李 波,鄭樹(shù)城,曾偉偉,王 慶,李瑩瑩,尹紀(jì)元,王雅慧,呂月鳳,石存斌,趙志英,姜志勇,王英英
(1.上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命科學(xué)學(xué)院,上海,201306;2.中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部漁用藥物創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東省水產(chǎn)動(dòng)物免疫技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣州,510385;3.佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院,動(dòng)物分子設(shè)計(jì)與精準(zhǔn)育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,普通高校動(dòng)物分子設(shè)計(jì)與精準(zhǔn)育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,生命科學(xué)與工程學(xué)院,廣東佛山,440605; 4.廈門大學(xué)海洋與地球?qū)W院, 福建廈門, 361100;5.海南省海洋與漁業(yè)科學(xué)院,海口,571126;6.廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心,廣州,510030)
多聚免疫球蛋白受體是一種Ⅰ型跨膜糖蛋白,能夠轉(zhuǎn)運(yùn)分泌型抗體抑制病原微生物黏附和入侵。哺乳動(dòng)物的多聚免疫球蛋白(polymeric immunoglobulin,pIg)R分子由胞質(zhì)區(qū),胞外配體結(jié)合區(qū)和跨膜區(qū)三部分構(gòu)成,其中胞外配體結(jié)合區(qū)含有5個(gè)免疫球蛋白樣功能結(jié)構(gòu)域(ILD1~I(xiàn)LD5),其中ILD1是與pIg結(jié)合的重要結(jié)構(gòu)域,與其它脊椎動(dòng)物中ILD的數(shù)量不同,魚(yú)類pIgR分子只發(fā)現(xiàn)有對(duì)應(yīng)哺乳動(dòng)物ILD1和ILD5的兩個(gè)免疫球蛋白樣結(jié)構(gòu)域。
目前pIgR的免疫學(xué)功能研究主要集中在粘膜上皮細(xì)胞中pIg的調(diào)節(jié)、與配體的結(jié)合以及對(duì)pIg的胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)等方面。在魚(yú)類研究上則主要涉及pIgR在病原感染過(guò)程中的調(diào)控作用。研究發(fā)現(xiàn),泥鰍()、鯽()、鯉()、斑馬魚(yú)()、草魚(yú)()以及大菱鲆()等魚(yú)類感染細(xì)菌后的pIgR表達(dá)水平相較健康的魚(yú)體具有顯著性差異。虹鱒()以及海鱸()體內(nèi)的pIgR通過(guò)與其共生菌和病原菌相結(jié)合而發(fā)揮抑制病原菌增殖的作用,表明pIgR在維持微生物群落以及抵御黏膜表面病原菌入侵方面發(fā)揮著重要作用。白斑綜合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)利用pIgR作為感染日本囊對(duì)蝦()的細(xì)胞表面受體,其胞外部分能夠與WSSV的VP24互作,胞內(nèi)部分則與鈣調(diào)素作用募集網(wǎng)格蛋白和AP-2復(fù)合物促進(jìn)WSSV的侵入。
本研究通過(guò)PCR技術(shù)對(duì)羅非魚(yú)pIgR基因R完整的開(kāi)放閱讀框序列進(jìn)行擴(kuò)增,預(yù)測(cè)了羅非魚(yú)pIgR的蛋白結(jié)構(gòu),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),檢測(cè)羅非魚(yú)感染羅非魚(yú)湖病毒(TiLV)后脾、腎以及皮膚組織中pIgR表達(dá)的變化,構(gòu)建了重組真核表達(dá)載體pEGFP-R并將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至羅非魚(yú)腦細(xì)胞(TiB)中,初步研究了羅非魚(yú)pIgR對(duì)TiLV增殖的影響, 為羅非魚(yú)的抗病毒免疫研究提供理論基礎(chǔ)。
實(shí)驗(yàn)采用的健康羅非魚(yú),平均體重(20±5) g,采購(gòu)自廣東省某養(yǎng)殖場(chǎng),暫養(yǎng)于120 cm×50 cm×60 cm的玻璃魚(yú)缸中,水溫維持在(28±1)℃且持續(xù)曝氣充氧,定時(shí)定量投喂。表達(dá)載體pEGFP-N1和克隆宿主5購(gòu)自北京天根生物科技有限公司;TiB由珠江水產(chǎn)研究所魚(yú)病室建立并保存; TiLV-2017A由Sven.M.Bergennman博士(德國(guó)動(dòng)物健康研究院) 贈(zèng)送;限制性內(nèi)切酶EcoRI和KpnI、15 000 DNA marker、反轉(zhuǎn)錄試劑盒等購(gòu)于寶生物工程有限公司;RNA提取試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒和膠回收試劑盒購(gòu)自O(shè)mega生物技術(shù)有限公司;熒光定量試劑盒購(gòu)自艾克瑞生物工程有限公司。
取健康羅非魚(yú)18尾。15尾用于攻毒,每尾腹腔注射200 μL濃度約為10copies/μL的TiLV,剩余3尾注射相同體積PBS作為對(duì)照。攻毒組在注射后的12、24、48、72、96 h參照文獻(xiàn)[4]分別取三尾魚(yú)的脾臟、腎臟、皮膚等組織進(jìn)行后續(xù)研究。使用Total RNA Kit I從收集的樣品中提取總RNA。經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳和NANODROP 2000分光光度計(jì)確定RNA質(zhì)量與濃度。參照PrimeScriptRT Reagent Kit反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書合成cDNA,-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>
根據(jù)NCBI上提供的pIgR參考序列(GenBank:MK061423.1),設(shè)計(jì)R基因ORF序列特異性擴(kuò)增引物。引物名稱及序列如表1所示。 以1.2步驟中獲得的cDNA為模板使用高保真酶Prime STAR MAX,按照50 μL反應(yīng)體系配制反應(yīng)液,即Prime STAR MAX 25 μL,R-EcoRI-F,R-KpnI-R各1 μL,cDNA 2 μL,無(wú)酶水21 μL;反應(yīng)條件為98 ℃ 10 s,55 ℃ 15 s,72 ℃ 10 s,經(jīng)35次循環(huán)后獲得ORF全長(zhǎng)。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%的凝膠電泳鑒定后,在1 023 bp左右出現(xiàn)單一的目的條帶,采用Gel Extraction Kit(廣州飛揚(yáng)生物工程有限公司,中國(guó))對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化。將純化產(chǎn)物連接至pMD18T載體,轉(zhuǎn)化到DH5α感受態(tài)細(xì)胞內(nèi),使用氨芐抗性平板進(jìn)行篩選,經(jīng)PCR檢測(cè)陽(yáng)性后,送生工生物工程股份有限公司測(cè)序。
表1 引物信息Tab.1 Primers information
采用SMART在線服務(wù)器(https://smart.embl-heidelberg.de/smart/set_mode.cgi?NORMAL=1)預(yù)測(cè)R的結(jié)構(gòu)域。通過(guò)I-tasser在線服務(wù)器(https://zhanggroup.org/I-TASSER/)預(yù)測(cè)R的三維結(jié)構(gòu)。使用Cluster-X2.0程序進(jìn)行多物種pIgR氨基酸序列比對(duì),使用MEGA-X軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生和進(jìn)化分析,采用鄰位相連法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。
根據(jù)得到的ORF序列設(shè)計(jì)了實(shí)時(shí)熒光定量引物(q-pIgR-F/q-pIgR-R),以β-actin(Tia-β-actin-F/ Tia-β-actin-R)作為內(nèi)參基因(序列見(jiàn)表1),按照SYBR Green Premix ProHS qPCR Kit 說(shuō)明書對(duì)1.2步驟中所取各組織中的pIgR進(jìn)行定量分析。最后根據(jù)所測(cè)得的Ct值,采用2法計(jì)算pIgR基因的相對(duì)表達(dá)量。
使用限制性內(nèi)切酶EcoRI和KpnI對(duì)擴(kuò)增獲得的R基因以及pEGFP-N1載體進(jìn)行酶切,反應(yīng)條件為37 ℃,1 h。使用Thermo Fisher 的T4連接酶對(duì)酶切產(chǎn)物進(jìn)行連接,連接條件為22 ℃ 10 min。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化后,涂布于卡那霉素抗性平板上篩選鑒定,陽(yáng)性克隆經(jīng)PCR以及酶切鑒定后送測(cè)序。序列正確的質(zhì)粒命名為pEGFP-R。使用Omega公司的無(wú)內(nèi)毒素的質(zhì)粒提取試劑盒提取重組質(zhì)粒pEGFP-R,測(cè)定質(zhì)粒濃度后-20 ℃保存。
將狀態(tài)良好的TiB細(xì)胞經(jīng)胰酶消化處理后,用含10% 胎牛血清(FBS)的M199培養(yǎng)基制備成含有1×10個(gè)/mL的細(xì)胞懸液,分別吸取2.5 mL的細(xì)胞懸液接種到六孔板的三個(gè)孔中,待細(xì)胞單層覆蓋到80%~90%左右的時(shí)候,分別向其中的兩孔中轉(zhuǎn)染2 μg的重組質(zhì)粒pEGFP-R以及pEGFP-N1空載,剩下一孔不做轉(zhuǎn)染。轉(zhuǎn)染方法參照Lipo-fectamine2000(Invitrogen,USA)的說(shuō)明書進(jìn)行。轉(zhuǎn)染36 h后,棄上清,加入200 μL 1× SDS緩沖液收取細(xì)胞樣到1.5 mL的離心管中,混勻后煮沸5 min,12 000離心1 min獲得上清。蛋白樣品經(jīng)SDS-PAGE電泳分離后,轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜(NC膜)上進(jìn)行Western blot分析。5%脫脂奶室溫下封閉1 h,將商品化GFP兔抗按照1∶4 000倍稀釋后室溫孵育2 h,加入二抗(1∶4 000稀釋)室溫孵育2 h,加入顯色液顯色,拍照記錄。
將狀態(tài)良好的TiB細(xì)胞于轉(zhuǎn)染前24 h接種到底面積為25 cm的6個(gè)細(xì)胞培養(yǎng)瓶中,平均分為2組。 每一組參照Lipofectamine2000說(shuō)明書步驟分別轉(zhuǎn)染50 μg的pEGFP-N1質(zhì)粒和pEGFP-R過(guò)表達(dá)質(zhì)粒,每組設(shè)置三個(gè)平行。并在轉(zhuǎn)染后的36 h時(shí)棄掉培養(yǎng)液,用HBSS清洗兩遍,分別加入濃度約為10copies/μL 的TiLV病毒液各1 mL,在28 ℃的培養(yǎng)箱中孵育1.5 h,之后棄掉病毒液,補(bǔ)加5 mL的含5%FBS的M199培養(yǎng)基,繼續(xù)放入28 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。在病毒感染后的48 h和72 h收樣。分別對(duì)-1基因,-8和-10基因進(jìn)行定量檢測(cè)。
使用GraphPad Prism 8 軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的數(shù)據(jù)按照tests方法進(jìn)行顯著性差異分析,>005表示差異不顯著,<005表示差異顯著,<0.01表示差異極顯著。
通過(guò)PCR擴(kuò)增的基因經(jīng)測(cè)序比對(duì)后,確認(rèn)為羅非魚(yú)pIgR 完整ORF 序列。結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)顯示,羅非魚(yú)pIgR蛋白的第1~20個(gè)氨基酸構(gòu)成一個(gè)信號(hào)肽,第25~130以及第137~229個(gè)氨基酸分別構(gòu)成兩個(gè)Ig樣結(jié)構(gòu)域(圖1-A);同源建模結(jié)果顯示,pIgR蛋白整體呈扭曲的“L”型,主要由反平行β片層和無(wú)規(guī)卷曲組成(圖1-B);進(jìn)化樹(shù)分析顯示,pIgR主要分為哺乳類,兩棲類和鳥(niǎo)類,以及硬骨魚(yú)類三個(gè)亞群。其中羅非魚(yú)pIgR與同屬于鱸形目()的大口黑鱸()以及斜帶石斑魚(yú)()的pIgR最為接近(圖2)。
圖1 羅非魚(yú)pIgR蛋白結(jié)構(gòu)域與三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig.1 Prediction of tilapia pIgR protein domain and 3D structureA結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè):紅色區(qū)域?yàn)樾盘?hào)肽,綠色區(qū)域?yàn)镮g樣結(jié)構(gòu)域,紫色區(qū)域?yàn)榈蛷?fù)雜度區(qū);B:三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
圖2 不同物種pIgR蛋白序列系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 Phylogenetic tree of different species pIgR amino acids sequences
羅非魚(yú)在感染TiLV后,皮膚、脾臟以及腎臟三個(gè)組織器官中pIgR的表達(dá)量均呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì),感染后24 h皮膚中pIgR的表達(dá)量達(dá)到最高值(圖3-B);在脾臟和腎臟中則是48 h時(shí)表達(dá)量達(dá)到最高值隨后開(kāi)始下降(圖3-A、3-C)。
圖3 不同組織中的時(shí)相表達(dá)Fig.3 pIgR expression in different tissues at post infectionA:pIgR在脾臟中的時(shí)相;B:pIgR在皮膚中的時(shí)相;C:pIgR在腎臟中的時(shí)相;*表示差異存在顯著性(P<0.05),圖5同。
結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染pEGFP-R在55~70 kDa的位置出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的融合蛋白條帶(圖4),表明重組真核表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-R可以在細(xì)胞內(nèi)正確表達(dá)出目的蛋白。
圖4 Western-blot鑒定重組質(zhì)粒pEGFP-OnpIgR體外表達(dá)情況Fig.4 Expression of recombinant plasmid pEGFP-OnpIgR in vitroM為蛋白Marker;1為轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒細(xì)胞樣;2為轉(zhuǎn)染pEGFP-n1空載細(xì)胞樣;3為空白TiB細(xì)胞樣
圖5結(jié)果顯示,與對(duì)照組細(xì)胞相比,在過(guò)表達(dá)pIgR的細(xì)胞中TiLV感染后48 h和72 h的-8和-10片段的mRNA水平均明顯上調(diào),病毒拷貝數(shù)也顯著增多,表明pIgR顯著促進(jìn)了TiLV的增殖。
圖5 pIgR過(guò)表達(dá)對(duì)TiLV增殖的影響Fig.5 Effect of pIgR overexpression on TilV proliferation
本研究成功克隆了羅非魚(yú)pIgR 完整ORF序列,長(zhǎng)度為1 023 bp,蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)顯示羅非魚(yú)pIgR蛋白具有一個(gè)信號(hào)肽,兩個(gè)Ig樣結(jié)構(gòu)域,同源建模結(jié)果顯示,pIgR蛋白整體呈扭曲的“L”型,主要由反平行β片層和無(wú)規(guī)卷曲組成,與相關(guān)報(bào)道中的魚(yú)類pIgR結(jié)構(gòu)一致,表明羅非魚(yú)的pIgR具備結(jié)合和轉(zhuǎn)運(yùn)多聚免疫球蛋白的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ);系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示,硬骨魚(yú)類pIgR聚為一支,兩棲類和鳥(niǎo)類的聚為一支,哺乳類的聚為一支,且羅非魚(yú)pIgR與同屬于鱸形目的大口黑鱸以及斜帶石斑魚(yú)的pIgR聚為一個(gè)分支,而同屬于鯉科魚(yú)類的草魚(yú)、鯉魚(yú)以及斑馬魚(yú)又聚為一個(gè)分支,表明pIgR具有一定的種屬性差異。RT-qPCR定量結(jié)果顯示,感染TiLV后羅非魚(yú)皮膚、脾臟以及腎臟器官中pIgR的表達(dá)量均呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì),感染后24 h皮膚中表達(dá)量達(dá)到最高值,隨后開(kāi)始下降;在脾臟和腎臟中則是48 h時(shí)達(dá)到最高值隨后開(kāi)始下降。表明羅非魚(yú)受到外界刺激時(shí),相對(duì)于中樞免疫器官而言,粘液相關(guān)免疫組織能夠更早地做出免疫反應(yīng)。成功構(gòu)建了羅非魚(yú)pIgR過(guò)表達(dá)受體,并在TiB細(xì)胞中進(jìn)行pIgR過(guò)表達(dá)后顯著促進(jìn)了TiLV的增殖。與NIU等的發(fā)現(xiàn),WSSV能夠利用pIgR促進(jìn)自身增殖;在LLC-PK1細(xì)胞上過(guò)表達(dá)也能夠促進(jìn)豬流行性腹瀉病毒(PEDV)增殖等研究結(jié)果一致,初步表明TiLV也可能利用pIgR促進(jìn)自身感染。
目前關(guān)于魚(yú)類pIgR 的研究大多涉及對(duì)病原菌的響應(yīng)和表達(dá)模式分析。如pIgR在斜帶石斑魚(yú)、牙鲆()、大菱鲆和鯉魚(yú)等硬骨魚(yú)類組織中均有表達(dá),且在胃、腸道、鰓和皮膚等粘液相關(guān)組織中的表達(dá)量較高。通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)發(fā)現(xiàn)菌液浸泡處理后的鯉魚(yú)腸道中的pIgR表達(dá)量呈先上升后下降的趨勢(shì)。斑馬魚(yú)在感染海豚鏈球菌后,pIgR表達(dá)水平也呈現(xiàn)穩(wěn)定上升趨勢(shì),但是感染烏鱧彈狀病毒(SHRV)后的斑馬魚(yú)pIgR表達(dá)水平則穩(wěn)定下降。表明病毒刺激引起的pIgR表達(dá)變化與細(xì)菌刺激引起的變化存在著差異,具體原因有待后續(xù)進(jìn)一步研究證明。草魚(yú)浸泡感染柱狀黃桿菌后,pIgR mRNA水平也迅速顯著上升,隨后逐漸下降到對(duì)照水平,并且在草魚(yú)的皮膚中pIgR mRNA的增長(zhǎng)最早,幅度最大,且其在皮膚中的應(yīng)答反應(yīng)比在腸或鰓中更快。除了病原菌,有報(bào)道表明泥鰍在感染了白點(diǎn)蟲(chóng)之后,其脾臟、腎臟、鰓和皮膚中的pIgR表達(dá)量也顯著升高。盡管對(duì)多種不同硬骨魚(yú)類pIgR在應(yīng)對(duì)病原菌或寄生蟲(chóng)感染響應(yīng)的表達(dá)模式有了初步的了解,并提示其在黏膜免疫過(guò)程中發(fā)揮重要的作用,但其潛在的分子機(jī)制仍有待進(jìn)一步闡明。
除了黏膜免疫上的功能,pIgR作為細(xì)胞表面分子受體也常被部分病毒劫持作為入侵的靶點(diǎn)。之前的研究已發(fā)現(xiàn)多種病毒包括RNA 病毒和DNA病毒將pIgR作為病毒入侵的受體進(jìn)入細(xì)胞。如pIgR過(guò)表達(dá)的宿主細(xì)胞感染PEDV之后,PEDV的N蛋白、病毒滴度以及病毒mRNA均顯著增加,表明pIgR促進(jìn)了PEDV在宿主細(xì)胞內(nèi)的增殖。王會(huì)英等發(fā)現(xiàn),EPC細(xì)胞中干擾素的特異性表達(dá)能夠靶向抑制傳染性造血器官壞死病毒的增殖。而pIgR表達(dá)量的降低能夠?qū)е翴FN-γ表達(dá)水平的上升,從而減低鼠諾如病毒(MNV)的滴度,在pIgR敲降小鼠中,病毒的急性感染也出現(xiàn)減緩。以上研究均表明pIgR在影響病毒入侵過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。而關(guān)于水生動(dòng)物pIgR及病毒的研究,目前較為清晰的是日本囊對(duì)蝦pIgR(MjpIgR)與WSSV之間的互作,該病毒可通過(guò)與MjpIgR結(jié)合后經(jīng)網(wǎng)格蛋白介導(dǎo)的內(nèi)吞方式進(jìn)入細(xì)胞完成自身增殖。本研究發(fā)現(xiàn)羅非魚(yú)pIgR過(guò)表達(dá)后也促進(jìn)了TiLV的增殖,TiLV是否也是利用pIgR通過(guò)網(wǎng)格蛋白介導(dǎo)的內(nèi)吞進(jìn)入細(xì)胞將在后續(xù)的研究中進(jìn)一步闡明。
作為水生動(dòng)物新發(fā)病毒,TiLV的病原學(xué)及致病機(jī)理仍不清楚,本研究對(duì)羅非魚(yú)pIgR的生物學(xué)特性及對(duì)TiLV的增值影響作用進(jìn)行了初步研究,為后續(xù)TiLV致病機(jī)制的研究、抗TiLV藥物的研發(fā)和抗TiLV苗種的培育具有一定的借鑒意義。