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      宏基因組二代測序技術在艾滋病合并肺諾卡菌病診斷中的應用(附1例報告)

      2023-03-14 07:17:06趙蕊鄒俊
      老年醫(yī)學研究 2023年1期
      關鍵詞:諾卡菌諾卡洗液

      趙蕊,鄒俊

      南寧市第四人民醫(yī)院[廣西艾滋病臨床治療中心(南寧)]感染科,廣西南寧 530023

      諾卡菌在自然界廣泛存在,常寄生于腐物,形態(tài)為分枝棒狀,屬革蘭陽性需氧菌,部分諾卡菌抗酸染色結果表現(xiàn)為弱陽性,培養(yǎng)生長速度緩慢。諾卡菌病常見于艾滋病(AIDS)等免疫功能受損且伴有其他機會性感染患者,臨床表現(xiàn)無特異性,診斷依賴于病原學。由于諾卡菌與分支桿菌在形態(tài)、染色特征方面相似,臨床上易誤診。近年來,高通量測序技術不斷發(fā)展,逐步應用到感染性疾病領域,用于致病菌的快速精準鑒定。宏基因組二代測序技術(mNGS)可對感染標本直接進行高通量測序,保留并檢測樣本中全部病原信息,為AIDS復雜性感染提供快速精準診斷。本文報告1例老年AIDS合并諾卡菌病患者經常規(guī)診治及結合mNGS技術最終確診過程,總結臨床經驗,為該類疾病的快速準確診斷、治療及預后提供參考。

      1 病例資料

      1.1 基本資料 患者男,65歲,1個月前無明顯誘因下出現(xiàn)咳嗽,咳白色粘液痰,偶有咳血絲痰,伴乏力、納差、活動后氣促,無畏寒、寒戰(zhàn),無胸痛、心悸、端坐呼吸。于南寧市第九人民醫(yī)院行胸部CT:左下肺團塊狀軟組織密度灶,考慮占位性病變(周圍肺癌可能性大)。抽血檢查提示HIV初篩陽性。遂于2020年11月16日轉入我院。既往體健,有不潔性行為史。

      1.2 入院查體及實驗室檢查 體溫37.1 ℃,脈搏96 次/分,呼吸20 次/分,血壓95/59 mmHg,口腔黏膜未見白膜,心肺腹查體未見異常。全血細胞五分類+全程CRP:血紅蛋白78 g/L、中性粒細胞數(shù)6.4×109/L、淋巴細胞數(shù)0.5×109/L、超敏CRP(免疫熒光法)>5 mg/L、CRP定量33.40 mg/L。血清淀粉樣蛋白A>200 mg/L。血沉116 mm/h。血氣分析、降鈣素原(PCT)定量、新型隱球菌莢膜多糖抗原檢測、特殊腫瘤標志物五項、結核抗體均未見異常。曲霉菌半乳甘露聚糖、念珠菌甘露聚糖、血清呼吸道病原體IgM均為陰性。CD4+T淋巴細胞18個/微升。2020年11月18日胸部平掃+增強(圖1A),初步診斷:①肺部感染,結核待排;左肺下葉團片實變影,考慮感染性病變(馬爾尼菲藍狀菌或馬紅球可能);②兩肺上葉間隙旁型肺氣腫;③主動脈、冠狀動脈硬化;④左側胸膜增厚,雙側胸腔少量積液;⑤肝內膽管輕度擴張。

      1.3 診斷治療及預后 結合患者以上臨床資料,入院初步考慮AIDS可能性大,且合并細菌性肺炎。入院后予哌拉西林他唑巴坦(4.5 g靜滴,每8 h一次)、止血等對癥治療。患者仍有發(fā)熱、咳嗽、咳血絲痰癥狀。11月23日復查胸部CT提示肺部病灶較前增多(圖1B)。次日對患者肺穿刺組織行病理檢查(圖2):鏡下肺組織局灶可見壞死伴大量中性粒細胞浸潤,未見肉芽腫及朗漢斯巨細胞,形態(tài)上傾向于化膿性炎癥??顾幔ǎ?,糖原染色(-)。結核分枝桿菌復合群DNA未檢出。結合患者癥狀、胸部CT表現(xiàn),不能排除肺結核可能,遂予加用異煙肼(0.3 g/d)、利福平(0.45 g/d)、乙胺丁醇(0.75 g/d)和吡嗪酰胺(1.5 g/d)診斷性抗結核分枝桿菌治療。11月25日HIV-1抗體確認試驗陽性,確立診斷:AIDS。因患者反復咯血,考慮哌拉西林他唑巴坦有引起出血可能,改為頭孢他啶(2 g靜滴,每8 h一次)抗感染。患者痰培養(yǎng)出陰溝腸桿菌復合菌、鮑曼不動桿菌(頭孢他啶、阿米卡星均敏感),根據(jù)藥敏結果加阿米卡星(0.2 g,每12 h一次)聯(lián)合抗感染治療,并予氣管鏡肺泡灌洗液送長沙賽哲醫(yī)學檢驗實驗室行mNGS檢測。肺泡灌洗液mNGS檢測檢出諾卡菌屬,檢出序列數(shù)512(91.59%)。患者免疫力低下,為諾卡菌病易感者,且mNGS檢出諾卡菌序列數(shù)高,診斷考慮合并諾卡菌病,予加用復方磺胺甲唑(1.44 g口服,3次/日)聯(lián)合阿米卡星抗諾卡菌治療。用藥后患者無發(fā)熱,咳嗽減少,無咳血絲痰。11月30日胸部CT提示病灶減少(圖1C)。12月3日患者癥狀好轉,結合肺穿刺病理及灌洗液結果,暫排除肺結核診斷,修正診斷為:AIDS合并肺諾卡菌病。予停用其余藥物,繼續(xù)復方磺胺甲唑聯(lián)合阿米卡星抗諾卡菌治療。

      圖2 艾滋病合并諾卡菌肺炎患者肺穿刺組織病理檢查(蘇木精-伊紅染色法)

      12月8日復查胸部CT(圖1D)提示肺部病灶減少。次日患者病情好轉出院。出院后繼續(xù)復方磺胺甲唑(1.44 g,3次/日)抗諾卡菌治療3個月,2020年12月12日開始艾考恩丙替片抗HIV治療,隨訪至2022年4月18日,患者一般情況可,無不適癥狀。

      圖1 艾滋病合并諾卡菌肺炎患者胸部CT表現(xiàn)

      2 討論

      諾卡菌病多發(fā)生于免疫缺陷或長期應用免疫抑制劑的人群,且免疫缺陷患者比非免疫缺陷患者病情更嚴重,病死率明顯更高,但臨床表現(xiàn)無差異[1-2]。諾卡菌感染以肺諾卡菌病最為常見,考慮與諾卡菌經呼吸道侵入相關。主要臨床癥狀有咳嗽、咳痰,痰為膿性或血性,可伴發(fā)熱、盜汗、消瘦等類似結核中毒癥狀,胸部影像學檢查可表現(xiàn)為結節(jié)、大片滲出、實變、腫塊和空洞等多種形態(tài),可伴有膿腫、胸腔積液[3-4]。肺外諾卡菌病包括顱內諾卡菌感染[5-6]、皮膚諾卡菌?。?]、諾卡菌角膜炎[8]和諾卡菌敗血癥等。AIDS患者機體免疫功能障礙,是諾卡菌病的好發(fā)人群,然而諾卡菌病并不是常見機會性感染,其診斷依賴于病原學,常規(guī)檢查方法包括直接涂片鏡檢和培養(yǎng),陽性可確診。諾卡菌繁殖速度慢,一般2~7 d可見菌落,有時可能需要長達4周的時間,尤其是在選擇性分枝桿菌培養(yǎng)基上生長時。改良抗酸染色和革蘭染色涂片鏡檢對于在等待培養(yǎng)結果的同時提供快速推定診斷尤為重要[9],臨床醫(yī)師懷疑諾卡菌感染時需與檢驗科微生物室充分溝通,以便采取措施針對性培養(yǎng)及早期識別。然而由于諾卡菌病較少見,且臨床表現(xiàn)無特異性,臨床及檢驗易忽略。

      本病例中患者血培養(yǎng)、肺穿刺組織培養(yǎng)、肺泡灌洗液培養(yǎng)均為陰性,考慮與培養(yǎng)時間不足有關,如延長培養(yǎng)時間或可得到陽性結果。mNGS技術具有快速、準確的特點,應用mNGS技術檢測出諾卡菌不應被視為污染物,但需注意排除氣道定植菌可能,需結合患者臨床表現(xiàn)、影像學表現(xiàn)等綜合判斷。本病例中患者發(fā)熱、咳嗽、咯血,CT表現(xiàn)為大片實變影及結節(jié)、斑片、條索影,與報道相符,結合病原學證據(jù)及治療過程,最終診斷限定為AIDS合并諾卡菌肺炎。

      近年來,mNGS技術對于感染性疾病的診斷價值逐步顯現(xiàn),mNGS技術提取標本中全部核酸信息進行測序,可檢測樣本中全部微生物信息,為AIDS復雜性感染提供精準、及時的診斷。mNGS對所檢測標本中病原微生物具有全覆蓋、耗時短、無偏倚等優(yōu)勢,現(xiàn)已有較多關于應用mNGS技術輔助感染性疾病診斷的研究報道[11-12],包括呼吸系統(tǒng)、中樞神經系統(tǒng)、泌尿系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、骨關節(jié)、皮膚、眼內、血液等幾乎全身各部位感染[11]。特別是在一些免疫缺陷患者合并復雜感染,傳統(tǒng)檢驗難以確定的病原感染或罕見病原感染的病例中,mNGS技術在臨床診斷中表現(xiàn)出了獨特的優(yōu)勢。本病例患者為AIDS合并肺部感染,由于免疫缺陷患者機會性感染表現(xiàn)不典型,本病例初始誤診為結核,經抗結核治療效果欠佳,完善肺泡灌洗液mNGS檢查后明確病原為較為少見的諾卡菌,最終調整治療方案后好轉。

      mNGS技術缺點在于費用高,報告結果不能區(qū)分檢測出的微生物是否為致病菌,建議聯(lián)合傳統(tǒng)檢驗技術綜合判定,提高診斷的特異性和敏感性。送檢標本推薦血液、無菌體液或無菌病理組織。對于肺泡灌洗液標本,由于其可能混入氣管定植菌,因此需結合患者臨床表現(xiàn)、檢驗及影像學資料等進行綜合分析判定。檢測報告中序列數(shù)較高、排名靠前的病原微生物,需要排除污染菌、定植菌的可能后,可認為是感染致病菌。對于特殊致病病原體(如諾卡菌、支原體、流感病毒)、胞內菌(如結核、傷寒、布魯菌)、厚壁菌(如真菌)檢出序列數(shù)不高,也要考慮其為致病病原體的可能。本病例mNGS檢測出諾卡菌為特殊致病病原體,且臨床癥狀、體征、影像學表現(xiàn)均與肺諾卡菌病相符,經針對性抗諾卡菌治療后病情好轉,最終明確診斷。同樣,mNGS檢測技術也可能出現(xiàn)假陰性報告情況,可能原因有:應用抗生素后送檢、罕見病原體感染、胞內菌感染等,因檢出序列數(shù)少而未在報告中列舉,如臨床懷疑特定病原菌感染,可檢測后追溯原始數(shù)據(jù)庫查詢[13]。

      諾卡菌病規(guī)范治療首選磺胺類藥物[10]。在重癥感染或免疫抑制患者中,需要兩種或以上的藥物聯(lián)合使用,推薦復方磺胺甲唑聯(lián)合阿米卡星或亞胺培南,根據(jù)藥敏結果及時調整。肺諾卡菌感染或中樞神經系統(tǒng)外的多發(fā)膿腫,最小療程為6周,對于播散型或中樞神經系統(tǒng)諾卡菌感染,療程可用至3個月[6]。由于諾卡菌病易誤診,且免疫缺陷患者感染諾卡菌后病死率高,對于AIDS合并肺部感染者,胸部DR見單發(fā)或多發(fā)的結節(jié)伴空洞或肺實變,治療效果差,特別是合并皮下膿腫表現(xiàn)者,則需考慮諾卡菌病的可能性,及時行血、膿液、痰、支氣管灌洗液、肺組織穿刺等多部位標本培養(yǎng)及mNGS檢測,以盡早確診,提高本病的好轉率、治愈率。

      本病例的診療經過提示,由于諾卡菌培養(yǎng)生長速度緩慢,臨床常難以明確諾卡菌病診斷,需結合患者的臨床表現(xiàn)、影像學資料及治療經過綜合分析,對于疑似諾卡菌感染病例,應及時與檢驗科溝通,必要時延長病原培養(yǎng)時間。由于感染性疾病應用常規(guī)檢驗明確病原診斷具有一定難度,mNGS技術可以為感染性疾病診斷提供新的思路,其在病原診斷中具有廣闊的應用前景,值得繼續(xù)深入探索。

      利益沖突所有作者聲明不存在利益沖突

      作者貢獻聲明趙蕊:數(shù)據(jù)采集、整理及分析,文章撰寫;鄒俊:對病例診治及論文進行指導批閱

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