沈潔如 王素英 張宏宇 婁婷婷 喬晨曦
1(天津商業(yè)大學(xué)生物技術(shù)與食品科學(xué)學(xué)院, 天津市食品生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 天津 300134)
2(天津海關(guān)動(dòng)植物與食品檢測(cè)中心, 天津 300461)
纖維素和幾丁質(zhì)是自然界中儲(chǔ)量居第一位和第二位的生物質(zhì)資源,分別以葡萄糖和N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)為單體,通過(guò)β-1,4 糖苷鍵連接而成的直鏈高聚物[1-3]。一直以來(lái),這類(lèi)結(jié)晶態(tài)多糖的降解和利用是實(shí)驗(yàn)室和工業(yè)領(lǐng)域研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn)[4-6]。因纖維素和幾丁質(zhì)的分子內(nèi)部及分子間存在氫鍵,可形成高度有序的結(jié)晶態(tài)結(jié)構(gòu),限制了糖苷水解酶的可及性[7-8],阻礙多糖結(jié)晶區(qū)域的有效降解[9]。然而,具有氧化裂解纖維素和幾丁質(zhì)等結(jié)晶區(qū)域特性的裂解多糖單加氧酶(Lytic polysaccharide monooxygenases,LPMOs)的發(fā)現(xiàn),為頑固多糖降解提供了新的方向[10-14],在生物質(zhì)轉(zhuǎn)化和生物燃料工業(yè)等方面具有廣闊的應(yīng)用前景[15-16]。
在碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫(kù)(www.cazy.org)中,LPMOs 歸為輔助活性家族(Auxiliary activity family,AA),目前已有AA9~11 和AA13~16 共7 個(gè)家族,其中,AA9 和AA10 家族的LPMOs 研究比較深入[17-20]。AA9 家族的LPMOs 主要源于真菌,作用于纖維素[21-22]、可溶性纖維寡糖[23]、木聚糖[24]、半纖維素[25]和淀粉[26]等底物。AA10 家族的LPMOs 主要源于細(xì)菌,具有纖維素、幾丁質(zhì)、木聚糖以及甘露聚糖降解活性[10,14,27-28]。為探索各家族LPMOs 的酶學(xué)特性及其催化機(jī)理,對(duì)LPMOs 活性的檢測(cè)至關(guān)重要。目前,LPMOs 活性的檢測(cè)方法逐漸多樣化,主要包括色譜-質(zhì)譜法、比色法和熒光探針標(biāo)記法等。其中,色譜-質(zhì)譜法因其靈敏度高、可對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析等特點(diǎn),為解析LPMOs 催化機(jī)制提供了重要手段[21,29-31];比色法通過(guò)測(cè)定底物或產(chǎn)物的濃度,與酶活力建立量效關(guān)系,進(jìn)而表征LPMOs 活性,常應(yīng)用于突變體的快速高通量篩選[3];熒光探針標(biāo)記法利用熒光探針對(duì)多糖底物進(jìn)行標(biāo)記,通過(guò)測(cè)定熒光值表征LPMOs 活性[32]。以上方法雖存在一定的局限性,但都有其適用范圍,而各方法的有機(jī)結(jié)合可為L(zhǎng)PMOs 的新酶開(kāi)發(fā)、催化機(jī)制研究及酶工程中突變體的快速篩選等提供有力的技術(shù)支撐,從而實(shí)現(xiàn)LPMOs 在工業(yè)化生物質(zhì)轉(zhuǎn)化中的應(yīng)用。
有關(guān)LPMOs 活性檢測(cè)的綜述報(bào)道有許多[3-4,33],但重點(diǎn)集中在LPMOs 結(jié)構(gòu)、催化機(jī)制、家族分類(lèi)和底物特異性等方面的總結(jié)與評(píng)述,對(duì)檢測(cè)方法的論述較少。本文評(píng)述了近5 年LPMOs 活性檢測(cè)方法的研究進(jìn)展,重點(diǎn)對(duì)色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法、比色法和熒光探針標(biāo)記法等的基本原理及其在LPMOs 活性檢測(cè)中的應(yīng)用進(jìn)行了梳理,總結(jié)了LPMOs 活性檢測(cè)方法的優(yōu)缺點(diǎn)及適用范圍,并對(duì)其未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)進(jìn)行了展望。
色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法是基于樣品的保留時(shí)間、碎片離子和峰面積分析其種類(lèi)并計(jì)算含量,從而達(dá)到測(cè)定酶活力的目的[34]。不同催化活性的LPMOs 借助O2(或H2O2)和電子,從多糖鏈C1 或C4 位置獲取氫原子使之羥基化,導(dǎo)致糖苷鍵斷裂和多糖鏈端氧化[23,35],產(chǎn)生不同類(lèi)型的氧化產(chǎn)物。如具有纖維素活性的LPMOs 可以催化C1 或C4 位,也可以同時(shí)氧化二者[32,36]產(chǎn)生C1 位的醛糖酸和C4 位的4-醛基酮糖[3,10,22],幾丁質(zhì)活性的LPMOs 氧化C1 位生成醛糖酸內(nèi)酯,并水合形成醛糖酸[10,36-37](圖1)。對(duì)不同類(lèi)型的產(chǎn)物進(jìn)行識(shí)別和量化所用的色譜-質(zhì)譜法不同。目前,常用于檢測(cè)LPMOs 活性的色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法主要包括高效陰離子交換色譜-脈沖電流檢測(cè)法(High-performance anion-exchange chromatography-pulsed amperometric detector,HPAEC-PAD)、親水作用液相色譜-質(zhì)譜法(Hydrophilic interaction liquid chromatography-mass spectrometry,HILIC-MS)、多孔石墨化碳色譜-質(zhì)譜法(Porous graphitized carbon chromatography-mass spectrometry,PGC-MS)和超高效液相色譜-質(zhì)譜法(Ultra high performance liquid chromatography-mass spectrometry,UHPLC-MS)等,各檢測(cè)方法可測(cè)定產(chǎn)物的分子量范圍及優(yōu)缺點(diǎn)見(jiàn)表1。
表1 色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法在LPMOs活性檢測(cè)中的應(yīng)用Table1 Application of chromatography-mass spectrometry in detection of LPMOs activities
圖1 裂解多糖單加氧酶(LPMOs)氧化裂解纖維素和幾丁質(zhì)的機(jī)理及其產(chǎn)物的形成:(A)LPMOs 催化機(jī)理[30]; (B)纖維素氧化裂解產(chǎn)物[32]; (C)幾丁質(zhì)氧化裂解產(chǎn)物[10,37]Fig.1 Mechanism of oxidative cracking of cellulose and chitin by lytic polysaccharide monooxygenases(LPMOs) and the products: (A) Catalytic mechanism of LPMOs[30]; (B) Products of cellulose oxidated[32];(C) Products of chitin oxidated[10,37]
HPAEC 主要用于纖維素氧化產(chǎn)物糖醛酸的分析[10,29],其中,在檢測(cè)低聚合度產(chǎn)物時(shí)PAD 的靈敏度高于CAD[29]。通過(guò)HPAEC-PAD 分離纖維素降解產(chǎn)物,最先被分離出的是非氧化產(chǎn)物,其次是C1 和C4 氧化產(chǎn)物,最后是C1/C4 雙氧化產(chǎn)物[46](圖2)。在堿性條件下,C1 氧化產(chǎn)物因帶負(fù)電而被分離和檢測(cè)[40]。Westereng 等[40]通過(guò)HPAEC-PAD 耦合ESI-MS 檢測(cè)了ScLPMO10C 的C1 氧化產(chǎn)物,由于C4 氧化產(chǎn)物在堿性條件下易發(fā)生化學(xué)修飾和互變異構(gòu)[23,47],使質(zhì)譜無(wú)法檢測(cè)到相應(yīng)的分子質(zhì)量。在可溶性產(chǎn)物的檢測(cè)中,HPAEC-PAD 測(cè)定氧化寡糖的檢出限(Limit of detection,LOD)可達(dá)0.09~0.40 ng/injection,寡糖的LOD 值為0.34~0.66 ng/injection[29]。因檢測(cè)不溶性產(chǎn)物存在局限性,使測(cè)得的LPMOs 整體活性低于真實(shí)值[3]。Cannella 等[48]通過(guò)水解酶處理LPMOs 催化反應(yīng)后的產(chǎn)物,測(cè)定葡萄糖和葡糖酸的含量,并計(jì)算被氧化纖維素的總量,間接測(cè)定不溶性產(chǎn)物的含量。Frommhagen 等[24]采用相同的方法測(cè)定不溶物含量,得出在反應(yīng)初期不溶性物所含的氧化寡糖的量高于可溶性部分。然而,通過(guò)此方式水解不溶性產(chǎn)物再進(jìn)行分析時(shí),耗時(shí)較長(zhǎng)且標(biāo)準(zhǔn)品不易獲得,影響LPMOs 活性檢測(cè)的準(zhǔn)確性。因此,該方法僅限于可溶性產(chǎn)物的分析。
圖2 不同來(lái)源的LPMOs 作用于纖維素的氧化裂解產(chǎn)物[46]Fig.2 Oxidative cracking products of cellulose by LPMOs from different sources[46]
HILIC 常作為中性寡糖的分析方法,如幾丁質(zhì)降解產(chǎn)物[29,49]。Vaaje-Kolstad 等[10]通過(guò)HILIC 和MALDI-TOF-MS 聯(lián)用分析了源于粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratia marcescens)的CBP21 催化幾丁質(zhì)的反應(yīng)產(chǎn)物殼寡糖,并解析了CBP21 的催化機(jī)理。依據(jù)殼寡糖與幾丁-醛酸pH 值的不同,前者在中性流動(dòng)相(乙腈-水)中保持穩(wěn)定,后者因帶電荷,可通過(guò)增加離子強(qiáng)度調(diào)節(jié)洗脫液的pH 值實(shí)現(xiàn)殼寡糖和幾丁-醛酸的分離[50]。Westereng 等[29]通過(guò)堿性條件電離醛酸以及高強(qiáng)度離子洗脫液平衡電荷消除互斥效應(yīng),并在70%乙腈條件下,用HILIC 法檢測(cè)氧化寡糖的LOD 值范圍為33~113 ng/injection。由于PAD 的準(zhǔn)確性易受乙腈影響,因此CAD 常與HILIC-MS 結(jié)合檢測(cè)。然而,該方法在分析聚合度大于4 的寡糖和氧化寡糖時(shí),其解析效果較差[29],可通過(guò)升高柱溫來(lái)提高HILIC 色譜的分離效果以及改善峰形,并且能防止寡糖發(fā)生異構(gòu)分離現(xiàn)象。
鑒于上述C4 氧化產(chǎn)物檢測(cè)的局限性,Westereng 等[40]結(jié)合HILIC(WAX 柱)和PGC 分離出C1 和C4氧化產(chǎn)物,根據(jù)樣品的極性特征,利用石墨色譜柱實(shí)現(xiàn)了纖維寡糖和氧化寡糖的分離[51]。因醛糖酸和非氧化產(chǎn)物的電離常數(shù)(pKa)值不同,在PGC 色譜分離過(guò)程中,弱堿性條件(pH 8)的流動(dòng)相使醛糖酸帶負(fù)電(纖維二糖酸pKa=3.51[40]和D-葡萄糖酸pKa=3.7)[3,29]?;诖耍琖estereng 等[29]成功獲得了醛糖酸的分離條件以及相同聚合度的裂解產(chǎn)物的分離,如4-乙二醇醛糖和醛糖酸。對(duì)有相同保留時(shí)間的非氧化產(chǎn)物、C4 纖維糊精或醛酸及雙氧化產(chǎn)物,可通過(guò)質(zhì)譜分析或者β-葡萄糖苷酶水解產(chǎn)物再次檢測(cè)[40]。PGC-MS 和CAD 可直接兼容,并在低離子濃度的洗脫液下對(duì)C4-纖維寡糖進(jìn)行定量分析,其LOD 可低至45~66 ng/injection,滿(mǎn)足動(dòng)力學(xué)研究的要求[40]。然而,該方法存在一定的局限性,由于PGC 固定相對(duì)長(zhǎng)鏈寡糖有強(qiáng)親和力,即使在高洗脫強(qiáng)度下,聚合度>5 的中性纖維低聚糖也不能被洗脫[29],因此PGC 色譜只能分析聚合度≤5 的寡糖。
Silva 等[31]將UHPLC(HILIC 柱)與ESI-MS 聯(lián)用檢測(cè)聚合度為1~5 的寡糖,結(jié)合基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)進(jìn)一步分析了聚合度在3~10 之間的寡糖[42],獲得了完整的產(chǎn)物譜。然而,在質(zhì)譜分析中,LPMOs 反應(yīng)產(chǎn)物中氧化寡糖和寡糖的質(zhì)量差為m/z16,與鈉和鉀加合物的質(zhì)量差一致,而鈉和鉀加合物在大多數(shù)實(shí)驗(yàn)條件下存在,從而在質(zhì)譜分析中會(huì)產(chǎn)生m/z值重疊,而MALDI-TOF MS 的分辨率可達(dá)40000,可以區(qū)分具有重疊m/z值的化合物[50]。因此,MALDI-TOF MS 常作為一種定性評(píng)估LPMOs 氧化產(chǎn)物的分析方法[10,21,38,42-45,50],目前已成功分析了具有幾丁質(zhì)活性[10,52-53]、半纖維素活性[25,54]和淀粉活性[26]的LPMOs。此外,MALDI-TOF 還可以間接評(píng)估LPMOs 的底物特異性。Jensen 等[37]在探究底物特異性時(shí)將具有幾丁質(zhì)活性的ScLPMO10C 突變?yōu)榫哂欣w維素活性的LPMOs,借助UHPLC 和MALDI-TOF MS 測(cè)定了可溶性殼寡糖的含量,以表征ScLPMO10C 突變前后的氧化活性。
RP-UHPLC 分析LPMOs 氧化產(chǎn)物的應(yīng)用較少。Frommhagen 等[41]利用還原性的標(biāo)記物2-氨基苯甲酰胺(2-AB)與C4 氧化寡糖標(biāo)記,結(jié)合RP-UHPLC 成功分離了C4 寡糖。然而,寡糖的還原端與熒光團(tuán)-胺復(fù)合物反應(yīng)過(guò)程中形成的中間體不穩(wěn)定,因此Frommhagen 等[41]在不添加強(qiáng)還原劑的情況下,采用非緩沖洗脫液成功鑒定了寡糖和C4 氧化寡糖。該方法補(bǔ)充了C4 氧化產(chǎn)物的分析方法,相對(duì)于PGC 方法,其優(yōu)點(diǎn)是改進(jìn)了對(duì)纖維寡糖和C4 氧化寡糖的分析和鑒定[3],并因使用了非緩沖洗脫液,對(duì)質(zhì)譜靈敏度的影響較小。
在色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法中,HPAEC-PAD 是LPMOs 活性檢測(cè)方法中靈敏度最高的方法,可以分析聚合度較高的氧化產(chǎn)物,但不能與質(zhì)譜法直接兼容。與HPAEC-PAD 相比,HILIC 和PGC-LC 可與質(zhì)譜法直接兼容從而實(shí)現(xiàn)高靈敏度分析??梢岳肏PAEC-PAD 結(jié)合ESI-MS 分析C1 氧化產(chǎn)物[10,29]以及PGC 和CAD分離解析C4 氧化產(chǎn)物[40],兩者結(jié)合可以獲得纖維素產(chǎn)物譜信息。幾丁質(zhì)氧化產(chǎn)物常以HILIC 結(jié)合MALDI-TOF MS 進(jìn)行分析,從而表征LPMOs 活性[42]。在新酶挖掘及酶學(xué)特性的研究中,色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法仍是可靠的分析方法。
色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法雖具有高靈敏度的特點(diǎn),但其儀器設(shè)備昂貴,使用范圍受限。因此,開(kāi)發(fā)快速、簡(jiǎn)便的LPMOs 活性檢測(cè)方法引起了更多的關(guān)注。隨著LPMOs 研究的不斷深入,建立靈敏、快速的酶活檢測(cè)方法在LPMOs 的工程化改造過(guò)程中具有重要意義。因此,基于LPMOs 催化反應(yīng)特性的比色法得到了快速發(fā)展,傳統(tǒng)的二硝基水楊酸法、高靈敏度的比色法如鎳/鄰苯二酚紫分析法、D-葡萄糖酸/D-葡萄糖酸-δ-內(nèi)酯分析法以及基于H2O2產(chǎn)量的比色法等,被用于快速穩(wěn)定地檢測(cè)LPMOs 活性。本節(jié)以氧化產(chǎn)物的類(lèi)型為主線(xiàn),結(jié)合方法應(yīng)用和LPMOs 活性檢測(cè)的時(shí)間先后順序,分別基于生成的還原糖產(chǎn)物、C1 氧化產(chǎn)物以及H2O2等對(duì)基于比色法的LPMOs 活性檢測(cè)方法進(jìn)行闡述。
二硝基水楊酸法(3,5-Dinitrosalicylic acid,DNS)最初用于測(cè)定還原糖,通過(guò)還原糖與二硝基水楊酸在堿性條件下發(fā)生氧化還原反應(yīng),并在540 nm 處測(cè)定反應(yīng)產(chǎn)物的吸光度確定還原糖的含量[55]。該方法早期用于LPMOs 的活性測(cè)定,通過(guò)比較單一水解酶活性和經(jīng)LPMOs 協(xié)同作用的酶活性的差值判定LPMOs 活性。Kim 等[56]結(jié)合高效液相色譜法和DNS 法測(cè)定了葡萄糖和纖維二糖的含量,從而表征了CgAA9 和纖維素酶的協(xié)同作用。該方法操作簡(jiǎn)單,但表征LPMOs 活性的靈敏度較低。Deshavath 等[55]發(fā)現(xiàn)在呋喃糖存在的條件下,測(cè)得的還原糖含量遠(yuǎn)高于實(shí)際值,并且未檢測(cè)到非還原性寡糖。因此,該方法適用于探究LPMOs 的協(xié)同作用,而局限于混合產(chǎn)物中單糖的定量分析。
Wang 等[57]基于丙烯酸定量檢測(cè)法開(kāi)發(fā)了鎳/鄰苯二酚紫分析法用于LPMOs 活性檢測(cè)。該方法結(jié)合C1 氧化產(chǎn)物醛糖酸呈負(fù)電荷的特點(diǎn),并基于鄰苯二酚紫(Pyrocatechol violet,PV)與金屬陽(yáng)離子如Cu2+和Ni2+等螯合形成金屬離子-PV 復(fù)合物在特定波長(zhǎng)下有特征吸收,通過(guò)測(cè)定Ni2+-PV 在650 nm 處的吸光值,達(dá)到快速測(cè)定LPMOs 活性的目的。該方法還可根據(jù)離子吸附/解吸附原理,收集產(chǎn)物與Ni2+共孵育并加入PV,測(cè)定上清液中游離的Ni2+含量,從而計(jì)算多糖表面產(chǎn)生羧酸根的量。Ni 等[58]應(yīng)用Ni2+-PV 法檢測(cè)PcLPMO9D 酶活性時(shí)發(fā)現(xiàn)高濃度的LPMOs 對(duì)纖維素酶有影響。然而,該方法也存在局限性,在檢測(cè)羧酸根含量時(shí),Ni2+-羧酸不遵循1∶2 的比例結(jié)合[57],從而不能精準(zhǔn)定量檢測(cè)醛糖酸。因此,該方法適用于不同家族中LPMOs 活性的比較,以及LPMO 底物特異性的研究。
鑒于LPMOs 催化反應(yīng)底物形式的單一性,Keller 等[59]開(kāi)發(fā)了一種快速測(cè)定微晶纖維素和預(yù)處理麥秸中葡萄糖酸的方法。利用糖苷水解酶處理TtLPMO9E 酶解產(chǎn)物,通過(guò)D-葡萄糖酸/D-葡萄糖酸-δ-內(nèi)酯分析試劑盒(D-Gluconic acid/D-Glucono-δ-lactone assay)測(cè)定反應(yīng)產(chǎn)物葡萄糖酸。利用葡萄糖酸激酶、NADP 和6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶催化將葡萄糖酸轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和NADPH,通過(guò)測(cè)定NADPH 在340 nm 處的吸光值測(cè)定LPMOs 活性。該方法測(cè)定葡萄糖酸的LOD 值可低至0.27 mg/L,與HPAEC-PAD相比,其靈敏度可以實(shí)現(xiàn)對(duì)LPMOs 反應(yīng)產(chǎn)物的定量分析[3,59]。然而,該方法在更改條件時(shí)需進(jìn)行校準(zhǔn),以排除潛在的干擾。
上述檢測(cè)方法均需借助氧化產(chǎn)物對(duì)LPMOs 活性進(jìn)行定量分析,而根據(jù)LPMOs 的催化機(jī)理[2],還可通過(guò)H2O2的量表征其活性。LPMOs 活性中心的Cu(Ⅱ)被還原成Cu(Ⅰ),與O2結(jié)合形成活化的銅-氧復(fù)合物,使底物被氧化,進(jìn)而使糖苷鍵斷裂[10,60],產(chǎn)生氧化產(chǎn)物和水(圖3-b)。研究表明,H2O2也作為L(zhǎng)PMOs 的動(dòng)力學(xué)相關(guān)共底物[61],即Cu(Ⅰ)從底物中獲取氫原子并使之羥基化[61-62],進(jìn)而實(shí)現(xiàn)糖苷鍵斷裂(圖3-c)。圖3 中b 和c 兩種催化反應(yīng)途徑是以多糖為底物,其產(chǎn)生的氧化產(chǎn)物通過(guò)上述方法可以進(jìn)行檢測(cè)[10,61];圖3 中的途徑a 是在沒(méi)有多糖底物的條件下,Cu(Ⅰ)與O2反應(yīng)產(chǎn)生H2O2[2]。目前,通過(guò)測(cè)定H2O2的量表征LPMOs 活性的方法有傳統(tǒng)的Amplex red 過(guò)氧化物酶偶聯(lián)分析法、靈敏的2,6-二甲基苯酚比色法和準(zhǔn)確度較高的還原酚酞分析法。
圖3 LPMOs 的催化機(jī)理:(a) 沒(méi)有底物的催化反應(yīng)[2]; (b) O2 為共底物[10]; (c) H2O2 為共底物[61]Fig.3 Catalytic mechanism of LPMOs:(a)No substrate [2]; (b)O2 as co-substrate[10]; (c)H2O2 as co-substrate[61]
2.4.1 Amplex red過(guò)氧化物酶偶聯(lián)分析法
Amplex red 過(guò)氧化物酶偶聯(lián)分析法是經(jīng)典的測(cè)定過(guò)氧化物及H2O2的分析方法,在過(guò)氧化物酶(HRP)催化下,H2O2與Amplex red 按1∶1 的比例生成紅色高熒光的試鹵靈(Resorufin)(圖4)[63]。通過(guò)分光光度法(ε571=58000 L/(mol·cm)或熒光法(λEx/Em=569/585 nm)測(cè)定其熒光強(qiáng)度[63],間接測(cè)定LPMOs 活性。該方法操作快速,已被廣泛用于LPMOs 活性評(píng)估和高通量篩選[64]。Mutahir 等[42]利用該方法通過(guò)檢測(cè)H2O2的產(chǎn)率表征了LPMOs 活性。Limsakul 等[28]通過(guò)Amplex?Red 過(guò)氧化氫/過(guò)氧化物酶檢測(cè)試劑盒測(cè)定了LPMOs 活性,H2O2的濃度在0.1~2 μmol/L 范圍內(nèi)與熒光信號(hào)響應(yīng)呈線(xiàn)性關(guān)系,并且當(dāng)LPMOs濃度為5 μmol/L 時(shí),曲線(xiàn)擬合較好(R2=0.99)[63]。然而,該方法只能精準(zhǔn)測(cè)定濃度在20~574 mg/L 范圍內(nèi)的LPMOs[65],并且其檢測(cè)環(huán)境需要避免金屬離子的干擾,如游離Cu2+的存在可能導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果[54]。
圖4 Amplex red 過(guò)氧化物酶偶聯(lián)法的原理[63]Fig.4 Principle of Amplex red peroxidase-coupled assay[63]
2.4.2 2,6-二甲基苯酚比色法
Breslmayer 等[65,66]開(kāi)發(fā)了2,6-二甲基苯酚(2,6-Dimethoxyphenol,2,6-DMP)比色法,并用于快速評(píng)估LPMOs 活性。LPMOs 將兩分子的2,6-DMP 氧化為兩分子的2,6-DMP 自由基,因自由基不穩(wěn)定而自發(fā)聚合成氫化木酚酮(Hydrocoerulignone),最后經(jīng)LPMOs 氧化形成顯色產(chǎn)物木質(zhì)素(Coerulignone),根據(jù)木質(zhì)素在469 nm 處的特征吸收峰表征LPMOs 活性(圖5)[65]。該方法快速、簡(jiǎn)便,已被用于裂解纖維素和幾丁質(zhì)的LPMOs 活性測(cè)定,以及LPMOs 表達(dá)和純化過(guò)程中結(jié)合常數(shù)或熱穩(wěn)定性的測(cè)定[34,67-69]。2,6-DMP比色法定量LPMOs 的濃度可達(dá)0.5~50 mg/L[65],與Amplex red 過(guò)氧化物酶偶聯(lián)分析法相比,其靈敏度更高。然而,在酸性緩沖液中,該方法的靈敏度受限。因此,Breslmayr 等[66]在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了改進(jìn),以氫化木酚酮為底物測(cè)定LPMOs 活性。改進(jìn)后的方法適用于pH 4~8 的緩沖液環(huán)境,并且可以進(jìn)行準(zhǔn)確測(cè)定。
圖5 2,6-二甲氧基苯酚(2,6-DMP)比色法的原理[65]Fig.5 Principle of 2,6-dimethoxyphenol (2,6-DMP) assay[65]
2.4.3 還原酚酞分析法
Brander 等[70]基于Kastle-Meyer 實(shí)驗(yàn)原理開(kāi)發(fā)了還原酚酞分析法,并用于LPMOs 活性的快速檢測(cè)。以H2O2為共底物,通過(guò)LPMOs 氧化將無(wú)色的還原酚酞(Reduced phenolphthalein,rPHP)氧化成生酚酞(PHP)(圖6),通過(guò)測(cè)定PHP 在552 nm 處的吸光值間接測(cè)定LPMOs 的活性,以TaAA9A 為例,其活性檢測(cè)的LOD 低至15 nmol/L[70]。Brander 等[70]還發(fā)現(xiàn),以脫氫抗壞血酸(DHA)為還原劑時(shí),PHP 更容易定量。然而,抗壞血酸作為還原劑時(shí)不能促進(jìn)rPHP 氧化,反而會(huì)引起反應(yīng)中酶的降解。因此,該分析方法僅限于DHA 的反應(yīng)中LPMOs 活性評(píng)估[70]。與上述兩種比色法相比,該方法因rPHP 的高穩(wěn)定性和耐受性使得LPMOs 活性測(cè)定更準(zhǔn)確。
圖6 還原酚酞分析法的原理[70]Fig.6 Principle of reduced phenolphtalein assay[70]
偶氮木葡聚糖分析法(Azo-Xyloglucan Assay)最初應(yīng)用于纖維素酶中內(nèi)切葡聚糖酶[71]的活性檢測(cè)及木聚糖特異性評(píng)估[72]。將可溶性顯色底物偶氮木聚糖與染料雷馬氏亮藍(lán)(Remazol brilliant blue R,RBBR)混合,利用纖維素酶水解產(chǎn)生染色寡糖,測(cè)定染色寡糖在590 nm 處的吸光值表征內(nèi)切葡聚糖酶的酶活性[72]?;诖耍珻alderaro 等[3]利用LPMOs 反應(yīng)中還原劑的作用,通過(guò)測(cè)定還原劑添加前后上清液顏色變化定量分析LPMOs 的活性。該方法由于缺乏相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),尚無(wú)法評(píng)估其優(yōu)缺點(diǎn),因此還未得到廣泛應(yīng)用。
上述比色法均可表征LPMOs 活性,各種比色法靈敏度雖有差異,但在相應(yīng)的應(yīng)用范圍中能夠?qū)崿F(xiàn)精準(zhǔn)測(cè)定。如DNS 法的靈敏度雖低但可粗略計(jì)算酶活性,廣泛用于LPMOs 與水解酶協(xié)同作用的活性檢測(cè),鎳/鄰苯二酚紫分析法及D-葡萄糖酸/D-葡萄糖酸-δ-內(nèi)酯分析法與之相比靈敏度有所提升。在H2O2分析方法中,以Amplex red 過(guò)氧化物酶偶聯(lián)分析法應(yīng)用范圍最廣,而2,6-DMP 比色法靈敏度較高。在酶工程改造研究中,比色法可為突變體快速且穩(wěn)定的篩選提供技術(shù)支撐。
除上述色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法和比色法之外,還有特異性強(qiáng)的熒光探針標(biāo)記法,通過(guò)測(cè)定熒光值表征LPMOs 活性,目前用于LPMOs 活性測(cè)定的探針標(biāo)記主要有以下3 種。
SYTO-62 探針標(biāo)記法最初是測(cè)定聚合物表面的羧基, 經(jīng)Eibinger 等[12]調(diào)整改造后, 用熒光探針SYTO-62 標(biāo)記纖維素后與LPMOs 共孵育,借助激光共聚焦顯微鏡連續(xù)監(jiān)測(cè)纖維素結(jié)晶區(qū)域表面的氧化位點(diǎn), 確定反應(yīng)產(chǎn)生羧基的量表征LPMOs 活性, 最后證明源于粗糙脈孢菌Neurospora crassa的NcLPMO9F 在催化纖維素裂解時(shí)產(chǎn)生了多個(gè)氧化位點(diǎn)。
EDAC 熒光標(biāo)記是基于1-乙基-3-[3-(二甲氨基)丙基]碳二亞胺(EDAC)將醛酸活化,再由胺基熒光團(tuán)7-氨基-1,3-萘二磺酸(ANDA)胺化,形成的共軛產(chǎn)物在450 nm 處具有熒光吸收[73]。Vuong 等[32]通過(guò)將水溶性熒光團(tuán)共價(jià)連接到纖維素氧化部位,再與LPMOs 共孵育,測(cè)定熒光吸收值反映PcLPMO9D 活性。該方法常用于評(píng)估C1 位氧化LPMOs 活性,并與HPAEC 色譜法結(jié)合可以獲得有關(guān)LPMOs 氧化產(chǎn)物的更詳細(xì)信息。
ANTS 熒光標(biāo)記法是一種基于熒光團(tuán)8-氨基萘-1,3,6-三磺酸(ANTS)將反應(yīng)產(chǎn)物胺化而產(chǎn)生還原端,再經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳獲得多糖結(jié)構(gòu)的分析方法,即碳水化合物凝膠電泳(PACE)分析法。該方法通過(guò)測(cè)定探針標(biāo)記氧化產(chǎn)物的熒光值表征LPMOs 活性,如Quinlan 等[21]利用ANTS 熒光標(biāo)記并結(jié)合MALDI-TOF-MS 分析了源于Thermoascus aurantiacus的TaGH61A 降解纖維素產(chǎn)物,并比較Cu2+對(duì)TaGH61A 催化活性的影響。Frandsen 等[74]應(yīng)用該方法測(cè)定了源于Lentinus similis的氧化產(chǎn)物纖維二糖和纖維三糖,表征了LsLPMO9 活性,并測(cè)定了酶催化反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)參數(shù)。
除此之外,結(jié)合LPMOs 催化反應(yīng)中電子受體如氧氣的消耗量、電子供體如抗壞血酸的消耗量均可以間接測(cè)定LPMOs 的催化活性。Gusakov 等[75]基于耗氧率測(cè)量的方法,使用帶有高靈敏度熒光傳感器的Seahorse XFp 分析儀,監(jiān)測(cè)了3 種真菌LPMOs 對(duì)無(wú)定形區(qū)域纖維素的氧化活性。Yu 等[76]利用LPMOs外部電子供體的抗壞血酸的消耗量表征源于Bacillus atrophaeus的BatLPMO10 的活性。此外,根據(jù)磷酸溶脹纖維素(PASC)不透明的特征,LPMOs 裂解氧化PASC 使之溶解,通過(guò)檢測(cè)其光密度變化表征LPMOs 活性,Hansson 等[77]利用該特性測(cè)定HjLPMO9A 與之突變體氧化裂解纖維素活性,得出HjLPMO9A 突變體對(duì)纖維素裂解活性下降50%。
LPMOs 氧化裂解產(chǎn)物的組成各異,針對(duì)可溶性產(chǎn)物,色譜-質(zhì)譜法及比色法均可實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)測(cè)定,但在分析不溶性產(chǎn)物時(shí)存在局限性。熒光標(biāo)記法更適于不溶性產(chǎn)物的分析,從而可以實(shí)現(xiàn)LPMO 整體活性的檢測(cè)。隨著LPMOs 研究的不斷深入,自然界中越來(lái)越多的LPMOs 被發(fā)現(xiàn),因此需要發(fā)展精確且快速的酶活性測(cè)定方法,為其酶學(xué)特性的研究提供關(guān)鍵支持。隨著計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)技術(shù)的高速發(fā)展,蛋白質(zhì)工程對(duì)LPMOs 的改造將成為研究熱點(diǎn),高通量的LPMOs 活性篩選方法不但可以加速突變體篩選效率,也為L(zhǎng)PMOs 的產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。因此,LPMOs 酶活性的測(cè)定方法需要不斷地開(kāi)發(fā)和創(chuàng)新,以期研發(fā)適用性更廣、操作更快速、精度更高的檢測(cè)方法,為解決當(dāng)前方法的局限性提供新思路和新途徑。