【摘 要】目的:通過孟德爾隨機化(MR)算法,探究甲狀腺功能減退癥與系統(tǒng)性紅斑狼瘡、皮肌炎、類風濕關節(jié)炎、混合性結締組織病之間的因果關系。方法:根據(jù)相應的閾值從全基因組關聯(lián)研究數(shù)據(jù)(GWAS)中選取與甲狀腺功能減退癥有關的單核苷酸多態(tài)性位點(SNPs),并采用逆方差加權法(IVW)、MR-Egger回歸、加權中位數(shù)法、簡單模式和加權模式進行評估,以探究甲狀腺功能減退癥與多種結締組織疾病之間風險關聯(lián)性。同時利用Cochran Q檢驗評估SNPs的異質性,使用MR-Egger截距檢驗SNPss的水平多效性,以“留一法”敏感性分析驗證MR結果是否受單個SNP的影響。結果:甲狀腺功能減退癥是多種結締組織疾病發(fā)生的危險因素。IVW模型顯示,甲狀腺功能減退癥是系統(tǒng)性紅斑狼瘡(OR = 1.612)、皮肌炎(OR = 2.410)、類風濕關節(jié)炎(OR = 1.004)、混合性結締組織疾?。∣R = 1.078)的危險因素。MR-Egger回歸截距項的P值均 > 0.05,表明所用的SNPs不存在基因多效性,說明本研究的結果可靠;異質性檢驗結果的P值均 > 0.05,提示所篩SNPs之間無異質性;“留一法”敏感性分析顯示因果關聯(lián)不受單一SNP效應的影響。結論:遺傳學研究表明,甲狀腺功能減退癥增加系統(tǒng)性紅斑狼瘡、皮肌炎、類風濕關節(jié)炎、混合性結締組織疾病的發(fā)生風險。
【關鍵詞】 甲狀腺功能減退癥;結締組織疾病;孟德爾隨機化;因果關系
Exploring the Causal Relationship Between Hypothyroidism and Various Connective Tissue Diseases Based on Mendelian Randomization
CHEN Bing-kun,CHENG Bin,CHEN An-ming,LIU Hong-wei,HUANG Yan-feng,TANG Hao-xi,LI Lin-hai
【ABSTRACT】Objective:To explore the causal relationship between hypothyroidism and systemic lupus erythematosus,dermatomyositis,rheumatoid arthritis,and mixed connective tissue diseases using Mendelian randomization(MR)algorithm.Methods:Single nucleotide polymorphisms(SNPs)associated with hypothyroidism were selected from genome-wide association study data(GWAS)based on corresponding thresholds,and evaluated using inverse variance weighted(IVW),MR-Egger regression,weighted median,simple mode,and weighted mode to explore the risk association between hypothyroidism and various connective tissue diseases.At the same time,Cochran Q method was used to evaluate the heterogeneity of SNPs,and MR-Egger intercept was used to test the horizontal pleiotropy of SNPs.The "Leave-One-Out" sensitivity analysis was used to verify whether the MR results were affected by a single SNP.Results:Hypothyroidism is a risk factor for various connective tissue diseases.The IVW model shows that hypothyroidism is a risk factor for systemic lupus erythematosus(OR = 1.612),dermatomyositis(OR = 2.410),rheumatoid arthritis(OR = 1.004),and mixed connectivetissue diseases(OR = 1.078).The P-valuesof the intercept term in MR-Egger regression are all greater than 0.05,indicating that the SNPs used do not have gene pleiotropy,and the results of this study are reliable;the P-values of the heterogeneity test results are all greater than 0.05,indicating that there is no heterogeneity among the screened SNPs;the sensitivity analysis of the "Leave-One-Out" shows that causal associations are not affected by the effects of a single SNP.Conclusion:Genetic studies have shown that hypothyroidism increases the risk of systemic lupus erythematosus,dermatomyositis,rheumatoid arthritis,and mixed connective tissue diseases.
【Keywords】 hypothyroidism;connective tissue diseases;Mendelian randomization;causal relationship
結締組織?。╟onnective tissue disease,CTD)是一類以結締組織的炎癥、纖維化和免疫系統(tǒng)異常為特征的疾病,主要包括類風濕關節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)、系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)、皮肌炎(dermatomyositis,DM)、混合性結締組織?。╩ixed connective tissue disease,MCTD)等[1],這些疾病可以影響全身的多個器官和組織,包括皮膚、關節(jié)、肌肉、心臟、肺部和血管等[2-4]。它們是常見的自身免疫失衡引起的慢性炎癥性疾病,其病因尚不清楚,并且全球發(fā)病率日漸上升[5]。據(jù)報道,CTD不僅與免疫系統(tǒng)異常反應和遺傳物質改變有關,同時環(huán)境因素在CTD發(fā)病中也扮演重要角色[6]。目前,SONG等[7]研究發(fā)現(xiàn),CTD患者發(fā)生惡性腫瘤的風險升高,包括肺癌、乳腺癌等。因此,研究CTD的相關危險因素以及預防疾病的發(fā)生和發(fā)展尤為重要。
甲狀腺功能減退癥是一種甲狀腺激素相對缺乏的自身性免疫疾病,女性比男性患病率更高[8],且與多種疾病發(fā)生有關[9]。HEZARKHANI等[10]指出,甲狀腺功能減退癥與CTD在臨床和病因學上有共性,且兩者臨床表現(xiàn)相似,這可能增加甲狀腺功能減退癥患者發(fā)生CTD的風險。然而,MCCOY等[11]研究發(fā)現(xiàn),伴有甲狀腺功能減退癥的患者與發(fā)生CTD的風險之間并無明顯差異。因此,甲狀腺功能減退癥與CTD之間的確切關聯(lián)尚需進一步闡明。
由于混雜因素的干擾,以至于觀察性研究的結果易引起爭議[12],從而使得甲狀腺功能障礙與CTD發(fā)生風險理解存在不足。孟德爾隨機化(MR)法是將遺傳變異作為工具變量(IV)反映暴露因素與結局之間是否存在因果效應[13]。本研究基于全基因組關聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù)庫,通過MR分析探究甲狀腺功能減退癥是否與CTD風險增加存在因果關系。
1 資料與方法
1.1 研究設計 采用MR研究甲狀腺功能減退癥與多種CTD風險的因果關聯(lián)。首先,從GWSA數(shù)據(jù)庫獲得與甲狀腺功能減退癥有關的暴露因素數(shù)據(jù)集,并獲取相關的單核苷酸多態(tài)性位點(SNPs)作為IV。其次,通過GWSA獲取SLE、DM、RA、MCTD的關聯(lián)數(shù)據(jù)集,確定與IV的相應SNPs,通過統(tǒng)計學方法綜合評價甲狀腺功能減退癥與多種CTD的風險因果關聯(lián)。MR分析應滿足3個假設:①IV應與暴露因素具有顯著相關性;②IV與“暴露-結局”的混雜因素應被排除;③ IV僅通過暴露因素而非其他因素影響結局。見圖1。
1.2 資料來源 本研究數(shù)據(jù)來源于GWAS數(shù)據(jù)庫(https://gwas.mrcieu.ac.uk/),收集了歐洲相關SNPs數(shù)據(jù)集,包括甲狀腺功能減退癥(樣本量
22 687例,9 851 867個SNPs)、SLE(樣本量482 911例,24 198 877個SNPs),DM(樣本量213 353例,16 380 451個SNPs),RA(樣本量484 598例,9 587 836個SNPs)和MCTD(樣本量115 768例,16 380 466個SNPs)。見表1。
1.3 相關SNPs篩選 首先,以P < 5×10-8篩出與甲狀腺功能減退癥的SNPs位點,并設置連鎖不平衡參數(shù)(LD)R2 < 0.001,遺傳距離為10 MB,選擇具有最小P值的SNPs,并使用Phenoscanner排除混雜因素,從而篩選出適當?shù)腎V。其次,提取數(shù)據(jù)集SNPs的相應編號、效應等位基因和非效應的等位基因,并對其進行整理和合并,確保暴露因素和結局的效應值相對于同一等位基因。再次,采用多種統(tǒng)計學方法推斷甲狀腺功能減退癥和多種CTD的因果關聯(lián)。
1.4 統(tǒng)計學方法 將暴露和結局數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)合并以保證結局變量SNPs與暴露因素SNPs的等位基因一致。使用MR-Egger回歸法、加權中位數(shù)法、逆差加權法(IVW)、加權模式和簡單模式等統(tǒng)計方法驗證MR的結果,以評價因果關聯(lián)的真實性,其中,IVW法是主要的MR分析方法。在IV滿足MR的條件時,IVW將每個單獨的SNPs因果效應比值結合起來,以反映暴露對結局的因果關系;當SNPs為有效的IV時,加權中位數(shù)法可獲得對因果效應的一致估計[14];同時,MR-Egger回歸法用于檢驗IV是否存在多效性,其截距代表水平多效性的效應估計值[15]。統(tǒng)計分析采用R 4.1.0進行,并將檢驗水準設定為α = 0.05。
2 結 果
2.1 IV的篩選 IV的篩選需要滿足MR的條件,通過刪除弱IV及混雜因素相關的SNPs。共篩選出85個與甲狀腺功能減退癥有關的SNPs作為最終的IV,然后將甲狀腺功能減退癥SNPs數(shù)據(jù)集分別與CTD相關SNPs數(shù)據(jù)集合并,最終分別篩選出SNPSLE53個、SNPDM72個、SNPRA74個、SNPMCTD72個IV。見圖2。通過MR-Egger回歸可檢驗IV的水平多效性,結果顯示,截距項bSLE = -0.017(P = 0.548)、bDM = 0.019 (P = 0.694)、bRA = 0.0001(P = 0.115)、bMCTD = 0.004 (P = 0.165),表明所篩選的SNP與結局變量不存在基因多效性,因此不影響MR分析的結果。見表2。
2.2 MR結果分析 為了推斷甲狀腺功能減退癥與CTD是否存在因果關聯(lián)性,使用5種MR的相關分析方法,根據(jù)表3顯示,在IVW模型中,甲狀腺功能減退癥與SLE、DM、RA及MCTD的P值均 < 0.05,差異有統(tǒng)計學意義,其中ORSLE = 1.612、
ORDM = 2.410、ORRA = 1.004、ORMCTD = 1.078。此外,其他4種模型與IVW模型趨勢大體保持一致,提示甲狀腺功能減退癥增加了SLE、DM、RA及MCTD的發(fā)生風險,見圖3。
2.3 MR性能驗證 為了排除IV間的異質性,筆者采用了Cochran's檢驗,結果顯示,MR-Egger和IVW兩種方法的Cochran's Q檢驗P值均> 0.05,表明IV間不存在異質性,提示IV之間差異不影響甲狀腺功能減退癥和多種CTD的因果關聯(lián)。見表4。另外,從圖4可知,IV中的SNPs基本呈對稱分布,進一步提示IV間的異質性較小。為了排除單個SNP對因果關聯(lián)性的影響,使用“留一法”逐個去除SNPs,以檢驗其余SNPs因果效應與全部SNPs的MR分析結果,結果顯示,逐一排除單個SNP均在“0”的右側且偏倚較小,表明去除任意一個SNP均不影響因果關聯(lián)性的判斷,提示MR分析結果可靠。見圖5。
3 討 論
本研究使用GWAS數(shù)據(jù)集,運用MR分析,IVW結果支持甲狀腺功能減退癥與SLE(OR = 1.612)、DM(OR = 2.410)、RA(OR = 1.004),及MCTD(OR = 1.078)風險增加存在因果相關。
流行病學研究顯示,甲狀腺功能減退癥與CTD之間存在一定的關聯(lián)和相互影響[16]。甲狀腺功能減退癥通常是由于甲狀腺激素分泌不足引起代謝率下降[17],而CTD是一種自身免疫性疾病,可影響多個器官,治療復雜及病情反復[18]。多項研究結果顯示,甲狀腺功能減退癥患者更容易合并患有CTD。HAMPL等[19]研究發(fā)現(xiàn),患有甲狀腺功能減退癥的婦女患RA的風險增加。此外,一項回顧性研究顯示,甲狀腺功能減退癥患者合并患有SLE的比例明顯增加[20-21]。報道還指出,甲狀腺功能減退癥患者可能會出現(xiàn)關節(jié)疼痛、肌肉無力、皮膚干燥和炎癥性黏膜等癥狀,增加發(fā)生DM和RA等CTD風險[22-25]。然而,由于混雜因素和反向因果的影響,僅依靠觀察性研究很難明確甲狀腺功能減退癥與CTD之間的因果關系。
MR分析是一種相對新穎的流行病學研究方法,利用遺傳變異推斷疾病與健康結果的影響[26]。本研究采用MR方法,最大程度地避免混雜和反向因果的影響,從基因層面確定了甲狀腺功能減退癥是多種CTD的風險因素,其中包括SLE、RA、DM、MCTD等,為觀察性研究提供了更確切的依據(jù)。然而,本研究的不足之處在于結果僅基于歐洲人群,可能存在種族間的差異,因此需要在其他人群中進一步驗證。
綜上所述,本研究從遺傳學層面推斷甲狀腺功能減退癥與CTD的相關性,采用了IVW、加權中位數(shù)法等算法分析甲狀腺功能減退癥與SLE、DM、RA、MCTD的因果關系,且結果保持一致。因此,支持甲狀腺功能減退癥與多種CTD風險增加存在因果關聯(lián)性。
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收稿日期:2024-05-18;修回日期:2024-06-28