉湯含量的持續(xù)降低,WT株與KO株的OD600nm持續(xù)降低,但KO株始終低于WT株(圖4B)。在重金屬脅迫條件下,0.05 mmol/L Cu2+不影響WT株的密度,但此時KO株OD600nm較對照組降低了33.31%;當(dāng)Cu2+濃度繼續(xù)升高,WT株也表現(xiàn)出密度降低,只是相同條件下其OD600nm高于KO株(圖4C)。在消毒劑脅迫條件下,0.1 g/100 mL NaClO不干擾WT株的生長,而此時KO株非常敏感,密度較對照組降低了75.31%;NaClO質(zhì)量濃度為0.15 g/100 mL時,WT株OD600nm較對照組降低了60.90%,KO株此時幾乎不生長(圖4D)。上述結(jié)果表明,Hfq參與了波羅的海希瓦氏菌SB-19株對鹽分、營養(yǎng)、重金屬、消毒劑等脅迫環(huán)境的適應(yīng)過程,推測其通過影響sRNA與mRNA二者之間的結(jié)合來調(diào)節(jié)抗逆基因翻譯或蛋白質(zhì)降解,從而改變細(xì)菌的環(huán)境適應(yīng)能力,hfq基因缺失降低了波羅的海希瓦氏菌SB-19株的抗逆境能力。

      圖4 WT株和KO株抗NaCl(A)、營養(yǎng)(B)、重金屬Cu2+(C)和NaClO(D)脅迫Fig.4 Resistance of WT and KO strains to salt (A), nutrient (B), heavy metal (C), and disinfectant (D)

      2.5 hfq基因?qū)Σ_的海希瓦氏菌SB-19株致腐能力的影響

      水產(chǎn)品中蛋白質(zhì)在腐敗過程中被分解為氨和胺類等堿性含氮物質(zhì),即TVB-N;海水魚富含TMAO,在腐敗菌作用下TMAO脫氧還原成有臭味的TMA,因此TVB-N和TMA含量已成為鑒定水產(chǎn)品腐敗的重要指標(biāo)[2]。在4 ℃冷藏條件下,接種WT株和KO株的滅菌魚汁內(nèi)TVB-N和TMA含量隨著培養(yǎng)時間的延長而持續(xù)增加。在培養(yǎng)3 d,接種WT株的魚汁內(nèi)TVB-N質(zhì)量濃度達(dá)到(35.55f 3.32)mg/100 mL,超過了30 mg/100 mL的感官可接受閾值[30];接種KO株的魚汁在培養(yǎng)第4天時超過此閾值,且其所產(chǎn)生TVB-N含量始終低于同一時期WT株(圖5A)。TMA生成規(guī)律與TVB-N相似,接種WT株的滅菌魚汁在相同培養(yǎng)時間始終高于KO株(圖5B);上述TVB-N和TMA含量的變化說明hfq基因缺失后波羅的海希瓦氏菌SB-19株的致腐能力也相應(yīng)減弱。hfq基因缺失削弱了波羅的海希瓦氏菌SB-19株的致腐能力。

      圖5 接種WT株或KO株滅菌魚汁的TVB-N(A)和TMA(B)生成量Fig.5 Levels of TVB-N (A) and TMA (B) in sterilized fish juice inoculated with WT or KO strain

      Hfq在RNA翻譯水平存在正負(fù)兩種調(diào)控途徑:1)負(fù)向調(diào)控:Hfq與調(diào)控靶標(biāo)mRNA的sRNA結(jié)合,阻止靶標(biāo)mRNA在核糖體就位,進(jìn)而阻礙靶標(biāo)mRNA的翻譯;有些靶標(biāo)mRNA的5’非翻譯區(qū)堿基發(fā)生自我配對形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),也會阻礙靶標(biāo)mRNA的翻譯;2)正向調(diào)控:Hfq與調(diào)控靶標(biāo)mRNA的sRNA結(jié)合,形成的復(fù)合體阻止靶標(biāo)mRNA在5’非翻譯區(qū)形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),保證后續(xù)的翻譯順利進(jìn)行[10]。哈維氏弧菌中Hfq以負(fù)向調(diào)控方式發(fā)揮作用:當(dāng)細(xì)胞密度較低時,Qrr1-5產(chǎn)生的sRNA在Hfq作用下會抑制受體蛋白LuxR的表達(dá);當(dāng)細(xì)胞密度較高時,qrr基因不發(fā)生表達(dá),失去Hfq抑制的LuxR結(jié)合信號分子,進(jìn)而激活下游的群體感應(yīng)事件,如誘導(dǎo)細(xì)菌發(fā)出熒光[12]。對于波羅的海希瓦氏菌SB-19 WT株,隨著細(xì)菌密度的增加,其所分泌的信號分子水平升高,hfq基因表達(dá)水平也隨之上升,細(xì)菌表現(xiàn)出的群體感應(yīng)現(xiàn)象和滅菌魚汁的腐敗程度愈發(fā)明顯;而對于KO株,隨著細(xì)菌密度的增加,雖然其分泌的信號分子水平與WT株接近,但其群體感應(yīng)和滅菌魚汁的腐敗程度卻低于同時期的WT株,這說明波羅的海希瓦氏菌SB-19株的Hfq以正向調(diào)控方式發(fā)揮作用,這為今后研究海產(chǎn)品中特定腐敗菌的致腐能力奠定了理論基礎(chǔ)。

      3 結(jié) 論

      波羅的海希瓦氏菌SB-19株中存在一個hfq基因,且該基因表達(dá)水平隨著細(xì)菌的生長而升高;在4 ℃培養(yǎng)條件下,與WT株相比,KO株的生長速率明顯遲滯且穩(wěn)定期細(xì)菌密度較低,顯示hfq基因在波羅的海希瓦氏菌SB-19株的生長對數(shù)期和穩(wěn)定期發(fā)揮重要作用。WT株與KO株所分泌信號分子DKPs和AI-2水平接近,可見hfq基因不參與信號分子的分泌過程;然而,KO株卻表現(xiàn)為更低的生物被膜形成能力和胞外蛋白酶活性;接種KO株的滅菌魚汁也產(chǎn)生較少的TVB-N和TMA,說明Hfq正向調(diào)控波羅的海希瓦氏菌的群體感應(yīng)事件,但不參與信號分子的分泌過程。此外,KO株對鹽分、營養(yǎng)、重金屬、消毒劑等脅迫條件更為敏感,推測Hfq通過影響sRNA與mRNA二者之間的結(jié)合來調(diào)節(jié)抗逆基因的翻譯或蛋白質(zhì)的降解,從而改變細(xì)菌的環(huán)境適應(yīng)能力。綜上所述,波羅的海希瓦氏菌SB-19株中Hfq是一個全局性調(diào)控因子,整體調(diào)節(jié)該菌的諸多生理活動。本實(shí)驗(yàn)為波羅的海希瓦氏菌的基礎(chǔ)生物學(xué)研究和海產(chǎn)品微生物的致腐機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。

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