許瑾 李濤,,3 李楚琳 朱順妮 王忠銘 向文洲,3
(1. 中國科學(xué)院廣州能源研究所 廣東省新能源和可再生能源研究開發(fā)與應(yīng)用重點實驗室 中國科學(xué)院可再生能源重點實驗室,廣州 510640;2. 中國科學(xué)院南海海洋研究所 中國科學(xué)院熱帶海洋生物資源與生態(tài)重點實驗室 廣東省海洋藥物重點實驗室,廣州 510301;3. 南方海洋科學(xué)與工程廣東省實驗室(廣州),廣州 511458)
二十碳五烯酸(C20:5,EPA)是一種人體不能合成但又不可缺少的ω-3長鏈多不飽和脂肪酸,它具有降低膽固醇、預(yù)防心腦血管疾病的功能[1],此外,它也是許多水生甲殼類動物生長發(fā)育不可缺少的營養(yǎng)物質(zhì)[2]。自然界中許多微藻可以合成EPA,藻細(xì)胞合成的EPA主要存在于膜脂中[3-5],EPA對藻細(xì)胞具有儲存能量和碳源、清除胞內(nèi)自由基和調(diào)節(jié)膜流動性等作用,對維持藻細(xì)胞生命活動具有重要意義[6]。
微藻細(xì)胞EPA的合成主要有ω-3和ω-6兩種途徑[6],乙酰輔酶a經(jīng)脂肪酸從頭合成途徑生成C16:0,隨后在鏈延長酶、Δ9和Δ12去飽和酶的作用下,生成C18:2(ω-6)。ω-3途 徑 具 體 為C18:2(ω-6)→C18:3(ω-3)→C18:4(ω-3)→C20:4(ω-3)→EPA,其中涉及的酶依次為Δ15去飽和酶、Δ6去飽和酶、鏈延長酶和Δ5去飽和酶[6]。ω-6途徑具體為C18:2(ω-6)→C18:3(ω-6)→C20:3(ω-6)→C20:4(ω-6)→EPA,涉及的酶依次為Δ6去飽和酶、鏈延長酶、Δ5去飽和酶和Δ17去飽和酶[6]。許多脂肪酸去飽和酶并非以脂酰CoA或脂酰ACP為底物,而是以甘油脂為底物(如磷脂酰膽堿PC、單半乳糖甘油二脂MGDG、雙半乳糖甘油二脂DGDG和磷脂酰乙醇胺PE等),并且甘油酯的合成存在葉綠體與其他膜系統(tǒng)之間復(fù)雜且高度調(diào)控的相互作用[7],例如,EPA存在于類囊體膜的MGDG和DGDG中,而C16:0合成EPA需經(jīng)鏈延長酶、Δ5和Δ6去飽和酶的催化,鏈延長酶存在胞質(zhì)中,Δ5和Δ6去飽和酶存在于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,因此葉綠體外合成的EPA必須穿梭回葉綠體,才能參與MGDG和DGDG合成[8],對高等植物的研究表明這一穿梭載體可能是PC或者二酰甘油[7],但對于產(chǎn)EPA微藻,這一過程仍然未被解析。
影響微藻EPA合成的因素主要包括光強、營養(yǎng)鹽、溫度和鹽度等,研究表明低溫有利于微藻多不飽和脂肪酸的合成,而高溫不利于多不飽和脂肪酸的合成[8]。真眼點藻(Eustigmatos sp.)可以積累高含量的EPA受到廣泛關(guān)注,目前該藻已完成了全基因組測序,有望成為EPA研究的新模式物種[9]。溫度作為影響真眼點藻EPA合成的重要因素,目前鮮有報道。本研究以一株自行分離的真眼點藻JHsu-01為材料,設(shè)置高溫(30℃)和低溫(15℃)兩種培養(yǎng)條件,通過測定藻細(xì)胞生長、脂類組成、脂肪酸組成和分布,研究溫度對真眼點藻EPA合成規(guī)律的影響,隨后利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù),探究脂肪酸和脂類合成相關(guān)酶基因轉(zhuǎn)錄水平的變化,研究結(jié)果為后續(xù)通過基因改造提高真眼點藻EPA產(chǎn)量提供理論依據(jù)。
以真眼點藻(Eustigmatos sp. JHsu-01)為實驗材料,該藻株分離自廣東省韶關(guān)市丹霞山國家公園[10],現(xiàn)保藏于中國科學(xué)院廣州能源研究所。
1.2.1 培養(yǎng)方法 該藻利用BG-11培養(yǎng)基培養(yǎng)[11],培養(yǎng)至對數(shù)生長期的藻細(xì)胞離心后重新懸浮于新鮮BG-11培養(yǎng)基中,初始接種OD750為0.50 ± 0.02,培養(yǎng)容器為500 mL三角燒瓶,置于三溫區(qū)光照培養(yǎng)箱中進行培養(yǎng),培養(yǎng)時間為12 d。
設(shè)置2個處理組,分別為高溫處理組(30℃)和低溫處理組(15℃),每個處理組設(shè)置3個生物學(xué)重復(fù)。光強為300 μmol photons/(m2·s),連續(xù)照明,在培養(yǎng)周期中,每2 d測定生長參數(shù)(生物量和細(xì)胞密度)和光合效率,并收集藻泥利用FD-1-50冷凍干燥機(北京博醫(yī)康實驗儀器有限公司,中國)進行干燥,并保存在-20℃冰箱中備用。收集第6天藻泥,利用液氮速凍后,置于-80℃冰箱保存用于轉(zhuǎn)錄組測定。
1.2.2 細(xì)胞形態(tài)和細(xì)胞密度 使用BX41光學(xué)顯微鏡(Olympus,日本)觀察藻細(xì)胞形態(tài),并用XB-K-25血球計數(shù)板(上海求精生化試劑儀器有限公司,中國)測定細(xì)胞密度。
1.2.3 生物量 取藻液10 mL過濾到預(yù)先烘好的混合纖維濾膜(重量為m1,g)上,將帶有藻細(xì)胞的濾膜置于80℃烘箱24 h,放置干燥器中冷卻至室溫后稱重(重量為m2,g)。
1.2.4 總脂含量和脂類層析分級 80 mg藻粉加入3 mL 10%二甲亞砜-甲醇溶液,分別于50℃抽提30 min、冰浴抽提30 min后,離心收集上清液于預(yù)先烘干的玻璃小瓶中,藻渣加入乙醚/正己烷6 mL(1∶1,V∶V),冰浴抽提1 h,離心收集上清液至同一玻璃小瓶中,重復(fù)上述過程直到藻渣變白。在合并的抽提液中加入3 mL純水,震蕩分相,移取有機相,并氮氣吹干至恒重,即得總脂含量[12]。
以一定體積的氯仿/甲醇(1∶1,V∶V)溶解總脂,利用500 mg Cleanert Silica硅膠柱(博納艾杰爾科技有限公司,天津)進行總脂層析分級,首先用10 mL的氯仿洗脫得到中性脂(主要為三酰甘油),然后用10 mL丙酮洗脫得到粗糖脂,最后用10 mL甲醇洗脫得到磷脂,收集每一組份于小玻璃瓶中,在通風(fēng)櫥中用氮氣吹至較小體積,將濃縮液轉(zhuǎn)移至預(yù)先稱重的1.5 mL 塑料離心管中,用氮氣吹干至恒重,得到不同脂類組分的重量[13]。
1.2.5 脂肪酸組成和含量 稱25 mg藻粉,加入2 mL 2% H2SO4無水甲醇∶甲苯(90∶10,V∶V),充氬氣后,置于80℃的水浴加熱攪拌1.5 h,加入1 mL純水和1 mL正己烷震蕩分層,將上層有機相轉(zhuǎn)移到1.5 mL樣品瓶中,用氮氣吹干,同時加入1 mL碳十七烷酸甲酯,利用氣相色譜進行測定,獲得的脂肪酸峰與標(biāo)準(zhǔn)品圖譜比較,分析獲得其組成和含量。氣相色譜測定條件為DB-5毛細(xì)管柱(30 m × 0.25 mm),以高純氮氣為載氣,檢測器為FID檢測器,進樣口溫度260℃,程序升溫(60℃保留2 min→30℃/min升溫至120℃→1.5℃/min升溫至250℃保留2 min)[13]。
1.2.6 光合效率測定 利用脈沖調(diào)制式葉綠素?zé)晒鈨xPAM-100(Walz,德國)測定光系統(tǒng)II的實際光量子產(chǎn)量Y(PSII)和調(diào)節(jié)性能量耗散的量子產(chǎn)量Y(NPQ)。取藻液5 mL,于黑暗處適應(yīng)60 min,測定時,首先打開測量光(8 μmol photons·m-2·s-1)照射30 s, 測得初始熒光F0,隨后開啟飽和脈沖光(4 000 μmol photons·m-2·s-1)照射0.8 s,測得最大熒光Fm,打開光化光(300 μmol photons·m-2·s-1)照射10 min,測得最小熒光強度Fs,再次打開飽和脈沖光 (4 000 μmol photons·m-2·s-1)照 射0.8 s,測 得Fm′,根據(jù)以下公式計算得到Y(jié)(II)和Y(NPQ)。
Y(II)為光系統(tǒng)II的實際光量子產(chǎn)量,F(xiàn)′m為光化光條件下的最大熒光強度,F(xiàn)s為光化光條件下的最小熒光強度,F(xiàn)m為暗適應(yīng)后的最大熒光強度。
Y(NPQ)為光系統(tǒng)II調(diào)節(jié)性能量耗散的量子產(chǎn)量,F(xiàn)′m為光化光條件下的最大熒光強度,F(xiàn)m為暗適應(yīng)后的最大熒光強度。
1.2.7 轉(zhuǎn)錄組分析 (1)RNA提取、cDNA文庫構(gòu)建及測序:利用RNA提取試劑盒提取總RNA,RNA純度和完整性分別利用NanDrop 1000 spectrophotometer(Termo Scientific,USA)和Agilent 2100 Bioanalyzer(Agilent,USA)進行檢測。去除rRNA后,利用mRNA Capture Beads富集真核生物mRNA,采用高溫和金屬離子作用實現(xiàn)mRNA的片段化。以mRNA為模板,用六堿基隨機引物合成單鏈cDNA,隨后進行雙鏈cDNA的合成反應(yīng),再用DNA Clean Beads純化雙鏈cDNA,純化的雙鏈cDNA先進行末端修復(fù)、加A尾并連接測序接頭,再用DNA Clean Beads進行片段大小分選。最后進行PCR擴增,并用DNA Clean Beads純化PCR產(chǎn)物,得到最終的文庫。構(gòu)建好的文庫用Agilent 2100 Bioanalyzer進行質(zhì)檢。最后,利用Illumina HiSeq2000進行測序。(2)De novo組裝及基因注釋:對原始數(shù)據(jù)進行去除接頭序列及低質(zhì)量Reads的處理,獲得Clean Data;用短reads組裝軟件Trinity組裝,對組裝獲得的unigene進行BLAST,分別將unigene注釋到NR、Nt、Swiss-Prot、GO、KEGG和COG。(3)差異基因分析:利用FPKM(Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped)計算基因表達量。FPKM代表的是每一百萬個能對比上Reads中每kb外顯子的片段數(shù)。錯誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,F(xiàn)DR)<0.001且log2(fold change)>±1作為篩選條件評價基因的差異性。
1.2.8 統(tǒng)計分析 本文中所有圖表所示的平均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差均由3個生物學(xué)重復(fù)和3個測定重復(fù)計算獲得,利用SPSS 18.0進行數(shù)據(jù)分析(ANOVA),樣品均值之間的差異用最小顯著性差異(LSD)進行分析,置信度為0.05。
真眼點藻JHsu-01在30℃和15℃培養(yǎng)條件下的生長情況如圖1-A和1-B所示,15℃處理組獲得了更高的生物量(0.57 g/L),較30℃(0.48 g/L)提高了18.8%。細(xì)胞密度的變化趨勢與生物量一致,15℃比30℃提高了17.8%。圖1-C和1-D是真眼點藻在30℃和15℃培養(yǎng)條件下的細(xì)胞形態(tài),結(jié)果表明,溫度對真眼點藻JHsu-01的細(xì)胞形態(tài)影響較大,30℃時葉綠體分界不明顯,葉綠體出現(xiàn)片段化,細(xì)胞黃綠色,可見多個大且分散的眼點,眼點呈鮮紅色,15℃處理組,葉綠體結(jié)構(gòu)完整,周生裂葉狀,細(xì)胞深綠色,存在1-2個眼點,眼點呈暗紅色。
圖1 不同溫度培養(yǎng)下真眼點藻JHsu-01的細(xì)胞形態(tài)及生長特性Fig.1 Cell morphology and growth characteristics of Eustigmatos sp. JHsu-01 cultured at different temperatures
Y(PSII)表示藻細(xì)胞光系統(tǒng)II的實際光量子產(chǎn)量,如圖2-A所示,隨著培養(yǎng)時間的延長,30℃條件下,藻細(xì)胞的Y(PS II)均呈現(xiàn)降低趨勢,至培養(yǎng)結(jié)束,Y(PS II)降低幅度達到98.5%,說明30℃培養(yǎng)條件顯著抑制了藻細(xì)胞光系統(tǒng)II的活性。15℃條件下,藻細(xì)胞的Y(PS II)相對穩(wěn)定。Y(NPQ)是光系統(tǒng)II的調(diào)節(jié)性能量耗散的量子產(chǎn)量,如圖2-B所示,30℃條件下,藻細(xì)胞的Y(NPQ)顯著高于15℃,說明藻細(xì)胞在30℃條件下將更多能量用于熱耗散。
圖2 溫度對真眼點藻JHsu-01的PSII的實際光量子產(chǎn)量(A)和PSII的調(diào)節(jié)性能量耗散的量子產(chǎn)量(B)的影響Fig.2 Effects of temperature on the effective photochemical quantum yield of PSII(A)and quantum yield of the light-induced non-photochemical fluorescence quenching of PSII(B)of Eustigmatos sp. JHsu-01
溫度對真眼點藻JHsu-01油脂含量的影響如圖3-A所示,30℃組從第2天開始總脂含量呈降低趨勢,而15℃組總脂含量逐漸增加,培養(yǎng)結(jié)束時,15℃組的總脂含量為20.3% DW,30℃處理組的總脂含量為16.0% DW。30℃培養(yǎng)條件下,中性脂比例逐漸增加,從初始的40.7% TL(total lipid)增加至62.3% TL,膜脂(糖脂+磷脂)的比例由59.3% TL降低至37.8% TL(圖3-B);15℃培養(yǎng)條件下,中性脂由40.7% TL增加至46.8% TL,膜脂(糖脂+磷脂)的比例由59.3% TL降低至53.3% TL(圖3-B),上述結(jié)果表明,30℃加速了中性脂的積累,但不利于膜脂的積累,而15℃有利于膜脂的積累,而不利于中性脂的積累。
圖3 溫度對真眼點藻JHsu-01總脂含量(A)和脂類分級(B)的影響Fig.3 Effects of temperature on the total lipid content(A)and lipid classification(B)of Eustigmatos sp. JHsu-01
真眼點藻JHsu-01脂肪酸組成的時相變化如圖4所示,C16:0、C16:1、C18:1和C20:5是該藻的主要脂肪酸,30℃培養(yǎng)顯著提高了C16:1的比例,由培養(yǎng)初始的37.6% TFA(total fatty acid)增加至50.4% TFA,15℃培養(yǎng)時,C16:1的比例變化較小(在35.7%-37.6% TFA范圍變化)。30℃條件下,EPA由培養(yǎng)初始的23.8% TFA逐漸降至14.1% TFA,而15℃條件下,EPA的含量穩(wěn)定在27.7%-28.7% TFA,上述結(jié)果表明,15℃有利于EPA的合成,而30℃不利于EPA的合成。
圖4 30℃(A)和15℃(B)培養(yǎng)溫度對真眼點藻JHsu-01脂肪酸組成的影響Fig.4 Effects of 30℃(A)and 15℃(B)on the fatty acid composition of Eustigmatos sp. JHsu-01
由圖5-A和5-B可知,30℃培養(yǎng)顯著降低了真眼點藻的EPA含量,藻細(xì)胞EPA含量由2.30% DW(0 d)降低至1.37% DW(12 d),降低幅度達到40.6%(P<0.01),而15℃條件下,藻細(xì)胞中EPA含量由2.30% DW(0 d)增加至2.78% DW(12 d),增加幅度達到20.86%(P<0.05),說明15℃比30℃更有利于EPA的合成。進一步測定了不同脂組分的EPA含量(圖5-A和5-B),30℃培養(yǎng)條件下,中性脂的EPA含量變化較小,糖脂和磷脂的EPA含量明顯降低,至培養(yǎng)結(jié)束,糖脂和磷脂的EPA含量分別降低65.44%和69.95%(P<0.05),上述結(jié)果表明,膜脂中EPA含量的降低是導(dǎo)致EPA總量減低的原因。
為了分析藻細(xì)胞合成EPA后的去向問題,本研究分析了總EPA在中性脂、糖脂和磷脂的比例,由圖5-C和5-D可知,溫度可以影響藻細(xì)胞EPA在不同脂組分間的分布,15℃培養(yǎng)條件下,總EPA在中性脂、糖脂和磷脂中的比例分別為22.0%、62.0%和16.0%(第12天),而30℃培養(yǎng)條件下,總EPA在中性脂、糖脂和磷脂中的比例分別為40.9%、51.4%和8.3%(第12天),30℃培養(yǎng)條件下,EPA在中性脂的比例較15℃增加了85.9%(P<0.05),而在糖脂的比例較15℃降低了17.1%(P<0.05),上述結(jié)果表明,15℃條件下,微藻更多的EPA分布在糖脂和磷脂中,而30℃條件下,微藻將更多的EPA分布在中性脂中。
圖5 EPA在中性脂、糖脂和磷脂中的分布Fig.5 Distribution of EPA in neutral lipids,glycolipids and phospholipids
測序及注釋:高通量測序獲得Raw Reads經(jīng)過低質(zhì)量數(shù)據(jù)過濾后,得到高質(zhì)量Clean Reads分別為55.1 M(30℃)和49.8 M(15℃),GC含量均超過55%,Q20均大于98%,N堿基比例低于0.01%,表明轉(zhuǎn)錄組測序質(zhì)量較高,可用于進一步的生物信息學(xué)分析;將Clean Reads數(shù)據(jù)de novo組裝獲得參考序列,獲得unigene數(shù)目為106 864個,將unigene與數(shù)據(jù)庫進行比對,共有67 363個成功得到了注釋,注釋率為63.0%。同源物種分布結(jié)果顯示物種相似度最高的5個物種分別為水云(22.4%)、伽得擬微綠球藻(13.1%)、玉米(6.1%)、大豆疫霉菌(6.0%)和抑食金球藻(5.2%)(圖6-A);E-value分布結(jié)果顯示31.8%的mapped sequences展示出較強的可信度(小于10-45),仍然有68.2%的mapped sequences展示出在10-5-10-45的可信度(圖6-B);序列覆蓋度結(jié)果顯示相似度大于80%的mapped sequences只有2.7%,其余mapped sequences展示出17-80%的相似度(圖6-C)。
圖6 注釋基因的統(tǒng)計分析Fig.6 Statistical analysis of annotated genes
脂肪酸合成:乙酰輔酶a經(jīng)乙酰CoA羧化酶(ACCase)催化生成丙二酸單酰-ACP,隨后經(jīng)過縮合、還原、脫水和還原4步反應(yīng)進行鏈延長,每循環(huán)一次增加2個碳,4步反應(yīng)分別在3-酮?;?ACP合成酶(fabF)、3-酮酰基-ACP還原酶(fabZ)、3-酮?;?ACP脫水酶(fabG)和烯酯酰ACP還原酶I(fabI)進行,最終合成C16:0和C18:0。結(jié)果顯示accA、fabF、fabG、fabZ、fabI四個基因在15℃條件下均顯著上調(diào),說明15℃條件下較30℃條件更有利于脂肪酸的合成(圖7和表1)。
脂肪酸去飽和:EPA合成中的3個關(guān)鍵去飽和酶(Δ5、Δ6和Δ15脂肪酸去飽和酶),在15℃條件下,均顯著上調(diào)(圖7和表1),說明15℃條件下較30℃條件更有利于EPA的合成,未注釋到Δ17脂肪酸去飽和酶,因此無法確定ω-6合成途徑是否存在。
硫脂和糖脂合成:SQDG合成中的兩個關(guān)鍵酶硫代異鼠基轉(zhuǎn)移酶(SQD2)和UDP-硫代異鼠糖合酶(SQD1)在15℃條件下均顯著上調(diào);MGDG和DGDG合成中的兩個關(guān)鍵酶二?;视?-β-半乳糖基轉(zhuǎn)移酶(MGD)和二半乳糖二酰基甘油合酶(DGD)在15℃條件下均顯著上調(diào)(圖7和表1),說明15℃條件下較30℃條件更有利于硫脂和糖脂的合成。
磷脂合成:PC、PE和磷脂酰絲氨酸(PS)合成中的3個關(guān)鍵酶CPT1、EPT1和PTDSS2下調(diào),磷脂酰甘油(PG)的關(guān)鍵酶pgsA和GEP4無顯著性變化,磷脂酰肌醇(PI)合成中的關(guān)鍵酶CDIPT上調(diào)(圖7和表1)。
三酰甘油合成:磷酸二羥丙酮分別經(jīng)3-磷酸甘油?;D(zhuǎn)移酶(GPDH)、甘油磷酸脫氫酶(GPAT)、1-?;视?3-磷酸?;D(zhuǎn)移酶(plsC)、磷脂酸磷酸酶(PLPP)、二?;视王;D(zhuǎn)移酶(DGAT)合成三酰甘油,其中,GPAT、plsC、PLPP和DGAT在15℃條件下均上調(diào)(圖7和表1),說明15℃條件下較30℃條件更有利于甘油酯的合成。
表1 脂肪酸合成相關(guān)酶基因的變化情況Table 1 Expression changes of genes in lipid and fatty acid biosynthesis pathways
圖7 溫度對真眼點藻JHsu-01脂肪酸代謝通路的變化Fig.7 Changes of temperature on the fatty acid metabolic pathways of Eustigmatos sp. JHsu-01
溫度是影響微藻生長的重要環(huán)境因素之一,針對一些具有生物餌料潛力的微藻,研究溫度的影響尤為重要。本研究表明,真眼點藻JHsu-01在15℃條件下的細(xì)胞密度、生物量和光合效率均高于30℃培養(yǎng)條件,由于該藻株采集自廣東地區(qū),生境溫度可達30℃以上,但實際上降低培養(yǎng)溫度更有利于其生長。大部分微藻在15-30℃均可以生長,但適宜生長的溫度卻各有不同,三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum CCMM2012)、微擬球藻(Nannochloropsis sp. CCMM6004)和 柵 藻(Scenedesmus quadricauda CCMM4002)的適宜生長溫度均為25℃[14],瑞典四爿藻(Tetraselmis suecica FIKU032)可以在40℃條件下生長[15]。真眼點藻綱共有1目6科13屬28種,它們在淡水、海水和土壤表面等環(huán)境中都有分布[16],大部分已報道的真眼點藻研究中,培養(yǎng)溫度通常為25℃[17],具體到真眼點藻綱的某一種類,適宜生長的溫度可能存在較大差異,適宜眼點擬微球藻(Nannochloropsis oculata)生長的溫度為21℃[18],大洋擬微球藻(Nannochloropsis oceanica)在18-28℃條件下都可以正常生長[19]。本研究重點探究低溫和高溫對真眼點藻JHsu-01多不飽和脂肪酸代謝的影響,對于適宜其生長的具體溫度,則需要更為細(xì)化的溫度梯度實驗進行驗證。
溫度可以影響微藻的脂類合成[20]。真眼點藻JHsu-01在15℃培養(yǎng)條件下獲得了更高的總脂含量,分析脂類組成發(fā)現(xiàn),15℃條件下總脂含量提高的原因是由于膜脂比例增加引起,膜脂提高通常是微藻增強環(huán)境適應(yīng)性的一種策略。不同種類微藻對溫度的響應(yīng)存在差異,改變小球藻(Chlorella sp. MACC-728)的培養(yǎng)溫度,其油脂含量并沒有顯著變化[21],四尾柵藻(Scenedesmus quadricauda)在30℃時,脂類積累效率最高[22],由于脂類合成涉及的酶種類多,因此溫度影響脂類合成的潛在調(diào)控位點可能存在多個,目前對于這一調(diào)控機制仍不清楚。
溫度可以影響微藻的脂肪酸組成[20]。研究表明,微藻脂肪酸的不飽和度隨溫度降低而增加,而飽和脂肪酸比例隨溫度升高而增加[20,23]。本研究也發(fā)現(xiàn)了類似規(guī)律,真眼點藻JHsu-01在30℃時的EPA含量為1.37% DW,而15℃時EPA含量達到2.78% DW,提高幅度達到102.9%,說明15℃比30℃更有利于EPA的合成。利用10、15、20、25和30℃培養(yǎng)三角褐指藻(P. tricornutum MP-2),結(jié)果表明15℃處理組的EPA含量最高[24];當(dāng)培養(yǎng)溫度由10℃提高到25℃時,菱形藻(Nitzschia paleacea)的EPA相對含量由28.4% TFA降低至18.1% TFA,韋氏海鏈藻(Thalassiosira weissflogii)的培養(yǎng)溫度由16℃提高到20℃,其EPA含量明顯降低[25]。低溫有利于EPA合成的原因可能與藻細(xì)胞調(diào)節(jié)膜的流動性有關(guān),膜脂中不飽和脂肪酸增加,可以保證膜在低溫條件仍具有較好的流動性,從而執(zhí)行正常的生理功能[26]。
溫度可以改變真眼點藻EPA在中性脂、糖脂和磷脂中的分布,低溫使更多的EPA分配在糖脂中,糖脂是類囊體膜的主要成分,分布在糖脂中的EPA增加,預(yù)示著類囊體膜的流動性增加,類囊體膜上的色素蛋白復(fù)合物可以更好的橫向運動,提高光能吸收和傳遞效率。30℃培養(yǎng)使藻細(xì)胞合成的EPA更多的分布在中性脂中,結(jié)合“EPA總量減少”、“膜脂比例降低而中性脂比例增加”這一結(jié)果,我們推測30℃條件下,中性脂的EPA可能有一部分來源于磷脂,藻細(xì)胞中存在磷脂轉(zhuǎn)化為三酰甘油的途徑,這步反應(yīng)在磷脂酰膽堿-二?;视王;D(zhuǎn)移酶(PDAT)催化作用下進行,衣藻的PDAT擁有?;D(zhuǎn)移酶及脂肪酶兩種活性,在膜脂分解的過程中,伴隨TAG的產(chǎn)生,使藻細(xì)胞在各種脅迫條件下更好地生存[27]。
轉(zhuǎn)錄組測序可以全面快速地獲得藻細(xì)胞在某一狀態(tài)下幾乎所有轉(zhuǎn)錄本的序列信息,是一種探究微藻代謝規(guī)律的理想技術(shù)。真眼點藻JHsu-01在15℃培養(yǎng)條件下合成脂肪酸的能力增強,并且合成EPA的3個關(guān)鍵酶基因(Δ15、Δ5和Δ6去飽和酶)上調(diào),這結(jié)果可以解釋15℃比30℃更有利于EPA的合成。球等鞭金藻(Isochrysis galbana)IgFAD5基因僅在低溫15℃處理6-12 h期間表達水平較高[28],球等鞭金藻3011的Δ4、Δ5、Δ6、Δ8、Δ9和Δ12在18℃的相對表達量最高[29],上述結(jié)果與本研究結(jié)果相似,均表明低溫可以誘導(dǎo)一些脂肪酸去飽和酶的表達。
微藻細(xì)胞中存在原核和真核兩種膜脂合成途徑,原核途徑發(fā)生在質(zhì)體內(nèi),而真核途徑發(fā)生在內(nèi)質(zhì)網(wǎng),原核途徑合成的膜脂主要有磷脂酰甘油PG、MGDG、DGDG和SQDG,而真核途徑合成的脂類主要有PE、PS、PC和PI等[7]。15℃培養(yǎng)條件下,合成糖脂(MGD和DGD)和硫脂(SQD1和SQD2)關(guān)鍵酶基因的表達上調(diào),說明低溫條件下,葉綠體膜脂合成旺盛,藻細(xì)胞可能具有更強的光需求。三酰甘油合成中的幾個關(guān)鍵酶基因(GPAT、plsC、PLPP和DGAT)在15℃條件下的表達均上調(diào),說明TAG合成加強,但15℃條件下的中性脂比例比30℃有所降低,推測上述結(jié)果可能與糖脂與中性脂的合成速率有關(guān),15℃條件下糖脂合成增強,當(dāng)糖脂合成速率快于TAG合成速率時,就會出現(xiàn)中性脂比例降低的現(xiàn)象,后續(xù)可以通過熒光定量PCR對糖脂和TAG合成通路的關(guān)鍵酶基因更加更準(zhǔn)確的量化分析。
真眼點藻JHsu-01的EPA主要分布在糖脂中,根據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)并不能得出EPA分布在糖脂中原因。大量研究表明,許多微藻合成的EPA同樣分布在糖脂中,如紫球藻[5]、三角褐指藻[4]、微擬球藻[4]等,三角褐指藻84%的EPA存在于糖脂中,而僅有11%的EPA存在于TAG中[4],紫球藻可以積累占總脂肪酸約47%的EPA,但分布在TAG中的EPA僅有2%[5],這一分配機制可能與某些酶對特定脂肪酸選擇性有關(guān),大洋微擬球藻(Nannochloropsis oceanica)中存在的2種類型的DGAT(NoDGAT2J和NoDGAT2K),它們對某一種多不飽和脂肪酸具有偏好性,因此可以調(diào)節(jié)EPA在TAG中的比例[30]。真眼點藻JHsu-01的EPA傾向于分配在糖脂中,推測可能與MGD和DGD對脂肪酸選擇的特異性有關(guān)系,對這一機制更深入的分析,需要借助脂組學(xué)技術(shù),盡可能多的鑒定脂類分子,并通過生物信息學(xué)分析,獲得它們之間的關(guān)聯(lián)性,進而闡釋EPA分布的內(nèi)在調(diào)控機制。
15℃較30℃更有利于真眼點藻JHsu-01的生長、膜脂和EPA的合成,EPA含量最高達到2.78% DW。溫度可以改變EPA在糖脂和中性脂之間的分布比例,15℃條件下,微藻更多的EPA分布在糖脂和磷脂中,而30℃條件下,微藻將更多的EPA分布在中性脂中。低溫條件下,脂肪酸從頭合成、三酰甘油、糖脂、硫脂和ω-3合成途徑加強。綜上所述,低溫是促進微藻EPA合成的重要條件,同時也是一種獲得高含量糖脂型EPA的理想培養(yǎng)方式。