摘要: 熒光分子斷層成像(fluorescence molecular tomography, FMT)是一種很有潛力的光學分子影像技術(shù),由于光在生物組織內(nèi)傳輸時會產(chǎn)生大量隨機的強散射,傳播過程極其復雜,使得熒光分子斷層成像重建具有高度的病態(tài)性。為了獲得準確的重建結(jié)果,提出了一種基于樂觀陰影集的FMT優(yōu)化策略。首先,定義了一種基于陰影集的情緒決策—樂觀決策和悲觀決策。然后,提出了一種基于樂觀決策的FMT優(yōu)化策略,該策略將熒光產(chǎn)額信息轉(zhuǎn)換為模糊信息樣本,通過陰影集計算當前模糊信息樣本的最佳閾值,對樣本的劃分采取樂觀決策。最后,篩選出熒光目標的預測位置。實驗結(jié)果表明,所提算法能夠有效提高FMT重建的精度。
關(guān)鍵詞: 陰影集; 三支決策; 熒光分子斷層成像; 樂觀決策
中圖分類號: TP391. 4
文獻標志碼: A
文章編號: 1671-6841(2025)01-0040-06
DOI: 10.13705/j.issn.1671-6841.2023142
Optimization Strategy of FMT Based on Optimistic Shadowed Sets
ZHANG Qinran1, GUO Dongkai1, YI Huangjian1 , XIE Qiong2
(1.College of Information and Science Technology, Northwestern University, Xi′an 710127, China;
2.The First Affiliated Hospital of Hunan University of Traditional Chinese Medicine, Changsha 410208, China)
Abstract: Fluorescence molecular tomography (FMT) was a promising optical molecular imaging technique.
that allowed disease onset and progression to be monitored at the cellular and molecular level without trauma. A large number of random strong scatterings were generated as light was transmitted through biological tissues, and the propagation process was extremely complex, resulting in fluorescence molecular tomography reconstruction being affected by a high degree of ill-posedness. Deriving the location distribution of fluorescent targets within the living body from the limited fluorescence yield information was deemed extremely challenging.
The transmission of light through biological tissues resulted in a substantial number of spontaneous and intense scatterings. The propagation process exhibited a high degree of complexity, contributing to a pronounced ill-posedness in the reconstruction of fluorescence molecular tomography.
In order to obtain accurate and stable reconstruction results, an optimization strategy for FMT based on optimistic shadowed sets was proposed. Firstly, an emotional decision, including optimistic and pessimistic decisions, was defined based on shadow sets. Then, an optimization strategy for FMT based on the optimistic decision was introduced. The strategy could convert fluorescence yield information into fuzzy information samples as the membership degree of the fluorescence target, and calculated the optimal threshold of current fuzzy information samples by shadow set. Optimistic decision was adopted for the division of samples. Finally,
the true position of fluorescent targets was selected. The experimental results indicated that the algorithm proposed effectively improved the accuracy of FMT reconstruction compared with the unoptimized FMT reconstruction algorithm.
Key words: shadowed sets; three-way decision; fluorescence molecular tomography; optimistic decision
0引言
Zadeh[1]提出的模糊集把原本的二值結(jié)構(gòu)擴展為多值結(jié)構(gòu),并用一連串的隸屬度來表示事物的歸屬程度。Pedrycz在模糊集的基礎(chǔ)上提出了陰影集[2],作為粗糙集和模糊集之間的橋梁,在保留了模糊集固有的不確定性的同時,通過一對閾值(β,α)將隸屬度函數(shù)f(x)∈[0,1]擴展到f(x)∈{0,1,[0,1]},其中[0,1]也被稱為“陰影區(qū)域”。陰影集作為三支決策的一種特殊模型,在決策方面同樣也符合規(guī)則,即對陰影區(qū)域采取延遲決策。研究人員往往只處理核心區(qū)域中的樣本,但是在實際應用中,陰影部分的樣本同樣具有一定的研究價值。如何處理陰影部分的樣本就成為一個重要的問題。
熒光分子斷層成像是一種能夠在細胞和分子水平上無創(chuàng)監(jiān)測疾病的發(fā)生和發(fā)展的分子影像技術(shù),它具有零放射性、操作簡單、成本低等優(yōu)點,在腫瘤早期檢測、藥物開發(fā)等研究領(lǐng)域獲得了極大關(guān)注[3]。然而,由于光在生物內(nèi)傳輸時產(chǎn)生大量隨機的強散射行為,傳播過程極其復雜,使得熒光分子斷層成像重建具有高度不適定性和病態(tài)性[4]。要由有限的熒光測量數(shù)據(jù)來反演活體內(nèi)部熒光目標的位置分布,極具挑戰(zhàn)性。
我們首先定義了一種基于陰影集的情緒決策——樂觀決策和悲觀決策。將熒光分子斷層成像重建的熒光產(chǎn)額信息轉(zhuǎn)化成模糊信息表,建立隸屬度關(guān)系,通過陰影集對樣本進行劃分,由于核心區(qū)域中的樣本較少,采用樂觀決策對模糊信息表進行處理,獲得樂觀集合,由此獲得熒光目標的三維分布。本文的主要貢獻包括兩個方面。
1) 定義了樂觀陰影集和悲觀陰影集,從而使得陰影集在具體應用領(lǐng)域中更具有可解釋性。
2) 根據(jù)實際應用情況,將樂觀陰影集策略應用于熒光分子斷層成像重建中,提出了基于陰影集的FMT優(yōu)化策略。實驗結(jié)果表明,本文提出的優(yōu)化方法可以有效提高FMT重建的定位精度。
1相關(guān)工作
1.1延遲區(qū)域決策處理
延遲區(qū)域的處理一直是專家的主要研究方向。現(xiàn)在的研究主要集中在閾值劃分和邊界域樣本處理等方面。文獻[5]選擇將陰影區(qū)域的樣本交給專家處理,雖然一定程度上提高了準確性但是增加了算法的使用限制。文獻[6]通過陰影集對同時含有標記和未標記數(shù)據(jù)的樣本進行了劃分,構(gòu)建了半監(jiān)督陰影集,減少了陰影區(qū)域的樣本和決策風險,增加了算法的準確性。但是陰影部分的樣本并未給出處理方法。文獻[7]通過對考慮延遲決策的風險和受錯判風險敏感程度等給出了延遲區(qū)域的風險計算公式,從而對延遲區(qū)域采取更加合理的決策,但是文中并未給出相應的決策。
1.2熒光分子斷層成像
提高FMT重建精度是研究人員的主要研究問題。文獻[8]將自適應對抗學習策略與FMT結(jié)合,消除了不同噪聲水平對重建結(jié)果的影響,提高了重建算法的魯棒性。文獻[9]提出用隨機Kaczmarz方法解決FMT中的逆向問題,同時基于隨機Kaczmarz提出了一種自適應允許區(qū)域的重建方法,該方法以高準確性恢復了嚙齒動物的頸動脈硬化斑塊,提高了重建算法的魯棒性。文獻[10]提出了一種最大似然期望最大化的重建方法,準確地對FMT系統(tǒng)中的泊松噪聲進行了建模,減少了背景區(qū)域噪聲,改善了圖像質(zhì)量。文獻[11]首次將三支決策與FMT相結(jié)合,提出了一種基于三支決策的熒光分子斷層成像重建框架。在對閾值的處理上,作者認為生物體表面的熒光產(chǎn)額信息是一種條件概率,具有不確定性,同時FMT的代價函數(shù)也是未知的,采用了兩個最常用的閾值β=0.2,α=0.8,同時文中并未對延遲區(qū)域的樣本進行處理,在實際應用中缺乏普適性。
2相關(guān)知識
2.1陰影集
定義1陰影集
定義一個非空論域U,從形式上看,一個陰影集A表示為從論域U到集合{0,[0,1],1}的映射,A:U→{0,[0,1],1}。A的定義為β=1-α:
A(μ)=0,μ≤β,
[0,1],β<μ<α,
1,μ≥α。(1)
在式(1)中,論域U被分為三個區(qū)域,0、[0,1]、1表示三個量化度,陰影集A(μ)的具體規(guī)則如下。
1) 當對象的隸屬度μ≥α,完全接受,同時通過提升操作將該對象的隸屬度提升為1。
2) 當對象的隸屬度μ≤β,完全拒絕,同時通過降低操作將該對象的隸屬度降低為0。
3) 當對象的隸屬度β<μ<α,劃分至陰影區(qū)域,同時將其隸屬度轉(zhuǎn)化為[0,1],它可以是區(qū)間中的任何數(shù)。
對于閾值的計算方法,Pedrycz[2]提出了一種確定閾值的方法,陰影集的整體不確定性如圖1所示。具體公式為
Ω=∫A(x)≤βA(x)dx,
Ω=∫β<A(x)<αdx,
Ω=∫α≤A(x)(1-A(x))dx,(2)
V(α)=∫μ≤αA(x)dx+
∫1-α≤μ(1-μ)dx-
∫α<μ<1-αdx。(3)
為了減少區(qū)域操作帶來的不確定性,對于任一陰影集,可以找到代價函數(shù)V(α)的最小值來求得此時的最佳閾值(β,α)。
2.2熒光分子斷層成像
熒光分子斷層成像技術(shù)是使用熒光標記物對生物體內(nèi)的靶向目標進行標記,在生物體外部使用特定波長的光照射,熒光標記物受到外部光的照射發(fā)射熒光,通過成像系統(tǒng)采集活體外部的熒光,基于光傳輸方程和適當?shù)臄?shù)學方法,反演靶向目標的位置、濃度分布、環(huán)境參數(shù)等[12-13]。
光在生物體內(nèi)的傳播可用輻射傳輸方程來描述,但該方程很難直接求解,通常用擴散方程來近似輻射傳輸方程。有限元方法是一種求解擴散方程的數(shù)值方法,它可以建立物體表面的光子流通率與熒光目標X之間的關(guān)系[22],
=BX,(4)
ε=‖-BX‖2。(5)
在重建過程中,為了增加結(jié)果的準確性,應當使得生物體表面光子流通率與熒光目標之間的差異最小。通常求取ε的最小值來獲得熒光目標的近似解。盡管如此,F(xiàn)MT逆向問題依然是典型的亮度不適定問題。目標函數(shù)為
在重建過程中,為了增加結(jié)果的準確性,應當使得生物體表面光子流通率與計算的熒光目標之間的差異最小。通常求取最小值來獲得熒光目標的近似解。在數(shù)學上,可以通過增加正則化項來約束解,于是上述問題的目標函數(shù)變?yōu)?/p>
Min{‖-BX‖2+λ‖X‖},(6)
其中:λ為正則化參數(shù),根據(jù)不同的處理方法取值為1或2;P為范數(shù),取值為1或2。
3基于樂觀陰影集的FMT優(yōu)化方法
3.1陰影集的情緒決策
陰影集通過引入一對閾值(β,α)來映射集合{0,[0,1],1}中的隸屬度,描述模糊集的三個區(qū)域。對于正域中的元素,采取完全接受;對于負域中的元素我們采取完全拒絕;對于邊界域采取延遲觀測態(tài)度,等待更多信息[14-16]。
在實際應用中,樣本往往難以獲得且成本極高。例如,在獲取生物體的熒光產(chǎn)額信息時,由于光在生物體內(nèi)傳輸時經(jīng)過大量隨機的強散射,生物體某一處的熒光產(chǎn)額信息可能充滿著大量的不確定性,同時也很難獲得更多的信息。所以需要對三分決策作出新的解釋。受主動約束陰影集和被動約束陰影集的啟發(fā)[17],提出了陰影集的樂觀決策和悲觀決策。
定義2樂觀陰影集S
定義一個非空論域U,假設一個陰影集S, 陰影集S最佳劃分閾值為(β,α),則陰影集S從論域U到集合{0,[0,1],1}的映射為S:U→{0,[0,1],1},當陰影集S采取式(7)決策時,如圖2(a)所示,稱此時的陰影集為樂觀陰影集S,
S=0,x<β,
1,x≥β。(7)
根據(jù)定義2,當樣本的隸屬度x<β時,和一般陰影集相同,我們認為此時的樣本可參考性差,對其采用拒絕的決策;當樣本的隸屬度x≥β,由于樣本的限制,我們認為此時陰影部分的樣本依舊具有可參考性,所以對整體采用接受的決策。
定義3悲觀陰影集S
定義一個非空論域U,假設一個陰影集S, 陰影集S最佳劃分閾值為(β,α),則陰影集S從論域U到集合{0,[0,1],1}的映射為
S:U→{0,[0,1],1},當陰影集S采取式(8)決策時,如圖2(b)所示,稱此時的陰影集為悲觀陰影集S,
S=0,x<α,
1,x≥α。(8)
根據(jù)定義3,當樣本的隸屬度x≥α時,和一般陰影集相同,認為此時的樣本具有較強的可參考性,對其采用接受的決策;當樣本的隸屬度x<α,由于樣本的限制,認為此時陰影部分的樣本并不具有可參考性,所以對整體采用拒絕的決策。
陰影集的樂觀和悲觀決策的主要區(qū)別在于對陰影部分樣本的處理。悲觀決策認為,當上升區(qū)域中的樣本較多時(上升區(qū)域中的樣本與總體樣本數(shù)的比值大于0.5),此時上升區(qū)域的樣本足以優(yōu)化結(jié)果。樂觀陰影決策認為,當上升區(qū)域的樣本數(shù)量較少時(上升區(qū)域中的樣本與總體樣本數(shù)的比值小于0.5),此時劃分在上升區(qū)域的樣本可能非常少甚至沒有所需樣本,此時需要陰影區(qū)域和上升區(qū)域的樣本一起優(yōu)化最終結(jié)果。
3.2基于樂觀陰影集的FMT優(yōu)化策略
對于熒光分子斷層成像,我們進行了三組試驗,分別在數(shù)字仿真小鼠的不同位置種植腫瘤,小鼠的尺寸為長38 mm,寬20.8 mm,高35 mm,器官信息如圖3(a)所示。在三組實驗中,小鼠體內(nèi)腫瘤植入位置分別如圖3(a)、圖4(a)、圖5(a)所示。在實驗中,我們采用了基于不完全變量截斷共軛梯度重建算法[18]作為基礎(chǔ)重建算法。
表1為實驗的閾值劃分情況,三組實驗中有效劃分樣本占比均較少。從圖4可以看到,最佳閾值α均在V(x)取最小值時取得,從劃分樣本占比來看,實驗1和2分別占比0.13和0.10,這表明在實驗中大部分的樣本并不具有實驗價值,這是由于所采集的熒光數(shù)據(jù)為小鼠全身熒光產(chǎn)額信息,同時由于FMT本身具有的病態(tài)性,腫瘤信息只會在部分區(qū)域呈現(xiàn)為熒光信息。在實驗3中,劃分樣本占比只有0.04,從圖5(a)中可以看出,腫瘤位于小鼠心臟中,在重建時其所發(fā)射的光需要經(jīng)歷更復雜的強散射,相比實驗1和2具有更多的不適性,所以有效熒光數(shù)據(jù)減少。三組實驗的有效樣本占比遠小于0.5,所以本文采用陰影集樂觀決策。針對熒光數(shù)據(jù)的FMT重建不精確的問題,通過FMT重建算法獲得生物體內(nèi)部的熒光產(chǎn)額信息與節(jié)點坐標,然后通過歸一化將熒光產(chǎn)額信息轉(zhuǎn)換為隸屬度樣本。歸一化的計算為
x=x-xminxmax-xmin。(9)
值得一提的是,考慮樣本的特殊性,對象的隸屬度應該符合規(guī)則:
1) 節(jié)點離熒光目標中心越近,隸屬度越大;
2) 當隸屬度為1時,并不代表此節(jié)點一定是熒光目標。
通過陰影集平衡樣本整體的不確定性,計算最佳閾值(β,α)。同時,我們認為陰影部分的樣本同樣也接收到大量熒光信息,考慮樣本的不確定性和稀少性,這些熒光信息同樣應該引起重視,所以采取陰影集的樂觀決策,對樣本進行劃分。
針對已劃分樣本,通過對應節(jié)點的編號尋找對應坐標并計算坐標的均值,從而得到預測結(jié)果。為了驗證算法的準確性,引入了歐氏距離公式計算預測坐標與真實坐標之間的距離,具體計算公式為
dis=(x-x)2+(y-y)2+(z-z)2。(10)
算法的具體描述如算法1所示。算法提出了一種陰影集的情緒決策,在針對不同的樣本和不同的需求時,采取陰影集的悲觀決策或者樂觀決策,增加了陰影集的可解釋性,同時使得FMT對熒光目標的重建更加精確。
算法1基于樂觀陰影集的FMT優(yōu)化策略
輸入:FMT重建算法獲得的熒光產(chǎn)額信息Sample。
輸出:生物體內(nèi)部熒光目標的三維坐標。
1) 對熒光產(chǎn)額信息Sample進行歸一化,將其變?yōu)槟:畔颖緓。
2) 通過公式(3)計算模糊信息樣本x的最佳閾值(β,α)。
3) 采取陰影集的樂觀決策S對當前樣本進行劃分,得到Sample。
4) 計算Sample所對應的三維坐標x、y、z。
5) 計算x、y、z的均值x、y、z。
6) 輸出最終結(jié)果x、y、z。
對已處理的熒光產(chǎn)額信息通過公式(3)計算當前最佳閾值(β,α),最佳閾值如圖3(b)、圖4(b)、圖5(b)所示。最終結(jié)果如表2~4所示。
在三次實驗中,所提優(yōu)化算法得到的重建腫瘤位置與真實腫瘤位置之間的距離分別為0.7 mm、1.4 mm、3.3 mm,而基礎(chǔ)算法得到的重建腫瘤位置與真實腫瘤位置之間的距離分別為1.7 mm、2.1 mm、3.9 mm。結(jié)果表明,本文所提出的優(yōu)化算法在三次實驗的預測結(jié)果與基礎(chǔ)重建算法相比均更加準確,因此證明所提算法具有有效性。
4結(jié)論
本文提出了一種陰影集的情緒決策,在平衡樣本的不確定性的同時,提高算法的準確性。我們將此方法與FMT重建相結(jié)合,提出了一種基于樂觀陰影集的FMT優(yōu)化策略。通過陰影集來平衡樣本的不確定性,同時采取樂觀決策對樣本進行劃分,對劃分的樣本進行處理得到熒光目標的三維坐標,從而增加FMT重建精度。本研究以醫(yī)學的實際問題為導向,對其他醫(yī)學問題的處理和模糊理論的應用具有參考意義。
參考文獻:
[1]ZADEH L A. Fuzzy sets[J]. Information and control, 1965, 8(3): 338-353.
[2]PEDRYCZ W. Shadowed sets: representing and processing fuzzy sets[J]. IEEE transactions on systems, man, and cybernetics, part B (cybernetics), 1998, 28(1): 103-109.
[3]何雪磊. 融合結(jié)構(gòu)與稀疏先驗的熒光分子斷層成像方法研究[D]. 西安: 西北大學, 2021.
HE X L. Study on fluorescence molecular tomography method combining structure and sparse prior[D]. Xi′an: Northwest University, 2021.
[4]ARRIDGE S R, SCHOTLAND J C. Optical tomography: forward and inverse problems[J]. Inverse problems, 2009, 25(12): 123010.
[5]LI Y S, SHAO X Y. Thresholds learning of three-way decisions in pairwise crime linkage[J]. Applied soft computing, 2022, 120: 108638.
[6]YUE X D, LIU S W, QIAN Q, et al. Semi-supervised shadowed sets for three-way classification on partial labeled data[J]. Information sciences, 2022, 607: 1372-1390.
[7]李言, 李麗紅, 李爽, 等. 基于集對聯(lián)系熵的三支決策模型及應用[J]. 鄭州大學學報(理學版), 2017, 49(3): 52-58.
LI Y, LI L H, LI S, et al. Three-way decisions model and application based on set pair information entropy[J]. Journal of Zhengzhou university (natural science edition), 2017, 49(3): 52-58.
[8]ZHANG P, SONG F, MA C B, et al. Robust reconstruction of fluorescence molecular tomography based on adaptive adversarial learning strategy[J]. Physics in medicine and biology, 2023, 68(4): 2176-2184.
[9]ZHANG P, LIU J, YIN L, et al. Adaptive permissible region based random Kaczmarz reconstruction method for localization of carotid atherosclerotic plaques in fluorescence molecular tomography[J]. Physics in medicine & biology, 2022, 67(17): 175008.
[10]ZHU Y S, JHA A K, WONG D F, et al. Image reconstruction in fluorescence molecular tomography with sparsity-initialized maximum-likelihood expectation maximization[J]. Biomedical optics express, 2018, 9(7): 3106-3121.
[11]YI H J, JIAO P, LI X N, et al. Three-way decision based reconstruction frame for fluorescence molecular tomography[J]. Journal of the optical society of America A, 2018, 35(11): 1814.
[12]DARNE C, LU Y J, SEVICK-MURACA E M. Small animal fluorescence and bioluminescence tomography: a review of approaches, algorithms and technology update[J]. Physics in medicine and biology, 2014, 59(1): R1-64.
[13]JIANG X, DENG Y, LUO Z Y, et al. Accelerating fDOT image reconstruction based on path-history fluorescence Monte Carlo model by using three-level parallel architecture[J]. Optics express, 2015, 23(20): 25996.
[14]YAO Y Y. Three-way decisions with probabilistic rough sets[J]. Information sciences, 2010, 180(3): 341-353.
[15]YAO Y Y. The superiority of three-way decisions in probabilistic rough set models[J]. Information sciences, 2011, 181(6): 1080-1096.
[16]YAO Y Y. An outline of a theory of three-way decisions[M]∥Rough Sets and Current Trends in Computing. Berlin: Springer Press, 2012: 1-17.
[17]ZHOU J, GAO C, PEDRYCZ W, et al. Constrained shadowed sets and fast optimization algorithm[J]. International journal of intelligent systems, 2019, 34(10): 2655-2675.
[18]HE X W, LIANG J M, WANG X R, et al. Sparse reconstruction for quantitative bioluminescence tomography based on the incomplete variables truncated conjugate gradient method[J]. Optics express, 2010, 18(24): 24825-24841.