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      基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)的白扁豆總皂苷抑制前列腺癌細胞系PC-3細胞生長的機制研究*

      2022-08-20 06:12:50袁強華
      關(guān)鍵詞:白扁豆總皂苷貨號

      袁強華 韓 君

      (1)成都中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院藥劑科,成都 610072;2)北京康仁堂藥業(yè)有限公司中藥配方顆粒關(guān)鍵技術(shù)國家地方聯(lián)合工程研究中心,北京 101301)

      前列腺癌是老年男性泌尿生殖系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,在全球男性腫瘤中,發(fā)病率和死亡率分別位列第2位和第5位[1]。近年來上市的內(nèi)分泌治療藥物只能有限改善前列腺癌患者的預(yù)后情況,并且長期使用容易出現(xiàn)耐藥性。此外,用于前列腺癌治療的化療藥如多西他賽等,其靶向效率不佳,故現(xiàn)有藥物仍有局限性[2]。這些局限性限制了前列腺癌藥物長期療效以及應(yīng)用。

      從天然藥物中分離提取化學(xué)成分是抗癌藥物的來源之一。研究表明,一些中藥提取物對前列腺癌具有明顯的抗腫瘤效果[3],因此進一步探索能夠抑制前列腺癌發(fā)生發(fā)展的中藥成分是有必要的。

      白扁豆,屬于豆科植物,在全國各地均有栽培。白扁豆的種子能夠作為重要的中藥原材料,活性成分的前期研究發(fā)現(xiàn)其種子含有皂苷[4]。藥理以及臨床研究均發(fā)現(xiàn),白扁豆總皂苷具有抗菌及增強細胞免疫的作用,小扁豆凝集素能明顯抑制肝癌細胞生長[5]。目前關(guān)于白扁豆總皂苷在前列腺癌中的作用及其發(fā)揮作用的分子機制尚未見報道。

      因此,本研究擬利用白扁豆總皂苷處理前列腺癌細胞系,探究白扁豆總皂苷對前列腺癌的作用以及其發(fā)揮作用的具體分子機制,力圖為前列腺癌的臨床干預(yù)提供新的治療手段。

      1 材 料

      1.1 實驗材料

      PC-3細胞購自中科院細胞庫,白扁豆總皂苷(批號201210)購自成都植標(biāo)化純生物技術(shù)有限公司,PBS緩沖液(貨號B548117-0500)購自生工生物,胎牛血清(貨號16000-044)購自Gibco,胰酶(貨號C0201)、CCK8檢測試劑盒(貨號C0038)購自碧云天生物,RIPA細胞裂解液、BCA蛋白濃度檢測試劑盒、超敏ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒購自上海碧云天生物公司,兔抗人醛脫氫酶7家族成員A1(ALDH7A1)(貨號DF12247)購自Affinity Biosciences公司,兔抗人胱硫醚β合成酶樣(CBSL)(貨號AP17189PU-N)購自O(shè)riGene公司,兔抗人甘氨酸C-乙酰轉(zhuǎn)移酶(GCAT)(貨號ab181094)、兔抗人二甲基甘氨酸脫氫酶(DMGDH)(貨號ab198292),鼠抗人磷酸甘油酸變位酶家族成員4(PGAM4)(貨號ab279384)、β-肌動蛋白抗體(β-actin antibody)(貨號ab8226)、辣根過氧化酶標(biāo)記山羊抗鼠IgG(貨號ab6789)、辣根過氧化酶標(biāo)記山羊抗兔IgG(貨號ab136636)購自Abcam公司,DMEM/F12培養(yǎng)基(貨號D6421)購自Sigma-Aldrich公司,pcDNA3.1哺乳動物表達載體(貨號V79020)、Lipofectamine LTX(貨號15338500)購自Invitrogen公司。

      1.2 儀器

      倒置顯微鏡(IX70型Olympus公司);酶標(biāo)儀(MK3 Thermo);實時熒光定量PCR儀(CFX96 Bio-Rad)。

      2 方法

      2.1 細胞培養(yǎng)

      PC-3細胞用含有10%胎牛血清的DMEM/F12培養(yǎng)基,置于37℃、CO2體積分數(shù)為5%的飽和濕度培養(yǎng)箱中進行常規(guī)培養(yǎng)。

      2.2 藥物處理

      稱取白扁豆總皂苷,用二甲基亞砜(DMSO)充分溶解并配制400 g/L母液。用完全培養(yǎng)基將白扁豆總皂苷分別稀釋成終濃度為0、15.625、31.25、62.5、125、250、500、1 000、2 000、4 000 mg/L,用DMSO作為對照。

      2.3 CCK8檢測

      取對數(shù)生長期的細胞接種于96孔板中,每孔接種5 000個細胞,將96孔板在培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜。細胞培養(yǎng)過夜后,取出96孔板,吸棄培養(yǎng)基,每個實驗組加入含有上述不同濃度藥物的培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)24 h,每組設(shè)置3個平行孔。培養(yǎng)基中加入對應(yīng)體積的DMSO為空白對照組。處理結(jié)束后向每孔中加入CCK8溶液(每孔100μl培養(yǎng)基中加入10μl CCK8)。37℃培養(yǎng)箱孵育1 h后,用酶標(biāo)儀測定450 nm處的吸光度值。

      2.4 RNA提取

      細胞分成空白對照組和1 086 mg/L白扁豆總皂苷處理組兩個組,每組3個平行孔,藥物處理24 h后,棄掉細胞培養(yǎng)液。向培養(yǎng)板中每孔加入1 ml TRizol試劑,收集細胞樣本。之后向其中加入200μl氯仿,劇烈震蕩混勻。離心,收集上層的液體,并向其中加入等體積的異丙醇,充分混勻,使RNA沉淀。離心,棄掉上清,用預(yù)冷的75%乙醇洗滌沉淀。最后向離心管中加入適量體積的蒸餾水溶解RNA,并進行濃度測定。

      2.5 反轉(zhuǎn)錄和實時定量PCR反應(yīng)

      反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)根據(jù)南京諾唯贊公司的HiScript?III RT SuperMix for qPCR(+gDNA wiper)試劑盒(R323-01)進行,具體步驟按照說明書進行,反轉(zhuǎn)錄RNA的量為1μg。反轉(zhuǎn)錄結(jié)束后,向每管加入180μl TE溶液或者ddH2O將cDNA稀釋10倍,并將樣本放入-20℃冰箱保存,用于后續(xù)實驗。實時定量PCR反應(yīng)參照諾唯贊公司的ChamQ SYBR qPCR Master Mix試劑盒(Q311-02)進行。首先向每管2×ChamQ SYBR qPCR Master Mix中加入50μl ROX Reference Dye II,混合均勻,然后按照表1配制反應(yīng)體系:

      Table 1 RT-PCR reaction system

      配制好反應(yīng)液后,將液體依次加入96孔板中,最后加入cDNA。加樣結(jié)束后,用膜將96孔板封好,1 200 r/min離心1 min。接著在實時定量PCR儀上進行反應(yīng),反應(yīng)條件參照說明書。每個基因選用特定的引物重復(fù)檢測3次,基因的表達水平選用β-actin作為內(nèi)參。采用2-△△Ct法對基因的表達進行相對定量。引物序列如表2。

      Table 2 Primers for RT-PCR

      2.6 轉(zhuǎn)錄組測序及數(shù)據(jù)處理

      按照之前總RNA抽提方法抽提空白對照組和白扁豆總皂苷處理組的RNA,用Qubit Fluorometer和Agilent bioanalyzer 2100對RNA進行質(zhì)量檢測,RIN值大于7.5的RNA樣品用于后續(xù)的建庫。利用NEBNext? Ultra? RNA Library Prep Kit for Illumina?試劑盒進行建庫,建庫后的樣本采用雙端測序(2×150 bp)。利用FastQC軟件對測序得到的原始數(shù)據(jù)進行質(zhì)控分析,利用HISAT2進行序列比對,參考基因組為hg19。用String Tie和Ballgown軟件找到不同處理組之間的差異基因列表。本文選用變化倍數(shù)大于2(fold change>2)的差異基因進行后續(xù)的數(shù)據(jù)分析。轉(zhuǎn)錄組測序的原始數(shù)據(jù)已經(jīng)上傳NCBI,序列號為:PRJNA751036。

      2.7 細胞總蛋白質(zhì)抽提

      首先收集不同處理組的PC-3細胞樣本,并向其中加入適量的RIPA細胞裂解液,冰上裂解細胞30 min。細胞裂解之后,以最高轉(zhuǎn)速4℃離心15 min,將上清液轉(zhuǎn)移至新的EP管中,即為細胞中總蛋白質(zhì)。之后利用BCA蛋白濃度測定試劑盒檢測蛋白質(zhì)總濃度。測定濃度之后,向蛋白質(zhì)中加入等體積的上樣緩沖液,99℃加熱使蛋白質(zhì)變性,并將樣本保存在-20℃冰箱中。

      2.8 Western blot

      取40μg變性蛋白加到上樣孔中,進行SDSPAGE凝膠電泳。電泳結(jié)束后,進行轉(zhuǎn)膜,轉(zhuǎn)膜條件為恒流300 mA,時間為1 h。之后將PVDF膜放置在5%脫脂奶粉中室溫封閉2 h,分別加入對應(yīng)的一抗進行孵育(ALDH7A1一抗1∶500稀釋,GCAT一抗1∶1 000稀釋,PGAM4一抗1∶1 000稀釋,DMGDH一抗1∶1 000稀釋,CBSL一抗1∶500稀釋,β-actin一抗1∶1 000稀釋),4℃孵育過夜。第二天先用TBST洗膜3次,每次10 min。再加入1∶2 000稀釋的二抗室溫孵育2 h,TBST洗膜3次,每次10 min。最后將超敏ECL化學(xué)發(fā)光試劑滴加到PVDF膜上,進行曝光成像和拍照。蛋白質(zhì)的表達以β-actin為內(nèi)參,使用Quantity One軟件分析各條帶的蛋白質(zhì)相對表達水平。

      2.9 細胞轉(zhuǎn)染

      為了構(gòu)建ALDH7A1過表達質(zhì)粒,本文將人全長ALDH7A1 cDNA克隆到pcDNA3.1載體中(pc-ALDH7A1)??蛰d體pcDNA3.1為對照組(pc-NC)。按照廠商提供的說明書,使用Lipofectamine LTX將以上質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)染到PC-3細胞中,細胞轉(zhuǎn)染48 h后收集樣本,用于后續(xù)的Western blot分析。

      2.10 統(tǒng)計分析

      本文采用GraphPad Prsim 6.0軟件進行統(tǒng)計分析,所有數(shù)據(jù)表示為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差。本文使用t檢驗對不同組別進行顯著性分析。所有數(shù)據(jù)都進行至少3次獨立重復(fù)實驗。P值小于0.05被認為具有統(tǒng)計學(xué)意義。

      3 結(jié) 果

      3.1 白扁豆總皂苷能夠抑制前列腺癌細胞系PC-3細胞的生長

      本文先用不同濃度的白扁豆總皂苷處理前列腺癌PC-3細胞,CCK8結(jié)果顯示,當(dāng)濃度為0~250 mg/L時,白扁豆總皂苷對細胞的生長基本沒有影響。但是,當(dāng)濃度升高為500~4 000 mg/L時,細胞生長受到明顯抑制,并且呈濃度依賴性(圖1a,b)。進一步結(jié)果顯示,白扁豆總皂苷的IC50值為1 086 mg/L,因此后續(xù)實驗本文選用該濃度處理細胞。本文用該濃度處理細胞并收集不同時間點的細胞樣本進行檢測。RT-PCR結(jié)果顯示,隨著處理時間的延長,促凋亡標(biāo)志物BAX的mRNA水平顯著增加(圖1c)。因此,白扁豆總皂苷在體外能夠顯著抑制前列腺癌細胞的生長。

      Fig 1 The effect of total saponins of Lablab Semen Album on cell growth

      3.2 轉(zhuǎn)錄組分析

      為了探索白扁豆總皂苷抑制前列腺癌細胞生長的分子機制,本文對空白對照組和濃度為1 086 mg/L的白扁豆總皂苷處理12 h的細胞進行了轉(zhuǎn)錄組分析。結(jié)果顯示,不同組別的基因表達量基本沒有差異,分布也是基本一致的(圖2a)。差異基因分析結(jié)果顯示,與對照組相比,白扁豆總皂苷處理的細胞中具有2 360個差異基因,其中1 982個基因上調(diào),378個基因下調(diào)(圖2b)。

      Fig 2 Transcriptome analysis

      3.3 差異表達基因功能和通路富集分析

      為了探究對照組和給藥組的差異表達基因所參與的生物學(xué)過程及其功能,本文將變化倍數(shù)大于2并且P<0.05的差異基因進行基因組京都百科全書(KEGG)信號通路和基因功能注釋(GO)富集分析。KEGG結(jié)果顯示,差異表達基因富集在很多腫瘤相關(guān)通路,例如腫瘤代謝和IL-17相關(guān)通路等(圖3a)。GO結(jié)果顯示,差異表達基因顯著富集到有絲分裂紡錘體檢查點(mitotic spindle checkpoint)、紡錘體組裝檢查點(spindle assembly checkpoint)等一系列跟癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)的生物學(xué)過程(圖3b)。并且,這些差異基因主要分布在螺旋體雙子(gemini of coiled bodies)等(圖3c)。此外,差異表達基因的分子學(xué)功能主要跟錯配DNA結(jié)合(mismatched DNA binding)、金屬羧肽酶活性(metallocarboxypeptidase activity)和Toll樣受體結(jié)合(Toll-like receptor binding)等功能相關(guān)(圖3d)。

      Fig.3 Analysis of pathways and functions enrichment of differentially expressed genes after total saponins of Lablab Semen Album act on prostate cancer cells

      對代謝通路中的基因進一步分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)主要富集的差異基因有ALDH7A1、GCAT、PGAM4、DMGDH、CBSL、肌氨酸脫氫酶(SARDH)和哌可酸和肌氨酸氧化酶(PIPOX)(圖4a)。蛋白質(zhì)互作分析預(yù)測結(jié)果顯示,這7個蛋白質(zhì)之間存在相互作用(圖4b)。

      Fig.4 Attribution of pathway genes and analysis of protein interaction

      3.4 差異表達基因驗證

      由于轉(zhuǎn)錄組分析的結(jié)果存在一定程度的假陽性,因此為進一步證實測序結(jié)果,本文先用濃度為1 086 mg/L的白扁豆總皂苷處理PC-3細胞12 h,接著利用實時定量PCR對上述7個基因的表達進行驗證。結(jié)果顯示,在7個基因中有5個基因的mRNA水平與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致,它們分別是:

      ALDH7A1、GCAT、PGAM4、DMGDH、CBSL,而另外兩個基因SARDH和PIPOX的mRNA水平在不同組別之間沒有顯著差異(圖5a)。

      進一步本文對這5個差異基因的蛋白質(zhì)水平也進行了檢測。結(jié)果顯示,與對照組相比,濃度為1 086 mg/L白扁豆總皂苷處理的PC-3細胞中ALDH7A1、GCAT和PGAM4的蛋白質(zhì)表達水平顯著降低(P<0.05),而DMGDH和CBSL的蛋白質(zhì)表達水平顯著升高(P<0.001),與之前的RT-PCR驗證結(jié)果一致(圖5b,c)。

      Fig.5 Verification results of differentially expressed genes

      Fig.6 Influences of ALDH7A1 overexpression on the role of total saponins of Lablab Semen Album in inhibiting prostate cancer cell proliferation

      3.5 ALDH7A1過表達解除了白扁豆總皂苷對前列腺癌細胞系PC-3細胞的抑制作用

      白扁豆總皂苷處理的PC-3細胞中ALDH7A1的mRNA和蛋白質(zhì)表達水平均顯著降低。因此,為了進一步探究ALDH7A1是否參與了白扁豆總皂苷對PC-3細胞的生長抑制作用,本文構(gòu)建了ALDH7A1過表達質(zhì)粒并將其轉(zhuǎn)染到PC-3細胞,隨后用濃度為1 086 mg/L的白扁豆總皂苷處理細胞12 h。Western blot結(jié)果表明,ALDH7A1過表達質(zhì)粒顯著增加了PC-3細胞中ALDH7A1的蛋白質(zhì)表達(P<0.001),并且ALDH7A1過表達顯著增加了白扁豆總皂苷處理的PC-3細胞中ALDH7A1蛋白表達(P<0.01,圖6a,b)。CCK-8的結(jié)果顯示,pc-ALDH7A1轉(zhuǎn)染促進了PC-3細胞活力(P<0.001),白扁豆總皂苷處理則顯著抑制了PC-3的細胞活力(P<0.001),而進一步轉(zhuǎn)染pc-ALDH7A1后,部分逆轉(zhuǎn)了白扁豆總皂苷對細胞活力的抑制(P<0.01,圖6c),以上結(jié)果表明,白扁豆總皂苷通過下調(diào)ALDH7A1的表達抑制前列腺癌細胞系PC-3細胞生長。

      4 討 論

      前期研究表明,白扁豆中含有皂苷類成分,采用四極桿-靜電場軌道肼高分辨質(zhì)譜儀在負離子模式下對白扁豆總皂苷進行成分分析共鑒定出18個化合物,其中多為齊墩果烷型三萜類皂苷。如竹節(jié)參皂苷IVa(chikusetsusaponin IVa)、竹節(jié)參皂苷V(chikusetsusaponin V)和大豆皂苷I(soyasaponin I)等,且這些皂苷類成分具有廣泛的藥理活性[6-7]。采用紫外可見分光光度計測定白扁豆總皂苷(以齊墩果酸計)樣品中含量結(jié)果為52.8%。

      雖然之前報道小扁豆凝集素能夠抑制肝癌細胞的生長,但關(guān)于白扁豆總皂苷在前列腺癌中的作用目前尚無報道。而本研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)白扁豆總皂苷的給藥濃度大于500 mg/L時,其能明顯抑制前列腺癌細胞系PC-3的生長。并且隨著處理時間的延長,白扁豆總皂苷能夠促進PC-3細胞中促凋亡蛋白BAX的表達。轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),白扁豆總皂苷處理后引起的差異表達基因主要跟腫瘤代謝相關(guān)。通過對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行驗證,結(jié)果發(fā)現(xiàn),與對照組相比,在白扁豆總皂苷處理的細胞中ALDH7A1、GCAT和PGAM4的水平顯著降低,而DMGDH和CBSL的水平顯著升高。

      ALDH7A1作為乙醛脫氫酶,負責(zé)將膽堿代謝后的甜菜堿醛代謝成甜菜堿[8]。研究發(fā)現(xiàn),ALDH7A1在胰腺癌病人中高表達,其通過增加耗氧量和促進ATP的產(chǎn)生,從而促進胰腺癌的發(fā)生發(fā)展[9]。DMGDH是一種線粒體基質(zhì)黃素蛋白,負責(zé)二甲基甘氨酸的去甲基化,形成肌氨酸[10]。據(jù)報道,DMGDH在肝癌病人中顯著下調(diào),其通過影響Akt信號通路的活化,從而促進肝癌細胞的轉(zhuǎn)移[11]。PGAM4作為磷酸甘油酸變位酶(PGAM)的家族成員,是糖酵解和葡萄糖異生通路中的一種重要酶。PGAM4可以催化3-磷酸甘油酸鹽(3-PGA)轉(zhuǎn)化為2-磷酸甘油酸鹽(2-PGA)。在腫瘤細胞中,PGAM可調(diào)節(jié)糖酵解與其他ATP產(chǎn)生通路以及糖異生之間的平衡[12]。目前,對于GCAT和CBSL兩個基因在腫瘤中的作用尚未報道。此外,本研究還發(fā)現(xiàn)DMGDH的互作蛋白支架蛋白4A(Cullin4A,CUL4A),CUL4A已經(jīng)被報道能夠促進腫瘤的生長[13],暗示DMGDH可能與CUL4A相互作用介導(dǎo)白扁豆總皂苷對前列腺癌生長的抑制作用。

      本研究發(fā)現(xiàn),白扁豆總皂苷可以抑制前列腺癌細胞系PC-3細胞的生長。進一步的體外細胞實驗結(jié)果表明,白扁豆總皂苷通過下調(diào)ALDH7A1的表達從而抑制PC-3細胞生長。而之前的文獻報道ALDH7A1通過影響腫瘤代謝參與癌癥的發(fā)生發(fā)展,但是在前列腺癌中其是否具有相同的作用并不清楚。因此,接下來將繼續(xù)探究白扁豆總皂苷是否通過影響腫瘤代謝抑制PC-3細胞的生長。

      5 結(jié) 論

      本研究發(fā)現(xiàn)白扁豆總皂苷可以抑制前列腺癌細胞系PC-3細胞的生長。并且,白扁豆總皂苷可能通過影響腫瘤細胞的代謝過程發(fā)揮抑癌作用。體外細胞實驗結(jié)果表明,白扁豆總皂苷下調(diào)前列腺癌細胞中ALDH7A1的表達可能與其抑制前列腺癌細胞增殖作用相關(guān)。本研究的發(fā)現(xiàn)為前列腺癌的臨床干預(yù)提供了新的治療手段和見解。

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