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      基于機(jī)器視覺(jué)技術(shù)的紫蘇種子活力快檢指標(biāo)篩選研究

      2022-11-23 01:38:14吳偉鋒侯浩楠涂柯玲寧翠玲楊成民董學(xué)會(huì)曹海祿孫群
      中國(guó)種業(yè) 2022年11期
      關(guān)鍵詞:單粒種子活力紫蘇

      吳偉鋒 侯浩楠 涂柯玲 寧翠玲 楊成民 董學(xué)會(huì) 曹海祿 孫群

      (1 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)中藥材研究中心/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)作物種子全程技術(shù)研究北京創(chuàng)新中心/北京市作物遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193;2 承德恒德本草農(nóng)業(yè)科技有限公司,河北承德 067000;3 中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所,北京 100193;4 恒德本草(北京)農(nóng)業(yè)科技有限公司,北京 100070)

      紫蘇(Perilla frutescens(L.)Britt.)為唇形科紫蘇屬一年生草本植物,是我國(guó)傳統(tǒng)中藥的重要一味,以全草入藥,葉可解表散寒,籽可潤(rùn)肺平喘,??衫須鈱捴衃1]。紫蘇市場(chǎng)需求廣泛,在我國(guó)各地均有規(guī)模化人工種植。但目前市場(chǎng)上銷(xiāo)售的紫蘇種子多從大田或野外直接采收而來(lái),種子質(zhì)量難以控制,種子凈度、發(fā)芽率、出苗整齊度偏低[2]。從紫蘇種子質(zhì)量相關(guān)的3個(gè)現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn),即中華人民共和國(guó)農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)NY/T 2494—2013《植物新品種特異性、一致性和穩(wěn)定性測(cè)試指南 紫蘇》[3]、中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)T/CACM 1056.83—2019《中藥材種子種苗 紫蘇種子》[4]和河北省地方標(biāo)準(zhǔn)DB13/T 1320.1—2010《中藥材種子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn) 第1 部分:紫蘇》[5]來(lái)看,這3個(gè)文件規(guī)定的發(fā)芽率標(biāo)準(zhǔn)(≥75%)均遠(yuǎn)低于農(nóng)作物種子的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。種子質(zhì)量已成為制約紫蘇規(guī)范化生產(chǎn)和發(fā)展的“瓶頸”。種子作為最基本的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料,在儲(chǔ)藏的過(guò)程中會(huì)發(fā)生自然老化,隨著老化程度的增加,種子的活力會(huì)持續(xù)下降,對(duì)種子播種后萌發(fā)以及田間出苗等會(huì)產(chǎn)生極大的影響。傳統(tǒng)檢測(cè)種子生活力或活力的方法是進(jìn)行發(fā)芽試驗(yàn),測(cè)量周期長(zhǎng),對(duì)種子具破壞性,而且由于發(fā)芽環(huán)境及人為操作等因素,結(jié)果穩(wěn)定性不夠理想。種子清選是提升種子質(zhì)量的重要手段之一,主要按種子的物理特性(如寬度、厚度、長(zhǎng)度、比重、臨界懸浮速度、顏色等)除去種子中的夾雜物質(zhì),如未成熟的、破碎的以及遭受病蟲(chóng)害的種子和雜草種子,提升種子的凈度和發(fā)芽率。在判斷加工程序的有效性方面,多肉眼判斷凈度,無(wú)法快速評(píng)判種子的活力。中藥材種業(yè)市場(chǎng)的種子質(zhì)量監(jiān)管、種子質(zhì)量提升手段有效性的及時(shí)判斷等均需要對(duì)種子活力進(jìn)行快速檢測(cè)。

      種皮葉綠素含量是作為判定種子成熟度及種子質(zhì)量的重要指標(biāo)之一,種子葉綠素含量高,則成熟度低;反之,葉綠素含量低則成熟度相對(duì)高。歐洲廣泛采用葉綠素?zé)晒鈨x對(duì)種子葉綠素含量進(jìn)行快速檢測(cè)[6-8],葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)的操作原理是當(dāng)波長(zhǎng)650~730nm 的光照在種子表皮上,種子表皮上的葉綠素將以熒光和熱的形式散發(fā)能量,通過(guò)對(duì)種子表皮上葉綠素?zé)晒獾臋z測(cè),實(shí)現(xiàn)種子成熟度或種子活力的快速判別。Jalink等[9]依靠葉綠素?zé)晒夂繉?duì)種子活力進(jìn)行分級(jí);Kenanoglu等[10]使用葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)種子分選機(jī)對(duì)辣椒種子進(jìn)行分級(jí)。目前光學(xué)葉綠素?zé)晒鈾z測(cè)儀便攜易操作,檢測(cè)快速,但仍存在成本較高的問(wèn)題。

      機(jī)器視覺(jué)技術(shù)近年來(lái)發(fā)展迅速,是一種計(jì)算機(jī)技術(shù)和圖像識(shí)別處理技術(shù)相結(jié)合的多領(lǐng)域新型交叉技術(shù)[11],具有計(jì)算能力強(qiáng)、價(jià)格低、非破壞性和高效率等特點(diǎn)[12],在農(nóng)作物種子質(zhì)量分類(lèi)、品種鑒別等方面已有廣泛應(yīng)用[13-16]。Xu等[17]通過(guò)機(jī)器視覺(jué)技術(shù)采集提取了黃芪種子的多個(gè)顏色特征,其中R 值和G 值與葉綠素含量的決定系數(shù)R2達(dá)到0.969 和0.965,基于多個(gè)特征建立的葉綠素含量預(yù)測(cè)模型,其R2達(dá)到0.940 以上。

      基于上述研究進(jìn)展,本研究利用收集到的大量不同來(lái)源、不同加工方式處理后的紫蘇種子,通過(guò)機(jī)器視覺(jué)技術(shù)采集種子的尺寸、顏色和紋理等表型指標(biāo),通過(guò)比較單粒種子各表型指標(biāo)與活力之間的相關(guān)性,以篩選到的指標(biāo)在不同活力紫蘇種子批間進(jìn)行比較驗(yàn)證,確定可以代替葉綠素含量的種子活力快檢指標(biāo)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料試驗(yàn)以15個(gè)批次(來(lái)源)紫蘇種子作為試驗(yàn)材料(表1),其中單粒試驗(yàn)使用Lot 3 批次紫蘇種子,千粒重為3.134g,發(fā)芽率為69.3%。以33份不同加工環(huán)節(jié)(篩選、比重選、色選處理)的紫蘇種子(Lot 1加工后的3份種子,Lot 2加工后的4份種子,Lot 3 加工后的10 份種子,Lot 12 加工后的6 份種子,Lot 13 加工后的2 份種子,Lot 14 加工后的6 份種子,Lot 15 加工后的2 份種子)為快檢指標(biāo)驗(yàn)證樣品。

      表1 15個(gè)批次的紫蘇種子

      1.2 試驗(yàn)方法

      1.2.1 單粒試驗(yàn)從Lot 3 中選取凈種600 粒,置于Microtek MiCardWizard 掃描儀(上海中晶科技有限公司)上,進(jìn)行種子掃描,獲得分辨率為300dpi 的圖片,保存為.tif 無(wú)損格式。

      使用種子表型全自動(dòng)提取系統(tǒng)(PhenoSeed,南京智農(nóng)云芯大數(shù)據(jù)科技有限公司與中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)種子科學(xué)與技術(shù)研究中心共同研發(fā))進(jìn)行種子表型指標(biāo)的提取。尺寸指標(biāo)包括長(zhǎng)(Length,單位mm)、寬(Width,單位mm)、長(zhǎng)寬比(L/W Ratio)、投影面積(Area,單位mm2)、周長(zhǎng)(Perimeter,單位mm)、圓度(Roundness);顏色指標(biāo)包括紅色值(Red,R)、綠色值(Green,G)、藍(lán)色值(Blue,B)、色相(Hue,H)、飽和度(Saturation,S)、明度(Value,V)、亮度(Luminosity,L)、從紅色至綠色的范圍(a)、從藍(lán)色至黃色的范圍(b)、灰度(Gray)的平均值(mean)及標(biāo)準(zhǔn)差(std);紋理指標(biāo)包括Gray、R、G、B 這4個(gè)分量下的對(duì)比度(Contrast)、相異性(Dissimilarity)、同質(zhì)性(Homogeneity)、能量(Energy)、自相關(guān)(Correlation)、角二階矩(ASM)、熵(Entropy)。

      將種子按掃描時(shí)的序號(hào)放入發(fā)芽盒中,25℃光照條件下進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)發(fā)芽試驗(yàn),每天檢查種子是否發(fā)芽,統(tǒng)計(jì)到第8 天。

      然后采用Excel 2016、SPSS 21.0 對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),分析單粒種子發(fā)芽情況與種子表型指標(biāo)之間的相關(guān)性。

      1.2.2 群體試驗(yàn)測(cè)定15個(gè)批次紫蘇種子的尺寸、顏色、紋理指標(biāo),分析種子的表型指標(biāo)與種子發(fā)芽率之間的相關(guān)性。

      1.2.3 快檢指標(biāo)的篩選與驗(yàn)證以33 份不同加工環(huán)節(jié)處理(篩選、比重選、色選)后的紫蘇種子建立驗(yàn)證樣品池。采用FluoMini Pro 光學(xué)葉綠素?zé)晒猓–F)檢測(cè)儀檢測(cè)其葉綠素含量,補(bǔ)充提取機(jī)器視覺(jué)指標(biāo)和發(fā)芽率,進(jìn)行相關(guān)性分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 單粒紫蘇種子活力與機(jī)器視覺(jué)指標(biāo)的相關(guān)性分析相關(guān)性分析表明,多項(xiàng)指標(biāo)與單?;盍Υ嬖谙嚓P(guān)性,篩選出20個(gè)與單粒發(fā)芽結(jié)果顯著或極顯著相關(guān)的指標(biāo)。由表2 可知,顏色指標(biāo)的相關(guān)系數(shù)(紅色值、綠色值、藍(lán)色值、從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、色相、飽和度、明度)多高于尺寸指標(biāo)(長(zhǎng)、寬、長(zhǎng)寬比、投影面積、圓度)。其中從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、色相、飽和度這幾個(gè)指標(biāo)與活力的相關(guān)系數(shù)較高,絕對(duì)值達(dá)到0.437 以上。后續(xù)將重點(diǎn)關(guān)注這幾個(gè)顏色指標(biāo)。

      表2 紫蘇單粒種子表型指標(biāo)與發(fā)芽率相關(guān)指標(biāo)篩選

      2.2 不同批次紫蘇種子活力與機(jī)器視覺(jué)指標(biāo)的相關(guān)性分析以15 份紫蘇種子為材料進(jìn)行群體試驗(yàn),對(duì)種子批發(fā)芽率和群體表型指標(biāo)平均值進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果表明多個(gè)顏色指標(biāo)與發(fā)芽率存在顯著相關(guān)或極顯著相關(guān),相較于單粒試驗(yàn),未篩選到尺寸指標(biāo)。從表3 可以看出,與單粒發(fā)芽試驗(yàn)相比,顯著或極顯著相關(guān)的指標(biāo)數(shù)量減少至10個(gè)。其中葉綠素含量與發(fā)芽率呈現(xiàn)顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為-0.549。單粒試驗(yàn)中篩選到的從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、色相、飽和度指標(biāo)同樣出現(xiàn)在群體試驗(yàn)結(jié)果中,相關(guān)系數(shù)分別為-0.826、-0.949、0.922、-0.820。除了指標(biāo)平均值外,雖然從紅色至綠色的范圍標(biāo)準(zhǔn)差、從藍(lán)色至黃色的范圍標(biāo)準(zhǔn)差、飽和度標(biāo)準(zhǔn)差與發(fā)芽率的相關(guān)系數(shù)絕對(duì)值超過(guò)0.549(參考葉綠素與發(fā)芽率的相關(guān)系數(shù)),考慮到檢測(cè)的方便性,舍棄不用。后面的驗(yàn)證試驗(yàn)將重點(diǎn)驗(yàn)證從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、色相、飽和度這幾個(gè)指標(biāo)。

      表3 15 份紫蘇種子表型指標(biāo)與發(fā)芽率相關(guān)指標(biāo)篩選

      2.3 快檢指標(biāo)篩選以33 份不同加工環(huán)節(jié)(機(jī)器篩選、液體比重選及G、R 值分選)的紫蘇種子進(jìn)行驗(yàn)證,獲得與前面相對(duì)一致的結(jié)果,篩選出22個(gè)與發(fā)芽率顯著或極顯著相關(guān)指標(biāo)。其中葉綠素含量與發(fā)芽率呈極顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為-0.569(表4)。從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、色相、飽和度這幾個(gè)指標(biāo)中色相與發(fā)芽率的相關(guān)系數(shù)降到0.380,不如其余3個(gè)指標(biāo)穩(wěn)定。從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、飽和度均與發(fā)芽率呈極顯著負(fù)相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為-0.596、-0.730、-0.699,雖略低于15 份紫蘇種子中與發(fā)芽率的相關(guān)系數(shù),但仍均高于葉綠素含量與發(fā)芽率之間的相關(guān)系數(shù)。進(jìn)一步比較不同加工環(huán)節(jié)分選得到的不同組別種子間從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、飽和度這3個(gè)指標(biāo)的變異系數(shù),探究其在區(qū)分種子發(fā)芽率上的有效性,結(jié)果表明從紅色至綠色的范圍平均值在不同組別之間變異系數(shù)最高,穩(wěn)定高于不同組別的葉綠素變異系數(shù),因此優(yōu)先推薦通過(guò)檢測(cè)從紅色至綠色的范圍平均值進(jìn)行生產(chǎn)上加工或處理手段的有效性判斷。

      表4 33 份紫蘇種子表型指標(biāo)與發(fā)芽率相關(guān)指標(biāo)篩選

      3 結(jié)論與討論

      3.1 單粒試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)紫蘇種子活力與顏色指標(biāo)相關(guān)性強(qiáng)進(jìn)行紫蘇種子單粒發(fā)芽試驗(yàn)的目的是為了將每粒種子的表型指標(biāo)與其發(fā)芽情況對(duì)應(yīng),通過(guò)隨機(jī)選取一定數(shù)量的紫蘇種子進(jìn)行試驗(yàn),可以得到大量的表型數(shù)據(jù)和對(duì)應(yīng)的發(fā)芽結(jié)果,從而對(duì)活力快檢指標(biāo)進(jìn)行初步篩選。相關(guān)性分析表明,20個(gè)指標(biāo)與發(fā)芽率存在顯著或極顯著關(guān)系,種子的多個(gè)尺寸指標(biāo)包含在其中,但相關(guān)系數(shù)并不高,多數(shù)低于顏色指標(biāo)。

      考慮紫蘇種子快檢指標(biāo)的篩選精簡(jiǎn)性和實(shí)用性,為此選擇了相關(guān)系數(shù)較高的a、b、H、S 值作為初步的篩選指標(biāo),后續(xù)對(duì)15 份不同批次的種子進(jìn)行數(shù)據(jù)采集,驗(yàn)證以上4個(gè)指標(biāo)作為快檢指標(biāo)的可靠性。

      3.2 群體試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)紫蘇種子活力與a、b、H、S指標(biāo)相關(guān)性強(qiáng)對(duì)15 份種子分別進(jìn)行機(jī)器視覺(jué)掃描、葉綠素含量測(cè)定以及發(fā)芽率測(cè)定,并將每份種子的表型指標(biāo)平均值與發(fā)芽率進(jìn)行相關(guān)性分析,最終選取得到10個(gè)與發(fā)芽率顯著或極顯著相關(guān)指標(biāo)。相較于單粒試驗(yàn)結(jié)果,群體試驗(yàn)并未篩選到與活力顯著相關(guān)的尺寸指標(biāo),這表明在同一批次內(nèi),紫蘇種子活力與尺寸指標(biāo)相關(guān)聯(lián),但在不同批次之間,種子的尺寸差異更多是遺傳因素所導(dǎo)致,與活力的關(guān)系并不顯著。相比之下,顏色指標(biāo)與活力的相關(guān)性較為穩(wěn)定,其中從紅色至綠色的范圍(a)、從藍(lán)色至黃色的范圍(b)、色相(H)、飽和度(S)指標(biāo)相關(guān)系數(shù)絕對(duì)值均穩(wěn)定高于0.549(參考葉綠素相關(guān)系數(shù))。

      3.3 快檢指標(biāo)篩選除機(jī)器視覺(jué)技術(shù)外,近年來(lái)基于光學(xué)特性的種子活力快速無(wú)損檢測(cè)技術(shù)也在逐漸興起,包括X 射線(xiàn)技術(shù)、近紅外光譜技術(shù)、高光譜成像技術(shù)等。但這些技術(shù)尚處于實(shí)驗(yàn)室研究階段,目前市面上缺少商用的種子活力檢測(cè)設(shè)備,原因在于光學(xué)檢測(cè)技術(shù)成本普遍較高,并且對(duì)于不同品種或批次的種子,往往需要通過(guò)光譜數(shù)據(jù)和發(fā)芽試驗(yàn)建立相應(yīng)的模型,實(shí)際應(yīng)用較為復(fù)雜[18]。本研究首次采用機(jī)器視覺(jué)技術(shù)對(duì)紫蘇種子進(jìn)行快檢指標(biāo)篩選,在一定程度上,對(duì)檢測(cè)加工工序是否有效、種子處理是否有效等提供了數(shù)據(jù)指導(dǎo),大大降低了檢測(cè)成本,實(shí)際操作也更為簡(jiǎn)便。本研究以各種比重篩選、液體比重選及色選分選的種子作為驗(yàn)證材料,對(duì)從紅色至綠色的范圍、從藍(lán)色至黃色的范圍、色相、飽和度作為快檢指標(biāo)的穩(wěn)定性和區(qū)分度進(jìn)行比較,擴(kuò)充了樣本數(shù)據(jù)池,增加了數(shù)據(jù)可信性。

      通過(guò)分析比較不同加工環(huán)節(jié)的種子進(jìn)行快檢指標(biāo)的確定,最終以相關(guān)性穩(wěn)定的從紅色至綠色的范圍(a)、從藍(lán)色至黃色的范圍(b)、飽和度(S)作為快檢指標(biāo)。在紫蘇種子生產(chǎn)、加工、銷(xiāo)售等各個(gè)環(huán)節(jié),可通過(guò)機(jī)器視覺(jué)技術(shù)快速提供種子的a、b、S 值,用于種子質(zhì)量的快速判定,比較加工工序是否有效,種子處理是否有效等。

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